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51. Mitigation of heterocyclic aromatic amines in cooked meat. Part I: Informed selection of antioxidants based on molecular modeling

Author: Patrick Blinet, Frédéric Mercier, Laurent Debrauwer, Sylvie Chevolleau, Laurent Chaloin, Erwan Engel, Maïa Meurillon, Magaly Angénieux, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), MetaboHUB-MetaToul, Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), This research was conducted as part of the MARMEAT project supported by the TRANSFORM division of the French National Research Institute for Agriculture, Food and the Environment (INRAE)., Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Métabolomique et Fluxomique (MetaToul) (TBI-MetaToul), MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Models, Molecular, Informed choice, Molecular model, Mitigation, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, Molecular modeling, Wine, Structure activity relationship (SAR), Resveratrol, 01 natural sciences, Antioxidants, Analytical Chemistry, chemistry.chemical_compound, Structure-Activity Relationship, 0404 agricultural biotechnology, Heterocyclic Compounds, Origanum, Quinoxalines, Analog design, Structure–activity relationship, Animals, Food science, Cooked meat, Cooking, Amines, Carcinogen, chemistry.chemical_classification, Tea, Chemistry, Plant Extracts, 010401 analytical chemistry, Aromatic amine, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, Heterocyclic aromatic amines, 040401 food science, 0104 chemical sciences, Red Meat, Formulation, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Quinolines, Cattle, Heterocyclic Aromatic Amines, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science
Abstract: International audience; This work aimed to develop a method permitting an informed choice of antioxidants to reduce carcinogenic heterocyclic aromatic amine (HAA) formation during proteinaceous food cooking. Therefore, a three-step approach was developed. First, the most promising antioxidants were selected using molecular modeling approaches. For this, analog design was used to highlight the most suitable antioxidants based on their diversification potential using bioisosteric replacement. Then, structure activity relationship studies allowed drawing the relevant properties for inhibiting HAA formation and explained partly the inhibitory activity. Secondly, the approved antioxidants were tested in ground beef patties to assess their inhibitory properties against HAA formation. Resveratrol was found to be the most efficient as it totally inhibited MeIQ and reduced MeIQx and PhIP formation by 40 and 70%, respectively. Finally, natural ingredients rich in these antioxidants were evaluated. Oregano was found to totally inhibit MeIQ formation and to reduce by half MeIQx and PhIP formation.
Published: 2020

52. Perinatal exposure to a dietary pesticide cocktail does not increase susceptibility to high-fat diet-induced metabolic perturbations at adulthood but modifies urinary and fecal metabolic fingerprints in C57Bl6/J mice

Author: Wendy Klement, Hervé Guillou, Léonie Dopavogui, Lorraine Smith, Laurence Gamet-Payrastre, Guylène Feuillet, Nicola Marchi, Arnaud Polizzi, Frédéric de Bock, Emilien L. Jamin, Laurent Debrauwer, Sandrine Ellero-Simatos, Céline Lukowicz, Benoist Schaal, Sharon Barretto, Nicolas Loiseau, Bruno Patris, Cécile Canlet, Laila Mselli-Lakhal, Frédéric Lasserre, Anne Fougerat, Colette Denis, Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Exposition, Perturbation Endocrino-métabolique et Reproduction (ToxAlim-EXPER), L.S. PhD is supported by grants from the Ministry for Agriculture and Food and the Ministry for an Ecological and Solidary Transition, with the financial support of the French Biodiversity Agency and from the department AlimH of INRAE. This work was supported by a grant from the Ministry for Agriculture and Food and the Ministry for an Ecological and Solidary Transition, with the financial support of the French Biodiversity Agency (Epidemicmac and GepeTho), by ANR, France (Syneract and Hepatobrain) and Region Occitanie. We thank Anexplo Genotoul MetaToul for their excellent work on plasma biochemistry. All MS and NMR experiments were performed using instruments of the Metatoul-AXIOM platform, partner of the national infrastructure of metabolomics and fluxomics: MetaboHUB [MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010, 2011], ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, Guerineau, Nathalie C., and Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation - - METABOHUB2011 - ANR-11-INBS-0010 - INBS - VALID
Subjects: Tolerable daily intake, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Physiology, Urine, 010501 environmental sciences, Perinatal, Diet, High-Fat, 01 natural sciences, Energy homeostasis, Dietary exposure, chemistry.chemical_compound, Feces, Mice, Lactation, Medicine, Animals, Metabolomics, Pesticides, lcsh:Environmental sciences, Captan, 0105 earth and related environmental sciences, General Environmental Science, lcsh:GE1-350, 2. Zero hunger, Perinatal Exposure, business.industry, Pesticide, Pesticide cocktail, Gastrointestinal Microbiome, [SDV] Life Sciences [q-bio], Mice, Inbred C57BL, medicine.anatomical_structure, Metabolism, chemistry, 13. Climate action, Female, business
Abstract: International audience; Background: We recently demonstrated that chronic dietary exposure to a mixture of pesticides at low-doses induced sexually dimorphic obesogenic and diabetogenic effects in adult mice. Perinatal pesticide exposure may also be a factor in metabolic disease etiology. However, the long-term consequences of perinatal pesticide exposure remain controversial and largely unexplored.Objectives: Here we assessed how perinatal exposure to the same low-dose pesticide cocktail impacted metabolic homeostasis in adult mice.Methods: Six pesticides (boscalid, captan, chlopyrifos, thiachloprid, thiophanate, and ziram) were incorporated in food pellets. During the gestation and lactation periods, female (F0) mice were fed either a pesticide-free or a pesticide-enriched diet at doses exposing them to the tolerable daily intake (TDI) level for each compound, using a 1:1 body weight scaling from humans to mice. All male and female offsprings (F1) were then fed the pesticide-free diet until 18 weeks of age, followed by challenge with a pesticide-free high-fat diet (HFD) for 6 weeks. Metabolic parameters, including body weight, food and water consumption, glucose tolerance, and urinary and fecal metabolomes, were assessed over time. At the end of the experiment, we evaluated energetic metabolism and microbiota activity using biochemical assays, gene expression profiling, and 1H NMR-based metabolomics in the liver, urine, and feces.Results: Perinatal pesticide exposure did not affect body weight or energy homeostasis in 6- and 14-week-old mice. As expected, HFD increased body weight and induced metabolic disorders as compared to a low-fat diet. However, HFD-induced metabolic perturbations were similar between mice with and without perinatal pesticide exposure. Interestingly, perinatal pesticide exposure induced time-specific and sex-specific alterations in the urinary and fecal metabolomes of adult mice, suggesting long-lasting changes in gut microbiota.Conclusions: Perinatal pesticide exposure induced sustained sexually dimorphic perturbations of the urinary and fecal metabolic fingerprints, but did not significantly influence the development of HFD-induced metabolic diseases.
Published: 2020

53. Postprandial NMR-Based Metabolic Exchanges Reflect Impaired Phenotypic Flexibility across Splanchnic Organs in the Obese Yucatan Mini-Pig

Author: Isabelle Savary-Auzeloux, Cécile Canlet, Nathalie Poupin, Dominique Dardevet, Marie Tremblay-Franco, Aurélien Amiel, Fabien Jourdan, Sergio Polakof, Laurent Debrauwer, Didier Rémond, Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), INRAE AlimH department funding French Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolomique et Fluxomique (MetaToul) (TBI-MetaToul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: 0301 basic medicine, Blood Glucose, Magnetic Resonance Spectroscopy, Swine, high fat-high sucrose diet, [SDV]Life Sciences [q-bio], postprandial, mini-pigs, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Dietary Sucrose, energy metabolism, Glucose homeostasis, Homeostasis, Intestinal Mucosa, Nutrition and Dietetics, Glycogen, Postprandial Period, metabolomics, Postprandial, Swine, Miniature, Animal Nutritional Physiological Phenomena, Female, Splanchnic, lcsh:Nutrition. Foods and food supply, arteriovenous differences, medicine.medical_specialty, 030209 endocrinology & metabolism, lcsh:TX341-641, Biology, Diet, High-Fat, liver, Article, 03 medical and health sciences, Metabolomics, Insulin resistance, Internal medicine, medicine, Metabolome, Animals, Obesity, intestine, phenotypic flexibility, medicine.disease, 030104 developmental biology, Endocrinology, chemistry, Insulin Resistance, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Food Science
Abstract: The postprandial period represents one of the most challenging phenomena in whole-body metabolism, and it can be used as a unique window to evaluate the phenotypic flexibility of an individual in response to a given meal, which can be done by measuring the resilience of the metabolome. However, this exploration of the metabolism has never been applied to the arteriovenous (AV) exploration of organs metabolism. Here, we applied an AV metabolomics strategy to evaluate the postprandial flexibility across the liver and the intestine of mini-pigs subjected to a high fat&ndash, high sucrose (HFHS) diet for 2 months. We identified for the first time a postprandial signature associated to the insulin resistance and obesity outcomes, and we showed that the splanchnic postprandial metabolome was considerably affected by the meal and the obesity condition. Most of the changes induced by obesity were observed in the exchanges across the liver, where the metabolism was reorganized to maintain whole body glucose homeostasis by routing glucose formed de novo from a large variety of substrates into glycogen. Furthermore, metabolites related to lipid handling and energy metabolism showed a blunted postprandial response in the obese animals across organs. Finally, some of our results reflect a loss of flexibility in response to the HFHS meal challenge in unsuspected metabolic pathways that must be further explored as potential new events involved in early obesity and the onset of insulin resistance.
Published: 2020

54. Suspect and non-targeted screening of chemicals of emerging concern for human biomonitoring, environmental health studies and support to risk assessment: From promises to challenges and harmonisation issues

Author: Noelia Caballero-Casero, Martin Krauss, Robert Barouki, Jana Klánová, Jeroen Meijer, Marja H. Lamoree, Annelaure Damont, François Fenaille, Herbert Oberacher, Jean-Philippe Antignac, Bruno Le Bizec, Jelle Vlaanderen, Denis Sarigiannis, Mariane Pourchet, Elliott J. Price, Laurent Debrauwer, Adrian Covaci, Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Masaryk University [Brno] (MUNI), Toxicological Center, University of Antwerp (UA)-Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institute of Legal Medicine, Innsbruck Medical University [Austria] (IMU), Vrije Universiteit Amsterdam [Amsterdam] (VU), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments (LEMM), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Institute for Risk Assessment Sciences [Utrecht, The Netherlands] (IRAS), Utrecht University [Utrecht], Helmholtz Zentrum für Umweltforschung = Helmholtz Centre for Environmental Research (UFZ), Aristotle University of Thessaloniki, Toxicité environnementale, cibles thérapeutiques, signalisation cellulaire (T3S - UMR_S 1124), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The authors thank the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme HBM4EU under Grant Agreement No. 733032 for its financial support, as well as the Region pays de la Loire, France for its co-funding of the M.P. E.P. acknowledges support from the Czech Operational Programme Research, Development and Education - Project, European Project: 733032, E&H: Environmental Chemistry and Toxicology, AIMMS, LESUR, Hélène, European Union's Horizon 2020 research and innovation programme - 733032 - INCOMING, École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, Innsbruck Medical University = Medizinische Universität Innsbruck (IMU), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Non targeted, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Computer science, [SDV]Life Sciences [q-bio], 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, High resolution mass spectrometry, SDG 3 - Good Health and Well-being, Environmental health, Biomonitoring, Chemical of emerging concern, Metabolites, Humans, Profiling (information science), [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Biology, lcsh:Environmental sciences, 0105 earth and related environmental sciences, General Environmental Science, lcsh:GE1-350, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Warning system, business.industry, Non-targeted screening, Environmental Exposure, Suspect screening, Food safety, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Chemistry, Workflow, 13. Climate action, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Environmental Pollutants, Suspect, business, Risk assessment, Environmental Health, Biological Monitoring, Chromatography, Liquid, Environmental Monitoring
Abstract: Large-scale suspect and non-targeted screening approaches based on high-resolution mass spectrometry (HRMS) are today available for chemical profiling and holistic characterisation of biological samples. These advanced techniques allow the simultaneous detection of a large number of chemical features, including markers of human chemical exposure. Such markers are of interest for biomonitoring, environmental health studies and support to risk assessment. Furthermore, these screening approaches have the promising capability to detect chemicals of emerging concern (CECs), document the extent of human chemical exposure, generate new research hypotheses and provide early warning support to policy. Whilst of growing importance in the environment and food safety areas, respectively, CECs remain poorly addressed in the field of human biomonitoring. This shortfall is due to several scientific and methodological reasons, including a global lack of harmonisation. In this context, the main aim of this paper is to present an overview of the basic principles, promises and challenges of suspect and non-targeted screening approaches applied to human samples as this specific field introduce major specificities compared to other fields. Focused on liquid chromatography coupled to HRMS-based data acquisition methods, this overview addresses all steps of these new analytical workflows. Beyond this general picture, the main activities carried out on this topic within the particular framework of the European Human Biomonitoring initiative (project HBM4EU, 2017-2021) are described, with an emphasis on harmonisation measures.
Published: 2020

55. Development and validation of a modified QuEChERS protocol coupled to UHPLC-APCI-MS/MS for the simple and rapid quantification of 16 heterocyclic aromatic amines in cooked beef

Author: Sylvie Chevolleau, A. Bouville, Laurent Debrauwer, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: Time Factors, [SDV]Life Sciences [q-bio], Atmospheric-pressure chemical ionization, Quechers, 01 natural sciences, Analytical Chemistry, Matrix (chemical analysis), 0404 agricultural biotechnology, Heterocyclic Compounds, Tandem Mass Spectrometry, QuEChERS extraction, Validation, Animals, Cooking, Amines, Chromatography, High Pressure Liquid, 2. Zero hunger, Chromatography, Molecular Structure, Chemistry, Solid Phase Extraction, 010401 analytical chemistry, Extraction (chemistry), Ms analysis, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, Cooked beef, Heterocyclic aromatic amines, 040401 food science, 0104 chemical sciences, Red Meat, UHPLC-APCI-MS/MS, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Carcinogens, Cattle, Heterocyclic Aromatic Amines, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science
Abstract: International audience; Heterocyclic aromatic amines (HAAs) are neo-formed compounds generated during the cooking of meats and are known or suspected to be mutagenic and carcinogenic. In this study, a novel, simple, and fast methodology combining salting-out liquid-liquid microextraction, solid-phase extraction (SPE), and UHPLC-APCI-MS/MS was developed for the analysis of 16 HAAs. The QuEChERS extraction (quick, easy, cheap, efficient, rugged, and safe) was revisited and modified using mixed-mode SPE purification to adapt the method to the particular physicochemical properties of HAAs and the fatty nature of the beef matrix. The UHPLC-MS/MS analysis was performed on a C8 column in less than 4 min using positive APCI ionisation and an internal standard. The method was validated according to the European Medicines Agency and Eurachem guidelines and was successfully applied to beef samples of various cooking degrees, showing HAA levels similar to those shown by previous studies.
Published: 2020

56. High Heterogeneity of Multidrug-Resistant Enterobacteriaceae Fecal Levels in Hospitalized Patients Is Partially Driven by Intravenous β-Lactams

Author: Miguel A. Sanz, Joao B. Xavier, Bernhard Kuster, Alejandro Artacho, Beatriz Herrera, Iván Peñaranda, Miguel Salavert, Ana Djukovic, Carles Ubeda, Laurent Debrauwer, Jaime Sanz, María José Garzón, Jose Luis López-Hontangas, Eva María González-Barberá, Karina B. Xavier, Jean-Marc Rolain, Centro de Ciencias de la Atmosfera [Mexico], Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Service d'hématologie clinique [Avicenne], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Avicenne, Memorial Sloane Kettering Cancer Center [New York], Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN)
Subjects: medicine.medical_specialty, medicine.drug_class, Antibiotics, Cephalosporin, Microbial Sensitivity Tests, Clinical Therapeutics, beta-Lactams, Meropenem, Feces, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Antibiotic resistance, Enterobacteriaceae, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Drug Resistance, Multiple, Bacterial, Internal medicine, medicine, Humans, Pharmacology (medical), Clinical significance, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Pharmacology, 0303 health sciences, Acute leukemia, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, Leukemia, biology, 030306 microbiology, business.industry, biology.organism_classification, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, Anti-Bacterial Agents, Cephalosporins, Culture Media, 3. Good health, Hospitalization, Multiple drug resistance, Infectious Diseases, Injections, Intravenous, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, business, medicine.drug
Abstract: International audience; Multidrug-resistant Enterobacteriaceae (MRE) colonize the intestine asymptomatically from where they can breach into the bloodstream and cause life-threatening infections, especially in heavily colonized patients. Despite the clinical relevance of MRE colonization levels, we know little about how they vary in hospitalized patients and the clinical factors that determine those levels. Here we conducted one of the largest studies of MRE fecal levels by tracking longitudinally 133 acute leukemia patients and monitoring their MRE levels over time through extensive culturing. MRE were defined as Enterobactericeae species that acquired non-susceptibility to ≥1 agent in ≥3 antimicrobial categories. In addition, due to the selective media used, the MRE had to be resistant to third-generation cephalosporins. MRE were detected in 60% of the patients, but their fecal levels varied considerably among patients and within the same patient (>6 and 4 orders of magnitude, respectively). Multivariate analysis of clinical metadata revealed an impact of intravenous beta-lactams (i.e. meropenem and piperacillin-tazobactam), which significantly diminished the fecal MRE levels in hospitalized patients. Consistent with a direct action of beta-lactams, we found an effect only when the patient was colonized with strains sensitive to the administered beta-lactam (p
Published: 2020

57. Modelling intrahepatic metabolic rewiring during the onset of obesity using arterio- venous blood metabolomics profiles

Author: Nathalie Poupin, Marie Tremblay-Franco, Cécile Canlet, Aurélien Amiel, Didier Rémond, Laurent Debrauwer, Dominique Dardevet, Fabien Jourdan, Isabelle Savary-Auzeloux, Sergio Polakof, Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolomique et Fluxomique (MetaToul) (TBI-MetaToul), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université
Subjects: [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2020

58. A European proposal for quality control and quality assurance of tandem mass spectral libraries

Author: Emma L. Schymanski, Tobias Schulze, Adrian Covaci, Laurent Debrauwer, François Fenaille, Martin Krauss, Marja H. Lamoree, Kathleen Rousseau, Annelaure Damont, Herbert Oberacher, Noelia Caballero-Casero, Michael Sasse, Emilien L. Jamin, Jean-Philippe Antignac, Yann Guitton, University of Innsbruck, Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Helmholtz Zentrum für Umweltforschung = Helmholtz Centre for Environmental Research (UFZ), Toxicological Center, University of Antwerp (UA)-Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Vrije Universiteit Brussel [Bruxelles] (VUB), Luxembourg Centre For Systems Biomedicine (LCSB), University of Luxembourg [Luxembourg], The authors acknowledge financial support by the HBM4EU project. HBM4EU has received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under Grant Agreement No. 733032., European Project: 733032, Leopold Franzens Universität Innsbruck - University of Innsbruck, École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), ToxAlim (ToxAlim), Helmholtz Centre for Environmental Research (UFZ), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay, E&H: Environmental Chemistry and Toxicology, AIMMS, Fonds National de la Recherche - FnR [sponsor], and Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB) [research center]
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Compound identification, Computer science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Liquid chromatography mass spectrometry, Tandem mass spectral library, Context (language use), HRMS, Orbitrap, Tandem mass spectrometry, Non-targeted analysis, 01 natural sciences, Environmental science, law.invention, Chemistry [G01] [Physical, chemical, mathematical & earth Sciences], 03 medical and health sciences, law, Biology, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, business.industry, 010401 analytical chemistry, Comparability, Quality control, Pollution, Data science, Quality assurance, 0104 chemical sciences, Human biomonitoring, Identification (information), Chemistry, Chimie [G01] [Physique, chimie, mathématiques & sciences de la terre], Ion trap, Suspect, business, Exposomics
Abstract: Background High resolution mass spectrometry (HRMS) is being used increasingly in the context of suspect and non-targeted screening for the identification of bioorganic molecules. There is correspondingly increasing awareness that higher confidence identification will require a systematic, group effort to increase the fraction of compounds with tandem mass spectra available in central, publicly available resources. While typical suspect screening efforts will only result in tentative annotations with a moderate level of confidence, library spectral matches will yield higher confidence or even full confirmation of the identity if the reference standards are available. Results This article first explores representative percent coverage of measured tandem mass spectra in selected major environmental suspect databases of interest in the context of human biomonitoring, demonstrating the current extensive gap between the number of potential substances of interest (up to hundreds of thousands) and measured spectra (0.57–3.6% of the total chemicals have spectral information available). Furthermore, certain datasets are benchmarked, based on previous efforts, to show the extent to which acquired experimental data were comparable between laboratories, even with HRMS instruments based on different technologies (i.e., quadrupole–quadrupole-time of flight versus ion trap/quadrupole-Orbitrap). Instruments and settings that are less comparable are also revealed, primarily linear ion trap instruments, which show distinctly lower comparability. Conclusions Based on these efforts, harmonization guidelines for the acquisition and processing of tandem mass spectrometry data are proposed to enable European (and ideally worldwide) laboratories to contribute to common resources, without requiring extensive changes to their current in house methods.
Published: 2020

59. Lactose and Fructo-oligosaccharides Increase Visceral Sensitivity in Mice via Glycation Processes, Increasing Mast Cell Density in Colonic Mucosa

Author: Sophie Yvon, Mathilde Leveque, Maïwenn Olier, Françoise Guéraud, Helene Eutamene, Vassilia Theodorou, Pauline Rivière, Sylvie Chevolleau, Valérie Tondereau, Jean-François Martin, Jasper B. J. Kamphuis, Laurent Debrauwer, Bruno P. Guiard, Isabelle Jouanin, Maria-Helena Noguer-Meireles, LESUR, Hélène, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherches sur la Cognition Animale - UMR5169 (CRCA), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuro-Gastroentérologie & Nutrition (ToxAlim-NGN), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Bibliothèque Sainte-Geneviève (BSG), Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3, Prévention et promotion de la cancérogénèse par les aliments (ToxAlim-PPCA), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Receptor for Advanced Glycation End Products, Oligosaccharides, Lactose, Advanced Glycation End Products, Irritable Bowel Syndrome, Feces, Mice, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Glycation, Mast Cells, Intestinal Mucosa, Irritable bowel syndrome, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Gastroenterology, Abdominal Oblique Muscles, Mast cell, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, medicine.anatomical_structure, Hyperalgesia, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Vitamin B Complex, Advanced glycation end-product, 030211 gastroenterology & hepatology, FODMAP, medicine.medical_specialty, Colon, 03 medical and health sciences, Bloating, Internal medicine, medicine, Animals, Gastrointestinal Transit, Mouse Model, Hepatology, Electromyography, Functional Bowel Disorder, Mastocytes, medicine.disease, Diet, Mice, Inbred C57BL, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, Endocrinology, chemistry, Fermentation, Pyridoxamine
Abstract: International audience; Background & AimsIrritable bowel syndrome (IBS) is characterized by abdominal pain, bloating, and erratic bowel habits. A diet low in fermentable oligosaccharides, disaccharides, monosaccharides, and polyols (FODMAPs) can reduce symptoms of IBS, possibly by reducing microbial fermentation products. We investigated whether ingestion of FODMAPs can induce IBS-like visceral hypersensitivity mediated by fermentation products of intestinal microbes in mice.MethodsC57Bl/6 mice were gavaged with lactose, with or without the antiglycation agent pyridoxamine, or saline (controls) daily for 3 weeks. A separate group of mice were fed a diet containing fructo-oligosaccharides, with or without pyridoxamine in drinking water, or a normal chow diet (controls) for 6 weeks. Feces were collected and analyzed by 16S ribosomal RNA gene sequencing and bacterial community analyses. Abdominal sensitivity was measured by electromyography and mechanical von Frey filament assays. Colon tissues were collected from some mice and analyzed by histology and immunofluorescence to quantify mast cells and expression of advanced glycosylation end-product specific receptor (AGER).ResultsMice gavaged with lactose or fed fructo-oligosaccharides had increased abdominal sensitivity compared with controls, associated with increased numbers of mast cells in colon and expression of the receptor for AGER in proximal colon epithelium. These effects were prevented by administration of pyridoxamine. Lactose and/or pyridoxamine did not induce significant alterations in the composition of the fecal microbiota. Mass spectrometric analysis of carbonyl compounds in fecal samples identified signatures associated with mice given lactose or fructo-oligosaccharides vs controls.ConclusionsWe found that oral administration of lactose or fructo-oligosaccharides to mice increases abdominal sensitivity, associated with increased numbers of mast cells in colon and expression of AGER; these can be prevented with an antiglycation agent. Lactose and/or pyridoxamine did not produce alterations in fecal microbiota of mice. Our findings indicate that preventing glycation reactions might reduce abdominal pain in patients with IBS with sensitivity to FODMAPs.
Published: 2020

60. Proton NMR enables the absolute quantification of aqueous metabolites and lipid classes in unique mouse liver samples

Author: Aurélien Amiel, Hervé Guillou, Marie Tremblay-Franco, Simon Ducheix, Roselyne Gautier, Alexandra Montagner, Laurent Debrauwer, Arnaud Polizzi, Justine Bertrand-Michel, Cécile Canlet, ProdInra, Migration, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), National Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics, Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateau MetaToul-LIPIDOMIQUE = MetaToul-Lipidomics, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-MetaboHUB-MetaToul, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Région Occitanie (H.G., A.P., A.M., S.D.), ANR Hepadialogue ANR-17-CE14-0015 (H.G., A.P., A.M., S.D.), and the French National Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics MetaboHUB ANR-11-INBS-010 (C.C., A.A., L.D., M.T.-F., R.G., J.B.-M.), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Canlet, Cécile
Subjects: 0301 basic medicine, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Metabolite, 1H-NMR spectroscopy, Toxicology, liver, 01 natural sciences, Biochemistry, Article, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Lipidomics, medicine, steatosis, Food and Nutrition, Molecular Biology, Toxicologie, Alanine, Aqueous solution, Chromatography, Cholesterol, 010401 analytical chemistry, Extraction (chemistry), metabolomics quantitative profiling, medicine.disease, 0104 chemical sciences, [SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, 030104 developmental biology, chemistry, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Alimentation et Nutrition, Proton NMR, lipidomics, Steatosis, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; Hepatic metabolites provide valuable information on the physiological state of an organism, and thus, they are monitored in many clinical situations. Typically, monitoring requires several analyses for each class of targeted metabolite, which is time consuming. The present study aimed to evaluate a proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR) method for obtaining quantitative measurements of aqueous and lipidic metabolites. We optimized the extraction protocol, the standard samples, and the organic solvents for the absolute quantification of lipid species. To validate the method, we analyzed metabolic profiles in livers of mice fed three different diets. We compared our results with values obtained with conventional methods and found strong correlations. The 1H-NMR protocol enabled the absolute quantification of 29 aqueous metabolites and eight lipid classes. Results showed that mice fed a diet enriched in saturated fatty acids had higher levels of triglycerides, cholesterol ester, monounsaturated fatty acids, lactate, 3-hydroxy-butyrate, and alanine and lower levels of glucose, compared to mice fed a control diet. In conclusion, proton NMR provided a rapid overview of the main lipid classes (triglycerides, cholesterol, phospholipids, fatty acids) and the most abundant aqueous metabolites in liver.
Published: 2020

61. Targeting Colon Luminal Lipid Peroxidation Limits Colon Carcinogenesis Associated with Red Meat Consumption

Author: Pascal Schlich, Véronique Santé-Lhoutellier, Fabrice Pierre, Valérie Scislowski, Nathalie Naud, Thierry Sayd, Didier Viala, Didier Attaix, Laurent Debrauwer, Gunter G. C. Kuhnle, Adeline Blot, Denis E. Corpet, Françoise Guéraud, Estelle Pujos-Guillot, Nathalie Meunier, Florence Blas-Y-Estrada, Christine Urbano, Sylviane Taché, Sylvie Chevolleau, Océane C B Martin, Céline Chantelauze, Denis Durand, J. Dupuy, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), SensoStat, Food and Nutritional Sciences, University of Reading (UOR), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CRNH, Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Meat Quality and Processes, Association pour le Développement de l'Industrie de la Viande, ANR [ANR-10-ALIA-14], INRA, ADIV, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Prévention et promotion de la cancérogénèse par les aliments (ToxAlim-PPCA), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Plateforme Ezop (Ezop), Association pour le Développement de l'Industrie de la Viande (ADIV), French National Institute for Agricultural Research (INRA) French Technical Center of Meat (ADIV), ANR-10-ALIA-0014,SECURIVIANDE,Stratégies préventives de la cancérogenèse colorectale en production et transformation des viandes(2010), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Male, intermediate consumption, 0301 basic medicine, Cancer Research, Antioxidant, Colorectal cancer, medicine.medical_treatment, Lipid peroxidation, Feces, Mice, chemistry.chemical_compound, Cooking, 2. Zero hunger, Human feces, Cross-Over Studies, peroxydation lipidique, food and beverages, lipid peroxidation, Middle Aged, Healthy Volunteers, 3. Good health, Oncology, Red Meat Consumption, Colonic Neoplasms, Red meat, biomarker, Female, carcinogenesis, biomarqueur, cancerogénèse, Adult, medicine.medical_specialty, Azoxymethane, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Heme, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Animals, Humans, viande rouge, Carcinogen, 030109 nutrition & dietetics, colon, business.industry, Neoplasms, Experimental, medicine.disease, Rats, Inbred F344, Rats, Red Meat, consommation, Endocrinology, chemistry, Carcinogens, business, Biomarkers
Abstract: Red meat is probably carcinogenic to humans (WHO/IARC class 2A), in part through heme iron-induced lipoperoxidation. Here, we investigated whether red meat promotes carcinogenesis in rodents and modulates associated biomarkers in volunteers, speculating that an antioxidant marinade could suppress these effects via limitation of the heme induced lipid peroxidation. We gave marinated or non-marinated beef with various degrees of cooking to azoxymethane-initiated rats, Min mice, and human volunteers (crossover study). Mucin-depleted foci were scored in rats, adenoma in Min mice. Biomarkers of lipoperoxidation were measured in the feces and urine of rats, mice, and volunteers. The organoleptic properties of marinated meat were tested. Fresh beef increased colon carcinogenesis and lipoperoxidation in rats and mice and lipoperoxidation in humans. Without an adverse organoleptic effect on meat, marinade normalized peroxidation biomarkers in rat and mouse feces, reduced peroxidation in human feces and reduced the number of Mucin-depleted foci in rats and adenoma in female Min mice. This could lead to protective strategies to decrease the colorectal cancer burden associated with red meat consumption. Cancer Prev Res; 11(9); 569–80. ©2018 AACR.
Published: 2018

62. Dietary pesticide exposure profiles in the NutriNet-Santé cohort

Author: Emmanuelle Kesse-Guyot, Denis Lairon, Julia Baudry, Mathilde Touvier, Jean-Pierre Cravedi, Laurence Gamet-Payrastre, Pauline Rebouillat, Serge Hercberg, Bruno Taupier-Letage, Laurent Debrauwer, Rodolphe Vidal, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), FENS, REBOUILLAT, Pauline, AUDOUX, Michèle, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition (C2VN), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 030309 nutrition & dietetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Medicine (miscellaneous), Spinosad, 030209 endocrinology & metabolism, Biology, Food group, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Intermediate energy, Environmental health, Medicine, 030212 general & internal medicine, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, education.field_of_study, Nutrition and Dietetics, business.industry, Dietary exposure, 030503 health policy & services, Public Health, Environmental and Occupational Health, Vegan Diet, Pesticide, 16. Peace & justice, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Agriculture, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Cohort, Food systems, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, 0305 other medical science, business, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, medicine.drug
Abstract: Pesticides are used in large quantities in current agriculture all over Europe. Some pesticides are suspected of having negative effects on human health. While the risk associated with occupational exposure is getting well-documented, evidence of dietary exposure to these molecules in the general population is lacking. The aim of this study is to describe dietary exposure to pesticides among NutriNet-Santé cohort participants’.NutriNet-Santé is a web-based cohort of French middle-aged adults launched in 2009. BioNutriNet is an ancillary study launched in 2014, aiming to measure organic and conventional food consumption and evaluate different dimensions of diet sustainability. Dietary intake of organic and conventional foods was assessed using a 264 items self-administered semi-quantitative food frequency questionnaire. Exposure to 25 commonly used pesticides was evaluated using contamination data from CVUA Stuttgart accounting for farming system. Dietary pesticide exposure profiles were identified using Non-Negative Matrix factorization (NMF), specially adapted for non-negative data with excess zeros. The NMF scores were then introduced in a hierarchical clustering process. Identified clusters were described in terms of sociodemographics, dietary patterns and exposure to pesticides.A total of 34,442 participants were selected. Four clusters were identified. All clusters seemed to be exposed to the same molecules, with gradual intensity. The first cluster was characterized by the lowest energy-intake, highest organic food consumption (26.9%) and lowest dietary pesticide exposure; participants had highest consumption levels of organic food groups, including fruits and vegetables. Proportion of male participants and of rural residents was higher than in other groups. Clusters 2 and 3 were characterized by intermediate energy intake, and low organic food consumption. High conventional fruits and vegetables intake and moderate pesticide exposure were observed in cluster 2, composed of a lower smokers’ proportion. Cluster 3 individuals were less exposed to pesticides than clusters 2 and 4, except for Spinosad and Pyrethrins. Cluster 4 was characterized by the highest energy intake, lowest organic food consumption (12.2%), and highest pesticide exposure ; high consumption levels of conventional fruits, vegetables and a higher proportion of vegetarians were observed. This cluster was composed of 85.6% female participants, mainly retired (47.5%), mostly living in cities of 200 000 inhabitants and more (48.2%), and physically active.Dietary pesticide exposures seem to vary across the clusters and depending on the proportion of organic food in the diet. High consumers of conventional fruits and vegetables consumers seem to be more exposed to our selection of pesticides.
Published: 2019

63. From genomics to metabolomics, moving toward an integrated strategy for the discovery of fungal secondary metabolites

Author: Isabelle P. Oswald, Emilien L. Jamin, Thaïs Hautbergue, Olivier Puel, Laurent Debrauwer, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, MetaboHUB, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), This study was co-funded by INRA and French Minister of Higher Education and Research in the context of a project supported by French National Agency of Research (ANR-15-CE21-0010-21Newmyco), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-15-CE21-0010,Newmyco,Metabolome de deux contaminants fongiques du blé d'importance majeure: identification de nouveaux métabolites toxiques(2015), ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaboHUB-MetaToul, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), OSWALD, Isabelle, Metabolome de deux contaminants fongiques du blé d'importance majeure: identification de nouveaux métabolites toxiques - - Newmyco2015 - ANR-15-CE21-0010 - AAPG2015 - VALID, and Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation - - METABOHUB2011 - ANR-11-INBS-0010 - INBS - VALID
Subjects: Proteomics, 0301 basic medicine, MESH: Isotope Labeling, MESH: Genomics / methods, [SDV]Life Sciences [q-bio], Secondary Metabolism, Biochemistry, Gene Knockout Techniques, Drug Discovery, Data Mining, MESH: Gene Knockout Techniques, Animal health, Drug discovery, Culture environment, Genomics, MESH: Proteomics / methods, [SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, MESH: Secondary Metabolism, [SDV.TOX.TVM] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Vegetal toxicology and mycotoxicology, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Isotope Labeling, Multigene Family, MESH: Genome, Fungal, Identification (biology), Genome, Fungal, MESH: Metabolomics / methods, Emerging technologies, [SDV.TOX.TVM]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Vegetal toxicology and mycotoxicology, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, Computational biology, Biology, 03 medical and health sciences, Metabolomics, MESH: Computer Simulation, MESH: Drug Discovery, Computer Simulation, MESH: Biological Products / metabolism, Secondary metabolism, MESH: Biological Products / isolation & purification, Biological Products, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, MESH: Fungi / metabolism, Organic Chemistry, [SDV.BA.MVSA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, Fungi, MESH: Fungi / genetics, MESH: Data Mining / methods, 030104 developmental biology, [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, MESH: Multigene Family
Abstract: International audience; Fungal secondary metabolites are defined by bioactive properties that ensure adaptation of the fungus to its environment. Although some of these natural products are promising sources of new lead compounds especially for the pharmaceutical industry, others pose risks to human and animal health. The identification of secondary metabolites is critical to assessing both the utility and risks of these compounds. Since fungi present biological specificities different from other microorganisms, this review covers the different strategies specifically used in fungal studies to perform this critical identification. Strategies focused on the direct detection of the secondary metabolites are firstly reported. Particularly, advances in high-throughput untargeted metabolomics have led to the generation of large datasets whose exploitation and interpretation generally require bioinformatics tools. Then, the genome-based methods used to study the entire fungal metabolic potential are reported. Transcriptomic and proteomic tools used in the discovery of fungal secondary metabolites are presented as links between genomic methods and metabolomic experiments. Finally, the influence of the culture environment on the synthesis of secondary metabolites by fungi is highlighted as a major factor to consider in research on fungal secondary metabolites. Through this review, we seek to emphasize that the discovery of natural products should integrate all of these valuable tools. Attention is also drawn to emerging technologies that will certainly revolutionize fungal research and to the use of computational tools that are necessary but whose results should be interpreted carefully.
Published: 2018

64. An efficient data-filtering strategy for easy metabolite detection from the direct analysis of a biological fluid using Fourier transform mass spectrometry

Author: Estelle Rathahao-Paris, Jean-Pierre Cravedi, Sandra Alves, Laurent Debrauwer, and Alain Paris
Subjects: 0301 basic medicine, Chromatography, Isotope, Metabolite, 010401 analytical chemistry, Organic Chemistry, Extraction (chemistry), Filter (signal processing), Mass spectrometry, 01 natural sciences, Fourier transform ion cyclotron resonance, 0104 chemical sciences, Analytical Chemistry, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 030104 developmental biology, chemistry, Data extraction, Vinclozolin, Spectroscopy
Abstract: RATIONALE High-throughput analyses require an overall analytical workflow including not only a robust and high-speed technical platform, but also dedicated data-processing tools able to extract the relevant information. This work aimed at evaluating post-acquisition data-mining tools for selective extraction of metabolite species from direct introduction high-resolution mass spectrometry data. METHODS Investigations were performed on spectral data in which seven metabolites of vinclozolin, a dicarboximide fungicide containing two chloride atoms, were previously manually identified. The spectral data obtained from direct introduction (DI) and high-resolution mass spectrometry (HRMS) detection were post-processed by plotting the mass defect profiles and applying various data-filtering methods based on accurate mass values. RESULTS Exploration of mass defect profiles highlighted, in a specific plotting region, the presence of compounds containing common chemical elements and pairs of conjugated and non-conjugated metabolites resulting from classical metabolic pathways. Additionally, the judicious application of mass defect and/or isotope pattern filters removed many interfering ions from DI-HRMS data, greatly facilitating the detection of vinclozolin metabolites. Compared with previous results obtained by manual data treatment, three additional metabolites of vinclozolin were detected and putatively annotated. CONCLUSIONS Tracking simultaneously several specific species could be efficiently performed using data-mining tools based on accurate mass values. The selectivity of the data extraction was improved when the isotope filter was used for halogenated compounds, facilitating metabolite ion detection even for low-abundance species. Copyright © 2016 John Wiley & Sons, Ltd.
Published: 2017

65. Combination of Isotope Labeling and Molecular Networking of Tandem Mass Spectrometry Data To Reveal 69 Unknown Metabolites Produced by

Author: Thaïs, Hautbergue, Emilien L, Jamin, Robin, Costantino, Souria, Tadrist, Lauriane, Meneghetti, Jean-Claude, Tabet, Laurent, Debrauwer, Isabelle P, Oswald, and Olivier, Puel
Subjects: Carbon Isotopes, Molecular Structure, Nitrogen Isotopes, Cheese, Tandem Mass Spectrometry, Isotope Labeling, Food Microbiology, Penicillium, Pork Meat, Secondary Metabolism
Abstract: The secondary metabolome of
Published: 2019

66. Detection of plasmid-mediated colistin resistance, mcr-1 gene, in Escherichia coli isolated from high-risk patients with acute leukemia in Spain

Author: Miguel A. Sanz, Laurent Debrauwer, Ana Djukovic, Rym Lalaoui, Jaime Sanz, Eva María González-Barberá, Carles Ubeda, Sofiane Bakour, Karina B. Xavier, Jose Luis López-Hontangas, Jean-Marc Rolain, Bernhard Kuster, Miguel Salavert, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunitat Valenciana [Espagne] (FISABIO), Hospital Universitari i Politècnic La Fe, Universidad Carlos III de Madrid [Madrid] (UC3M), Instituto Gulbenkian de Ciência [Oeiras] (IGC), Fundação Calouste Gulbenkian, Technical University of Munich (TUM), Technische Universität München [München] (TUM), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CIBER de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), ANR FloraStopInfectMRE project, InfecERA-ERANET-Acciones complementarias [PCIN-2015-094], IHU Mediterranee Infection, Marseille, France, French Government [10-IAHU-03], Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hospital Universitari i Politècnic La Fe = University and Polytechnic Hospital La Fe, MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan)
Subjects: 0301 basic medicine, Microbiology (medical), medicine.drug_class, 030106 microbiology, Antibiotics, Colistin resistance, Microbial Sensitivity Tests, Biology, medicine.disease_cause, beta-Lactamases, Microbiology, Leukemic patients, 03 medical and health sciences, Minimum inhibitory concentration, 0302 clinical medicine, Plasmid, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Drug Resistance, Bacterial, medicine, Escherichia coli, Humans, Pharmacology (medical), [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, 030212 general & internal medicine, Escherichia coli Infections, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, Leukemia, Colistin, Escherichia coli Proteins, Middle Aged, biology.organism_classification, Enterobacteriaceae, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, 3. Good health, Anti-Bacterial Agents, Infectious Diseases, Spain, Colistin resistance, Escherichia coli, Leukemic patients, Spain, mcr-1 gene, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Multilocus sequence typing, mcr-1 gene, MCR-1, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, medicine.drug, Plasmids
Abstract: Background: Bacterial infections in immunocompromised patients are associated with a high mortality and morbidity rate. In this high-risk group, the presence of multidrug-resistant (MDR) bacteria, particularly bacteria that harbor a transferable antibiotic resistance gene, complicates the management of bacterial infections. In this study, we investigated the presence of the transferable colistin resistance mcr genes in patients with leukemia in Spain. Methods: 217 fecal samples collected in 2013-2015 from 56 patients with acute leukemia and colonized with MDR Enterobacteriaceae strains, were screened on September 2017 for the presence of the colistin resistance mcr genes (mcr-1 to -5) by multiplex PCR. mcr positive strains selected on LBJMR and Mac-Conkey supplemented with colistin (2 mu g/ml) media were phenotypically and molecularly characterized by antimicrobial susceptibility testing, minimum inhibitory concentration, multilocus sequence typing and plasmid characterization. Results: Among 217 fecal samples, 5 samples collected from 3 patients were positive for the presence of the mcr-1 colistin-resistance gene. Four Escherichia coli strains were isolated and exhibited resistance to colistin with MIC = 4 mu g/ml. Other genes conferring the resistance to beta-lactam antibiotics have also been identified in mcr-1 positive strains, including bla(TEM-206) and bla(TEM-98). Three different sequence types were identified, including ST1196, ST140 and ST10. Plasmid characterization allowed us to detect the mcr-1 colistin resistance gene on conjugative IncP plasmid type. Conclusion: To the best of our knowledge, we have identified the mcr-1 gene for the first time in leukemia patients in Spain. In light of these results, strictmeasures have been implemented to prevent its dissemination. (c) 2019 Japanese Society of Chemotherapy and The Japanese Association for Infectious Diseases. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.
Published: 2019

67. Développement d'une approche intégrative modélisatrice pour évaluer l'exposition interne foetale humaine à un contaminant, appliquée au bisphénol A au titre de molécule modèle

Author: Gayrard-Troy, Véronique V., Glenn Gauderat, Marlène Lacroix, Alain Berrebi, Daniel Zalko, Laurent Debrauwer, Catherine Viguié, Nicole Picard-Hagen, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Gynécologie‑Obstétrique, Hôpital Paule de Viguier, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], and Centre hospitalier universitaire de Toulouse - CHU Toulouse
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2019

68. Improvement of diet sustainability with increased level of organic food in the diet: findings from the BioNutriNet cohort

Author: Louise Seconda, Denis Lairon, Louis-Georges Soler, Bruno Taupier-Letage, Oualid Hamza, Marie-Josèphe Amiot, Emmanuelle Kesse-Guyot, Pilar Galan, Julia Baudry, Serge Hercberg, Christine Boizot-Szantai, Brigitte Langevin, Rodolphe Vidal, Benjamin Allès, Jean Pierre Cravedi, Philippe Pointereau, Laurent Debrauwer, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Solagro, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Sorbonne Paris Nord, Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Information – Technologies – Analyse Environnementale – Procédés Agricoles (UMR ITAP), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Marchés, Organisations, Institutions et Stratégies d'Acteurs (UMR MOISA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Alimentation et sciences sociales (ALISS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille (LIFL), Université de Lille, Sciences et Technologies-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Lille, Sciences Humaines et Sociales-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition (C2VN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Association Solagro (Solagro), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Sorbonne Paris Nord
Subjects: Male, 030309 nutrition & dietetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], Medicine (miscellaneous), 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, 7. Clean energy, dietary score, Cohort Studies, Surveys and Questionnaires, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, cumulative energy demand, 0303 health sciences, sustainability indicator, Nutrition and Dietetics, Energy demand, observational data, organic food consumption, Dietary pattern, Middle Aged, Nutrition Surveys, Cohort, diet monetary cost, Female, Food, Organic, France, dietary greenhouse gas emission, Nutritive Value, Adult, Adolescent, Food Contamination, Biology, 12. Responsible consumption, Feeding and Eating Disorders, 03 medical and health sciences, Young Adult, Economic indicator, Environmental health, Humans, dietary pesticide exposure, 0105 earth and related environmental sciences, Aged, Consumption (economics), Pesticide, Diet, 13. Climate action, Food, Greenhouse gas, Sustainability, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; Background: Organic food consumption has steadily increased over the past decade in westernized countries. Objective:We aimed, based on observational data, to compare some sustainability features of diets from consumers with varying levels of organic food. Methods: The diet sustainability among 29,210 participants of the NutriNet-Santé study was estimated using databases developed within the BioNutriNet project. Four dimensions (nutrition, environment, economy, and toxicology) of diet sustainability were assessed using: 1) nutritional indicators through dietary intakes and dietary scores, and BMI; 2) environmental indicators (greenhouse gas emissions, cumulative energy demand, and land occupation); 3) economic indicators via diet monetary costs; and 4) estimated daily food exposures to 15 pesticides. Adjusted means (95% CI) across weighted quintiles of organic food consumption in the diet were estimated via ANCOVA. Breakdown methods were used to disentangle the contribution of the production system (organic compared with conventional) from the dietary pattern in the variation of diet-related environmental impacts, monetary costs, and pesticide exposure, between the 2 extreme quintiles. Results: Higher organic food consumption was associated with higher plant-food and lower animal-food consumption, overall nutritional quality (higher dietary scores), and lower BMI. Dietrelated greenhouse-gas emissions, cumulative energy demand, and land occupation gradually decreased with increasing organic food consumption, whereas total diet monetary cost increased. Diet exposure to most pesticides decreased across quintiles. Conclusions: Diets of high organic food consumers were generally characterized by strong nutritional and environmental benefits. The latter were mostly driven by the low consumption of animal-based foods, whereas the production system was responsible for the higher diet monetary costs, and the overall reduced dietary pesticide exposure.
Published: 2019

69. Influence of digestion on consumer exposure to polychlorobiphenyls in meat

Author: Jérémy Ratel, Erwan Engel, Christelle Planche, Frederic Mercier, Cheng Zhang, Gaud Dervilly, Isabelle Albert, Jessica Tressou, Laurent Debrauwer, ProdInra, Migration, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Mathématiques et Informatique Appliquées (MIA-Paris), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [INFO]Computer Science [cs], [MATH] Mathematics [math], [MATH]Mathematics [math], [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [INFO] Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2019

70. Exposure to bisphenol A and bisphenol S and incident type 2 diabetes: A case-cohort study in the French cohort DESIR

Author: Rémy Slama, Marie-Aline Charles, Fanny Rancière, Beverley Balkau, Ronan Roussel, Laurent Debrauwer, Dianna J. Magliano, Marlène Z. Lacroix, Jérémie Botton, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Cité (UPC), Faculté de Pharmacie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S 872)), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Baker IDI Heart and Diabetes Institute, Monash University, Institut inter-Régional pour la SAnté (IRSA), Université de Paris (UP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ProdInra, Migration, Université Paris Cité (UPCité), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaboHUB-MetaToul, and Rancière, Fanny
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Bisphenol A, Pediatrics, endocrine system, Health, Toxicology and Mutagenesis, Type 2 diabetes, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, 010501 environmental sciences, Toxicology and food chain, 01 natural sciences, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Phenols, Risk Factors, Diabetes mellitus, Epidemiology, medicine, Humans, Sulfones, Science Selection, 030212 general & internal medicine, Benzhydryl Compounds, Toxicologie et chaîne alimentaire, 0105 earth and related environmental sciences, urogenital system, business.industry, Incidence, Incidence (epidemiology), Public Health, Environmental and Occupational Health, Environmental Exposure, medicine.disease, 3. Good health, Diabetes Mellitus, Type 2, [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, Bisphenol S, chemistry, Cohort, Environmental Pollutants, Female, France, business, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, Cohort study
Abstract: International audience; BACKGROUND:The question of whether exposure to bisphenol A (BPA) contributes to the development of type 2 diabetes is still unresolved. Most epidemiological evidence on the association between BPA and diabetes is from cross-sectional studies or longitudinal studies with single urinary measurements. No prospective study has examined exposure to BPA analogs such as bisphenol S (BPS) in relation to incident type 2 diabetes. OBJECTIVES:We aimed to investigate whether exposure to BPA and BPS, assessed at up to two time points, was associated with the incidence of type 2 diabetes. METHODS:We performed a case-cohort study on 755 participants without diabetes at baseline and followed-up over 9 y as part of the French prospective cohort Data from an Epidemiological Study on the Insulin Resistance Syndrome (D.E.S.I.R.). BPA-glucuronide (BPA-G) and BPS-glucuronide (BPS-G) were assessed in fasting spot urine samples collected during the health examinations at baseline and 3 y later. Associations with incident diabetes were examined using Prentice-weighted Cox regression models adjusted for potential confounders. RESULTS:A total of 201 incident cases of type 2 diabetes were diagnosed over the follow-up, including 30 in the subcohort. Compared with participants with the lowest average BPA exposure (below the first quartile), participants in the second, third, and fourth quartile groups of exposure had a near doubling of the risk of type 2 diabetes, with a hazard ratio (HR) = 2.56 (95% CI: 1.16, 5.65), 2.35 (95% CI: 1.07, 5.15), and 1.56 (95% CI: 0.68, 3.55), respectively. The detection of BPS-G in urine at one or both time points was associated with incident diabetes, with an HR = 2.81 (95% CI: 1.74, 4.53). DISCUSSION:This study shows positive associations between exposure to BPA and BPS and the incidence of type 2 diabetes, independent of traditional diabetes risk factors. Our results should be confirmed by recent, population-based observational studies in different populations and settings. Overall, these findings raise concerns about using BPS as a BPA substitute. Further research on BPA analogs is warranted.
Published: 2019

71. Urinary pesticide concentrations in French adults with low and high organic food consumption: results from the general population-based NutriNet-Santé

Author: Gwendolina Limon, Rodolphe Vidal, Serge Hercberg, Nathalie Druesne-Pecollo, Denis Lairon, Jean Pierre Cravedi, Emmanuelle Kesse-Guyot, Laurent Debrauwer, Bruno Taupier-Letage, Pilar Galan, Julia Baudry, Gaël Durand, Adéline Delcambre, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), LABOCEA Laboratoire [Plouzané, France], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-13-ALID-0001, ANR-13-ALID-0001,BioNutriNet,Consommation d'aliments issus de l'agriculture biologique: déterminants et motivation vis-à-vis de la durabilité, impact nutritionnel, économique, environnemental et toxicologique(2013), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), MetaToul AXIOM (E20), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Hôpital Avicenne, and Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition (C2VN)
Subjects: Adult, Male, Urinary system, Food consumption, Population based, 030501 epidemiology, Toxicology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Organophosphorus Compounds, Tandem Mass Spectrometry, Vegetables, Humans, Medicine, Prospective Studies, 2. Zero hunger, Pyrethroid, business.industry, Dietary exposure, Organophosphate, Public Health, Environmental and Occupational Health, pesticides, Middle Aged, Pesticide, Pollution, dietary exposure, chemistry, Fruit, Propensity score matching, Female, Food, Organic, epidemiology, France, 0305 other medical science, business, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Chromatography, Liquid
Abstract: International audience; An organic diet may reduce dietary exposure to pesticides but findings based on observational data are scant. We aimed to compare urinary pesticide concentrations between “organic” and “conventional” consumers from the NutriNet-Santé study. Organic food consumption was determined using a self-reported food frequency questionnaire. Individuals with a proportion of organic food in the whole diet (in g/d) below 10% were defined as low organic food consumers and those whose proportion was above 50% as high organic food consumers. A propensity score matching procedure was then used to obtain two similar subsets of 150 participants, differing mostly by the organic valence of their diet. Urinary pesticide and metabolite concentrations (organophosphorus, pyrethroid, and azole compounds) were determined by UPLC-MS/MS, standardized with respect to creatinine. The molar sums of total diethylphosphates, dimethylphosphates, and dialkylphosphates were also computed. Differences in distributions across groups were tested using Wilcoxon signed-rank test for matched data. Mean age was 58.5 years and 70% of participants were women. Significantly lower urinary levels of diethylthiophosphate, dimethylthiophosphate, dialkylphosphates, and free 3-phenoxybenzoic acid were observed among organic consumers compared to conventional consumers. Our findings confirm that exposure to certain organophosphate and pyrethroïd pesticides in adults may be lowered by switching from conventional to organic foods. This is particularly of high interest among conventional fruit and vegetable consumers, as their exposure may be the highest.
Published: 2019

72. Some differences in nutritional biomarkers are detected between consumers and non-consumers of organic foods: findings from the BioNutriNet Project

Author: Marie-Josèphe Amiot, Denis Lairon, Emmanuelle Kesse-Guyot, Véronique Ducros, Serge Hercberg, Nathalie Druesne-Pecollo, Laurent Debrauwer, Pilar Galan, Julia Baudry, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris 13 (UP13), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Service de Biochimie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Marchés, Organisations, Institutions et Stratégies d'Acteurs (UMR MOISA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition (C2VN), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), HESAM Université (HESAM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM)
Subjects: 0301 basic medicine, organic food, epidemiological study, Medicine (miscellaneous), minéraux, qualité nutritionnelle, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Food science, vitamine, Carotenoid, Original Research, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Nutrition and Dietetics, biology, acide gras, carotenoids, minerals, Micronutrient, vitamins, Lycopene, carotenoid, alimentation biologique, Zeaxanthin, Santé publique et épidémiologie, nutrition, Food Composition, Nutritional Value, and Toxicology, Alimentation et Nutrition, biomarker, biomarqueur, Linoleic acid, 030209 endocrinology & metabolism, fatty acids, 03 medical and health sciences, carotenoide, beta-Carotene, Food and Nutrition, étude épidémiologique, 030109 nutrition & dietetics, nutritional quality, Fatty acid, biomarkers, Fatty acid desaturase, chemistry, biology.protein, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, fatty acid, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science
Abstract: Background[br/] Meta-analyses have compared the nutrient content of both organic and non-organic foods. However, the impacts of such variations on human nutritional biomarkers still need to be assessed.[br/] Objective[br/] In a nested clinical study from the NutriNet-Santé study, we aimed to compare the nutritional status of “organic” and “non-organic” food consumers matched on a propensity score.[br/] Methods[br/] Based on self-reported organic food consumption assessed through a food frequency questionnaire, 150 low and 150 high organic food consumers were selected with < 10% or > 50% of organic food in their diet respectively (expressed as the proportion of organic food in the whole diet in g/d). Participants were matched using a propensity score derived from sociodemographic, food and health variables. Fasting plasma samples were analyzed using acknowledged laboratory methods for measurements of iron status, magnesium, copper, cadmium, carotenoids, vitamins A and E, and fatty acids.[br/] Results[br/] We found significant differences between low and high organic food consumers with similar dietary patterns, with respect to plasma levels of magnesium, fat-soluble micronutrients (α-carotene, β-carotene, lutein and zeaxanthin), fatty acids (linoleic, palmitoleic, γ-linolenic and docosapentanoeic acids), and some fatty acid desaturase indexes. No differences between the two groups were detected for plasma levels of iron, copper, cadmium, lycopene, β–cryptoxanthin, vitamins A and E.[br/] Conclusion[br/] If confirmed by other studies, our data suggest that a high consumption of organic foods, compared to very low consumption, modulates, to some extent, the nutritional status of individuals with similar dietary patterns. Further research including prospective cohort studies is needed to evaluate he clinical relevance of such differences.
Published: 2019

73. Identification of lipids of the stratum corneum by high performance thin layer chromatography and mass spectrometry

Author: Jean-Claude Tabet, Laëtitia Jourdes, Nathalie Borotra, Sandrine Bessou-Touya, Laurent Debrauwer, Hélène Duplan, Carine Jacques, Emilien L. Jamin, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Axiom Platform, Centre de Recherche Pierre Fabre (Centre de R&D Pierre Fabre), PIERRE FABRE, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Adult, Ceramide, Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization, 010402 general chemistry, Tandem mass spectrometry, Mass spectrometry, Ceramides, 01 natural sciences, high performance thin layer chromatography with ultraviolet detection, chemistry.chemical_compound, Tandem Mass Spectrometry, Stratum corneum, medicine, Humans, skin lipids, ceramide, High performance thin layer chromatography, Spectroscopy, mass spectrometry, Skin, chemistry.chemical_classification, Chromatography, integumentary system, Sphingosine, Chemistry, 010401 analytical chemistry, Fatty acid, General Medicine, Middle Aged, Lipids, Atomic and Molecular Physics, and Optics, 0104 chemical sciences, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, charge-driven fragmentation, identification, Female, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Gas chromatography, Chromatography, Thin Layer, Epidermis
Abstract: International audience; The stratum corneum, the outermost layer of the epidermis, is the most important skin barrier against exogenous physical and chemical effects, in addition to protecting against dehydration. Ceramides are integral parts of the intercellular lipid lamellae of the stratum corneum and play an important role in the barrier function of mammalian skin. Ceramides are sphingolipids consisting of sphingoid bases linked to fatty acids by an amide bond. Typical sphingoid bases in the skin are composed of dihydrosphingosine, sphingosine, phytosphingosine, and 6-hydroxysphingosine, and the fatty acid acyl chains are composed of non-hydroxy fatty acid, alpha-hydroxy fatty acid, omega-hydroxy fatty acid, and esterified omega-hydroxy fatty acid. Analytical methods, such as gas chromatography/mass spectrometry, high performance thin layer chromatography with UV detection, and liquid chromatography/mass spectrometry, have been developed for the identification and quantification of ceramides in the stratum corneum. However, only a few publications relate to the mass fragmentation patterns specific to ceramide types to determine the structure of skin ceramides. Moreover, these studies provide very limited structural information and only for some ceramides. Therefore, the aim of our study was to develop a quick and easy method of quantification of ceramides, cholesterol, and free fatty acids by high performance thin layer chromatography with ultraviolet detection. High performance thin layer chromatography with ultraviolet detection was also coupled with mass spectrometry using negative ionization by electrospray and tandem mass spectrometry (MS/MS) for identification of ceramides' structure.
Published: 2018

74. Identification des fonctions physiologiques de PPARbeta hépatocytaire : rôle possible dans le diabète de type 2

Author: Marie Tremblay-Franco, Walter Wahli, Aurélien Amiel, Céline Lukowicz, Hervé Guillou, Arnaud Polizzi, Géraldine Michel, Edwin Fouché, Cécile Canlet, Alexandra Montagner, Laurent Debrauwer, Marion Régnier, Frédéric Lasserre, and Claire Naylies
Subjects: Endocrinology, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Internal Medicine, General Medicine
Published: 2017

75. Comparison of the metabolism of 10 chemicals in human and pig skin explants

Author: Daniela Lange, Richard Cubberley, Carine Jacques-Jamin, Sébastien Grégoire, Daniel Zalko, E. N. Person, Emilien L. Jamin, Martina Klaric, Amy L. Roe, Laurent Debrauwer, S. Salhi, Helga Rothe, Joan Eilstein, Andreas Schepky, Hélène Duplan, Corie A. Ellison, Camille Genies, Nicola J. Hewitt, Centre de Recherche Pierre Fabre (Centre de R&D Pierre Fabre), PIERRE FABRE, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Beiersdorf AG, Procter and Gamble, GSK, Unilever, Cosmet Europe, Partenaires INRAE, Cosmetics Europe, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: pig, 0301 basic medicine, Swine, Skin Absorption, Metabolite, Glucuronidation, Aldehyde dehydrogenase, Human skin, Cosmetics, cosmetics chemicals, Administration, Cutaneous, Toxicology, Aryl sulfotransferase activity, 030226 pharmacology & pharmacy, Substrate Specificity, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Organ Culture Techniques, 0302 clinical medicine, Sulfation, Cytochrome P-450 Enzyme System, Species Specificity, Animals, Humans, Tissue Distribution, human, Glucuronosyltransferase, Research Articles, Skin, integumentary system, biology, Chemistry, Metabolism, Metabolic Detoxication, Phase II, 3. Good health, Metabolic pathway, 030104 developmental biology, skin metabolism, Biochemistry, comparison, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, biology.protein, Metabolic Detoxication, Phase I, Sulfotransferases, Research Article
Abstract: Skin metabolism is important to consider when assessing local toxicity and/or penetration of chemicals and their metabolites. If human skin supply is limited, pig skin can be used as an alternative. To identify any species differences, we have investigated the metabolism of 10 chemicals in a pig and human skin explant model. Phase I metabolic pathways in skin from both species included those known to occur via cytochrome P450s, esterases, alcohol dehydrogenases and aldehyde dehydrogenases. Common Phase II pathways were glucuronidation and sulfation but other conjugation pathways were also identified. Chemicals not metabolized by pig skin (caffeine, IQ and 4‐chloroaniline) were also not metabolized by human skin. Six chemicals metabolized by pig skin were metabolized to a similar extent (percentage parent remaining) by human skin. Human skin metabolites were also detected in pig skin incubations, except for one unidentified minor vanillin metabolite. Three cinnamyl alcohol metabolites were unique to pig skin but represented minor metabolites. There were notable species differences in the relative amounts of common metabolites. The difference in the abundance of the sulfate conjugates of resorcinol and 4‐amino‐3‐nitrophenol was in accordance with the known lack of aryl sulfotransferase activity in pigs. In conclusion, while qualitative comparisons of metabolic profiles were consistent between pig and human skin, there were some quantitative differences in the percentage of metabolites formed. This preliminary assessment suggests that pig skin is metabolically competent and could be a useful tool for evaluating potential first‐pass metabolism before testing in human‐derived tissues., We have investigated the metabolism of 10 chemicals in viable pig and human skin. Phase I and II metabolic pathways were present in skin from both species. Chemicals not metabolized by pig skin were also not metabolized by human skin. Six chemicals metabolized by pig skin were also metabolized to a similar extent by human skin. Pig and human skin produced common metabolites, although some species differences were observed and as their relative amounts differed.
Published: 2018

76. Proposal for a chemically consistent way to annotate ions arising from the analysis of reference compounds under ESI conditions: A prerequisite to proper mass spectral database constitution in metabolomics

Author: François Fenaille, Estelle Pujos-Guillot, Anna Warnet, Jean-Claude Tabet, Annelaure Damont, Laurent Debrauwer, Marie-Françoise Olivier, Bernard Lyan, Christophe Junot, Stéphane Bernillon, Emilien L. Jamin, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), MetaboHUB, Université Paris Saclay (COmUE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB), Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU), METABOHUB, ANR-11-INBS-0010, Service de Pharmacologie et d'Immunoanalyse (SPI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Plateforme d'Exploration du Métabolisme, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Subjects: Electrospray, High-resolution mass spectrometry, Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization, Databases, Factual, Annotation, Computational biology, Mass spectrometry, 01 natural sciences, Metabolomics, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Tandem Mass Spectrometry, Mass spectra, Fluxomics, Spectroscopy, Chromatography, High Pressure Liquid, Data Curation, Principal Component Analysis, Chemistry, 010405 organic chemistry, 010401 analytical chemistry, Computational Biology, MS databases, 0104 chemical sciences, Identification (information), Data exchange, Mass spectrum, Mass spectral database
Abstract: Nowadays, high-resolution mass spectrometry is widely used for metabolomic studies. Thanks to its high sensitivity, it enables the detection of a large range of metabolites. In metabolomics, the continuous quest for a metabolite identification as complete and accurate as possible has led during the last decade to an ever increasing development of public MS databases (including LC-MS data) concomitantly with bioinformatic tool expansion. To facilitate the annotation process of MS profiles obtained from biological samples, but also to ease data sharing, exchange, and exploitation, the standardization and harmonization of the way to describe and annotate mass spectra seemed crucial to us. Indeed, under electrospray (ESI) conditions, a single metabolite does not produce a unique ion corresponding to its protonated or deprotonated form but could lead to a complex mixture of signals. These MS signals result from the existence of different natural isotopologues of the same compound and also to the potential formation of adduct ions, homomultimeric and heteromultimeric ions, fragment ions resulting from "prompt" in-source dissociations. As a joint reflection process within the French Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics (MetaboHUB) and with the purpose of developing a robust and exchangeable annotated MS database made from pure reference compounds (chemical standards) analysis, it appeared to us that giving the metabolomics community some clues to standardize and unambiguously annotate each MS feature was a prerequisite to data entry and further efficient querying of the mass spectral database. The use of a harmonized notation is also mandatory for interlaboratory MS data exchange. Additionally, thorough description of the variety of MS signals arising from the analysis of a unique metabolite might provide greater confidence on its annotation.
Published: 2018

77. Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs

Author: Gaëlle Lefort, Laurence Liaubet, Patrick Tardivel, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Laurent Debrauwer, Nathalie Villa-Vialaneix, Rémi Servien, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), DigitAG, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

78. Solid-phase extraction of drugs with cuttlebone powder as a sorbent

Author: Ibtissem Ghorbel-Abid, Laurent Debrauwer, Rafik Kalfat, Hassen Khazri, Malika Trabelsi-Ayadi, National Institute of Research and Physico-Chemical Analysis, Partenaires INRAE, Faculté des Sciences de Bizerte [Université de Carthage], Université de Carthage - University of Carthage, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Cuttlefish, Naproxen, Sorbent, Surface Properties, [SDV]Life Sciences [q-bio], Filtration and Separation, Ibuprofen, 01 natural sciences, High-performance liquid chromatography, Bone and Bones, cuttlebone powder, drugs, Analytical Chemistry, Phase (matter), medicine, Animals, solid-phase extraction, Solid phase extraction, Particle Size, high-performance liquid chromatography, Chromatography, Molecular Structure, 010405 organic chemistry, Chemistry, 010401 analytical chemistry, Extraction (chemistry), Solid Phase Extraction, Decapodiformes, 0104 chemical sciences, Carbamazepine, Adsorption, Powders, Selectivity, medicine.drug
Abstract: International audience; We investigated cuttlefish bone powder for the solid-phase extraction of naproxen, ibuprofen and carbamazepine. The basic principles controlling the extraction are presented to aid in the choice of the nature and quantity of the extracting phase according to the sample matrix and the solute properties, based on the mechanisms of phase retention. Their retention mechanism is based on hydrogen bonding and electrostatic interactions. The results show a significant recovery rate for the three drugs, selectivity and low cost. The method has successfully reduced the amount of tested pharmaceuticals with recoveries higher than 87% at pH 4.
Published: 2018

79. Metabolic effects of a chronic dietary exposure to a low-dose oesticide cocktail in mice: Sexual dimorphism and role of the constitutive androstane receptor

Author: Jean-François Martin, Arnaud Polizzi, Hervé Guillou, Céline Lukowicz, Emilien L. Jamin, Cécile Canlet, Nicolas Loiseau, Laurent Debrauwer, Justine Bertrand-Michel, Vassilia Theodorou, Laurence Gamet-Payrastre, Talal Al Saati, Claire Naylies, Laila Mselli-Lakhal, Sandrine Ellero-Simatos, Alexandra Montagner, Marion Régnier, Yannick Lippi, Frédéric Lasserre, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Transcriptomic impact of Xenobiotics (E23 TRiX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, MetaboHUB, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuro-Gastroentérologie & Nutrition (ToxAlim-NGN), Exposition, Perturbation Endocrino-métabolique et Reproduction (ToxAlim-EXPER), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaboHUB-MetaToul, ProdInra, Migration, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Insecticides, Health, Toxicology and Mutagenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Physiology, Receptors, Cytoplasmic and Nuclear, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Animals, Genetically Modified, Dietary Exposure, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Mice, Sex Factors, Glucose Metabolism Disorder, Constitutive androstane receptor, medicine, Metabolome, Animals, Receptor, Toxicity Tests, Chronic, Constitutive Androstane Receptor, 0105 earth and related environmental sciences, Glucose Metabolism Disorders, business.industry, Research, Fatty liver, Body Weight, Public Health, Environmental and Occupational Health, Glutathione, Pesticide, medicine.disease, Fungicides, Industrial, Sexual dimorphism, Fatty Liver, Mice, Inbred C57BL, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, chemistry, Liver, Inactivation, Metabolic, Female, business
Abstract: Background: Epidemiological evidence suggests a link between pesticide exposure and the development of metabolic diseases. However, most experimental studies have evaluated the metabolic effects of pesticides using individual molecules, often at nonrelevant doses or in combination with other risk factors such as high-fat diets. Objectives: We aimed to evaluate, in mice, the metabolic consequences of chronic dietary exposure to a pesticide mixture at nontoxic doses, relevant to consumers’ risk assessment. Methods: A mixture of six pesticides commonly used in France, i.e., boscalid, captan, chlorpyrifos, thiofanate, thiacloprid, and ziram, was incorporated in a standard chow at doses exposing mice to the tolerable daily intake (TDI) of each pesticide. Wild-type (WT) and constitutive androstane receptor–deficient (CAR−/−) male and female mice were exposed for 52 wk. We assessed metabolic parameters [body weight (BW), food and water consumption, glucose tolerance, urinary metabolome] throughout the experiment. At the end of the experiment, we evaluated liver metabolism (histology, transcriptomics, metabolomics, lipidomics) and pesticide detoxification using liquid chromatography–mass spectrometry (LC-MS). Results: Compared to those fed control chow, WT male mice fed pesticide chow had greater BW gain and more adiposity. Moreover, these WT males fed pesticide chow exhibited characteristics of hepatic steatosis and glucose intolerance, which were not observed in those fed control chow. WT exposed female mice exhibited fasting hyperglycemia, higher reduced glutathione (GSH):oxidized glutathione (GSSG) liver ratio and perturbations of gut microbiota–related urinary metabolites compared to WT mice fed control chow. When we performed these experiments on CAR−/− mice, pesticide-exposed CAR−/− males did not exhibit BW gain or changes in glucose metabolism compared to the CAR−/− males fed control chow. Moreover, CAR−/− females fed pesticide chow exhibited pesticide toxicity with higher BWs and mortality rate compared to the CAR−/− females fed control chow. Conclusions: To our knowledge, we are the first to demonstrate a sexually dimorphic obesogenic and diabetogenic effect of chronic dietary exposure to a common mixture of pesticides at TDI levels, and to provide evidence for a partial role for CAR in an in vivo mouse model. This raises questions about the relevance of TDI for individual pesticides when present in a mixture. https://doi.org/10.1289/EHP2877
Published: 2018

80. Development and validation of an ultra high performance liquid chromatography-electrospray tandem mass spectrometry method using selective derivatisation, for the quantification of two reactive aldehydes produced by lipid peroxidation, HNE (4-hydroxy-2(E)-nonenal) and HHE (4-hydroxy-2(E)-hexenal) in faecal water

Author: Fabrice Pierre, Françoise Guéraud, Nathalie Naud, Isabelle Jouanin, Maria-Helena Noguer-Meireles, Laurent Debrauwer, Sylvie Chevolleau, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Prévention et promotion de la cancérogénèse par les aliments (ToxAlim-PPCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Electrospray, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, HHE (4-hydroxy-2(E)-hexenal, Mass spectrometry, Tandem mass spectrometry, 01 natural sciences, Biochemistry, Analytical Chemistry, Lipid peroxidation, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Feces, Drug Stability, Limit of Detection, Tandem Mass Spectrometry, Nonenal, HNE (4-hydroxy-2(E)-nonenal), Animals, Solid phase extraction, Chromatography, High Pressure Liquid, chemistry.chemical_classification, validation, Aldehydes, Chromatography, UHPLC-ESI-MS/MS method, 010401 analytical chemistry, Fatty acid, Reproducibility of Results, Cell Biology, General Medicine, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Rats, 030104 developmental biology, chemistry, Reagent, Linear Models, Lipid Peroxidation
Abstract: International audience; Red or processed meat rich diets have been shown to be associated with an elevated risk of colorectal cancer (CRC). One major hypothesis involves dietary heme iron which induces lipid peroxidation. The quantification of the resulting reactive aldehydes (e.g. HNE and HHE) in the colon lumen is therefore of great concern since these compounds are known for their cytotoxic and genotoxic properties. UHPLC-ESI-MS/MS method has been developed and validated for HNE and HHE quantification in rat faeces. Samples were derivatised using a brominated reagent (BBHA) in presence of pre-synthesized deuterated internal standards (HNE-d11/HHE-d5), extracted by solid phase extraction, and then analysed by LC-positive ESI-MS/MS (MRM) on a TSQ Vantage mass spectrometer. The use of BBHA allowed the efficient stabilisation of the unstable and reactive hydroxy-alkenals HNE and HHE. The MRM method allowed selective detection of HNE and HHE on the basis of characteristic transitions monitored from both the 79 and 81 bromine isotopic peaks. This method was validated according to the European Medicines Agency (EMEA) guidelines, by determining selectivity, sensitivity, linearity, carry-over effect, recovery, matrix effect, repeatability, trueness and intermediate precision. The performance of the method enabled the quantification of HNE and HHE in concentrations 0.10–0.15 μM in faecal water. Results are presented on the application to the quantification of HNE and HHE in different faecal waters obtained from faeces of rats fed diets with various fatty acid compositions thus corresponding to different pro-oxidative features.
Published: 2017

81. ASICS: an automatic method for identification andquantification of metabolites in complex 1D 1HNMR spectra

Author: Patrick Tardivel, Cécile Canlet, Gaëlle Lefort, Laurent Debrauwer, Marie Tremblay Franco, Didier Concordet, Rémi Servien, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Quantification of metabolites, NIST plasma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Metabolomics, Identification of metabolites, [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], Nuclear magnetic resonance
Abstract: National audience; One of the major challenges in NMR/mass spectrometry analysis of metabolic profiles relies onthe identification and quantification of metabolites in complex biological mixtures. These features aremandatory to make metabolomics asserting a general approach to test a priori formulated hypotheseson the basis of exhaustive metabolome characterization rather than an exploratory tool dealing with un-known metabolic features. In this communication we propose a method, named ASICS, based on astrong statistical theory that handles automatically the metabolites identification and quantification inproton NMR spectra. A statistical linear model is built to explain a complex spectrum using a librarycontaining pure metabolite spectra. This model can handle local or global chemical shift variations dueto experimental conditions using a warping function. A statistical lasso-type estimator identifies andquantifies the metabolites in the complex spectrum. This estimator shows good statistical properties andhandles peak overlapping issues. The performances of the method were investigated on known mixtures(such as synthetic urine) and on plasma datasets from duck and human (plasma NIST SRM1950) using alibrary of 175 pure metabolites. Results show noteworthy performances, outperforming current existingmethods (namely MetaboHunter, BATMAN, Bayesil or Chenomx) for the identification and the quan-tification of metabolites. Furthermore, ASICS could easily be used routinely according to its reasonablecomputational time (no more than 3 minutes for the whole analysis of a complex spectrum). In conclu-sion, ASICS is a completely automated procedure for metabolites identification and quantification in 1HNMR spectra of biological mixtures. It will enable empowering NMR-based metabolomics by quicklyand accurately helping experts to obtain metabolic profiles. ASICS is already available as a R function orwithin the more user-friendly Galaxy/W4M interface developed by the MetaboHUB infrastructure andIFB (French Institute of Bioinformatics).
Published: 2017

82. Biological and environmental influence on tissue fatty acid compositions in wild tropical tunas

Author: Fany Sardenne, Aurélien Amiel, Frédéric Ménard, Edwin Fouché, Edouard Kraffe, Laurent Debrauwer, Nathalie Bodin, MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Seychelles Fishing Authority (SFA) (SFA), Université des Seychelles, Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, Skipjack tuna, Chromatography, Gas, Physiology, panorama, Essential fatty acids, 01 natural sciences, Biochemistry, chemistry.chemical_compound, Animals, Polar and neutral lipids, 14. Life underwater, Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, biology, Tuna, Large pelagic fish, 010604 marine biology & hydrobiology, ACL, Fatty Acids, Fatty acid, 04 agricultural and veterinary sciences, biology.organism_classification, Eicosapentaenoic acid, Biological membrane, Oleic acid, chemistry, Docosahexaenoic acid, DISCOVERY, 040102 fisheries, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Arachidonic acid, Western Indian Ocean, Stearic acid, Docosapentaenoic acid, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, PUFA
Abstract: 00000; International audience; This study examined the fatty acid composition of three sympatric tropical tuna species (bigeye Thunnus obesus, yellowfin T. albacares and skipjack tuna Kastuwonus pelamis) sampled in the Western Indian Ocean in 2013. The fatty acid compositions of neutral and polar lipids, respectively involved in energy storage and cell membrane structure, were explored and compared in four tissues (red and white muscles, liver and gonads), according to biological (size, sex and maturity) and environmental (season and area) factors. The liver and the red muscle were the fattest tissues (i.e., higher levels of storage lipids) in all species and polar lipids were the lowest in the white muscle. Species and tissue types explained most differences in fatty acid compositions, while environmental factors had limited effects, except in the hepatic cell membrane where fatty acid composition varied with monsoons. Docosahexaenoic acid (22:6n-3) was the major fatty acid in both polar and neutral lipid fractions, especially in muscles. Eicosapentaenoic acid (20:5n-3) and oleic acid (18:1n-9) were in higher proportion in neutral than in polar lipids. Arachidonic acid (20:4n-6) and 22:6n-3, together with docosapentaenoic acid (22:5n-6) and stearic acid (18:0), showed preferential accumulation in polar lipids. 20:4n-6 was particularly involved in cell membranes of ovary and white muscle. Overall, an important inter-individual variability in fatty acid compositions of structural lipids was found within tissue types despite considering biological factors that are most likely to influence this type of lipids. It suggests that fatty acid profiles are influenced by individual-specific behaviors.
Published: 2017

83. ASICS: an automatic method for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Author: Patrick Tardivel, Didier Concordet, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Gaëlle Lefort, Rémi Servien, Laurent Debrauwer, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul-AXIOM, Plateforme de Métabolomique et de Chimie Analytique en Toxicologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, Quantification of metabolites, Computer science, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Analytical chemistry, 01 natural sciences, Biochemistry, Nuclear magnetic resonance, NIST Plasma, 03 medical and health sciences, Metabolomics, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Metabolome, Identification of metabolites, Statistical theory, 010401 analytical chemistry, Linear model, Estimator, 0104 chemical sciences, Identification (information), 030104 developmental biology, Proton NMR, A priori and a posteriori, Biological system
Abstract: International audience; Introduction : Experiments in metabolomics rely on the identification and quantification of metabolites in complex biological mixtures. This remains one of the major challenges in NMR/mass spectrometry analysis of metabolic profiles. These features are mandatory to make metabolomics asserting a general approach to test a priori formulated hypotheses on the basis of exhaustive metabolome characterization rather than an exploratory tool dealing with unknown metabolic features. Objectives : In this article we propose a method, named ASICS, based on a strong statistical theory that handles automatically the metabolites identification and quantification in proton NMR spectra. Methods : A statistical linear model is built to explain a complex spectrum using a library containing pure metabolite spectra. This model can handle local or global chemical shift variations due to experimental conditions using a warping function. A statistical lasso-type estimator identifies and quantifies the metabolites in the complex spectrum. This estimator shows good statistical properties and handles peak overlapping issues. Results : The performances of the method were investigated on known mixtures (such as synthetic urine) and on plasma datasets from duck and human. Results show noteworthy performances, outperforming current existing methods. Conclusion : ASICS is a completely automated procedure to identify and quantify metabolites in 1H NMR spectra of biological mixtures. It will enable empowering NMR-based metabolomics by quickly and accurately helping experts to obtain metabolic profiles.
Published: 2017

84. Development of an on-line solid phase extraction ultra performance liquid chromatography technique coupled to tandem mass spectrometry for quantification of bisphenol S and bisphenol S glucuronide: applicability to toxicokinetic investigations

Author: Nicole Picard-Hagen, Véronique Gayrard, Flore C. Grandin, Marlène Z. Lacroix, Sylvie Puel, Catherine Viguié, Laurent Debrauwer, Pierre-Louis Toutain, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Exposition, Perturbation Endocrino-métabolique et Reproduction (ToxAlim-EXPER), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Lacroix, Marlène Z.
Subjects: Bisphenol A, Bioanalysis, bisphenol S glucuronide, bisphenol S, toxicokinetic, liquid chromatography, mass spectrometry, Metabolite, [SDV]Life Sciences [q-bio], 010501 environmental sciences, Tandem mass spectrometry, 01 natural sciences, Biochemistry, Analytical Chemistry, chemistry.chemical_compound, Glucuronides, Phenols, Limit of Detection, Tandem Mass Spectrometry, Animals, Humans, Solid phase extraction, Sulfones, Chromatography, High Pressure Liquid, 0105 earth and related environmental sciences, Detection limit, Chromatography, Sheep, 010401 analytical chemistry, Organic Chemistry, Solid Phase Extraction, Reproducibility of Results, General Medicine, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Toxicokinetics, Bisphenol S, chemistry, Glucuronide, Blood Chemical Analysis
Abstract: International audience; Regulatory measures and public concerns regarding bisphenol A (BPA) have led to its replacement by structural analogs, such as Bisphenol S (BPS), in consumer products. At present, no toxicokinetic investigations have been conducted to assess the factors determining human internal exposure to BPS for subsequent risk assessment. Toxicokinetic studies require reliable analytical methods to measure the plasma concentrations of BPS and its main conjugated metabolite, BPS - glucuronide (BPS - G). An efficient on - li ne SPE - UPLC - MS/MS method for the simultaneous quantification of BPS and BPS - G in ovine plasma was therefore developed and validated in accordance with the European Medicine s Agency guidelines for bioanalytical method validation. This method has a limit of quantification of 3 ng mL - 1 for BPS and 10 ng mL - 1 for BPS - G , a n analytical capacity of 200 samples per day, and is particularly well suited to toxicokinetic studies. Use of this method in toxicokinetic studies in sheep showed that BPS, like BPA, is efficiently metabolized into its glucuronide form . However, the clearance s and distribution s of BPS and BPS - G were lower than those of the corresponding unconjugated and glucuroconjugated forms of BPA .
Published: 2017

85. Evidencing 98 secondary metabolites of Penicillium verrucosum using substrate isotopic labeling and high-resolution mass spectrometry

Author: Isabelle P. Oswald, Michel Pean, Olivier Puel, Thaïs Hautbergue, Emilien L. Jamin, Souria Tadrist, Marcel Delaforge, Lauriane Meneghetti, Laurent Debrauwer, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Axiom Platform, MetaToul-MetaboHUB, National Infrastructure of Metabolomics and Fluxomics, Groupe de Recherches Appliquées en Phytotechnologie (GRAP), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Microbiologie Environnementale et Moléculaire (MEM), Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French National Infrastructureof Metabolomics and Fluxomics (MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010), ANR-15-CE21-0010,Newmyco,Metabolome de deux contaminants fongiques du blé d'importance majeure: identification de nouveaux métabolites toxiques(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Puel, Olivier, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, penicillium verrucosum, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, mass spectrum analysis, toxicologie alimentaire, stable isotope labeling, Fungus, secondary metabolite, Secondary metabolite, Mass spectrometry, Biochemistry, Analytical Chemistry, Isotopic labeling, 03 medical and health sciences, Metabolomics, spectrométrie de masse, medicine, Penicillium verrucosum, Metabolome, Chromatography, High Pressure Liquid, mass spectrometry, molecular networking, Chromatography, biology, Chemistry, public health, fungus, Penicillium, Cell Biology, General Medicine, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, métabolite secondaire, santé publique, Isotope Labeling, secondary plant products, medicine.drug
Abstract: Industrial applications of fungal compounds, coupled with the emergence of fungal threats to natural ecosystems and public health, have increased interest in filamentous fungi. Among all pathogenic fungi, Penicillium verrucosum is one of the most common mold-infecting stored cereals in temperate regions. However, it is estimated that 80% of fungal secondary metabolites remain unknown. To detect new P. verrucosum compounds, an untargeted metabolomic approach was applied to fungus grown on wheat grains labeled with stable isotopes: (i) natural grains (99% 12C); (ii) grains enriched with 97% of 13C; and (iii) grains enriched with 53% of 13C and 97% of 15N. Analyses performed by high-performance liquid chromatography coupled with high-resolution mass spectrometry (HPLC-HRMS) enabled the specific detection of fungal metabolites, and the unambiguous characterization of their chemical formulas. In this way, 98 secondary metabolites were detected and their chemical formulas were determined. Of these, only 18 identifications could be made based on databases, the literature and mass spectrometry fragmentation experiments, with the result that 80 were totally unknown. Molecular networks were generated to analyze these results, leading to the characterization by MSn experiments of a new fungisporin produced by P. verrucosum. More generally, this article provides precise mass spectrometric data about all these compounds for further studies of the Penicillium metabolome.
Published: 2017

86. Relation between crust development and heterocyclic aromatic amine formation when air-roasting a meat cylinder

Author: Predrag Ikonić, Jérôme Molina, Sylvie Chevolleau, Sylvie Clerjon, Alain Kondjoyan, Stéphane Portanguen, Laurent Debrauwer, Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), University of Novi Sad - UNS (SERBIA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, University of Novi Sad, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)
Subjects: Hot Temperature, Organoleptic, Ingénierie des aliments, 01 natural sciences, croute, Analytical Chemistry, Cylinder (engine), law.invention, Heterocyclic Compounds, law, chaleur, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Roast beef, beef, crust, heat, heterocyclic amines, hot air, juice, transfer, Cooking, Food science, Amines, skin and connective tissue diseases, Roasting, chemistry.chemical_classification, crust, heterocyclic amines, heat, juice, transfer, beef, hot air, integumentary system, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, 040401 food science, Colored, Beef, Heterocyclic Aromatic Amines, Heterocyclic amines, Hot air, Meat, Biochimie, education, bœuf, Mineralogy, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, 0404 agricultural biotechnology, food, flux d'air chaud, Animals, Food engineering, amine hétérocyclique, Toxicologie, Juice, 010401 analytical chemistry, Aromatic amine, Crust, Creatine, Heat, food.food, 0104 chemical sciences, Transfer, chemistry, Cattle, jus, Warmth, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other, Food Science
Abstract: peer-reviewed, The meat crust that develops during cooking is desired by consumers for its organoleptic properties, but it is also where heterocyclic aromatic amines (HAs) are formed. Here we measured HAs formation during the development of a colored crust on the surface of a beef meat piece. HAs formation was lower in the crust than previously measured in meat slices subjected to the same air jet conditions. This difference is explained by a lower average temperature in the colored crust than in the meat slices. Temperature effects can also explain why colored crust failed to reproduce the plateauing and decrease in HAs content observed in meat slices. We observed a decrease in creatine content from the center of the meat piece to the crust area. In terms of the implications for practice, specific heating conditions can be found to maintain a roast beef meat aspect while dramatically reducing HAs content.
Published: 2016

87. Effects of pan cooking on micropollutants in meat

Author: Philippe Marchand, Patrick Blinet, Frédéric Mercier, Gaud Dervilly-Pinel, Sylvie Chevolleau, Jérémy Ratel, Erwan Engel, Christelle Planche, Laurent Debrauwer, Magaly Angénieux, Julie Zinck, Nathalie Marchond, Thierry Guérin, Claude Chafey, Engel, Erwan, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons-Alfort (LSAl), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), French National Research Agency - France ANR-12-ALID-0004, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratory for Food Safety, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: viande, Phorate, Hot Temperature, Meat, Food Handling, [SDV]Life Sciences [q-bio], meat, pan cooking, polychlorinated biphenyls (PCBs), polychlorinated dibenzo-p-dioxins, dibenzofurans (PCDD/Fs), trace elements, pesticides, comprehensive two-dimensional gas, chromatography-time-of-flight mass, spectrometry (GC GC-TOF/MS), chemical risk assessment, toxicologie alimentaire, Food chemistry, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Analytical Chemistry, chemistry.chemical_compound, Dieldrin, cuisson au four, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Aldrin, Cooking, biphenyl, pesticide, 0105 earth and related environmental sciences, Pollutant, élément trace, 010401 analytical chemistry, food and beverages, General Medicine, Pesticide, Polychlorinated Biphenyls, micropolluant, 0104 chemical sciences, 3. Good health, cuisson, chemistry, Environmental chemistry, Lindane, Sulfotep, Food Science
Abstract: International audience; This work presents the effects of pan cooking on PCBs, PCDD/Fs, pesticides and trace elements in meat from a risk assessment perspective. Three different realistic cooking intensities were studied. A GC_GC-TOF/MS method was set up for the multiresidue analysis of 189 PCBs, 17 PCDD/Fs and 16 pesticides whereas Cd, As, Pb and Hg were assayed by ICP-MS. In terms of quantity, average PCB losses after cooking were 18 ± 5% for rare, 30 ± 3% for medium, and 48 ± 2% for well-done meat. In contrast, average PCDD/F losses were not significant. For pesticides, no loss occurred for aldrin, lindane, DDE or DDD, whereas losses exceeding 80% were found for dieldrin, sulfotep or phorate. Losses close to the margin of error were observed for trace elements. These results are discussed in light of the physicochemical properties of the micropollutants as well as of water and fat losses into cooking juice.
Published: 2016

88. Disposition of fipronil in rats

Author: G. Delous, Daniel Zalko, Catherine Viguié, Laurent Debrauwer, Jean Pierre Cravedi, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Exposition, Perturbation Endocrino-métabolique et Reproduction (ToxAlim-EXPER), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), French Ministry of Ecology and Sustainable Development [PNRPE 000042], Midi Pyrenees region [08004686, 09006143], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Male, Insecticides, Environmental Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], Health, Toxicology and Mutagenesis, Metabolite, Adipose tissue, Urine, 010501 environmental sciences, Pharmacology, 01 natural sciences, Hydroxylation, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, In vivo, medicine, Animals, Environmental Chemistry, Tissue Distribution, Phenylpyrazoles, Biotransformation, Fipronil, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, 0303 health sciences, Kidney, Public Health, Environmental and Occupational Health, General Medicine, General Chemistry, Metabolism, Glucuronic acid, Pollution, Rats, 3. Good health, Pesticide, medicine.anatomical_structure, chemistry, Pyrazoles
Abstract: International audience; In the scientific literature, little attention has been paid to the disposition of fipronil, a phenyl pyrazole insecticide. In this study, the tissue distribution, the metabolic fate, and the elimination of fipronil was investigated in rats using radiolabeled fipronil. When a single oral dose of (14)C-fipronil (10 mg kg(-1) b.w.) was given to rats, the proportion of dose eliminated in urine and feces 72 h after dosing was ca 4% for each route. At the end of the experiment the highest levels of radioactivity were found in adipose tissue and adrenals. The main part of the radioactivity present in investigated tissues (adipose tissue, adrenals, liver, kidney, testes) was due to fipronil-sulfone. Five additional metabolites, isolated from urine were characterized by LC-MS/MS. Most of them are formed by the loss of the trifluoromethylsulphinyl group and subsequent hydroxylation and/or conjugation to glucuronic acid or sulfate. In conclusion, the retention of the metabolite fipronil sulfone in tissues following fipronil administration raises the question of the potential toxicity of this insecticide.
Published: 2013

89. Exposure to bisphenol S (BPS) and the incidence of type 2 diabetes in a French prospective cohort study

Author: M.-A. Charles, Marlène Z. Lacroix, Dianna J. Magliano, Fanny Rancière, Ronan Roussel, Jérémie Botton, Laurent Debrauwer, Beverley Balkau, and Remy Slama
Subjects: endocrine system, Pediatrics, medicine.medical_specialty, urogenital system, business.industry, Incidence (epidemiology), Type 2 diabetes, urologic and male genital diseases, medicine.disease, chemistry.chemical_compound, Bisphenol S, chemistry, General Earth and Planetary Sciences, Medicine, business, Prospective cohort study, reproductive and urinary physiology, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, General Environmental Science
Abstract: Introduction: Exposure to bisphenol A (BPA) substitutes is expected to increase in the coming years. Potential alternatives include bisphenol S (BPS), for which experimental studies suggest similar...
Published: 2016

90. Chemical Composition, Antioxidant and Cytotoxic Activities of Roots and Fruits of Berberis libanotica

Author: Leina El Hosry, Elnur Garayev, Fathi Mabrouki, Laurent Boyer, Riad Elias, Sok-Siya Bun, Edmond Cheble, Laurent Debrauwer, Lizette Auezova, Santé Publique et maladies Chroniques : Qualité de vie Concepts, Usages et Limites, Déterminants (SPMC), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques (IP-TPT), Service de Santé des Armées-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratory of Pharmacognosy and Ethnopharmacology, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Lebanese University [Beirut] (LU), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Lebanese University [Beirut], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Service de Santé des Armées, MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, Jatrorrhizine, Berberis, antioxidant, Hyperoside, Plant Science, phenolic compounds, Berberis libanotica, alkaloids, 01 natural sciences, Plant Roots, Antioxidants, chemistry.chemical_compound, Rutin, Chlorogenic acid, Drug Discovery, Humans, Gallic acid, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Pharmacology, biology, Traditional medicine, General Medicine, biology.organism_classification, Quercitrin, 3. Good health, 0104 chemical sciences, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, 010404 medicinal & biomolecular chemistry, Complementary and alternative medicine, chemistry, Fruit, cytotoxicity, Drug Screening Assays, Antitumor, Quercetin, HT29 Cells, 010606 plant biology & botany
Abstract: Fourteen compounds belonging to different chemical classes were characterized in the roots and fruits extracts from Berberis libanotica, using the same HPLC-DAD-MS method. Thirteen were reported, for the first time, from the fruits whereas the roots contained mostly alkaloids of which 3 out of 5 are reported for the first time. Their structures were established on the basis of MS data as gallic acid (1), chlorogenic acid (2), delphinidin (3), oxyacanthine (4), rutin (5), hyperoside (6), berbamine (7), isoquercitrin (8), quercitrin (9), jatrorrhizine (10), palmatine (11), berberine (12), quercetin (13) and luteolin (14). Extracts containing compounds 4 and 7 showed significant cytotoxicity against the HT29 cell line with an IC50 of 12.2–26.1 μg/mL. Fruits extracts, due mostly to compounds 1 and 2, showed potent antioxidant activities with an EC50 of 0.0025-0.019 mg/mL.
Published: 2016

91. PPARβ hépatocytaire est un senseur circadien des acides gras alimentaires

Author: Claire Naylies, Marie Tremblay-Franco, A. Amiel, Edwin Fouché, Frédéric Lasserre, H. Guillou, W. Wahli, Arnaud Polizzi, Géraldine Michel, Alexandra Montagner, Laurent Debrauwer, Céline Lukowicz, Marion Régnier, Yannick Lippi, and Cécile Canlet
Subjects: Nutrition and Dietetics, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Internal Medicine
Abstract: Introduction et but de l’etude La regulation du metabolisme hepatique des acides gras obeit a de nombreux mecanismes transcriptionnels. Les recepteurs actives par les proliferateurs de peroxysomes (PPARs) dont il existe trois isotypes, sont des facteurs de transcription de la famille des recepteurs nucleaires actives par des acides gras et leurs derives. Ils coexistent dans les hepatocytes. PPARa controle l’expression d’enzymes impliquees dans le catabolisme des acides gras hepatiques en reponse au jeune notamment et PPARg est exprime dans les situations de surcharge des hepatocytes en lipides ce qui suggere un role dans l’etiologie des steatoses hepatiques. PPARb est l’isotype dont la fonction hepatique est la moins connue. Afin d’etudier son role dans les hepatocytes, nous avons cree un nouveau modele murin de deletion hepato-specifique du recepteur par le systeme Albumine-Cre/Lox (Pparbhep–/–) et une approche de biologie integrative in vivo. Materiel et methodes Nous avons tout d’abord determine l’activite circadienne du recepteur par une approche transcriptomique. Apres avoir defini la fenetre d’activite circadienne du recepteur, nous avons analyse sa reponse a un stimulus pharmacologique (traitement avec un agoniste specifique de PPARb), metabolique (regime obesogene), pathologique (injection de LPS, regime deficient en methionine et choline favorisant la steatohepatite) et nutritionnel (regimes apportant differents types d’acides gras de l’alimentation). Nous avons utilise des approches combinant exploration fonctionnelle in vivo (tolerance au glucose, sensibilite a l’insuline), biochimie (lipidomique et RMN), histologie et analyses du transcriptome. Resultats Nos resultats ont prouve que, dans les hepatocytes, PPARb obeit in vivo a une regulation circadienne dependante de la prise alimentaire. En outre, nous avons montre que l’activite du recepteur est uniquement detectable en fin de phase nocturne, coincidant avec la forte activite glycolytique et lipogenique du foie. Le recepteur controle l’expression de genes impliques dans l’homeostasie des acides gras en reponse a une activation pharmacologique. L’activite du recepteur est inhibee en reponse a une inflammation aigue (choc septique) et chronique (steatohepatite). Il est egalement inhibe lors de la steatose induite par un regime obesogene. Enfin, PPARb est inhibe par un regime riche en polyinsatures alimentaires (huile de poisson) mais active par un regime deficient en acides gras essentiels (huile de coco hydrogene). L’absence de PPARb dans les hepatocytes inhibe la capacite du foie a reguler la biosynthese des acides gras insatures via la voie des desaturases (Scd1, Fads2) et elongases (Elovl6, Elovl5) qui est stimulee lors d’une carence alimentaire. Conclusion En conclusion, notre etude permet de mieux connaitre les fonctions hepatocytaires de PPARb dans des conditions physiologiques et physiopathologiques. De plus, nos travaux identifient PPARb comme le premier recepteur aux acides gras agissant comme regulateur circadien de l’homeostasie des lipides en reponse aux variations qualitatives des apports alimentaires.
Published: 2017

92. Pharmacokinetics, Metabolism and Excretion of Megazol in a Trypanosoma brucei gambiense Primate Model of Human African Trypanosomiasis

Author: G. Chauviere, Bernard Bouteille, Guy Dubreuil, Michel Dumas, Georges Houin, Bertin Enanga, Jacques Périé, Hamid Boudra, Laurent Debrauwer, Christian Labat, and Jerôme Mezui Me Ndong
Subjects: 0303 health sciences, 030306 microbiology, 030231 tropical medicine, Urine, Biology, Pharmacology, Trypanosoma brucei, medicine.disease, biology.organism_classification, 3. Good health, Megazol, Excretion, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, chemistry, Pharmacokinetics, Oral administration, Drug Discovery, Immunology, medicine, African trypanosomiasis, Feces
Abstract: The pharmacokinetics of megazol (2-amino-5-(1-methyl-5-nitro-2-imidazolyl)-1,3,4-thiadiazol, CAS 19622-55-0) was investigated after a 100 mg/kg oral administration to six primates infected with Trypanosoma brucei gambiense. The plasma levels of megazol were between 0.2 µg/ml and 46 µg/ ml 24 h after dosing in all animals. In animals with prolonged infection, megazol absorption was accelerated (T max was 4 h compared with 8 h, for day 53 and day 39 post inoculation) but the amount absorbed was not modified. The megazol concentrations in the cerebrospinal fluid represented between 5.5% and 10.6% of the plasma levels at the same times. Unchanged megazol was eliminated predominantly via the kidneys: 46-96% of the ingested dose was recovered in the urine, compared with 0-5% in the faeces. Furthermore, this urinary elimination of megazol was altered in animals with prolonged infections. In the urine, 4 unknown metabolites were observed, unchanged megazol was characterized by LC-MS/MS. This study indicates that megazol crosses the blood-brain barrier after oral administration. Prolonged infections affect the absorption of megazol and its urinary elimination.
Published: 2011

93. Metabolic Fate of [14C]Diuron and [14C]Linuron in Wheat (Triticum aestivum) and Radish (Raphanus sativus)

Author: Haifaa Alsayeda, Isabelle Jouanin, Sophie Pascal-Lorber, Cécile Canlet, Laurent Debrauwer, François Laurent, Xénobiotiques, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse - ENVT (FRANCE), and Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE)
Subjects: 0106 biological sciences, Plant uptake, BIOAVAILABILITY, Biodiversité et Ecologie, Phenylurea herbicides, [SDV]Life Sciences [q-bio], Electrospray ionization, Chemical structure, DIURON, Raphanus, BIODEGRADATION, 3,4-DICHLOROANILINE, 010501 environmental sciences, Ecotoxicologie, 01 natural sciences, High-performance liquid chromatography, chemistry.chemical_compound, Botany, plant uptake, PLANTS, Poaceae, Legume, metabolization, 0105 earth and related environmental sciences, Metabolization, 2. Zero hunger, glucosylated conjugates, Chromatography, DUCKWEED LEMNA-MINOR, biology, Chemistry, food and beverages, General Chemistry, Metabolism, biology.organism_classification, TRANSLOCATION, Glucosylated conjugates, edible plants, LINURON, Edible plants, GLUCOSYLTRANSFERASES, General Agricultural and Biological Sciences, Xenobiotic, 010606 plant biology & botany
Abstract: Publication Inra prise en compte dans l'analyse bibliométrique des publications scientifiques mondiales sur les Fruits, les Légumes et la Pomme de terre. Période 2000-2012. http://prodinra.inra.fr/record/256699; International audience; Metabolism of xenobiotics in plants usually occurs in three phases, phase I (primary metabolism), phase II (conjugation processes), and phase III (storage). The uptake and metabolism of [C-14]diuron and [C-14]linuron were investigated in wheat and radish. Seeds were sown in quartz sand and irrigated with a nutrient solution of either radioactive herbicide. Plants were harvested after two weeks, and metabolites were extracted and then analyzed by radio-reverse-high-performance liquid chromatography (HPLC). Uptake of the two molecules was higher in radish compared to wheat. Translocation of parent compounds and related metabolites from roots to aerial plant parts was important, especially for radish. A large proportion of extractable residues were found in radish whereas nonextractable residues amounted to 30% in wheat, mainly associated with roots. Chemical structure of metabolites was thereafter identified by acid, alkaline, and enzymatic hydrolyses followed by electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) and proton nuclear magnetic resonance spectroscopy (H-1 NMR). This study highlighted the presence of diuron and linuron metabolites conjugated to sugars in addition to N-demethylation and N-demethoxylation products.
Published: 2010

94. New amide alkaloid from the aerial part of Piper capense L.f. (Piperaceae)

Author: Evelyne Ollivier, Cécile Canlet, Sébastien Hutter, Nadine Azas, Ali Mohamed Kaou, Valérie Mahiou-Leddet, and Laurent Debrauwer
Subjects: Stereochemistry, Antiparasitic, medicine.drug_class, Piper capense, Microbial Sensitivity Tests, Antiepilepsirine, Antimalarials, chemistry.chemical_compound, Alkaloids, Piperidines, Cell Line, Tumor, Amide, parasitic diseases, Drug Discovery, medicine, Humans, Medicinal plants, Pharmacology, Plants, Medicinal, Molecular Structure, biology, Plant Extracts, Alkaloid, General Medicine, Piperaceae, biology.organism_classification, Amides, Antineoplastic Agents, Phytogenic, chemistry, Epoxy Compounds, Piper
Abstract: Together with apigenine dimethylether and piperchabamide A, a new amide alkaloid, Kaousine and the Z form of antiepilepsirine were isolated from the aerial part of Piper capense L.f (Piperaceae). Their structures were elucidated by spectrometric methods and their in vitro antiparasitic activities were evaluated on Plasmodium falciparum.
Published: 2010

95. Characterisation of B(a)P metabolites formed in an ex vivo pig skin model using three complementary analytical methods

Author: Carine Jacques, Emilien L. Jamin, Alain Mavon, Elisabeth Perdu, Laurent Debrauwer, Hélène Duplan, Daniel Zalko, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Xénobiotiques, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire de Pharmacocinétique Cutanée (LABORATOIRE DE PHARMACOCINéTIQUE CUTANéE), Centre de Recherche Pierre Fabre (Centre de R&D Pierre Fabre), and PIERRE FABRE-PIERRE FABRE
Subjects: Electrospray, Swine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Metabolite, 010501 environmental sciences, Tandem mass spectrometry, Mass spectrometry, 01 natural sciences, Biochemistry, High-performance liquid chromatography, Analytical Chemistry, chemistry.chemical_compound, Glucuronic Acid, Tandem Mass Spectrometry, Benzo(a)pyrene, Animals, Ear, External, Chromatography, High Pressure Liquid, Skin, 0105 earth and related environmental sciences, Chromatography, Molecular Structure, Sulfates, 010401 analytical chemistry, Stereoisomerism, Glucuronic acid, 0104 chemical sciences, chemistry, Models, Animal, Female, Oxidation-Reduction, Ex vivo
Abstract: International audience; An original method was developed to separate, identify and quantify the different benzo(a)pyrene (B(a)P) metabolites formed through oxidative and conjugative pathways. All B(a)P metabolites were separated by an improved high-performance liquid chromatography method, then detected and quantified relatively by online radioactivity detection. At the same time, metabolite structures were characterised by tandem mass spectrometry using two complementary ionisation modes: electrospray ionisation in the negative mode and atmospheric pressure chemical ionisation in the positive mode. This method was successfully applied to the analysis of B(a)P metabolites, produced by incubation of B(a)P with the ex vivo pig ear skin model. These include glucuronic acid and sulphate conjugates of B(a)P-OHs and B(a)P-diols, as well as direct phase I metabolites: B(a)P-tetrol, B(a)P-diones, B(a)P-catechols, B(a)P-diols and B(a)P-OHs.
Published: 2010

96. Characterization of biliary metabolites of fluoranthene in the common sole ( Solea solea )

Author: Laurent Debrauwer, Cécile Canlet, Guy Claireaux, Anne Hillenweck, Jean-Pierre Cravedi, and Aourell Mauffret
Subjects: Common sole, Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization, Magnetic Resonance Spectroscopy, Health, Toxicology and Mutagenesis, Metabolite, Glucuronidation, Polycyclic aromatic hydrocarbon, Excretion, chemistry.chemical_compound, medicine, Animals, Environmental Chemistry, Radiometry, Chromatography, High Pressure Liquid, Fluoranthene, chemistry.chemical_classification, Fluorenes, Chromatography, biology, Gallbladder, biology.organism_classification, medicine.anatomical_structure, chemistry, Biochemistry, Flatfishes, Xenobiotic, Water Pollutants, Chemical
Abstract: Fluoranthene is one of the most abundant polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) pollutants in the environment. Studies of the metabolism of PAHs have highlighted the importance of the gallbladder in concentrating xenobiotics in fish before excretion in feces. Analysis of bile metabolites can be considered useful for monitoring and assessing the exposure of fish to PAHs. Although the fate of several PAHs in marine organisms has been widely investigated, information is lacking regarding the metabolism of fluoranthene in fish. Therefore, we investigated the metabolic pathways of [14C]fluoranthene in the common sole (Solea solea) by identifying bile metabolites using electrospray ionization/mass spectrometry (ESI/MS) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. [14C]Fluoranthene was administered by intraperitoneal injection to 20 common soles. Groups of animals (n = 5) were killed 1, 2, 3, and 4 d postdosing, and gallbladders were excised for radioactivity counting and bile analysis. Biliary metabolites were separated and quantified by radio-high-performance liquid chromatography, and structure identification was performed by ESI/MS. Isomeric structures were confirmed by NMR analyses. At the end of the experiment, 12.2% of the administered radioactivity was recovered in bile. As expected, hydroxylation and glucuronidation were the predominant metabolic pathways. The 7-O-glucuronide-fluoranthene metabolite (representing 13.3% of total radioactivity found in bile), 8-O-glucuronide-fluoranthene (11.8%), trans-2,3-dihydro-3-hydroxy-2-O-glucuronide-fluoranthene (17.9%), and cis-2,3-dihydro-2-hydroxy-3-O-glucuronide-fluoranthene (13.9%) were the major metabolites observed in bile. Minor metabolites, such as trans-2,3-dihydro-2-hydroxy-3-O-glucuronide-fluoranthene (3.9%) and 2,3-di-O-glucuronide-fluoranthene (6.6%), also were identified. The 2,3-dihydrodiol-fluoranthene metabolite, which is found in bile conjugated to glucuronic acid, would be, after hydrolysis of the conjugates, a suitable biomarker of PAH pollution in the marine environment.
Published: 2008

97. Characterisation of bioactive compounds in infant formulas using immobilised recombinant estrogen receptor-α affinity columns

Author: Raffaela Piccinelli, Karl-Werner Schramm, Elisabeth Perdu, Catherine Leclercq, Sonia Dagnino, Laurent Debrauwer, Patrick Balaguer, Marchela Pandelova, Jean Pierre Cravedi, Daniel Zalko, Jan-Åke Gustafsson, and Anne Riu
Subjects: Estrogen receptor, Genistein, Toxicology, Chromatography, Affinity, Cell Line, law.invention, chemistry.chemical_compound, Liquid chromatography–mass spectrometry, law, Animals, Humans, Chromatography, Dose-Response Relationship, Drug, Daidzein, Estrogen Receptor alpha, Soy Foods, Estrogens, General Medicine, Infant Formula, Recombinant Proteins, Rats, Xenoestrogen, chemistry, Microsomes, Liver, Recombinant DNA, Phytoestrogens, Estrogen receptor alpha, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, Food Science
Abstract: In this study, the use of recombinant estrogen receptor alpha (ERalpha)-based affinity columns was reported, for the isolation and the identification of estrogenic substances present in complex matrices, focusing on bioactive compounds present in foodstuff. The capability of affinity columns to trap high, but also low-affinity radio-labelled ligands (17beta-estradiol, genistein and bisphenol A) was demonstrated. Three pooled samples of infant formulas (milk-based, hypoallergenic and soy-based formulas for infants aged 0-4 months) from a EU market basket were prepared by the CASCADE Network of Excellence. After determining the estrogenic activity of these food samples, human recombinant ERalpha ligand binding domain (LBD) based affinity columns combined with suitable analytical methods (high resolution LC-MS/MS) were used to identify the bioactive compounds present in the soy-based formula extract, namely phytoestrogens (genistein and daidzein) involved in the agonistic activity measured. Incubations of genistein with liver microsomes were carried out and the extracts analysed following the same protocol, demonstrating that hERalpha affinity columns can also be used for trapping active metabolites. This approach combining bioluminescent cell lines with this useful tool based on hERalpha-LBD affinity columns thus allowed the purification and the concentration of both known and unknown estrogenic ligands prior to investigation of their structure using LC-MS.
Published: 2008

98. Mass spectrometric investigation of the sequence selectivity for adduction of heterocyclic aromatic amines on single-strand oligonucleotides

Author: Emilien L. Jamin, Laurent Debrauwer, Jacques Tulliez, and Delphine Arquier
Subjects: Oligonucleotide, Stereochemistry, Guanine, Electrospray ionization, Organic Chemistry, Quinoline, Tandem mass spectrometry, Mass spectrometry, Analytical Chemistry, Nucleobase, Adduct, chemistry.chemical_compound, chemistry, Spectroscopy
Abstract: Heterocyclic aromatic amines (HAAs) generated during the cooking of meats are known to be genotoxic substances able to form covalent bonds with DNA bases after metabolic activation. This work aimed at the investigation of the influence of the local environment of nucleobases along the nucleotidic sequence on its modification induced by two different HAAs, namely 2-amino-1-methyl-6-phenylimidazo[4,5-b]pyridine (PhIP) and 2-amino-3-methylimidazo[4,5-f]quinoline (IQ), in order to identify possible sequences more susceptible to modification. A systematic study of the neighbouring base effect on the adduction was emphasized. Thus, PhIP and IQ adducts have been synthesized with various T-rich model single-strand oligonucleotides displaying different flanking bases (A, G, C or T) at the 3' or the 5' side of the targeted guanine, which allowed a comparison of the flanking base effects on adduction. Modified oligonucleotides were then analyzed by high-performance liquid chromatography (HPLC) coupled to electrospray ionization mass spectrometry. The localization of the modifications induced by PhIP or IQ along the oligonucleotide sequence was achieved by tandem mass spectrometry, and modification yields of the various model sequences were compared. Results indicate a favouring sequence context effect on the G-C8-IQ adduct formation with the sequence 5'GGG3'. Although higher than IQ, modification yields observed with PhIP showed a less obvious effect of the neighbouring base on the G-C8-PhIP adduct formation, with a preferential sequence 5'GGA/G/T3'.
Published: 2008

99. Biotransformation of genistein and bisphenol A in cell lines used for screening endocrine disruptors

Author: Elisabeth Perdu, Ingemar Pongratz, Katarina Pettersson, Laurent Debrauwer, M. Fernández-Cabrera, N. Olea, Daniel Zalko, Julian Bursztyka, and Jean Pierre Cravedi
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Time Factors, Metabolite, Glucuronates, Endocrine Disruptors, Toxicology, Models, Biological, Cell Line, Mice, chemistry.chemical_compound, Phenols, Biotransformation, In vivo, Cell Line, Tumor, Internal medicine, medicine, Animals, Humans, Benzhydryl Compounds, Rats, Wistar, chemistry.chemical_classification, Sulfates, Chemistry, In vitro toxicology, General Medicine, Genistein, Rats, Metabolic pathway, Enzyme, Endocrinology, Liver, Endocrine disruptor, Biochemistry, Xenobiotic
Abstract: In vitro assays provide the opportunity for generating alerts for chemicals which interact with hormone receptors and are also valuable tools for mechanistic research. However, the limited capabilities of in vitro models to metabolically activate or inactivate xenobiotics may lead to misinterpretation of the in vitro data if such information is not taken into account. The aim of this study was to investigate the metabolic capabilities of human HepG2, human MCF7 and mouse HC11 cell lines used for testing endocrine disruptors (EDs) toward radiolabelled bisphenol A and genistein, two estrogenic compounds for which metabolic pathways in vivo as in vitro are well known. Incubations were performed during 12–48 h with 250.103 cells in 12 wells plates and 5–25 μM of substrates. The kinetics of formation of the metabolites were studied. Rat liver slices were used as reference for comparison with the metabolic capabilities of the cell lines. HC11 cells did not show any biotransformation capability while the major biotransformation pathways in HepG2 and MCF7 cells were conjugation to sulfate and to a lesser extent to glucuronic acid. We detected no phase I metabolite, even in rat liver slices. These results suggest that HC11 cells should be a valuable cellular system to study the intrinsic estrogenic activity of the tested compound, while HepG2 and MCF7 cells can help to take into account part of the metabolic fate of the tested compound that occur in vivo. However, since phase I enzymes are poorly or not at all expressed in these systems, their use in endocrine disruptor testing may result in false negative for compounds for which bioactivation is a prerequisite.
Published: 2008

100. Comparison of genistein metabolism in rats and humans using liver microsomes and hepatocytes

Author: Roger Rahmani, Jacques Tulliez, Georges de Sousa, Julian Bursztyka, Cécile Canlet, Emilio Benfenati, Elisabeth Perdu, Georges Delous, Jean Pierre Cravedi, and Laurent Debrauwer
Subjects: Male, Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization, Magnetic Resonance Spectroscopy, Metabolite, Genistein, Toxicology, Rats, Sprague-Dawley, chemistry.chemical_compound, Tandem Mass Spectrometry, In vivo, medicine, Animals, Humans, biology, food and beverages, Cytochrome P450, General Medicine, Metabolism, biology.organism_classification, Rats, medicine.anatomical_structure, Microsoma, chemistry, Biochemistry, Hepatocyte, Hepatocytes, Microsomes, Liver, biology.protein, Microsome, Female, Chromatography, Liquid, Food Science
Abstract: Species differences and metabolism are the most crucial factors in considering the effects of genistein. The aim of this study was to have a better knowledge of the metabolic fate of genistein in humans as compared with rats. For this purpose, radiolabeled genistein was incubated with human and rat liver microsomes and with cryopreserved hepatocytes from both species. Incubations were performed using a wide range of genistein concentrations to analyze the kinetics of formation of the metabolites. Metabolite profiling was obtained using an HPLC system connected to a radioactivity detector. Identification of the metabolites was based on their retention times as compared with those of authentic standards and on LC-MS (ESI-MS/MS) or NMR analyses. In both species, liver microsomes produced the same three hydroxylated metabolites (8-OH, 6-OH and 3'-OH-genistein) whereas cryopreserved hepatocytes produced the same glucurono- and sulfo-conjugates (genistein 4'-O-sulfate 7-O-glucuronide, genistein 7-O-glucuronide, genistein 4'-O-glucuronide, genistein 7-O-sulfate and genistein 4'-O-sulfate). The rate of metabolism varied with species. 3'-Hydroxygenistein was the predominant metabolite produced by rat liver microsomes, whereas in humans 3'-hydroxy and 8-hydroxygenistein were produced in the same range. In both human and rat hepatocyte incubations, genistein 7-O-glucuronide represented more than 50% of the incubated dose. Our results on hepatocytes confirmed the predominance of conjugation reaction compared to oxidative reaction observed in vivo.
Published: 2008

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