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Synthese eines DNA-Promotorsegments mit allen vier epigenetischen Nukleosiden: 5-Methyl-, 5-Hydroxymethyl-, 5-Formyl- und 5-Carboxy-2′-Desoxycytidin.

Authors :
Schröder, Arne S.
Steinbacher, Jessica
Steigenberger, Barbara
Gnerlich, Felix A.
Schiesser, Stefan
Pfaffeneder, Toni
Carell, Thomas
Source :
Angewandte Chemie. Jan2014, Vol. 126 Issue 1, p321-324. 4p.
Publication Year :
2014

Abstract

Ein 5 ‐ Formyl ‐ 2′ ‐ desoxycytidin(fdC) ‐ Phosphoramidit ‐ Baustein wurde entwickelt, der die Synthese fdC ‐ haltiger DNA in ausgezeichneter Reinheit und Ausbeute ermöglicht. In Kombination mit Phosphoramiditen für 5 ‐ Methyl ‐ dC, 5 ‐ Hydroxymethyl ‐ dC und 5 ‐ Carboxy ‐ dC gelang die Herstellung eines Segments des OCT4 ‐ Promotors, das alle vier epigenetischen Basen enthält. Aufgrund des großen Interesses an diesen neuen epigenetischen Basen sollte die Fähigkeit, alle vier von ihnen in DNA einzubringen, von besonderer Bedeutung sein. Biologisch relevante Promotorsegmente mit allen vier epigenetischen Nukleosiden sind nun durch Festphasensynthese zugänglich. Mit dem hier vorgestellten fdC ‐ Phosphoramidit werden keine Nebenreaktionen an 5 ‐ Formylcytosin beobachtet. Zusätzlich vermeiden milde Entschützungsbedingungen Oxidationen oder Reduktionen, was mit einer detaillierten massenspektrometrischen Analyse nachgewiesen werden konnte. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Details

Language :
English
ISSN :
00448249
Volume :
126
Issue :
1
Database :
Academic Search Index
Journal :
Angewandte Chemie
Publication Type :
Academic Journal
Accession number :
93316710
Full Text :
https://doi.org/10.1002/ange.201308469