1. Théorie mathématique des catégories en biologie et notion d'équivalence naturelle chez Robert Rosen
- Author
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Franck Varenne, Groupe d'étude des méthodes de l'analyse sociologique (GEMAS), and Université Paris-Sorbonne (UP4)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
Philosophy ,05 social sciences ,010103 numerical & computational mathematics ,General Medicine ,16. Peace & justice ,01 natural sciences ,[SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM] ,0506 political science ,biologie théorique ,[SHS.HISPHILSO]Humanities and Social Sciences/History, Philosophy and Sociology of Sciences ,théorie des catégories ,Rosen ,Digital humanities ,050602 political science & public administration ,modèles computationnels ,0101 mathematics ,[INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] ,Humanities ,Rashevsky ,[MATH.MATH-CT]Mathematics [math]/Category Theory [math.CT] - Abstract
International audience; The aim of this paper is to describe and analyze the epistemological justification of a proposal initially made by the biomathematician Robert Rosen in 1958. In this theoretical proposal, Rosen suggests using the mathematical concept of “category” and the correlative concept of “natural equivalence” in mathematical modeling applied to living beings. Our questions are the following: According to Rosen, to what extent does the mathematical notion of category give access to more “natural” formalisms in the modeling of living beings? Is the so-called “naturalness” of some kinds of equivalences (which the mathematical notion of category makes it possible to generalize and to put at the forefront) analogous to the naturalness of living systems? Rosen appears to answer “yes” and to ground this transfer of the concept of “natural equivalence” in biology on such an analogy. But this hypothesis, although fertile, remains debatable. Finally, this paper makes a brief account of the later evolution of Rosen’s arguments about this topic. In particular, it sheds light on the new role played by the notion of “category” in his more recent objections to the computational models that have pervaded almost every domain of biology since the 1990s.; L'objectif de cet article est de rendre compte de la justification épistémologique de la proposition faite, dès 1958, par le biomathématicien Robert Rosen d'introduire le concept mathématique de " catégorie " et celui - corrélatif - d'" équivalence naturelle " dans la modélisation mathématique appliquée au vivant. Nos questions sont les suivantes : en quoi la notion mathématique de catégorie permet-elle, selon Rosen, de donner accès à des formalismes plus " naturels " pour la modélisation du vivant ? La naturalité de certaines équivalences (que la notion mathématique de catégorie sert justement à généraliser et à mettre en évidence) est-elle analogue à la naturalité des systèmes vivants ? Rosen semble faire fond sur cette dernière hypothèse, féconde, mais pourtant discutable. Cet article propose ensuite de mesurer l'évolution du discours de Rosen à ce sujet, en particulier dans ses conséquences apparemment décisives pour la critique des modèles computationnels du vivant, modèles aujourd'hui en pleine expansion.
- Published
- 2013