26 results on '"Berri, Cecile"'
Search Results
2. Tissue Resources for the Functional Annotation of Animal Genomes
- Author
-
Tixier-Boichard, Michèle, Fabre, Stéphane, Dhorne-Pollet, Sophie, Goubil, Adeline, Acloque, Hervé, Vincent-Naulleau, Silvia, Ross, Pablo, Wang, Ying, Chanthavixay, Ganrea, Cheng, Hans, Ernst, Catherine, Leesburg, Vicki, Giuffra, Elisabetta, Zhou, Huaijun, Group, Collaborative Working, Taragnat, Catherine, Berri, Cecile, Jardet, Déborah, Godet, Estelle, Laurent, Fabrice, Gomot, Gilles, Dardente, Hughes, Grasseau, Isabelle, Dubois, Jean-Philippe, Gautron, Joel, Gérard, Nadine, Quéré, Pascale, Lavocat, Roger-Paul, Dalbies-Tran, Rozenn, Métayer, Sonia, Marthey, Sylvain, Coustham, Vincent, and Druart, Xavier
- Subjects
Biological Sciences ,Genetics ,tissue sampling ,repository ,mammals ,bird ,cryopreservation ,genome ,Collaborative Working Group ,Clinical Sciences ,Law - Abstract
In order to generate an atlas of the functional elements driving genome expression in domestic animals, the Functional Annotation of Animal Genome (FAANG) strategy was to sample many tissues from a few animals of different species, sexes, ages, and production stages. This article presents the collection of tissue samples for four species produced by two pilot projects, at INRAE (National Research Institute for Agriculture, Food and Environment) and the University of California, Davis. There were three mammals (cattle, goat, and pig) and one bird (chicken). It describes the metadata characterizing these reference sets (1) for animals with origin and selection history, physiological status, and environmental conditions; (2) for samples with collection site and tissue/cell processing; (3) for quality control; and (4) for storage and further distribution. Three sets are identified: set 1 comprises tissues for which collection can be standardized and for which representative aliquots can be easily distributed (liver, spleen, lung, heart, fat depot, skin, muscle, and peripheral blood mononuclear cells); set 2 comprises tissues requiring special protocols because of their cellular heterogeneity (brain, digestive tract, secretory organs, gonads and gametes, reproductive tract, immune tissues, cartilage); set 3 comprises specific cell preparations (immune cells, tracheal epithelial cells). Dedicated sampling protocols were established and uploaded in https://data.faang.org/protocol/samples. Specificities between mammals and chicken are described when relevant. A total of 73 different tissues or tissue sections were collected, and 21 are common to the four species. Having a common set of tissues will facilitate the transfer of knowledge within and between species and will contribute to decrease animal experimentation. Combining data on the same samples will facilitate data integration. Quality control was performed on some tissues with RNA extraction and RNA quality control. More than 5,000 samples have been stored with unique identifiers, and more than 4,000 were uploaded onto the Biosamples database, provided that standard ontologies were available to describe the sample. Many tissues have already been used to implement FAANG assays, with published results. All samples are available without restriction for further assays. The requesting procedure is described. Members of FAANG are encouraged to apply a range of molecular assays to characterize the functional status of collected samples and share their results, in line with the FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable) data principles.
- Published
- 2021
3. Phosphatase PTEN in chicken muscle is regulated during ontogenesis
- Author
-
Vaudin, Pascal, Dupont, Joëlle, Duchêne, Sophie, Audouin, Estelle, Crochet, Sabine, Berri, Cécile, and Tesseraud, Sophie
- Published
- 2006
- Full Text
- View/download PDF
4. Molecular Phenotyping of White Striping and Wooden Breast Myopathies in Chicken
- Author
-
Praud, Christophe, primary, Jimenez, Justine, additional, Pampouille, Eva, additional, Couroussé, Nathalie, additional, Godet, Estelle, additional, Le Bihan-Duval, Elisabeth, additional, and Berri, Cecile, additional
- Published
- 2020
- Full Text
- View/download PDF
5. Effect of postmortem storage on the Z-line region of titin in bovine muscle
- Author
-
Boyer-Berri, Cecile and Greaser, Marion L.
- Subjects
Cattle -- Genetic aspects ,Muscle proteins -- Physiological aspects ,Muscles -- Genetic aspects ,Zoology and wildlife conservation - Abstract
Myofibrils were prepared from bovine muscles (cutaneous trunci, rectus abdominis, psoas major, and masseter) and compared between different aging periods at 4 [degrees] C (0, 1, 2, 4, 8, and 16 d). Myofibrils were stained with an antibody directed against a 56-kDa fragment (FE-RE) of titin located in the Z-line region. Unaged myofibrils from all four muscles showed a single stained band at the Z-line with similar intensities. Postmortem time did not significantly affect the total amount of fluorescence in the sarcomere, suggesting the titin FE-RE epitope was not degraded nor were titin fragments containing this epitope released during storage. However, the fluorescence patterns were altered. The relative fluorescence intensity at the Z-line decreased but that in the I-band increased gradually, showing the translocation of some titin FE-RE epitopes during the aging period. This suggested that a cleavage occurred in a region of titin very close to the Z-line during postmortem storage. Usually the position of maximum fluorescence remained at the Z-line, although about 1/3 of the myofibrils from rectus abdominis showed a two-band pattern around the Z-line after 16 d of aging. The titin changes observed may be related to the increased fragility of the myofibril and the improvement of meat tenderness during postmortem storage. Key Words: Postmortem Changes, Myofibrils, Bovidae, Degradation, Muscles
- Published
- 1998
6. THERMOCHICK : Acclimatation embryonnaire à la chaleur. Quels sont les mécanismes modifiés chez le poulet de chair en finition ?
- Author
-
Loyau, Thomas, Hennequet Antier, Christelle, Métayer Coustard, Sonia, Leduc, Marie, Crochet, Sabine, Cailleau-Audouin, Estelle, SANNIER, MELANIE, Berri, Cecile, Duclos, Michel Jacques, Tesseraud, Sophie, Couroussé, Nathalie, Chartrin, Pascal, Praud, Christophe, Everaert, Nadia, Rideau, Nicole, Mignon-Grasteau, Sandrine, Moroldo, Marco, Lecardonnel, Jerôme, Martin, Patrice, COUSTHAM, Vincent, Lagarrigue, Sandrine, Yahav, S., Collin, Anne, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Liège, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Agricultural Research Organization
- Subjects
adaptation à la chaleur ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,embryon aviaire ,[INFO]Computer Science [cs] ,acclimatation au chaud ,poulet de chair ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2016
7. Managing poultry meat quality by nutrition
- Author
-
Berri, Cecile, Métayer Coustard, Sonia, Lessire, Michel, Duval, Elisabeth, Bouvarel, Isabelle, Tesseraud, Sophie, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ITAVI, and World's Poultry Science Association (WPSA). INT.
- Subjects
performance de carcasse ,composition de la carcasse ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,qualité de la viande ,[INFO]Computer Science [cs] ,qualité de la carcasse ,poulet de chair ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2015
8. Identification of biomarkers of meat quality by high throughput analyses of muscle transcripts and serum metabolites of two lines of broilers divergently selected on breast meat ultimate pH
- Author
-
Beauclercq, Stéphane, Hennequet-Antier, Christelle, Nadal-Desbarats, Lydie, Moroldo, Marco, Duval, Elisabeth, Berri, Cecile, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département d'Analyses Chim ique Biologique et Médicale, PPF Analyse des Systèmes Biologiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (Inserm)-Université Francois Rabelais [Tours], Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, CASDAR Optiviande, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., and Recherches Avicoles (SRA)
- Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences ,Ultimate pH ,Transcriptomic ,Metabolomic ,Meat quality ,Biomarkers - Abstract
The processing ability of chicken meat is very variable, which could impact on the competitiveness of the poultry industry. As in pig, high variations in ultimate pH lead to defects of appearance, conservation and processing yields. To understand the biological and genetic mechanisms involved in the control of poultry meat quality, two chicken lines were divergently selected on the breast meat ultimate pH (pHu): the pHu- and the pHu+ lines. Their average pHu diverges of 0.5 pH units in the breast Pectoralis major (PM), which corresponds to a 20% difference of muscle glycogen (pHu- > pHu+). The present study aims at identifying biomarkers of meat quality by using high throughput approaches for the profiling of the muscle transcriptome (8x60K custom Agilent microarray) and for the characterization of metabolome in muscle and serum (proton and phosphorus NMR analysis on muscle and proton NMR on serum). The analysis by Gene Ontology of the differentially expressed genes between muscles from the pHu- and the pHu+ lines indicates an over-representation of genes involved in 6 processes, i.e., the sarcomere organization, the positive regulation of phosphorylation, the pyruvate metabolism, the glycolysis, and the coenzyme and phosphorus metabolism. Most of the genes involved in the glycolysis pathway were over-expressed in the pHu- compared to the pHu+ line. The serum of the pHu- chickens was characterized by higher glucose level and lower concentrations in byproducts of purine degradation compared to the pHu+ line. These observations could help at a better understanding of the molecular pathways underlying the differential ability of the pHu- and pHu+ line to store glycogen in their muscle. By defining a set of pertinent biomarkers, our goal is to build a predictive model of the breast muscle ultimate pH to optimize the quality of poultry meat in relation to breeding and rearing factors.
- Published
- 2015
9. Genetic parameters of white striping in relation to body weight, carcass composition and meat quality traits in broiler chickens
- Author
-
Alnahhas, Nabeel, Berri, Cecile, Chabault, Marie, Chartrin, Pascal, Boulay, Maryse, Bourin, Marie-Christine, Le Bihan-Duval, Elisabeth, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français (SYSAAF), and ITAVI
- Subjects
muscle pectoral ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,défaut ,qualité de la viande ,[INFO]Computer Science [cs] ,paramètre génétique ,poulet de chair ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2015
10. Cartographie fine de QTL de qualité de la carcasse et de la viande dans une lignée de poulets à croissance lente
- Author
-
Allais, Sophie, Hennequet-Antier, Christelle, Berri, Cecile, Chabault-Dhuit, Marie, Salles , Laurent, D'abaddie, François, Demeure, Olivier, Duval, Elisabeth, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SASSO, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Unité de Recherches Avicoles (URA)
- Subjects
health care facilities, manpower, and services ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,education ,health care economics and organizations - Abstract
International audience; absent
- Published
- 2015
11. Acclimatation embryonnaire à la chaleur : quels sont les mécanismes moléculaires modifiées chez le poulet de chair en finition ?
- Author
-
Loyau, Thomas, Hennequet-Antier, Christelle, Metayer-Coustard, Sonia, Leduc, Marie, Crochet, Sabine, Audouin, Estelle, Sannier, Mélanie, Berri, Cecile, Duclos, Michel, Tesseraud, Sophie, Couroussé, Nathalie, Chartrin, Pascal, Praud, Christophe, Everaert, N., Rideau, Nicole, Grasteau, Sandrine, Moroldo, Marco, Lecardonnel, Jerôme, Martin, Patrice, Coustham, Vincent, Lagarrigue, Sandrine, Yahav, S., Collin, Anne, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Liège, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institute of Plant Sciences, Recherches Avicoles (SRA), URA 0083, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] - Abstract
absent
- Published
- 2015
12. OVALI : un outil pratique d'évaluation de la durabilité des filières avicoles 1 - Evaluer l'existant pour identifier des marges de progrès
- Author
-
Protino, Juliette, Magdelaine, Pascale, Berri, Cecile, Meda, Bertrand, Ponchant, Paul, Dusart, Léonie, Chevalier, Dylan, Dezat, Elodie, Lescoat, Philippe, Bouvarel, Isabelle, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ITAVI, Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire, Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne, Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CASDAR, Recherches Avicoles (SRA), Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] - Abstract
absent
- Published
- 2015
13. BCMO1 as a potential target to improve skeletal muscle growth and repair
- Author
-
Praud, Christophe, Le Vern, Yves, Al Ahmadieh, Sultan, Berri, Cecile, Duclos, Michel Jacques, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Société Française de Myologie (SFM). FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours
- Subjects
enzyme ,Vertebrate Zoology ,[SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology ,poulet ,tissu musculaire ,Zoologie des vertébrés ,cytométrie de flux ,BCMO1 enzyme ,myogenesis ,myogénèse ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2014
14. Fine mapping of QTL for carcass and meat quality traits in a chicken slow-growing line
- Author
-
Allais, Sophie, Hennequet-Antier, Christelle, Berri, Cecile, Chabault-Dhuit, Marie, D'Abbadie, François, Demeure, Olivier, Duval, Elisabeth, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Société SASSO, EADGENE, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Recherches Avicoles (SRA)
- Subjects
QTL ,chicken ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,poulet ,qualité de la viande ,lignée génétique ,slow-growing line ,meat quality ,volaille ,carcass quality ,carcasse de poulet ,viande de volaille ,lignée sélectionnée - Abstract
absent
- Published
- 2014
15. Can plasma metabolites predict fat deposition in peripheral tissues of chicken?
- Author
-
Jégou, Maëva, Louveau, Isabelle, Gondret, Florence, Lalande-Martin, Julie, Tea, I, Duval, Elisabeth, Berri, Cecile, Lagarrigue, Sandrine, Duclos, Michel, Baeza, Elisabeth, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR Fatinteger, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Unité de Recherches Avicoles (URA)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] - Abstract
absent
- Published
- 2014
16. Using Targeted Resequencing for Identification of Candidate Genes and SNPs for a QTL Affecting the pH Value of Chicken Meat
- Author
-
Li, Xidan, Liu, Xiaodong, Nadaf, Javad, Le Bihan-Duval, Elisabeth, Berri, Cecile, Dunn, Ian, Talbot, Richard, De Koning, Dirk-Jan, Li, Xidan, Liu, Xiaodong, Nadaf, Javad, Le Bihan-Duval, Elisabeth, Berri, Cecile, Dunn, Ian, Talbot, Richard, and De Koning, Dirk-Jan
- Abstract
Using targeted genetical genomics, a quantitative trait locus (QTL) affecting the initial postmortem pH value of chicken breast muscle (Pectoralis major) on chromosome 1 (GGA1) recently was fine-mapped. Thirteen genes were present in the QTL region of approximately 1 Mb. In this study, 10 birds that were inferred to be homozygous for either the high (QQ) or low (qq) QTL allele were selected for resequencing. After enrichment for 1 Mb around the QTL region, >500 x coverage for the QTL region in each of the 10 birds was obtained. In total 5056 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified for which the genotypes were consistent with one of the QTL genotypes. We used custom tools to identify putative causal mutations in the mapped QTL region from these SNPs. Four nonsynonymous SNPs differentiating the two QTL genotype groups were identified within four local genes (PRDX4, EIF2S3, PCYT1B, and E1BTD2). Although these are likely candidate SNPs to explain the QTL effect, 54 additional consensus SNPs were detected within gene-related regions (untranslated regions, splicing sites CpG island, and promoter regions) for the QQ birds and 71 for the qq birds. These could also play a role explaining the observed QTL effect. The results provide an important step for prioritizing among a large amount of candidate mutations and significantly contribute to the understanding of the genetic mechanisms affecting the initial postmortem pH value of chicken muscle.
- Published
- 2015
- Full Text
- View/download PDF
17. L'instabilité sociale affecte le comportement ainsi que certaines capacités d'apprentissage des poulets
- Author
-
Foucher, Carole, Calandreau, Ludovic, Bertin, Aline, Bignon, Laure, Guardia, Sarah, Le Bihan-Duval, Elisabeth, Berri, Cecile, and Arnould, Cécile
- Subjects
apprentissage associatif ,poulet ,réactivité émotionnelle ,comportement social ,comportement animal ,poulet de chair ,Autre (Sciences du Vivant) - Published
- 2013
18. Génomique et viande : quelles avancées, quelles applications ?
- Author
-
Picard, Brigitte, Berri, Cecile, Lebret, Bénédicte, Lefèvre, Florence, Liaubet, Laurence, Damon, Marie, Le Bihan-Duval, Elisabeth, Cassar-Malek, Isabelle, Hocquette, Jean-François, Renand, Gilles, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Recherches Avicoles ( SRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage, Institut National de Recherche Agronomique, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement ( SCRIBE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -IFR140, Laboratoire de Génétique Cellulaire ( LGC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-IFR140, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences ,poisson ,génomique expressionnelle ,production animale ,poulet ,food and beverages ,bœuf ,qualité de la viande ,haut débit ,biomarqueur ,[ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences ,porc ,technologie - Abstract
Session : Bases biologiques de la qualité et génétique/génomique; The development of genomics tools is a considerable technological progress that allows the simultaneous analysis of thousands of genes (SNP chips), transcripts (transcriptomics) and proteins (proteomics). Using these technologies allows the measurement of complex phenotypes such as traits related to product quality. The objective of this review is to present the various studies conducted the last years in various meat industry to identify biomarkers of meat quality. The text is based on the strate gy developed by each sector in terms of meat quality.
- Published
- 2012
19. Adaptative response of chickens to hot environments induced by changing incubation temperature
- Author
-
Collin, Anne, Loyau, Thomas, Bedrani, Larbi, Berri, Cecile, Métayer Coustard, Sonia, Praud, Christophe, Duclos, Michel Jacques, Tesseraud, Sophie, Rideau, Nicole, Hennequet Antier, Christelle, Everaert, Nadia, Mignon-Grasteau, Sandrine, Yahav, S., Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Catholique de Louvain (UCL), and Agricultural Research Organization
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] - Published
- 2012
20. Influence of increasing slaughter age of chickens on meat quality, welfare, and technical and economic results
- Author
-
Baeza, Elisabeth, Arnould, Cécile, Jlali, Maamer, Chartrin, Pascal, Gigaud, Verane, Mercerand, Frederic, Durand, C., Meteau, Karine, Duval, Elisabeth, Berri, Cecile, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), Montifaut Jambon, Fleury Michon, Elevage Alternatif et Santé des Monogastriques (UE EASM), This study was supported by grants from the 'Conseil Régional du Centre' and INRA (Department of Animal Physiology and Rearing Systems)., Recherches Avicoles (SRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 83 Recherches Avicoles, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (PEAT), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
welfare ,slaughter age ,production efficiency ,litter ,chicken ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,meat quality - Abstract
Chantier qualité GA; Because of the increasing demand for rawcuts and processed products, there is a trend to producingvery heavy broilers. Breeds that are used for such kinds ofproduction have been intensively selected for growth rateand breast meat yield, and birds are reared for a longerperiod than standard broilers. This study was to evaluatethe effects of increasing slaughter age on technical andeconomic factors, including production effi ciency andenvironmental costs, bird welfare, and breast meat qualityin a modern heavy broiler line. Five groups of 300 maleRoss 708 chickens were reared until slaughter ages of 35,42, 49, 56, or 63 d. Increasing age at slaughter from 35to 63 d resulted in a 7.4-fold increase (P < 0.01) in mortalityrate (5.21 vs. 0.70%). It also increased (P < 0.001)the slaughter weight and ADFI of birds 2.5- and 1.4-fold,respectively, without affecting their G:F. Under our experimentalconditions, economic profi t evaluated through thenet gain reached a maximum at 42 d. The moisture andammonium content of litter increased (P < 0.05 and P
- Published
- 2012
21. Approches combinées de génomique positionnelle et expressionnelle pour l'étude des gènes contrôlant la qualité de la viande chez les volailles
- Author
-
Berri, Cecile, Pitel, Frederique, Nadaf, Javad, Sibut, Vonick, Gigaud, Vérane, Duclos, Michel Jacques, and Lebihan-Duval, Elisabeth
- Subjects
volaille ,qualité technologique ,viande ,gène ,acceptabilité ,poulet ,Sciences agricoles ,Agricultural sciences - Abstract
Les évolutions importantes des modes de consommation des volailles (vers davantage de produits découpés ou élaborés au détriment des carcasses entières) ont renforcé l’importance de la qualité de la viande. Il existe aujourd’hui une forte variabilité de cette qualité, qu’il convient de mieux maîtriser pour contrôler les caractéristiques finales du produit. A côté des adaptations technologiques développées par les industriels, des recherches ont été initiées pour améliorer en amont la qualité de la viande, notamment par la voie génétique. Des approches complémentaires de génomique positionnelle (recherche de QTL) et expressionnelle (étude du transcriptome musculaire) ont été initiées pour identifier les gènes impliqués dans les variations de la qualité chez le Poulet. Ces études s’appuient sur des modèles animaux, lignées expérimentales ou commerciales, qui présentent de fortes différences de croissance et de qualité. Des premiers résultats originaux ont été obtenus sur les régions chromosomiques (ou QTL) contrôlant la cinétique de chute du pH post mortem, la couleur ou les pertes en eau par exsudation du filet de poulet. Les perspectives visent maintenant à identifier les polymorphismes sous-jacents, ou à défaut des marqueurs génétiques proches, pour une utilisation en sélection. Ces futures recherches bénéficieront des progrès importants réalisés dans les technologies de typage (avec l’accès chez le Poulet aux marqueurs haut débit de type SNP), mais aussi de la mise en évidence par les études du transcriptome des gènes et voies métaboliques contribuant à l’élaboration de la qualité., Important changes in the ways of consumption of poultry (towards more cuts or elaborated products to the detriment of whole carcasses) have highlighted the importance of meat quality. Besides technological adaptations, research has been developed in order to improve the quality of the meat upstream, in particular by genetics. Additional approaches of positional (QTL research) and expressional (microarrays for gene expression profiling) genomics were intended to identify the genes involved in the quality of chicken meat. These studies take advantage of animal models, either experimental or commercial lines, which exhibit great differences in growth and meat quality. First original results were obtained for the chromosomal regions (or QTL) involved in the variation of post mortem pH fall, colour and drip loss in the breast meat of the chicken. Further studies are now aimed at identifying the underlying polymorphisms, or closely linked genetic markers, that could be used for selection. This future research will benefit from the progress made in genotyping technologies (with the access to high-density SNP markers in the chicken) as well as from the information revealed by microarray analyses on the genes and metabolic pathways contributing to chicken meat quality.
- Published
- 2008
22. An Expression QTL of Closely Linked Candidate Genes Affects pH of Meat in Chickens
- Author
-
Nadaf, Javad, primary, Berri, Cecile, additional, Dunn, Ian, additional, Godet, Estelle, additional, Le Bihan-Duval, Elisabeth, additional, and De Koning, Dirk Jan, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
23. Myofibre typing and ontogenesis in farm animal species
- Author
-
Picard, Brigitte, Jurie, Catherine, Cassar Malek, Isabelle, Hocquette, Jean-François, Lefaucheur, Louis, Berri, Cecile, Alami Durante, Hélène, Rescan, Pierre-Yves, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de recherches porcines, Unité de Recherches Avicoles (URA), Station d'hydrobiologie, and Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE)
- Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences ,ontogénèse ,fibre musculaire ,muscle ,Sciences agricoles ,Agricultural sciences - Abstract
Chez les espèces d’intérêt agronomique, les caractéristiques des fibres musculaires jouent un rôle important dans le déterminisme de la qualité organoleptique de la viande. Ce dossier fait le point des connaissances concernant la caractérisation des fibres musculaires et l’acquisition de leurs propriétés (contractiles et métaboliques) dans les principales espèces productrices de viande (bovins, porcs, volailles) et chez les poissons. La mise en place des fibres musculaires, qui débute très tôt au cours de la vie fœtale, implique des vagues successives de plusieurs générations de cellules myogéniques qui sont à l’origine des différents types de fibres. Le nombre total de fibres reste stable après la naissance chez le bovin, le porc et les volailles. En revanche, chez certains poissons, il augmente encore au cours de la vie postnatale. Chez le bovin, les principales étapes de la différenciation contractile et métabolique des fibres ont lieu durant le dernier tiers de la vie fœtale. En revanche, l’acquisition de ces propriétés se fait principalement pendant les deux semaines qui suivent la naissance chez le porc ou la volaille. Ainsi, si les principes généraux du développement musculaire sont comparables dans les différentes espèces, ils se déroulent selon une cinétique différente en relation avec la maturité de chaque espèce à la naissance. Toutefois, dans toutes les espèces, les propriétés des fibres sont caractérisées par une large plasticité tout au long de la vie des animaux, ce qui laisse la possibilité de les modifier par le biais des facteurs d’élevage., This paper synthetizes the studies carried out on myofibre typing and ontogenesis in the principal farm animal species since muscle fibre characteristics play a key role in meat quality. After a general description of muscle fibre characteristics and ontogenesis, four articles review the particularities of bovine, porcine, chicken and fish. In all species myofibre ontogenesis begins very early during embryonic life, with the appearance of two or three successive waves of myoblasts which constitute the origin of the different types of muscle fibres. In the largest species (bovine, pig) a third generation arises in the late foetal or early postnatal period. Following these two or three waves of myogenesis, the total number of fibres is fixed except in fish where hyperplasia occurs after birth. Contractile and metabolic differentiation proceeds by steps in parallel to myogenesis. In bovine, the main events of differentiation occur during foetal life, whereas they occur soon after birth in pig, poultry, but some plasticity remains later in life in all species. This comparative survey shows that the cellular processes of differentiation are comparable between species, while their timing is usually species specific.
- Published
- 2003
24. Muscle metabolism and meat quality abnormalities
- Author
-
Massimiliano Petracci, Francesca Soglia, Cécile Berri, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Bologna, M. Petracci, C. Berri, Petracci, Massimiliano, Soglia, Francesca, Berri, Cecile, and Recherches Avicoles (SRA)
- Subjects
2. Zero hunger ,0301 basic medicine ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,Muscle metabolism ,040301 veterinary sciences ,muscle ,chicken ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,poulet ,Physiology ,food and beverages ,qualité de la viande ,muscle growth, muscle metabolism, abnormalities, meat quality, PSE, DFD, deep pectoral myopathy, white-striping, wooden breast, spaghetti meat ,04 agricultural and veterinary sciences ,Biology ,Muscle hypertrophy ,0403 veterinary science ,03 medical and health sciences ,030104 developmental biology ,medicine ,Genetic selection ,Poultry meat ,medicine.symptom ,Myopathy - Abstract
In the past decades, the growing demand for poultry meat has led to progressive improvements in genetic selection to produce fast-growing broilers; however, these methods have induced the appearance of several spontaneous, idiopathic muscle abnormalities along with an increased susceptibility to stress-induced myopathies such as deep pectoral myopathy, pale, soft, and, exudative syndrome, and more recently muscle-growth-related abnormalities such as white-striping, wooden breast, and spaghetti meat. This chapter evaluates the consequences of genetic selection on muscle traits and describes the relevance and effects of the major breast abnormalities on the nutritional, technological, and sensorial characteristics of meat.
- Published
- 2017
25. Alimentation des animaux et qualité de leurs produits (collection Agriculture d'Aujourd'hui)
- Author
-
BERTHELOT Valérie and BERTHELOT Valérie
- Abstract
Les produits animaux occupent une place importante dans notre régime alimentaire en apportant des nutriments indispensables à notre équilibre physiologique. Au-delà de cette qualité nutritionnelle, ils doivent aussi répondre à des objectifs de qualité sanitaire, sensorielle et de service ainsi qu'aux attentes des consommateurs. L'objectif de cet ouvrage est de faire la synthèse des connaissances scientifiques sur les relations entre ces différentes qualités et l'alimentation des animaux. La formulation des régimes alimentaires a évolué pour assurer une qualité optimale des produits issus des élevages tout en satisfaisant au mieux les besoins des animaux. Après un chapitre introductif sur la notion de qualité et son sens actuel, Alimentation des animaux et qualité de leurs produits aborde en 13 chapitres les thématiques suivantes : • Alimentation animale, formulation des régimes et réglementation • Déterminants alimentaires et non alimentaires en élevage de la qualité des produits • Qualité des produits animaux et attente des consommateurs : intégration du volet alimentation et mise en œuvre par les acteurs des filières.
- Published
- 2018
26. Applied Ethology: Understanding Behaviour to Improve Livelihood
- Author
-
Hötzel, Maria José, Pinheiro Machado Filho, Luiz Carlos, Hötzel, Maria José, and Pinheiro Machado Filho, Luiz Carlos
- Abstract
Proceedings of the 47th congress of the International Society for Applied Ethology
- Published
- 2013
Catalog
Discovery Service for Jio Institute Digital Library
For full access to our library's resources, please sign in.