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Nicolas Papon, Benoit Briard, Thierry Fontaine, Neil A. R. Gow, Thirumala-Devi Kanneganti, Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100 (CEPR), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), St Jude Children's Research Hospital, University of Aberdeen, University of Exeter, Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Université d'Angers (UA), Université de Brest (UBO), NG acknowledges welcome support of a Senior Investigator (101873/Z/13/Z), Collaborative (200208/A/15/Z, 215599/Z/19/Z) and Strategic Awards (097377/Z11/Z) and the MRC Centre for Medical Mycology [MR/N006364/2]., Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques (ICAT), and Fontaine, Thierry

Wenxia Fang, Tuo Wang, Pingzhen Wei, Liyanage D. Fernando, Thierry Fontaine, Cheng Jin, Jean-Paul Latgé, Malitha C. Dickwella Widanage, Arnab Chakraborty, Louisiana State University (LSU), Guangxi Academy of Sciences [Nanning, China], Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Crete [Heraklion] (UOC), This work was supported by the National Institutes of Health (NIH) grant AI149289 toT.W. Preparation of isotopically labeled samples was supported by the Bagui ScholarProgram Fund of Guangxi Zhuang Autonomous Region 2016A24 to C.J. A portion ofthis work was performed at the National High Magnetic Field Laboratory, which issupported by the National Science Foundation Cooperative Agreement No. DMR-1644779 and the State of Florida., Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Rosemary Ann Barnes, Laurence Decourty, Sylvie Cupferman, Florence Menard-Szczebara, Christophe d'Enfert, Cosmin Saveanu, Maria Dalko-Sciba, Jean-Yves Maillard, Sadri Znaidi, Rebecca Wesgate, Murielle Chauvel, Tristan Rossignol, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Microbiologie Moléculaire, Vaccinologie et Développement Biotechnologique (LR11IPT01), Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Cardiff University, Génétique des Interactions macromoléculaires, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), L’Oréal Research and Innovation, University Hospital of Wales [Cardiff, UK], Cardiff University (Cardiff University), L'Oreal Group, L'Oreal, France, ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-08-JCJC-0019,GENO-GIM,Obtention d'une carte d'interactions génétiques à l'échelle génomique chez la levure(2008), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Génétique des Interactions macromoléculaires / Genetics of Macromolecular Interactions, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and University Hospital of Wales (UHW)

Rocchi, S, Scherer, E, Mengoli, C, Alanio, A, Botterel, F, Bougnoux, M, Bretagne, S, Cogliati, M, Cornu, M, Dalle, Frédéric, Damiani, Céline, Denis, J, Fuchs, S, Gits-Muselli, M, Hagen, F, Halliday, C, Hare, R, Iriart, Xavier, Klaassen, C, Lackner, M, Lengerova, M, Letscher-Bru, V, Morio, F, Nourrisson, C, Posch, W, Sendid, B, Springer, J, Willinger, B, White, P, Barnes, R, Cruciani, M, Donnelly, J, Loeffler, J, Millon, L, Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Università degli Studi di Padova = University of Padua (Unipd), Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals (CNRMA), Institut Pasteur [Paris] (IP), Mycologie moléculaire - Molecular Mycology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpitaux Universitaire Saint-Louis, Lariboisière, Fernand-Widal, Université Paris Cité (UPCité), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Faculté de médecine (UPEC Médecine), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA), CHU Henri Mondor [Créteil], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Università degli Studi di Milano = University of Milan (UNIMI), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Vin Aliment Microbiologie et Stress (VAlMiS), Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de parasitologie et de mycologie médicales [CHU Amiens], CHU Amiens-Picardie, Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294 (AGIR ), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Laboratoire de Parasitologie et de Mycologie Médicale [Strasbourg], Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Leopold Franzens Universität Innsbruck - University of Innsbruck, UFR Médecine [Santé] - Université Paris Cité (UFR Médecine UPCité), Univ Utrecht, Westerdijk Fungal Biodivers Inst, Fungal Physiol, Uppsalalaan 8, NL-3584 CT Utrecht, Netherlands, Partenaires INRAE, University Medical Center [Utrecht], Shanghai Key Laboratory of Molecular Medical Mycology, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Statens Serum Institut [Copenhagen], Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Erasmus University Medical Center [Rotterdam] (Erasmus MC), Innsbruck Medical University = Medizinische Universität Innsbruck (IMU), University Hospital Brno, CHU Strasbourg, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Clermont-Ferrand, University Hospital Wuerzburg / Universitäts­klinikum Würzburg, Medizinische Universität Wien = Medical University of Vienna, Public Health Wales [Cardiff, Royaume uni], University of Texas Health Science Center at San Antonio [San Antonio, Tx, USA], This work was supported by a grant from the French Ministry of Health PHRC (Projet Hospitalier de Recherche Clinique) national-ModiMucor 2014-A00580-47., Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Génomique évolutive, modélisation et santé (CNRS-UMR2000), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Université Paris Cité - UFR Médecine [Santé] (UPCité UFR Médecine), CHU Henri Mondor, Biologie des ARN des Pathogènes fongiques - RNA Biology of Fungal Pathogens, Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Cité (UPCité), University of Innsbruck, Service de Parasitologie et Mycologie, CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Padova Medical School, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPC), Université Paris Cité - UFR Médecine Paris Centre [Santé] (UPC Médecine Paris Centre), Université Paris Cité (UPC), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Cité (UPC), and Università degli Studi di Milano [Milano] (UNIMI)

Marisa Valentine, Mark S. Gresnigt, Carol A. Munro, Karine Roget, Ricardo Fróis-Martins, Salomé LeibundGut-Landmann, Pieter Van den Abbeele, Yoan Emritloll, Frédéric Bequet, Moran Morelli, Leovigildo-Rey Alaban, Nathaniel Cole, Ilse D. Jacobsen, Mihai G. Netea, Stéphanie Bornes, Sayoni Chakraborty, Alistair J. P. Brown, Margot Delavy, Ann-Kristin Kaune, Alan W. Walker, Diletta Rosati, Peter A Warn, Daria Kosmala, Marie-Elisabeth Bougnoux, Claudia Thoral, Chaysavanh Manichanh, Benoît Marsaux, Vincent Thomas, Zixuan Xie, Christophe d'Enfert, Bernhard Hube, Mélanie Legrand, Karla Queiroz, Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Aberdeen, BIOASTER Microbiology Technology Institute [Lyon], École Doctorale Bio Sorbonne Paris Cité [Paris] (ED562 - BioSPC), Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Cité (UPCité), Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology (Hans Knoell Institute), Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany], ProDigest BVBA, Partenaires INRAE, Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH), Mimetas, Radboud University Medical Center [Nijmegen], Vall d'Hebron University Hospital [Barcelona], Magic Bullet Consulting, Unité Mixte de Recherche sur le Fromage (UMRF), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), NEXBIOME Therapeutics, University of Exeter, We received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Sklodowska-Curie action, Innovative Training Network: FunHoMic, grant N° 812969. CdE received funding from the French Government ‘Investissement d'Avenir’ program (Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID), the Agence Nationale de la Recherche (ERA-Net Infect-ERA, FUNCOMPATH, ANR-14-IFEC-0004), the EU Horizon2020 consortium ‘Host-Directed Medicine in invasive FUNgal infections’—HDM-FUN (Grant Agreement 847507). SLL and CdE received funding from the Swiss National Science Foundation (Sinergia program, #CRSII5_173863). BIOASTER received funding from the French Government ‘Investissement d'Avenir’ program (Grant No. ANR-10-AIRT-03). MSG was supported by a Humboldt Research Fellowship for Postdoctoral Researchers by the Alexander von Humboldt-Foundation and the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) Emmy Noether Program (project no. 434385622/GR 5617/1-1). BH was supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) project Hu 532/20-1, project C1 within the Collaborative Research Centre (CRC)/Transregio 124 FungiNet and the Balance of the Microverse Cluster under Germany´s Excellence Strategy—EXC 2051–Project-ID 390713860, the EU Horizon2020 consortium ‘Host-Directed Medicine in invasive FUNgal infections’—HDM-FUN (Grant Agreement 847507), the Leibniz Association Campus InfectoOptics SAS-2015-HKI-LWC and the Wellcome Trust (215599/Z/19/Z). IDJ was supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) project C5 within the Collaborative Research Centre (CRC)/Transregio 124 FungiNet and the Balance of the Microverse Cluster under Germany´s Excellence Strategy—EXC 2051–Project-ID 390713860, the Leibniz Association Campus InfectoOptics SAS-2015-HKI-LWC and the Wellcome Trust (Grant 215599/Z/19/Z). CM received funding from the the Instituto de Salud Carlos III/FEDER. MGN was supported by an ERC Advanced Grant (#833247) and a Spinoza grant of the Netherlands Organization for Scientific Research. CAM was supported by EU Horizon2020 consortium ‘Host-Directed Medicine in invasive FUNgal infections’—HDM-FUN (Grant Agreement 847507) and the Wellcome Trust Strategic Award for Medical Mycology and Fungal Immunology (097377/Z/11/Z). AWW receives core funding support from the Scottish Government's Rural and Environment Science and Analytical Services (RESAS). AJPB was supported by a programme grant from the UK Medical Research Council (MR/M026663/1) and by the Medical Research Council Centre for Medical Mycology at the University of Exeter (MR/N006364/1)., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-14-IFEC-0004,FunComPath,From fungal commensalism to pathogenicity:dissection of the colonization-to-infection shift of Candida albicans(2014), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,BIOASTER(2010), European Project: 812969,H2020-MSCA-ITN-2018,FunHoMic(2019), European Project: 847507,H2020-SC1-2019-Two-Stage-RTD,HDM-FUN(2020), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), École Doctorale Bio Sorbonne Paris Cité [Paris] (ED BioSPC), Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université de Paris (UP), Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut Català de la Salut, [d'Enfert C] Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques, Département de Mycologie, Institut Pasteur, USC 2019 INRA, 75015 Paris, France. [Kaune AK] Aberdeen Fungal Group, Institute of Medical Sciences, University of Aberdeen, Ashgrove Road West, Foresterhill, Aberdeen AB25 2ZD, UK. [Alaban LR] BIOASTER Microbiology Technology Institute, 69007 Lyon, France. Université de Paris, Sorbonne Paris Cité, 75015 Paris, France. [Chakraborty S] Microbial Immunology Research Group, Emmy Noether Junior Research Group Adaptive Pathogenicity Strategies, and the Department of Microbial Pathogenicity Mechanisms, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology – Hans Knöll Institute, 07745 Jena, Germany. Institute of Microbiology, Friedrich Schiller University, 07743 Jena, German. [Cole N] Gut Microbiology Group, Rowett Institute, University of Aberdeen, Ashgrove Road West, Foresterhill, Aberdeen AB25 2ZD, UK. [Delavy M] Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques, Département de Mycologie, Institut Pasteur, USC 2019 INRA, 75015 Paris, France. Université de Paris, Sorbonne Paris Cité, 75015 Paris, France. [Manichanh C] Grup de Recerca en Microbioma Intestinal, Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain, and Vall d'Hebron Barcelona Hospital Campus

Thierry Fontaine, Jean-Paul Latgé, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Crete [Heraklion] (UOC), This research was funded by the Aviesan project Aspergillus, the French Government’s Investissement d’Avenir program, Laboratoire d’Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (grant ANR-10-LABX-62-IBEID), la Fondation pour la Recherche Médicale (DEQ20150331722 LATGE Equipe FRM 2015) and ANR-DFG AfuINF., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Christophe d'Enfert, Marie-Elisabeth Bougnoux, Nicolas Papon, Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Université d'Angers (UA), SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques (ICAT), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Parasite (GEIHP), Biologie et Pathogénicité fongiques, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris]

François Danion, Vishukumar Aimanianda, Jagadeesh Bayry, Amélie Duréault, Sarah Sze Wah Wong, Marie-Elisabeth Bougnoux, Colas Tcherakian, Marie-Alexandra Alyanakian, Hélène Guegan, Anne Puel, Capucine Picard, Olivier Lortholary, Fanny Lanternier, Jean-Paul Latgé, Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Aspergillus, Institut Pasteur [Paris], Immuno-pathologie et immuno-intervention thérapeutique = Immunopathology and Therapeutic Immuno-intervention [CRC], Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), Unité de Parasitologie-Mycologie, Service de Microbiologie [Hôpital Necker-Enfants-Malades, Paris], Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service de pneumologie [Hôpital Foch], Hôpital Foch [Suresnes], Immunologie biologique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de Parasitologie-Mycologie [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Rockefeller University [New York], Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Centre de Référence Déficits Immunitaires Héréditaires (CEREDIH), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Paris (UP), Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals (CNRMA), Mycologie moléculaire - Molecular Mycology, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported by the French national reference center for Primary Immunodeficiencies [CEREDIH, Hôpital Necker-Enfants malades, Assistance Publique-Hôpitaux (AP-HP) de Paris, Paris, France]. VA was supported by Franco-Indian CEFIPRA (project No. 5403-1) and ANR-DFG AfuINT grants. Imagine Institute work was supported by the Agence Nationale de la Recherche – Investissements d'Avenir program (ANR-10-IAHU-01)., French national reference center for Primary Immunodeficiencies [CEREDIH, Hopital Necker-Enfants malades, Assistance Publique-Hopitaux (APHP) de Paris, Paris, France]Franco-Indian CEFIPRA5403-1, ANR-10-IAHU-0001,Imagine,Institut Hospitalo-Universitaire Imagine(2010), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut Pasteur [Paris] (IP), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aimanianda, Vishukumar, Instituts Hospitalo-Universitaires - Institut Hospitalo-Universitaire Imagine - - Imagine2010 - ANR-10-IAHU-0001 - IAHU - VALID, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École pratique des hautes études (EPHE), Immunopathologie et immunointervention thérapeutique (CRC - Inserm U1138), École pratique des hautes études (EPHE)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Biologie et Pathogénicité fongiques, Service de pneumologie [Hôpital Foch, Suresnes], Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Génétique Humaine des Maladies Infectieuses (Equipe Inserm U1163), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-10-IAHU-0001/10-IAHU-0001,Imagine,Imagine(2010)

Amitabha Chattopadhyay, Neeraj Chauhan, Parijat Sarkar, Naseem A. Gaur, Dominique Sanglard, Alix T. Coste, Brooke D. Esquivel, Nitesh Kumar Khandelwal, Murielle Chauvel, Rajendra Prasad, Meghna Gupta, Paola Coccetti, Alok K. Mondal, Theodore C. White, Ashutosh Singh, Christophe d'Enfert, Jawaharlal Nehru University (JNU), International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology [New Delhi] (ICGEB), Rutgers, The State University of New Jersey [New Brunswick] (RU), Rutgers University System (Rutgers), CSIR - Centre for Cellular and Molecular Biology (CCMB), University of Missouri [Kansas City] (UMKC), University of Missouri System, Università degli Studi di Milano-Bicocca [Milano] (UNIMIB), Lucknow University, Université de Lausanne (UNIL), University of California [San Francisco] (UCSF), University of California, Institut Pasteur [Paris], Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, Government of India [BT/01/CEIB/10/III/02, BT/PR7392/MED/29/652/2012, BT/PR14879/BRB10/885/2010], National Institutes of Health [R01AI124499], DST PURSE grant, Khandelwal, N, Chauhan, N, Sarkar, P, Esquivel, B, Coccetti, P, Singh, A, Coste, A, Gupta, M, Sanglard, D, White, T, Chauvel, M, Denfert, C, Chattopadhyay, A, Gaur, N, Mondal, A, Prasad, R, Università degli Studi di Milano-Bicocca = University of Milano-Bicocca (UNIMIB), Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), University of California [San Francisco] (UC San Francisco), University of California (UC), Institut Pasteur [Paris] (IP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Prasad, Rajendra

Shantanu Chowdhury, Kaustuv Sanyal, Hiram Sanchez, Sophie Bachellier-Bassi, Rima Singha, Christophe d'Enfert, Laxmi Shanker Rai, Tanmoy Chakraborty, David R. Andes, Bipin Chand, Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research (JNCASR), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Wisconsin-Madison, Genotypic Technology Private Limited, CSIR Institute of Genomics and Integrative Biology [New Delhi] (IGIB), This project was supported by a Science and Engineering Research Board (SERB), grant no. SR/SO/BB-0107/2012 (URL: http://www.serb.gov.in/home.php) to KS. This work was partially supported by the Tata Innovation Fellowship (URL: http://www.dbtindia.nic.in/tata-innovation-fellowship) (grant no. BT/HRD/35/01/03/2017) to KS, intramural financial support from Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research (JNCASR) (URL: http://www.jncasr.ac.in), and grant no. BT/INF/22/SP27679/2018 of Department of Biotechnology in Life Science Research, Education and Training (DBT-BUILDER) (URL: http://www.dbtindia.nic.in/wp-content/uploads/Guidelines_BiotechFacility12112015.pdf) to JNCASR. This project is also supported by Fondation pour la Recherche Médicale (FRM DBF20160635719) https://www.frm.org/ L.S.R. Wellcome Trust DBT India Alliance (500127/Z/09/Z). https://www.indiaalliance.org/ S.C. National Institute of Health (R01AI073289). https://www.nih.gov/ D.R.A Fondation pour la Recherche Médicale (FRM DBF20160635719) https://www.frm.org/ C.D. French Government’s Investissements d'Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID) https://anr.fr/ProjetIA-10-LABX-0062 C.D., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Fanny Lanternier, Christophe d'Enfert, Jessica Quintin, Guilhem Janbon, Biologie des ARN des Pathogènes fongiques - RNA Biology of Fungal Pathogens, Institut Pasteur [Paris] (IP), Immunologie des Infections fongiques - immunology of fungal infections, Mycologie moléculaire - Molecular Mycology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris], Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Microbiologie et Chaîne Alimentaire (MICA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Priya Jaitly, Adeline Feri, Kaustuv Sanyal, Mélanie Legrand, Christophe d'Enfert, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research (JNCASR), Cellule Pasteur, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité, M.L., C.D., and K.S. are supported by a grant from the Indo French Centre for the Promotion of Advanced Research (CEFIPRA, Project no. 5703-2). Work in the laboratory of C.D. has been supported by the French Government’s Investissement d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID). A.F. was the recipient of a PhD. grant from INRA Jouy-en-Josas and Institut Pasteur. Work in the laboratory of K.S. is supported by grants from the Department of Biotechnology, Government of India (BT/PR13909/BRB/10/1432/2015, BT/PR14557/BRB/10/15529/2016, BT/HRD/35/01/03/2017) and a grant for Life Science Research, Education, and Training (BT/INF/22/SP27679/2018). P.J. and K.S. are also financially supported by an intramural Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research (JNCASR) grant., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Christophe d'Enfert, Matthieu Palayret, Emilie Sitterlé, Natacha Sertour, Corinne Maufrais, Marie-Elisabeth Bougnoux, Cellule Pasteur, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité, Unité de Parasitologie-Mycologie, Service de Microbiologie [Hôpital Necker-Enfants-Malades, Paris], Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Biologie de l'École polytechnique (X-DEP-BIO), École polytechnique (X), DIM Malinf - Region Ile-de-France (DIM Malinf - Region Ile-de-France), French Government's Investissement d'Avenir program (Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases) [ANR-10-LABX-62-IBEID], We thank Anne-Flore Bonvalot, Camille Phan and Charles Pinard for their precious help in this work., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Bougnoux, Marie-Elisabeth, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Corinne Maufrais, Christophe d'Enfert, Timea Marton, Adeline Feri, Pierre-Henri Commere, Mélanie Legrand, Cellule Pasteur, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Cytométrie (Plate-forme), Institut Pasteur [Paris], Cytometrie et Biomarqueurs – Cytometry and Biomarkers (UTechS CB), Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), T.M. is the recipient of a Ph.D. fellowship from the Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases (ANR-10-LABX-62-IBEID). A.F. was the recipient of a Ph.D. fellowship from INRA and Institut Pasteur. We acknowledge support from the French Government’s Investissement d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases [ANR-10-LABX-62-IBEID])., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Legrand, Mélanie, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Jean-Pierre Gangneux, Muriel Cornet, Sébastien Bailly, Chantal Fradin, Céline Féger, Jean-François Timsit, Olivier Leroy, Boualem Sendid, Marie-Elisabeth Bougnoux, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Grenoble, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lille Inflammation Research International Center - U 995 (LIRIC), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), EMIBiotech, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Chatiliez, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), The study data were analyzed and interpreted independently of the study’ sponsor, MSD France., Gangneux, Jean-Pierre, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Lille Inflammation Research International Center (LIRIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)

Marie-Elisabeth Bougnoux, Gavin Sherlock, Patrick Wincker, Marina Marcet-Houben, Emmanuelle Permal, Toni Gabaldón, Dorothée Diogo, Christophe Battail, Natacha Sertour, Patrice Le Pape, Laurence Ma, Jong Hee Shin, Andrew M. Borman, Julie Poulain, Robin C. May, Jeanne Ropars, Soo Hyun Kim, Christiane Bouchier, Kevin Mosca, Shangrong Fan, Christophe d'Enfert, Corinne Maufrais, Kerstin Voelz, Orazio Romeo, Guillaume Laval, Anuradha Chowdhary, Aurélie Perin, Katja Schwartz, Ecologie Systématique et Evolution (ESE), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Genomic Regulation (CRG-UPF), CIBER de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona], Unité de Recherche Génomique Info (URGI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics, Génomique (Plate-Forme), Institut Pasteur [Paris], Centre de Recherche et Innovation Technologique (CITECH), Stanford University [Stanford], University of Birmingham [Birmingham], Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Génomique métabolique (UMR 8030), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Public Health England [London], University of Delhi, Peking University [Beijing], Chonnam National University [Gwangju], Cibles et médicaments de l'infection, de l'immunité et du cancer (IICiMed), Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), University of Messina, Centro Neurolesi Bonino Pulejo Messina (IRCCS Messina), Centro de Regulación Genómica (CRG), ICREA Infection Biology Laboratory (Department of Experimental and Health Sciences), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], the Genoscope (projet #15 AP2008/2009 SNP C. albicans) and the Swiss National Science Foundation (Sinergia CRSII5_173863/1) to C.E., J.R. was supported by a Pasteur-Roux fellowship from Institut Pasteur. D.D. was the recipient of a PhD fellowship from Institut National de la Recherche Agronomique. E.P. was the recipient of a post-doctoral fellowship from the Wellcome Trust (WT088858MA). M.M.-H. and T.G. were supported by a grant from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, BFU2015–67107 cofunded by the European Regional Development Fund (ERDF). C.E., M.-E.B., S.H.K., and J.H.S. were supported by a grant from the French and Korean Ministries for Foreign Affairs (PHC STAR 2011 25841YA). R.C.M. was supported by project MitoFun, funded by the European Research Council under the European Union’s Seventh Framework Programme (FP/2007–2013)/ERC Grant Agreement No. 614562 and by a Wolfson Research Merit Award from the Royal Society. R.C.M. and K.V. were funded by the Surgical Reconstruction and Microbiology Research Centre, which is supported by the National Institute of Health Research, UK. G.S. was supported by the NIH grants R01-HG003468 and RO1-DE015873. C.E. and T.G. are members of the CNRS GDRI 0814 iGenolevures consortium. High-throughput sequencing has been performed on the Genomics Platform, member of France Génomique consortium (ANR10-INBS-09-08)., We thank Bernard Dujon and Tatiana Giraud for providing insights on an earlier version of this manuscript., ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), ANR-10-INBS-09-01/10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), European Project: 614562,EC:FP7:ERC,ERC-2013-CoG,MITOFUN(2014), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF), Génomique (Plate-Forme) - Genomics Platform, Institut Pasteur [Paris] (IP), Stanford University, Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité (IICiMed), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), and Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Sophie Bachellier-Bassi, Christophe d'Enfert, Iryna Denega, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], This project has received funding from the European Union's Horizon 2020 255research and innovation programme under the Marie Sklodowska-Curie grant agreement No 665807, and from the Institut Carnot Pasteur Microbes & Santé. This work has been supported by grants from the French Government’s Investissement d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID) to C.d’E, ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), European Project: 665807,H2020,H2020-MSCA-COFUND-2014,PASTEURDOC(2015), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), and Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases

Thierry Jouault, Frédéric Dalle, Sophie Bachellier-Bassi, Ralitsa Atanassova, Frédéric Vincent, Valérie Gouyer, Christophe d'Enfert, Carol A. Munro, Natacha Sertour, Jean-Luc Desseyn, Sadri Znaidi, Arturo Hernández-Cervantes, Marie-Elisabeth Bougnoux, Lasse van Wijlick, Université de Tunis El Manar (UTM), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Microbiologie Moléculaire, Vaccinologie et Développement Biotechnologique (LR11IPT01), Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Lille Inflammation Research International Center - U 995 (LIRIC), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, University of Aberdeen, Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), This work has been supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (KANJI, ANR‐08‐MIE‐033‐01 to C. d'E. and F. D., ERA‐Net Infect‐ERA, FUNCOMPATH, ANR‐14‐IFEC‐0004, and CANDIHUB, ANR‐14‐CE‐0018 to C. d'E.), the French Government's Investissement d'Avenir program (Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR‐10‐LABX‐62‐IBEID to C. d'E. and Institut de Recherche Technologique BIOASTER, ANR‐10‐AIRT‐03 to C. d'E., F. D., and T. J.), the European Commission (FinSysB, PITN‐GA‐2008‐214004 to C. d'E.), and the Wellcome Trust (The Candida albicans ORFeome project, WT088858MA to C. d'E. and C. M.). C. M. acknowledges support from the Medical Research Council, UK (New Investigator Award, G0400284), the MRC Centre for Medical Mycology (MR/N006364/1), and the University of Aberdeen. S. Z. is an Institut Pasteur International Network Affiliate Program Fellow. S. Z., L. v. W., and A. H. C. were the recipients of post‐doctoral fellowships from the European Commission (FINSysB, PITN‐GA‐2008‐214004 to S. Z.), the Agence Nationale de la Recherche (KANJI, ANR‐08‐MIE‐033‐01 to S. Z., ERA‐Net Infect‐ERA, FUNCOMPATH, ANR‐14‐IFEC‐0004 to A. H. C., CANDIHUB, ANR‐14‐CE‐0018 to L. v. W), and the French Government's Investissement d'Avenir program (Institut de Recherche Technologique BIOASTER, ANR‐10‐AIRT‐03 to S. Z. and A. H. C.)., ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans(2008), ANR-14-IFEC-0004,FunComPath,From fungal commensalism to pathogenicity:dissection of the colonization-to-infection shift of Candida albicans(2014), ANR-14-CE14-0018,CANDIHUB,Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l'homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,BIOASTER(2010), European Project: 214004,PEOPLE,FP7-PEOPLE-2007-1-1-ITN,FINSYSB(2008), Université Tunis El Manar (UTM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Lille Inflammation Research International Center (LIRIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), KANJI, ANR-08-MIE-033-01,KANJI, ANR-08-MIE-033-01,KANJI, ANR-08-MIE-033-01, ANR-14-CE14-0018,CANDIHUB,Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l’homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida(2014), ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,Investissement d'Avenir BIOASTER(2012), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Lille Inflammation Research International Center - U 995 [LIRIC], Ben Hassine, AbdelHakim, Maladies Infectieuses et environnement - Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans - - KANJI2008 - ANR-08-MIEN-0033 - MIE - VALID, Recherche transnationale sur les maladies infectieuses humaines - From fungal commensalism to pathogenicity:dissection of the colonization-to-infection shift of Candida albicans - - FunComPath2014 - ANR-14-IFEC-0004 - IFEC - VALID, Appel à projets générique - Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l'homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida - - CANDIHUB2014 - ANR-14-CE14-0018 - Appel à projets générique - VALID, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, Instituts de recherche technologique - BIOASTER - - BIOASTER2010 - ANR-10-AIRT-0003 - AIRT - VALID, and Pathogenomics and Systems Biology of Fungal Infections - An Integrative Approach - FINSYSB - - PEOPLE2008-10-01 - 2012-09-30 - 214004 - VALID

Rivoisy, Claire, Vena, Antonio, Schaeffer, Laura, Charlier, Caroline, Fontanet, Arnaud, Delahaye, François, Bouza, Emilio, Lortholary, Olivier, Lefort, Agnès, Yazdanpanah, Yazdan, Wolff, Michel, Houze, Sandrine, Ferry, Tristan, Wallon, Martine, Strady, Christophe, Toubas, Dominique, Bréchot, Nicolas, Henry, Benoit, Fekkar, Arnaud, Fourme, Thierry, Amouroux, Isabelle, Mainardi, Jean-Luc, Dannaoui, Eric, Rogeaux, Olivier, Levast, Marion, Chirouze, Catherine, Million, Laurence, Bastides, Frédéric, Chandenier, Jacques, Lançon, Jean-Pierre, Ovize, Anne, Abgueguen, Pierre, Bouchara, Jean-Philippe, Tric, Laurent, Habib, Gilbert, Gourriet, Frederic, Aaron, Laurent, Bougnoux, Marie Elisabeth, Camou, Fabrice, Accoceberry, Isabelle, Sánchez, Fernando Fernández, Noureddine, Mariam, Rosas, Gabriel, de la Torre Lima, Javier, Aramendi, José, Bereciartua, Elena, Victoria Boado, María, Campaña Lázaro, Marta, Goikoetxea, Josune, José Goiti, Juan, Hernández, José Luis, Iruretagoyena, José Ramón, Zuazabal, Josu Irurzun, López-Soria, Leire, Montejo, Miguel, Pérez, Pedro María, Rodríguez, Regino, Voces, Roberto, López, Mª Victoria García, Georgieva, Radka Ivanova, Solero, Manuel Márquez, Bailón, Isabel Rodríguez, Morales, Josefa Ruiz, Cuende, Ana María, Echeverría, Tomás, Fuerte, Ana, Gaminde, Eduardo, Goenaga, Miguel Ángel, Idígoras, Pedro, Iribarren, José Antonio, Yarza, Alberto Izaguirre, Urkola, Xabier Kortajarena, Reviejo, Carlos, Carrasco, Rafael, Climent, Vicente, Llamas, Patricio, Merino, Esperanza, Plazas, Joaquín, Reus, Sergio, Álvarez, Nemesio, Bravo-Ferrer, Jose María, Castelo, Laura, Cuenca, José, Llinares, Pedro, Rey, Enrique Miguez, Mayo, María Rodríguez, Sánchez, Efrén, Regueiro, Dolores Sousa, Martinez, Francisco Javier, del Mar Alonso, Mª, Castro, Beatriz, Marrero, Dácil García, Durán, Mª del Carmen, Gómez, Mª Antonia Miguel, Calzada, Juan La, Nassar, Ibrahim, Ciezar, Antonio Plata, Iglesias, José Mª Reguera, Asensio, Víctor, Costas, Carlos, de la Hera, Jesús, Suárez, Jonnathan Fernández, Fraile, Lisardo Iglesias, Arguero, Víctor León, Menéndez, José López, MenciaBajo, Pilar, Morales, Carlos, Torrico, Alfonso Moreno, Palomo, Carmen, Martínez, Begoña Paya, Esteban, Ángeles Rodríguez, García, Raquel Rodríguez, Asensio, Mauricio Telenti, Almela, Manuel, Armero, Yolanda, Azqueta, Manuel, Brunet, Merce, Cartañá, Ramón, Cervera, Carlos, Falces, Carlos, Fita, Guillermina, Fuster, David, de la Maria, Cristina García, Gatell, José, Pérez, Jaume Llopis, Marco, Francesc, Mestres, Carlos, Miró, José Mª, Moreno, Asunción, Ninot, Salvador, Quintana, Eduardo, Paré, Carlos, Pericás, Juan Manuel, Pomar, José, Ramírez, José, Rovira, Irene, Sitges, Marta, Soy, Dolors, Téllez, Adrián, Vila, Jordi, Bermejo, Javier, Cuerpo, Gregorio, de Egea, Viviana, Eworo, Alia, Cruz, Ana Fernández, Leoni, Mª Eugenia García, del Vecchio, Marcela González, Ramallo, Víctor González, Hernández, Martha Kestler, Marín, Mercedes, Martínez-Sellés, Manuel, Menárguez, Mª Cruz, Muñoz, Patricia, Rincón, Cristina, Rodríguez-Abella, Hugo, Rodríguez-Créixems, Marta, Pinilla, Blanca, Pinto, Ángel, Valerio, Maricela, Moreno, Eduardo Verde, Antorrena, Isabel, Loeches, Belén, Moreno, Mar, Ramírez, Ulises, Bastón, Verónica Rial, Romero, María, Saldaña, Araceli, Castillo, Carlos Armiñanzas, Arnaiz, Ana, Berrazueta, José, Bellisco, Sara, Belaustegui, Manuel Cobo, Durán, Raquel, Fariñas, MªCarmen, Fariñas-Álvarez, Concepción, Mazarrasa, Carlos Fernández, Izquierdo, Rubén Gómez, Rico, Claudia González, Díez, José Gutiérrez, Durán, Rafael Martín, Pajarón, Marcos, Parra, José Antonio, Teira, Ramón, Zarauza, Jesús, Pavía, Pablo García, González, Jesús, Orden, Beatriz, RAMOS, Antonio, González, Elena Rodríguez, Centella, Tomasa, Hermida, José Manuel, Luis Moya, José, Martín-Dávila, Pilar, Navas, Enrique, Oliva, Enrique, del Río, Alejandro, Ruiz, Soledad, Tenorio, Carmen Hidalgo, de Castro, Antonio, de Cueto, Marina, Gallego, Pastora, Acebal, Juan Gálvez, Baño, Jesús Rodríguez, de Alarcón, Arístides, García, Emilio, Haro, Juan Luis, Lepe, José Antonio, López, Francisco, Luque, Rafael, Alonso, Luis Javier, Gutiérrez, José Manuel Azcona, Blanco, José Ramón, García, Lara, Oteo, José Antonio, de Benito, Natividad, Gurguí, Mercé, Pacho, Cristina, Pericas, Roser, Pons, Guillem, Alvarez, M., Fernández, A, Prieto, A., Regueiro, Benito, Tijeira, E, Vega, Marino, Blasco, Andrés Canut, Mollar, José Cordo, Arana, Juan Carlos Gainzarain, Uriarte, Oscar García, López, Alejandro Martín, de Zárate, Zuriñe Ortiz, Matos, José Antonio Urturi, Nacle, Mª Belén, Sánchez-Porto, Antonio, Vallejo, Luis, ArribasLeal, José Mª, Vázquez, Elisa García, Torres, Alicia Hernández, Blázquez, Ana, de la Morena Valenzuela, Gonzalo, Alonso, Ángel, Aramburu, Javier, Calvo, Felicitas Elena, Rodríguez, Anai Moreno, Tarabini-Castellani, Paola, Gálvez, Eva Heredero, Bellido, Carolina Maicas, Pau, José Largo, Sepúlveda, Mª Antonia, Sierra, Pilar Toledano, Iqbal-Mirza, Sadaf Zafar, Alcolea, Eva Cascales, Serrano, Pilar Egea, Hernández Roca, José Joaquín, Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Institut des Maladies Génétiques Imagine [Paris], Hospital General Universitario 'Gregorio Marañón' [Madrid], Epidémiologie des Maladies Emergentes, Pasteur-Cnam risques infectieux et émergents (PACRI), Institut Pasteur [Paris]-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut Pasteur [Paris]-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris]-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Mère et enfant face aux infections tropicales (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de Parasitologie, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Matrice extracellulaire et dynamique cellulaire - UMR 7369 (MEDyC), SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut Élie Cartan de Lorraine (IECL), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Mycologie moléculaire, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des Maladies Infectieuses, CHR Chambéry, Laboratoire de Bactériologie, Centre Hospitalier Régional de Chambéry, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Service de Médecine Interne et Maladies Infectieuses [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), CHU Tours, Service de Parasitologie - Mycologie - Médecine Tropicale, Eurofins Biomnis [Lyon, France], Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Angers], Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Groupe d’Etude des Interactions Hôte-Pathogène, Université d'Angers (UA), Service de cardiologie, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Hôpital St-André, Réanimation, CHU Bordeaux [Bordeaux], Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universitad Politecnica de Alicante (UPA), Departamento de Lenguajes y Sistemas Informaticos, Instituto Tecnologico de Aragon (ITA), Instituto Tecnológico de Aragón, Department of Anatomy and Cell Biology [Montréal], McGill University, Universitat de Barcelona (UB), AIDS Research Group [Barcelona, Spain], August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute - IDIBAPS [Barcelona, Spain]-Hospital Clinic [Barcelona, Spain], Instituto Tecnológico de Tláhuac, Cardiology Department, Thorax Clinic Institute, Hospital Cliınic, Institut d'Investigacions Biomèdiques [Barcelona], Clinical Microbiology and Infectious Diseases Department, Universidad Complutense de Madrid [Madrid] (UCM), Universidade de Aveiro, Departamento de Quimica Organica [Universidad de Cordoba], Universidad de Córdoba [Cordoba], Department of Microbiology, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, University Rovirai Virgili de Tarragona (URV), Chercheur indépendant, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Universidad Complutense de Madrid = Complutense University of Madrid [Madrid] (UCM), Centro de Investigación Biomédica en Red Enfermedades Respiratorias (CIBERES), Epidémiologie des Maladies Emergentes - Emerging Diseases Epidemiology, Pasteur-Cnam Risques infectieux et émergents (PACRI), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Institut Pasteur [Paris] (IP)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Eurofins Biomnis, Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Instituto Tecnológico de Aragón (ITAINNOVA), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba], This work was supported by the Programa Multidisciplinar para la Gestión de Antifúngicos y la Reducción de Candidiasis Invasora (PROMULGA) II Project, Instituto de Salud Carlos III, partially financed by the European Regional Development Fund (grant PI13/01148). A. V. is supported by a Rio Hortega contract from the Instituto de Salud Carlos III, also partially financed by the European Regional Development Fund (grant CM15/00181)., Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Hospital Clinic [Barcelona, Spain]-August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute - IDIBAPS [Barcelona, Spain], and Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Corinne Maufrais, Sadri Znaidi, Irena Maslanka, Charlotte Majgier, Renaud A. Julien, Carol A. Munro, Louise A. Walker, Laurence Arbogast, Sophie Bachellier-Bassi, Yogesh Chaudhari, Ute Zeidler, Laurence Ma, Keunsook K. Lee, Murielle Chauvel, Tristan Rossignol, Floris Schoeters, Christophe d'Enfert, Christiane Bouchier, Audrey Nesseir, Emmanuelle Permal, Hélène Tournu, Magali Tichit, Vitor Cabral, Mélanie Legrand, Patrick Van Dijck, Helene Boyer, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Aberdeen, Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modul-Bio, Biomics, Centre de Recherche et Innovation Technologique (CITECH), Institut Pasteur [Paris]-Institut Pasteur [Paris], Wellcome Trust [088858/Z/09/Z to C.A.M., C.D.], European Commission (FINSysB) [PITN-GA-2008-214004 to C.D.] Agence Nationale de la Recherche [KANJI, ANR-08-MIE-033-01 to C.D., CANDICOL, ANR-10-01 to C.D.], Belgian Science Policy Office, Interuniversity Attraction Poles Programme [IAP P7/28 to P.V.D.], Medical Research Council New Investigator Award [G0400284 to C.A.M.], MRC Centre for Medical Mycology and the University of Aberdeen [MR/M026663/1], FINSysB Consortium PhD Fellowship [PITN-GA-2008-214004 to V.C.], DIM-MalInf Région Ile-de-France PhD Fellowship (to A.N.), C. albicans ORFeome Project Post-doctoral Fellowship [WT088858MA to E.P.], NPARI Consortium Postdoctoral Fellowship [LSHE-CT-2006-037692 to T.R.], Programme Fungi from Institut Carnot-Pasteur Maladies Infectieuses Postdoctoral Fellowship (to U.Z.), FINSysB Post-doctoral Fellowship [PITN-GA-2008-214004 to S.Z.], KANJI consortia Post-doctoral Fellowship [ANR-08-MIE-033-01 to S.Z.], KU Leuven CREA Grant [2011-2013 to H.T.], France Génomique Consortium [ANR10-INBS-09-08], French Government’s Investissement d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases) [ANR-10-LABX-62-IBEID]. Funding for open access charge: Institutional (Institut Pasteur)., ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans(2008), ANR-10-PATH-0008,CANDICOL(2010), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), European Project: 214004,PEOPLE,FP7-PEOPLE-2007-1-1-ITN,FINSYSB(2008), Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Catholique de Louvain (UCL), Université Sorbonne Paris Cité (COMUE) (USPC), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Bachellier- Bassi, Sophie, D'Enfert, Christophe, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris], ANR: ANR-10-INBS-09-08,The 'France Génomique' consortium, ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), and Bachellier-Bassi, Sophie

d'Enfert, Christophe, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Elizabeth M. Johnson, Mahmoud A. Ghannoum, Michael R. Yeaman, Carol A. Munro, Patrick Van Dijck, Jeniel E. Nett, Dominique Sanglard, Richard Calderone, Leah E. Cowen, Johan Maertens, Maiken Cavling Arendrup, Axel A. Brakhage, Judith Berman, Katrien Lagrou, Christophe d'Enfert, Karin Thevissen, Paul Cos, Gordon Ramage, Jelmer Sjollema, Tom Coenye, Isabel Spriet, Paul E. Verweij, Jose L. Lopez-Ribot, Ana Espinel-Ingroff, Sebastian A. J. Zaat, Emilia Cantón, Mary Ann Jabra-Rizk, David R. Andes, Neil A. R. Gow, Scott G. Filler, Mira Edgerton, Maurizio Sanguinetti, Michael A. Pfaller, Joost Wauters, Bruno P. A. Cammue, Clarissa J. Nobile, Hubertus Haas, Adilia Warris, Shawn R. Lockhart, Van Dijck, Patrick, Sjollema, Jelmer, Thevissen, Karin, Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), University Medical Center Groningen [Groningen] (UMCG), Vlaams Instituut voor Biotechnologie [Ghent, Belgique] (VIB), Center for Plant Systems Biology (PSB Center), Tel Aviv University [Tel Aviv], Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Wisconsin-Madison, Statens Serum Institut [Copenhagen], Rigshospitalet [Copenhagen], Copenhagen University Hospital, University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology (Hans Knoell Institute), Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany], Georgetown University Medical Center, Medical Research Institute La Fe, Partenaires INRAE, Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), ESCMID [Basel], University of Antwerp (UA), University of Toronto, University at Buffalo [SUNY] (SUNY Buffalo), State University of New York (SUNY), Virginia Commonwealth University (VCU), Harbor UCLA Medical Center [Torrance, Ca.], University Hospitals of Cleveland, Case Western Reserve University [Cleveland], University of Aberdeen, Innsbruck Medical University [Austria] (IMU), University of Maryland [Baltimore], Public Health England, Centers for Disease Control and Prevention [Atlanta] (CDC), Centers for Disease Control and Prevention, The University of Texas at San Antonio (UTSA), UZ Leuven, University of California [Merced], University of California, University of Iowa [Iowa City], JMI Laboratories, University of Glasgow, Université de Lausanne (UNIL), Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), Università cattolica del Sacro Cuore [Roma] (Unicatt), Radboud university [Nijmegen], Univ Aberdeen, Aberdeen Fungal Grp, MRC Ctr Med Mycol, Foresterhill, Aberdeen, Scotland, University Hospitals Leuven [Leuven], Academic Medical Center - Academisch Medisch Centrum [Amsterdam] (AMC), University of Amsterdam [Amsterdam] (UvA), Industrial Research Fund [IOFm/05/022], Israel Science Foundation [314/13], Wellcome Trust, MRC, Agence Nationale de Recherche [ANR-10-LABX-62-IBEID], National Institutes of Health [R35GM124594, R21AI125801], Wellcome Trust Strategic Award [097377], MRC Centre for Medical Mycology at the University of Aberdeen [MR/N006364/1], Astellas, Basilea, Gilead, MSD, NovaBiotics, Pfizer, T2Biosystems, F2G, Cidara, Amplyx, MRC [MR/N006364/1], FWO [FWO WO.009.16N]., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), European Project: 340087,EC:FP7:ERC,ERC-2013-ADG,RAPLODAPT(2014), Tel Aviv University (TAU), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), Innsbruck Medical University = Medizinische Universität Innsbruck (IMU), Universitair Ziekenhuis Leuven (UZ Leuven), University of California [Merced] (UC Merced), University of California (UC), Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Università cattolica del Sacro Cuore = Catholic University of the Sacred Heart [Roma] (Unicatt), and Radboud University [Nijmegen]

Christophe d'Enfert, Floris Schoeters, Patrick Van Dijck, Carol A. Munro, VIB-KU Leuven Center for Microbiology [Belgium], Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Institute of Botany and Microbiology [Leuven], University of Aberdeen, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interuniversity Attraction Poles ProgrammeBelgian Federal Science Policy Office, Belgian Science Policy OfficeBelgian Federal Science Policy Office [IAP P7/28], KU Leuven Research CouncilKU Leuven [C14/17/063], French Government's Investissement d'Avenir program (Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases)French National Research Agency (ANR) [ANR-10-LABX-62-IBEID], Wellcome TrustWellcome Trust [088858/Z/09/Z], MRC Centre for Medical Mycology [MR/N006364/1], ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Van Dijck, Patrick, VIB-KU Leuven Center for Microbiology [Leuven, Belgium], Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Basso, Virginia, Znaidi, Sadri, Lagage, Valentine, Cabral, Vitor, Schönherr, Franziska Annett, LeibundGut-Landmann, Salomé, d'Enfert, Christophe, Bachellier-Bassi, Sophie, Cellule Pasteur, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Université de Tunis El Manar (UTM), Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Institute of Virology [Zürich], Laboratorio microbiologia applicata [Bellinzona], Scuola universitaria professionale della Svizzera italiana = University of Applied Sciences and Arts of Southern Switzerland [Manno] (SUPSI), Work in the d’Enfert laboratory was supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (CANDIHUB, ANR-14-CE14-0018), the European Commission (FINSysB, PITN-GA-2008-214004) and the French Government’s Investissements d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID). Work in the LeibundGut laboratory was supported by the Swiss National Science Foundation (grant number PP00P3_150758) and the program 'Rare Diseases - New Approaches' from Gebert Rüf Foundation (grant number GRS-044/11). V.B. was supported by a stipend from the Pasteur - Paris University (PPU) International PhD program and the 'Fondation Daniel et Nina Carasso'. S.Z. was supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (CANDIHUB, ANR-14-CE14-0018) and the French Government’s Investissements d’Avenir program (Institut de Recherche Technologique BIOASTER, ANR-10-AIRT-03). V.C. was the recipient of a PhD fellowship of the European Commission (FINSysB, PITN-GA-2008-214004)., ANR-14-CE14-0018,CANDIHUB,Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l'homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,BIOASTER(2010), European Project: 214004,PEOPLE,FP7-PEOPLE-2007-1-1-ITN,FINSYSB(2008), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Université Tunis El Manar (UTM), Scuola universitaria professionale della Svizzera italiana [Manno] (SUPSI), ANR-14-CE14-0018,CANDIHUB,Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l’homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida(2014), ANR-10-LABX-0062/10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,Investissement d'Avenir BIOASTER(2012), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Zurich, and Bachellier-Bassi, Sophie

Florian Sparber, Marie-Elisabeth Bougnoux, Natacha Sertour, K. Trautwein-Weidner, U. Hetzel, Norman Pavelka, F. A. Schönherr, G. T. T. Le, A. Gladiator, Salomé LeibundGut-Landmann, C. F. Corti, Eva Guiducci, Florian R. Kirchner, Christophe d'Enfert, University of Zürich [Zürich] (UZH), Scuola Universitaria Professionale della Svizzera italiana, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Agency for science, technology and research [Singapore] (A*STAR), Laboratoire de Microbiologie Clinique [AP-HP Hôpital Necker-Enfants Malades], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Work in the LeibundGut-laboratory was supported by the program 'Rare Diseases—New Approaches' from Gebert Rüf Foundation (grant number GRS-044/11). CD acknowledges support from the French Government’s Investissement d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID)., ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), University of Zurich, LeibundGut-Landmann, S, Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), and Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Dupont, Joëlle, Dequin, Sylvie, Giraud, Tatiana, Le Tacon, François, Marsit, Souhir, Ropars, Jeanne, Richard, Franck, Selosse, Marc-André, Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Université des Antilles (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Sorbonne Université (SU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Sciences Pour l'Oenologie (SPO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Ecologie Systématique et Evolution (ESE), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Arbres-Microorganismes (IAM), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Soo Hyun Kim, Hee-Chang Jang, Jong Hee Shin, Young Youn Choi, Christophe d'Enfert, Eun Song Song, Marie-Elisabeth Bougnoux, Min Ji Choi, Chonnam National University [Gwangju], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), This work was supported by a Chonnam National University Hospital Research Institute of Clinical Medicine grant (CRI11082) and a grant from the French and Korean Ministries for Foreign Affairs (PHC STAR 2011 25841YA)., Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) - Institut Pasteur [Paris]

Oumaïma Ibrahim-Granet, Paris Laskaris, Jean-Paul Latgé, Christophe d'Enfert, Ahmad Atrouni, José Antonio Calera, Hélène Munier-Lehmann, Jean-Marc Cavaillon, Cytokines et Inflammation, Institut Pasteur [Paris], Universidad de Salamanca, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Chimie et Biocatalyse, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aspergillus, Institut Pasteur, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Pasteur [PTR 468], Institut Pasteur [Paris] (IP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Fanny Lanternier, Anne-Laure Roupie, Christophe d'Enfert, Bénédicte Neven, Felipe Suarez, Anne Scemla, Marie-Elisabeth Bougnoux, Aurélie Dupuis, Denis Caillot, Cécile Schrimpf, Etienne Paubelle, Pierre Frange, Frédéric Dalle, Cécile Angebault, Olivier Lortholary, Aurélie Agathine, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire de Microbiologie Clinique [AP-HP Hôpital Necker-Enfants Malades], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre National de Référence des Mycoses invasives et antifongiques - Mycologie moléculaire (CNRMA), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Réseau CENTAURE, Service Néphrologie et transplantation rénale Adultes [CHU Necker], Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service d'Hématologie Clinique (CHU de Dijon), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], This work was supported by the Association pour la Promotion de l′Enseignement et de la Recherche en Mycologie., Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Centre National de Référence des Mycoses invasives et antifongiques - Mycologie moléculaire ( CNRMA ), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Pasteur [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Bougnoux, Marie-Elisabeth

Kos, Iaroslava, Patterson, Miranda J, Znaidi, Sadri, Kaloriti, Despoina, da Silva Dantas, Alessandra, Herrero-de-Dios, Carmen M, D'Enfert, Christophe, Brown, Alistair J P, Quinn, Janet, Institute for Cell and Molecular Biosciences, Newcastle University [Newcastle], Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Aberdeen, This work, including the efforts of Alistair J.P. Brown, was funded by Wellcome Trust (097377 and 080088). This work, including the efforts of Janet Quinn, was funded by Wellcome Trust (097377 and 089930). This work, including the efforts of Alistair J.P. Brown, was funded by EC | European Research Council (ERC) (ERC-2009-AdG-249793). This work, including the efforts of Alistair J.P. Brown, was funded by Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) (BB/F00513X/1 and BB/K017365/1). This work, including the efforts of Janet Quinn, was funded by Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) (BB/K016393/1). This work, including the efforts of Christophe d’Enfert, was funded by Agence Nationale de la Recherche (ANR) (ANR-14-CE14-0018-01 and ANR-10-LABX-62-IBEID)., ANR-14-CE14-0018,CANDIHUB,Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l'homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), European Project: 249793,EC:FP7:ERC,ERC-2009-AdG,STRIFE(2010), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], ANR-14-CE14-0018,CANDIHUB,Réponse au stress et virulence chez les champignons pathogènes de l’homme : une approche comparative systémique des réseaux de régulation chez les espèces du genre Candida(2014), ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Aureslien Lesnard, Peggy Suzanne, Jean-Paul Latgé, David S. Askew, Ute Zeidler, Olivier Helynck, Sylvain Rault, Cosmin Saveanu, Karthik Krishnan, Christophe d'Enfert, Shriya Raj, Hélène Munier-Lehmann, Aspergillus, Institut Pasteur [Paris], University of Cincinnati (UC), Chimie et Biocatalyse, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris], Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique des Interactions macromoléculaires, Aviesan BAP109, Institut Carnot Pasteur Maladies Infectieuses FUNGI, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], University of Cincinnati, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie ( CERMN ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Pasteur [Paris], Latgé, Jean-Paul, Munier-Lehmann, Hélène, Saveanu, Cosmin, Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Génétique des Interactions macromoléculaires / Genetics of Macromolecular Interactions

Albac, Sandrine, Schmitz, Antonin, Lopez-Alayon, Carolina, d'Enfert, Christophe, Sautour, Marc, Ducreux, Amandine, Labruère-Chazal, Catherine, Laue, Michael, Holland, Gudrun, Bonnin, Alain, Dalle, Frederic, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Institut de Mathématiques de Bourgogne [Dijon] (IMB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB), Robert Koch Institute [Berlin] (RKI), Agence Nationale de la Recherche. Grant Number: ANR-08-MIEN- 033-01 BIOASTER-Sanofi-Alliance pour les Sciences de la Vie et de la Santé (AVIESAN) Investissement d'Avenir. Grant Number: ANR-10-AIRT-03, ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans(2008), ANR-10-AIRT-0005,NANOELEC,NANOELEC(2010), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR: ANR-10-AIRT-05,Programme Investissements d’Avenir, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Pasteur [Paris], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut de Mathématiques de Bourgogne [Dijon] ( IMB ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Robert Koch Institute [Berlin] ( RKI ), ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans ( 2008 ), ANR : ANR-10-AIRT-05,Programme Investissements d’Avenir, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Guilhem Janbon, Christophe d'Enfert, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Our work on C. glabrata biofilms was funded by grants of Institut Pasteur (PTR50 and PTR173 to CdE and GJ), from the Agence Nationale de la Recherche (ERA-Net Pathogenomics, FUNPATH, ANR-06-PATHO_005-01 to CdE) and the French Government's Investissement d'Avenir program (Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID to CdE)., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-06-PATH-0005,FUNPATH,Genomic approaches to unravel the molecular mechanisms of pathogenicity in the human fungal pathogen candida glabrata(2006), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], and ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010)

Marie-Elisabeth Bougnoux, Stevenn Volant, Françoise Botterel, Christophe d'Enfert, Amine Ghozlane, Cécile Angebault, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), CHU Henri Mondor, Institut Pasteur [Paris], Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), This study was supported by a grant from Pfizer and the Société Française de Mycologie Médicale (Prix de Recherche SFMM - Pfizer 2015) to CA. MEB received institutional grant funding from MSD and Astellas and lecture fees or travel grants from MSD, Astellas, and Gilead Sciences. FB received grants from Astellas, and payment for lectures from Merck. The specific roles of these authors are articulated in the 'author contributions' section., We thank Olivier Join-Lambert and Emmanuelle Bille for their precious help in this work., Bougnoux, Marie-Elisabeth, École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA), CHU Henri Mondor [Créteil], Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Christophe d'Enfert, Tristan Rossignol, Govindsamy Vediyappan, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), We are grateful to Caroline Proux and Jean-Yves Coppé at the PF2 Platform of Pasteur Genopole Ile-de-France for help with microarray experiments. Caspofungin was kindly provided by Merck & Co. Fluconazole was kindly provided by Pfizer Inc.This work was supported by a grant from the European Commission to C.D. (EURESFUN, LSHM-CT-2005-518199). G.V. was the recipient of a postdoctoral fellowship in the framework of the EURESFUN Consortium. T.R. was the recipient of a postdoctoral fellowship in the framework of the NPARI Consortium (LSHE-CT-2006-037692)., Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], and Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Christophe d'Enfert, Brenda A. McManus, Derek J. Sullivan, Marie-Elisabeth Bougnoux, Gary P. Moran, Miles A. Nunn, David C. Coleman, Trinity College Dublin, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), National Environmental Research Council Centre for Ecology and Hydrology, We thank Oscar Merne for assistance with collection of avian excrement samples and identification of specific species of birds at sampling sites. This study was supported by the Microbiology Research Unit, Dublin Dental School and Hospital.Ms McManus is a doctoral candidate in the Microbiology Research Unit at Dublin Dental School and Hospital, Trinity College Dublin. Her research interests focus on analysis of the population structure of the novel yeast pathogen C. dubliniensis by using MLST., Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris]

Tristan Rossignol, Desmond G. Higgins, Christophe d'Enfert, Chen Ding, Geraldine Butler, Alessandro Guida, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University College Dublin (UCD), Science Foundation Ireland and the Health Research Board, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Jennifer Scott, Clara Valero, Álvaro Mato-López, Ian J. Donaldson, Alejandra Roldán, Harry Chown, Norman Van Rhijn, Rebeca Lobo-Vega, Sara Gago, Takanori Furukawa, Alma Morogovsky, Ronen Ben Ami, Paul Bowyer, Nir Osherov, Thierry Fontaine, Gustavo H. Goldman, Emilia Mellado, Michael Bromley, Jorge Amich, University of Manchester [Manchester], Universidade de São Paulo = University of São Paulo (USP), Instituto de Salud Carlos III [Madrid] (ISC), Tel Aviv University (TAU), Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Universidade Federal de São Paulo, J.A. is funded by an Atracción de Talento Modalidad 1 (020-T1/BMD-200) contract of the Madrid Regional Government. J.S. has been funded by a BSAC Scholarship (bsac-2016-0049). C.V. was funded by FAPESP (2108/00715-3 and 2020/01131-5). G.H.G. has been funded by FAPESP (2016/07870-9 and 2021/04977-5), CNPq (301058/2019-9 and 404735/2018-5) and by the NIH/NIAID (grant R01AI153356). S.G. was cofunded by the NIHR Manchester Research Centre and the Fungal Infection Trust., Comunidad de Madrid (España), São Paulo Research Foundation, National Council for Scientific and Technological Development (Brasil), and NIH - National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) (Estados Unidos)

Joaquín Bernal-Bayard, Jérôme Thiebaud, Marina Brossaud, Audrey Beaussart, Céline Caillet, Yves Waldvogel, Laetitia Travier, Sylvie Létoffé, Thierry Fontaine, Bachra Rokbi, Philippe Talaga, Christophe Beloin, Noëlle Mistretta, Jérôme F. L. Duval, Jean-Marc Ghigo, Génétique des Biofilms - Genetics of Biofilms, Université Paris Cité (UPCité)-Microbiologie Intégrative et Moléculaire (UMR6047), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad de Sevilla / University of Sevilla, Sanofi Pasteur [Marcy-l'Étoile, France], Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions cerveau-immunité - Brain-immune communication, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), European Project: 842629,Salmofish, Duval, Jerome, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, and Tracing T3SS effectors in vivo during Salmonella infection in the zebrafish model - Salmofish - 0000-00-00 - 0000-00-00 - 842629 - VALID

Marc J. E. C. van der Maarel, Marco A. van den Berg, Steven Geysens, Etienne Danchin, Rachel M. van der Kaaij, Hein Stam, Jibin Sun, Kaj Albermann, Maurien M.A. Olsthoorn, Arnold J. M. Driessen, Frans M. Klis, Monika Schmoll, Gerald Hofmann, K. Pal, Thomas Guillemette, Bernard Henrissat, Johannes H. de Winde, David B. Archer, Coenie Goosen, Pedro M. Coutinho, Richard Albang, Michael Cornell, Jens Nielsen, Johannes Andries Roubos, Harrie J. Kools, Peter J.J. Van De Vondervoort, Cornelis Maria Jacobus Sagt, Noël Nicolaas Maria Elisabeth Van Peij, Jannick Dyrløv Bendtsen, Alard Van Dijk, Marga Herweijer, Martin Mortimer, Ursula Rinas, An-Ping Zeng, Roland Contreras, Holger Wedler, Stephen G. Oliver, Cees A. M. J. J. van den Hondel, David W. Ussery, Gert S.P. Groot, Jaap Visser, Mikael Rørdam Andersen, Arthur F. J. Ram, Hildegard Henna Menke, René T. J. M. van der Heijden, Paul S. Dyer, Piet W. J. de Groot, Han A. B. Wösten, Alfons J. M. Debets, Jacques A.E. Benen, János Varga, Lubbert Dijkhuizen, Christian P. Kubicek, Peter J. T. Dekker, Albert J. J. van Ooyen, Johannes Petrus Theodorus Wilhelmus Van Den Hombergh, Ronald P. de Vries, Rogier Meulenberg, Jürgen Lauber, Mark X. Caddick, Geoffrey Turner, Xin Lu, Patricia Ann van Kuyk, Wouter Vervecken, Peter J. Schaap, Piet W.M. van Dijck, Stefaan Breestraat, Herman Jan Pel, Christophe d'Enfert, DSM, Delft University of Technology (TU Delft), School of Biology, University of Nottingham, UK (UON), Technical University of Denmark [Lyngby] (DTU), Wageningen University and Research Centre (WUR), Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Sheffield [Sheffield], Utrecht University [Utrecht], Biomax Informatics AG, CLC bio, Partenaires INRAE, School of Biological Sciences, University of Liverpool, Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), Flanders Institute for Biotechnology, University of Manchester [Manchester], Architecture et fonction des Macromolécules Biologiques - UMR 6098 (AFMB), Université de Provence - Aix-Marseille 1-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Genetics, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), University of Groningen, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Pasteur [Paris], Centre for Carbohydrate Bioprocessing, VU University Amsterdam, Unité de recherche Pathologie végétale et phytobactériologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Leiden University, Radboud University Medical Center [Nijmegen], Vienna University of Technology, Qiagen GmbH, Center for Microbial Biotechnology (CMB), University of Szeged, Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), Center for Biological Sequence Analysis, Fungal Biodiversity Centre, Fungal Genetics and Technology Consultancy, Ministère de la Recherche : programme ACI-BCMS, Enzywall, Sonderforschungsbereich 578 (SFB578) of the Deutsche Forschungsgemeinschaft, Germany, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology, Host-Microbe Interactions, Molecular Microbiology, Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark (DTU), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP), Vrije Universiteit Amsterdam [Amsterdam] (VU), Universiteit Leiden, University of Szeged [Szeged], Vrije universiteit = Free university of Amsterdam [Amsterdam] (VU), and Sub Molecular Microbiology

B. Anne Neville, Christophe d'Enfert, Marie-Elisabeth Bougnoux, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], This work has been supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (KANJI, ANR-08-MIE-033–01, ERA-Net Infect-ERA, FUNCOMPATH, ANR-14-IFEC-0004), Danone Nutricia Research, and the French Government's Investissement d'Avenir program (Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases, ANR-10-LABX-62-IBEID, Institut de Recherche Technologique BIOASTER, ANR-10-AIRT-03) to CdE and by grants from DIM Malinf – Région Ile-de-France to MEB. BAN was the recipient of a post-doctoral fellowship from Danone Nutricia Research., ANR: kanji,R-08-MIE-033–01, ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,Investissement d'Avenir BIOASTER(2012), ANR-14-IFEC-0004,FunComPath,From fungal commensalism to pathogenicity:dissection of the colonization-to-infection shift of Candida albicans(2014), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans(2008), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,BIOASTER(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Anne Scemla, Christophe Legendre, Gilles Quesne, Emilie Sitterlé, Marie-Elisabeth Bougnoux, Caroline Charlier, Olivier Lortholary, Carine El Sissy, Sophie Bachelier-Bassi, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service de transplantation rénale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Bougnoux, Marie-Elisabeth, Dannaoui, Eric, Accoceberry, Isabelle, Angoulevant, Adela, Bailly, E., Bouchara, Jean-Philippe, Botterel, Françoise, Chevrier, Sylviane, Chouaki, Taieb, Cornet, Muriel, Fekkar, Arnault, Dalle, Frédéric, Gangneux, Jean-Pierre, Guitard, Juliette, Hennequin, Christophe, Lepape, Patrice, Maubon, Danièle, Ranque, Stéphane, Sendid, Boualem, Chandenier, Jacques, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Dynamic Microbiology - EA 7380 (DYNAMIC), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Université Paris-Est (UPE)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Université d'Angers (UA), CHU Henri Mondor, CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Amiens-Picardie, Université de Picardie Jules Verne (UPJV), CHU Grenoble, Service de Parasitologie - Mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Hôpital du Bocage, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Cibles et médicaments de l'infection, de l'immunité et du cancer (IICiMed), Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU de Lille), Physiopathologie des Candidoses, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Service de parasitologie, mycologie, médecine tropicale [CHRU Tours], European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Deseases (ECCMID). INT., Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service de parasitologie - mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est (UPE)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), CHU Henri Mondor [Créteil], Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité (IICiMed), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)

Mélanie Legrand, Raphaël Loll-Krippleber, Adeline Feri, Marie Nguyen, Corinne Maufrais, Christophe d'Enfert, Jennifer Yansouni, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Cytométrie (Plate-forme), Institut Pasteur [Paris], Centre d'Informatique pour la Biologie, PT Génomique et Transcriptomique, BIOASTER, Lyon, This work was supported by the French Government's Investissement d'Avenir program, Laboratoire d'Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases (grant ANR-10-LABX-62-IBEID). R.L.-K. was the recipient of a Ph.D. grant from INRA and the Institut Pasteur. M.L. was the recipient of a postdoctoral fellowship from the Institut Pasteur (Bourse Roux)., ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), BIOASTER Microbiology Technology Institute [Lyon], ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), and Institut Pasteur [Paris] (IP)

Martin E. A. Richter, Ekkehard Hiller, Bernhard Hube, Lydia Kasper, Sascha Brunke, Dominique Ferrandon, Christophe d'Enfert, Jessica Quintin, Steffen Rupp, Karl Kuchler, Ilse D. Jacobsen, Tobias Schwarzmüller, Department of Microbial Pathogenicity Mechanisms [Jena], Hans Knoell Institute, Center for Sepsis Control & Care, Jena University Hospital, Réponse immunitaire et developpement chez les insectes (RIDI - UPR 9002), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Escuela de Ciencas Biologicas, Pontificia Universidad Catolica del Ecuador, Research Group Microbial Immunology, Hans Knöll Institute, Jena University Hospital [Jena], Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology (Fraunhofer IGB), Fraunhofer (Fraunhofer-Gesellschaft), Medizinische Universität Wien = Medical University of Vienna, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), This work was supported via institutional support from CNRS, by the DeutscheForschungsgemeinschaft (DFG) and the Austrian Science Foundation (FWF) via a joint DACH project of the B.H. and K.K. laboratories (DFG HU 528/17-1 and FWF-I-746-B11), and by the German Federal Ministry of Education and Health (BMBF)and the FWF via the ERA-Net Pathogenomics project FunPath (BMBF-FKZ:0313931B and FWF-API-0125). The work of S.B., M.E.R. and B.H. was further supported by the German Federal Ministry of Education and Health (BMBF) Germany via the Integrated Research and Treatment Center, Center for Sepsis Control and Care (CSCC, FKZ: 01EO1002). Work in the K.K. laboratory was supported by the Austrian Science Foundation FWF by a grant from the Christian Doppler Society., Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology (IGB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Brunke, Sascha, Quintin, Jessica, Pontificia Universidad Católica del Ecuador, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), RIBIERRE, Helene, and Publica

Taeyup Kim, Anna K. Averette, Joohyeon Hong, Kwang Woo Jung, Yong-Hwan Lee, Li Li Wang, Jaeyoung Choi, Gena Lee Meyers, Min Su Kim, Kyung-Tae Lee, Eunji Cheong, Shinae Maeng, Min Hee Song, Yong Sun Bahn, Guilhem Janbon, Suyeon Cha, Je Hyun Ji, Dong-Hoon Yang, Seo Young Kim, Jooyoung Jang, Joseph Heitman, Gloria Adedoyin, Hyojeong Kwon, Hyelim Kim, Yin Won Lee, Soohyun Bang, Yee Seul So, Goun Park, Hyo Jeong Byun, Jang-Won Lee, Yonsei University, Department of Biotechnology, College of Life Science and Biotechnology, Seoul National University [Seoul] (SNU), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Duke University Medical Center, National Research Foundation of Korea from MEST 2008-0061963 2010-0029117, NIH/NIAID R01-AI050438-10, ANR 2010-BLAN-1620-01, ANR-10-BLAN-1620,YeastIntrons,Analyse globale de la régulation des ARN contenant des PTC par la voie du NMD et le complexe EJC-like chez des levures riches ou pauvres en introns(2010), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Jung, Kwang-Woo, and Yang, Dong-Hoon

Pilar Gutiérrez-Escribano, Francisco Escobar del Rey, M. Belén Suárez, Alberto González-Novo, Carlos R. Vázquez de Aldana, Gavin Sherlock, Yolanda Arnáiz-Pita, Jaime Correa-Bordes, Christophe d'Enfert, Marie-Elisabeth Bougnoux, Diana Calderón-Noreña, Encarnación Dueñas-Santero, Sara Orellana-Muñoz, Junta de Extremadura, Agence Nationale de la Recherche (France), National Institutes of Health (US), European Commission, Ministerio de Economía y Competitividad (España), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Spain] (CSIC), Universidad de Salamanca, Universidad de Extremadura (UEX), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], Stanford University [Stanford], Spanish Ministerio de Economía y Competitividad(MINECO) (BFU2010-15884 to CRVdA andBFU2012-39910 to JCB), co-sponsored by theEuropean Union FEDER program and from the Juntade Extremadura (GRU10-008) to JCB, DMCN andSOM were supported by pre-doctoral fellowships (FPIprogram) from the Spanish Government. CdE hasreceived funding from the French Government, Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Stanford University, Universidad de Extremadura - University of Extremadura (UEX), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Davood Mansouri, Caroline Galeotti, Parvaneh Adimi, Olivier Lortholary, Laurent Abel, Sébastien Héritier, Mahin Jamshidi, Valeska Bidault, Marie-Elisabeth Bougnoux, Capucine Picard, Jean-Laurent Casanova, Luyan Liu, Elisa Barbati, Stéphane Blanche, Maryline Chomton, Serge Romana, Emmanuel Jacquemin, Vincent Pedergnana, Seyed Alireza Mahdaviani, Fanny Lanternier, Julie Lachenaud, Marie-Louise Frémond, Danielle Canioni, Adela Angoulvant, Ulrich Meinzer, Emmanuel Gonzales, Mélanie Migaud, Anne Puel, Nahal Mansouri, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Human genetics of infectious diseases : Mendelian predisposition (Equipe Inserm U1163), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), DHU Hepatinov, Centre de Référence des Maladies Auto-Inflammatoires et des Amyloses [Le Kremlin-Bicêtre] (CeRéMAIA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Signalisation calcique et interactions cellulaires dans le foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier René Dubos [Pontoise], Masih Daneshvari Hospital, Partenaires INRAE, Shahid Beheshti University, Islamic Azad University, Department of Infectious Disease, Hanoï Medical University, Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Rockefeller University [New York], Centre National de Référence des Mycoses invasives et antifongiques - Mycologie moléculaire (CNRMA), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), The ANR (grant GENCMCD 11-BSV3-005-01, the Jeffrey Modell Foundation, the French government's Investissement d'Avenir program (ANR-10-LABX-62-IBEID), the Clinical and Translational Science Award Program, National Center for Advancing Translational Sciences, National Institutes of Health (grant UL1TR000043), Rockefeller University, including the St. Giles Foundation, INSERM, and Paris Descartes University, ANR-11-BSV3-0005,GENCMCD,Dissection génétique de la candidose cutanéo-muqueuse chronique chez l'homme(2011), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Coordination des Cellules et Morphogenèse / Heart Morphogenesis (Imagine - Institut Pasteur U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Pasteur [Paris], Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ProdInra, Migration, BLANC - Dissection génétique de la candidose cutanéo-muqueuse chronique chez l'homme - - GENCMCD2011 - ANR-11-BSV3-0005 - BLANC - VALID, and Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID

Oliver Kurzai, Marie-Elisabeth Bougnoux, Ronny Martin, Kerstin Kaerger, Johannes Elias, Grit Walther, Johanna Huyke, Michael Weber, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology (Hans Knoell Institute), Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany], Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans Knoell Institute, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Faculté de Médecine, Université de Ngozi, University of Würzburg, Wellcome Trust, Robert-Koch-Institute from funds provided by the German Ministry of Health (grant-No.1369-240), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP)

Louise A. Walker, Vitor Cabral, Keunsook K. Lee, Tristan Rossignol, Murielle Chauvel, Christophe d'Enfert, Mathias L. Richard, Etienne Dague, Arnaud Firon, Sadri Znaidi, Carol A. Munro, Mélanie Legrand, Hélène Martin-Yken, Sophie Bachellier-Bassi, Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris], School of Medical Sciences, University of Aberdeen, Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Équipe NanoBioSystèmes (LAAS-NBS), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, European Commission (EURESFUN) [LSHM-CT-2005-518199], European Commission (Galar Fungail 2) [MRTN-CT-2003-504148], European Commission (FINSysB) [PITN-GA-2008-214004], Agence Nationale de la Recherche (KANJI) [ANR-08-MIE-033-01], Wellcome Trust (The Candida albicans ORFeome project) [WT088858MA], Institut Pasteur (Bourse Roux), Medical Research Council [G0400284], Agence Nationale de la Recherche (AFMYST project) [ANR-11-JSV5-001-01, SD 30024331], ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans(2008), ANR-11-JSV5-0001,AFMYST,Etude Biophysique, biochimique et biomoléculaire de la paroi des levures.(2011), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Paris-Sorbonne (UP4), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Biologie et Pathogénicité fongiques (BPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Cabral, Vitor, and Znaidi, Sadri