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Phenotypic variation can partly be explained by genetic variation, such as variation in single nucleotide polymorphism (SNP) genotypes. Genomic selection methods seek to predict genetic values (breeding values) based on SNP genotypes. To develop and to optimize these methods, simulated data are often used, which follow a rather simple genotype-phenotype map. Is the conventional approach for data simulation in this field an appropriate basis to optimize such methods in view of experimental data? Here, we present an alternative approach, striving to simulate more realistic data based on a genotype-phenotype map which includes a simulated metabolome level. This level was used to simulate genetic values, implicitly including additive and non-additive genetic effects, whereas in a conventional approach additive and dominance effects were explicitly simulated and assembled to genetic values. For both simulation approaches, different scenarios regarding numbers of quantitative trait loci (QTLs) and SNPs were analysed using fastBayesB as prediction method. We observed that our alternative map showed a smaller prediction precision (at least 3.75 %) compared to the conventional approach in all investigated scenarios. The observed degree of linearity is at least 94.12 % of the conventional approach or less. Additionally, we present results for different simulated data and experimental data to allow a comparison on a purely conceptual level. Concluding, simulating a more complex genotype-phenotype map including a molecular level, allows to study processing of variation from the genetic to the phenotype level in more detail and may prepare the ground for modern methods of genomic selection.

Un año más me es grato presentar, en el marco del Programa de Mejora del Caballo Anglo-árabe el sexto Catálogo de Reproductores de esta raza, en el que se recogen los caballos que han alcanzado alguna de las Categorías Genéticas recogidas en su Esquema de Selección (Jóvenes Reproductores Recomendados y Reproductores Élites), para las disciplinas hípicas de Concurso Completo de Equitación, Salto de Obstáculos y Raid. Como en años anteriores, la información genealógica, fenotípica y genética de los animales en Catálogo se presenta a modo de ficha individual, con objeto de proporcionar la mayor información posible de cada animal. Las valoraciones genéticas de las distintas disciplinas evaluadas, que nos han permitido determinar los animales con Categorías Genéticas, se han realizado tanto a partir de los controles de rendimientos de las Pruebas de Selección de Caballos Jóvenes (PSCJ) como de las pruebas federativas (Real Federación Hípica Española -RFHE-). Para la disciplina de Concurso Completo de Equitación se han valorado un total de 9.980 caballos (1.197 de raza Aá), a partir de construir la matriz de parentesco de los 1090 caballos (259 Aá) participantes en las PSCJ y en la RFHE (los registros de las PSCJ se complementan con los de la RFHE con objeto de aumentar el número de registros y de este modo contribuir significativamente a aumentar la fiabilidad de las valoraciones genéticas) con un total de 8.331 registros (2.671 de los cuales pertenecen a caballos Aá). Para la disciplina de Salto de Obstáculos se han valorado a 22.488 animales (949 Aá) a partir de las 10.438 participaciones registradas (261 Aá) por los 1.893 caballos participantes (65 Aá). La valoración realizada, para la obtención de los animales con la categoría de Reproductor Élite, uniendo información de las PSCJ y de las pruebas de la RFHE, se ha realizado sobre un total de 22.488 caballos (949 Aá) a partir de las 196.649 participaciones registradas (2.654 de caballos Aá). Para la valoración genética que se ha realizado para la disciplina de Raid se ha contado con un total de 5.120 (991 Aá) participaciones recogidas en las PSCJ y de RFHE. El número total de animales participantes ha sido de 1523 (311 Aá). El número total de animales valorados en el pedigrí ha sido de 9.527 (971 de raza Aá). Aprovecho la ocasión para agradecer la labor realizada por la Asociación Española de Criadores de Caballos Anglo Árabes en el marco del Programa de Mejora de esta raza, que con su desempeño y buen hacer está favoreciendo el progreso genético del Caballo Angloárabe. Así mismo, agradecer la colaboración de la Real Federación Hípica Española, de los técnicos, los ganaderos, los jueces y los jinetes que han contribuido a generar los datos de rendimientos necesarios para realizar las valoraciones genéticas, que nos han permitido establecer los animales con categorías genéticas que se recogen en el presente Catálogo. El esfuerzo conjunto de todos los organismos y personas implicadas está permitiendo el progreso genético que se está consiguiendo en el caballo de raza Anglo árabe. Ministerio de Agricultura, alimentación y medio ambiente PAI-AGR-158 Ministerio de Agricultura, alimentación y medio ambiente PAI-AGR-273

Me es grato presentar el sexto Catálogo de Reproductores del Caballo de Deporte Español (CDE), en el que se recogen los animales que han alcanzado las Categorías Genéticas de Jóvenes Reproductores Recomendados, de Reproductores Mejorantes o Reproductores Élite, para las disciplinas hípicas de Salto de Obstáculos, Doma Clásica, Concurso Completo de Equitación y Raid. Para realizar las valoraciones genéticas que han dado lugar a que los animales alcancen las distintas categorías genéticas ha sido preciso contar con los controles de rendimientos realizados tanto en las Pruebas de Selección de Caballos Jóvenes (PSCJ) como en las pruebas federativas (Real Federación Hípica Española ‐ RFHE). La información genealógica, fenotípica y genética de los animales con categoría genética se ha recogido en el presente Catálogo de Reproductores, a modo de ficha individual, con objeto de difundir la mejora de la raza Caballo de Deporte Español. En la valoración genética realizada para obtener la categoría de Joven Reproductor Recomendado en la disciplina de Salto de Obstáculos se han valorado a 22.488 animales a partir de las 10.438 participaciones registradas por los 1.952 caballos participantes (1.617 de CDE). Así mismo, se ha realizado una valoración genética con los datos generados tanto en las PSCJ como en las pruebas de la RFHE, con objeto de aumentar el número de registros y de este modo contribuir significativamente a aumentar la fiabilidad de las valoraciones genéticas realizadas. La valoración genética, para alcanzar la categoría de Reproductor Mejorante y Reproductor Élite se ha realizado sobre un total de 22.488 caballos (3.133 de CDE) a partir de las 196.649 participaciones registradas (53.585 de animales CDE) procedentes de 8.446 ejemplares (2.388 CDE). En la valoración genética realizada para la disciplina de Concurso Completo de Equitación, se han contabilizado, para obtener las categorías de Joven Reproductor Recomendado, Reproductor Mejorante y/o Reproductor Élite, un total de 9.980 caballos valorados (633 CDE) a partir de las 8.331 participaciones registradas por los 1.114 caballos participantes (409 CDE). En la valoración genética realizada para la disciplina de Doma Clásica, se han valorado un total de 23.218 ejemplares (514 CDE) a partir de las 11.753 participaciones (678 de CDE) de los 5.226 caballos participantes (356 CDE). Para la disciplina de Raid se han valorado 9.527 animales, a partir de 1.327 participaciones registradas por los 669 caballos participantes (32 CDE) para poder determinar los posibles animales con categoría de Joven Reproductor Recomendado para Raid. Por otro lado, se realizó una segunda valoración para determinar los posibles animales con categoría de Reproductores Mejorantes y Reproductores Élite, empleando los datos recogidos por la RFHE. El número total de registros para los caractéres Puesto Clasificatorio y Probabilidad de no ser Eliminado, ha sido de 5.120, procedentes de 1.187 caballos (65 CDE). Ministerio de Agricultura, alimentación y medio ambiente PAI-AGR-158 Ministerio de Agricultura, alimentación y medio ambiente PAI-AGR-273

Un año más me enorgullece presentar el Catálogo de Reproductores del caballo de Pura Raza Española, refl ejo del éxito del Programa de Mejora de la raza que cada vez va aumentando gracias a los esfuerzos de la ANCCE y de todos los agentes implicados. Esta publicación se incluye dentro de las actuaciones del Programa de Difusión de la Mejora que la ANCCE desarrolla y que constituye una de las principales fortalezas de esta raza autóctona poniendo en valor su potencial a nivel mundial. En este Catálogo se publican los 114 reproductores que tras la valoración genética de este año han obtenido alguna de las categorías establecidas en el Programa de Mejora de la raza: 79 Jóvenes Reproductores Recomendados, 31 Reproductores Mejorantes y 4 Reproductores Élite. La elección y utilización de los ejemplares, que transmiten las cualidades genéticas más adecuadas a su descendencia, promueve la consolidación del Programa de Mejora de la raza e incrementa el progreso genético obtenido hasta la fecha. Esta elección se nos facilita a los ganaderos y técnicos del sector a través de esta herramienta esencial.

Un reto de la ganadería moderna es la conservación del patrimonio genético autóctono amenazado por las razas mejoradas, y la justificación para conservar las razas ganaderas precisa de una revalorización de sus producciones. Con el objetivo de mostrar las posibilidades productivas de una raza bovina autóctona española en peligro de extinción y contribuir a su desarrollo, este estudio presenta por primera vez las variables de calidad de la carne de terneros de la raza Pajuna criados en dos sistemas de producción: semiextensivo (pasto y alimento concentrado, Sem) y extensivo (pastoreo permanente, Ex). También se analizaron los cambios en las variables de calidad de la carne durante 7, 14 y 21 d de maduración. Un panel de consumidores no entrenados comparó las preferencias del consumo de esta carne en los tres momentos de maduración. El diseño experimental fue completamente al azar y con un arreglo factorial 23: sistema de producción (Sem y Ex), y maduración (T7, T14 y T21 d), y se usaron 23 canales de terneros castrados de dos años de edad de raza Pajuna. Las características de la carne de los terneros fueron similares a las descritas para otras razas autóctonas españolas. La carne de los terneros del sistema Ex fue más oscura y presentó un contenido mayor de ácidos grasos poliinsaturados que la producida en sistema Sem (13.90 y 7.14 %, respectivamente). En la carne, para ambos sistemas de producción, aumentó la luminosidad (L), la capacidad de retención de agua y la terneza durante el proceso de maduración, y los cambios más relevantes se observaron durante los primeros 14 d de maduración. Después de ese período se observaron las mejores notas de valoración de la carne. A challenge of modern stock breeding is conservation of the native gene pool threatened by improved breeds, and the justification to conserve livestock breeds requires a revaluation of their production. With the aim of showing the productive possibilities of a native Spanish bovine breed in danger of extinction, and to contribute to its development, this study presents for the first time the variables of meat quality in Pajuna breed calves raised in two production systems: semi-extensive (grass and feed concentrate, Sem) and extensive (permanent grazing, Ex). The changes in meat quality variables were also analyzed at 7, 14 and 21 d of maturation. A panel of untrained consumers compared the consumption preferences for this meat at different moments of maturation. The experimental design was completely random with a factorial arrangement of 23: production system (Sem and Ex), and maturation (T7, T14 and T21 d), and 23 Pajuna breed castrated calves’ carcasses of two years of age were used. The characteristics of the calves’ meat were similar to those described for other Spanish native breeds. The calves’ meat from the Ex system was darker and presented higher content of polyunsaturated fatty acids than the one produced in the Sem system (13.90 and 7.14 %, respectively). In the meat, for both production systems, luminosity (L) increased, as well as the water-holding capacity and the tenderness during the maturation process, and the most relevant changes were observed during the first 14 d of maturation. The best evaluation notes for the meat were observed after that period.

Avanzando en el Programa de Mejora de la raza equina Anglo-árabe (Aá), me es grato presentar el sexto Catálogo de Reproductores de esta raza, en el que se recogen los caballos que han alcanzado alguna de las Categorías Genéticas recogidas en su Programa de Mejora (Jóvenes Reproductores Recomendados y Reproductores Élites), para las disciplinas hípicas de Concurso Completo de Equitación, Salto de Obstáculos y Raid. Como en años anteriores, la información genealógica, fenotípica y genética de los animales en Catálogo se presenta a modo de ficha individual, con objeto de proporcionar la mayor información posible de cada animal. Las valoraciones genéticas de las distintas disciplinas evaluadas, que nos han permitido determinar los animales con Categorías Genéticas, se han realizado tanto a partir de los controles de rendimientos de las Pruebas de Selección de Caballos Jóvenes (PSCJ) como de las pruebas federativas (Real Federación Hípica Española -RFHE-). Para la disciplina de Concurso Completo de Equitación se han valorado un total de 9.083 caballos (1.169 de raza Aá), a partir de construir la matriz de parentesco de los 958 caballos (253 Aá) participantes en las PSCJ y en la RFHE (los registros de las PSCJ se complementan con los de la RFHE con objeto de aumentar el número de registros y de este modo contribuir significativamente a aumentar la fiabilidad de las valoraciones genéticas) con un total de 6.933 registros (2.264 de los cuales pertenecen a caballos Aá). Para la disciplina de Salto de Obstáculos se han valorado a 21.537 animales (938 Aá) a partir de las 10.106 participaciones registradas (256 Aá) por los 1.819 caballos participantes (62 Aá). La valoración realizada, para la obtención de los animales con la categoría de Reproductor Élite, uniendo información de las PSCJ y de las pruebas de la RFHE, se ha realizado sobre un total de 21.536 caballos (934 Aá) a partir de las 173.161 participaciones registradas (2.499 de caballos Aá). Para la valoración genética que se ha realizado para la disciplina de Raid se ha contado con un total de 1.225 participaciones recogidas en las PSCJ. El número total de animales participantes ha sido de 598 (111 Aá). También se realizó una segunda valoración para determinar los posibles animales con categoría de Reproductores Élites, con los datos Federativos. Se utilizaron 4.660 registros, para el carácter "puesto clasificatorio", pertenecientes a 1.061 animales (217 Aá). En cuanto al carácter "tiempo" se dispuso de menos registros, un total 3.286 pertenecientes a 933 animales (185 Aá). Para ambos caracteres el número total de animales valorados en el pedigrí ha sido de 8.988 (880 de raza Aá). Aprovecho la ocasión para agradecer la labor realizada por la Asociación Española de Criadores de Caballos Anglo Árabes en el marco del Programa de Mejora de esta raza, que con su desempeño y buen hacer está favoreciendo el progreso genético del Caballo Angloárabe. Así mismo, agradecer la colaboración de la Real Federación Hípica Española, de los técnicos, los ganaderos, los jueces y los jinetes que han contribuido a generar los datos de rendimientos necesarios para realizar las valoraciones genéticas, que nos han permitido establecer los animales con categorías genéticas que se recogen en el presente Catálogo. El esfuerzo conjunto de todos los organismos y personas implicadas está permitiendo el progreso genético que se está consiguiendo en el caballo de raza Anglo árabe. Ministerio de Agricultura, alimentación y medio ambiente PAI AGR-158 MERAGEM Unión Europea PAI AGR-158 MERAGEM

Un reto de la ganadería moderna es la conservación del patrimonio genético autóctono amenazado por las razas mejoradas, y la justificación para conservar las razas ganaderas precisa de una revalorización de sus producciones. Con el objetivo de mostrar las posibilidades productivas de una raza bovina autóctona española en peligro de extinción y contribuir a su desarrollo, este estudio presenta por primera vez las variables de calidad de la carne de terneros de la raza Pajuna criados en dos sistemas de producción: semiextensivo (pasto y alimento concentrado, Sem) y extensivo (pastoreo permanente, Ex). También se analizaron los cambios en las variables de calidad de la carne durante 7, 14 y 21 d de maduración. Un panel de consumidores no entrenados comparó las preferencias del consumo de esta carne en los tres momentos de maduración. El diseño experimental fue completamente al azar y con un arreglo factorial 23: sistema de producción (Sem y Ex), y maduración (T7, T14 y T21 d), y se usaron 23 canales de terneros castrados de dos años de edad de raza Pajuna. Las características de la carne de los terneros fueron similares a las descritas para otras razas autóctonas españolas. La carne de los terneros del sistema Ex fue más oscura y presentó un contenido mayor de ácidos grasos poliinsaturados que la producida en sistema Sem (13.90 y 7.14 %, respectivamente). En la carne, para ambos sistemas de producción, aumentó la luminosidad (L), la capacidad de retención de agua y la terneza durante el proceso de maduración, y los cambios más relevantes se observaron durante los primeros 14 d de maduración. Después de ese período se observaron las mejores notas de valoración de la carne. A challenge of modern stock breeding is conservation of the native gene pool threatened by improved breeds, and the justification to conserve livestock breeds requires a revaluation of their production. With the aim of showing the productive possibilities of a native Spanish bovine breed in danger of extinction, and to contribute to its development, this study presents for the first time the variables of meat quality in Pajuna breed calves raised in two production systems: semi-extensive (grass and feed concentrate, Sem) and extensive (permanent grazing, Ex). The changes in meat quality variables were also analyzed at 7, 14 and 21 d of maturation. A panel of untrained consumers compared the consumption preferences for this meat at different moments of maturation. The experimental design was completely random with a factorial arrangement of 23: production system (Sem and Ex), and maturation (T7, T14 and T21 d), and 23 Pajuna breed castrated calves’ carcasses of two years of age were used. The characteristics of the calves’ meat were similar to those described for other Spanish native breeds. The calves’ meat from the Ex system was darker and presented higher content of polyunsaturated fatty acids than the one produced in the Sem system (13.90 and 7.14 %, respectively). In the meat, for both production systems, luminosity (L) increased, as well as the water-holding capacity and the tenderness during the maturation process, and the most relevant changes were observed during the first 14 d of maturation. The best evaluation notes for the meat were observed after that period.

La presente invención se encuadra en el campo general del sector agroalimentario y en particular, se refiere a un método para la determinación de la pureza racial de la especie porcina (raza ibérica) y de productos derivados. Los autores de la presente invención han evaluado diferentes metodologías para la determinación del origen racial de los cerdos de diferentes razas, diseñando marcadores moleculares diagnóstico de tipo SNP útiles para la discriminación racial de animales vivos, productos frescos y elaborados. La metodología desarrollada permite una rápida y certera detección de alelos de razas que suponen fraudes al consumidor, a la hora de elegir productos del cerdo de alto valor añadido.

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Presentado a la 17 Reunion de Mejora Genetica Animal, 5-6 Junio 2014, Universidad de Barcelona

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Con la finalidad de mejorar la fiabilidad de las evaluaciones genéticas, se realizaron estudios para la identificación y cuantificación del nivel de conexión entre rebaños ovinos de la raza Merino Español. Esta raza basa su explotación en un sistema extensivo y casi nula utilización de la inseminación artificial (I.A). Para asegurar un nivel adecuado de conexión genética entre rebaños, necesaria para obtener valoraciones fiables de los valores genéticos (VG) en el esquema de selección de la raza, se viene empleando un sistema de conexión indirecta mediante la valoración de algunos jóvenes sementales en prueba (previa valoración por descendencia en su propia explotación). Los mejores sementales de cada explotación son trasladados a un rebaño experimental, que es utilizado como "rebaño conector" para una segunda valoración bajo las mismas condiciones ambientales. Este sistema presenta un inconveniente claro al exigir la utilización de machos probados previamente en su propia explotación para la conexión de rebaños y campañas ganaderas. Esto determina un retraso en la prueba de descendencia de los sementales y una disminución en el progreso genético con relación a sistemas de conexión clásicos. Para esta tesis se utilizaron los datos de los controles de rendimiento proporcionados por la Asociación Nacional de Criadores de Ganado Selecto de la raza Merino entre los años 2000 a 2011. El conjunto de datos originales consistió en 86773 registros del peso a 75 días de edad, con un número total de animales en el archivo de pedigrí de 110510 (86879 corderos hijos de 2011 sementales y 40257 ovejas), en 47 rebaños que integran el Núcleo Control Cárnico (NCC) de la raza. Los resultados obtenidos indicaron una conexión directa entre rebaños de 55,3% y conexiones indirectas a través del rebaño conector (CENSYRA) de 95,7% ..., In order to improve the reliability of the genetic evaluations, studies were performed for the identification and quantification of the level of connection between herds of Spanish Merino. This breed bases its exploitation on a extensive system and almost none use of artificial insemination (A.I). To ensure an adequate level of genetic connection among herds, required for reliable assessments of the breeding values (BV) of the animals in the selection scheme of the breed, an indirect connection system has been employed through the assessment of some young sires under test (prior evaluation by descent on his own herd). The best sires were transferred to an experimental herd, which is used as a "connector flock" for a second valuation under the same environmental conditions and on several occasions for its relationship with the rest of the males found in the original herds. This system has a clear disadvantage by requiring the use of proven sires on its own herd for connecting the herds and livestock campaigns causes a decrease in the genetic progress in relation to traditional connection systems. Data from the Asociación Nacional de Criadores de Ganado Merino (National Association of Spanish Merino Sheep Breeders), colleted between the years 2000 to 2011, were used for this thesis. The original database consisted of 86773 weights registered at 75 days of age, with 110510 animals in the pedigree file (86879 lambs sons of 2011 sires and 40257 ewes) in 47 herds which constitute the Selection Nucleus (SN) of the breed. The results showed that 55.3% of the herds were directly connected and 95.7%, were indirectly connected through the connector herd (CENSYRA), suggesting the existance of a significant level of exchange of genetic material between herds. To analyse the system of conection of the breed, the genetic similarity (GS) between herds was estimated. Twenty-nine herds (61.7%) shared parents with al least another herd, whereas fourteen (28.6%) were found to have gene

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La valoración genética para caracteres relacionados con la mayoría de las disciplinas ecuestres tiene el inconveniente de la fuerte influencia del factor humano en el desempeño del equino (generalmente la interacción entre el jinete y el caballo), lo cual puede determinar valoraciones muy sesgadas sino se tiene en cuenta este hecho. En este trabajo se comparan distintos modelos de evaluación genética en cuanto a la forma de incluir el jinete, utilizando para ello como ejemplo los resultados de la prueba de doma clásica en la disciplina de concurso completo de equitación con la finalidad de determinar el mejor modelo. Los datos se analizaron mediante modelo animal empleando el software ASREML. En total se evaluaron 8 modelos diferentes que diferían en la inclusión o no del entrenador (y si este se consideraba como efecto fijo o como aleatorio), así como la inclusión del jinete y/o la interacción jinete-animal en dicho modelo de evaluación. En todos los modelos se incluyeron como efectos fijos el concurso-juez, el nivel de estrés, la edad y el sexo del caballo participante. De acuerdo a los resultados obtenidos se considera que el modelo más adecuado a este tipo de datos es un modelo en que se tenga en cuenta como efectos aleatorios el animal, el jinete y la interacción entre ambos.

En los últimos años se están incorporando masivamente en España, en general, y en Andalucía, en particular, razas ovinas foráneas de aptitud lechera, fundamentalmente las razas Assaf, Awassi y Lacaune. Su introducción está fomentando, asimismo, la realización de cruces indiscriminados con nuestras razas ovinas autóctonas, de aptitud lechera pero de menor especialización, al menos cuantitativamente (Casas et al., 2005). El objetivo de este estudio ha sido analizar en dos grupos de animales de un mismo rebaño (ovejas puras de raza Merina de Grazalema, y ovejas cruzadas Merina de Grazalema x Awassi) las características de la producción lechera, y proceder a la elaboración de quesos para estudiar las posibles diferencias tecnológicas de los quesos derivados de ambas elaboraciones. A través del mismo se ha comprobado una mayor producción lechera de las ovejas cruzadas (167.35±13.20 kg frente a 136.84±4.25 kg) pero con un porcentaje de grasa (6.25±0.34 % frente a 8.27±0.22 %), proteína (4.71±0.14 % frente a 5.80±0.09 %) y extracto seco (10.97±0.46 % frente a 14.07±0.28 %), estadísticamente inferior. En cuanto a los parámetros de aptitud tecnológica, los valores de tiempo de coagulación medio (24.70±0.77 minutos), dureza media (dureza del coágulo a los 30 minutos) de 25.03±2.27 mm, y el rendimiento en cuajada (327.50±5.70 g/l), mostraron cifras inferiores a las referenciadas por Casas et al. (2005) para la raza ovina Merina de Grazalema. Finalmente, la velocidad de endurecimiento resultó mayor a los valores obtenidos en el trabajo citado anteriormente (4.59±0.54 min.). Por otro lado, estos mismos parámetros mostraron valores inferiores en el tiempo de coagulación (19.60±0.62 minutos), velocidad de endurecimiento (3.97±0.38 min.) y rendimiento en cuajada (290.55±6.67), mientras que la dureza media (32.85±2.03 mm) fue superior en las ovejas cruzadas, respecto a los valores encontrados en esta misma explotación para los animales puros. Como consecuencia de todo ello, el rendimiento quesero real fue del 30.25 % para las ovejas puras frente al 23.70 % de las cruzadas. Esto determina que la producción quesera real que se obtiene por oveja pura, sea superior al de la cruzada (41.38 kg queso fresco/lactación frente a los 39.70 de la cruzada).

Los resultados de 94469 registros mensuales de la producción de leche y sus componentes de 9271 cabras Payoya, paridas entre Noviembre 2002 y Diciembre de 2007 fueron analizadas mediante modelos de regresión aleatoria con el objetivo de estimar los principales parámetros genéticos para estos caracteres. Una ecuación de orden 3 para los efectos genéticos y para los efectos de ambiente individual, así como el uso de la varianza residual heterogénea fue el modelo de mejor ajuste. Para todas las variables analizadas se manifestó la tendencia al incremento en el valor de la heredabilidad (h2) a medida que se avanza en la lactación, excepto en la producción de leche en el día de control, cuyos mayores valores se presentaron a en la parte intermedia de esta. Los valores de h2 oscilaron entre 0.14 a 0.23 para la producción de leche; 0.33 a 0.40 para % de proteína; 0.10 a 0.20 para % de grasa; 0.26 a 0.40 para % de lactosa y finalmente 0.12 a 0.29 para la materia seca. En todas las variables las correlaciones genéticas fueron positivas y altas entre registros adyacentes. Se encontró una amplia variabilidad de origen genético en la forma de la curva de lactación de los animales. A total of 94469 test day records of milk yield and milk composition (fat, protein and dry matter contents) from 9271 Payoya goats, collected between November 2002 to December 2007 were analyzed using random regression models to estimate the parameter genetic for these traits. A third order equation for genetic and environment permanent effects, with a heterogeneous residual variance model was the best fit model. For all the traits analyzed results show an increase trend in the heritability values through lactation curve, except for milk yield. This shows the highest values in the middle of lactation. Heritabilities ranged from 0.14 to 0.23 for milk yield, from 0.33 to 0.40% for protein content; 0.10 to 0.20 for fat %, 0.26 to 0.40 for lactose % and finally from 0.12 to 0.29 for dry matter. Genetic correlations were positive and high between adjacent records in all traits. There was a wide genetic variability in the shape of the lactation curve.

Ponencia publicada en ITEA, vol.104 Los mismos sementales o algunos muy emparentados se utilizan en diferentes ganaderías. El rendimiento del semental puede variar según la ganadería por lo que puede ser recomendable incluir en los modelos de estimación el efecto ambiental macho x ganadería (s). Sin embargo, no existen estudios que analicen la influencia de este efecto sobre parámetros genéticos de caracteres de interés en el caballo. En este estudio se pretende evaluar el efecto de la inclusión del efecto s en los modelos de estimación de parámetros genéticos de 8 medidas zoométricas: alzada a la cruz (HW), altura de pecho (HC), longitud de extremidades (LL), longitud corporal (BL), anchura de pecho (WC), perímetro torácico (HGC), perímetro de rodilla (KP) y perímetro de caña (CBC). Se estimaron los componentes de la varianza a partir de los datos obtenidos en 16.472 animales utilizando un modelo animal multivariado con una metodología REML. Las heredabilidades oscilaron entre 0,26 (HC y WC) y 0,57 (HW) y las estimas del efecto s entre 0,02 (HW) y 0,09 (WC y HGC). Las correlaciones entre efectos s fueron positivas, significativas y, en general, entre moderadas y bajas, variando entre 0,09 (HW-BC) y 0,62 (HW-BL); excepto para LL, que fueron negativas y bajas (-0,20 - -0,68). Se considera recomendable incluir este efecto en los modelos de valoración genética en razas equinas. The same or closely related stallions are used for reproduction across studs differing in environments. Stallions may perform differently across studs, and adjustment for the environmental sire x stud effect (s) may be recommended. However, there are no available studies analysing the influence of such effect on estimation of genetic parameters in horses. This research aimed at assessing the effect of including s effects in the models for eight body measurements: height at withers (HW), height at chest (HC), leg length (LL), body length (BL), width of chest (WC), heart girth circumference (HGC), knee perimeter (KP) and cannon bone circumference (CBC). Using data from 16,472 individuals, genetic parameters were estimated using a multivariate animal model by REML. The estimated heritabilities ranged between 0.26 (HC and WC) and 0.57 (HW) and estimates for the s effect from 0.02 (HW) to 0.09 (WC and HGC). Correlations between s effects were positive, significant and from moderate to low, varying between 0.09 (HW-BC) and 0.62 (HW-BL); except for LL, which were negative and low (-0.20 - -0.68). Selective decisions or preferential management practices can cause this environmental effect. The inclusion of an s effect in models fitted for genetic evaluation in horse breeding schemes can be advisable.

Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria RZ03-019

Publicado en el año 2008 en: Revista ITEA, 104 (2), 295-302. http://www.aida-itea.org/index.php/revista/contenidos?idArt=87&lang=esp Webs desde donde descargar las ponencias: http://acteon.webs.upv.es/ Web del congreso: http://www.uco.es/genetica/MERAGEM/xivreunion.htm La raza Merina ha tenido a lo largo de la historia un importante papel desde el punto de vista político, biológico, económico y ganadero, siendo hoy día la raza de aptitud cárnica de mayor censo de nuestro país. El objetivo de este trabajo ha sido conocer la situación de las estirpes tradicionales más importantes de la raza Merina en España (“Serena”, “Hidalgo”, “Granda” y “López-Montenegro”) mediante el uso de herramientas genealógicas y moleculares. Según nuestros resultados las estirpes que más influencia mantienen actualmente son la “Serena” y la “Hidalgo” con un 27% y un 15% respectivamente mientras que “López-Montenegro” y “Granda” cuentan con sólo un 0,3%. Se ha puesto de manifiesto la predilección de los criadores por determinados tipos de merino lo que podría poner en peligro la variabilidad genética intrarracial del Merino haciendo desaparecer alguna de las estirpes tradicionales, que por sus características morfológicas y productivas son menos rentables económicamente. Las dos estirpes con más influencia en la población son las que han presentado unos valores de variabilidad genética, estimada a partir de marcadores moleculares, mas reducida. Sin embargo las estirpes “Granda” y “López-Montenego” han presentado los valores mayores de heterocigosidad observada (Ho) (0,67 y 0,70), esperada (He) (0,68, 0,72) y número medio de alelos por locus (Nma) (7,45 y 7,97) respectivamente. La comparación entre ambas metodologías determinó que el coeficiente de diferenciación genética (FST) para los animales de las cuatro líneas identificadas, fue un 30% más elevado mediante genealogías que mediante información molecular. Preliminary assessment of population structure of Spanish Merino Breed: traditional strains situation using genealogical and molecular analysis Merino sheep breed is the most important breed in Spain according to their census. It is the most censed meat production sheep breed in Spain. It has played an important role in the politic, biologic, economical and livestock aspects. The aim of this study is assess the situation of the most important traditional strains in Spain of Merino breed (“Serena”, “Higalgo”, “Granda” y “López-Montenegro”) using genealogical and molecular information. The most influential strains in the present Merino population are “Serena” and “Hidalgo” (27% and 15% respectively). “Lopez-Montenegro” and “Granda” strains have only 0.3% of influence. The breeder’s preferences in raise some strains have been evidenced. This task could endanger the intra population genetic variability of the Merino breed and some traditional strains could disappear because of their economical worse morphological and productive trait. The two more influential strains (“Serena” and “Hidalgo”) have shown the lowest value of the molecular variability parameters. However the highest values have been shown by “Granda” and “López-Montenego” strains (observed heterozygosis (Ho) = 0.67 and 0.70; expected heterozygosis (He) = 0,68 and 0,72; and average number of alleles per locus was 7,45 and 7,97 respectively). We found that the coefficient of genetic differentiation value (FST) using genealogical information, for the four strains analyzed, was 30% higher than using molecular information.

La terneza de la carne es un factor determinante del nivel de satisfacción del consumidor. Sin embargo, la disminución de su elevada variabilidad es difícil de llevar a cabo por el gran número de factores genéticos y no genéticos que la determinan. De la misma forma su mejora está condicionada por la falta de criterios objetivos de selección, especialmente de aquellos que pueden ser realizados en el animal in vivo. la identificación de marcadores genéticos en el bovino relacionada con el carácter terneza de la carne proporciona nuevos criterios de selección para facilitar la mejora genética de la calidad de la carne. Destacan en este sentido los genes responsables del complejo enzimático calpaína (μ y m-calpaína)-calpastatina. En diversas razas extranjeras se ha encontrado que variaciones en una sola base (SNP: Single Nucleotide Polymorphism) de estos genes pueden determinar variaciones en la terneza de la carne. Los objetivos del presente estudio son la caracterización genética para los genes que codifican a los enzimas μ-calpaína (CAPN1) y calpastatina (CAST) de una muestra de las razas autóctonas que se están explotando en el suroeste español. Nuestros resultados muestran que las tres razas mayoritarias de la Dehesa española están en una situación muy favorable en cuanto al polimorfismo del gen CAPN1 y CAST con frecuencias génicas más altas de los alelos más propicios para la terneza de la carne que el resto de las razas analizadas. Así para el sitio 4.558 del gen CAPN1 las razas Retinta, Avileña y Morucha presentan unos porcentajes del alelo más favorable (G en este caso) del 66,7; 64 y 35% respectivamente, para el gen CAST los resultados son aún más alentadores puesto que los porcentajes de alelos favorables son en el caso de la raza Retinta del 86%, Morucha 75% y Avileña 68,7%. Una vez que sea realizada la comprobación de que dicho alelos tengan el efecto deseado reseñado en las razas europeas en las nuestras sería recomendable la utilización de estos marcadores como criterios de selección (MAS. Molecular Assited Selection) in vivo, al menos en las tres razas maternales de la dehesa.

Ministerio de Agricultura y Pesca, Alimentación y Medio Ambiente

Ministerio de Agricultura, Pesca y alimentación PAI AGR-158

Mitochondrial DNA variability was studied in indigenous Iberian sheep and results analysed for each of the four morphological trunks. Three maternal lineages, B, A and C were identified. Mean nucleotide diversity for each of the ovine groups was estimated, showing a lower value for the churro trunk, intermediate values for entrefino and merino trunks, while the iberian group had the greatest mitochondrial diversity. Within the churro trunk all mitochondrial DNA sequences belonged to haplogroup B, also known as European type, and among churro breeds Latxa sheep showed the lowest diversity of all Iberian sheep analysed. A few animals of the entrefino trunk showed a maternal A, or Asiatic, lineage, namely Spanish Manchega and Portuguese Serra da Estrela sheep. In the merino group Merino Branco breed showed differences with the rest of sheep, particularly much greater nucleotide diversity and the presence of animals of maternal lineage A. On the other hand, moderate diversity was evident among the rest of merino populations, as it was the case of Spanish pure Merino for which all animals belonged to maternal lineage B. Finally, the iberian trunk showed the highest mean nucleotide diversity and in this group maternal lineage C was identified. The presence of this mitochondrial DNA type was evident in both breeds corresponding to this trunk: Montesina and Ojalada. This result is of particular relevance since this maternal lineage has been discovered quite recently and mainly in Asiatic ovines. Se estudió la variabilidad en el DNA mitocondrial en distintas razas ovinas ibéricas y los resultados obtenidos se analizaron para cada uno los cuatro troncos etnológicos. Se identificaron los tres linajes maternos conocidos como B, A y C. La diversidad nucleotídica promedio estimada para cada uno de los grupos ovinos fue menor para el tronco churro, intermedia para los grupos entrefino y merino, mientras que el tronco ibérico mostró la mayor diversidad mitocondrial. En el tronco churro todas las secuencias de DNA mitocondrial correspondieron al haplogrupo B, también denominado europeo, y entre sus razas la Latxa fue la de menor diversidad de todos las razas Ibéricas analizadas. En el tronco entrefino se identificaron unos pocos animales del linaje materno A, o asiático, en concreto en la raza española Manchega y en la portuguesa Serra da Estrela. En la agrupación merina se encontraron diferencias entre la raza Merino Branco y el resto, mostrando la primera una diversidad nucleotídica muy superior, así como la presencia de algunos animales del linaje A. Por el contrario, en el resto de las poblaciones merinas, entre ellas el Merino puro español, se detectó una variabilidad moderada y sus animales pertenecían en todos los casos al linaje materno B. Finalmente, el tronco ibérico presentó el valor promedio más elevado de diversidad nucleotídica y en esta agrupación ovina se identificó el linaje materno C. La presencia de este tipo de DNA mitocondrial fue puesta de manifiesto en ambas razas representantes de este tronco, Montesina y Ojalada. Este resultado es de particular relevancia dado que este linaje materno ha sido descubierto no hace mucho tiempo y fundamentalmente en ovinos asiáticos.

Los planes de mejora del ovino autóctono español tienen en la actualidad como objetivo de selección los caracteres ligados al crecimiento predestete y postdestete y en algunos casos la prolificidad, debido principalmente al carácter maternal de estas razas. La valoración genética para estos caracteres, basada en modelos cuantitativos con metodología Blup, exige un sistema de control de rendimientos en finca que generalmente se efectúa mediante controles periódicos en tiempo (pesos vivos a diferentes edades), con estimación de la producción total a una edad-tipo determinada (peso vivo a 30 días por ejemplo en el caso del Merino).

El nivel de grasa intramuscular o marbling constituye uno de los principales atributos de la calidad de la carne. Los avances en genética molecular en las últimas décadas han permitido la identificación de gran cantidad de marcadores genéticos asociados a genes que afectan a caracteres de interés en producción ganadera, incluyendo genes simples con efectos importantes en el fenotipo o QTL (regiones genómicas que afectan a caracteres cuantitativos). Estas nuevas tecnologías han proporcionado herramientas con un gran potencial para mejorar la respuesta a la selección, especialmente cuando se trata de caracteres que son difíciles de mejorar a partir de prácticas convencionales por su baja heredabilidad o porque los métodos para cuantificar su expresión son caros, destructivos, poco precoces en la vida del animal o difíciles de llevar a cabo. El objetivo de este trabajo ha sido llevar a cabo un estudio preliminar para caracterizar a las razas bovinas de fomento ligadas a la dehesa para el gen que codifica al enzima diacilglicerol O-aciltransferansa 1, enzima vinculado al carácter infiltración de grasa intramuscular, uno de los principales atributos de la calidad de la carne para el consumidor.