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Introduction: Next Generation Sequencing (NGS) is cost-effective and a faster method to study genes, but its protocol is challenging. Objective: To analyze different adjustments to the protocol for screening the BRCA genes using Ion Torrent PGM sequencing and correlate the results with the number of false positive (FP) variants. Material and methods: We conducted a library preparation process and analyzed the number of FP InDels, the library concentration, the number of cycles in the target amplification step, the purity of the nucleic acid, the input, and the number of samples/Ion 314 chips in association with the results obtained by NGS. Results: We carried out 51 reactions and nine adjustments of protocols and observed eight FP InDels in homopolymer regions. No FP Single-Nucleotide Polymorphism variant was observed; 67.5% of protocol variables were jointly associated with the quality of the results obtained (p

Trabalho Final do Mestrado Integrado em Medicina apresentado à Faculdade de Medicina Introdução: As mutações nos genes BRCA estão associadas a uma maior predisposição para o desenvolvimento de cancro da mama e ovário. Tem sido sugerido que portadoras destas mutações podem apresentar uma reserva ovárica diminuída. Contudo, os resultados de diversos estudos são inconsistentes. O objetivo deste estudo foi avaliar a reserva ovárica e a resposta à estimulação ovárica controlada em mulheres jovens portadoras da mutação BRCA1 ou BRCA2, referenciadas para aconselhamento ou preservação da fertilidade.Métodos: Foi realizado um estudo retrospetivo através da análise dos processos clínicos de 10 doentes com diagnóstico de mutação BRCA, referenciadas ao Serviço de Medicina da Reprodução do Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra (CHUC). Foi realizada uma análise descritiva dos dados clínicos e demográficos, da reserva ovárica e da resposta à estimulação ovárica. A reserva ovárica foi determinada de acordo com os níveis de hormona anti mülleriana (HAM), da hormona estimuladora de folículos (FSH) e a contagem de folículos antrais (CFA). Resultados: Foram estudadas 10 mulheres, oito portadoras da mutação BRCA1, e duas da mutação BRCA2. Duas mulheres (25%) tiveram níveis séricos de HAM inferiores ao percentil 5 quando comparados com valores específicos para a idade, ambas portadoras da mutação BRCA1. A resposta à estimulação ovárica controlada foi subótima (número de ovócitos obtidos inferior a 10) em 60% das doentes que realizaram criopreservação de ovócitos, todas portadoras da mutação BRCA1. O número de ovócitos em metáfase II foi inferior a oito ovócitos em todas as doentes, tanto BRCA1 como BRCA2. Uma diminuição dos níveis de HAM superior a 80% foi verificada após tratamento do cancro da mama.Discussão: A reserva ovárica encontrou-se diminuída em 25% das mulheres estudadas e a maioria apresentou uma resposta subótima à estimulação ovárica controlada realizada no contexto de preservação da fertilidade. O número de ovócitos maduros foi igualmente inferior ao valor ótimo. As mulheres que realizaram tratamentos para o cancro da mama, após preservação de fertilidade, desenvolveram insuficiência ovárica prematura. Apesar da amostra ser pequena, estes resultados estão de acordo com vários estudos publicados e reforçam a importância do aconselhamento em relação à preservação da fertilidade. São necessários estudos adicionais para esclarecer o efeito destas mutações no potencial reprodutivo das portadoras.Conclusão: As portadoras de mutações BRCA devem ser aconselhadas em relação ao risco de diminuição do seu potencial reprodutivo e esclarecidas quanto às estratégias de preservação da fertilidade. Introduction: Mutations in the BRCA genes are associated with an increased predisposition to the development of breast and ovarian cancer. It has been suggested that carriers of these mutations may have a decreased ovarian reserve. However, the results of several studies are inconsistent. The aim of this study was to evaluate the ovarian reserve and the response to controlled ovarian stimulation in young women carrying a BRCA1 or BRCA2 mutation, referred for counseling or fertility preservation.Methods: A retrospective study was conducted through the analysis of the clinical files of 10 patients diagnosed with BRCA mutation, referred to the Reproductive Medicine Service of the Hospital and University Center of Coimbra (CHUC). A descriptive analysis of the clinical and demographic data, the ovarian reserve and the response to ovarian stimulation was performed. The ovarian reserve was determined according to the levels of anti-Müllerian hormone (HAM), follicle stimulating hormone (FSH) and antral follicle count (CFA).Results: Ten women were studied, eight with the BRCA1 mutation and two with the BRCA2 mutation. Two women (25%) had serum HAM levels below the 5th percentile when compared to age-specific values, both with the BRCA1 mutation. The response to controlled ovarian stimulation was suboptimal (number of oocytes obtained less than 10) in 60% of patients who underwent oocyte cryopreservation, all carrying the BRCA1 mutation. The number of oocytes in metaphase II was less than eight oocytes in all patients, both BRCA1 and BRCA2. A decrease in HAM levels of more than 80% was seen after treatment for breast cancer.Discussion: Ovarian reserve was reduced in 25% of the women studied and the majority showed a suboptimal response to controlled ovarian stimulation performed in the context of fertility preservation. The number of mature oocytes was also less than the optimal value. Women who underwent breast cancer treatments, after fertility preservation, developed premature ovarian failure. Although based on a small sample, these results are in accordance with several published studies and reinforce the importance of counseling regarding fertility preservation. Additional studies are needed to clarify the effect of these mutations on the reproductive potential of carriers.Conclusion: Carriers of BRCA mutations should be informed about the risk of a decreased reproductive potential and counselled about fertility preservation strategies.

Repairing damage and errors that occur in the DNA molecule is essential to maintain the integrity of the genome and cell viability. Deficits in DNA repair mechanisms lead to an increased risk of genetic instability and contribute to neoplastic transformation. Poly (ADP-ribose) polymerases (PARP) are a group of enzymes that play a key role in signalling and repairing DNA errors. The inhibition of its activity is a therapeutic strategy that takes advantage of the mechanism of synthetic lethality and that can be used in the treatment of tumours with specific defects in DNA repair pathways, namely in tumours with mutations in the tumour suppressor genes BRCA1 and BRCA2. There are several PARP inhibitors (iPARP), already approved by the USA Food and Drug Administration and the European Medicines Agency used in the treatment of breast, ovarian, pancreatic and prostate cancer. However, as with other target therapies, despite being well tolerated and widely used in the clinical practice, iPARP resistance is common and can be developed through various molecular mechanisms. In this article, we intend to make an updated review on iPARP and its main role in tumour cells, highlighting the several resistance mechanisms that have been recently revealed, as well as the current clinical applications and toxicity associated with this target therapy.A reparação dos danos que ocorrem na molécula de ADN é fundamental para manter a integridade do genoma e a viabilidade celular. Défices nos mecanismos de reparação desta molécula cursam com um aumento do risco para instabilidade genética e contribuem para a transformação neoplásica. As poly (ADP-ribose) polymerases (PARP) são um grupo de enzimas que apresentam um papel chave na sinalização e reparação dos erros no ADN. A inibição da sua atividade é uma estratégia terapêutica que tira partido do mecanismo de letalidade sintética e que pode ser usada no tratamento de tumores com defeitos específicos nas vias de reparação de ADN, nomeadamente em tumores com mutações nos genes supressores tumorais BRCA1 e BRCA2. Existem vários inibidores das PARP (iPARP) já aprovados pela Food and Drug Administration dos Estados Unidos da América e pela Agência Europeia do Medicamento e utilizados no tratamento do cancro da mama, ovário, pâncreas e próstata. No entanto, tal como acontece com outras terapias alvo, a resistência aos iPARP é comum apesar de bem tolerados e amplamente utilizados na prática clínica, e pode desenvolver-se através de vários mecanismos moleculares. Neste artigo, pretendemos realizar uma revisão atualizada sobre os iPARP e o seu principal modo de ação em células tumorais, dando a conhecer os vários mecanismos de resistência que têm sido recentemente revelados, assim como as atuais aplicações clínicas e a toxicidade associada a esta terapia alvo.

Resumen Introducción. El cáncer de mama es un problema mundial de salud pública; entre el 5 y el 10 % de los casos presentan agregación familiar, lo que se explicaría por la presencia de mutaciones en genes de alto riesgo como el BRCA1 y el BRCA2. El origen fundador de la deleción BRCA1 3450del4 en Colombia ya fue reportado. Objetivo. Hacer un análisis descriptivo de seis familias del del Tolima y del Huila con la deleción BRCA1 3450del4 de la asociación de la mutación germinal, con el cáncer de mama y la agregación familiar. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo y transversal de seis casos índice con cáncer de mama positivos para BRCA1 3450del4, que cumplían tres de los criterios establecidos por Jalkh, et al. A partir de la información de las entrevistas, se realizaron los árboles genealógicos (GenoPro™, versión 2016). Se tipificó la mutación en familiares sanos y afectados que aceptaron participar. Resultados. De los 78 individuos seleccionados por conveniencia en las seis familias, 30 presentaron la mutación BRCA1 3450del4; de ellos, seis tenían cáncer de mama, uno, cáncer de ovario, uno, cáncer de mama y ovario, y otro, cáncer de próstata; 21 no presentaban neoplasias. De los 30 individuos portadores de la variante patogénica, seis eran hombres y 24 mujeres, 13 de ellas menores de 30 años. Conclusiones. En este estudio se confirmó la asociación de la deleción BRCA1 3450del4 con el cáncer de mama de agregación familiar. Abstract Introduction: Breast cancer is a worldwide public health problem; between 5% and 10% of the cases present familial aggregation explained by genes of high risk such as BRCA1 and BRCA2. The founding origin of the deletion BRCA1 3450del4 in Colombia has been previously reported. Objective: To carry out in six families from Tolima and Huila departments a descriptive analysis of the presence of the BRCA1 3450del4 mutation associated with breast cancer and familial aggregation. Materials and methods: We conducted a descriptive and cross-sectional study of six index cases with breast cancer positive for BRCA1 3450del4 that fulfilled three of the criteria established by Jalkh, et al. The genealogical trees were made using the information of the interview data (GenoPro™, version 2016). The mutation was typified in healthy and affected relatives who agreed to participate. Results: Thirty of the 78 individuals selected by convenience in the six families presented the mutation BRCA1 3450del4 six of whom developed breast cancer, one, ovarian cancer, one ovarian and breast cancer, and one prostate cancer; 21 did not present any type of neoplasm at the time of the study. Of the 30 individuals carrying the pathogenic variant, six were men, 24 were women, and 13 of these were under 30. Conclusions: In this study of families with the deletion BRCA1 3450del4 in Tolima and Huila we confirmed its association with familial aggregation of breast cancer.

Resumen: Las mutaciones de BRCA1 son raras en el cáncer de mama (CM) esporádico; sin embargo, su expresión a nivel tumoral se encuentra disminuida o ausente en 30%-50% de los casos. Objetivo: valorar la expresión tumoral de BRCA1 por inmunohistoquímica (IHQ) en mujeres uruguayas diagnosticadas de CM antes de los 40 años. Material y método: se incluyeron pacientes diagnosticadas de CM antes de los 40 años. Se utilizaron los anticuerpos monoclonales anti-BRCA1 MS110 contra el extremo N-terminal y GLK-2 contra el extremo C-terminal. Se calculó la sobrevida global (SVG) y la sobrevida libre de enfermedad (SVLE), para la construcción de las curvas se utilizó el método de Kaplan-Meier y la diferencia de sobrevida se evaluó mediante el test de log rank. Resultados: se incluyeron 40 pacientes, la SVG y la SVLE a cinco años fueron de 73% y 60% respectivamente. La expresión de BRCA1 mediante GLK-2 fue 10% (p=0,015) y de 40% vs 72% (p=0,034) respectivamente. La expresión de BRCA1 mediante MS110 fue 10% (p=0.015) and 40% vs. 72% (p = 0.034) respectively. The expression of BRCA1 by MS110 was 10% (p=0,015) e 40% vs. 72% (p=0,034) respectivamente. A expressão de BRCA1 mediante MS110 foi =10% em 11 das 40 pacientes (27,5%). Não foram encontradas diferenças na SVG nem na SVLE aos 5 anos com este marcador. Conclusão: foi encontrada perda da expressão tumoral de BRCA1 determinada por GLK-2 em 40% das pacientes incluídas e foi associada a uma menor SVG e SVLE, o que poderia ter um valor prognóstico desfavorável nestas pacientes.

Objective: To estimate the economic impact of the introduction of olaparib in the Spanish National Health System as maintenance monotherapy in patients with BRCA-mutation positive high-grade serous ovarian cancer. Method: A budget impact model was developed from the Spanish NHS perspective and a time horizon of 5 years for four treatment lines. The model included prevalent and incident patients estimated according to Spanish epidemiological data. Patients moved between treatment lines according to the progression-free survival and overall survival curves obtained from the respective clinical trials. Only direct costs (€ 2017) were considered: pharmacological, administration, adverse effects and genetic tests. The robustness of the model was verified by a univariate sensitivity analysis. Results: The use of olaparib meant that, after 5 years, 6% fewer patients progressed to later lines compared to scenario without olaparib, remaining longer in the second line and delaying the initiation of subsequent lines. The total estimated budgetary impact ranged between € 1.6 and € 5.4 million (1-5 years). The economic impact associated to the introduction of olaparib is partially offset by the lower cost of chemotherapy, related adverse events, and palliative care in patients with olaparib than in patients without it. Conclusions: Olaparib as maintenance treatment in patients with BRCA-mutation positive high-grade serous ovarian cancer increases progression-free survival and delays the use of subsequent chemotherapy, with an budgetary impact for the Spanish National Health System of 5.4 million euros after 5 years. Resumen Objetivo: Estimar el impacto económico de la introducción de olaparib en el Sistema Nacional de Salud como monoterapia de mantenimiento en pacientes con cáncer de ovario seroso de alto grado y mutación BRCA. Método: Se desarrolló un modelo de impacto presupuestario desde la perspectiva del Sistema Nacional de Salud y un horizonte temporal de cinco años a lo largo de cuatro líneas de tratamiento. El modelo incluye pacientes prevalentes e incidentes estimadas a partir de datos epidemiológicos españoles. Las pacientes se mueven entre las líneas de tratamiento en función de las curvas de supervivencia libre de progresión y supervivencia global obtenidas de los respectivos ensayos clínicos. Solo se consideraron costes directos (€ 2017): farmacológicos, de administración, efectos adversos y test genéticos. La robustez del modelo se ha comprobado a través de un análisis de sensibilidad univariante. Resultados: El uso de olaparib conllevó que, tras cinco años, un 6% menos de pacientes progresaran a líneas posteriores, en comparación al escenario sin olaparib, permaneciendo más tiempo en segunda línea y retrasando el inicio de líneas subsiguientes. El impacto presupuestario total estimado osciló entre 1,6 y 5,4 millones de euros (1-5 años). Este impacto económico se ve parcialmente compensado por los costes de la quimioterapia, el manejo de sus efectos adversos y los cuidados paliativos, los cuales producen ahorros para el Sistema Nacional de Salud. Conclusiones: Olaparib como tratamiento de mantenimiento en pacientes con cáncer de ovario seroso de alto grado y mutación del gen BRCA aumenta la supervivencia libre de progresión y retrasa la utilización de quimioterapia posteriores, con un impacto presupuestario para el Sistema Nacional de Salud de 5,4 millones de euros tras 5 años.

Background Breast cancer is one of the most prevalent malignancies in the world. In Peru, breast cancer is the second cause of death among women. Five to ten percent of patients present a high genetic predisposition due to BRCA 1 and BRCA 2 germline mutations. Methods We performed a comprehensive analysis of BRCA 1 and BRCA 2 genes by Sanger sequencing and multiplex ligation‐dependent probe amplification (MLPA ) to detect large rearrangements in patients from 18 families, which met the criteria for hereditary breast cancer. Results In this series, we found four pathogenic mutations, three previously reported (BRCA 1 : c.302‐1G>C and c.815_824dup10; BRCA 2 : c.5946delT) and a duplication of adenines in exon 15 in BRCA 1 gene (c.4647_4648dupAA , ClinVar SCV 000256598.1). We also found two exonic and four intronic variants of unknown significance and 28 polymorphic variants. Conclusion This is the first report to determine the spectrum of mutations in the BRCA 1/BRCA 2 genes in Peruvian families selected by clinical and genetic criteria. The alteration rate in BRCA 1/BRCA 2 with proven pathogenic mutation was 22.2% (4 out 18) and this finding could be influenced by the reduced sample size or clinical criteria. In addition, we found three known BRCA 1/BRCA 2 mutations and a BRCA 1 c.4647_4648dupAA as a novel pathogenic mutation.

Resumen: Introducción: el cáncer de mama representa la primera causa de muerte por cáncer en mujeres de Uruguay. Se estima que cerca de 7% son causados por mutaciones en el ácido desoxirribonucleico germinal. Los costos de la secuenciación genética han descendido dramáticamente gracias a la aparición de la secuenciación de nueva generación (NGS). El cambio tecnológico abrió una nueva etapa en el estudio del cáncer hereditario en nuestro país. Objetivo: comunicar los resultados de la utilización de tecnología NGS y paneles multigénicos en familias uruguayas con alto riesgo de cáncer de mama hereditario. Pacientes y método: se secuenciaron 135 familias de alto riesgo que provenían de la consulta de consejería genética que funciona en el Grupo Colaborativo Uruguayo: Investigación de afecciones oncológicas hereditarias. Cuando la historia familiar sugería claramente un síndrome de cáncer de mama y ovario hereditario se efectuó secuenciación NGS exclusiva de los genes BRCA1 y 2; cuando el patrón familiar no configuraba claramente se utilizó un panel multigénico. Resultados: se efectuó NGS exclusiva de genes BRCA1 y 2 en 62 familias y un panel multigénico en 73 familias. Se identificaron en total 29 mutaciones patógenas (21 en genes BRCA y 8 en otros genes). Dos de ellas fueron noveles y tres pueden considerarse recurrentes en la población uruguaya. Conclusiones: este trabajo es el primero en Uruguay en reportar el resultado de esta nueva tecnología en el cáncer de mama hereditario. El hallazgo de 29 mutaciones patógenas nos ayuda a delinear el perfil mutacional de nuestro país. Abstract: Introduction: breast cancer is women’s first cause of death in Uruguay. According to estimations, around 7% of cases result from germinal mutations by deoxyribonucleic acid. The cost of genetic sequencing has dramatically dropped thanks to the arrival of next-generation sequencing (NGS). This technological change opened a new era in the study of hereditary cancer in our country. Objective: to communicate the results of using NGS technology and multigenic panels in Uruguayan families with high risk of hereditary breast cancer. Method: 135 high risk families referred by the genetic counselling consultation that is provided at the Uruguayan Collaborative Group (Hereditary Oncological Conditions Research) were sequenced. When the family history clearly suggested hereditary breast and ovary cancer was a possibility, exclusive NGS sequencing was done for BRCA1 and BRCA2 genes; when the family pattern was not clear to this respect, multigenic panels were used. Results: exclusive NGS sequencing for BRCA1 and BRCA2 genes was done in 62 families, and multigenic panels were used in 73 families. 29 pathogenic mutations were identified (21 in BRCA genes and 8 in other genes). Two of them were new to the disease and three could be considered recurrent in the Uruguayan population. Conclusions: this study is the first one in Uruguay to report the results of this new technology in hereditary breast cancer. The finding of 29 pathogenic mutations contributes to outlining the mutational profile of our country. Resumo: Introdução: o câncer de mama é a primeira causa de morte por câncer em mulheres no Uruguai. Estima-se que aproximadamente 7% sejam causados por mutações no ácido desoxirribonucleico germinal. Os custos da sequenciação genética diminuíram dramaticamente graças ao aparecimento da sequenciação de nova geração (NGS). Esta nova tecnologia deu inicio a uma nueva etapa no estudo do câncer hereditário no nosso país. Objetivo: comunicar os resultados da utilização de tecnologia NGS e painéis mutagênicos em famílias uruguaias com alto risco de câncer de mama hereditário. Pacientes e método: 135 famílias de alto risco originárias do aconselhamento genético que funciona no Grupo Colaborativo Uruguaio: Pesquisa de afecções oncológicas hereditárias foram sequenciadas. Quando a história familiar sugeria uma síndrome de câncer de mama e ovário hereditários fez-se a secuenciacao NGS exclusivamente dos genes BRCA1 e 2; quando o padrão familiar não era claro foi utilizado um painel multigênico. Resultados: realizou-se NGS exclusivamente de genes BRCA1 e 2 em 62 famílias e um painel multigênico em 73 famílias. Foram identificadas 29 mutações patogênicas (21 em genes BRCA e 8 em outros genes). Duas eram novas e três podem ser consideradas como recorrentes na população uruguaia. Conclusões: este trabalho é o primeiro que apresenta os resultados desta nova tecnologia aplicada ao câncer de mama hereditário no Uruguai. O achado de 29 mutações patogênicas ajuda a definir o perfil mutacional do nosso país.

This article discusses ethical, scientific and legal aspects of the patenting of human genes, starting from a historical context of intellectual property of living beings and passing through the decision of the US Supreme Court in Myriad Genetics case, conflict over patent of the genes BRCA1 and BRCA2, related to breast cancer and ovarian cancer. Moreover, the article discusses regulatory instruments on the subject, considering both the Brazilian and international legislation. Finally, it contrasts different positions on patent of human genes, adopting critical position that this matter deserves. Este artículo aborda los aspectos éticos, científicos y legales de las patentes de genes humanos, a partir de un contexto histórico de la propiedad intelectual de los seres vivos y pasando por la decisión de la Corte Suprema de Estados Unidos en el caso Myriad Genetics, el conflicto sobre patentes de los genes BRCA1 y BRCA2 relacionados con el cáncer de mama y cáncer de ovario. Además, el artículo analiza los instrumentos normativos sobre el tema, teniendo en cuenta tanto la legislación brasileña como internacional. Por último, contrasta diferentes posiciones sobre las patentes de los genes humanos, y adopta una posición crítica que este asunto merece. O presente artigo discute aspectos éticos, científicos e jurídicos sobre o patenteamento de genes humanos, partindo de um contexto histórico sobre propriedade intelectual de seres vivos e passando pela decisão da Suprema Corte dos EUA relativa ao caso Myriad Genetics, conflito em torno da patente dos genes BRCA1 e BRCA2, relacionados ao câncer de mama e de ovário. Além disso, o artigo aborda diplomas normativos sobre o assunto, considerando tanto a legislação brasileira quanto a internacional. Por fim, contrapõe posições distintas sobre patente de genes humanos, adotando posicionamento crítico que o assunto merece.

IntroductionWomen who have pathogenic mutations in theBRCA1andBRCA2genes are at greatly increased risks for breast and ovarian cancers. Although risk-reduction strategies can be undertaken by these women, knowledge regarding the uptake of these strategies is limited. Additionally, the healthcare behaviours of women who receive inconclusive test results are not known. This study protocol describes the creation of a retrospective cohort of women who have undergone genetic testing forBRCA1andBRCA2, linking genetic test results with administrative data to quantify the uptake of risk-reduction strategies and to assess long-term cancer and non-cancer outcomes after genetic testing.Methods and analysisApproximately two-thirds ofBRCA1andBRCA2testing in Ontario, Canada is performed at North York General Hospital (NYGH) and Mount Sinai Hospital (MSH), Toronto. We will use registries at these sites to assemble a cohort of approximately 17 000 adult women who underwentBRCA1andBRCA2testing from January 2007 to April 2016. Trained chart abstractors will obtain detailed information for all women tested over this period, including demographics, personal and family cancer histories and genetic test results. We will link these data to provincial administrative databases, enabling assessment of healthcare utilisation and long-term outcomes after testing. Study outcomes will include the uptake of breast cancer screening and prophylactic breast and ovarian surgery, cancer incidence and mortality and incidence of non-cancer health outcomes, including cardiovascular, osteoporotic and neurodegenerative disease.Ethics and disseminationThis study has been approved by the Research Ethics Boards at NYGH (no 16-0035), MSH (no 13-0124) and Sunnybrook Health Sciences Centre (no 275-2016). We plan to disseminate research findings through peer-reviewed publications and presentations at national and international meetings.

OBJECTIVE: To evaluate the distribution of molecular subtypes of breast tumors diagnosed in young Brazilian women and to analyze the frequency of loss of heterozygocity (LOH) in BRCA1 among different molecular subtypes of early-onset breast cancer. METHODS: Samples from 72 cases of invasive breast carcinoma diagnosed in women aged between 19 and 40 years were evaluated using an immunohistochemical panel of biomarkers. Three intragenic BRCA1 locus microsatellites, D17S1322, D17S1323, and D17S855, were PCR amplified from matched normal (lymphocyte) and tumor DNAs for (LOH) analysis. RESULTS: We found 13 cases (18%) that had an immunohistochemical profile consistent with being basal-like. Forty cases (55%) were luminal A type; 11% (8 cases) were luminal B type, 13% (9 cases) were HER2-overexpressing tumors and two cases were ER-/HER2- carcinomas lacking basal marker expression. Four of the 16 informative cases at D17S1322, one of the four informative cases at D17S855, and none of the five informative cases at D17S1323 displayed LOH (four basal-like and one Luminal A). Microsatellite instability (MSI) at D17S855 and D17S1322 was found in two cases (one a basal-like and one Luminal A). CONCLUSION: In our study, basal-like tumor was the second most frequent molecular type among young Brazilian women and was only observed in women diagnosed under the age of 35 years. There was no significant difference of LOH at BRCA1 locus rates between basal-like breast tumors and not-basal-like breast tumors (p=0.62). LOH in BRCA1 and MSI in these breast cancers were not frequent but may indicate a small group of breast cancers with a specific molecular makeup.OBJETIVO: Avaliar a distribuição dos subtipos moleculares dos tumores de mama diagnosticados em mulheres brasileiras jovens e determinar a frequência de perda de heterozigose (LOH) no gene BRCA1 entre os diferentes subtipos moleculares de tumores. MÉTODOS: Setenta e dois casos de carcinoma invasivo de mama diagnosticados em mulheres entre 19 e 40 anos de idade foram classificados de acordo com o subtipo molecular utilizando um painel imunoistoquímico e para a análise de LOH foram utilizados três marcadores intragênicos para o gene BRCA1 (D17S1322, D17S855, D17S1323). RESULTADOS: Treze casos (18%) apresentaram perfil imunoistoquímico compatível com carcinoma do tipo basal (basal-like tumor). Quarenta casos (55%) foram classificados como tumores do tipo luminal A; 11% (oito casos) do tipo luminal B, 13% (nove casos) corresponderam a tumores com superexpressão de HER2 (HER2-overexpressing tumors) e dois casos corresponderam a carcinomas ER/HER2 negativos sem expressão de marcadores basais. LOH foi detectada em quatro dos 16 casos informativos para o marcador D17S1322 e em um dos quatro casos informativos para D17S855. Instabilidade de microssatélites (MSI) foi observada em dois casos, um do tipo basalóide e um do tipo luminal A. CONCLUSÃO: Carcinomas do tipo "basal-like" corresponderam ao segundo subtipo molecular mais frequente entre os tumores de mama diagnosticados neste grupo de mulheres e foram restritos às mulheres com idade inferior a 35 anos. Não houve diferença significativa na frequência de LOH no gene BRCA1 entre os subtipos moleculares (p= 0,62). A frequência de LOH e de instabilidade de microssatélite em BRCA1 foi baixa neste grupo de pacientes, porém podem indicar um pequeno grupo de cânceres de mama com características moleculares específicas distintas.

Objectives: Missense variants are very commonly detected when screening for mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes. Pathogenic mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes lead to an increased risk of developing breast, ovarian, prostate and/or pancreatic cancer. This study aimed to assess the predictive capability of in silico programmes and mutation databases in assisting diagnostic laboratories to determine the pathogenicity of sequence-detectable mutations. Methods: Between July 2011 and April 2013, an analysis was undertaken of 13 missense BRCA gene variants that had been detected in patients referred to the Genetic Health Services New Zealand (Northern Hub) for BRCA gene analysis. The analysis involved the use of 13 in silico protein prediction programmes, two in silico transcript analysis programmes and the examination of three BRCA gene databases. Results: In most of the variants, the analysis showed different in silico interpretations. This illustrates the interpretation challenges faced by diagnostic laboratories. Conclusion: Unfortunately, when using online mutation databases and carrying out in silico analyses, there is significant discordance in the classification of some missense variants in the BRCA genes. This discordance leads to complexities in interpreting and reporting these variants in a clinical context. The authors have developed a simple procedure for analysing variants; however, those of unknown significance largely remain unknown. As a consequence, the clinical value of some reports may be negligible.

Certain mutations in BRCA1 and BRCA2 genes are frequent in the Ashkenazi Jewish population. Several factors contribute to this increased frequency, including consanguineous marriages and an event known as a "bottleneck", which occurred in the past and caused a drastic reduction in the genetic variability of this population. Several studies were performed over the years in an attempt to elucidate the role of BRCA1 and BRCA2 genes in susceptibility to breast cancer. The aim of this study was to estimate the carrier frequency of certain common mutations in the BRCA1 (185delAG and 5382insC) and BRCA2 (6174delT) genes in an Ashkenazi Jewish population from Porto Alegre, Brazil. Molecular analyses were done by PCR followed by RFLP (ACRS). The carrier frequencies for BRCA1 185delAG and 5382insC were 0.78 and 0 respectively, and 0.4 for the BRCA2 6174deT mutation. These findings are similar to those of some prior studies but differ from others, possibly due to excluding individuals with a personal or family history of cancer. Our sample was drawn from the community group and included individuals with or without a family or personal history of cancer. Furthermore, increased dispersion among Ashkenazi subpopulations may be the result of strong genetic drift and/or admixture. It is therefore necessary to consider the effects of local admixture on the mismatch distributions of various Jewish populations.

O câncer de mama é uma das neoplasias malignas mais comuns que afetam mulheres de todo o mundo. No Brasil, o Estado do Rio Grande do Sul tem índices de incidência e mortalidade por câncer de mama que situam-se entre os maiores do país. Aproximadamente 5-10% dos diagnósticos são causados por mutações germinativas em genes de predisposição entre os quais estão BRCA1 e BRCA2, associados à Síndrome de Câncer de mama e Ovário Hereditários (Hereditary Breast and Ovarian Cancer Syndrome ou HBOC, OMIM #114480).A identificação dos casos hereditários de câncer de mama é importante porque indivíduos afetados apresentam risco cumulativo vital muito superior ao da população para o desenvolvimento de câncer, porque familiares de um afetado podem estar igualmente em risco porque há medidas de rastreamento intensivo e intervenções preventivas que podem diminuir significativamente o risco de câncer em portadores de mutação. O diagnóstico molecular da síndrome HBOC é laborioso e caro devido à heterogeneidade molecular da doença. Famílias que apresentam características indicativas de uma síndrome de predisposição ao câncer de mama e ovário hereditários, mas que são negativas para mutações pontuais em BRCA1/2 vêm sendo testadas para grandes rearranjos visto que essas anormalidades têm sido consideradas como respondendo por, no mínimo, 10% do todos os casos HBOC com mutação identificável, incluindo grandes deleções ou duplicações. Um estudo recente de Portugal, demonstrou que um rearranjo fundador no exon 3 de BRCA2 ocorre em por 8% das famílias HBOC do Norte do país. Os objetivos deste trabalho incluíram a verificação da freqüência e caracterização de rearranjos gênicos nos genes BRCA1 e BRCA2, incluindo a mutação fundadora c.156_157insAlu no exon 3 de BRCA2 em famílias brasileiras dealto risco para a síndrome HBOC. Em um grupo de 145 indivíduos em risco nãorelacionados rastreados para a mutação fundadorac.156_157insAlu no exon 3 de BRCA2 foram encontrados 3 portadores da mutação (prevalência de 2%). Em um grupo de 145 indivíduos de risco não-relacionados rastreados para rearranjos gênicos em BRCA1 e BRCA2 pela técnica de MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification) foram identificados 4 portadores de mutação germinativa, sendo a mutação em dois deles um rearranjo gênico no gene BRCA1 (1,4%) envolvendo sequencias Alu. Rearranjos gênicos em BRCA1 e BRCA2 são responsáveis por uma parcela das mutações em famílias HBOC Brasileiras. O presente estudo, envolvendo uma série grande de famílias com o fenótipo da síndrome HBOC, não identificou novos rearranjos fundadores, no entanto, demonstrou a presença de rearranjos tanto em BRCA1 quanto em BRCA2, reiterando a importância da busca ativa por estas alterações, que dificilmente são identificadas por técnicas convencionais de sequenciamento gênico. A técnica de MLPA associada a um protocolo específico para detecção da mutação fundadora Portuguesa c.156_157insAlu podem ser utilizadas como estratégia inicial de rastreamento de mutações em famílias Brasileiras com a síndrome. Os resultados apresentados aqui, no entanto, indicam que mutações serão identificadas em menos de 10% dos casos utilizando esta estratégia. Breast cancer is one of the most common malignancies affecting women worldwide. In Brazil, the State of Rio Grande do Sul has incidence rates and mortality from breast cancer are among the largest in the country. Approximately 5-10% of the cases are caused by germline mutations in predisposing genes including BRCA1 and BRCA2 are associated with the syndrome of breast and ovarian cancer Hereditary (Hereditary Breast and Ovarian Cancer Syndrome or HBOC, OMIM # 114480). The identification of inherited cases of breast cancer is important because affected individuals have cumulative risk life much higher than the population for developing cancer because of an affected family may also be at risk because there are measures of intensive screening and preventive interventions that can significantly decrease the risk of cancer in mutation carriers. The molecular diagnosis of HBOC syndrome is laborious and expensive due to the molecular heterogeneity of the disease. Families that have characteristics indicative of a cancer predisposition syndrome of hereditary breast and ovarian cancers, but are negative for mutations in BRCA1/2 have been tested for large rearrangements because these abnormalities have been identified as accounting for at least 10 % of all cases HBOC identifiable mutation, including large deletions or duplications. A recent study from Portugal, the founder showed that a rearrangement in exon 3 of BRCA2 occurs in 8% of HBOC families of the north. The objectives of this work included the verification of the frequency and characterization of gene rearrangements in BRCA1 and BRCA2 genes, including c.156_157insAlu founder mutation in exon 3 of BRCA2 mutations in Brazilian families at high risk for HBOC syndrome. In a group of 145 individuals at risk unrelated traced to c.156_157insAlu founder mutation in exon 3 of 3 found BRCA2 mutation carriers (prevalence 2%). In a group of 145 individuals at risk unrelated screened for gene rearrangements in BRCA1 and BRCA2 by the technique of MLPA (multiplex ligationdependent probe amplification) identified four carriers of germline mutation, and two of the mutation in a gene rearrangement in the gene BRCA1 (1.4%) involving Alu sequences. Gene rearrangements in BRCA1 and BRCA2 account for a portion of HBOC mutations in Brazilian families. This study, involving a large series of families with HBOC syndrome phenotype, no new rearrangements identified founders, however, showed the presence of rearrangements in both BRCA1 and BRCA2, reiterating the importance of active search for these changes, which hardly are identified by conventional techniques of gene sequencing. The technique of MLPA protocol associated with a specific mutation detection founder Portuguese c.156_157insAlu strategy can be used as initial screening for mutations in families with Brazilian syndrome. The results presented here, however, indicate mutations that will be identified in less than 10% of the cases using this strategy.

Enquadramento: Os avanços na compreensão dos mecanismos moleculares e genéticos do cancro levaram a uma gestão mais “personalizada” da doença. Este conceito aplicado ao cancro da mama e/ou ovário permitiu revelar que as mulheres portadoras de mutações germinativas em BRCA apresentam uma maior probabiliade de desenvolver este tipo de cancro. Além disso, essa informação contribuiu para a elaboração de guidelines direccionadas para a orientação clínica destas mulheres, uma vez que a decisão a tomar é complexa. Objectivos e métodos: A presente revisão visa abordar a problemática da prevenção do cancro da mama e/ou ovário, bem como o acompanhamento – clínico e psicológico – das mulheres portadoras de mutações em BRCA, após a realização do teste genético. A metodologia escolhida baseou-se em artigos indexados na PubMed e guidelines disponíveis em websites clínicos. Resultados: A orientação clínica destas pacientes inclui a profilaxia e vigilância do cancro. A cirurgia profilática é a estratégia actualmente mais recomendada, tendo a anexectomia bilateral profilática uma eficácia superior à mastectomia bilateral profilática. As alternativas que podem ser consideradas abrangem a vigilância e quimioprevenção. A vigilância mamária apresenta bons resultados comparativamente à ginecológica. A quimioprevenção está reservada para as mulheres que optam por participar em ensaios clínicos com os fármacos disponíveis (i.e., tamoxifeno e raloxifeno). Conclusões: A orientação clínica das portadoras saudáveis de mutações em BRCA requere uma estratégia preventiva individual, na qual a intervenção de uma equipa multidisciplinar e especializada é fundamental. A decisão não cabe ao clínico, mas sim à própria paciente após esta ter sido totalmente informada e esclarecida em consultas de aconselhamento genético.

12 p. Introduction. Breast cancer is considered a worldwide public health problem, and, in Santander Province, Colombia, it is the first leading cause of morbidity and mortality by cancer in women. All cancers are considered genetic diseases, and mutations in BRCA (BReast CAncer) genes raises the risk for breast cancer by 60%-80%. The current study searched for the two most frequent BRCA1 mutations reported in the Breast Cancer Core Information database. Objective. The presence of specific mutations (185delAG, exon 2 and 5382insC, exon 20) was determined for the BRCA1 gene in women with familial/hereditary breast cancer. Materials and methods. The sample included 30 female patients using the oncology services in Bucaramanga, eastern Colombia; an informed consent, a questionnaire and a blood sample were obtained from each. The molecular analysis was done with PCR-Mismatch, to detect the insertion or eliminatation of a restriction site, and enzymatic digestion methods (HinfI or DdeI). Results. Two of the most frequent BRCA1 mutations in the international database were not found in the 30 patients studied. Conclusion. Additional mutation screening techniques are necessary involving the entire BRCA1 gene, are necessary in order to better characterize the molecular epidemiology of breast cancer in Bucaramanga, Santander, Colombia. Introducción. El cáncer de mama es un problema de salud pública a nivel mundial y en Santander es la primera causa de morbimortalidad por cáncer en mujeres. Todo cáncer se considera una enfermedad genética y las mutaciones en los genes BRCA confieren un riesgo de 60% a 80% para el cáncer de mama. Este estudio consistió en buscar las dos mutaciones BRCA1 más frecuentes según la base de datos Breast Cancer Core Information. Objetivo. Determinar la presencia de mutaciones específicas (185delAG, exón 2, y 5382insC, exón 20) en el gen BRCA1 en mujeres con cáncer de mama heredo-familiar, atendidas en los diferentes servicios de oncología de Bucaramanga, Colombia. Materiales y métodos. La muestra incluyó 30 pacientes, de las cuales se obtuvo un consentimiento informado, un cuestionario dirigido y sangre venosa para los estudios moleculares. El análisis molecular se realizó mediante PCR-mismatch, para introducir o eliminar sitios de restricción, y digestión enzimática (HinfI o DdeI). Resultados. No se detectaron dos de las mutaciones más frecuentes en el gen BRCA1 en las 30 pacientes estudiadas. Conclusión. Se requieren más estudios en la región que abarquen la tamización de la totalidad del gen BRCA1, para hacer una mayor contribución al conocimiento de la epidemiología molecular del cáncer de mama en Bucaramanga, Santander, Colombia.

Base Teórica: O câncer de mama é provavelmente o mais temido pelas mulheres devido a sua alta freqüência e, sobretudo, pelos seus efeitos psicológicos que afetam a percepção da sexualidade e a própria imagem pessoal. Ele é relativamente raro antes dos 35 anos de idade, mas acima desta faixa etária sua incidência cresce rápida e progressivamente. Estudos indicam que fatores genéticos e ambientais são responsáveis pela incidência do câncer de mama, sendo que a hereditariedade provavelmente tenha participação restrita no desenvolvimento deste tipo de tumor. Os principais genes associados ao desenvolvimento do câncer de mama, BRCA1 e BRCA2, são responsáveis por cerca de 80% desses casos, conferindo um risco de 71 a 85% de chance de desenvolver a neoplasia em alguma fase da vida. Mutações nesses genes, classificados como supressores tumorais, demonstram que a perda de suas funções não pára o ciclo celular, não permite a ação do sistema de reparo, e não estimula a apoptose (morte celular programada), culminando em replicação anormal e câncer. A observação epidemiológica de que mulheres judias de origem Ashkenazi parecem ser mais vulneráveis ao câncer de mama está sendo explicada através de estudos moleculares dos genes BRCA1 e BRCA2, onde encontramos a prevalência de três mutações específicas: 185delAG e 5382insC, no gene BRCA1 e 6174delT, no gene BRCA2. Métodos: Utilizou-se um banco de DNA pré-existente, extraído de 209 mulheres da comunidade judaica Ashkenazi da cidade de Porto Alegre. A amplificação do DNA foi realizada por PCR, através da técnica PSM (PCR Mediated site-direct) seguida de digestão dos produtos de PCR com enzimas de restrição. Os objetivos foram verificar se as freqüências das mutações 185delAG e 5382insC, no gene BRCA1 são significativas nesta população e compará-las com demais freqüências encontradas. Resultados: Foram encontradas três pacientes com a mutação 185delAG e duas pacientes com a mutação 5382insC, com as freqüências de 1,435% (95% IC: 0,366; 3,856) e 0,957% (95% IC: 0,161; 3,125), respectivamente. Introduction: Breast cancer is probably the worst diagnosed cancer for women due to its high frequency and furthermore by its psychological problems that affect the perception of sexuality and the self image. It is relatively rare before 35 years of age, but beyond this age its incidence increases rapidly and progressively. Studies show that genetic and environmental factors are responsible for breast cancer incidence, but heredity may play a restrict role in the development of this kind of tumor. The main genes associated to the development of breast cancer, BRCA1 and BRCA2, are responsible for almost 80% of these cases, reaching a chance between 71 and 85% of developing the disease at any life stage. Mutations in these genes, classified as tumor suppressors, do not allow the repair mechanisms of DNA to perform its action and do not stimulate apoptosis, culminating in abnormal replication and cancer. The epidemiological observation in which Ashkenazi Jewish women seems to be more vulnerable to breast cancer is explained through molecular studies of BRCA1 and BRCA2 genes, where three specific mutations have been found (185delAG and 5382insC, in the BRCA1 gene and 6174delT, in the BRCA2 gene). Methods: A pre-existent bank of DNA extracted from 209 women of the Ashkenazi Jewish community of Porto Alegre city has been used. The DNA amplification was performed through PCR, using the PSM (PCR Mediated Site-Direct) technique followed by the digestion of PCR products with restriction enzymes. The objectives of this study was to identify the frequencies of mutations 185delAG and 5382insC at the BRCA1 gene and verify if they are significantly different in this population when compared to frequencies found in other studies. Results: We found three patients with 185delAG mutation and two patients with 5382insC mutation, with frequencies of 1.435% (95% CI: 0,366; 3,856) and 0,957% (95% IC: 0,161; 3,125), respectively.

Mutações no gene BRCA1 são conhecidas como a causa mais freqüente a predisposição aos cânceres hereditários de mama e ovário. Embora menos que 10% de todos os casos de câncer de mama e ovário manifestem características hereditárias, estima-se que até 80% dos casos hereditários são relacionados a mutações no gene BRCA1. A maioria das mulheres com câncer de aparecimento precoce e forte história familiar são portadoras de mutações em BRCA1. A identificação e caracterização destas mutações na população brasileira são cruciais para o aconselhamento genético e prevenção. Neste trabalho, apresentamos dados da seqüência de ADN de 47 pacientes que foram selecionados pelo Grupo de Aconselhamento Genético em Câncer de Mama e Ovário do Instituto Nacional de Câncer-RJ. Todos os éxons codificantes e junções íntron-éxon foram analisadas. Sete mutações (15%) foram encontradas em BRCA1 entre os 47 pacientes incluídos na investigação: uma idêntica inserção (insC 5382) foi encontrada no éxon 20 de quatro pacientes, uma deleção de quatro pares de bases (3450 del4 CAAG) no éxon 11, resultando em um códon de parada, no quinto paciente; uma transição (T>C IVS 17+2) no íntron 17, afetando o sítio de processamento do ARNm no sexto paciente; e uma transição C>T resultante em um códon de parada (Q1135X) no éxon 11 do sétimo paciente. Outro paciente sem mutações detectadas em BRCA1 apresentou uma mutação em BRCA2 (IVS 21+4 A>G) no íntron 21, outro gene relacionado ao câncer de mama masculino e feminino. A identificação destas mutações associadas aos cânceres de mama e ovário hereditários contribuirá para o conhecimento do perfil mutacional de BRCA1 na população brasileira.

12 p., Introduction. Breast cancer is considered a worldwide public health problem, and, in Santander Province, Colombia, it is the first leading cause of morbidity and mortality by cancer in women. All cancers are considered genetic diseases, and mutations in BRCA (BReast CAncer) genes raises the risk for breast cancer by 60%-80%. The current study searched for the two most frequent BRCA1 mutations reported in the Breast Cancer Core Information database. Objective. The presence of specific mutations (185delAG, exon 2 and 5382insC, exon 20) was determined for the BRCA1 gene in women with familial/hereditary breast cancer. Materials and methods. The sample included 30 female patients using the oncology services in Bucaramanga, eastern Colombia; an informed consent, a questionnaire and a blood sample were obtained from each. The molecular analysis was done with PCR-Mismatch, to detect the insertion or eliminatation of a restriction site, and enzymatic digestion methods (HinfI or DdeI). Results. Two of the most frequent BRCA1 mutations in the international database were not found in the 30 patients studied. Conclusion. Additional mutation screening techniques are necessary involving the entire BRCA1 gene, are necessary in order to better characterize the molecular epidemiology of breast cancer in Bucaramanga, Santander, Colombia., Introducción. El cáncer de mama es un problema de salud pública a nivel mundial y en Santander es la primera causa de morbimortalidad por cáncer en mujeres. Todo cáncer se considera una enfermedad genética y las mutaciones en los genes BRCA confieren un riesgo de 60% a 80% para el cáncer de mama. Este estudio consistió en buscar las dos mutaciones BRCA1 más frecuentes según la base de datos Breast Cancer Core Information. Objetivo. Determinar la presencia de mutaciones específicas (185delAG, exón 2, y 5382insC, exón 20) en el gen BRCA1 en mujeres con cáncer de mama heredo-familiar, atendidas en los diferentes servicios de oncología de Bucaramanga, Colombia. Materiales y métodos. La muestra incluyó 30 pacientes, de las cuales se obtuvo un consentimiento informado, un cuestionario dirigido y sangre venosa para los estudios moleculares. El análisis molecular se realizó mediante PCR-mismatch, para introducir o eliminar sitios de restricción, y digestión enzimática (HinfI o DdeI). Resultados. No se detectaron dos de las mutaciones más frecuentes en el gen BRCA1 en las 30 pacientes estudiadas. Conclusión. Se requieren más estudios en la región que abarquen la tamización de la totalidad del gen BRCA1, para hacer una mayor contribución al conocimiento de la epidemiología molecular del cáncer de mama en Bucaramanga, Santander, Colombia.

The discovery of the association between breast and ovarian cancer and the BRCA genes and the development of methods for genetic testing made it possible to screen women for genetic predisposition to develop hereditary breast cancer (HBC). Parallelly, prevention strategies, including clinical surgical and medical interventions become available in order to reduce cancer risk. In a meantime, we became aware of limitations of genetic testing from the aspect of BRCA gene penetrance, negative result interpretation etc. All of these, together with data that invasive prevention strategies such as prophylactic surgery demonstrate better results in risk reduction than regimens including self and clinical-examination, face BRCA mutation carriers with difficult choice for risk reduction options. Therefore, the patients at high risk of HBC can best make informed decisions when guided by a multidisciplinary genetic counseling team.