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As comunidades rurais estão localizadas longe dos centros urbanos, onde o fornecimento adequado de água potável é prejudicado. Na falta de uma rede pública de distribuição, a obtenção de água, é feita a partir de fontes superficiais e subterrâneas, onde a qualidade microbiana é muitas vezes desconhecida. Goiás possui 9,7% da população em áreas rurais e estudos anteriores feitos em algumas dessas comunidades rurais e tradicionais já demonstraram vulnerabilidade da água para o consumo desses residentes por patógenos de veiculação hídrica, como os vírus entéricos. Logo, o objetivo do trabalho foi continuar a avaliação da contaminação fecal de amostras de água provenientes de fontes individuais e coletivas, de 24 comunidades em áreas rurais do Estado de Goiás. Foram coletadas 160 amostras, cujas fontes de água eram poço tubular raso, poço tubular profundo, poço raso escavado e nascente, mananciais superficiais, água da chuva armazenada em cisternas e caminhão pipa. Utilizou-se como indicadores de contaminação fecal os vírus entéricos Adenovírus humano (HAdV), Rotavírus (RV) e Enterovírus (EV), analisados por qPCR. Ao todo, 30% das amostras apresentaram indicativo de contaminação fecal. As taxas de detecção foram de 20% para RV, 9,4% para HAdV e 4,4% para EV. As médias geométricas de concentração desses indicadores foram 1,5x106 CG/L, 1,9x106 CG/L e 7,1x105 CG/L, respectivamente. RV foi o indicador viral de maior prevalência em fontes subterrâneas, sendo estatisticamente associado a poços tubulares rasos. Em amostras de nascente, destaca-se o HAdV com 11,8%. Nas amostras de cisterna, tanto HAdV quanto RV, foram encontrados na mesma prevalência. Esses resultados revelam que a população analisada está vulnerável a doenças de veiculação hídrica causadas por patógenos entéricos, servindo para orientar a futuras decisões e aprimorar as práticas cotidianas de tratamento de água nestas comunidades. Rural communities are located far from urban centers, where the adequate supply of potable water is hampered. In the lack of a public distribution network, water is obtained from surface and groundwater sources, where the microbial quality is often unknown. Goiás has 9.7% of the population in rural areas and previous studies carried out in some of these rural and traditional communities have already demonstrated the vulnerability of water for the consumption of these residents by waterborne pathogens, such as enteric viruses. Therefore, the aim of the work was to continue the evaluation of fecal contamination of water samples from individual and collective sources, from 24 communities in rural areas of the State of Goiás. 160 samples were collected, whose water sources were shallow tubular well, deep tubular well, dug well and spring, surface water, rainwater stored in cisterns and water truck. The enteric viruses Human Adenovirus (HAdV), Rotavirus (RV) and Enterovirus (EV) were used as indicators of fecal contamination, analyzed by qPCR. In all, 30% of the samples showed signs of fecal contamination. Detection rates were 20% for RV, 9.4% for HAdV and 4.4% for EV. The geometric means of concentration of these indicators were 1.5x106 GC/L, 1.9x106 GC/L and 7.1x105 GC/L, respectively. RV was the most prevalent viral indicator in underground sources, being statistically associated with shallow tubular wells. In spring samples, HAdV stands out with 11.8%. In the cistern samples, both HAdV and RV were found in the same prevalence. These results reveals that the analyzed population is vulnerable to waterborne diseases caused by enteric pathogens, serving to guide future decisions and improve daily water treatment practices in these communities. Outro

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates. Resumo O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.

RESUMO A concepção dos sistemas de drenagem de águas pluviais como separador absoluto é uma característica marcante na gestão das águas urbanas, no entanto não é o reflexo da realidade de tal sistema na maioria das cidades brasileiras, onde frequentemente esgotos e águas pluviais escoam pelos mesmos condutos. Diante disso, o objetivo do presente trabalho foi investigar as contribuições de contaminação fecal dos canais de drenagem afluentes ao Canal do Prado, pertencentes ao sistema de macrodrenagem de águas pluviais da cidade de Campina Grande, na Paraíba. Para a realização da pesquisa de campo, foram definidos sete pontos de monitoramento ao longo do canal e, como indicadores de contaminação fecal, coliformes termotolerantes, Escherichia coli e os ovos dos helmintos Ascaris lumbricoides, Taenia sp, Hymenolepis nana, Hymenolepis diminuta, Enterobius vermicularis, Ancilostomideo sp e Trichuris sp. Os resultados apontaram que ovos de Ascaris lumbricoides foram os que apresentaram maior frequência nos pontos de monitoramento, relacionados à maior descarga de esgotos sanitários. Tais descargas também foram verificadas por elevados valores médios de coliformes termotolerantes que atingiram até 1,6 x 107 UFC.100 mL-1, valor típico de esgoto sanitário. Escherichia coli ocorreu em mais de 90% das amostras coletadas em todos os pontos de monitoramento. ABSTRACT The design of rainwater drainage systems as an absolute separator is a significant feature in urban water management, however, this is not a reflection of the reality of such a system in most Brazilian cities, where sewage and rainwater often run along the same path. Therefore, the aim of this study was to investigate contributions of fecal contamination from tributary drainage channels to Canal do Prado, belonging to the urban macro-drainage system of rainwater in the city of Campina Grande, Paraíba State. For the fieldwork, seven monitoring points were set along the channel object of this study, determining thermotolerant coliforms, Escherichia coli, and helminth eggs of Ascaris lumbricoides, Taenia sp, Hymenolepis nana, Hymenolepis diminuta, Enterobius vermicularis, and Trichuris sp, as fecal contamination indicators. The results pointed out that eggs of Ascaris lumbricoides were those with the highest frequency in monitoring points, being this related to the increased discharge of sewage. Such discharges were also verified by high mean values of thermotolerant coliforms that reached up to 1.6 x 107 CFU.100 mL-1, typical value of domestic sewage. Escherichia coli was present in over 90% of all samples collected from monitoring points.

The microbiological safety of water is related to faecal contamination, and conventional biomarkers of water contamination for human consumption do not allow revealing what the source of faecal contamination is. The aim of the research is to find scientific evidence about alternative biomarkers that can identify the source of faecal contamination in water for human consumption. This is a qualitative and descriptive research, an integrative literature review. Biomarkers used were bacteria, viruses, protozoa and archaea, and 72.7% of the studies had samples from groundwater. Detection rates of Bacteriodales genetic markers specific to humans were higher than on animals in most studies, which were performed in groundwater. Archeal markers were more prevalent than Bacteriodales in the studied water bodies. The seasonal variability in the occurrence of fecal contamination biomarkers was identified in 60% of the studies that carried out this assessment. The sensitivity and specificity of species-specific markers may vary according to the region studied. It is suggested that the use of these markers should be combined with the monitoring of conventional fecal contamination biomarkers. It is perceived the need for further studies on the use of biomarkers to identify possible sources of human and / or animal contamination in water for human consumption, and the assess the risk and incidence of waterborne diseases in the studied places. La seguridad microbiológica del agua está relacionada con la contaminación fecal, y los biomarcadores convencionales de contaminación del agua para consumo humano, no revelan esa fuente de contaminación. El objetivo de la investigación es encontrar evidencia científica sobre biomarcadores alternativos que puedan identificar la fuente de contaminación fecal en el agua destinada al consumo humano. Ésta es una investigación cualitativa, descriptiva, una revisión integradora de la literatura. Los biomarcadores utilizados fueron bacterias, virus, protozoos y archeas, y el 72,7% de los estudios tenían muestras de aguas subterráneas. En la mayoría de los estudios las tasas de detección de marcadores genéticos de Bacteriodales específicos fueron más altas en humanos que en animales, destaca este hallazgo en aguas subterráneas. Los marcadores arqueológicos fueron más frecuentes que los Bacteriodales en los cuerpos de agua estudiados. En el 60% de los estudios que llevaron a cabo esta evaluación se identificó la variabilidad estacional en la aparición de biomarcadores de contaminación fecal La sensibilidad y la especificidad de los marcadores específicos de la especie pueden variar según la región estudiada. Se sugiere que el uso de estos marcadores se combine con el monitoreo de biomarcadores convencionales de contaminación fecal. Se ve la necesidad de que se realicen más investigaciones que utilicen biomarcadores que identifiquen posibles fuentes de contaminación humana y / o animal en el agua para consumo humano, y que evalúen el riesgo y la incidencia de enfermedades transmitidas por el agua en los lugares estudiados. A segurança microbiológica da água está relacionada à contaminação fecal, e os biomarcadores convencionais de contaminação da água para consumo humano não permitem revelar qual é a fonte de contaminação fecal. O objetivo da pesquisa é encontrar evidências científicas sobre biomarcadores alternativos que possam identificar a fonte de contaminação fecal na água destinada ao consumo humano. Trata-se de uma pesquisa qualitativa, descritiva, tipo revisão integrativa de literatura. Biomarcadores utilizados foram bactérias, vírus, protozoários e arqueas, e 72,7% dos estudos tiveram amostras provenientes de águas subterrâneas. Taxas de detecção de marcadores genéticos Bacteriodales específicos de humanos foram maiores do que de animais na maioria dos estudos, destaca-se este achado em águas subterrâneas. Marcadores arqueais foram mais prevalentes que Bacteriodales nos corpos de água estudados. A variabilidade sazonal da ocorrência dos biomarcadores de contaminação fecal foi identificada em 60% dos estudos que realizaram essa avaliação. A sensibilidade e a especificidade dos marcadores espécie-específicos podem variar de acordo com a região estudada. Sugere-se que o uso desses marcadores deve ser combinado ao monitoramento de biomarcadores de contaminação fecal convencionais. Percebe-se a necessidade de mais pesquisas que utilizem biomarcadores que identifiquem possíveis fontes de contaminação humana e/ou animal na água de consumo humano, e que avaliem risco e incidência de doenças de veiculação hídrica nos locais estudados.

A segurança microbiológica da água está relacionada à contaminação fecal, e os biomarcadores convencionais de contaminação da água para consumo humano não permitem revelar qual é a fonte de contaminação fecal. O objetivo da pesquisa é encontrar evidências científicas sobre biomarcadores alternativos que possam identificar a fonte de contaminação fecal na água destinada ao consumo humano. Trata-se de uma pesquisa qualitativa, descritiva, tipo revisão integrativa de literatura. Biomarcadores utilizados foram bactérias, vírus, protozoários e arqueas, e 72,7% dos estudos tiveram amostras provenientes de águas subterrâneas. Taxas de detecção de marcadores genéticos Bacteriodales específicos de humanos foram maiores do que de animais na maioria dos estudos, destaca-se este achado em águas subterrâneas. Marcadores arqueais foram mais prevalentes que Bacteriodales nos corpos de água estudados. A variabilidade sazonal da ocorrência dos biomarcadores de contaminação fecal foi identificada em 60% dos estudos que realizaram essa avaliação. A sensibilidade e a especificidade dos marcadores espécie-específicos podem variar de acordo com a região estudada. Sugere-se que o uso desses marcadores deve ser combinado ao monitoramento de biomarcadores de contaminação fecal convencionais. Percebe-se a necessidade de mais pesquisas que utilizem biomarcadores que identifiquem possíveis fontes de contaminação humana e/ou animal na água de consumo humano, e que avaliem risco e incidência de doenças de veiculação hídrica nos locais estudados.

Carvalho V.A., Cardoso Filho F.C., Rios F.P.B., Lima C.E., Muratori M.C.S. & Keller K.M. [Coliforms and Salmonella spp. in ground meat comercialized at Teresina, PI.] Coliformes e Salmonella spp. em carne moída comercializada em Teresina, PI. Revista Brasileira de Medicina Veterinária, 33(1):32-36. 2011. Departamento de Morfofisiologia Veterinária, Universidade Federal do Piauí, Campus Universitário Ministro Petrônio Portella, Teresina, 64049-550, PI, Brasil. E-mail: chrismuratori@uol.com.br The ground meat stands out among the meat products because it is well accepted by the consumers, for its convenience and affordability. The grind of the meat may favor the contamination and the multiplication of a greater quantity of microorganisms, due to the increased of the contact surface, being the food most exposed to contamination. This study investigated the hygienic and sanitary conditions in ground meat sold in Teresina, PI. To analyze the quality of ground meat, 30 samples were collected from six shops located in different geographical areas of Teresina city, PI. The method used was of the most probable number (MPN) for coliforms at 35 and 45o C and the research of Salmonella spp. There were variations among markets for coliforms enumeration at 35ºC. It was checked that all samples were contaminated with coliforms at 35o C, with values ranging from 1.36 to 3.38 MPN/ g in log10 (x+1). The sampling places “B” and “F” had the lowest level of contamination. The six shops studied did not differ in coliforms at 45ºC. It was observed that 93% of ground meat samples were contaminated by these bacteria, ranging from 0.30 to 3.08 MPN / g in log10 (x+1). In just one settlement was possible to isolate Salmonella spp. from one (20.0%) sample among five collected in the sampling place “B”, representing a danger to the public health. The hygienic and sanitary conditions of ground beef sold in Teresina are variable, it is possible to isolate coliforms at 35o C and 45o C and Salmonella spp., A carne moída destaca-se entre os produtos cárneos, por ser bem aceita pelo consumidor, devido sua praticidade e por apresentar preços acessíveis. A moagem da carne pode favorecer a contaminação e a multiplicação de uma maior quantidade de microrganismos, devido ao aumento da superfície de contato, ficando o alimento mais exposto à contaminação. Este trabalho verificou as condições higiênico-sanitárias em carne moída comercializada em Teresina, PI. Para analisar a qualidade da carne moída, foram coletadas 30 amostras provenientes de seis estabelecimentos comerciais localizados em diferentes zonas geográficas da cidade de Teresina, PI. Foi utilizado o método do número mais prová- vel (NMP) para coliformes a 35o e a 45o C e pesquisa delho verificou as condições higiênico-sanitárias em carne moída comercializada em Teresina, PI. Para analisar a qualidade da carne moída, foram coletadas 30 amostras provenientes de seis estabelecimentos comerciais localizados em diferentes zonas geográficas da cidade de Teresina, PI. Foi utilizado o método do número mais prová- vel (NMP) para coliformes a 35o e a 45o C e pesquisa deSalmonella spp. Houve variações entre mercados para enumeração de coliformes a 35 o C. Pode-se verificar que todas as amostras estavam contaminadas com coliformes a 35o C, com valores que variaram entre 1,36 a 3,38NMP/ g em log10 (x+1). Os locais de coleta “B” e “F” apresentaram os menores índices de contaminação. Os seis estabelecimentos estudados não diferiram quanto aos coliformes a 45o C. Foi possível observar que 93 % das amostras de carne moída apresentaram contaminação destas bactérias, com variação entre 0,30 a 3,08 NMP/ g em log10 (x+1). Em apenas um estabelecimento foi possí- vel isolar Salmonella spp., em uma (20,0%) amostra das cinco coletadas no local de coleta “B”, representando um perigo à saúde pública. As condições higiênico-sanitárias da carne moída comercializada em Teresina são variá- veis, sendo possível isolar coliformes a 35 ºC e a 45 °C e Salmonella spp.

O meio rural carece de serviços de saneamento básico. Assim, frequentemente, as instalações de obtenção de água e de disposição de esgoto ficam sob iniciativa de cada morador, os quais podem não contar com o recurso financeiro e o conhecimento técnico para construí-las e mantê-las funcionando adequadamente. Dessa forma, a água para consumo humano fica sujeita à contaminação fecal e, consequentemente, à presença de patógenos de veiculação hídrica, como os vírus entéricos. O objetivo desse trabalho foi avaliar a contaminação fecal de amostras de água proveniente de fontes individuais utilizadas para o abastecimento domiciliar em áreas rurais do Estado de Goiás. As amostras foram coletadas de 86 residências, distribuídas em 15 comunidades, cujas fontes de água eram poços tubulares, poços escavados, nascentes, mananciais superficiais e água da chuva. Utilizou-se como indicadores de contaminação fecal a bactéria Escherichia coli (EC), analisada pelo método do substrato cromogênico definido, e os vírus entéricos adenovírus humano (HAdV) e enterovírus (EV), analisados por qPCR. Observou-se que 90,7% das amostras apresentaram indicativo de contaminação fecal. As taxas de detecção foram 74,4% para EC, 57% para HAdV e 9,3% para EV. As médias de concentração desses indicadores foram, respectivamente, 8,34 x 101 NMP/100mL, 8,6 x 105 CG/L e 9,75 x 105 CG/L. O indicador EC foi o mais prevalente em amostras de água subterrânea e superficial. O indicador HAdV foi significativamente mais detectado em amostras de águas subterrâneas em relação as de águas superficiais e foi mais eficiente em indicar contaminação em poços tubulares. Em amostras de cisternas, os indicadores virais foram os mais prevalentes. Não foi observada associação de frequências nem correlação de concentrações entre EC e HAdV. HAdV indicou contaminação fecal humana e teve bom desempenho como indicador complementar. Esses resultados revelam que a população analisada está vulnerável a doenças de veiculação hídrica causadas por patógenos entéricos. The rural environment lacks basic sanitation services. Thus, the water supply and sewage disposal facilities are often under the initiative of each resident, who may not have the financial resources and technical knowledge to build and keep them functioning properly. Thus, water for human consumption is subject to fecal contamination and, consequently, to the presence of waterborne pathogens, such as enteric viruses. The objective of this work was to evaluate the fecal contamination of water samples from individual sources used for household supply in rural areas of the State of Goiás. The samples were collected from 86 homes, distributed in 15 communities, whose water sources were tubular wells, dug wells, springs, surface waters and rainwater. Escherichia coli (EC) bacteria, analyzed by the defined chromogenic substrate method, and the enteric virus human adenovirus (HAdV) and enterovirus (EV), analyzed by qPCR, were used as fecal contamination indicators. It was observed that 90.7% of the samples showed indications of fecal contamination. Detection rates were 74.4% for EC, 57% for HAdV and 9.3% for EV. The concentration averages of these indicators were, respectively, 8.34 x 101 NMP / 100mL, 8.6 x 105 CG / L and 9.75 x 105 CG / L. The EC indicator was the most prevalent in ground and surface water samples. The HAdV indicator was significantly more detected in groundwater samples than in surface water and was more efficient in indicating contamination in tubular wells. In cistern samples, viral indicators were the most prevalent. There was no association of frequencies or correlation of concentrations between EC and HAdV. HAdV indicated human fecal contamination and performed well as a complementary indicator. These results reveal that the analyzed population is vulnerable to waterborne diseases caused by enteric pathogens. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

The use of water treatment plant sludge to restore degraded soils is customary agricultural practice, but it could be dangerous from the point of view of both health and the environment. A transient increase of either pathogenic or indicator microbial populations, whose persistence in time is variable and attributed to the characteristics of the soil (types of materials in the soil), any amendments (origin and treatments it has undergone) or the weather (humidity and temperature mainly), has often been detected in soils treated with this kind of waste. Given their origin, water treatment plant sludges could lead to the transmission of a) pathogens and b) antibiotic-resistant microorganisms to human beings through the food chain and cause the spreading of antibiotic resistances as a result of their increase and persistence in the soil for variable periods of time. However, Spanish legislation regulating the use of sludges in the farming industry is based on a very restricted microbiological criterion. Thus, we believe better parameters should be established to appropriately inform of the state of health of soils treated with water treatment plant sludge, including aspects which are not presently assessed such as antibiotic resistance. La aplicación de lodos de depuradora es una práctica habitual en agricultura como método de recuperación de suelos degradados que podría no estar exenta de peligrosidad cuando se evalúa desde los puntos de vista ambiental y sanitario. Habitualmente se ha detectado en el suelo tratado con estos residuos un incremento transitorio de las poblaciones microbianas bien patógenas, bien indicadoras, cuya persistencia en el tiempo es variable y atribuida a las características del suelo (tipo de materiales en el suelo), de las enmiendas (origen y tratamiento que han sufrido) o el clima (principalmente humedad y temperatura). Los lodos de depuradora, por su origen, podrían producir la transferencia al ser humano a través de la cadena tró ca de 1) microorganismos patógenos y 2) microorganismos resistentes a antibióticos y producir la diseminación de resistencias a antibióticos, por el incremento y mantenimiento de estos en el suelo por periodos variables de tiempo. Sin embargo, la legislación española que regula la aplicación de lodos en el sector agrario ha optado por un criterio microbiológico muy limitado. Por ello, estimamos que se deberían establecer mejores parámetros que informen apropiadamente del estado sanitario de los suelos tratados con lodos de depuradora que incluyeran, además, aspectos que actualmente no se evalúan como la resistencia a antibióticos. A aplicação de lamas de estações de tratamento de águas residuais é uma prática habitual na agricultura como método de recuperação de solos degradados que pode não estar isenta de perigos quando avaliada dos pontos de vista ambiental e sanitário. Habitualmente tem-se detetado no solo tratado com este tipo de resíduos um incremento transitório das populações microbianas quer patogénicas, quer indicadoras, cuja persistência no tempo é variável e atribuída às características do solo (tipo de materiais no solo), das correções (origem e tratamento aplicado) ou o clima (principalmente a humidade e a temperatura). As lamas das estações de tratamento, pela sua origem, poderiam proporcionar a transferência para o ser humano através da cadeia alimentar de 1) microrganismo patogénicos e 2) microrganismos resistentes a antibióticos e produzir a disseminação de resistências a antibióticos, pelo aumento e manutenção destes no solo por períodos de tempo variáveis. Contudo, a legislação espanhola que regula a aplicação de lamas no setor agrário optou por um critério microbiológico muito limitado. Por essa razão, consideramos que se deveriam estabelecer melhores parâmetros que informem devidamente sobre o estado sanitário dos solos tratados com lamas e que incluam também aspetos que atualmente não se avaliam como a resistência a antibióticos.

RESUMO Foi avaliada a qualidade sanitária e físico-química das águas utilizadas na irrigação de hortaliças em cinco hortas localizadas em dois municípios paraibanos. As águas de irrigação apresentaram elevada contaminação fecal (CF: 104 UFC 100 mL-1) infectando os vegetais; esta contaminação teve como origem as descargas de esgotos domésticos nos córregos e açudes utilizados na irrigação, resultando no reúso indireto de esgotos na agricultura. As alfaces (Lactuca sativa L.) irrigadas com tais águas apresentaram concentrações de coliformes fecais entre 1,0 x 103 e 1,6 x 106 e de E. coli entre 2,5 x 102 e 2,5 x 104 NMP g-1, indicando riscos para a saúde dos consumidores, porém as alfaces provenientes dos mercados públicos apresentaram carga fecal entre 7,5 x 103 e 3,8 x 104 NMP g-1, não havendo diferenças significativas com aquelas das hortas. A elevada carga fecal do adubo orgânico de origem animal (valor médio entre 1,3 x 105 e 2,6 x 106 NMP g-1) comumente utilizada nas hortas também contribuiu na contaminação das alfaces. Do ponto de vista físico-químico, as águas de irrigação continham apreciáveis concentrações de sais, porém não apresentaram altos risco de salinização ou de sodificação do solo. ABSTRACT The sanitary and physico-chemical quality of water used in the irrigation of vegetable crops was evaluated in 5 farms in 2 municipalities of the State of Paraíba, Brazil. The irrigation water presented high fecal load (FC: 104 CFU 100 mL-1) contaminating the vegetables. The contamination occurred due to the fact that domestic sewage is discharged into the water streams, resulting in indirect reuse of wastewater in the agriculture. Lettuce (Lactuca sativa L.) irrigated with such waters showed high levels of fecal contamination (FC: 1,0 x 103 and 1.6 x 106 MPN g-1 and E. coli: 2.5 x 102 and 2.5 x 104 MPN g-1), exposing the consumers of these vegetables to health hazards, however the lettuce in the public markets presented fecal coliformes between 7,5 x 103 and 3,8 x 104 MPN g-1 and there were no significant differences with that of vegetable gardens. The high levels of fecal coliformes in the organic manure (mean value between 1.3 x 105 and 2.6 x 106 MPN g-1 ) used in cultivation also contributed towards contamination of lettuce. Although the waters contained considerable concentrations of salts they did not present high risks of salinization or sodification of the soil.

Este trabalho teve como objetivos comparar diferentes procedimentos de preparo de carcaças de frango para análises microbiológicas; mapear os micro-organismos presentes nas principais etapas do abate de frangos; avaliar as implicações microbiológicas da contaminação fecal em carcaças de frango, procedimentos para a sua remoção, bem como comparar quatro técnicas para identificar tipos de Salmonella. Na avaliação dos procedimentos oficiais do Brasil, da União Europeia e dos EUA para análise de Salmonella, foi constatado que os mesmos são equivalentes para detectar a presença da bactéria em carcaças de frango. Por outro lado, o procedimento dos EUA permitiu encontrar maiores quantidades de E. coli, coliformes totais e Enterobacteriaceae, mas foi equivalente aos demais procedimentos para a análise de aeróbios mesófilos. O mapeamento das etapas críticas de abate demonstrou que Campylobacter jejuni, C. coli e C. lari não foram encontrados em nenhuma das amostras analisadas e Salmonella foi detectada em etapas aleatórias do processo de abate. A etapa de escaldagem reduziu a contaminação das carcaças com Salmonella e o resfriamento aumentou a positividade. A presença de Salmonella nas granjas, antes do abate, não teve relação com sua presença no intestino e nas carcaças dos animais durante o abate, mesmo em carcaças contaminadas por fezes. Por outro lado, a prevalência de Campylobacter em carcaças contendo fezes foi elevada e associada com contaminações nas granjas e no intestino dos animais. A lavagem das carcaças com água potável para remover a contaminação fecal foi eficiente para diminuir os níveis de micro-organismos indicadores de qualidade e higiene e é um procedimento alternativo ao refile das partes contaminadas. A comparação das técnicas para identificar os sorotipos de Salmonella demonstrou que a bioquímica em sistema VITEK 2TM apresentou bom desempenho para identificar apenas S. Enteritidis. A técnica de ribotipagem apresentou 100% de correlação com a técnica sorológica e apresentou o melhor poder discriminatório para identificar e diferenciar sorotipos de Salmonella. A técnica de espectrometria de massas identificou os sorotipos apenas em nível de gênero e mais estudos precisam ser feitos para melhorar a aplicação desta técnica na identificação de tipos de Salmonella. The aims of this work were to compare different sampling protocols to detect Salmonella and to enumerate quality and hygiene indicator microorganisms in broiler carcasses based on recommendations by legislations in Brazil, European Union and USA, to map the microorganisms present in the main stages of poultry slaughtering, to evaluate the microbiological implications of fecal contamination in poultry carcasses and procedures for removal of this contamination and to compare four techniques for Salmonella identification. In the evaluation of the official procedures from Brazil, European Union and USA the three protocols were equivalent in the detection of Salmonella in broiler carcasses. However, the USA protocol found larger amounts of E. coli, total coliforms, and Enterobacteriaceae than the others but similar counts of aerobic mesophilic. The mapping of the critical stages of slaughter showed that Campylobacter jejuni, C. coli and C. lari were not found in any samples analyzed but Salmonella was detected in random phases of the slaughter process. Scalding reduced contamination of carcasses and cooling in water increased positivity. The presence of Salmonella on farms before slaughter was not related with its presence in the intestine of animals and in the carcasses during slaughter, even in samples contaminated by feces. On the other hand, the prevalence of Campylobacter in carcasses with fecal contamination was high and it was associated with its contamination on the farms and in the intestines of the birds. Washing with water to remove fecal contamination on the carcasses was efficient and decreased the levels of microorganisms indicators of quality and hygiene when compared with trimming. The comparison of techniques to identify the types of Salmonella showed that biochemical VITEK 2TM was efficient to identify S. Enteritidis, but not the other types of Salmonella when compared with serological ones. Ribotyping showed 100% correlation with the serological technique and had the best discriminatory power to identify and differentiate Salmonella isolates. Mass spectrometry identified the isolates only at genus levels and more studies need to be done to improve the application of this technique proves to identify types of Salmonella.

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-07T14:47:29Z No. of bitstreams: 3 Pre textuais Introducao Pt 1 e Pt 2 A.pdf: 3304615 bytes, checksum: 878371786751317cce097169dba444d3 (MD5) Pt 2 B e Pt 3.pdf: 2341953 bytes, checksum: bf1fd1aab580a32213b8372d9abe0f66 (MD5) Pt 4 e Pt final.pdf: 2024818 bytes, checksum: f7b1ee7b1573ee2ecf4314ada92be5f1 (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-07T14:47:29Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Pre textuais Introducao Pt 1 e Pt 2 A.pdf: 3304615 bytes, checksum: 878371786751317cce097169dba444d3 (MD5) Pt 2 B e Pt 3.pdf: 2341953 bytes, checksum: bf1fd1aab580a32213b8372d9abe0f66 (MD5) Pt 4 e Pt final.pdf: 2024818 bytes, checksum: f7b1ee7b1573ee2ecf4314ada92be5f1 (MD5) Previous issue date: 2010-03-23 Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro This thesis presents a study on the accumulation of organic matter in the sediments of the complex estuarine lagoon Mundaú Manguaba (CELMM) using lipids (fatty acids, sterols and linear alcohols) as molecular markers to evaluate the sources (natural and anthropogenic) and spatial and temporal variation in the composition of sedimentary organic matter, as well as the influence of diagenetic processes on the quality and preservation of it. The CELMM is characterized by a high potential for recycling and storage of materials and is subject to various anthropogenic activities, including urbanization and practice of monoculture of cane sugar, in addition to suffering an accelerated process of environmental degradation. By multivariate analysis was possible to discern sources of lipids, and from this, identify the contributions of organic matter - plankton (phytoplankton and zooplankton), terrigenous and bacterial - for different sectors CELMM. It was possible to identify an increase in the accumulation of organic matter of autochthonous origin in the lagoons in recent years. This effect was more significant in Mundaú, reflecting the higher level of anthropogenic disturbance at the pool. The level of fecal contamination - assessed through fecal sterols - may be considered medium to low compared with other sites that also have significant human influence. The diagenetic transformation of organic matter as measured by the reasons stanol / sterol, showed that bacterial activity in CELMM is significant even in the water column or sediment-water interface, but that after the burial of organic matter is preserved. Essa dissertação apresenta um estudo sobre o acúmulo de matéria orgânica nos sedimentos do complexo estuarino lagunar Mundaú Manguaba (CELMM) utilizando lipídios (ácidos graxos, esteróis e alcoóis lineares) como marcadores moleculares , com o objetivo de avaliar as fontes (naturais e antrópicas) e a variação espacial e temporal na composição da matéria orgânica sedimentar, assim como a influência dos processos diagenéticos sobre a qualidade e a preservação da mesma. O CELMM é caracterizado por um alto potencial de reciclagem e retenção de materiais e está sujeito a diversas atividades antropogênicas, incluindo a urbanização e as práticas de monocultura de cana-de-açúcar, além de sofrer um processo acelerado de degradação ambiental. Através de análise estatística multivariada foi possível discenir as fontes dos lipídios e, a partir disto, identificar as contribuições de matéria orgânica planctônica (fitoplâncton e zooplâcton), terrígena e bacteriana para os diferentes compartimentos do CELMM. Foi possível identificar um incremento no acúmulo de matéria orgânica de origem autóctona nas lagoas nos últimos anos. Este efeito foi mais significativo em Mundaú, reflexo do maior nível de alteração antrópica nessa lagoa. O nível de contaminação fecal avaliado através de esteróis fecais pode ser considerado de médio a baixo, quando comparados com outros locais que também apresentam influência antrópica significativa. A transformação diagenética da matéria orgânica, avaliada através das razões estanol/esterol, mostrou que a atividade bacteriana no CELMM é significativa ainda na coluna d água ou na interface água-sedimento, mas que após o soterramento a matéria orgânica fica preservada.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:35:34Z : No. of bitstreams: 1 pinto_fr_me_jabo.pdf: 471521 bytes, checksum: 29f86a542fac384caf6026a29762bf8a (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Realizou-se o presente estudo objetivando-se conhecer a dinâmica da contaminação fecal e uso do cloro na desinfecção da água oferecida a bezerras em propriedade leiteira, pela determinação do número mais provável - NMP de enterococos e Escherichia coli, do número de microrganismos mesófilos, concentração de cloro, pH e temperatura. O manejo das bezerras era realizado em locais coberto e não coberto. Cada manejo utilizou dez bebedouros: cinco com água não clorada e cinco com clorada. No local não coberto a água sofria uma troca diária, estando 24 horas à disposição das bezerras, e era amostrada após sua colocação (T0), após 17 horas (T1) e 24 horas (T2). No local coberto ocorriam duas trocas diárias da água, estando 17 horas, na 1ª troca e 7 horas na 2ª troca à disposição das bezerras e as colheitas eram feitas após a colocação da água na 1ª troca (T0), após 17 horas (T1), após a colocação na 2ª troca (T0) e após 7 horas (T1). Na estação de chuva realizaram-se três amostragens com cinco repetições cada, na seca, três amostragens, as duas primeiras com cinco repetições e a última com três. A cloração reduziu significativamente os NMP de enterococos e E. coli e os números de microrganismos mesófilos em todas amostras de águas cloradas. O melhor manejo da água de consumo das bezerras foi em local coberto, com cloração (5,0 mg.L-1) e troca da água três vezes ao dia. The objective of the study was to evaluate fecal contamination dynamic and use of chlorine on the disinfection of the offered water for calves in a dairy farm, through the most probably number determination (MPN) of enterococcus, Escherichia coli and determination of the mesophilic microorganisms, chlorine demand, pH and temperature. The calves management was at no covered and covered place. Ten watering though, five with chlorinated water and five with no chlorinated water were used in each one of the managements. At the no covered place, water was changed once a day, staying for 24 hours for calves use. Water was assessment immediately after water place (T0), after 17 hours (T1) and after 24 hours (T2). At the covered place, water was changed twice a day, staying for 17 hours (first water change) and for 7 hours (second water change) for calves use. Water was assessment immediately after water place of first water change (T0), after 17 hours (T1), immediately after water place of second water change (T0) and after 7 hours (T1). In rain season were analyzed three water sample with five repetitions each one. In dry season were analyzed three water sample (first and second with five repetitions and third with three repetitions). Water chlorination decreases the MPN of the enterococcus and E. coli and number of mesophilic microorganisms in all chlorination water samples. The best management to calves drinking water in dairy farm to guarantee water s quality is the management at covered place, with chlorination (5,0 mg.L-1) and three time water change a day.

A Agência Ambiental de Inglaterra e País de Gales assegurou o financiamento EU INTERREG IIIB de um projecto denominado ‘ICREW’ – Melhorar as Águas Costeiras e Recreativas. Pretendia-se com o projecto ajudar cinco estados-membro da UE – Reino Unido, Irlanda, França, Portugal e Espanha – a melhorar a qualidade das referidas águas e preparar a implementação de nova legislação da UE respeitante às mesmas. O projecto ICREW foi avaliado em aproximadamente €8m. e era composto por sete projectos, ou “acções piloto”. O projecto ICREW decorreu entre Abril de 2003 e Abril 2006. Uma dessas acções piloto, Acção Piloto 3, que envolvia parceiros da Irlanda, França, Portugal e RU, abordou o tema do rastreamento da fonte microbial da poluição fecal, do ponto de vista regulamentar. O seu objectivo foi “gerar uma ferramenta de trabalho que pode ser usada para distinguir as fontes de poluição que contribuem para uma amostra ambiental”. INTERREG IIIB

A study on the distribution patterns of enteropathogenic bacteria polluting the shoreline in Natal, Rio Grande do Norte, Brazil, was carried out based on 72 samples obtained from three storm sewers and adjoining beach locations, Praia do Meio (PM), Areia Preta (AP) and Ponta Negra (PN). From each location, 12 water samples were taken and analyzed for fecal coliforms (FC) and Escherichia coli. In AP, two (16.7%) of the seawater samples and five (41.7%) of the storm sewer samples yielded values above 1.1 × 10(7) FC/100 ml, whereas only one (8.3%) of the samples from PM reached this level. There was no correlation (p > 0.05) between rainfall indeces and FC values. A total of 64 E. coli isolates were obtained: 37 from the storm sewer samples and 27 from the seawater samples. Of these isolates, four (O143, two O112ac, and O124) were enteroinvasive and two (O111 and O125) were enteropathogenic. Resistance to antibiotics and to heavy metals was also analyzed. Almost 36% of the E. coli strains isolated were resistant to more than one antibiotic. All strains were resistant to zinc and copper at the highest concentration tested (250 µg/ml), and several (23.4%) were resistant to mercury at 50 µg/ml. Our results agreed with previous reports that antibiotic resistance is commonly associated with heavy-metal resistance in pathogens. Se realizó un estudio sobre la distribución de las bacterias enteropatógenas que contaminan la costa en Natal (Rio Grande do Norte, Brasil), a partir de 72 muestras obtenidas en tres colectores pluviales (storm sewers) y en unas playas adyacentes a los mismos, Praia do Meio (PM), Areia Preta (AP) y Ponta Negra (PN). En cada punto se tomaron 12 muestras, que se analizaron en busca de coliformes fecales (CF) y de Escherichia coli. En AP, dos (16,7%) de las muestras de agua de mar y cinco (41,7%) de las de agua del colector dieron valores superiores a 1,1 × 10(7) CF/100 ml, mientras que sólo una (8,3%) de las muestras de PM alcanzó este nivel. No se encontró correlación (p > 0,05) entre los índices de pluviosidad y los valores de CF. Se obtuvo un total de 64 aislados de E. coli: 37 a partir de muestras de colectores y 27 a partir de muestras de agua de mar. De estos aislados, cuatro (un O143, dos O112ac y un O124) eran enteroinvasivos y dos (O111 y O125) eran enteropatógenos. Se analizó también la resistencia a antibióticos y a metales pesados. Casi el 36% de las cepas de E. coli aisladas eran resistentes a más de un antibiótico. Todas las cepas eran resistentes al zinc y al cobre a la mayor concentración probada (250 µg/ml), y varias cepas (23.4%) eran resistentes al mercurio a 50 µg/ml. Nuestros resultados coinciden con trabajos anteriores que indican que en bacterias patógenas la resistencia a antibióticos suele ir asociada a la resistencia a metales pesados. Foi realizado um estudo sobre a distribuição de bactérias enteropatogênicas que contaminam a costa de Natal (Rio Grande do Norte, Brasil) a partir de 72 amostras obtidas em três galerias pluviais (storm sewers) e nas praias adjacentes às mesmas: Praia do Meio (PM), Areia Preta(AP) e Ponta Negra (PN). Em cada ponto foram tomadas 12 amostras nas quais foram investigadas a presença de coliformes fecais (CF) e Escherichia coli. Na AP duas (16,7%) das amostras de água do mar e cinco (41,7%) das águas das galerias apresentaram valores superiores a 1,1 × 10(7) CF/100 ml enquanto somente uma (8,3%) das amostras da PM alcançou este nível. Não foi encontrada correlação (p > 0,05) entre os índices pluviométricos e os valores de CF. Obteve-se um total de 64 isolados de E. coli: 37 a partir de amostras das galerias e 27 a partir de amostras de água do mar. Destes isolados, quatro (um O143, dois O112ac e um O124) eram enteroinvasivos e dois (O111 e O125) eram enteropatógenos. Foi analisada também a resistência a antibióticos e a metais pesados. Quase 36% das cepas de E. coli isoladas eram resistentes a mais de um antibiótico. Todas as cepas eram resistentes a zinco e a cobre na maior concentração testada (250 µg/ml), e várias cepas (23.4%) eram resistentes a mercúrio (50 µg/ml). Os resultados coincidem com trabalhos anteriores que indicam que em bactérias patógenas a resistência a antibióticos está associada à resistência a metais pesados.

E. coli, coliformes, enterococos intestinais, estas bactérias foram durante décadas a luz do sol na luta contra a propagação de doenças transmissíveis por águas de consumo e recreativas. A sua presença em massas de água correlaciona-se diretamente com a doença humana. No entanto, essa correlação não é total. Há uma percentagem de casos em que a sua presença não tem implicações na saúde humana. Como resolver estes casos, de forma a identificar as fontes de contaminação fecal? A Biotecnologia respondeu a esta questão. O genoma das Bacteroides spp., bactérias pertencentes à flora intestinal de animais de sangues quentes e dificeis de cultivar em laboratório, apresentam pequenas variações de acordo com espécies que colonizam, indicando assim se a presença do seu material genético numa água é de origem humana, bovina, canídea, suína ou avícola, por exemplo. A sua pesquisa para determinar fontes de contaminação fecal em massas de água denomina-se de Microbial Source Tracking. Este método não veio substituir a utilização das bactérias intestinais tradicionais, que são indicadores simples e eficientes, mas veio dar resposta à procura das fontes biológicas de uma contaminação fecal. E. coli, coliforms, intestinal enterococci, these bacteria have been for decades the sunshine of the struggle against the propagation of waterborne diseases. Its presence in water bodies correlates directly with human disease. Yet, this correlation is not complete; there is a percentage of presence that has no implications in human health. How can these cases be resolved in such a way that the sources of faecal contamination be identified? Biotechnology answered this question. The genome of Bacteroides spp., which are bacteria that belong to the intestinal flora of warm-blooded animals, hardly cultivable in laboratory, vary according to the animal species which they colonise. Due to this characteristic, the presence of its genetic material in water may be tracked to have originated, for example, in humans, bovines, canines, swine or fowl. The determination of sources of faecal contamination in water bodies is named “Microbial Source Tracking”. It does not replace the traditional use of intestinal bacteria, which are simple and efficient indicators, but it does respond to the search for biological sources of fecal contamination. info:eu-repo/semantics/publishedVersion