RESUMEN: Los macroinvertebrados acuáticos son organismos idóneos para valorar el estado ecológico de sistemas fluviales y se ha evidenciado que no solo responden a las alteraciones de la calidad del agua, sino a la dinámica de los caudales. El objetivo de esta investigación fue determinar las variaciones en el ensamblaje de macroinvertebrados acuáticos ante alteraciones de caudal por captación de agua en los ríos Cocorná, San Lorenzo y la quebrada Guarinó, Antioquia-Colombia. En tal sentido, se realizaron cuatro muestreos añas de muestreo en noviembre de 2018, febrero, marzo y mayo de 2019, correspondientes a épocas de lluvia, seca, transición y lluvia. Se midieron variables físico-químicas in situ y se tomaron muestras para el análisis en laboratorio. Se seleccionaron 20 microhábitats por cada campaña y por cada sitio. En cada uno de ellos se tomaron medidas de profundidad, velocidad de la corriente y se caracterizó el tipo de sustrato. Los macroinvertebrados fueron colectados con una Red tipo Surber. Para el análisis de los datos se utilizaron los softwares Biodiversity Pro, Statgraphics, Excel y PHABSIM, con los cuales se realizaron métricas de diversidad, análisis de la correlación de la varianza (ACV), curvas de idoneidad y modelación hidrobiológica, respectivamente. Se colectó un total de 4623 individuos, donde el 48,8% se concentró en San Lorenzo, el 30,5% en Guarinó y el 20,7% restante en Cocorná. Los ACV mostraron que la época de muestreo fue el factor que influyó mayormente en la varianza de las variables físico-químicas, sin embargo, en la mayoría de las variables no hubo diferencias significativas. Los macroinvertebrados acuáticos tuvieron preferencias por la velocidad de la corriente entre 0,8 y 1,2 m/s, la profundidad entre 1 y 1,4 m y el sustrato de piedras pequeñas, piedras grandes y rocas. La modelación hidrobiológica determinó que la extracción del agua genera diversos efectos, que van desde la pérdida de hábitat hasta cambios en las zonas que actualmente son las más aptas. Se concluye que estos resultados pueden orientar la toma de decisiones en cuanto a la estimación de caudales ambientales, y se recomienda, por tanto, regular la captación de acuerdo con la época del año. ABSTRACT: Aquatic macroinvertebrates are ideal organisms for estimating the ecological status of river systems and it has been shown that they respond not only to alterations in water quality, but also to the dynamics of flows. The objective of this research was to determine the variations in the assembly of aquatic macroinvertebrates in the face of alterations in flow by water collection in the rivers Cocorná, San Lorenzo and the Guarinó Creek, Antioquia-Colombia. In this sense, four sampling campaigns were carried out in November 2018, February, March and May 2019, corresponding to rainy, dry, transition and rainy seasons. Physical-chemical variables were measured in situ and samples were taken for laboratory analysis. Twenty microhabitats were selected for each campaign and for each site. Depth, current velocity and substrate type were measured in each of them. The macroinvertebrates were collected with Red Surber. For the data analysis, Biodiversity Pro, Statgraphics, Excel and PHABSIM software were used, in which diversity metrics, variance correlation analysis (VCA), suitability curves and hydrobiological modeling, respectively, were performed. A total of 4623 individuals were collected, with 48.8% concentrated in San Lorenzo, 30.5% in Guarinó and the remaining 20.7% in Cocorná. The LCAs showed that the sampling time was the factor that influenced the most the variance of the physical-chemical variables; however, in most of the variables there were not significant differences. Aquatic macroinvertebrates had preferences for current velocity between 0.8 and 1.2 m/s, depth between 1 and 1.4 m and substrate of small rocks, large rocks and rocks. Hydrobiological modeling determined that water extraction generates various effects, ranging from habitat loss to changes in areas that are currently the most suitable. It is concluded that these results can guide decision making regarding the estimation of environmental flows, and it is therefore recommended to regulate the collection according to the time of year.