Associations entre les consommations alimentaires et la composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes français en bonne santé

Introduction et but de l’etude Le microbiote intestinal joue un role important dans le fonctionnement de l’organisme et ses desequilibres sont lies a de nombreuses pathologies. Il apparait donc comme une nouvelle cible therapeutique potentielle. De plus en plus d’etudes tentent donc de mettre en evidence des facteurs influencant sa composition ou son activite. Parmi les facteurs modifiables, l’alimentation semble etre un contributeur important. L’objectif de cette etude est de caracteriser les relations entre alimentation et composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes en bonne sante. Materiel et methodes Cette etude a ete menee sur 862 individus en bonne sante de la population Consortium Milieu Interieur. Des donnees alimentaires ont ete collectees via un questionnaire de frequence alimentaire. La composition du microbiote intestinal a ete determinee dans les selles par sequencage du gene codant pour l’ARN ribosomique 16S. Les indices d’α-diversite (diversite : Div ; richesse observee : Sobs) et la matrice de β-diversite (distance de Bray-Curtis) ont ete determines. Les correlations de Spearman ont ete calculees entre chacune des variables alimentaires et les indices d’α-diversite. Les associations entre les variables alimentaires et la matrice de β-diversite ont ete calculees par PERMANOVA ajustees sur l’IMC, le sexe, l’âge et le statut tabagique. Une correction de Benjamini–Hochberg (False Discovery Rate de 10 %) a ete appliquee. Resultats et analyse statistique Les correlations de Spearman montrent que 9 (respectivement 6) facteurs sont significativement associes a l’indice Div (respectivement Sobs). Ainsi, Div augmente avec la consommation de poisson, œufs, fruits crus et diminue avec la consommation de viande, viennoiseries, produits frits, plats cuisines, desserts et sodas (r de Spearman compris entre −0,15 et 0,13) ; et Sobs augmente avec la consommation de poisson et fruits crus et diminue avec la consommation de charcuterie, produits frits, plats cuisines et sodas (r de Spearman compris entre −0,17 et 0,13). Les PERMANOVA montrent que 3 facteurs sont significativement associes a la β-diversite. Les consommations de produits laitiers (hors fromages), fruits crus et legumes crus expliquent ainsi 0,577 % de la variation de la composition globale. Conclusion Cette etude suggere l’existence d’associations entre les consommations alimentaires et differents indicateurs de la composition du microbiote intestinal au sein d’une population d’adultes en bonne sante. L’analyse de l’association specifique de chacune des variables alimentaires a l’echelle taxonomique est en cours via l’utilisation de modeles d’associations multivariees avec modele lineaire (MaAsLin).