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22 results on '"Valentin Partula"'

1. A comprehensive assessment of demographic, environmental, and host genetic associations with gut microbiome diversity in healthy individuals

Author: Petar Scepanovic, Flavia Hodel, Stanislas Mondot, Valentin Partula, Allyson Byrd, Christian Hammer, Cécile Alanio, Jacob Bergstedt, Etienne Patin, Mathilde Touvier, Olivier Lantz, Matthew L. Albert, Darragh Duffy, Lluis Quintana-Murci, Jacques Fellay, and The Milieu Intérieur Consortium
Subjects: Microbiome, Gut, Human, Genomics, 16S rRNA gene sequencing, GWAS, Microbial ecology, QR100-130
Abstract: Abstract Background The gut microbiome is an important determinant of human health. Its composition has been shown to be influenced by multiple environmental factors and likely by host genetic variation. In the framework of the Milieu Intérieur Consortium, a total of 1000 healthy individuals of western European ancestry, with a 1:1 sex ratio and evenly stratified across five decades of life (age 20–69), were recruited. We generated 16S ribosomal RNA profiles from stool samples for 858 participants. We investigated genetic and non-genetic factors that contribute to individual differences in fecal microbiome composition. Results Among 110 demographic, clinical, and environmental factors, 11 were identified as significantly correlated with α-diversity, ß-diversity, or abundance of specific microbial communities in multivariable models. Age and blood alanine aminotransferase levels showed the strongest associations with microbiome diversity. In total, all non-genetic factors explained 16.4% of the variance. We then searched for associations between > 5 million single nucleotide polymorphisms and the same indicators of fecal microbiome diversity, including the significant non-genetic factors as covariates. No genome-wide significant associations were identified after correction for multiple testing. A small fraction of previously reported associations between human genetic variants and specific taxa could be replicated in our cohort, while no replication was observed for any of the diversity metrics. Conclusion In a well-characterized cohort of healthy individuals, we identified several non-genetic variables associated with fecal microbiome diversity. In contrast, host genetics only had a negligible influence. Demographic and environmental factors are thus the main contributors to fecal microbiome composition in healthy individuals. Trial registration ClinicalTrials.gov identifier NCT01699893
Published: 2019
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2. Associations between consumption of dietary fibers and the risk of cardiovascular diseases, cancers, type 2 diabetes, and mortality in the prospective NutriNet-Santé cohort

Author: Elisa Desmetz, Lluis Quintana-Murci, Mathilde Touvier, Léopold Fezeu, Serge Hercberg, Nathalie Druesne-Pecollo, Chantal Julia, Darragh Duffy, Pilar Galan, Mélanie Deschasaux, Paule Latino-Martel, Valentin Partula, Olivier Lantz, Bernard Srour, Stanislas Mondot, Emmanuelle Kesse-Guyot, Eloi Chazelas, Matthew L. Albert, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Immunité et cancer (U932), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC1428 IGR-CURIE, Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chaire Génomique humaine et évolution, Collège de France (CdF (institution)), Department of Immunology and Infectious Diseases, Insitro [San Francisco], Immunobiologie des Cellules dendritiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), NutriNet-Santé study was supported by the following French public institutions: Ministère de la Santé, Santé Publique France, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Conservatoire National des Arts et Métiers (CNAM) and Université Paris-XIII Nord. The Milieu Intérieur Consortium was supported by French Government’s Investissement d’Avenir Program, Laboratoire d’Excellence 'Milieu Intérieur' Grant ANR-10-LABX-69-01. Valentin Partula was funded by Ph.D. a grant from the Labex Milieu Interieur, and is provided financial support from École doctorale 474 Frontières de l’Innovation en Recherche et Education – Programme Bettencourt., Milieu intérieur, ANR-10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE(2010), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège de France - Chaire Génomique humaine et évolution, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Paris (UP), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris]
Subjects: Adult, Dietary Fiber, Male, medicine.medical_specialty, Colorectal cancer, prospective cohort, Medicine (miscellaneous), 030209 endocrinology & metabolism, Type 2 diabetes, dietary fibers, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Breast cancer, Neoplasms, Internal medicine, Vegetables, cancers, medicine, Humans, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, 2. Zero hunger, Nutrition and Dietetics, Proportional hazards model, business.industry, Public health, Cancer, Middle Aged, medicine.disease, mortality, cardiovascular diseases, 3. Good health, Diabetes Mellitus, Type 2, Fruit, Cohort, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Female, type 2 diabetes, business
Abstract: BACKGROUND Mounting evidence, yet with varying levels of proof, suggests that dietary fibers (DFs) may exert a protective role against various chronic diseases, but this might depend on the DF type and source. OBJECTIVES Our objectives were to assess the associations between the intake of DFs of different types [total (TDF), soluble (SF), insoluble (IF)] and from different sources (fruits, vegetables, whole grains, legumes, potatoes and tubers) and the risk of cardiovascular diseases (CVDs), cancer, type 2 diabetes (T2D), and mortality in the large-scale NutriNet-Sante prospective cohort (2009-2019). METHODS Overall, 107,377 participants were included. Usual DF intake was estimated from validated repeated 24-h dietary records over the first 2 y following inclusion in the cohort. Associations between sex-specific quintiles of DF intake and the risk of chronic diseases and mortality were assessed using multiadjusted Cox proportional hazards models. RESULTS T2D risk was inversely associated with TDFs [HR for quintile 5 compared with quintile 1: 0.59 (95% CI: 0.42, 0.82), P-trend
Published: 2020
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3. Plasma Metabolomic Signatures Associated with Long-term Breast Cancer Risk in the SU.VI.MAX Prospective Cohort

Author: Mélanie Pétéra, Lucie Lécuyer, Aicha Demidem, Stéphanie Durand, Delphine Centeno, Nathalie Druesne-Pecollo, Emmanuelle Kesse-Guyot, Mélanie Deschasaux, Valentin Partula, Pilar Galan, Adrien Rossary, Bernard Lyan, Marie-Paule Vasson, Bernard Srour, Serge Hercberg, Mathilde Touvier, Marie Lagree, Thomas Ferreira, Estelle Pujos-Guillot, Paule Latino-Martel, Céline Dalle, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Plateforme d'Exploration du Métabolisme, MetaboHUB, Institut de Chimie, Université Clermont Auvergne (UCA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), and Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: Adult, 0301 basic medicine, Oncology, medicine.medical_specialty, Epidemiology, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Mass Spectrometry, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Breast cancer, Risk Factors, Internal medicine, Biomarkers, Tumor, medicine, Humans, Metabolomics, Prospective Studies, Prospective cohort study, Cell Proliferation, Cause of death, business.industry, Blood Proteins, Environmental exposure, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, Glutamine, Oxidative Stress, 030104 developmental biology, Case-Control Studies, 030220 oncology & carcinogenesis, Etiology, Female, Energy Metabolism, business, Chromatography, Liquid, Follow-Up Studies, Cohort study, Blood drawing
Abstract: Background: Breast cancer is a major cause of death in occidental women. The role of metabolism in breast cancer etiology remains unclear. Metabolomics may help to elucidate novel biological pathways and identify new biomarkers to predict breast cancer long before symptoms appear. The aim of this study was to investigate whether untargeted metabolomic signatures from blood draws of healthy women could contribute to better understand and predict the long-term risk of developing breast cancer. Methods: A nested case–control study was conducted within the SU.VI.MAX prospective cohort (13 years of follow-up) to analyze baseline plasma samples of 211 incident breast cancer cases and 211 matched controls by LC/MS. Multivariable conditional logistic regression models were computed. Results: A total of 3,565 ions were detected and 1,221 were retained for statistical analysis. A total of 73 ions were associated with breast cancer risk (P < 0.01; FDR ≤ 0.2). Notably, we observed that a lower plasma level of O-succinyl-homoserine (OR = 0.70, 95%CI = [0.55-0.89]) and higher plasma levels of valine/norvaline [1.45 (1.15–1.83)], glutamine/isoglutamine [1.33 (1.07–1.66)], 5-aminovaleric acid [1.46 (1.14–1.87)], phenylalanine [1.43 (1.14–1.78)], tryptophan [1.40 (1.10–1.79)], γ-glutamyl-threonine [1.39 (1.09–1.77)], ATBC [1.41 (1.10–1.79)], and pregnene-triol sulfate [1.38 (1.08–1.77)] were associated with an increased risk of developing breast cancer during follow-up. Conclusion: Several prediagnostic plasmatic metabolites were associated with long-term breast cancer risk and suggested a role of microbiota metabolism and environmental exposure. Impact: After confirmation in other independent cohort studies, these results could help to identify healthy women at higher risk of developing breast cancer in the subsequent decade and to propose a better understanding of the complex mechanisms involved in its etiology.
Published: 2019
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4. NMR metabolomic profiles associated with long-term risk of prostate cancer

Author: Marie-Paule Vasson, Pilar Galan, Emmanuelle Kesse-Guyot, Philippe Savarin, Serge Hercberg, Nadia Bouchemal, Nathalie Druesne-Pecollo, L. Lécuyer, Valentin Partula, Bernard Srour, Adrien Rossary, Mohamed Nawfal Triba, Aicha Demidem, Mélanie Deschasaux-Tanguy, Mathilde Touvier, Agnès Victor Bala, Paule Latino-Martel, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques (CSPBAT), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sorbonne Paris Nord, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Auvergne [CHU Clermont-Ferrand] (CRNH A), Direction de la recherche clinique et de l’innovation [CHU Clermont-Ferrand] (DRCI), CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Département de Santé Publique [Avicenne], Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Fondation de France 2015 00060743Institut National du Cancer (INCA) France INCa_11323Federative Institute for Biomedical Research IFRB Paris 13, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), and HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Adult, Male, Oncology, medicine.medical_specialty, Magnetic Resonance Spectroscopy, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Disease, 01 natural sciences, Biochemistry, 03 medical and health sciences, Prostate cancer, Internal medicine, Biomarkers, Tumor, medicine, Humans, Metabolomics, Prospective Studies, Prospective cohort study, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, business.industry, 010401 analytical chemistry, Prostatic Neoplasms, Odds ratio, Middle Aged, [SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, Molecular medicine, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Logistic Models, Case-Control Studies, Cohort, Etiology, business, Cohort study
Abstract: Prostate cancer is a multifactorial disease whose aetiology is still not fully understood. Metabolomics, by measuring several hundred metabolites simultaneously, could enhance knowledge on the metabolic changes involved and the potential impact of external factors. The aim of the present study was to investigate whether pre-diagnostic plasma metabolomic profiles were associated with the risk of developing a prostate cancer within the following decade. A prospective nested case-control study was set up among the 5141 men participant of the SU.VI.MAX cohort, including 171 prostate cancer cases, diagnosed between 1994 and 2007, and 171 matched controls. Nuclear magnetic resonance (NMR) metabolomic profiles were established from baseline plasma samples using NOESY1D and CPMG sequences. Multivariable conditional logistic regression models were computed for each individual NMR signal and for metabolomic patterns derived using principal component analysis. Men with higher fasting plasma levels of valine (odds ratio (OR) = 1.37 [1.07–1.76], p = .01), glutamine (OR = 1.30 [1.00–1.70], p = .047), creatine (OR = 1.37 [1.04–1.80], p = .02), albumin lysyl (OR = 1.48 [1.12–1.95], p = .006 and OR = 1.51 [1.13–2.02], p = .005), tyrosine (OR = 1.40 [1.06–1.85], p = .02), phenylalanine (OR = 1.39 [1.08–1.79], p = .01), histidine (OR = 1.46 [1.12–1.88], p = .004), 3-methylhistidine (OR = 1.37 [1.05–1.80], p = .02) and lower plasma level of urea (OR = .70 [.54–.92], p = .009) had a higher risk of developing a prostate cancer during the 13 years of follow-up. This exploratory study highlighted associations between baseline plasma metabolomic profiles and long-term risk of developing prostate cancer. If replicated in independent cohort studies, such signatures may improve the identification of men at risk for prostate cancer well before diagnosis and the understanding of this disease.
Published: 2021
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5. Associations between untargeted plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in the

Author: Valentin, Partula, Mélanie, Deschasaux-Tanguy, Stanislas, Mondot, Agnès, Victor-Bala, Nadia, Bouchemal, Lucie, Lécuyer, Christine, Bobin-Dubigeon, Marion J, Torres, Emmanuelle, Kesse-Guyot, Bruno, Charbit, Etienne, Patin, Karen E, Assmann, Paule, Latino-Martel, Chantal, Julia, Pilar, Galan, Serge, Hercberg, Lluis, Quintana-Murci, Matthew L, Albert, Darragh, Duffy, Olivier, Lantz, Philippe, Savarin, Mohamed Nawfal, Triba, and Mathilde, Touvier
Subjects: Adult, Feces, Plasma, Creatinine, RNA, Ribosomal, 16S, Metabolome, Humans, Metabolomics, Gastrointestinal Microbiome
Abstract: Host-microbial co-metabolism products are being increasingly recognised to play important roles in physiological processes. However, studies undertaking a comprehensive approach to consider host-microbial metabolic relationships remain scarce. Metabolomic analysis yielding detailed information regarding metabolites found in a given biological compartment holds promise for such an approach. This work aimed to explore the associations between host plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in healthy adults of the Milieu Intérieur study. For 846 subjects, gut microbiota composition was profiled through sequencing of the 16S rRNA gene in stools. Metabolomic signatures were generated through proton NMR analysis of plasma. The associations between metabolomic variables and α- and β-diversity indexes and relative taxa abundances were tested using multi-adjusted partial Spearman correlations, permutational ANOVA and multivariate associations with linear models, respectively. A multiple testing correction was applied (Benjamini-Hochberg, 10 % false discovery rate). Microbial richness was negatively associated with lipid-related signals and positively associated with amino acids, choline, creatinine, glucose and citrate (-0·133 ≤ Spearman's ρ ≤ 0·126). Specific associations between metabolomic signals and abundances of taxa were detected (twenty-five at the genus level and nineteen at the species level): notably, numerous associations were observed for creatinine (positively associated with eleven species and negatively associated with Faecalibacterium prausnitzii). This large-scale population-based study highlights metabolites associated with gut microbial features and provides new insights into the understanding of complex host-gut microbiota metabolic relationships. In particular, our results support the implication of a 'gut-kidney axis'. More studies providing a detailed exploration of these complex interactions and their implications for host health are needed.
Published: 2020

6. Diet-Related Metabolomic Signature of Long-Term Breast Cancer Risk Using Penalized Regression: An Exploratory Study in the SU.VI.MAX Cohort

Author: Paule Latino-Martel, Pietro Ferrari, Céline Dalle, Emmanuelle Kesse-Guyot, Mathilde Touvier, Pierre Micheau, Adrien Rossary, Sophie Lefèvre-Arbogast, Pilar Galan, Cécilia Samieri, Mélanie Deschasaux, Delphine Centeno, Lucie Lécuyer, Bernard Lyan, Marie-Paule Vasson, Valentin Partula, Marie Lagree, Bernard Srour, Nada Assi, Serge Hercberg, Mélanie Pétéra, Nathalie Druesne-Pecollo, Vivian Viallon, Aicha Demidem, Stéphanie Durand, Claudine Manach, Estelle Pujos-Guillot, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'Exploration du Métabolisme, MetaboHUB, Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), UMR 1219, Centre de Recherche Inserm-Université de Bordeaux, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux, Institut de Chimie, Université Clermont Auvergne (UCA), International Agency for Research on Cancer, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)
Subjects: Adult, 0301 basic medicine, Oncology, medicine.medical_specialty, Epidemiology, Metabolite, education, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Risk Assessment, Mass Spectrometry, LEHA, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Metabolomics, Breast cancer, Risk Factors, Internal medicine, Biomarkers, Tumor, medicine, Humans, Steroid sulfate, Risk factor, Randomized Controlled Trials as Topic, Penalized regression, business.industry, Feeding Behavior, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, Logistic Models, 030104 developmental biology, Clinical Trials, Phase III as Topic, chemistry, Case-Control Studies, 030220 oncology & carcinogenesis, Piperine, Cohort, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: Background: Diet has been recognized as a modifiable risk factor for breast cancer. Highlighting predictive diet-related biomarkers would be of great public health relevance to identify at-risk subjects. The aim of this exploratory study was to select diet-related metabolites discriminating women at higher risk of breast cancer using untargeted metabolomics. Methods: Baseline plasma samples of 200 incident breast cancer cases and matched controls, from a nested case–control study within the Supplémentation en Vitamines et Minéraux Antioxydants (SU.VI.MAX) cohort, were analyzed by untargeted LC-MS. Diet-related metabolites were identified by partial correlation with dietary exposures, and best predictors of breast cancer risk were then selected by Elastic Net penalized regression. The selection stability was assessed using bootstrap resampling. Results: 595 ions were selected as candidate diet–related metabolites. Fourteen of them were selected by Elastic Net regression as breast cancer risk discriminant ions. A lower level of piperine (a compound from pepper) and higher levels of acetyltributylcitrate (an alternative plasticizer to phthalates), pregnene-triol sulfate (a steroid sulfate), and 2-amino-4-cyano butanoic acid (a metabolite linked to microbiota metabolism) were observed in plasma from women who subsequently developed breast cancer. This metabolomic signature was related to several dietary exposures such as a “Western” dietary pattern and higher alcohol and coffee intakes. Conclusions: Our study suggested a diet-related plasma metabolic signature involving exogenous, steroid metabolites, and microbiota-related compounds associated with long-term breast cancer risk that should be confirmed in large-scale independent studies. Impact: These results could help to identify healthy women at higher risk of breast cancer and improve the understanding of nutrition and health relationship.
Published: 2020
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7. Untargeted plasma metabolomic profiles associated with overall diet in women from the SU.VI.MAX cohort

Author: Mélanie Deschasaux, Pierre Micheau, Mathilde Touvier, Nathalie Druesne-Pecollo, Adrien Rossary, Pilar Galan, Marie-Paule Vasson, Delphine Centeno, Bernard Srour, Aicha Demidem, Bernard Lyan, Paule Latino-Martel, Valentin Partula, Mélanie Pétéra, Céline Dalle, Lucie Lécuyer, Serge Hercberg, Emmanuelle Kesse-Guyot, Stéphanie Durand, Claudine Manach, Estelle Pujos-Guillot, Marie Lagree, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Institut National du Cancer (INCA) France INCa_8085 INCa_11323Federative Institute for Biomedical Research IFRB Paris 13 Region Ile-de-France, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), and HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Medicine (miscellaneous), 030209 endocrinology & metabolism, Cohort Studies, Decile, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Metabolomics, Vegetables, medicine, Humans, Food science, Carnitine, Dietary patterns, education, 2. Zero hunger, education.field_of_study, 030109 nutrition & dietetics, Nutrition and Dietetics, Overall diet, Mass spectrometry, business.industry, Cholic acid, 24-h dietary records, Plasma levels, Diet, 3. Good health, Cross-Sectional Studies, chemistry, Cohort, Female, Alcohol intake, business, medicine.drug
Abstract: Dietary intakes are reflected in plasma by the presence of hundreds of exogenous metabolites and variations in endogenous metabolites. The exploration of diet-related plasma metabolic profiles could help to better understand the impact of overall diet on health. Our aim was to identify metabolomic signatures reflecting overall diet in women from the French general population. This cross-sectional study included 160 women in the SU.VI.MAX cohort with detailed dietary data (≥ 10 24-h dietary records) selected according to their level of adherence to the French dietary recommendations, represented by the validated score mPNNS-GS; 80 women from the 10th decile of the score were matched with 80 women from the 1st decile. Plasma metabolomic profiles were acquired using untargeted UPLC-QToF mass spectrometry analysis. The associations between metabolomic profiles and the mPNNG-GS, its components and Principal Component Analyses-derived dietary patterns were investigated using multivariable conditional logistic regression models and partial correlations. Adherence to the dietary recommendations was positively associated with 3-indolepropionic acid and pipecolic acid (also positively associated with fruit and vegetable intake and a healthy diet)—2 metabolites linked to microbiota and inversely associated with lysophosphatidylcholine (LysoPC(17:1)), acylcarnitine C9:1 (also inversely associated with a healthy diet), acylcarnitine C11:1 and 2-deoxy-D-glucose. Increased plasma levels of piperine and Dihydro4mercapto-3(2H) furanone were observed in women who consumed a Western diet and a healthy diet, respectively. Ethyl-β-D-glucopyranoside was positively associated with alcohol intake. Plasma levels of LysoPC(17:1), cholic acid, phenylalanine-phenylalanine and phenylalanine and carnitine C9:1 decreased with the consumption of vegetable added fat, sweetened food, milk and dairy products and fruit and vegetable intakes, respectively. This study highlighted several metabolites from both host and microbial metabolism reflecting the long-term impact of the overall diet. SU.VI.MAX, clinicaltrials.gov NCT00272428. Registered 3 January 2006, https://clinicaltrials.gov/show/NCT00272428
Published: 2020
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8. Sociodemographic and economic factors are associated with weight gain between before and after cancer diagnosis: results from the prospective population-based NutriNet-Santé cohort

Author: Pilar Galan, Laurent Zelek, Serge Hercberg, Philippine Fassier, Hélène Hoarau, Paule Latino-Martel, Mathilde Touvier, Mélanie Deschasaux, Marina Touillaud, Rebeca Gonzalez, Patrick Bachmann, Nathalie Druesne-Pecollo, Bernard Srour, Valentin Partula, and Patrice Cohen
Subjects: Gerontology, weight gain, weight loss, cancer diagnosis, breast cancer, socio-demographic factors, 03 medical and health sciences, prise de poids, 0302 clinical medicine, Breast cancer, Weight loss, medicine, cancer, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, 2. Zero hunger, business.industry, Cancer, Odds ratio, medicine.disease, 3. Good health, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, medicine.symptom, business, Body mass index, Weight gain, Research Paper, Demography
Abstract: // Philippine Fassier 1 , Laurent Zelek 1, 2 , Patrick Bachmann 3 , Marina Touillaud 3 , Nathalie Druesne-Pecollo 1 , Valentin Partula 1 , Serge Hercberg 1, 4 , Pilar Galan 1 , Patrice Cohen 5 , Helene Hoarau 5 , Paule Latino-Martel 1 , Bernard Srour 1 , Rebeca Gonzalez 1 , Melanie Deschasaux 1 and Mathilde Touvier 1 1 Nutritional Epidemiology Research Team (EREN): Inserm U1153, Inra U1125, Cnam, Paris 5, 7 and 13 Universities, Sorbonne Paris Cite Epidemiology and Statistics Research Center, F-93017, Bobigny, France 2 Oncology Department, Avicenne Hospital, F-93017, Bobigny, France 3 Cancer, Environment and Nutrition Unit, Leon Berard Center, F-69000, Lyon, France 4 Public Health Department, Avicenne Hospital, F-93017, Bobigny, France 5 Sociology Department, University of Rouen, DySola, EA 4701, F-76821, Rouen, France Correspondence to: Philippine Fassier, email: p.fassier@eren.smbh.univ-paris13.fr Keywords: weight gain, weight loss, cancer diagnosis, breast cancer, socio-demographic factors Abbreviations: BMI: body mass index; OR: odds ratio; CI: confidence interval Received: November 25, 2016 Accepted: March 27, 2017 Published: May 08, 2017 ABSTRACT Purpose: While many cancer patients are affected by weight loss, others tend to gain weight, which may impact prognosis and risk of recurrence and of second cancer. The aim of this prospective study was to investigate weight variation between before and after cancer diagnosis and socio-demographic, economic, lifestyle and clinical factors associated with moderate-to-severe weight gain. Methods: 1051 incident cases of first primary cancer were diagnosed in the NutriNet-Sante cohort between 2009 and 2015. Weight was prospectively collected every 6 months since subjects’ inclusion (i.e. an average of 2y before diagnosis). Mean weights before and after cancer diagnosis were compared with paired Student’s t-test. Factors associated with moderate-to-severe weight gain (≥5% of initial weight) were investigated by age and sex-adjusted logistic regression. Results: Weight loss was observed in men (-3.54±4.39kg in those who lost weight, p=0.0002) and in colorectal cancer patients (-3.94±4.40kg,p=0.001). Weight gain was observed in breast and skin cancers (2.83±3.21kg,p=0.04, and 2.96±2.75kg,p=0.04 respectively). Women (OR=1.75[1.06-2.87],p=0.03), younger patients (2.44[1.51-3.70],p
Published: 2017
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9. Abstract P5-13-01: Sociodemographic and economic factors are essential determinants of weight gain between before and after cancer diagnosis: Results from the prospective population-based NutriNet-Santé cohort

Author: Philippine Fassier, M Touillaud, Patrice Cohen, Bernard Srour, Mélanie Deschasaux, Mathilde Touvier, Serge Hercberg, L. Lécuyer, H. Hoarau, Pilar Galan, Nathalie Druesne-Pecollo, P. Bachmann, Paule Latino-Martel, Rebeca Gonzalez, Valentin Partula, and Laurent Zelek
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, Pediatrics, medicine.medical_specialty, Colorectal cancer, business.industry, Cancer, Retrospective cohort study, medicine.disease, 3. Good health, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, 0302 clinical medicine, Breast cancer, Oncology, Weight loss, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, medicine, medicine.symptom, 10. No inequality, Prospective cohort study, business, Weight gain
Abstract: Background: While many cancer patients are affected by weight loss, others tend to gain weight, which may impact prognosis and risk of recurrence and of second cancer. The aim of this prospective study was to investigate weight variation between before and after cancer diagnosis and socio-demographic, economic, lifestyle and clinical factors associated with moderate-to-severe weight gain. Methods: 1051 incident cases of first primary cancer were diagnosed in the NutriNet-Santé cohort between 2009 and 2015. Weight was prospectively collected every 6 months since subjects' inclusion (i.e. an average of 2y before diagnosis). Mean weights before and after cancer diagnosis were compared with paired Student's t-test. Factors associated with moderate-to-severe weight gain (≥5% of initial weight) were investigated by multivariable logistic regression. Results: Weight loss was observed in men (-3.54kg in those who lost weight, p=0.0002) and in colorectal cancer patients (-3.94kg, p=0.0012). Weight gain was observed in breast and skin cancers (2.83kg, p=0.047, and 2.96kg, p=0.03 respectively). Women (OR=1.99[1.18-3.35]), younger patients (OR=1.78[1.05-3.03]), those with lower education (OR=2.17[1.07-4.37]), those with excess weight before diagnosis (OR=1.53[1.02-2.30]) and those who stopped smoking after diagnosis (OR=4.60[2.06-10.25]) were more likely to experience moderate-to-severe weight gain. In breast cancer patients, induced menopause was associated with weight gain (OR=4.12[1.76-9.67]), but no association was detected for tumor characteristics or treatments. Conclusion: This large prospective cohort provided original results on weight variation between before and after cancer diagnosis, highlighting different weight trajectories. Socio-demographic and economic factors appeared to strongly influence the risk of weight gain, illustrating social inequalities in health. Citation Format: Fassier P, Zelek L, Partula V, Lecuyer L, Srour B, Bachmann P, Touillaud M, Druesne-Pecollo N, Galan P, Hercberg S, Cohen P, Hoarau H, Latino-Martel P, Gonzalez R, Deschasaux M, Touvier M. Sociodemographic and economic factors are essential determinants of weight gain between before and after cancer diagnosis: Results from the prospective population-based NutriNet-Santé cohort [abstract]. In: Proceedings of the 2016 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2016 Dec 6-10; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(4 Suppl):Abstract nr P5-13-01.
Published: 2017
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10. A comprehensive assessment of demographic, environmental, and host genetic associations with gut microbiome diversity in healthy individuals

Author: Christian Hammer, Lluis Quintana-Murci, Allyson L. Byrd, Jacques Fellay, Cécile Alanio, Petar Scepanovic, Valentin Partula, Mathilde Touvier, Olivier Lantz, Stanislas Mondot, Jacob Bergstedt, Etienne Patin, Darragh Duffy, Matthew L. Albert, Flavia Hodel, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Genentech, Inc. [San Francisco], Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania [Philadelphia], Lund University [Lund], Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immunité et cancer (U932), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Immunobiologie des Cellules dendritiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Swiss Institute of Bioinformatics [Genève] (SIB), Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), This work benefited from the support of the French government’s Invest in the Future Program, managed by the Agence Nationale de la Recherche (ANR, reference 10-LABX-69-01). It was also supported by a grant from the Swiss National Science Foundation (31003A_175603 to JF)., We would like to thank to all the donors for their contribution to the study. The Milieu Intérieur Consortium is composed of the following team leaders: Laurent Abel (Hôpital Necker, Paris, France), Andres Alcover (Institut Pasteur, Paris, France), Hugues Aschard (Institut Pasteur, Paris, France), Kalla Astrom (Lund University, Lund, Sweden), Philippe Bousso (Institut Pasteur, Paris, France), Pierre Bruhns (Institut Pasteur, Paris, France), Ana Cumano (Institut Pasteur, Paris, France), Caroline Demangel (Institut Pasteur, Paris, France), Ludovic Deriano (Institut Pasteur, Paris, France), James Di Santo (Institut Pasteur, Paris, France), Françoise Dromer (Institut Pasteur, Paris, France), Darragh Duffy (Institut Pasteur, Paris, France), Gérard Eberl (Institut Pasteur, Paris, France), Jost Enninga (Institut Pasteur, Paris, France), Jacques Fellay (EPFL, Lausanne, Switzerland), Odile Gelpi (Institut Pasteur, Paris, France), Ivo Gomperts-Boneca (Institut Pasteur, Paris, France), Milena Hasan (Institut Pasteur, Paris, France), Serge Hercberg (Université Paris 13, Paris, France), Olivier Lantz (Institut Curie, Paris, France), Claude Leclerc (Institut Pasteur, Paris, France), Hugo Mouquet (Institut Pasteur, Paris, France), Sandra Pellegrini (Institut Pasteur, Paris, France), Stanislas Pol (Hôpital Côchin, Paris, France), Antonio Rausell (INSERM UMR 1163 – Institut Imagine, Paris, France), Lars Rogge (Institut Pasteur, Paris, France), Anavaj Sakuntabhai (Institut Pasteur, Paris, France), Olivier Schwartz (Institut Pasteur, Paris, France), Benno Schwikowski (Institut Pasteur, Paris, France), Spencer Shorte (Institut Pasteur, Paris, France), Vassili Soumelis (Institut Curie, Paris, France), Frédéric Tangy (Institut Pasteur, Paris, France), Eric Tartour (Hôpital Européen George Pompidou, Paris, France), Antoine Toubert (Hôpital Saint-Louis, Paris, France), Mathilde Touvier (Université Paris 13, Paris, France), Marie-Noëlle Ungeheuer (Institut Pasteur, Paris, France), Matthew L. Albert (Roche Genentech, South San Francisco, CA, USA), and Lluis Quintana-Murci (Institut Pasteur, Paris, France). Matthew L. Albert and Lluis Quintana-Murci are the co-coordinators of the consortium. Additional information can be found at http://www.milieuinterieur.fr/en., ANR-10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE(2010), Vougny, Marie-Christine, Laboratoires d'excellence - GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE - - MILIEU INTERIEUR2010 - ANR-10-LABX-0069 - LABX - VALID, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Pennsylvania, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Collège de France - Chaire Génomique humaine et évolution, Collège de France (CdF (institution)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Institut Curie-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR: 10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE(2010), Fellay, Jacques [0000-0002-8240-939X], Apollo - University of Cambridge Repository, and Fellay, Jacques
Subjects: Male, population-structure, imputation, Genome-wide association study, dna, Cohort Studies, Feces, 0302 clinical medicine, GWAS, Gut, 16S rRNA gene sequencing, media_common, milieu-interieur, 0303 health sciences, dynamics, Genomics, Middle Aged, Healthy Volunteers, 3. Good health, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, Medical genetics, lcsh:QR100-130, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Female, Demographics, Sex ratio, Human, Adult, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, [SDV.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology, media_common.quotation_subject, Single-nucleotide polymorphism, Biology, Environment, Microbiology, lcsh:Microbial ecology, Young Adult, 03 medical and health sciences, Genetic variation, medicine, Humans, Microbiome, genome, Life Style, Aged, Demography, 030304 developmental biology, inference, Healthy, Bacteria, Host (biology), Research, Gastrointestinal Microbiome, extraction, 030217 neurology & neurosurgery, Imputation (genetics), Diversity (politics)
Abstract: Background The gut microbiome is an important determinant of human health. Its composition has been shown to be influenced by multiple environmental factors and likely by host genetic variation. In the framework of the Milieu Intérieur Consortium, a total of 1000 healthy individuals of western European ancestry, with a 1:1 sex ratio and evenly stratified across five decades of life (age 20–69), were recruited. We generated 16S ribosomal RNA profiles from stool samples for 858 participants. We investigated genetic and non-genetic factors that contribute to individual differences in fecal microbiome composition. Results Among 110 demographic, clinical, and environmental factors, 11 were identified as significantly correlated with α-diversity, ß-diversity, or abundance of specific microbial communities in multivariable models. Age and blood alanine aminotransferase levels showed the strongest associations with microbiome diversity. In total, all non-genetic factors explained 16.4% of the variance. We then searched for associations between > 5 million single nucleotide polymorphisms and the same indicators of fecal microbiome diversity, including the significant non-genetic factors as covariates. No genome-wide significant associations were identified after correction for multiple testing. A small fraction of previously reported associations between human genetic variants and specific taxa could be replicated in our cohort, while no replication was observed for any of the diversity metrics. Conclusion In a well-characterized cohort of healthy individuals, we identified several non-genetic variables associated with fecal microbiome diversity. In contrast, host genetics only had a negligible influence. Demographic and environmental factors are thus the main contributors to fecal microbiome composition in healthy individuals. Trial registration ClinicalTrials.gov identifier NCT01699893
Published: 2019
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11. P4-18-05 - Associations between untargeted plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in the milieu intérieur population of healthy adults

Author: Valentin Partula
Published: 2019
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12. P2-04-05 - Associations between consumption of dietary fibers and the risk of chronic diseases and mortality in the French Nutrinet-Sante cohort

Author: Mathilde Touvier, Mélanie Deschasaux, Nathalie Druesne-Pecollo, HERCBERG HERCBERG, Pilar Galan, Chantal Julia, Emmanuelle Kesse-Guyot, LATINO-MARTEL Paule, Elisa Desmetz, Bernard Srour, and Valentin Partula
Published: 2019
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13. Associations between usual diet and gut microbiota composition: results from the Milieu Intérieur cross-sectional study

Author: Camille Buscail, Pilar Galan, Lluis Quintana-Murci, Karen E. Assmann, Mélanie Deschasaux, Vincent Rouilly, Darragh Duffy, Emmanuelle Kesse-Guyot, Valentin Partula, Olivier Lantz, Mathilde Touvier, M. Torres, Matthew L. Albert, Chantal Julia, Paule Latino-Martel, Stéphanie Thomas, Stanislas Mondot, Serge Hercberg, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Santé publique France, Hôpital Avicenne, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Centre de Recherche Translationnelle (CRT), Institut Pasteur [Paris], Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immunobiologie des Cellules dendritiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics, Genentech, Inc. [San Francisco], Immunité et cancer (U932), Institut Curie-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Translationnelle - Center for Translational Science (CRT), Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie [Paris], Vougny, Marie-Christine, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris]
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, Male, [SDV.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology, Colon, Population, Medicine (miscellaneous), Gut flora, Diet Surveys, Food group, 03 medical and health sciences, Feces, Young Adult, Abundance (ecology), RNA, Ribosomal, 16S, Humans, Food science, Microbiome, education, Aged, 2. Zero hunger, education.field_of_study, Analysis of Variance, 030109 nutrition & dietetics, Nutrition and Dietetics, biology, Bacteria, gut microbiota, digestive, oral, and skin physiology, Feeding Behavior, Sequence Analysis, DNA, Middle Aged, biology.organism_classification, Diet, Gastrointestinal Microbiome, 030104 developmental biology, Cross-Sectional Studies, Diet, Western, Milieu Intérieur Consortium, Multivariate Analysis, usual diet, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Female, epidemiology, Omnivore, Analysis of variance, France, healthy population, Akkermansia muciniphila
Abstract: International audience; BACKGROUND:Diet is widely recognized as one of the main modifiable drivers of gut microbiota variability, and its influence on microbiota composition is an active area of investigation.OBJECTIVE:The present work aimed to explore the associations between usual diet and gut microbiota composition in a large sample of healthy French adults.METHODS:Gut microbiota composition was established through sequencing of the 16S rRNA gene in stool samples from 862 healthy French adults of the Milieu Intérieur study. Usual dietary consumptions were determined through the administration of a food-frequency questionnaire. The associations between dietary variables and α- and β-diversity indexes and relative taxa abundances were tested using Spearman correlations, permutational ANOVAs, and multivariate analyses with linear models, respectively.RESULTS:Foods generally considered as healthy (raw fruits, fish) were positively associated with α-diversity, whereas food items for which a limited consumption is generally recommended (fried products, sodas or sugary drinks, fatty sweet products, processed meats, ready-cooked meals, and desserts) were negatively associated with α-diversity. Fruits, fried products, ready-cooked meals, and cheese contributed to shifts within microbiota composition (β-diversity). Our results also highlighted a number of associations between various food group intakes and abundances of specific phyla, genera, and species. For instance, the consumption of cheese was negatively associated with Akkermansia muciniphila abundance.CONCLUSIONS:This large-scale population-based study supports that the usual consumption of certain food items is associated with several gut microbial features, and extends the mechanistic arguments linking Western diet to an altered microbiota composition. These results provide new insights into the understanding of complex diet-gut microbiota relations, and their implications for host health deserve further investigation because altered microbiota diversity was consistently linked to increased risk of several health outcomes. This trial was registered at clinicaltrials.gov as NCT01699893.
Published: 2019
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14. Dietary iron intake and breast cancer risk: modulation by an antioxidant supplementation

Author: Fabrice Pierre, Paule Latino-Martel, Serge Hercberg, Valentin Partula, Abou Diallo, Mathilde Touvier, Bernard Srour, Pilar Galan, Philippine Fassier, Mélanie Deschasaux, Françoise Guéraud, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Public Health Department, Réseau National Alimentation Cancer Recherche (réseau NACRe), Prévention et promotion de la cancérogénèse par les aliments (ToxAlim-PPCA), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Canceropole Ile-de-France (public funding from the Paris region), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Université Paris 13 - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National Polytechnique [Toulouse] (INP) - Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) - Université Paul Sabatier - Toulouse 3 (UPS) - Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Deschasaux, Mélanie
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, medicine.medical_specialty, Pathology, Antioxidant, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], Iron, Physiology, Breast Neoplasms, Placebo, mammary malignant tumor, human health, Antioxidants, Lipid peroxidation, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Breast cancer, breast cancer, Epidemiology, medicine, Humans, dietary iron, antioxidants, lipid peroxidation, prospective study, Prospective Studies, Prospective cohort study, métabolisme du fer, Aged, Dietary iron, business.industry, Proportional hazards model, peroxydation lipidique, cancer du sein, santé humaine, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, Oncology, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, Dietary Supplements, Female, business, Research Paper
Abstract: Experimental results suggested that iron-induced lipid peroxidation may explain the direct associations observed between red/processed meat intakes and colorectal and breast cancer risk. However, epidemiological evidence is lacking. Thus, we investigated the association between dietary iron intake and breast cancer risk, and its potential modulation by an antioxidant supplementation and lipid intake. This prospective study included 4646 women from the SU. VI. MAX trial (daily lowdose antioxidants vs. placebo). 188 incident breast cancers were diagnosed (median follow-up= 12.6y). Dietary iron intake was assessed using repeated 24h dietary records. Multivariable Cox proportional hazards models were computed. Dietary iron intake was associated with an increased breast cancer risk (HRT3vs. T1= 1.67 (1.022.71), P-trend= 0.04). This association was observed in the placebo group (HRT3vs. (T1)= 2.80 (1.42-5.54), P-trend= 0.003), but not in the antioxidant-supplemented group (P-trend= 0.7, P-interaction= 0.1). Besides, in the placebo group, the increased breast cancer risk associated with dietary iron intake was more specifically observed in women with higher lipid intake (P-trend= 0.046). These findings suggest that dietary iron intake may be associated with an increased breast cancer risk, especially in women who did not received antioxidants during the trial and who consumed more lipids. This supports the experimental results suggesting that breast cancer risk may be increased by iron-induced lipid peroxidation.
Published: 2016
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15. Association entre profils métabolomiques plasmatiques par RMN et risque à long terme de développer un cancer de la prostate

Author: L. Lécuyer, Emmanuelle Kesse-Guyot, Aicha Demidem, M. Nawfal Triba, Pilar Galan, Adrien Rossary, S. Hercberg, Mélanie Deschasaux, Nadia Bouchemal, Philippe Savarin, Mathilde Touvier, Valentin Partula, M.-P. Vasson, Paule Latino-Martel, A. Victor Bala, L. Le Moyec, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UMR 7244, Spectroscopies Biomolécules et Milieux Biologiques (SBMB), Laboratoire CSPBAT, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de biologie intégrative des adaptations à l'exercice (UBIAE), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Nord (Paris 13), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Département de Santé Publique, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), CHU Clermont-Ferrand, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques (CSPBAT), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris 13 (UP13)-Institut Galilée-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris 13 (UP13)-Institut Galilée-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris 13 (UP13)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Nutrition and Dietetics, 030309 nutrition & dietetics, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Internal Medicine, 030209 endocrinology & metabolism, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 3. Good health
Abstract: Discipline Epidemiologie. Introduction et but de l’etude Le cancer de la prostate est l’un des principaux cancers chez l’homme dans le monde. Les mecanismes impliques dans son etiologie sont encore mal compris. La metabolomique est un puissant outil permettant d’elucider de nouvelles voies mecanistiques mis en jeu et d’identifier de nouveaux biomarqueurs caracteristiques d’un profil a plus haut risque de developper un cancer de la prostate a long terme. Cette etude prospective a donc pour but d’etudier si des profils metabolomiques etablis a partir d’un prelevement sanguin sur des hommes a priori en bonne sante pourraient contribuer a l’identification des hommes a plus haut risque de developper un cancer de la prostate dans la prochaine decennie et de mieux comprendre les mecanismes impliques dans la mise en place de ce cancer. Materiel et methodes Un cas-temoin niche prospectif a ete realise dans la cohorte SU.VI.MAX, incluant 162 cas de cancer de la prostate diagnostiques pendant les 13 ans de suivi, et 162 temoins apparies. Les profils metabolomiques RMN non cibles ont ete realises sur des echantillons de plasma pre-diagnostic preleves a l’inclusion en utilisant les sequences NOESY 1D et CPMG d’un spectrometre Bruker Avance III de 500 MHz. Des modeles de regressions logistiques conditionnelles multivariees ont ete realises sur chaque variable RMN. Resultats et analyse statistique Les hommes ayant un taux plasmatique moins eleve en uree et plus eleve en valine, albumine, tyrosine, phenylalanine, 3-methylhistidine, histidine, glutamine, albumine lysyl et creatine avaient un plus haut risque de developper un cancer de la prostate dans les 13 qui suivaient. Le metabolite le plus associe au risque du cancer de la prostate etait l’histidine (OR = 1,46 [1,12–1,88], p = 0,004). Conclusion Cette etude a mis en evidence une association entre les profils metabolomiques RMN et le risque de developper un cancer de la prostate a long terme. Ces resultats fournissent des elements qui pourront permettre de mieux comprendre les mecanismes complexes impliques dans la carcinogenese de la prostate. S’ils sont repliques dans une cohorte independante, ils pourront contribuer au developpement de strategies pour l’identification des personnes a plus haut risque de developper un cancer de la prostate. Trial registration SU.VI.MAX, clinicaltrials.gov NCT00272428 . Registered 3 January 2006.
Published: 2018
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16. Signatures métabolomiques associées à des profils alimentaires spécifiques dans la cohorte su.vi.max

Author: Pierre Micheau, Valentin Partula, Estelle Pujos-Guillot, Bernard Srour, Mélanie Deschasaux, Marie-Paule Vasson, S. Hercberg, Adrien Rossary, Mélanie Pétéra, Pilar Galan, Aicha Demidem, Claudine Manach, L. Lécuyer, Delphine Centeno, T. Mathilde, Bernard Lyan, Paule Latino-Martel, Céline Dalle, Emmanuelle Kesse-Guyot, Christine Morand, Stéphanie Durand, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Département de Santé Publique, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Clermont-Ferrand, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Paris 13 (UP13)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), département de santé publique, Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris 13 (UP13)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lécuyer, Lucie, ProdInra, Migration, Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), and HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Nutrition and Dietetics, 030309 nutrition & dietetics, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030209 endocrinology & metabolism, signatures métabolomiques, [SDV] Life Sciences [q-bio], 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Internal Medicine, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, su.vi.max
Abstract: Discipline Epidemiologie. Introduction et but de l’etude Notre alimentation se traduit au niveau plasmatique par la presence de divers metabolites exogenes et endogenes. L’identification de profils de metabolites plasmatiques lies a la nutrition permettrait d’ameliorer les mesures d’exposition alimentaire en epidemiologie nutritionnelle et de mieux comprendre les effets biologiques de certains composants alimentaires et notamment ceux de la qualite de l’alimentation sur la sante. Notre objectif etait donc de determiner les associations entre differents profils alimentaires et les profils de metabolites plasmatiques. Materiel et methodes Cette etude incluait 160 femmes de la cohorte SU.VI.MAX (≥10 R24). Ces femmes ont ete selectionnees selon leur niveau d’adequation aux recommandations du Programme National Nutrition Sante ; 80 femmes au sein du 10e decile de la distribution du score PNNS-GS, appariees avec 80 femmes du 1er decile. Les echantillons de plasma recoltes a l’inclusion, ont ete analyses en spectrometrie de masse non ciblee. Les donnees ont ete analysees avec des methodes de regressions logistiques conditionnelles (1e vs 10e decile du score PNNS-GS) et des analyses de correlations avec les composantes du score PNNS-GS et avec des patterns issus d’une Analyse en Composante Principale (ACP) realisee sur 29 groupes d’aliments. Resultats et analyse statistique Au total, 30 ions etaient associes aux donnees nutritionnelles, l’identification de ces ions est en cours. 10 ions etaient associes au score PNNS-GS (FDR |0,2|) ; 4 associes negativement au profil alimentaire « Western », dont l’acide pipecolique ; 5 associes positivement au profil alimentaire « Healthy », dont l’acide pipecolique et 1 associe negativement a ce dernier profil ; 1 associe negativement au profil alimentaire « Produits sucres ». L’acide pipecolique etait egalement associe (FDR |0,2|) a la composante « fruits et legumes » du score PNNS-GS. Conclusion Cette etude met en evidence des associations entre profils metabolomiques et profils alimentaires obtenus par deux methodes complementaires. Les premiers resultats permettent de reveler des signatures metabolomiques liees a des profils alimentaires differents. L’identification de ces signatures pourrait contribuer a terme a l’amelioration de l’evaluation des expositions nutritionnelles dans les etudes epidemiologiques et a une meilleure comprehension des mecanismes impliques dans les relations nutrition-sante.
Published: 2018
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17. Signatures métabolomiques par spectrométrie de masse et risque de cancer du sein

Author: Aicha Demidem, Mathilde Touvier, Emmanuelle Kesse-Guyot, Lucie Lécuyer, Pilar Galan, Bernard Lyan, Thomas Ferreira, Claudine Manach, Marie Lagree, Paule Latino-Martel, Valentin Partula, Céline Dalle, Mélanie Deschasaux, Stéphanie Durand, Bernard Srour, Estelle Pujos-Guillot, Marie-Paule Vasson, Mélanie Pétéra, S. Hercberg, Adrien Rossary, Delphine Centeno, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre de Recherche en Nutrition Humaine, Département de Santé Publique, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Clermont-Ferrand, Fondation ARC., Réseau National Alimentation Cancer Recherche (réseau NACRe). FRA., ProdInra, Archive Ouverte, département de santé publique, Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Societe Francaise de Nutrition Enterale et Parenterale (SFNEP). et Societe Francaise de Nutrition (SFN), FRA., Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Centre Jean Perrin - Centre Régional de Lutte contre le Cancer d'Auvergne, and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)
Subjects: 0303 health sciences, Nutrition and Dietetics, [CHIM.ANAL] Chemical Sciences/Analytical chemistry, 030309 nutrition & dietetics, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, cancer du sein, mass spectrum analysis, étude prospective, 030209 endocrinology & metabolism, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, mammary malignant tumor, 3. Good health, 03 medical and health sciences, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, 0302 clinical medicine, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, spectrométrie de masse, Internal Medicine, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, métabolomique, plasma
Abstract: Remerciements : Institut National du Cancer (INCa) / Institut Fédératif de Recherche biomédicale (IFRB) / Canceropôle Ilede- France / Réseau NACReRemerciements : Institut National du Cancer (INCa) / Institut Fédératif de Recherche biomédicale (IFRB) / Canceropôle Ilede-France / Réseau NACRe; Introduction et but de l’étude : La métabolomique permet d’étudier l’ensemble des métabolites présents dans unbiofluide. Cette étude basée sur une analyse non ciblée en spectrométrie de masse a pour but d’étudier si des profils métabolomiques établis à partir d’un prélèvement sanguin sur des femmes à priori en bonne santé, pourrait contribuer à prédire le risque à long terme de développer le cancer du sein et d’améliorer la compréhension de son étiologie.Matériel et méthodes : Un cas-témoin niché prospectif a été mené dans la cohorte SU.VI.MAX, incluant 211 cas de cancer du sein et 211 témoins appariés. Les profils métabolomiques ont été établis sur des échantillons de plasma prélevés à l’inclusion, avant l’apparition du cancer, grâce à une analyse non ciblée par spectrométrie de masse (LC-MS). Des modèles de régressions logistiques conditionnelles multivariées ont été calculés sur chaque ion présélectionné grâce à une ANOVA et sur les combinaisons de potentiels biomarqueurs issus d’une Analyse en Composante Principale. Une correction de test multiple de type FDR (False Discovery Rate) a été appliquée.Résultats et Analyse statistique : Plusieurs métabolites étaient associés au risque de cancer du sein. La finalisation de l’identification des métabolites discriminants est en cours. Au vu des résultats actuels, les femmes caractérisées par un niveau plasmatique plus élevé de valine (OR=1,45 [1,15-1,83]; p= 0.009), de phénylalanine (OR=1,43 [1,14-1,78]; p=0,009), de tryptophane (OR=1,4 [1,1-1,79]; p=0,01), et de glutamine (OR=1,33 [1,07-1,66]; p=0,01) et d’un niveau plus bas d’OSuccinyl-L-homoserine (OR=0,7 [0,55-0,89]; p=0,01) auraient un risque plus important de développer le cancer du sein dans la décennie qui suit.Conclusion : Cette étude suggère plusieurs associations entre profils métabolomiques à l’inclusion et risque à long terme de développer le cancer du sein et confirme certains résultats que nous avons mis en évidence par une analyse RMN. Cette étude pourrait aider à améliorer l’identification des femmes à risque de développer un cancer du sein, bien avant l’apparition des symptômes. L’étude des biomarqueurs nutritionnels associés au risque de développer cette pathologie (actuellement en cours) pourra permettre de préciser le rôle de la nutrition (facteur modifiable) dans l’étiologie du cancer du sein et d’améliorer les stratégies préventives.
Published: 2017

18. Identification de biomarqueurs nutritionnels par une approche métabolomique en spectrométrie de masse

Author: Pilar Galan, Mélanie Deschasaux, Pierre Micheau, L. Lécuyer, Mathilde Touvier, Claudine Manach, Delphine Centeno, Valentin Partula, Mélanie Pétéra, Bernard Srour, Estelle Pujos-Guillot, Bernard Lyan, Serge Hercberg, Paule Latino-Martel, Emmanuelle Kesse-Guyot, Christine Morand, Céline Dalle, Stéphanie Durand, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Santé Publique, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris 13 (UP13)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 2. Zero hunger, 0303 health sciences, étude épidémiologique, Nutrition and Dietetics, 030309 nutrition & dietetics, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Chimie analytique, 030209 endocrinology & metabolism, rôle nutritionnel, 3. Good health, 03 medical and health sciences, Santé publique et épidémiologie, 0302 clinical medicine, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Alimentation et Nutrition, Internal Medicine, Food and Nutrition, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Analytical chemistry, biomarqueur, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, métabolomique
Abstract: International audience; Introduction et but de l’étude: Ce travail s’inscrit dans le cadre du projet Metabo-KS (2015-2017, INCa, PI : M Touvier), qui vise à: découvrir les biomarqueurs prédictifs du cancer du sein, de la qualité du régime alimentaire et d’aliments spécifiques en utilisant la métabolomique, puis à relier ces biomarqueurs pour améliorer la compréhension du rôle de la nutrition sur le risque de cancer du sein. Le présent travail porte sur la découverte de biomarqueurs plasmatiques des apports alimentaires usuels par l'exploration du métabolome alimentaire (« food metabolome ») par spectrométrie de masse non ciblée. Matériel et méthodes: Les femmes de la cohorte SU.VI.MAX ayant rempli au moins dix enregistrements alimentaires de 24h ont été stratifiées en déciles selon leur niveau d'adhésion aux recommandations du Programme français National Nutrition Santé. Au total, 80 femmes ont été sélectionnées aléatoirement dans le 10e décile de la distribution PNNS-GS et ont été appariées sur 80 femmes du 1er décile. Les échantillons de plasma prélevés à l’inclusion ont été analysés en spectrométrie de masse non ciblée en utilisant UPLC-ESI-QToF. 1575 et 601 signaux ont été détectés (mode positif et négatif). Les profils métabolomiques ont été comparés en utilisant des méthodes statistiques univariées et multivariées pour sélectionner les ions associés à la consommation de 58 aliments / groupes d’aliments. Résultats et Analyse statistique : 84 et 30 ions (mode positif et négatif) étaient associés à des aliments spécifiques / des groupes alimentaires (r> 0,3, valeur p avec BH
Published: 2017
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19. Associations entre les consommations alimentaires et la composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes français en bonne santé

Author: Pilar Galan, Mathilde Touvier, Lluis Quintana-Murci, Mélanie Deschasaux, Darragh Duffy, Serge Hercberg, Emmanuelle Kesse-Guyot, Valentin Partula, Paule Latino-Martel, Matthew L. Albert, M. Torres, and Stanislas Mondot
Subjects: Nutrition and Dietetics, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Internal Medicine
Abstract: Introduction et but de l’etude Le microbiote intestinal joue un role important dans le fonctionnement de l’organisme et ses desequilibres sont lies a de nombreuses pathologies. Il apparait donc comme une nouvelle cible therapeutique potentielle. De plus en plus d’etudes tentent donc de mettre en evidence des facteurs influencant sa composition ou son activite. Parmi les facteurs modifiables, l’alimentation semble etre un contributeur important. L’objectif de cette etude est de caracteriser les relations entre alimentation et composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes en bonne sante. Materiel et methodes Cette etude a ete menee sur 862 individus en bonne sante de la population Consortium Milieu Interieur. Des donnees alimentaires ont ete collectees via un questionnaire de frequence alimentaire. La composition du microbiote intestinal a ete determinee dans les selles par sequencage du gene codant pour l’ARN ribosomique 16S. Les indices d’α-diversite (diversite : Div ; richesse observee : Sobs) et la matrice de β-diversite (distance de Bray-Curtis) ont ete determines. Les correlations de Spearman ont ete calculees entre chacune des variables alimentaires et les indices d’α-diversite. Les associations entre les variables alimentaires et la matrice de β-diversite ont ete calculees par PERMANOVA ajustees sur l’IMC, le sexe, l’âge et le statut tabagique. Une correction de Benjamini–Hochberg (False Discovery Rate de 10 %) a ete appliquee. Resultats et analyse statistique Les correlations de Spearman montrent que 9 (respectivement 6) facteurs sont significativement associes a l’indice Div (respectivement Sobs). Ainsi, Div augmente avec la consommation de poisson, œufs, fruits crus et diminue avec la consommation de viande, viennoiseries, produits frits, plats cuisines, desserts et sodas (r de Spearman compris entre −0,15 et 0,13) ; et Sobs augmente avec la consommation de poisson et fruits crus et diminue avec la consommation de charcuterie, produits frits, plats cuisines et sodas (r de Spearman compris entre −0,17 et 0,13). Les PERMANOVA montrent que 3 facteurs sont significativement associes a la β-diversite. Les consommations de produits laitiers (hors fromages), fruits crus et legumes crus expliquent ainsi 0,577 % de la variation de la composition globale. Conclusion Cette etude suggere l’existence d’associations entre les consommations alimentaires et differents indicateurs de la composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes en bonne sante. L’analyse de l’association specifique de chacune des variables alimentaires a l’echelle taxonomique est en cours via l’utilisation de modeles d’associations multivariees avec modele lineaire (MaAsLin).
Published: 2018
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20. Abstract P1-02-01: NMR metabolomic signatures reveal predictive plasma metabolites associated with long-term risk of developing breast cancer

Author: Laurent Zelek, Paule Latino-Martel, Philippe Savarin, A. Victor Bala, Bernard Srour, Mélanie Deschasaux, Mathilde Touvier, Aicha Demidem, L. Lécuyer, M.-P. Vasson, L Le Moyec, Nadia Bouchemal, Pilar Galan, M. Nawfal Triba, Serge Hercberg, Valentin Partula, Adrien Rossary, Thibault Fiolet, and Emmanuelle Kesse-Guyot
Subjects: Oncology, Cancer Research, medicine.medical_specialty, Creatinine, business.industry, 05 social sciences, medicine.disease_cause, Creatine, medicine.disease, 3. Good health, Glutamine, chemistry.chemical_compound, Metabolomics, Breast cancer, chemistry, Internal medicine, Cohort, 050501 criminology, Medicine, business, Carcinogenesis, Prospective cohort study, 0505 law
Abstract: Background: Combination of metabolomics and epidemiological approaches opens new perspectives for ground-breaking discoveries. The aim of the present study was to investigate for the first time whether plasma non-targeted metabolomic profiles, established from a simple blood draw from healthy women, could contribute to predict the risk of developing breast cancer within the following decade and to better understand the etiology of this complex disease. Methods: A prospective nested case-control study was set up in the SU.VI.MAX cohort, including 206 breast cancer cases diagnosed during a 13y follow-up, and 396 matched controls. Non-targeted NMR metabolomic profiles were established from baseline plasma samples. Multivariable conditional logistic regression models were computed for each individual NMR variable and for combinations of variables derived by principal component analysis. Results: Several metabolomic variables from 1D NMR spectroscopy were associated with breast cancer risk. Women characterized by higher fasting plasma levels of valine, lysine, arginine, glutamine, creatine, creatinine, and glucose and lower plasma levels of lipoproteins, lipids, glycoproteins, acetone, glycerol-derived compounds and unsaturated lipids had a higher risk of developing breast cancer. P-values ranged from 0.00007 (ORT3vsT1=0.37[0.23-0.61] for glycerol-derived compounds) to 0.04 (ORT3vsT1=1.61[1.02-2.55] for glutamine). Conclusion: This study highlighted associations between baseline NMR plasma metabolomic signatures and long-term breast cancer risk. These results provide interesting insights to better understand complex mechanisms involved in breast carcinogenesis and evoke plasma metabolic disorders favorable for carcinogenesis initiation. This study may contribute to develop screening strategies for the identification of at-risk women for breast cancer well before symptoms appear. Citation Format: Lécuyer L, Victor Bala A, Deschasaux M, Bouchemal N, Nawfal Triba M, Vasson M-P, Rossary A, Demidem A, Galan P, Hercberg S, Partula V, Le Moyec L, Srour B, Fiolet T, Latino-Martel P, Kesse-Guyot E, Zelek L, Savarin P, Touvier M. NMR metabolomic signatures reveal predictive plasma metabolites associated with long-term risk of developing breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the 2017 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2017 Dec 5-9; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(4 Suppl):Abstract nr P1-02-01.
Published: 2018
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21. Déterminants de la prise de poids après diagnostic de cancer dans la cohorte prospective NutriNet-Santé (France)

Author: Patrice Cohen, M. Touvier, H. Hoarau, N. Druesne-Pecollo, Valentin Partula, M. Deschasaux, Marina Touillaud, L. Zelek, S. Hercberg, P. Fassier, P. Bachmann, P. Latino-Martel, P. Galan, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité Cancer, environnement et nutrition, Centre Léon Bérard, Département de Santé Publique, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), CHU Bordeaux [Bordeaux], Association des Epidémiologistes de Langue Française (ADELF). FRA., and Association pour le Développement de l'Epidémiologie de Terrain (EPITER). FRA.
Subjects: Économiques, Epidemiology, Prise de poids, Public Health, Environmental and Occupational Health, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Facteurs sociodémographiques, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Perte de poids, Cancer du sein, 3. Good health
Abstract: National audience; Introduction Alors que certains patients atteints de cancer ont tendance à perdre du poids, d’autres au contraire subissent une prise de poids, qui peut avoir un impact sur le pronostic, le risque de récidive ou de second cancer. L’objectif de cette étude prospective était d’étudier la variation de poids avant/après diagnostic de cancer et les facteurs sociodémographiques, économiques, de style de vie et cliniques associés à une prise de poids modérée-à-sévère. Méthode Le poids et la taille étaient collectés prospectivement chez 1051 sujets ayant eu un diagnostic de cancer validé depuis leur inclusion dans la cohorte NutriNet-Santé. Les IMC moyens avant/après diagnostic ont été comparés avec des tests de Student sur données appariées. Les caractéristiques associées à la prise de poids ont été investiguées par régression logistique. Résultats On observait une diminution du poids chez les hommes (-3,54 kg chez ceux qui perdaient du poids, p = 0,0002) et les cancers colorectaux (-3,94 kg, p = 0,001), une prise de poids était observée chez les cas de cancer du sein et de la peau (2,83 kg, p = 0,05 et 2,96 kg, p = 0,03 respectivement). Les femmes (OR = 1,99 [1,18–3,35]), les plus jeunes (OR = 1,78 [1,05–3,03]), ceux en surpoids avant diagnostic (OR = 1,53 [1,02–2,30]), avec un niveau d’étude plus faible (OR = 2,17 [1,07–4,37]) et ayant arrêté après diagnostic (OR = 4,60 [2,06–10,25]) avaient plus tendance à une prise de poids modérée-à-sévère. Ces résultats étaient similaires chez les cas de cancer du sein ; en outre une ménopause artificielle était associée à un risque accru de prise de poids (OR = 4,12 [1,76–9,67]). En revanche, les caractéristiques des tumeurs mammaires (récepteurs ER/PR, taille, traitements…) n’étaient pas associées à la prise de poids. Conclusion Cette large cohorte prospective fournit des résultats originaux sur les variations de poids entre avant et après un diagnostic de cancer, mettant en évidence différentes trajectoires pondérales. Les facteurs sociodémographiques, économiques semblent influencer la prise de poids, illustrant des inégalités de santé.
Published: 2016
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22. Variations of physical activity and sedentary behavior between before and after cancer diagnosis: Results from the prospective population-based NutriNet-Sante cohort

Author: Serge Hercberg, Nathalie Druesne-Pecollo, Laurent Zelek, Valentin Partula, Marina Touillaud, Paule Latino-Martel, Patrice Cohen, Jean-Michel Oppert, Mélanie Deschasaux, Bernard Srour, Pilar Galan, Patrick Bachmann, Mathilde Touvier, Mehdi Menai, Philippine Fassier, Hélène Hoarau, ProdInra, Archive Ouverte, Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Réseau National Alimentation Cancer Recherche (réseau NACRe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Epidemiology and Statistics Research Center, Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Oncology Department, Ippokration Hospital, Centre Léon Bérard, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamiques sociales et langagières (DYSOLA), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Institute of Cardiometabolism and Nutrition - Department of Nutrition, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Public Health Department, Canceropole Ile-de-France (from the Paris region), Ministere de la Sante, Institut de Veille Sanitaire (InVS), Institut National de la Prevention et de l'Education pour la Sante (INPES), Fondation pour la Recherche Medicale (FRM), Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (INSERM), Conservatoire National des Arts et Metiers (CNAM), Universite Paris, Fassier, Philippine, Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Université Paris 13 - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Sorbonne Paris Cité (COMUE) (USPC), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon, Université de Rouen Normandie, Normandie Université (NU) - Normandie Université (NU), Sorbonne Universités, Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Hôpital Universitaire Pitié Salpêtrière, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP - HP), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Skin Neoplasms, [SDV]Life Sciences [q-bio], Physical activity, prospective cohort, Observational Study, physical activity, Breast Neoplasms, Population based, Lower risk, 03 medical and health sciences, Sex Factors, 0302 clinical medicine, cancer survivors, sedentary behavior, variations, Surveys and Questionnaires, Humans, Medicine, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, Exercise, Aged, business.industry, Prostatic Neoplasms, Cancer, General Medicine, Sedentary behavior, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Logistic Models, Socioeconomic Factors, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, ComputingMethodologies_DOCUMENTANDTEXTPROCESSING, Physical therapy, Female, Observational study, France, Colorectal Neoplasms, business, Research Article
Abstract: Supplemental Digital Content is available in the text, Physical activity (PA) but also reduced sedentary behavior may be associated with better prognosis and lower risk of recurrence in cancer patients. Our aim was to quantify the variations in PA and time spent sedentary between before and after diagnosis, relying on prospective data in French adults. We also investigated sociodemographic and lifestyle factors associated with these variations. Subjects (n = 942) were incident cancer cases diagnosed in the NutriNet-Santé cohort between 2009 and 2015. PA and sedentary behavior were prospectively collected with the 7-day short version of the IPAQ questionnaire every year since subjects’ inclusion (i.e., an average of 2 year before diagnosis). All PA and sitting time points before and after diagnosis was compared by mixed model. Factors associated with decrease in PA and increase in sitting time were investigated using logistic regressions. Overall and vigorous PA decreased after diagnosis (P = 0.006, −32.8 ± 36.8 MET-hour/week on average, in those who decreased their overall PA and P = 0.005, −21.1 ± 36.8 MET-hour/week for vigorous PA, respectively), especially in prostate (−39.5 ± 36.3 MET-hour/week) and skin (−35.9 ± 38 MET-hour/week) cancers, in men (−40.8 ± 46.3MET-hour/week), and in those professionally inactive (−34.2 ± 37.1 MET-hour/week) (all P
Published: 2016
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22 results on '"Valentin Partula"'

1. A comprehensive assessment of demographic, environmental, and host genetic associations with gut microbiome diversity in healthy individuals

2. Associations between consumption of dietary fibers and the risk of cardiovascular diseases, cancers, type 2 diabetes, and mortality in the prospective NutriNet-Santé cohort

3. Plasma Metabolomic Signatures Associated with Long-term Breast Cancer Risk in the SU.VI.MAX Prospective Cohort

4. NMR metabolomic profiles associated with long-term risk of prostate cancer

5. Associations between untargeted plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in the

6. Diet-Related Metabolomic Signature of Long-Term Breast Cancer Risk Using Penalized Regression: An Exploratory Study in the SU.VI.MAX Cohort

7. Untargeted plasma metabolomic profiles associated with overall diet in women from the SU.VI.MAX cohort

8. Sociodemographic and economic factors are associated with weight gain between before and after cancer diagnosis: results from the prospective population-based NutriNet-Santé cohort

9. Abstract P5-13-01: Sociodemographic and economic factors are essential determinants of weight gain between before and after cancer diagnosis: Results from the prospective population-based NutriNet-Santé cohort

10. A comprehensive assessment of demographic, environmental, and host genetic associations with gut microbiome diversity in healthy individuals

11. P4-18-05 - Associations between untargeted plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in the milieu intérieur population of healthy adults

12. P2-04-05 - Associations between consumption of dietary fibers and the risk of chronic diseases and mortality in the French Nutrinet-Sante cohort

13. Associations between usual diet and gut microbiota composition: results from the Milieu Intérieur cross-sectional study

14. Dietary iron intake and breast cancer risk: modulation by an antioxidant supplementation

15. Association entre profils métabolomiques plasmatiques par RMN et risque à long terme de développer un cancer de la prostate

16. Signatures métabolomiques associées à des profils alimentaires spécifiques dans la cohorte su.vi.max

17. Signatures métabolomiques par spectrométrie de masse et risque de cancer du sein

18. Identification de biomarqueurs nutritionnels par une approche métabolomique en spectrométrie de masse

19. Associations entre les consommations alimentaires et la composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes français en bonne santé

20. Abstract P1-02-01: NMR metabolomic signatures reveal predictive plasma metabolites associated with long-term risk of developing breast cancer

21. Déterminants de la prise de poids après diagnostic de cancer dans la cohorte prospective NutriNet-Santé (France)

22. Variations of physical activity and sedentary behavior between before and after cancer diagnosis: Results from the prospective population-based NutriNet-Sante cohort

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