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Identificar genes implicados en los mecanismos patogénicos de la retinopatía diabética no proliferante, como estrés oxidativo, alteración de la matriz extracelular y/o apoptosis, para valorar el riesgo de desarrollo de la misma en una población de diabéticos tipo2 (DM2).

La comunicación interventricular (CIV) es una de las principales formas de cardiopatía congénita (CPC) en los individuos con el síndrome de deleción del cromosoma 22q11 del Homo sapiens(HSA22q11). Con objeto de identificar los genes candidates situados en el HSA22q11 asociados a la CIV, se analizó la pérdida de heterocigosis (LOH) mediante determinación del genotipo de microsatélites y análisis de dosis de siete genes candidatos.

Aproximadamente un 20-40% de los casos de hipercolesterolemia familiar diagnosticada no muestran mutación causal en los genes candidatos, por lo que algunos de estos casos pueden tener un origen poligénico. Se han identificado diferentes variantes genéticas de un solo nucleótido que ayudan a diferenciar las hipercolesterolemias poligénicas de las monogénicas. El objetivo es estudiar la contribución de dichas variantes a la concentración de colesterol unido a lipoproteínas de baja densidad (cLDL) en probandos con hipercolesterolemia genética sin mutación en genes candidatos (hipercolesterolemia genética sin hipercolesterolemia familiar) y establecer el valor de una puntuación genética basada en las frecuencias de dichas variantes de un solo nucleótido en el cribado en cascada de sus familiares.

Nuestro objetivo fue aproximar la prevalencia de mutaciones en los genes candidatos de hipercolesterolemia familiar (HF) en una población española de mediana edad, y determinar el valor predictivo de los criterios clínicos de sospecha de HF en la detección de mutaciones causales.

ResumenEn bovinos, la reducción de la eficiencia reproductiva de los sistemas de producción de carne y doble propósito se atribuye a factores nutricionales, sanitarios, climáticos y en última instancia a características genéticas de los animales. Sin embargo, en condiciones de trópico cálido húmedo, variaciones genéticas entre razas podrían reducir la edad al primer parto, el intervalo entre partos y aumentar la vida útil de las vacas. Las razas Sanmartinero y Casanareño podrían mejorar los sistemas de producción bovina debido al aporte de variantes genéticas que emergieron en el proceso de adaptación a las duras condiciones de la Orinoquía Colombiana. Actualmente, los genes con función biológica conocida se usan como marcadores moleculares para estimar parámetros de diversidad genética pecuaria facilitando la identificación y ubicación dentro del genoma de regiones que codifican o regulan la expresión de rasgos de interés económico. En ganado criollo colombiano Romosinuano se han identificado genes candidatos del eje Hormona de crecimiento/Factor de crecimiento similar a la insulina que se asocian positivamente con edad al primer parto, intervalo entre partos, longevidad y protección del embrión al estrés calórico. No obstante en las razas criollas Sanmartinero y Casanareño reconocidas empíricamente por estas características, no han sido sometidas a dichos análisis de genes candidatos que permitan promover un valor agregado a los animales. El objetivo de esta revisión es documentar algunos parámetros reproductivos y genéticos de las razas criollas Sanmartinero y Casanareño que soportan la necesidad de desarrollar estudios moleculares y justificar su uso en los sistemas de producción de carne y doble propósito de la Orinoquía colombiana.

Diversos polimorfismos en genes candidatos que codifican proteínas del sistema hemostático se han propuesto como factores de riesgo para el desarrollo de trombosis.

The aim of this study was to increase marker density in a previously identified late blight resistance QTL in a diploid potato population. SSR markers from the reference potato genome sequence were located by e-PCR in the QTL region in the chromosome 9 genetic map of the diploid potato population B3C1HP, and utilized to identify more candidate genes locating between the SSR markers. After verified by PCR and genetic mapping, two SSR markers and two DM candidate genes were mapped in the QTL peak in the maternal genetic map of B3C1HP. The new markers narrowed down the average 2-LOD support interval from 2.6 to 1.4 cM. The new markers on the LOD peak are valuable for fine mapping and positional cloning of the alleles in late blight resistance QTL. This study proves that combination of SSR and e-PCR is an effective way to develop markers in target QTL region. El objetivo de este estudio era aumentar la densidad de marcadores en un QTL de resistencia a tizón tardío previamente identificado en una población diploide de papa cultivada. Marcadores de SSR de la secuencia del genoma de la papa fueron localizados por e-PCR en la región QTL en el mapa genético del cromosoma 9 del diploide población B3C1HP, y utilizadas para identificar más genes candidatos con la localización entre los marcadores de SSR. Después de verificación por PCR y mapeo genético dos marcadores de SSR y dos genes candidatos DM fueron asignadas en el pico de QTL en el mapa genético de B3C1HP. Los nuevos marcadores redujeron el intervalo medio de soporte 2-LOD de 2.6 a 1.4 cM. Los nuevos marcadores en el pico LOD son valiosos para el mapeo fino y la clonación posicional de los alelos de QTL de resistencia al tizón tardío. Este estudio demuestra que la combinación de SSR y e-PCR es una manera eficaz para desarrollar marcadores en la región QTL.

El principal objetivo de la farmacogenómica (PGx) es definir un tratamiento farmacológico individualizado basado en el perfil genético de cada paciente, convirtiendo el paradigma clásico de tratamiento clínico centrado en la enfermedad en un nuevo enfoque, la medicina personalizada. Los polimorfismos genéticos pueden modificar la expresión y la función de las enzimas y las proteínas involucradas en la farmacocinética y la farmacodinámica de los fármacos. Así, la presencia de variantes alélicas permite predecir la respuesta farmacológica para garantizar la eficacia y la seguridad del tratamiento. Para la aplicación clínica de la PGx mediante la identificación de dichas variantes existen actualmente 2 planteamientos diferentes: el análisis de genes candidatos y los estudios de asociación genómica. La implementación clínica de la PGx mejora la eficacia, la seguridad y la relación costo-efectividad de los tratamientos; sin embargo, se ha ralentizado debido a una serie de barreras que se revisarán en este trabajo, así como sus posibles soluciones.

En los próximos años, los hallazgos en la secuenciación del genoma van a ampliar el conocimiento de muchas enfermedades neurológicas hereditarias, por lo que se van a poder diagnosticar con más facilidad. Sin embargo, la decisión sobre qué pruebas solicitar debe estar basada en el fenotipo del paciente y los hallazgos clínicos. Las nuevas técnicas de secuenciación de todo el exoma van a resultar muy útiles para probar los múltiples genes candidatos que producen una enfermedad o para descubrir causas de trastornos neurológicos poco frecuentes. Según qué enfermedad se sospeche, se aplicará una técnica de examen genético u otra. El asesoramiento genético va ser fundamental para dar información a los pacientes que sufran este tipo de enfermedades y para sus familias. El determinar qué alteración genética sufre un individuo también va a servir para prever posibles complicaciones, como la hipertermia familiar en enfermedades neuromusculares. El futuro impulso de la farmacogenómica va a permitir evaluar el riesgo de efectos secundarios e individualizar las dosis y los tratamientos.

La insuficiencia ovárica prematura (IOP) se define por un hipogonadismo hipergonadótropo de origen periférico en una mujer menor de 40 años. Su prevalencia gira en torno al 1-2% y su origen sigue siendo desconocido en el 60-70% de los casos. Entre las etiologías, existen causas iatrogénicas, autoinmunitarias, ambientales y genéticas, pero la insuficiencia ovárica suele ser «idiopática». Los recientes avances, en particular en el campo genético con el descubrimiento de nuevos genes candidatos implicados en la IOP, ofrecen nuevos indicios etiológicos. El objetivo del estudio inicial es confirmar el diagnóstico, descartar una etiología conocida y valorar la repercusión de la hipoestrogenia frecuentemente asociada. Incluye como mínimo un cariotipo, la búsqueda de una premutación FMR1 y un estudio autoinmunitario. El tratamiento se basa en la sustitución de la falta hormonal que protege a las pacientes de las complicaciones cardiovasculares y de la osteoporosis en particular. La fecundación in vitro con donación de ovocito es la técnica de referencia en caso de deseo de embarazo de la pareja.

Tuber dormancy and sprouting are important traits in commercial potato varieties. Since wild Solanumspecies can contribute new alleles in breeding, we combined Solanum chacoenseand S. berthaultiispecies in a mapping population to develop a linkage map with genome wide markers and identify quantitative trait loci (QTL) for tuber dormancy and sprouting. There was genetic variation for the evaluated traits and high correlation (0.80) between dormancy and apical dominance release. QTL for tuber dormancy and sprouting traits were mapped to the same or similar positions on chromosomes 2, 3, 5, and 7, explaining from 9.5% to 16.3% of the phenotypic variance. We identified candidate genes associated with all major phytohormone regulation in close linkage with the QTL. The QTL on chromosomes 2, 3 and 7 are good candidates for marker assisted breeding, since they were associated with dormancy and apical dominance release and should be useful to delay or accelerate tuber sprouting. Dormancia y brotación de tubérculos son rasgos importantes en variedades comerciales de papa. Las especies silvestres de Solanumcontribuyen con allelos utilies en mejormiento genético, por lo que se combinaron Solanum chacoensey S. berthaultiien una población de mapeo para desarrollar un mapa genetico con marcadores genómicos y para identificar marcadores asociados con locide rasgos cuantitativos (QTL) para dormancia y brotación de tubérculos. Hubo variación genética para los rasgos evaluados y una alta correlación (0.80) entre dormancia y rompimiento de dominancia apical. Se encontraron QTL para estos rasgos de tubérculos cerca o en la misma posición en los cromosomas 2, 3, 5 y 7, explicando de 9,5% a 16,3% de la varianza fenotípica. Se identificaron genes candidatos asociados con la mayoria de las fitohormonas de regulación en estrecho ligamiento con los QTL. Se determinó que QTL en los cromosomas 2, 3 y 7 son buenos candidatos para el mejoramiento asistido por marcadores, ya que se asociaron tanto a dormancia como a rompimiento de dominancia apical, por lo cual deberían ser útiles para retrasar o acelerar la brotación de tubérculos.

La secuenciación masiva (o de nueva generación) del ácido desoxirribonucleico ha revolucionado el diagnóstico genético. Esta tecnología reduce el trabajo y el coste necesarios para el análisis simultáneo de muchos genes, lo que hace que más pacientes puedan acceder a un estudio genético. En el caso de la miocardiopatía hipertrófica, se ha pasado de analizar los tres genes principales (MYH7, MYBPC3, TNNT2)a secuenciar más de veinte genes. A pesar de las ventajas que esto representa en términos de información, muchos pacientes presentan variantes de significado incierto (fundamentalmente cambios de aminoácido) que están también en al menos uno de los controles cuyo genoma se ha secuenciado. Esta situación aboca a un «callejón sin salida» en caso de que no se pueda demostrar que esas variantes segregan con la enfermedad en la familia del paciente. En ausencia de evidencia clara de que sean realmente patogénicas, no se podrán emplear para un consejo genético fiable a los familiares del paciente. Finalmente, la secuenciación masiva también permite identificar nuevos genes candidatos pero, una vez más, el problema de las variantes de significado incierto limita el éxito de estos estudios.

La metilación del ADN es un mecanismo epigenético que controla la expresión génica. En la enfermedad de Alzheimer (EA) se ha encontrado hipometilación global del ADN en neuronas del córtex cerebral humano. Además, se han identificado variaciones en el patrón de metilación de genes candidatos en el tejido cerebral entre pacientes y controles, como el gen PSEN1y APOE, relacionados con la fisiopatología de la EA. En otras demencias degenerativas también se han descrito variaciones en la metilación de genes clave, como hipometilación del gen SNCAen la enfermedad de Parkinson y la demencia con cuerpos de Lewy o hipermetilación del promotor del gen GRNen la demencia frontotemporal. Algunas de estas variaciones en el patrón de metilación del ADN son compartidas por el tejido cerebral y la sangre periférica. Este hallazgo permitirá su utilización como biomarcadores epigenéticos en el diagnóstico de las enfermedades neurodegenerativas.

El síndrome de distrés respiratorio agudo (SDRA) es la forma más grave de falla respiratoria. Teóricamente, cualquier noxa pulmonar aguda puede resultar en un SDRA, pero solo un pequeño porcentaje de individuos desarrolla la enfermedad. Sobre este fundamento, factores genéticos han sido implicados en el riesgo de desarrollar SDRA. Basado en la fisiopatología de esta enfermedad, múltiples genes candidatos han sido evaluados como potenciales modificadores, tanto en pacientes como en modelos animales de SDRA.

El ictus es una enfermedad que conlleva unas importantes repercusiones en términos de morbimortalidad, además de costes personales y sociales. Se trata de una entidad compleja en cuya patogenia intervienen múltiples factores ambientales y genéticos; a estos últimos se les atribuye un papel hasta en el 50% de los ictus. El objetivo de la revisión es analizar los métodos disponibles para el diagnóstico genético que incluyen estudios de ligamiento, de variación en número de copias, aproximaciones a genes-candidatos, y de genoma completo (GWAS) y de los polimorfismos asociados a su patogenia.