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1. Surface chemistry-mediated metal nanoclusters for in vivo shortwave infrared imaging

Author: Agnès Desroches-Castan, Yves Usson, Ute Resch-Genger, Jean-Luc Coll, Benjamin Musnier, Sabine Bailly, Maxime Henry, Karl David Wegner, Véronique Josserand, Xavier Le Guével, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Synthèse, Structure et Propriétés de Matériaux Fonctionnels (STEP ), SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Cancer Targets & Experimental Therapeutics, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), BioSanté (UMR BioSanté), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Bundesanstalt für Materialforschung und - prüfung [Berlin] (BAM), Angiogenèse hormono-régulée et angiogenèse tumorale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie Computationnelle et Modélisation (TIMC-BCM ), Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525 (TIMC ), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Biologie du Cancer et de l'Infection (BCI ), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U823 Grenoble, Institut Albert Bonniot, INSERM U823, équipe 5 (cibles diagnostiques ou thérapeutiques et vectorisation de drogues dans le cancer du poumon), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and le guevel, xavier
Subjects: Surface (mathematics), Chemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Quantitative Biology::Tissues and Organs, Monte Carlo method, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Shortwave infrared, Quantitative Biology::Cell Behavior, 0104 chemical sciences, Nanoclusters, [SDV] Life Sciences [q-bio], Metal, In vivo, visual_art, [CHIM] Chemical Sciences, Biophysics, visual_art.visual_art_medium, [CHIM]Chemical Sciences, Surface charge, 0210 nano-technology, Anisotropy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: We present a method of high resolution, non-invasive, in vivo vascular imaging obtained using watersoluble and bright SWIR-emitting gold nanoclusters presenting an anisotropic surface charge combined with SWIR detection and Monte Carlo processing of the images. We applied this approach to quantify vessel complexity in mice presenting vascular disorders.
Published: 2021

2. NLRP3- and AIM2-autonomy in a mouse model of MSU crystal-induced acute inflammation in vivo highlights imiquimod-dependent targeting of Il-1E expression as relevant therapy for gout patients

Author: Mariotte, Alexandre, De Cauwer, Aurore, Po, Chrystelle, Abou-Fayçal, Cherine, Pichot, Angélique, Paul, Nicodème, Aouadi, Ismael, Carapito, Raphael, Frisch, Benoit, Macquin, Cécile, Chatelus, Emmanuel, Sibilia, Jean, Armspach, Jean-Paul, Bahram, Seiamak, Georgel, Philippe, Frisch, Benoit, Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Equipe 2 - Bases Moléculaires de la Progression des Cancers du Poumon, Inserm U823, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Equipe Plate-forme GENOMAX (Inserm U1109), Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE-Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Conception et application de molécules bioactives (CAMB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Rhumatologie, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de Référence pour les Maladies Systémiques Autoimmunes Rares, Rhumatologie, CHU Strasbourg, Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ICube Laboratory, University of Strasbourg, CNRS, France, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE-Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Strasbourg (UNISTRA), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology
Abstract: L'article est publié dans la revue sous le titre définitif :"A mouse model of MSU-induced acute inflammation in vivo suggests imiquimod-dependent targeting of Il-1β as relevant therapy for gout patients"; International audience; The role of Monosodium Urate (MSU) crystals in gout pathophysiology is well described, as is the major impact of IL-1 in the inflammatory reaction that constitutes the hallmark of the disease. However, despite the discovery of the NLRP3 inflammasome and its role as a Pattern Recognition Receptor linking the detection of a danger signal (MSU) to IL-1 secretion in vitro, the precise mechanisms leading to joint inflammation in gout patients are still poorly understood. Here, we provide an extensive clinical, biological and molecular characterization of the acute uratic inflammation mouse model induced by subcutaneous injection of MSU crystals, which accurately mimics human gout. Our work reveals several key features of MSU-dependent inflammation and identifies novel therapeutic opportunities, among which the use of topical application of imiquimod to promote interferon-dependent anti-inflammatory action maybe relevant. All rights reserved. No reuse allowed without permission. (which was not peer-reviewed) is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity.
Published: 2020

3. Critical Assessment in Routine Clinical Practice of Liquid Biopsy for EGFR Status Testing in Non–Small-Cell Lung Cancer: A Single-Laboratory Experience (LPCE, Nice, France)

Author: Christelle Bonnetaud, Olivier Castelnau, Marius Ilie, Sylvie Leroy, Jonathan Benzaquen, Florian Cattet, Florence de Fraipont, Charles-Hugo Marquette, Simon Heeke, Fabrice Barlesi, Georges Garnier, Michel Poudenx, Charlotte Cohen, Isabelle Nanni, Lydia Ribeyre, Elodie Long-Mira, Loic Gazoppi, Carole Salacroup, Sandra Lassalle, Maryline Allegra, Paul Hofman, Marc G. Denis, Virginie Tanga, Julien Fayada, Jean-Philippe Berthet, Véronique Hofman, FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] (OncoAge), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire [UNIV Côte d'Azur] (UPMC), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire de Pathologie Clinique et Expérimentale. Hôpital Pasteur [Nice], Hôpital Pasteur [Nice] (CHU), Tumorothèque, Hôpital Pasteur [Nice] (CHU)-Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Laboratoire des Propriétés Mécaniques et Thermodynamiques des Matériaux (LPMTM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Galilée-Université Paris 13 (UP13), Department of Medical Oncology, Centre Hospitalier Princesse Grasse, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM U823, équipe 5 (cibles diagnostiques ou thérapeutiques et vectorisation de drogues dans le cancer du poumon), CIC - Biotherapie - Lyon - Grenoble, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de chirurgie thoracique et cardio-vasculaire, Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve-Université de Montpellier (UM), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Canceropôle PACA, Conseil Départemental des Alpes Maritimes, ANR-11-LABX-0028-01, Agence Nationale de la Recherche, Ligue Départementale 06 contre le Cancer, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Hôpital Arnaud de Villeneuve-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
Subjects: Adult, Male, 0301 basic medicine, Pulmonary and Respiratory Medicine, Oncology, Cancer Research, medicine.medical_specialty, Lung Neoplasms, Concordance, [SDV]Life Sciences [q-bio], DNA Mutational Analysis, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Afatinib, 03 medical and health sciences, T790M, 0302 clinical medicine, Gefitinib, Carcinoma, Non-Small-Cell Lung, Internal medicine, Biopsy, medicine, Humans, Digital polymerase chain reaction, Osimertinib, Liquid biopsy, Lung cancer, Aged, Aged, 80 and over, medicine.diagnostic_test, Clinical Laboratory Techniques, business.industry, Liquid Biopsy, Reproducibility of Results, Middle Aged, medicine.disease, Non-invasive assay, 3. Good health, ErbB Receptors, 030104 developmental biology, Erlotinib, 030220 oncology & carcinogenesis, Mutation, Female, France, business, medicine.drug
Abstract: International audience; Background - The introduction of liquid biopsy using PCR-based assays into routine practice has had a strong impact on the treatment of EGFR-mutated lung adenocarcinoma and is now commonly used for routine testing of EGFR mutations in certain clinical settings. To assess whether the claimed benefits of PCR-based assays hold true in daily practice at a multicenter clinical institution, we assessed how treatment decisions are affected by PCR-based assays for the analysis of EGFR mutations from plasma samples in a centralized laboratory (LPCE, Nice, France). Patients and methods - A total of 345 samples were analyzed using the US Food and Drug Administration-approved Cobas EGFR Mutation Test v2 and 103 using the Therascreen EGFR Plasma RGQ PCR Kit over 3 years (395 samples from 324 patients). Eleven plasma samples were validated independently using Cobas at 3 institutions, and 130 samples were analyzed using Stilla digital PCR. Clinical data were collected for 175 (54%) of 324 patients. Results - Cobas was superior to the Therascreen assay and demonstrated 100% reproducibility. Digital PCR showed only 48%, 83%, and 58% concordance with Cobas for exon 19 deletions, L858R mutations, and T790M mutations, respectively. Liquid biopsies helped inform and change treatment when resistance occurred and enabled the detection of EGFR mutations in patients when biopsy tissue results were unavailable. Conclusion - PCR-based assays are a fast and convenient test, allowing the detection of primary and secondary EGFR mutations from plasma. Cobas proved to be a reliable test, whereas digital PCR produced too many inconclusive results to be currently recommended as a principal testing device.
Published: 2020

4. Tartrate‐Resistant Acid Phosphatase Deficiency in the Predisposition to Systemic Lupus Erythematosus

Author: Marta E. Alarcón-Riquelme, Johan Frostegård, Alexandre Belot, Gillian I. Rice, Laurence Chaperot, Timothy J. Vyse, Jie An, Audrey F Dumax-Vorzet, Joel Plumas, Michael W. Beresford, Alice E. Wiedeman, Yanick J. Crow, Keith B. Elkon, Tracy A Briggs, Ian N. Bruce, Cláudia Carvalho, Department of Immunology, University of Washington [Seattle], Central Manchester NHS Foundation Trust, University of Manchester [Manchester], Oklahoma Medical Research Foundation (OMRF), Réponse immunitaire innée dans les maladies infectieuses et auto-immunes – Innate immunity in infectious and autoimmune diseases, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Translational Medicine, Faculdade de Medicina da Universidade do Porto (FMUP), Universidade do Porto, INSERM U823, équipe 9 (Immunobiologie et Immunothérapie des Cancers), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Karolinska Institutet [Stockholm], Guy's Hospital [London], Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidade do Porto = University of Porto, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Faculdade de Medicina da Universidade do Porto [Porto] (FMUP), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Immunology, Osteochondrodysplasias, medicine.disease_cause, Autoimmune Diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Rheumatology, medicine, Lupus Erythematosus, Systemic, Humans, Immunology and Allergy, Genetic Predisposition to Disease, Osteopontin, Phosphorylation, Tartrate-resistant acid phosphatase, Gene knockdown, Mutation, Lupus erythematosus, Systemic lupus erythematosus, Lupus Erythematosus, biology, Tartrate-Resistant Acid Phosphatase, Chemistry, Macrophages, Systemic, Transfection, medicine.disease, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, Molecular biology, 030104 developmental biology, 030220 oncology & carcinogenesis, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, biology.protein, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Anti-SSA/Ro autoantibodies
Abstract: International audience; OBJECTIVE: Mutations in the ACP5 gene, which encodes tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP), cause the immuno-osseous disorder spondyloenchondrodysplasia, which includes as disease features systemic lupus erythematosus (SLE) and a type I interferon (IFN) signature. Our aims were to identify TRAP substrates, determine the consequences of TRAP deficiency in immune cells, and assess whether ACP5 mutations are enriched in sporadic cases of SLE. METHODS: Interaction between TRAP and its binding partners was tested by a yeast 2-hybrid screening, confocal microscopy, and immunoprecipitation/Western blotting. TRAP knockdown was performed using small interfering RNA. Phosphorylation of osteopontin (OPN) was analyzed by mass spectrometry. Nucleotide sequence analysis of ACP5 was performed by Sanger sequencing or next-generation sequencing. RESULTS: TRAP and OPN colocalized and interacted in human macrophages and plasmacytoid dendritic cells (PDCs). TRAP dephosphorylated 3 serine residues on specific OPN peptides. TRAP knockdown resulted in increased OPN phosphorylation and increased nuclear translocation of IRF7 and P65, with resultant heightened expression of IFN-stimulated genes and IL6 and TNF following Toll-like receptor 9 stimulation. An excess of heterozygous ACP5 missense variants was observed in SLE compared to controls (P = 0.04), and transfection experiments revealed a significant reduction in TRAP activity in a number of variants. CONCLUSION: Our findings indicate that TRAP and OPN colocalize and that OPN is a substrate for TRAP in human immune cells. TRAP deficiency in PDCs leads to increased IFNα production, providing at least a partial explanation for how ACP5 mutations cause lupus in the context of spondyloenchondrodysplasia. Detection of ACP5 missense variants in a lupus cohort suggests that impaired TRAP functioning may increase susceptibility to sporadic lupus.
Published: 2016

5. In vitro PUVA treatment triggers calreticulin exposition and HMGB1 release by dying T lymphocytes in GVHD: New insights in extracorporeal photopheresis

Author: Céline Coppard, Marion Humbert, Laurence Chaperot, Dalil Hannani, Virginie Gauthier, Etienne Merlin, Françoise Gabert, Joel Plumas, INSERM U823, équipe 9 (Immunobiologie et Immunothérapie des Cancers), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire recherche et développement, EFS, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), EFS Rhône-Alpes et Développement, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
Subjects: Naive T cell, Ultraviolet Rays, T-Lymphocytes, Phagocytosis, T cell, Graft vs Host Disease, Apoptosis, Flow cytometry, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Immune system, Extracorporeal Photopheresis, Humans, Medicine, HMGB1 Protein, Cells, Cultured, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, medicine.diagnostic_test, business.industry, Macrophages, Dendritic Cells, Hematology, General Medicine, Dendritic cell, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Cell culture, Photopheresis, 030220 oncology & carcinogenesis, Immunology, Methoxsalen, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Calreticulin, business
Abstract: Background Extracorporeal photopheresis (ECP) is an effective therapy for graft vs host disease (GVHD), based on infusion of UVA-irradiated and 8 methoxy-psoralen (PUVA)-treated leukocytes. Reinfusion of these apoptosing cells affects the functionality of pathogenic T cells through poorly understood immunomodulatory mechanisms. Apoptosis is usually a silent, tolerance-associated process, but can also be immunogenic, depending on death-inducers and environmental context. Methods To understand ECP mechanisms of action, human alloreactive T cells generated in an in vitro model mimicking GVHD were used, as well as primary cells from GVHD patients. Cells were submitted to PUVA treatment and their phenotype and immunogenicity were analyzed, using cell culture and flow cytometry. Results In vitro PUVA treatment induced the expression of several damage-associated molecular patterns (DAMPs) by dying T cells (calreticulin, high-mobility group box-1, and to a lesser extent heat shock proteins 70 and 90), especially upon T cell activation, leading to their phagocytosis by macrophages and dendritic cells (DCs). Allogeneic DCs preincubated with PUVA treated T cells induced comparable naive T cell proliferation and polarization as control allogeneic DC. Conclusion Altogether, in our experimental settings, in vitro PUVA-treatment induces a partially immunogenic phenotype allowing phagocytosis of apoptotic cells by macrophages and DC, however not sufficient to induce dendritic cell maturation and T cell activation. These data refine current models of ECP-mediated immune modulation and emphasize the need to further analyze PUVA-treated cell interactions with immune cells.
Published: 2019

6. LKB1 specifies neural crest cell fates through pyruvate-alanine cycling

Author: Sakina Torch, Nadege Bondurand, Laurence Lafanechère, Karin Pernet-Gallay, Anca G. Radu, Lionel Larue, Nicolas Tricaud, Véronique Delmas, Renaud Blervaque, Chantal Thibert, Pierre Hainaut, Anthony Lucas, Marc Billaud, Nabeel Bardeesy, Florence Fauvelle, Veronique Pingault, Uwe Schlattner, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), IRMaGe (IRMaGe ), CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Physiopathologie du Cytosquelette, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Air Normand, Laboratory of Fundamental and Applied Bioenergetics = Laboratoire de bioénergétique fondamentale et appliquée (LBFA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Equipe n°3 Inserm U823, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Earth and Life Institute, Stress Agronomy Group, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Institut des Neurosciences de Montpellier - Déficits sensoriels et moteurs (INM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), INSERM U955, équipe 11, Service de Biochimie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Massachusetts General Hospital Cancer Center, Harvard Medical School [Boston] (HMS), Ctr Rech, Institut Curie [Paris], Apoptose Cancer et Développement, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique moléculaire, signalisation et cancer (GMSC), This work was founded by 'l’Institut National du Cancer' (Programme recherche translationnelle en cancérologie), 'la Ligue régionale contre le cancer' (comité de l’Isère R17030CC), 'l’Association pour la Recherche sur le Cancer' (Fondation ARC R17158CC), and NIH/NCI (1R01CA219670-01A1)., We are grateful to E. Fontaine and K. Padmanabhan for helpful comments about the results. We thank J. Courchet, B. Viollet, and J. Maurer for sharing cells and reagents. We thank S. Michallet, B. Sefrin, and P. Vernet from the animal facility of the Institute for Advanced Biosciences and F. Blanquet and C. Colomb from the animal facility PHTA of Grenoble. We are grateful to D. Bouvard for giving us the R26R mice and to G. Chevallier for help with mouse breeding and genotyping. We thank V. Blanc-Marquis for technical help. S. Michallet and M. Schweitzer were very helpful with excellent technical assistance. C. Caron helped us with human sample studies. This work benefited from the help of T. Dufourd and M. Aguilera during their internships in the laboratory. J. Delaroche and A. Bertrand from the electron microscopy facility of the Neuroscience Institute of Grenoble performed semithin sections, staining, and electronic microscopy experiments and analyses. We thank N. Gadot and the ANIPATH facility, University Lyon1 Laennec, for tissue sections., Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Neurosciences de Montpellier (INM), Hamant, Sarah, and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], AMP-Activated Protein Kinases, Enteric Nervous System, Mice, 0302 clinical medicine, [SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], Pyruvic Acid, skin and connective tissue diseases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Research Articles, Mice, Knockout, 0303 health sciences, education.field_of_study, Multidisciplinary, Alanine, Neural crest, Peripheral Nervous System Diseases, SciAdv r-articles, Cell Differentiation, Cell biology, Mitochondria, [SDV] Life Sciences [q-bio], medicine.anatomical_structure, Phenotype, Neural Crest, embryonic structures, Melanocytes, Stem cell, Signal transduction, Neuroglia, Signal Transduction, Research Article, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, Population, Schwann cell, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Cell fate determination, Biology, Protein Serine-Threonine Kinases, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, Gene Silencing, education, 030304 developmental biology, [SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis, Cell Biology, Embryonic stem cell, [SDV.BDD.EO]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Embryology and Organogenesis, Nerve Degeneration, Enteric nervous system, Energy Metabolism, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology
Abstract: Glial specification of neural crest cells requires the tumor suppressor LKB1-mediated action on alanine biosynthesis., Metabolic processes underlying the development of the neural crest, an embryonic population of multipotent migratory cells, are poorly understood. Here, we report that conditional ablation of the Lkb1 tumor suppressor kinase in mouse neural crest stem cells led to intestinal pseudo-obstruction and hind limb paralysis. This phenotype originated from a postnatal degeneration of the enteric nervous ganglia and from a defective differentiation of Schwann cells. Metabolomic profiling revealed that pyruvate-alanine conversion is enhanced in the absence of Lkb1. Mechanistically, inhibition of alanine transaminases restored glial differentiation in an mTOR-dependent manner, while increased alanine level directly inhibited the glial commitment of neural crest cells. Treatment with the metabolic modulator AICAR suppressed mTOR signaling and prevented Schwann cell and enteric defects of Lkb1 mutant mice. These data uncover a link between pyruvate-alanine cycling and the specification of glial cell fate with potential implications in the understanding of the molecular pathogenesis of neural crest diseases.
Published: 2019

7. The Fami-life study: protocol of a prospective observational multicenter mixed study of psychological consequences of grieving relatives in French palliative care units on behalf of the family research in palliative care (F.R.I.P.C research network)

Author: Véronique Michonneau-Gandon, Laure Copel, Virginie Verliac, Dominique Gracia, Gaelle Ranchou, Willeme Kaczmarek, Emmanuel De Larivière, Maité Garrouste-Orgeas, Adrien Evin, Virginie Guastella, Catherine Verlaine, Frédéric Guirimand, Jean-François Timsit, Alaa Mhalla, Florent Bienfait, Licia Touzet, Guillaume Bouquet, Marie Sonrier, Laurence Birkui de Francqueville, Ségolène Perruchio, Cécile Flahault, Anne Vanbésien, Sébastien Bailly, Carmen Mathias, Virginie Fossez-Diaz, Edith Poulain, Stéphane Ruckly, Véronique Marché, Cécile Poupardin, Dominique Michel, Bruno Richard, Salvy-Córdoba, Nathalie, Epidémiologie pronostique des cancers et affections graves, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Psychopathologie et Processus de Santé (LPPS - EA 4057), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre de recherche Versailles Saint-Quentin Institutions Publiques (VIP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), CH de Troyes, Centre Hospitalier [Douai, Nord], Centre Hospitalier de la Dracénie [Draguignan], Centre Hospitalier Compiègne-Noyon, Centre Hospitalier Tourcoing, Groupe Hospitalier Diaconesses Croix Saint-Simon, Groupe hospitalier de la région de Mulhouse Sud-Alsace (GHRMSA), Hopital de Salon d eProvence, AP-HP Hôpital A. Chenevier [Créteil], Centre Hospitalier Intercommunal Castres-Mazamet, Service d'Hépato-Gastroentérologie, Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Groupe Hospitalier Intercommunal Le Raincy-Montfermeil, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hopital de Périgueux (CH Périgueux), Hopital de Périgueux, Centre de Soins Palliatifs [CHU Clermont-Ferrand] (CSP), CHU Louise Michel [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Informatique et Distribution (ID-IMAG), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Institut de psychiatrie et neurosciences de Paris (IPNP - U1266 Inserm), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U823, équipe 11 (Epidémiologie des cancers et des affections graves), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Clinique de réanimation médicale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon-Hôpital Michallon, CIC - CHU Bichat, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)
Subjects: medicine.medical_specialty, Palliative care, media_common.quotation_subject, lcsh:Special situations and conditions, [SDV.NEU.PC] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Psychology and behavior, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Anxiety, Study Protocol, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Clinical Protocols, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Surveys and Questionnaires, Humans, Medicine, Family, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Psychiatry, Depression (differential diagnoses), media_common, Interpretative phenomenological analysis, [SDV.NEU.PC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Psychology and behavior, business.industry, Minimal clinically important difference, Incidence (epidemiology), lcsh:RC952-1245, Post-traumatic, General Medicine, Stress disorders, Relatives, 3. Good health, 030220 oncology & carcinogenesis, Grief, Observational study, France, medicine.symptom, business
Abstract: Background Grieving relatives can suffer from numerous consequences like anxiety, depression, post-traumatic stress disorder (PTSD) symptoms, and prolonged grief. This study aims to assess the psychological consequences of grieving relatives after patients’ death in French palliative care units and their needs for support. Methods This is a prospective observational multicenter mixed study. Relatives of adult patients with a neoplasia expected to be hospitalized more than 72 h in a palliative care unit for end-of-life issues will be included within 48 h after patient admission. End-of-life issues are defined by the physician at patient admission. Relatives who are not able to have a phone call at 6-months are excluded. The primary outcome is the incidence of prolonged grief reaction defined by an ICG (Inventory Complicate Grief) > 25 (0 best-76 worst) at 6 months after patient’ death. Prespecified secondary outcomes are the risk factors of prolonged grief, anxiety and depression symptoms between day 3 and day 5 and at 6 months after patients’ death based on an Hospital Anxiety and Depression score (range 0–42) > 8 for each subscale (minimal clinically important difference: 2.5), post-traumatic stress disorder symptoms 6 months after patient’ death based on the Impact of Events Scale questionnaire (0 best-88 worst) score > 22, experience of relatives during palliative care based on the Fami-Life questionnaire, specifically built for the study. Between 6 and 12 months after the patient’s death, a phone interview with relatives with prolonged grief reactions will be planned by a psychologist to understand the complex system of grief. It will be analyzed with the Interpretative Phenomenological Analysis. We planned to enroll 500 patients and their close relatives assuming a 25% prolonged grief rate and a 6-month follow-up available in 60% of relatives. Discussion This study will be the first to report the psychological consequences of French relatives after a loss of a loved one in palliative care units. Evaluating relatives’ experiences can provide instrumental insights for means of improving support for relatives and evaluation of bereavement programs. Trial registration NCT03748225 registered on 11/19/2018. Recruiting patients.
Published: 2019

8. Prenatal Exposure to Select Phthalates and Phenols and Associations with Fetal and Placental Weight among Male Births in the EDEN Cohort (France)

Author: Rémy Slama, Nadia Alfaidy, Barbara Heude, Claire Philippat, Jérémie Botton, Antonia M. Calafat, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Equipe 6 : ORCHAD - Origines précoces de la santé du développement de l'enfant (CRESS - U1153), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Epidemiologia Ambiental, Centre for Research in Environmental Epidemiology (CREAL)-Spanish Consortium for Research on Epidemiology and Public Health (CIBERESP) of Pamplona-Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques (IMIM), Invasion mechanisms in angiogenesis and cancer (IMAC), Biologie du Cancer et de l'Infection (BCI ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centers for Disease Control and Prevention [Atlanta] (CDC), Centers for Disease Control and Prevention, INSERM U823, équipe 12 (Epidémiologie Environnementale appliquée à la Reproduction et la Santé Respiratoire), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Alfaidy, Nadia, and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Health, Toxicology and Mutagenesis, Birth weight, Placenta, Phthalic Acids, Physiology, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Phenols, Pregnancy, Epidemiology, Medicine, Birth Weight, Humans, 030212 general & internal medicine, Prospective Studies, Prospective cohort study, [SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Fetus, business.industry, Research, Public Health, Environmental and Occupational Health, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, Environmental Exposure, medicine.disease, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Maternal Exposure, Prenatal Exposure Delayed Effects, embryonic structures, Cohort, Female, France, business, Biomarkers, Cohort study
Abstract: Background: The placenta performs crucial physiological functions to ensure normal fetal development. Few epidemiological studies investigated placental weight sensitivity to phthalates and phenols. Objective: Our goal was to explore whether maternal exposure to select phthalates and phenols is associated with changes in placental weight at birth and in placental–to–birth weight ratio (PFR). Methods: Placental weight and birth weight were available for 473 mother–son pairs in the EDEN (Etude des Déterminants pré et postnatals du développement et de la santé de l’Enfant) cohort for whom 9 phenols (4 parabens, 2 dichlorophenols, triclosan, benzophenone-3, bisphenol A) and 11 phthalate metabolites were measured in spot urine samples collected between weeks 23 and 29 of gestation. We used adjusted Elastic Net penalized regression models (ENET) to select biomarkers associated with placental weight, birth weight and PFR. Unpenalized effect estimates were then obtained by fitting linear regression models simultaneously adjusted for the ENET-selected biomarkers and a priori chosen confounders. Results: The multipollutant ENET model for placental weight retained four biomarkers: triclosan and monocarboxy-isononyl phthalate (MCNP), which were negatively associated with placental weight, and benzophenone-3 and the sum of parabens, which were positively associated with this outcome. The ENET model for PFR retained two phthalate metabolites [MCNP and monocarboxy-isooctyl phthalate (MCOP)], which were negatively associated with this outcome. Discussion: The positive association between the sum of parabens and placental weight was consistent with results of a previous study among 49 male births. Our results provide preliminary evidence of possible associations between other compounds such as triclosan, benzophenone-3, MCNP, and MCOP and both placental weight and PFR. These associations were not reported in previous studies and should be seen as hypothesis generating. Studies relying on repeated assessments of exposure in prospective mother–child cohorts are needed to substantiate the plausibility of the hypotheses generated by our results. https://doi.org/10.1289/EHP3523
Published: 2019

9. Cellular tension encodes local Src-dependent differential β

Author: De Mets, Richard, Wang, Irène, Balland, Martial, Oddou, Christiane, Moreau, Philippe, Fourcade, Bertrand, Albiges-Rizo, Corinne, Delon, Antoine, Destaing, Olivier, Weaver, Valerie Marie, Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire de Spectrométrie Physique (LSP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d'Hématologie [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MOTIV, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM U823, équipe 1 (DySAD), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Subjects: [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Integrin, Green Fluorescent Proteins, 02 engineering and technology, Biology, Mechanotransduction, Cellular, Models, Biological, 03 medical and health sciences, Mice, Protein Domains, β3 integrin, Cell Adhesion, Animals, Phosphorylation, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Tension (physics), Integrin beta1, Spectrum Analysis, Integrin beta3, Correction, Cell Biology, Fibroblasts, 021001 nanoscience & nanotechnology, Cell biology, Biomechanical Phenomena, Protein Transport, src-Family Kinases, biology.protein, Brief Reports, 0210 nano-technology, Intracellular, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, Micropatterning
Abstract: Integrins are transmembrane receptors that have a pivotal role in mechanotransduction processes by connecting the extracellular matrix to the cytoskeleton. Although it is well established that integrin activation/inhibition cycles are due to highly dynamic interactions, whether integrin mobility depends on local tension and cytoskeletal organization remains surprisingly unclear. Using an original approach combining micropatterning on glass substrates to induce standardized local mechanical constraints within a single cell with temporal image correlation spectroscopy, we measured the mechanosensitive response of integrin mobility at the whole cell level and in adhesion sites under different mechanical constraints. Contrary to β1 integrins, high tension increases β3 integrin residence time in adhesive regions. Chimeric integrins and structure–function studies revealed that the ability of β3 integrins to specifically sense local tensional organization is mostly encoded by its cytoplasmic domain and is regulated by tuning the affinity of its NPXY domains through phosphorylation by Src family kinases.
Published: 2018

10. Polyheteroaryl Oxazole/Pyridine-Based Compounds Selected in Vitro as G-Quadruplex Ligands Inhibit Rock Kinase and Exhibit Antiproliferative Activity

Author: Verga, Daniela, N'guyen, Chi-Hung, Dakir, Malika, Coll, Jean-Luc, Teulade-Fichou, Marie-Paule, Molla, Annie, Chimie, Modélisation et Imagerie pour la Biologie [Orsay], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U823, équipe 4 (Chromatine et Epigénétique), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Pyridines, Stereochemistry, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Ligands, G-quadruplex, 01 natural sciences, Focal adhesion, Dephosphorylation, Structure-Activity Relationship, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Bipyridine, Drug Discovery, Pyridine, Humans, Structure–activity relationship, Oxazoles, Protein Kinase Inhibitors, Cell Proliferation, Oxazole, rho-Associated Kinases, 010405 organic chemistry, Kinase, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, 3. Good health, 0104 chemical sciences, G-Quadruplexes, 030104 developmental biology, chemistry, Drug Design, Molecular Medicine, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other, HeLa Cells
Abstract: International audience; Heptaheteroaryl compounds comprised of oxazole and pyridine units (TOxaPy) are quadruplex DNA (G4)-interactive compounds. Herein, we report on the synthesis of parent compounds bearing either amino side chains (TOxaPy-1− 5) or featuring an isomeric oxazole-pyridine central connectivity (iso-TOxapy, iso-TOxapy 1−3) or a bipyridine core (iso-TOxabiPy). The new isomeric series showed significant G4-binding activity in vitro, and remarkably, three compounds (iso-TOxaPy, iso-TOxaPy-1, and iso-TOxabiPy) exhibited high antiproliferative activity toward a tumor panel of cancer cell lines. However, these compounds do not behave as typical G-quadruplex (G4) binders, and the kinase profiling assay revealed that the best antiproliferative molecule iso-TOxaPy selectively inhibited Rock-2. The targeting of Rock kinase was confirmed in cells by the dephosphorylation of Rock-2 substrates, the decrease of stress fibers, and peripheral focal adhesions, as well as the induction of long neurite-like extensions. Remarkably, two of these molecules were able to inhibit the growth of cells organized as spheroids.
Published: 2018

11. The CCM1–CCM2 complex controls complementary functions of ROCK1 and ROCK2 that are required for endothelial integrity

Author: Lisowska, Justyna, Rödel, Claudia Jasmin, Manet, Sandra, Miroshnikova, Yekaterina, Boyault, Cyril, Planus, Emmanuelle, De Mets, Richard, Lee, Hsiao-Hui, Destaing, Olivier, Mertani, Hichem, Boulday, Gwénola, Tournier-Lasserve, Elisabeth, Balland, Martial, Abdelilah-Seyfried, Salim, Albiges-Rizo, Corinne, Faurobert, Eva, Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie moléculaire et cellulaire de la différenciation, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Albert Bonniot-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), U823, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon], Génétique des maladies vasculaires, Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR6, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM U823, équipe 1 (DySAD), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Albert Bonniot (IAB), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Matière et Systèmes Complexes (MSC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Equipe de Recherche Labellisée 3148, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: CCM, Mechanotransduction, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], ddc:570, Endothelial integrity, [SDV]Life Sciences [q-bio], ROCK, [SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Institut für Biochemie und Biologie, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Endothelial integrity relies on a mechanical crosstalk between intercellular and cell-matrix interactions. This crosstalk is compromised in hemorrhagic vascular lesions of patients carrying loss-of-function mutations in cerebral cavernous malformation (CCM) genes. RhoA/ROCK-dependent cytoskeletal remodeling is central to the disease, as it causes unbalanced cell adhesion towards increased cell-extracellular matrix adhesions and destabilized cell-cell junctions. This study reveals that CCM proteins directly orchestrate ROCK1 and ROCK2 complementary roles on the mechanics of the endothelium. CCM proteins act as a scaffold, promoting ROCK2 interactions with VE-cadherin and limiting ROCK1 kinase activity. Loss of CCM1 (also known as KRIT1) produces excessive ROCK1-dependent actin stress fibers and destabilizes intercellular junctions. Silencing of ROCK1 but not ROCK2 restores the adhesive and mechanical homeostasis of CCM1 and CCM2-depleted endothelial monolayers, and rescues the cardiovascular defects of ccm1 mutant zebrafish embryos. Conversely, knocking down Rock2 but not Rock1 in wild-type zebrafish embryos generates defects reminiscent of the ccm1 mutant phenotypes. Our study uncovers the role of the CCM1-CCM2 complex in controlling ROCK1 and ROCK2 to preserve endothelial integrity and drive heart morphogenesis. Moreover, it solely identifies the ROCK1 isoform as a potential therapeutic target for the CCM disease.
Published: 2018

12. Survival benefit of mantle cell lymphoma patients enrolled in clinical trials : a joint study from the LYSA group and French cancer registries

Author: Olivier Hermine, Alain Monnereau, Anne Moreau, Marc Maynadié, Brigitte Trétarre, Remy Gressin, Xavier Troussard, Alix Augustin, Patricia Delafosse, Aurélie Bertaut, Steven Le Gouill, Anne-Sophie Woronoff, Registre des hémopathies malignes de Côte d'Or, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CIC Plurithématique de Nantes, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ministère des Affaires sociales et de la Santé-Direction générale de l'offre de soins (DGOS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Unité de biostatistiques [Centre Georges-François Leclerc], Centre Régional de Lutte contre le cancer - Centre Georges-François Leclerc ( CRLCC - CGFL ), Plateforme de génétique moléculaire des cancers d'Aquitaine, Institut Bergonié - CRLCC Bordeaux, FRANCIM, Réseau des registres français du cancer, Francim : Réseau français des registres des cancers, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire de Mathématiques et Applications ( LMA-Poitiers ), Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), AUGUSTIN, ALIX, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ministère des Affaires sociales et de la Santé-Direction générale de l'offre de soins (DGOS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Regulation of Bcl2 and p53 Networks in Multiple Myeloma and Mantle Cell Lymphoma (CRCINA-ÉQUIPE 10), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER, Institut Bergonié [Bordeaux], Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Registre des hémopathies malignes de Basse-Normandie [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Laboratoire de Mathématiques et Applications (LMA-Poitiers), Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)
Subjects: Male, Cancer Research, medicine.medical_specialty, Multivariate analysis, Population, Lymphoma, Mantle-Cell, Logistic regression, Prognostic factors, Population-based registry, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Internal medicine, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Antineoplastic Combined Chemotherapy Protocols, medicine, Humans, Registries, 10. No inequality, education, Aged, Neoplasm Staging, education.field_of_study, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Mantle cell lymphoma, business.industry, Age Factors, Cancer, General Medicine, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, Lymphoma, Non-Hodgkin's lymphoma, Clinical trial, Oncology, Case-Control Studies, 030220 oncology & carcinogenesis, Non-Hodgkin’s lymphoma, Physical therapy, Female, France, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, 030215 immunology, Clinical trial inclusion
Abstract: IF 3.503; International audience; PurposeMantle cell lymphoma (MCL) is a rare non-Hodgkin’s lymphoma entity with a poor prognosis. Therapeutic advances have improved the survival of patients enrolled in clinical trials; however, their impact on patients outside clinical trials remains unclear. In this work, we compared patient outcome inside and outside clinical trials.MethodsWe identified MCL patients recorded in six French population-based registries between 2008 and 2012 to perform a comparison with patients enrolled in two prospective multicenter MCL clinical trials conducted by the LYSA group during the same period. Variables associated with inclusion in a clinical trial were identified using a logistic regression. Pohar-Perme estimator and Nelson et al. flexible parametric model was used to estimate net survival probabilities and prognosis factors on excess mortality.ResultsA total of 312 registry patients were compared to the 372 patients enrolled in LYSA clinical trials. Patients included in clinical trials were younger (median age 60 vs 74, p < 0.001). Age and Ann Arbor stage IV were independently associated with enrollment [OR = 0.09 (0.06–0.12) and OR = 1.61 (1.11–2.34), respectively]. The 4 year net survival was better in clinical trials [79.9% (75.9–84.7) vs 60.3% (53.6–67.0)]. This result was confirmed in multivariate analysis in patients older than 65 years with a lower excess mortality rate [0.33 (0.17–0.66)].ConclusionsMCL included in trials are highly selected patients who are not representative of MCL patients who are encountered in everyday practice. With widened inclusion criteria, clinical trial patients could be more representative of the general population.
Published: 2018

13. The MEK1/2-ERK Pathway Inhibits Type I IFN Production in Plasmacytoid Dendritic Cells

Author: Vaclav Janovec, Besma Aouar, Albert Font-Haro, Tomas Hofman, Katerina Trejbalova, Jan Weber, Laurence Chaperot, Joel Plumas, Daniel Olive, Patrice Dubreuil, Jacques A. Nunès, Ruzena Stranska, Ivan Hirsch, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille ( CRCM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut Paoli-Calmettes-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Viral and Cellular Genetics, Institute of Molecular Genetics, Czech Academy of Sciences [Prague] ( ASCR ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), INSERM U823, équipe 9 (Immunobiologie et Immunothérapie des Cancers), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Laboratoire recherche et développement, EFS, Laboratoire d'Immunologie des Tumeurs, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut Paoli-Calmettes, Czech Academy of Sciences [Prague] (CAS), Charles University [Prague] (CU), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Etablissement français du sang- Rhône-Alpes [Lyon], Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), and This work was supported by grants from the Grantova Agentura Ceske Republiky (Czech Science Foundation) grant no. 14-32547S (IH) and by Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer. This work was also supported by institutional grants from the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, the Centre National de la Recherche Scientifique and Aix-Marseille Université to CRCM, and from Charles University, GAUK-434616 (AFH), SVV 260426. BIOCEV – Biotechnology and Biomedicine Centre of the Academy of Sciences and Charles University (CZ.1.05/1.1.00/02.0109) from the European Regional Development Fund (http://www.biocev.eu/) (IH). Ligue contre le cancer (http://www.ligue-cancer.net/) (BA). Algerian Ministry of Higher Education and Research, and Franco-Algerian Cooperation (BA).
Subjects: 0301 basic medicine, MAPK/ERK pathway, toll-like receptors 7 and 9 (TLR7/9), lcsh:Immunologic diseases. Allergy, Cell signaling, MAP Kinase Signaling System, B-cell receptor, Immunology, MAP Kinase Kinase 2, MAP Kinase Kinase 1, blood dendritic cell antigen 2, Receptors, Antigen, B-Cell, Proinflammatory cytokine, Cell Line, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, regulatory receptors, Immunology and Allergy, Humans, Calcium Signaling, Extracellular Signal-Regulated MAP Kinases, Protein kinase C, Protein Kinase C, Original Research, B-Lymphocytes, c-FOS, MEK1/2, Innate immune system, Chemistry, NF-kappa B, hemic and immune systems, Dendritic cell, TLR7, Dendritic Cells, 3. Good health, Cell biology, 030104 developmental biology, plasmacytoid dendritic cells, Toll-Like Receptor 9, Interferon Type I, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, type I interferon, B cell-like receptor signaling, lcsh:RC581-607, Proto-Oncogene Proteins c-fos, 030215 immunology
Abstract: International audience; Recent studies have reported that the crosslinking of regulatory receptors (RRs), such as blood dendritic cell antigen 2 (BDCA-2) (CD303) or ILT7 (CD85g), of plasmacytoid dendritic cells (pDCs) efficiently suppresses the production of type I interferons (IFN-I, α/β/ω) and other cytokines in response to toll-like receptor 7 and 9 (TLR7/9) ligands. The exact mechanism of how this B cell receptor (BCR)-like signaling blocks TLR7/9-mediated IFN-I production is unknown. Here, we stimulated BCR-like signaling by ligation of RRs with BDCA-2 and ILT7 mAbs, hepatitis C virus particles, or BST2 expressing cells. We compared BCR-like signaling in proliferating pDC cell line GEN2.2 and in primary pDCs from healthy donors, and addressed the question of whether pharmacological targeting of BCR-like signaling can antagonize RR-induced pDC inhibition. To this end, we tested the TLR9-mediated production of IFN-I and proinflammatory cytokines in pDCs exposed to a panel of inhibitors of signaling molecules involved in BCR-like, MAPK, NF-ĸB, and calcium signaling pathways. We found that MEK1/2 inhibitors, PD0325901 and U0126 potentiated TLR9-mediated production of IFN-I in GEN2.2 cells. More importantly, MEK1/2 inhibitors significantly increased the TLR9-mediated IFN-I production blocked in both GEN2.2 cells and primary pDCs upon stimulation of BCR-like or phorbol 12-myristate 13-acetate-induced protein kinase C (PKC) signaling. Triggering of BCR-like and PKC signaling in pDCs resulted in an upregulation of the expression and phoshorylation of c-FOS, a downstream gene product of the MEK1/2-ERK pathway. We found that the total level of c-FOS was higher in proliferating GEN2.2 cells than in the resting primary pDCs. The PD0325901-facilitated restoration of the TLR9-mediated IFN-I production correlated with the abrogation of MEK1/2-ERK-c-FOS signaling. These results indicate that the MEK1/2-ERK pathway inhibits TLR9-mediated type I IFN production in pDCs and that pharmacological targeting of MEK1/2-ERK signaling could be a strategy to overcome immunotolerance of pDCs and re-establish their immunogenic activity.
Published: 2018

14. Toward the Standardization of Mycological Examination of Sputum Samples in Cystic Fibrosis : Results from a French Multicenter Prospective Study

Author: Lafarge, Céline, Pontoire, Bruno, Cayot, Nathalie, Le Bail, Patricia, Coron, Noémie, Pihet, Marc, Fréalle, Emilie, Lemeille, Yolande, Pinel, Claudine, Pelloux, Hervé, Gargala, Gilles, Favennec, Loïc, Accoceberry, Isabelle, Durand-Joly, Isabelle, Dalle, Frédéric, Huet, Frédéric, Fanton, Annlyse, Boldron, Amale, Loeuille, Guy-André, Domblides, Philippe, Coltey, Bérengère, Pin, Isabelle, Llerena, Catherine, Troussier, Françoise, Person, Christine, Marguet, Christophe, Wizla, Nathalie, Thumerelle, Caroline, Turck, Dominique, Bui, Stéphanie, Fayon, Michael, Duhamel, Alain, Prévotat, Anne, Leroy, Sylvie, Wallaert, Benoit, Bouchara, Jean-Philippe, Delhaes, Laurence, Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ATOMycA (CRCINA-ÉQUIPE 6), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA), Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Université d'Angers (UA), Laboratoire de Parasitologie et Mycologie (Parasito - Myco - LILLE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie (UGA UFRP), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Pôle Biologie, Institut de Biologie et Pathologie, Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble, Laboratoire de parasitologie-mycologie, CHU Grenoble, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Appareil Digestif Environnement Nutrition (ADEN ), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Interactions Muqueuses Agents Transmissibles (LIMA), Université de Bourgogne (UB), Service de pédiatrie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre de Ressources et de Compétences de la Mucoviscidose [CHU Dijon] (CRCM ), CHU Bordeaux, Ctr Rech Mucoviscidose CRCM Adulte, CHU Bordeaux [Bordeaux], CRCM Adulte [Grenoble], Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pédiatrie générale et maladies infectieuses, Service de Pneumologie Pédiatrique [Angers], Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Centre Robert Debré, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service de pédiatrie médicale et médecine de l'adolescent [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Clinique de Pédiatrie, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille], Pediatrics, CHU Bordeaux, Dept Pediat CRCM, INSERM Ctr Invest Clin CIC5, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Cardio-thoracique de Bordeaux, U1045, Institut d'Informatique et de Mathématiques Appliquées de Grenoble (IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Pneumologie, Hôpital A. Calmette, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU de Nice), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle], Pole Cardio-vasculaire et pulmonaire [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de Parasitologie et de Mycologie [Lille], Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), French Ministry of Health and Research (PHRC N°2006/1902), the association 'Vaincre la Mucoviscidose' (Defeat Cystic Fibrosis) (MucoFong and Mucofong-ATF N8 2006/351), the Pharmaceutical Division of Pfizer France (Nu 2006/158), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD), ATIP AVENIR / ATOMycA (CRCINA - Département INCIT - Equipe 6), Centre de recherche de Cancérologie et d'Immunologie / Nantes - Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Parasite (GEIHP), Université Grenoble Alpes (UGA), Service de Pédiatrie, Centre de Ressources et de Compétences de la Mucoviscidose [Dijon], Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA), Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle], Institut de Microbiologie [CHRU Lille], Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), université de Bourgogne, PAM, Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Université de Bordeaux (UB), CH Dunkerque, Centre de Recherche en Chimie Moléculaire (CRCM), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe de Recherche sur les Antimicrobiens et les Micro-Organismes (GRAM 1.0), CHU Lille, CIC Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Etudes et de Recherche en Informatique Médicale [Lille] (CERIM), Hôpital Pasteur [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] ( PAM ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages ( BIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), ATIP AVENIR / ATOMycA ( CRCINA - Département INCIT - Equipe 6 ), Centre de recherche de Cancérologie et d'Immunologie / Nantes - Angers ( CRCINA ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Santé de l'Université de Nantes ( IRS-UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ) -Université d'Angers ( UA ) -Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Santé de l'Université de Nantes ( IRS-UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Parasite ( GEIHP ), Université d'Angers ( UA ), Laboratoire de Parasitologie et Mycologie ( Parasito - Myco - LILLE ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie ( UGA UFRP ), Université Grenoble Alpes ( UGA ), Appareil Digestif Environnement Nutrition ( ADEN ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité ( MCMP ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Interactions Muqueuses Agents Transmissibles ( LIMA ), Université de Bourgogne ( UB ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers-Centre Robert Debré, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ), CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, Institut d'Informatique et de Mathématiques Appliquées de Grenoble ( IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Nice ( CHU de Nice ), Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] ( CRCTB ), and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: Adult, Male, Microbiological Techniques, 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, Filamentous fungi, Adolescent, Veterinary (miscellaneous), Lung mycobiota, 030106 microbiology, Biology, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, Cystic fibrosis, Aspergillus fumigatus, Molds, Young Adult, 03 medical and health sciences, Medical microbiology, Exophiala, Mycological examination, medicine, Humans, Prospective Studies, Child, Candida albicans, [ SDV.MP.MYC ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Aged, Aged, 80 and over, Aspergillus, Lung Diseases, Fungal, Fungi, Sputum, Scedosporium apiospermum, Middle Aged, biology.organism_classification, [SDV.MP.MYC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Corpus albicans, 030104 developmental biology, Female, France, medicine.symptom, Agronomy and Crop Science
Abstract: IF 1.710; International audience; Fungal respiratory colonization of cystic fibrosis (CF) patients emerges as a new concern; however, the heterogeneity of mycological protocols limits investigations. We first aimed at setting up an efficient standardized protocol for mycological analysis of CF sputa that was assessed during a prospective, multicenter study: “MucoFong” program (PHRC-06/1902). Sputa from 243 CF patients from seven centers in France were collected over a 15-month period and submitted to a standardized protocol based on 6 semi-selective media. After mucolytic pretreatment, sputa were plated in parallel on cycloheximide-enriched (ACT37), erythritol-enriched (ERY37), benomyl dichloran–rose bengal (BENO37) and chromogenic (CAN37) media incubated at 37 °C and on Sabouraud–chloramphenicol (SAB27) and erythritol-enriched (ERY27) media incubated at 20–27 °C. Each plate was checked twice a week during 3 weeks. Fungi were conventionally identified; time for detection of fungal growth was noted for each species. Fungal prevalences and media performances were assessed; an optimal combination of media was determined using the Chi-squared automatic interaction detector method. At least one fungal species was isolated from 81% of sputa. Candida albicans was the most prevalent species (58.8%), followed by Aspergillus fumigatus (35.4%). Cultivation on CAN37, SAB27, ACT37 and ERY27 during 16 days provided an optimal combination, detecting C. albicans, A. fumigatus, Scedosporium apiospermum complex and Exophiala spp. with sensitivities of 96.5, 98.8, 100 and 100%. Combination of these four culture media is recommended to ensure the growth of key fungal pathogens in CF respiratory specimens. The use of such consensual protocol is of major interest for merging results from future epidemiological studies.
Published: 2018

15. Myoconductive and osteoinductive free-standing polysaccharide membranes

Author: Jonathan Lavaud, Jean-Luc Coll, João F. Mano, Catherine Picart, Claire Monge, Sofia G. Caridade, Raphael Guillot, Jorge Almodovar, Véronique Josserand, Laboratoire des matériaux et du génie physique (LMGP ), Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM U823 Grenoble, Institut Albert Bonniot, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U823, équipe 5 (cibles diagnostiques ou thérapeutiques et vectorisation de drogues dans le cancer du poumon), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Jean Lamour (IJL), Université de Lorraine (UL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Universidade do Minho
Subjects: free-standing membranes, layer-by-layer, Bone Morphogenetic Protein 2, 02 engineering and technology, Muscle Development, Bone tissue, 01 natural sciences, Biochemistry, Myoblasts, Chitosan, Mice, chemistry.chemical_compound, Tissue engineering, Osteogenesis, Transforming Growth Factor beta, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cell Differentiation, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, General Medicine, 021001 nanoscience & nanotechnology, Recombinant Proteins, 3. Good health, Cross-Linking Reagents, Membrane, medicine.anatomical_structure, Drug delivery, 0210 nano-technology, Biotechnology, Materials science, Biomedical Engineering, 010402 general chemistry, Time-Lapse Imaging, Bone morphogenetic protein 2, Article, Biomaterials, Osseointegration, Polysaccharides, In vivo, medicine, Animals, Humans, Molecular Biology, Cell Proliferation, Science & Technology, Membranes, Artificial, X-Ray Microtomography, 0104 chemical sciences, Osteoinduction, chemistry, Microscopy, Electron, Scanning, Wound healing, Biomedical engineering
Abstract: Free-standing (FS) membranes have increasing applications in the biomedical field as drug delivery systems for wound healing and tissue engineering. Here, we studied the potential of free-standing membranes made by the layer-by-layer assembly of chitosan and alginate to be used as a simple biomimetic system of the periosteum. The design of a periosteum-like membrane implies the elaboration of a thick membrane suitable for both muscle and bone formation. Our aim was to produce well-defined ∼50 μm thick polysaccharide membranes that could be easily manipulated, were mechanically resistant, and would enable both myogenesis and osteogenesis in vitro and in vivo. The membranes were chemically crosslinked to improve their mechanical properties. Crosslinking chemistry was followed via Fourier transform infrared spectroscopy and the mechanical properties of the membranes were assessed using dynamic mechanical analysis. The loading and release of the potent osteoinductive growth factor bone morphogenetic protein 2 (BMP-2) inside and outside of the FS membrane was followed by fluorescence spectroscopy in a physiological buffer over 1 month. The myogenic and osteogenic potentials of the membranes in vitro were assessed using BMP-2-responsive skeletal myoblasts. Finally, their osteoinductive properties in vivo were studied in a preliminary experiment using a mouse ectopic model. Our results showed that the more crosslinked FS membranes enabled a more efficient myoblast differentiation in myotubes. In addition, we showed that a tunable amount of BMP-2 can be loaded into and subsequently released from the membranes, depending on the crosslinking degree and the initial BMP-2 concentration in solution. Only the more crosslinked membranes were found to be osteoinductive in vivo. These polysaccharide-based membranes have strong potential as a periosteum-mimetic scaffold for bone tissue regeneration., This work was financially supported by the Foundation for Science and Technology (FCT) through the scholarship SFRH/BPD/96797/2013, Fundo Social Europeu (FSE), and Programa Diferencial de Potencial Human (POPH) granted to Sofia G. Caridade. C.M. is indebted to the Association Francaise contre les Myopathies for financial support via a post-doctoral fellowship (AFM project 16673). J.A. acknowledges the Whitaker International Fellows and Scholars Program for support via a post-doctoral fellowship. This work was supported by the European Commission (FP7 program) via a European Research Council starting grant (BIOMIM, GA 259370 to C.P.) and by the AFM (grant Microtiss, 16530). We thank Isabelle Paintrand for her technical help with the confocal apparatus.
Published: 2015

16. Two-photon multiplexing bio-imaging using a combination of Eu- and Tb-bioprobes

Author: Virginie Placide, Delphine Pitrat, Alain Duperray, Alexei Grichine, Chantal Andraud, Anh Thy Bui, Olivier Maury, Laboratoire de Chimie - UMR5182 (LC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut de Chimie du CNRS (INC), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Lanthanide, Photons, Luminescent Agents, Microscope, Materials science, Nanotechnology, Multiplexing, Molecular Imaging, law.invention, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Inorganic Chemistry, Bio imaging, Europium, Two-photon excitation microscopy, law, Cell Line, Tumor, Research studies, Humans, Terbium, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Excitation
Abstract: During the course of our research studies aiming to combine the unique photophysical properties of lanthanide complexes and the intrinsic advantage of a nonlinear two-photon excitation, we described the proof-of-concept of a biphotonic multiplexing bio-imaging experiment. To that end, a new Tb-luminescent bioprobe [TbL(2)] was designed using the TACN-trispicolinate platform. The biphotonic imaging of T24 fixed cells stained either with [TbL(2)] or with the already described [EuL(1)] complexes is reported. Finally the biphotonic multiplexing experiment was performed using a combination of both probes using the spectral mode of the two-photon microscope.
Published: 2015

17. Effect of Systematic Intensive Care Unit Triage on Long-term Mortality Among Critically Ill Elderly Patients in France : A Randomized Clinical Trial

Author: Guidet, Bertrand, Leblanc, Guillaume, Tabassome, Simon, Woimant, Maguy, Quenot, Jean-Pierre, Ganansia, Olivier, Maignan, Maxime, Yordanov, Youri, Delerme, Samuel, Doumenc, Benoit, Fartoukh, Muriel, Charestan, Pierre, Trognon, Pauline, Galichon, Bertrand, Javaud, Nicolas, Patzak, Anabela, Garrouste-Orgeas, Maïté, Thomas, Caroline, Azerad, Sylvie, Pateron, Dominique, Boumendil, Ariane, Service de Réanimation Médicale [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Epidémiologie, Systèmes d'Information, Modélisation, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Réanimation Médicale (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Equipe LIPNESS (LNC - U1231) (LIPNESS), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des urgences, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Bichat, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Robert Ballanger [Aulnay-sous-Bois], Hôpital Notre Dame de Bon Secours, GH Saint-Joseph, Hôpital Lariboisière, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AP-HP, Hôpital Ambroise Paré, Unité de Recherche Clinique et Département de Santé Publique, Service des Urgences [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Service de pharmacologie clinique [CHU Saint-Antoine], Hôpital avicenne, Université Paris 13 ( UP13 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Avicenne, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Equipe LIPNESS (LNC - U1231) ( LIPNESS ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité ( CRESS (U1153 / UMR_A 1125) ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Bichat, Unité de Soins Intensifs, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Tenon [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Lariboisière-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Hôpital Jean Verdier, Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] ( HEGP ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], CHU Saint-Antoine [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Avicenne, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Bichat, CHU Tenon [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Lariboisière-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Hôpital Jean Verdier [Bondy], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), and Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Avicenne
Subjects: Clinical trials, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Importance:The high mortality rate in critically ill elderly patients has led to questioning of the beneficial effect of intensive care unit (ICU) admission and to a variable ICU use among this population.Objective:To determine whether a recommendation for systematic ICU admission in critically ill elderly patients reduces 6-month mortality compared with usual practice.Design, Setting, and Participants:Multicenter, cluster-randomized clinical trial of 3037 critically ill patients aged 75 years or older, free of cancer, with preserved functional status (Index of Independence in Activities of Daily Living ≥4) and nutritional status (absence of cachexia) who arrived at the emergency department of one of 24 hospitals in France between January 2012 and April 2015 and were followed up until November 2015.Interventions:Centers were randomly assigned either to use a program to promote systematic ICU admission of patients (n=1519 participants) or to follow standard practice (n=1518 participants).Main Outcomes and Measures:The primary outcome was death at 6 months. Secondary outcomes included ICU admission rate, in-hospital death, functional status, and quality of life (12-Item Short Form Health Survey, ranging from 0 to 100, with higher score representing better self-reported health) at 6 months.Results:One patient withdrew consent, leaving 3036 patients included in the trial (median age, 85 [interquartile range, 81-89] years; 1361 [45%] men). Patients in the systematic strategy group had an increased risk of death at 6 months (45% vs 39%; relative risk [RR], 1.16; 95% CI, 1.07-1.26) despite an increased ICU admission rate (61% vs 34%; RR, 1.80; 95% CI, 1.66-1.95). After adjustments for baseline characteristics, patients in the systematic strategy group were more likely to be admitted to an ICU (RR, 1.68; 95% CI, 1.54-1.82) and had a higher risk of in-hospital death (RR, 1.18; 95% CI, 1.03-1.33) but had no significant increase in risk of death at 6 months (RR, 1.05; 95% CI, 0.96-1.14). Functional status and physical quality of life at 6 months were not significantly different between groups.Conclusions and Relevance:Among critically ill elderly patients in France, a program to promote systematic ICU admission increased ICU use but did not reduce 6-month mortality. Additional research is needed to understand the decision to admit elderly patients to the ICU.Trial Registration: clinical trials.gov Identifier: NCT01508819.
Published: 2017

18. Rituximab after Autologous Stem-Cell Transplantation in Mantle-Cell Lymphoma

Author: Steven, Le Gouill, Catherine, Thieblemont, Lucie, Oberic, Anne, Moreau, Krimo, Bouabdallah, Caroline, Dartigeas, Gandhi, Damaj, Thomas, Gastinne, Vincent, Ribrag, Pierre, Feugier, Olivier, Casasnovas, Hacène, Zerazhi, Corinne, Haioun, Hervé, Maisonneuve, Roch, Houot, Fabrice, Jardin, Eric, Van Den Neste, Olivier, Tournilhac, Katell, Le Dû, Franck, Morschhauser, Guillaume, Cartron, Luc-Matthieu, Fornecker, Danielle, Canioni, Mary, Callanan, Marie C, Béné, Gilles, Salles, Hervé, Tilly, Thierry, Lamy, Remy, Gressin, Olivier, Hermine, Marie-Helène, Delfau-Larue, Regulation of Bcl2 and p53 Networks in Multiple Myeloma and Mantle Cell Lymphoma (CRCINA-ÉQUIPE 10), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Mathématiques de Jussieu (IMJ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Bordeaux [Bordeaux], Nutrition, croissance et cancer (U 1069) (N2C), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Hématologie [CHU Amiens], CHU Amiens-Picardie, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hématopoïèse normale et pathologique (U1170 Inserm), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d’Innovation Thérapeutique et essais précoces [Gustave Roussy] (DITEP), Institut Gustave Roussy (IGR), Service d'Hématologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service d'Hématologie Clinique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Médecine Interne Onco-hématologie, Centre Hospitalier Général, Service d'hématologie clinique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service d'hématologie, Centre hospitalier La Roche-Sur-Yon, CHU Pontchaillou [Rennes], Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques (GPMCND), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cliniques Universitaires Saint-Luc [Bruxelles], Role of intra-Clonal Heterogeneity and Leukemic environment in ThErapy Resistance of chronic leukemias (CHELTER), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Clinique Victor Hugo [Le Mans], Biophysique, Médecine Nucléaire et Technologies Médicales (EA 1049), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service d'hématologie et oncologie médicale, Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Lapeyronie-Université de Montpellier (UM), CHU Strasbourg, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), INSERM U823, équipe 7 (Voies Oncogéniques Des Hémopathies Malignes), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Immunobiology of Human αβ and γδ T Cells and Immunotherapeutic Applications (CRCINA-ÉQUIPE 1), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Hôpital Saint-Louis, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole ( IUCT Oncopole - UMR 1037 ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Nutrition, croissance et cancer (U 1069) ( N2C ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Tours, CHU Caen, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Département d'hématologie [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy ( IGR ), Hématopoïèse normale et pathologique ( U1170 Inserm ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), University Hospital of Nancy, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Service de Médecine Onco-hématologie [La Roche sur Yon], Centre Hospitalier Universitaire de Nantes, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou, Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer ( MICMAC ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Groupe d'étude des proliférations lymphoïdes ( GPL ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Role of intra-Clonal Heterogeneity and Leukemic environment in ThErapy Resistance of chronic leukemias - Clermont Auvergne ( CHELTER ), Université Clermont Auvergne ( UCA ), Hôpital Claude Huriez-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Génétique, Immunothérapie, Chimie et Cancer ( GICC ), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien ( IPHC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service d'anatomie pathologique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Service d'hématologie [Hôpital Edouard Herriot - HCL], Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Adaptateurs de signalisation en hématologie ( ASIH ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Tours, and Hôpital Lapeyronie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Randomization, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], Lymphoma, Mantle-Cell, Hematopoietic stem cell transplantation, Transplantation, Autologous, Dexamethasone, Maintenance Chemotherapy, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Autologous stem-cell transplantation, Maintenance therapy, Antineoplastic Combined Chemotherapy Protocols, Humans, Immunologic Factors, Medicine, [ SDV.MHEP.HEM ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Proportional Hazards Models, business.industry, Cytarabine, Hematopoietic Stem Cell Transplantation, General Medicine, Middle Aged, medicine.disease, Combined Modality Therapy, Survival Analysis, 3. Good health, Lymphoma, Surgery, Transplantation, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, Mantle cell lymphoma, Rituximab, Cisplatin, business, 030215 immunology, medicine.drug
Abstract: Mantle-cell lymphoma is generally incurable. Despite high rates of complete response after initial immunochemotherapy followed by autologous stem-cell transplantation, patients have relapses. We investigated whether rituximab maintenance therapy at a dose of 375 mg per square meter of body-surface area administered every 2 months for 3 years after transplantation would prolong the duration of response.In a phase 3 trial involving 299 patients who were younger than 66 years of age at diagnosis, we randomly assigned 240 patients to receive rituximab maintenance therapy or to undergo observation after autologous stem-cell transplantation (120 patients per group); 59 patients did not undergo randomization. The primary end point was event-free survival (with an event defined as disease progression, relapse, death, allergy to rituximab, or severe infection) after transplantation among patients who underwent randomization.After four courses of immunochemotherapy induction (rituximab, dexamethasone, cytarabine, and a platinum derivative [R-DHAP]), the overall response rate was 89%, and the complete response rate 77%. Transplantation was performed in 257 patients. The median follow-up from randomization after transplantation was 50.2 months (range, 46.4 to 54.2). Starting from randomization, the rate of event-free survival at 4 years was 79% (95% confidence interval [CI], 70 to 86) in the rituximab group versus 61% (95% CI, 51 to 70) in the observation group (P=0.001). The rate of progression-free survival at 4 years was 83% (95% CI, 73 to 88) in the rituximab group versus 64% (95% CI, 55 to 73) in the observation group (P0.001). The rate of overall survival was 89% (95% CI, 81 to 94) in the rituximab group versus 80% (95% CI, 72 to 88) in the observation group (P=0.04). According to a Cox regression unadjusted analysis, the rate of overall survival at 4 years was higher in the rituximab group than in the observation group (hazard ratio for death, 0.50; 95% CI, 0.26 to 0.99; P=0.04).Rituximab maintenance therapy after transplantation prolonged event-free survival, progression-free survival, and overall survival among patients with mantle-cell lymphoma who were younger than 66 years of age at diagnosis. (Funded by Roche and Amgen; LyMa ClinicalTrials.gov number, NCT00921414 .).
Published: 2017

19. Mechanosensitivity of Cancer Cells in Contact with Soft Substrates Using AFM

Author: Valentin Laplaud, Claude Verdier, Yara Abidine, Vinoth Sundar Rajan, Alain Duperray, Richard Michel, Valérie M. Laurent, Andrei Constantinescu, LIPHY-DYFCOM, Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Laboratoire de mécanique des solides (LMS), École polytechnique (X)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), ANR-12-BS09-0020,TRANSMIG,Migration transendothéliale de cellules cancéreuses(2012), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), École polytechnique (X)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), DYFCOM, Verdier, Claude, BLANC - Migration transendothéliale de cellules cancéreuses - - TRANSMIG2012 - ANR-12-BS09-0020 - BLANC - VALID, DYnamique des Fluides COmplexes et Morphogénèse [Grenoble] (DYFCOM-LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), and École polytechnique (X)-Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris)
Subjects: 0301 basic medicine, transendothelial migration, Materials science, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Biophysics, Nanotechnology, Microscopy, Atomic Force, Viscoelasticity, 03 medical and health sciences, [SPI.MECA.BIOM] Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Biomechanics [physics.med-ph], Cell Line, Tumor, Microscopy, Humans, Neoplasm Invasiveness, Elasticity (economics), Cytoskeleton, Elastic modulus, viscoelasticity, Mechanical Phenomena, substrate corrections, mechanosenstivity, [SPI.MECA.BIOM]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Biomechanics [physics.med-ph], Actin cytoskeleton, Elasticity, Biomechanical Phenomena, indentation, 030104 developmental biology, Cell Biophysics, Cancer cell, cancer cells, Mechanosensitive channels, AFM, substrate correction, Rheology
Abstract: International audience; Cancer cells are usually found to be softer than normal cells, but their stiffness changes when they are in contactwith different environments because of mechanosensitivity. For example, they adhere to a given substrate by tuning theircytoskeleton, thus affecting their rheological properties. This mechanism could become efficient when cancer cells invadethe surrounding tissues, and they have to remodel their cytoskeleton in order to achieve particular deformations. Here weuse an atomic force microscope in force modulation mode to study how local rheological properties of cancer cells are affectedby a change of the environment. Cancer cells were plated on functionalized polyacrylamide substrates of different stiffnesses aswell as on an endothelium substrate. A new correction of the Hertz model was developed because measurements require one toaccount for the precise properties of the thin, layered viscoelastic substrates. The main results show the influence of local cellrheology (the nucleus, perinuclear region, and edge locations) and the role of invasiveness. A general mechanosensitive trend isfound by which the cell elastic modulus and transition frequency increase with substrate elasticity, but this tendency breaksdown with a real endothelium substrate. These effects are investigated further during cell transmigration, when the actincytoskeleton undergoes a rapid reorganization process necessary to push through the endothelial gap, in agreement with thelocal viscoelastic changes measured by atomic force microscopy. Taken together, these results introduce a paradigm for anew—to our knowledge—possible extravasation mechanism.
Published: 2017

20. Correction: ICAP-1 monoubiquitylation coordinates matrix density and rigidity sensing for cell migration through ROCK2–MRCKα balance

Author: Miroshnikova, Yekaterina, Le, Huy, Schneider, David, Thalheim, Torsten, Rübsam, Matthias, Bremicker, Nadine, Polleux, Julien, Kamprad, Nadine, Tarantola, Marco, Wang, Irène, Niessen, Carien, Galle, Joerg, Wickström, Sara, Bouin, Anne-Pascale, Kyumurkov, Alexander, Régent-Kloeckner, Myriam, Ribba, Anne-Sophie, Faurobert, Eva, Fournier, Henri-Noël, Bourrin-Reynard, Ingrid, Manet-Dupé, Sandra, Oddou, Christiane, Balland, Martial, Planus, Emmanuelle, Albiges-Rizo, Corinne, Department of Colloid Chemistry [Potsdam], Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Max-Planck-Gesellschaft-Max-Planck-Gesellschaft, Laboratoire de Spectrométrie Physique (LSP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interdisciplinary Centre for Bioinformatics [Leipzig] (IZBI), Universität Leipzig [Leipzig], Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire d'études de la différenciation et de l'adhérence cellulaires (LEDAC), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), INSERM U823, équipe 1 (DySAD), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, 030220 oncology & carcinogenesis, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Cell Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract: International audience
Published: 2017

21. αvβ3 integrins negatively regulate cellular forces by phosphorylation of its distal NPXY site

Author: Milloud, Rachel, Destaing, Olivier, De Mets, Richard, Bourrin-Reynard, Ingrid, Oddou, Christiane, Delon, Antoine, Wang, Irène, Albiges-Rizo, Corinne, Balland, Martial, Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physico-Chimie-Curie (PCC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MOTIV, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie Physique (LSP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), INSERM U823, équipe 1 (DySAD), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

22. Eradication of Hepatitis C Virus Infection in Patients With Cirrhosis Reduces Risk of Liver and Non-Liver Complications

Author: Pierre Nahon, Valérie Bourcier, Richard Layese, Etienne Audureau, Carole Cagnot, Patrick Marcellin, Dominique Guyader, Hélène Fontaine, Dominique Larrey, Victor De Lédinghen, Denis Ouzan, Fabien Zoulim, Dominique Roulot, Albert Tran, Jean-Pierre Bronowicki, Jean-Pierre Zarski, Vincent Leroy, Ghassan Riachi, Paul Calès, Jean-Marie Péron, Laurent Alric, Marc Bourlière, Philippe Mathurin, Sébastien Dharancy, Jean-Frédéric Blanc, Armand Abergel, Lawrence Serfaty, Ariane Mallat, Jean-Didier Grangé, Pierre Attali, Yannick Bacq, Claire Wartelle, Thông Dao, Yves Benhamou, Christophe Pilette, Christine Silvain, Christos Christidis, Dominique Capron, Brigitte Bernard-Chabert, David Zucman, Vincent Di Martino, Vincent Thibaut, Dominique Salmon, Marianne Ziol, Angela Sutton, Stanislas Pol, Françoise Roudot-Thoraval, Gérard Thiefin, Sophie Hillaire, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Foie, métabolismes et cancer, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Hôpital Cochin [AP-HP], Cellules souches normales et cancéreuses, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Arnault Tzanck, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Gastro-entérologie [Avicenne], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Département d'hépato-gastroentérologie, CHU Grenoble-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ScaLable Information Discovery and Exploitation [Grenoble] (SLIDE), Laboratoire d'Informatique de Grenoble (LIG ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Hôpital Saint-André, Hôpital Hôtel-Dieu de Clermont-Ferrand, CHU Clermont-Ferrand, CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor], CHU Tenon [AP-HP], Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Service de gastro-entérologie [CHU Trousseau], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier d'Aix en Provence [Aix-en-Provence] (CHIAP ), Service d'Hépato-Gastro-Enterologie et Nutrition [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Mobilités : Vieillissement, Pathologie, Santé (COMETE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Institut Mutualiste de Montsouris (IMM), CHU Amiens-Picardie, Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Hôpital Foch [Suresnes], Service d'hépatologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), CHU Pontchaillou [Rennes], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de médecine interne et centre de référence des maladies rares [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Service Maladies infectieuses et tropicales [AP-HP Hôpital Cochin], Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle (LVTS (UMR_S_1148 / U1148)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépatologie médicale [CHU Cochin], Immunobiologie des Cellules dendritiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de santé publique [Mondor], Service d'Hépato-gastroentérologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Hôpital Henri Mondor, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Department of hepatology, CHU Saint-Eloi, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Hôpital Purpan [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Service d'hépato-gastro-entérologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Hôpital Huriez-Université de Lille, Hôpital Claude Hurriez, Inserm, UMR-1053, Université de Bordeaux, Bordeaux, F-33076, France, Centre hospitalier universitaire de Bordeaux, Department of Hepatology, Hôpital Saint-André, Bordeaux, F-33076, France, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Hôpital Henri Mondor-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Paul Brousse-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Hopital d'Aix en Provence, Service d'Hépatogastroentérologie, Service de Médecine Interne (Med Int - Hôpital Foch), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), FHDH-ANRS CO4, Service d'anatomie pathologique, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides ( U1162 ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Beaujon, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Cochin [AP-HP], Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Avicenne, Centre méditérannéen de médecine moléculaire ( C3M ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Université de Lorraine ( UL ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), ScaLable Information Discovery and Exploitation [Saint Martin d’Hères] ( SLIDE ), Laboratoire d'Informatique de Grenoble ( LIG ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Service d'Hépato-Gastroentérologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques ( HIFIH ), Université d'Angers ( UA ), Hepato-gastro-enterology, Toulouse University hospital, Institut de Recherche en Santé Digestive - IRSD [Purpan, Toulouse], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse ( ENVT ), Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ) -Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ), CHU Saint-Antoine [APHP], Institut Mondor de Recherche Biomédicale ( IMRB ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Service de gastro-entérologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Service d'Hépato-Gastro-Enterologie et Nutrition [Caen], Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -CHU Caen, Mobilités : Vieillissement, Pathologie, Santé ( COMETE ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), Service de Médecine Interne ( Med Int - Hôpital Foch ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Jean Minjoz-Université de Franche-Comté ( UFC ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Hôpital Jean Verdier AP-HP Bondy, Hôpital Jean Verdier, Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle ( LVTS ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), CHU Trousseau [APHP], Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Grenoble Alpes (UGA)-CHU Grenoble, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: 0301 basic medicine, Liver Cirrhosis, Male, Cirrhosis, Sustained Virologic Response, Direct Antivirals, Gastroenterology, Body Mass Index, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer, 0302 clinical medicine, Prospective Studies, Prospective cohort study, Metabolic Syndrome, education.field_of_study, Incidence, Hazard ratio, Liver Neoplasms, virus diseases, Hepatitis C, Bacterial Infections, gamma-Glutamyltransferase, Middle Aged, Prognosis, 3. Good health, ANRS CirVir, Cardiovascular Diseases, Hepatocellular carcinoma, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, [ SDV.MHEP.HEG ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, France, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Population, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Lower risk, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Spontaneous bacterial peritonitis, Internal medicine, medicine, Diabetes Mellitus, Humans, Aspartate Aminotransferases, education, Aged, Dyslipidemias, Hepatology, business.industry, Platelet Count, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, medicine.disease, digestive system diseases, Surgery, 030104 developmental biology, Prothrombin Time, business, HCV Clearance, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; BACKGROUND & AIMS: We performed a prospective study to investigate the effects of a sustained viral response (SVR) on outcomes of patients with hepatitis C virus (HCV) infection and compensated cirrhosis. METHODS: We collected data from 1323 patients included in the prospective Agence Nationale pour la Recherche sur le SIDA et les hépatites virales (ANRS) viral cirrhosis (CirVir) cohort, recruited from 35 clinical centers in France from 2006 through 2012. All patients had HCV infection and biopsy-proven cirrhosis, were Child-Pugh class A, and had no prior liver complications. All patients received anti-HCV treatment before or after inclusion (with interferon then with direct antiviral agents) and underwent an ultrasound examination every 6 months, as well as endoscopic evaluations. SVR was considered as a time-dependent covariate; its effect on outcome was assessed by the Cox proportional hazard regression method. We used a propensity score to minimize confounding by indication of treatment and capacity to achieve SVR. RESULTS: After a median follow-up period of 58.2 months, 668 patients (50.5%) achieved SVR. SVR was associated with a decreased incidence of hepatocellular carcinoma (hazard ratio [HR] compared with patients without an SVR, 0.29; 95% confidence interval [CI], 0.19-0.43; P < .001) and hepatic decompensation (HR, 0.26; 95% CI, 0.17-0.39; P < .001). Patients with SVRs also had a lower risk of cardiovascular events (HR, 0.42; 95% CI, 0.25-0.69; P = .001) and bacterial infections (HR, 0.44; 95% CI, 0.29-0.68; P < .001). Metabolic features were associated with a higher risk of hepatocellular carcinoma in patients with SVRs, but not in patients with viremia. SVR affected overall mortality (HR, 0.27 compared with patients without SVR; 95% CI, 0.18-0.42; P < .001) and death from liver-related and non-liver-related causes. Similar results were obtained in a propensity score-matched population. CONCLUSIONS: We confirmed a reduction in critical events, liver-related or not, in a prospective study of patients with HCV infection and compensated cirrhosis included in the CirVir cohort who achieved an SVR. We found an SVR to reduce overall mortality and risk of death from liver-related and non-liver-related causes. A longer follow-up evaluation is required to accurately describe and assess specific risk factors for complications in this population.
Published: 2017

23. Safety and efficacy of daclatasvir-sofosbuvir in HCV genotype 1-mono-infected patients

Author: Dominique Thabut, Eric Billaud, Alpha Diallo, Sandy Lucier, Valérie Bourcier, Christophe Hézode, Fabien Zoulim, Isabelle Rosa, François Habersetzer, Patrick Marcellin, Ghassan Riachi, Anne Minello, Jérôme Gournay, Jean-Pierre Bronowicki, Eric Saillard, Claire Geist, Hélène Fontaine, Isabelle Fouchard-Hubert, Céline Dorival, Marc Bourlière, Dominique Larrey, Dominique Guyader, Sophie Metivier, Louis d’Alteroche, Albert Tran, Laurent Alric, Fabrice Carrat, Xavier Causse, Didier Samuel, Philippe Mathurin, Stanislas Pol, Victor de Ledinghen, Jean-Pierre Zarski, Olivier Chazouillères, Ventzislava Petrov-Sanchez, Véronique Loustaud-Ratti, Service d'hépatologie médicale [CHU Cochin], CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Service d'hépato-gastro-entérologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Département de la recherche clinique et du développement, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique ( iPLESP ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), AP HP, Departement Gastroenterologie, Centre Hospitalier Universitaire Henri Mondor, CHU Saint-Eloi, Cellules souches normales et cancéreuses, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Université de Lorraine ( UL ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre méditérannéen de médecine moléculaire ( C3M ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Gastro-entérologie - Hépatologie [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Département d'hépato-gastroentérologie, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire - CHB [Paul Brousse, Paris], Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Foie, métabolismes et cancer, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut de Recherche en Santé Digestive - IRSD [Purpan, Toulouse], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse ( ENVT ), Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ) -Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Service d'hépatologie [Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [APHP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Service d'Hépato-Gastroentérologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Service d'Hépato-gastroentérologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier, Hôpital Huriez-Université de Lille, Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation ( PIST ), Université de Limoges ( UNILIM ) -CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, CHU Trousseau [Tours], CHRU Tours, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ), Laboratoire HIFIH, Université d'Angers ( UA ), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Hépato-gastro-entérologie et oncologie digestive, Centre Hospitalier Régional d'Orléans ( CHR ), Centre hospitalier régional Metz-Thionville ( CHR Metz-Thionville ), CHI Créteil, Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]-Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Service des maladies infectieuses [Nantes], Recherches fondamentales, cliniques et thérapeutiques sur les hépatites virales, ANRS, INSERM-ANRS (France REcherche Nord&sud Sida-vih Hépatites), France, ANR (Agence Nationale de la Recherche), France, DGS (Direction Générale de la Santé), France and MSD, United States, Janssen, United States, Gilead, United States, Abbvie, United States, BMS, United States, Roche, Switzerland., Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Nutrition et cerveau (U1213, U855), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Molecular virology and immunology – Physiopathology and therapeutic of chronic viral hepatitis (Team 18) (Inserm U955), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Grenoble-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Hôpital Beaujon [AP-HP], Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation (PIST), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Hôtel-Dieu de Nantes, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Jonchère, Laurent, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Service Hépato-gastro-entérologie et oncologie digestive [CHR Orléans], Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Université Grenoble Alpes (UGA)-CHU Grenoble, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AP-HP Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AP-HP Hôpital Paul Brousse, Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Saint-Antoine [APHP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Jean Verdier [Bondy], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR), and Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)
Subjects: Male, Pyrrolidines, Sofosbuvir, Sustained Virologic Response, Hepacivirus, Direct antiviral agents, medicine.disease_cause, Chronic hepatitis C, Gastroenterology, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Medicine, 030212 general & internal medicine, biology, Imidazoles, Valine, Hepatitis B, Middle Aged, Genotype 1, 3. Good health, [ SDV.MHEP.MI ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Treatment Outcome, Cirrhosis, [SDV.SP.PHARMA] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Cohort, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, RNA, Viral, 030211 gastroenterology & hepatology, Drug Therapy, Combination, Female, [ SDV.MHEP.HEG ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, France, medicine.drug, medicine.medical_specialty, Daclatasvir, Hepatitis C virus, Antiviral Agents, Severe fibrosis, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Ribavirin, Hepather cohort, Humans, Aged, Hepatology, business.industry, [ SDV.SP.PHARMA ] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, biology.organism_classification, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Treatment, Regimen, chemistry, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Carbamates, business
Abstract: International audience; Background & aims - We report the first real-life results of the sofosbuvir+daclatasvir combination in hepatitis C virus (HCV) genotype 1 infected patients. Methods - The France REcherche Nord&Sud Sida-hiv Hépatites (ANRS) CO22 HEPATHER "Therapeutic options for hepatitis B and C: A French cohort" is a multicentre observational cohort which aims to include 15,000 HCV- and 10,000 HBV-infected patients. We selected all participants (n=768) with a HCV genotype 1 who initiated sofosbuvir (400mg/day) and daclatasvir (60mg/day) before October 1st 2014, with or without ribavirin (1-1.2g/day) for a duration of 12weeks or 24weeks. The main endpoint criterion was sustained virological response at 12weeks (SVR12), defined by the absence of detectable HCV-RNA 12weeks after the last treatment intake. Missing SVR12 measurements were imputed using SVR24 measurements (n=45), otherwise considered as virological failure (n=18). Results - A SVR12 was obtained in 729/768 (95%) patients, ranging from 92% (12-week sofosbuvir+daclatasvir) to 99% (24-week sofosbuvir+daclatasvir+ribavirin). The SVR12 rates did not significantly differ between the 24-week (550/574 (96%)) and the 12-week (179/194 (92%); p=0.0688) durations or between regimens with (165/169 (98%)) or without ribavirin (564/599 (94%); p=0.0850). The SVR12 rate was greater than 97% in non-cirrhotic patients irrespective of the treatment duration or the addition of ribavirin. Among cirrhotic patients, the SVR12 rate was higher with 24 than 12-week regimen (423/444 (95%) vs. 105/119 (88%); p=0.0054). Conclusion - The sofosbuvir+daclatasvir combination is associated with a high rate of SVR12 in patients infected by genotype 1, with an optimal duration of 12weeks in non-cirrhotic and 24weeks in cirrhotic patients. The number of patients receiving ribavirin was too low to adequately assess its impact. Lay summary - The sofosbuvir+daclatasvir combination of antiviral drugs is associated with a high rate (95%) of viral eradication in patients infected by HCV genotype 1. The best duration of a ribavirin-free sofosbuvir+daclatasvir combination seems to be 12weeks in non-cirrhotic patients and 24weeks for those with cirrhosis. Clinical trial number: NCT01953458.
Published: 2017

24. Keto-polymethines: a versatile class of dyes with outstanding spectroscopic properties for in cellulo and in vivo two-photon microscopy imaging

Author: San-Hui Chi, Boudewijn van der Sanden, Olivier Maury, Denis Jacquemin, Chantal Andraud, Joseph W. Perry, Alexei Grichine, Cyrille Monnereau, Alain Duperray, Boris Le Guennic, Jérôme Cuny, Simon Pascal, Florence Appaix, Sandrine Denis-Quanquin, Laboratoire de Chimie - UMR5182 (LC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), LIPHY-DYFCOM, Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Modélisation, Agrégats, Dynamique (LCPQ) (MAD), Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques (LCPQ), Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), School of Chemistry and Biochemistry, and Center for Organic Electronics and Photonics, Georgia Institute of Technology [Atlanta], D. J. acknowledges the ERC for financial support in the framework of a Starting Grant (Marches – 278845). J. W. P. and S.-H. C. acknowledge the support from the DARPA ZOE Program (W31P4Q-09-1-0012), and the AFOSR MURI (FA9550-10-1-0558)., Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), DYnamique des Fluides COmplexes et Morphogénèse [Grenoble] (DYFCOM-LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Elefantis, Nicolas, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
Subjects: Chemistry, Stereochemistry, Hydrogen bond, Quantum yield, 02 engineering and technology, General Chemistry, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Photochemistry, 01 natural sciences, Fluorescence, 0104 chemical sciences, Molecular engineering, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [CHIM.THEO] Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Molecular dynamics, Membrane, Two-photon excitation microscopy, Molecule, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; The synthesis of keto-heptamethine derivatives has been expanded to various new symmetrical and asymmetrical structures, including an unprecedented di-anionic keto-polymethine. The spectroscopic behavior of these new dyes has been systematically and thoroughly investigated, revealing that the formation of hydrogen bond interactions with protic solvents is responsible for a dramatic enhancement of the fluorescence quantum yield in the far-red spectral region. The existence of these strong hydrogen-bond interactions was further confirmed by molecular dynamics simulations. These bis-dipolar polymethines exhibit large two-photon absorption (TPA) cross-sections (σ2 in GM) in the near-infrared, making them ideal candidates for NIR-to-NIR two-photon microscopy imaging applications. We demonstrate that the molecular engineering of the hydrophilic/hydrophobic balance enables targeting of different cellular components, such as cytoplasm or cell membranes. Addition of appropriate substituents provides the molecule with high-water-solubility, affording efficient two-photon probes for angiography.
Published: 2017

25. ICAP-1 monoubiquitination coordinates matrix density and rigidity sensing for cell migration through ROCK2- MRCKα balance

Author: Eva Faurobert, Ingrid Bourrin-Reynard, Anne-Pascale Bouin, Christiane Oddou, Myriam Régent-Kloeckner, Martial Balland, Anne-Sophie Ribba, Corinne Albiges-Rizo, Alexander Kyumurkov, Henri-Noël Fournier, Emmanuelle Planus, Sandra Manet-Dupé, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire d'études de la différenciation et de l'adhérence cellulaires (LEDAC), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ALBIGES-RIZO, Corinne, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), INSERM U823, équipe 1 (DySAD), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Subjects: 0301 basic medicine, ICAP-1, Cell contractility, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Ubiquitin-Protein Ligases, Integrin, [SDV.BC.IC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], Biology, Models, Biological, Myotonin-Protein Kinase, Cell Line, Extracellular matrix, Focal adhesion, Mice, 03 medical and health sciences, Rigidity (electromagnetism), Cell Movement, [SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], Cell Adhesion, Animals, Humans, Monoubiquitination, Cell migration, Monoubiquitylation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Rigidity sensing, Adaptor Proteins, Signal Transducing, Focal Adhesions, rho-Associated Kinases, Binding Sites, Integrin beta1, Intracellular Signaling Peptides and Proteins, Ubiquitination, Membrane Proteins, Cell Biology, Actin cytoskeleton, Biomechanical Phenomena, Extracellular Matrix, Fibronectins, Cell biology, Fibronectin, 030104 developmental biology, biology.protein, Signal Transduction
Abstract: International audience; Cell migration is a complex process requiring density and rigidity sensing of the microenvironment to adapt cell migratory speed through focal adhesion and actin cytoskeleton regulation. ICAP-1 (also known as ITGB1BP1), a β1 integrin partner, is essential for ensuring integrin activation cycle and focal adhesion formation. We show that ICAP-1 is monoubiquitylated by Smurf1, preventing ICAP-1 binding to β1 integrin. The non-ubiquitylatable form of ICAP-1 modifies β1 integrin focal adhesion organization and interferes with fibronectin density sensing. ICAP-1 is also required for adapting cell migration in response to substrate stiffness in a β1-integrin-independent manner. ICAP-1 monoubiquitylation regulates rigidity sensing by increasing MRCKα (also known as CDC42BPA)-dependent cell contractility through myosin phosphorylation independently of substrate rigidity. We provide evidence that ICAP-1 monoubiquitylation helps in switching from ROCK2-mediated to MRCKα-mediated cell contractility. ICAP-1 monoubiquitylation serves as a molecular switch to coordinate extracellular matrix density and rigidity sensing thus acting as a crucial modulator of cell migration and mechanosensing.
Published: 2017

26. Identification of pyrrolopyrimidine derivative PP-13 as a novel microtubule-destabilizing agent with promising anticancer properties

Author: Pauline Gilson, Fernando Josa-Prado, Claire Beauvineau, Delphine Naud-Martin, Laetitia Vanwonterghem, Florence Mahuteau-Betzer, Alexis Moreno, Pierre Falson, Laurence Lafanechère, Véronique Frachet, Jean-Luc Coll, Jose Fernando Díaz, Amandine Hurbin, Benoit Busser, Hurbin, Amandine, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Dpt biochimie, toxicologie, pharmacologie [CHU Grenoble], CHU Grenoble, Centro de Investigaciones Biológicas (CSIC), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Chimie, Modélisation et Imagerie pour la Biologie [Orsay], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbiologie moléculaire et biochimie structurale / Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (MMSB), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported by the Institut Curie, the CNRS, the INSERM, and by grants from La Fondation de France, La Ligue contre le Cancer (comité de l’Isère), Cancéropôle CLARA (Lyon Auvergne Rhône-Alpes), and BFU2016–75319-R (AEI/FEDER, UE) from Ministerio de Economia y Competitividad (JFD)., Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Biochemistry Pharmacology and Toxicology Department, Centre Hospitalo-Universitaire de Grenoble, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie ( UGA UFRP ), Université Grenoble Alpes ( UGA ), Unité de pharmacologie chimique et génétique et d'imagerie ( UPCGI - UMR 8151 / UMR_S 1022 ), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Conception, synthèse et vectorisation de biomolécules. ( CSVB ), INSTITUT CURIE-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Laboratoire d'Etudes et de Recherches Appliquées en Sciences Sociales ( LERASS ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université Toulouse - Jean Jaurès ( UT2J ) -Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] ( IBCP ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Groupe Plateforme et Moyens Scientifiques et techniques communs / Centre de Criblage pour Molécules Bio-Actives ( GPMS / CMBA ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), INSERM U823, équipe 5 (cibles diagnostiques ou thérapeutiques et vectorisation de drogues dans le cancer du poumon), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Biochimie des Cancers et Biothérapies, CHU Grenoble-Hôpital Michallon-Hôpital Michallon, and Falson, pierre
Subjects: Cell Survival, [CHIM.THER] Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, lcsh:Medicine, Antineoplastic Agents, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Chick Embryo, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Article, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Tubulin, Cell Line, Tumor, [SDV.BC.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Animals, Humans, Pyrroles, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], lcsh:Science, [SDV.BBM.BC] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cell Proliferation, lcsh:R, Neoplasms, Experimental, Xenograft Model Antitumor Assays, Tubulin Modulators, Pyrimidines, Drug Resistance, Neoplasm, lcsh:Q, Drug Screening Assays, Antitumor, Colchicine
Abstract: International audience; Despite the emergence of targeted therapies and immunotherapy, chemotherapy remains the gold-standard for the treatment of most patients with solid malignancies. Spindle poisons that interfere with microtubule dynamics are commonly used in chemotherapy drug combinations. However, their troublesome side effects and the emergence of chemoresistance highlight the need for identifying alternative agents. We performed a high throughput cell-based screening and selected a pyrrolopyrimidine molecule (named PP-13). In the present study, we evaluated its anticancer properties in vitro and in vivo. We showed that PP-13 exerted cytotoxic effects on various cancer cells, including those resistant to current targeted therapies and chemotherapies. PP-13 induced a transient mitotic blockade by interfering with both mitotic spindle organization and microtubule dynamics and finally led to mitotic slippage, aneuploidy and direct apoptotic death. PP-13 was identified as a microtubule-targeting agent that binds directly to the colchicine site in β-tubulin. Interestingly, PP-13 overcame the multidrug-resistant cancer cell phenotype and significantly reduced tumour growth and metastatic invasiveness without any noticeable toxicity for the chicken embryo in vivo. Overall, PP-13 appears to be a novel synthetic microtubule inhibitor with interesting anticancer properties and could be further investigated as a potent alternative for the management of malignancies including chemoresistant ones. In the last two decades, advances in the understanding of carcinogenesis have revolutionized the management of cancer patients with the development of targeted therapies and immunotherapy. Identification of genetic alterations in subsets of cancers leading to different subcellular signals of tumour growth and progression elicited the clinical use of oncogene-targeted therapies for patients harbouring such anomalies 1-4. In lung cancers with EGFR-activating mutations, anti-EGFR therapies, including gefitinib, erlotinib, and afatinib, have been shown to improve progression-free survival and were approved as first-line options 5. However, despite the initial response, resistance mechanisms almost inevitably ensue and limit the long-term potency of targeted therapies 6, 7. Moreover, efforts are still needed for the management of patients without targetable oncogenic driver
Published: 2017

27. Mathematical framework for traction force microscopy

Author: Guido Vitale, Claude Verdier, Valentina Peschetola, Jocelyn Etienne, Alain Duperray, Luigi Preziosi, Richard Michel, Davide Carlo Ambrosi, DYFCOM, Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), DYnamique des Fluides COmplexes et Morphogénèse [Grenoble] (DYFCOM), Laboratoire de mécanique des solides (LMS), École polytechnique (X)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MOX, Milano, MOX-Dipartimento di Matematica (MOX), Politecnico di Milano [Milan] (POLIMI)-Politecnico di Milano [Milan] (POLIMI), Matematica, Politecnico di Torino, Dipartimento di Matematica 'Giuseppe Peano' [Torino], and Università degli studi di Torino (UNITO)-Università degli studi di Torino (UNITO)
Subjects: Surface (mathematics), Inverse problems, Mathematical optimization, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Traction (engineering), Living cell, Cell motility, 01 natural sciences, Traction force microscopy, Quantitative Biology::Cell Behavior, Tikhonov regularization, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Adjoint Method (AM), [MATH.MATH-MP]Mathematics [math]/Mathematical Physics [math-ph], QA1-939, 0101 mathematics, [PHYS.MECA.BIOM]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Biomechanics [physics.med-ph], 030304 developmental biology, Mathematics, 0303 health sciences, T57-57.97, Applied mathematics. Quantitative methods, Mathematical analysis, Minimization problem, [SPI.MECA.BIOM]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Biomechanics [physics.med-ph], Inverse problem, 010101 applied mathematics, Fourier transform, symbols, L -curve, Fourier Transform Traction Cytometry (FTTC)
Abstract: This paper deals with the Traction Force Microscopy (TFM) problem. It consists in obtaining stresses by solving an inverse problem in an elastic medium, from known experimentally measured displacements. In this article, the application is the determination of the stresses exerted by a living cell at the surface of an elastic gel. We propose an abstract framework which formulates this inverse problem as a constrained minimization one. The mathematical constraints express the biomechanical conditions that the stress field must satisfy. From this framework, two methods currently used can be derived, the adjoint method (AM) and the Fourier Transform Traction Cytometry (FTTC) method. An improvement of the FTTC method is also derived using this framework. The numerical results are compared and show the advantage of the AM, in particular its ability to capture details more accurately. Cet article est consacré au problème de la Microscopie à Force de Traction (TFM). Ce problème consiste à déterminer les contraintes exercées par une cellule lors de sa migration sur un substrat élastique à partir d’une mesure expérimentale des déplacements induits dans ce substrat. Mathématiquement, il s’agit de résoudre un problème inverse pour lequel nous proposons une formulation abstraite de type optimisation sous contraintes. Les contraintes mathématiques expriment les constraintes biomécaniques que doit satisfaire le champ de contraintes exercé par la cellule. Ce cadre abstrait permet de retrouver deux des méthodes de résolution utilisées en pratique, à savoir la méthode adjointe (AM) et la méthode de Cytométrie de Traction par Transformée de Fourier (FTTC). Il permet aussi d’ameliorer la méthode FTTC. Les résultats numériques obtenus sont ensuite comparés et démontrent l’avantage de la méthode adjointe, en particulier par sa capacité à capturer des détails avec une meilleure précision.
Published: 2013

28. Clinical and Molecular Findings in 39 Patients with KBG Syndrome Caused by Deletion or Mutation of ANKRD11

Author: Aurélia Jacquette, Alice Goldenberg, Thierry Frebourg, Julien Thevenon, David Geneviève, Anne-Marie Guerrot, Andrée Delahaye-Duriez, Yline Capri, Bruno Leheup, François Lecoquierre, Florence Riccardi, Tiffany Busa, Laurent Villard, Pierre Cacciagli, Vincent Gatinois, Julien Mancini, Chantal Missirian, Lionel Van Maldergem, Massimiliano Rossi, Laurence Perrin, Catherine Vincent-Delorme, Pascale Saugier-Veber, Philippe Khau Van Kien, Gwenaël Nadeau, Annick Toutain, Alain Verloes, Sandrine Marlin, Rolph Pfundt, Elise Schaefer, Arthur Sorlin, Vincent Michaud, Christel Thauvin-Robinet, Philippe Parent, Cyril Mignot, Charles Coutton, Nicole Philip, Véronique Satre, Aude Tessier, Service de génétique [Rouen], CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Human Genetics, Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Jean Verdier, Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques ( GMFC ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Rouen, Cellules souches mésenchymateuses, environnement articulaire et immunothérapies de la polyarthrite rhumatoide, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -IFR3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Génétique Cytogénétique et Embryologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ), Service de Génétique Médicale [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), CHU Trousseau [APHP], Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), École Supérieure des Géomètres et Topographes ( ESGT CNAM ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Laboratoire de Géodésie et de Géomatique ( L2G ESGT CNAM ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ) -Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ) -Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Service de Cytogénétique, Centre hospitalier de Valence, Centre de Référence des Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille ( CINaM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de génétique [Tours], Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Service de Génétique, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), AGeing and IMagery ( AGIM ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de génétique [Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Centre de Maladies Rares, Anomalies du Développement Nord de France-CH Arras - CHRU Lille, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut Paoli Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), Biostatistique et technologies de l'information et de la communication (BioSTIC) - [Hôpital de la Timone - APHM] ( BiosTIC ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Radboud University Medical Center [Nijmegen], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille (CINaM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), AGeing and IMagery (AGIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Département de génétique [Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut Paoli-Calmettes, Biostatistique et technologies de l'information et de la communication (BioSTIC) - [Hôpital de la Timone - APHM] (BiosTIC ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Gall, Valérie, Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École pratique des hautes études (EPHE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), and Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, 030105 genetics & heredity, medicine.disease_cause, Bioinformatics, Intellectual disability, Child, Genetics (clinical), Genetics, Comparative Genomic Hybridization, Mutation, Middle Aged, KBG syndrome, Phenotype, [ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Child, Preschool, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Female, Chromosome Deletion, medicine.symptom, Haploinsufficiency, Adult, Adolescent, Biology, Malignancy, Short stature, ANKRD11, Young Adult, 03 medical and health sciences, Intellectual Disability, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine, Humans, Precocious puberty, Abnormalities, Multiple, long-term prognosis, Alleles, Genetic Association Studies, Aged, Retrospective Studies, Bone Diseases, Developmental, Neurodevelopmental disorders Donders Center for Medical Neuroscience [Radboudumc 7], Tooth Abnormalities, 16q24.3 deletion, Point mutation, Facies, Infant, medicine.disease, haploinsufficiency, Repressor Proteins, Amino Acid Substitution, Autism, Chromosomes, Human, Pair 16
Abstract: Item does not contain fulltext KBG syndrome, due to ANKRD11 alteration is characterized by developmental delay, short stature, dysmorphic facial features, and skeletal anomalies. We report a clinical and molecular study of 39 patients affected by KBG syndrome. Among them, 19 were diagnosed after the detection of a 16q24.3 deletion encompassing the ANKRD11 gene by array CGH. In the 20 remaining patients, the clinical suspicion was confirmed by the identification of an ANKRD11 mutation by direct sequencing. We present arguments to modulate the previously reported diagnostic criteria. Macrodontia should no longer be considered a mandatory feature. KBG syndrome is compatible with autonomous life in adulthood. Autism is less frequent than previously reported. We also describe new clinical findings with a potential impact on the follow-up of patients, such as precocious puberty and a case of malignancy. Most deletions remove the 5'end or the entire coding region but never extend toward 16q telomere suggesting that distal 16q deletion could be lethal. Although ANKRD11 appears to be a major gene associated with intellectual disability, KBG syndrome remains under-diagnosed. NGS-based approaches for sequencing will improve the detection of point mutations in this gene. Broad knowledge of the clinical phenotype is essential for a correct interpretation of the molecular results. (c) 2016 Wiley Periodicals, Inc.
Published: 2016

29. Blood granulocyte patterns as predictors of asthma phenotypes in adults from the EGEA study

Author: Valérie Siroux, Rachel Nadif, Christophe Pison, Régis Matran, Jocelyne Just, Isabelle Pin, Nicole Le Moual, Anne Boudier, Frédéric Gormand, Vieillissement et Maladies chroniques : approches épidémiologique et de santé publique (VIMA), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Equipe d'Épidémiologie Environnementale appliquée à la Reproduction et la Santé Respiratoire (CRI INSERM/UJF - U823 ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de l'Asthme et des Allergies [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service de pneumologie [Centre Hospitalier Lyon Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratory of Fundamental and Applied Bioenergetics = Laboratoire de bioénergétique fondamentale et appliquée (LBFA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Clinique Universitaire de Pneumologie, Pôle Thorax et Vaisseaux [CHU Grenoble], Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble, Université Lille Nord de France (COMUE), Research was funded in part by the National Hospital Programme of Clinical Research (PHRC-national 2012, EvAdA), ANR-CES-2009, Region Nord Pas-de-Calais, Merck Sharp & Dohme, and the GA2LEN project, Global Allergy and Asthma European Network, and the Fonds AGIR pour les Maladies Chroniques., Faraldo, Beatrice, and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, Neutrophils, Asthma phenotypes, [SDV]Life Sciences [q-bio], Body Mass Index, Cohort Studies, Leukocyte Count, 0302 clinical medicine, Adrenal Cortex Hormones, Asthma control, Epidemiology, adults, Eosinophilia, 030212 general & internal medicine, Smoking, neutrophil, Middle Aged, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], medicine.anatomical_structure, Phenotype, Treatment Outcome, Bronchial hyperresponsiveness, Female, medicine.symptom, Bronchial Hyperreactivity, Pulmonary and Respiratory Medicine, Adult, medicine.medical_specialty, longitudinal, Granulocyte, 03 medical and health sciences, blood, Internal medicine, medicine, Humans, eosinophil, Asthma, business.industry, Immunoglobulin E, medicine.disease, Neutrophilia, respiratory tract diseases, asthma control, Eosinophils, Cross-Sectional Studies, 030228 respiratory system, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Immunology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, Granulocytes
Abstract: To what extent blood granulocyte patterns may predict asthma control remains under-studied. Our aim was to study associations between blood neutrophilia and eosinophilia and asthma control outcomes in adults.Analyses were conducted in 474 asthmatics from the first follow-up of the Epidemiological Study on the Genetics and Environment of Asthma (EGEA2), including 242 asthmatics who were adults a decade earlier (EGEA1). At EGEA2, asthma control was assessed using the Global Initiative for Asthma definition (2015), and asthma exacerbations by use of urgent care or courses of oral corticosteroids in the past year. Blood EOSlo/EOShi was defined as −3, respectively, and NEUlo/NEUhi as −3, respectively. Estimates were adjusted for age, sex and smoking.At EGEA2, NEUhi was associated with asthma exacerbations and poor asthma control (OR >2.10). EOShi was associated with higher bronchial hyperresponsiveness (BHR) (OR (95% CI) 2.21 (1.24–3.97)), poor lung function (p=0.02) and higher total IgE level (p=0.002). Almost 50% of asthmatics had a persistent pattern between surveys. Persistent NEUhi was associated with poor asthma control at EGEA2 (OR (95% CI) 3.09 (1.18–7.05)). EOShi at EGEA1 and persistent EOShi were associated with higher BHR (OR (95% CI) 2.36 (1.10–5.07) and 3.85 (1.11–13.34), respectively), poor lung function (p−4) at EGEA2.Granulocyte patterns were differently associated with asthma outcomes, suggesting specific roles for each one, which could be tested as predictive signatures.
Published: 2016

30. Atad2 is a generalist facilitator of chromatin dynamics in embryonic stem cells

Author: Morozumi, Yuichi, Boussouar, Fayçal, Tan, Minjia, Chaikuad, Apirat, Jamshidikia, Mahya, Colak, Gozde, He, Huang, Nie, Litong, Petosa, Carlo, De Dieuleveult, Maud, Curtet, Sandrine, Vitte, Anne-Laure, Rabatel, Clothilde, Debernardi, Alexandra, François-Loïc, Cosset, Verhoeyen, Els, Emadali, Anouk, Schweifer, Norbert, Gianni, Davide, Gut, Marta, Guardiola, Philippe, Rousseaux, Sophie, Gérard, Matthieu, Knapp, Stefan, Zhao, Yingming, Khochbin, Saadi, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The Chemical Proteomics Center and State Key Laboratory of Drug Research, Shanghai Institute of Materia Medica, Structural Genomics Consortium, University of Oxford, Nuffield Department of Clinical Medicine [Oxford], Ben May Department of Cancer Research, The University of Chicago Medicine, Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virus enveloppés, vecteurs et immunothérapie – Enveloped viruses, Vectors and Immuno-therapy (EVIR), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe 'Contrôle Métabolique des Morts Cellulaires' (INSERM U1065 - C3M), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Boehringer Ingelheim RCV, Centre for Genomic Regulation [Barcelona] (CRG), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF)-Centro Nacional de Analisis Genomico [Barcelona] (CNAG), Centre de Recherche en Cancérologie Nantes-Angers (CRCNA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Hôtel-Dieu de Nantes-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Laennec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Faculté de Médecine d'Angers-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), University of Oxford [Oxford], Target Discovery Institute (TDI), Nuffield Department of Clinical Medicine, Institut de biologie structurale ( IBS - UMR 5075 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre International de Recherche en Infectiologie ( CIRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ), Centre for Genomic Regulation [Barcelona] ( CRG ), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona]-Centro Nacional de Analisis Genomico [Barcelona] ( CNAG ), Inserm u892, Centre de Recherches en Cancérologie, Nantes, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adenosine Triphosphatases, Male, Proteomics, histone turnover, Chromatin Immunoprecipitation, germ cells, Genome, Pax3, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], FACT, epidrug, Acetylation, Cell Differentiation, Article, Chromatin, Nucleosomes, DNA-Binding Proteins, histone chaperone, ATPases Associated with Diverse Cellular Activities, Humans, cancer drug target, Embryonic Stem Cells, Cell Proliferation, Protein Binding
Abstract: International audience; Although the conserved AAA ATPase and bromodomain factor, ATAD2, has been described as a transcriptional co-activator upregulated in many cancers, its function remains poorly understood. Here, using a combination of ChIP-seq, ChIP-proteomics, and RNA-seq experiments in embryonic stem cells where Atad2 is normally highly expressed, we found that Atad2 is an abundant nucleosome-bound protein present on active genes, associated with chromatin remodelling, DNA replication, and DNA repair factors. A structural analysis of its bromodomain and subsequent investigations demonstrate that histone acetylation guides ATAD2 to chromatin, resulting in an overall increase of chromatin accessibility and histone dynamics, which is required for the proper activity of the highly expressed gene fraction of the genome. While in exponentially growing cells Atad2 appears dispensable for cell growth, in differentiating ES cells Atad2 becomes critical in sustaining specific gene expression programmes, controlling proliferation and differentiation. Altogether, this work defines Atad2 as a facilitator of general chromatin-templated activities such as transcription.
Published: 2016

31. Extensive characterization of NF-κB binding uncovers non-canonical motifs and advances the interpretation of genetic functional traits

Author: Imtiaz Nisar Lone, David Saliba, Trevor Siggers, Martha L. Bulyk, Irina A. Udalova, Jiannis Ragoussis, Ana Teixeira, Peter Humburg, Stefan Dimitrov, Daniel Wong, Spyros Oikonomopoulos, Dimitar Angelov, The Wellcome Trust Centre for Human Genetics [Oxford], University of Oxford [Oxford], Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Kennedy Institute of Rheumatology, Imperial College London, Division of Genetics, Brigham and Women's Hospital [Boston], Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology (HST), Harvard Medical School [Boston] (HMS), Department of Pathology, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U823, équipe 4 (Chromatine et Epigénétique), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The research leading to these results has received funding from the European Community's Seventh Framework Programme FP7/2007-2013: Model-In (222008) awarded to JR, IAU, DA and SD, the FP7 ITN Network INTEGER (214902) awarded to JR. In addition, the MRC project grant G0700818 awarded to IAU and JR. JR was also supported by the Wellcome Trust through grant 075491/Z/04., European Project: 222008,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2007-B,MODEL-IN(2008), University of Oxford, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BMC, Ed., Genomic determinants of inflammation: from physical measurements to system perturbation and mathematical modeling - MODEL-IN - - EC:FP7:HEALTH2008-12-01 - 2012-05-31 - 222008 - VALID, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Harvard University--MIT Division of Health Sciences and Technology, and Bulyk, Martha L.
Subjects: Quantitative Trait Loci, SPECIFICITIES, Protein Array Analysis, Single-nucleotide polymorphism, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Plasma protein binding, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Polymorphism, Single Nucleotide, Deep sequencing, IN-VITRO SELECTION, SACCHAROMYCES-CEREVISIAE, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Transcription (biology), [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Consensus Sequence, Humans, Nucleotide Motifs, Transcription factor, Alleles, 030304 developmental biology, Genetics, 0303 health sciences, TRANSCRIPTION-FACTOR-BINDING, SITES, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Binding Sites, Base Sequence, Research, TNF PROMOTER REGION, NF-kappa B, RECOGNITION, Chromatin, DNA binding site, DNA-PROTEIN INTERACTIONS, 030220 oncology & carcinogenesis, DISEASES, P50/P65 HETERODIMER, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], DNA microarray, Genome-Wide Association Study
Abstract: Background Genetic studies have provided ample evidence of the influence of non-coding DNA polymorphisms on trait variance, particularly those occurring within transcription factor binding sites. Protein binding microarrays and other platforms that can map these sites with great precision have enhanced our understanding of how a single nucleotide polymorphism can alter binding potential within an in vitro setting, allowing for greater predictive capability of its effect on a transcription factor binding site. Results We have used protein binding microarrays and electrophoretic mobility shift assay-sequencing (EMSA-Seq), a deep sequencing based method we developed to analyze nine distinct human NF-κB dimers. This family of transcription factors is one of the most extensively studied, but our understanding of its DNA binding preferences has been limited to the originally described consensus motif, GGRRNNYYCC. We highlight differences between NF-κB family members and also put under the spotlight non-canonical motifs that have so far received little attention. We utilize our data to interpret the binding of transcription factors between individuals across 1,405 genomic regions laden with single nucleotide polymorphisms. We also associated binding correlations made using our data with risk alleles of disease and demonstrate its utility as a tool for functional studies of single nucleotide polymorphisms in regulatory regions. Conclusions NF-κB dimers bind specifically to non-canonical motifs and these can be found within genomic regions in which a canonical motif is not evident. Binding affinity data generated with these different motifs can be used in conjunction with data from chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-Seq) to enable allele-specific analyses of expression and transcription factor-DNA interactions on a genome-wide scale., Wellcome Trust (London, England) (grant 075491/Z/04), European Commission (Seventh Framework Programme FP7/2007-2013: Model-In (222008)), European Commission (Seventh Framework Programme FP7 ITN Network INTEGER (214902)), Medical Research Council (Canada) (MRC project grant G0700818)
Published: 2016

32. 9q33.3q34.11 microdeletion: new contiguous gene syndrome encompassing STXBP1, LMX1B and ENG genes assessed using reverse phenotyping

Author: Laurence Faivre, Marie-Ange Delrue, Nathalie Marle, Fanny Morice-Picard, Pierre-Simon Jouk, Delphine Héron, Alice Goldenberg, Stéphanie Perez-Martin, Julien Thevenon, Frédéric Huet, Véronique Dulieu, Alice Masurel, Patricia Calenda, Patrick Callier, Salima El Chehadeh, Sylvie Manouvrier-Hanu, Sophie Dupuis-Girod, Pascale Saugier-Veber, Gipsy Billy-Lopez, Joris Andrieux, Paul Kuentz, Ghislaine Plessis, Christel Thauvin-Robinet, Géraldine Joly-Helas, Sophie Nambot, Mathilde Lefebvre, Charles Coutton, Anne-Laure Mosca-Boidron, Caroline Rooryck, Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Service de Cardiologie, Génétique des Anomalies du Développement ( GAD ), Université de Bourgogne ( UB ) -IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Pôle Rééducation - Réadaptation (Médecine Physique et Réadaptation) (CHU de Dijon), Service de pédiatrie (CHU de Dijon), EDF ( EDF ), Laboratoire de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] ( TIMC-IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Maladies Rares - Génétique et Métabolisme ( MRGM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Hôpital Pellegrin-Service de Génétique Médicale du CHU de Bordeaux, Groupe de Recherche Clinique : Déficience Intellectuelle et Autisme ( GRC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Centre de Référence des Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de génétique [Rouen], CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques ( GMFC ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Groupe Hospitalier Est, Regional council of Burgundy, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service de Cardiologie (hôpital général, CHU Dijon), Hôpital général (CHU Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, EDF (EDF), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Dynamiques Cellulaire et Tissulaire - Interdisciplinarité, Modélisation & Microscopie (TIMC-IMAG-DyCTiM2), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Maladies Rares - Génétique et Métabolisme (MRGM), Groupe de Recherche Clinique : Déficience Intellectuelle et Autisme (GRC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Groupe Hospitalier Est, IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Université de Bourgogne (UB), Dynamique Cellulaire et Tissulaire- Interdisciplinarité, Modèles & Microscopies (TIMC-IMAG-DyCTiM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, [ SDV.MHEP.PED ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, Haploinsufficiency, cerebral hypomyelination, west-syndrome, Bioinformatics, Craniofacial Abnormalities, 0302 clinical medicine, Intellectual disability, STXBP1, Child, Genetics (clinical), Nail patella syndrome, Genetics, Endoglin, Syndrome, 3. Good health, developmental delay, Phenotype, intellectual disability, Medical genetics, Female, Chromosome Deletion, Chromosomes, Human, Pair 9, medicine.medical_specialty, Adolescent, LIM-Homeodomain Proteins, Biology, Contiguous gene syndrome, Article, 03 medical and health sciences, Munc18 Proteins, Genetic linkage, medicine, Humans, de-novo mutations, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, disease, Epilepsy, infantile epileptic encephalopathy, association, deletions, medicine.disease, Human genetics, 030104 developmental biology, nail-patella syndrome, 030217 neurology & neurosurgery, Transcription Factors
Abstract: International audience; The increasing use of array-CGH in malformation syndromes with intellectual disability could lead to the description of new contiguous gene syndrome by the analysis of the gene content of the microdeletion and reverse phenotyping. Thanks to a national and international call for collaboration by Achropuce and Decipher, we recruited four patients carrying de novo overlapping deletions of chromosome 9q33.3q34.11, including the STXBP1, the LMX1B and the ENG genes. We restrained the selection to these three genes because the effects of their haploinsufficency are well described in the literature and easily recognizable clinically. All deletions were detected by array-CGH and confirmed by FISH. The patients display common clinical features, including intellectual disability with epilepsy, owing to the presence of STXBP1 within the deletion, nail dysplasia and bone malformations, in particular patellar abnormalities attributed to LMX1B deletion, epistaxis and cutaneousmucous telangiectasias explained by ENG haploinsufficiency and common facial dysmorphism. This systematic analysis of the genes comprised in the deletion allowed us to identify genes whose haploinsufficiency is expected to lead to disease manifestations and complications that require personalized follow-up, in particular for renal, eye, ear, vascular and neurological manifestations.
Published: 2016

33. The impact of cardiac ischemia/reperfusion on the mitochondria-cytoskeleton interactions

Author: Stéphane Tanguy, Karin Pernet-Gallay, Rafaela Bagur, Sarah Foriel, Alexei Grichine, Tuuli Kaambre, François Boucher, Rita Guzun, Caroline Sanchez, Yves Usson, Andrey V. Kuznetsov, Laboratory of Fundamental and Applied Bioenergetics = Laboratoire de bioénergétique fondamentale et appliquée (LBFA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Physiologie cardio-Respiratoire Expérimentale Théorique et Appliquée (TIMC-IMAG-PRETA), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), LIPHY-DYFCOM, Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cardiac Surgery Research Laboratory, Department of Heart Surgery-Innsbruck Medical University [Austria] (IMU), Dynamique Cellulaire et Tissulaire- Interdisciplinarité, Modèles & Microscopies (TIMC-IMAG-DyCTiM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Heart Ventricles, Cell Respiration, Myocardial Reperfusion Injury, Oxidative phosphorylation, Mitochondrion, Creatine, Mitochondria, Heart, Phosphocreatine, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Tubulin, Animals, Rats, Wistar, Cytoskeleton, Molecular Biology, 030102 biochemistry & molecular biology, biology, Myocardium, Cell biology, 030104 developmental biology, chemistry, biology.protein, Molecular Medicine, Creatine kinase, Intracellular
Abstract: International audience; Cardiac ischemia-reperfusion (IR) injury compromises mitochondrial oxidative phosphorylation (OxPhos) and compartmentalized intracellular energy transfer via the phosphocreatine/creatine kinase (CK) network. The restriction of ATP/ADP diffusion at the level of the mitochondrial outer membrane (MOM) is an essential element of compartmentalized energy transfer. In adult cardiomyocytes, the MOM permeability to ADP is regulated by the interaction of voltage-dependent anion channel with cytoskeletal proteins, particularly with β tubulin II. The IR-injury alters the expression and the intracellular arrangement of cytoskeletal proteins. The objective of the present study was to investigate the impact of IR on the intracellular arrangement of β tubulin II and its effect on the regulation of mitochondrial respiration. Perfused rat hearts were subjected to total ischemia (for 20min (I20) and 45min (I45)) or to ischemia followed by 30min of reperfusion (I20R and I45R groups). High resolution respirometry and fluorescent confocal microscopy were used to study respiration, β tubulin II and mitochondrial arrangements in cardiac fibers. The results of these experiments evidence a heterogeneous response of mitochondria to IR-induced damage. Moreover, the intracellular rearrangement of β tubulin II, which in the control group colocalized with mitochondria, was associated with increased apparent affinity of OxPhos for ADP, decreased regulation of respiration by creatine without altering mitochondrial CK activity and the ratio between octameric to dimeric isoenzymes. The results of this study allow us to highlight changes of mitochondrial interactions with cytoskeleton as one of the possible mechanisms underlying cardiac IR injury.
Published: 2016

34. CD1d-restricted peripheral T cell lymphoma in mice and humans

Author: Olivier Hermine, Philippe Gaulard, Paul Mondière, Martine Ffrench, Thierry Defrance, Mitchell Kronenberg, Tayla Heavican, Laurent Genestier, Archana Khurana, Rémy Robinot, Alexandra Traverse-Glehen, Marco Herling, Thierry Lamy, Nadine Martin, Emmanuel Bachy, Javeed Iqbal, Mikael Roussel, Mirjam Urb, Gabriel Bricard, Lucile Baseggio, Shilpi Chandra, Simon de Bernard, Laurent Buffat, Patrice N. Marche, Gilles Salles, Vahid Asnafi, Joël Lachuer, Alexandra Schrader, Olivier Blond, Stéphane Dalle, Olivier Thaunat, Sophie Gazzo, Giuliano Crispatzu, Morgan Taillardet, Magali Le Garff-Tavernier, Lymphocytes B effecteurs et à mémoire – Effector and memory B cells, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), La Jolla Institute for Immunology [La Jolla, CA, États-Unis], AltraBio [Lyon], Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Nebraska Medical Center, University of Nebraska System, Laboratoire d'Hématologie Cellulaire, Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), University of Cologne, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de référence des mastocytoses (CEREMAST), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hématologie Adulte, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Hematologie, CHU Pontchaillou [Rennes], Microenvironnement et cancer (MiCa), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Département de pathologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Association Instituts Carnot, HE-3553/4-1, Deutsche Forschungsgemeinschaft, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), La Jolla Institute for Allergy and Immunology (LIA), La Jolla Institute for Allergy & Immunology, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de référence des mastocytoses, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Centre International de Recherche en Infectiologie ( CIRI ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule ( LBMC ), Service d'Anatomie Pathologique, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Transplantation Rénale et d'Immunologie Clinique, Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université de Lyon, Institut Mondor de Recherche Biomédicale ( IMRB ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon ( CRCL ), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Centre de Recherche des Cordeliers ( CRC ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Necker Enfants-Malades (INEM) ( INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) ), Microenvironnement et cancer ( MiCa ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Department of Pathology and Microbiology, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Service d'hématologie, Hospices Civils de Lyon, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) - École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), S P Jain School of Global Management (.) (SPJ), Laboratoire d'anatomie et de cytopathologie - Centre hospitalier Lyon Sud, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon) - Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF) - CHU Grenoble - EFS - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physique des Particules de Marseille (CPPM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 - Aix Marseille Université (AMU) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3), Universität zu Lübeck [Lübeck], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) - Centre Léon Bérard [Lyon], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - École pratique des hautes études (EPHE) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Service de Radio-Oncologie [Lyon], Hospices Civils de Lyon - Centre Hospitalier Lyon Sud [Pierre Bénite], Institut Imagine (UMR 1163), Laboratory of Cellular and Molecular Mechanisms of Hemathological Disorders and Therapeutic Implication, Institut Necker Enfants-Malades (INEM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole), Université de Rennes 1 (UR1) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12) - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) - Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Albert Bonniot, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12) - IFR10, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Henri Mondor - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, T cell, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Receptors, Antigen, T-Cell, chemical and pharmacologic phenomena, Article, Mice, 03 medical and health sciences, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Antigen, Blocking antibody, medicine, Animals, Antigens, Ly, Humans, Immunology and Allergy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Research Articles, Mice, Knockout, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biology, Lymphoma, T-Cell, Peripheral, hemic and immune systems, Natural killer T cell, medicine.disease, Peripheral T-cell lymphoma, 3. Good health, Lymphoma, [SDV] Life Sciences [q-bio], Streptococcus pneumoniae, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, CD1D, biology.protein, Female, Antigens, CD1d, Tumor Suppressor Protein p53, Antibody, NK Cell Lectin-Like Receptor Subfamily B, Signal Transduction
Abstract: Genestier et al. shed light on the cellular origin of peripheral T cell lymphoma (PTCL), showing that in both mice and humans, unconventional CD1d-restricted T cells may give rise to PTCL., Peripheral T cell lymphomas (PTCLs) are a heterogeneous entity of neoplasms with poor prognosis, lack of effective therapies, and a largely unknown pathophysiology. Identifying the mechanism of lymphomagenesis and cell-of-origin from which PTCLs arise is crucial for the development of efficient treatment strategies. In addition to the well-described thymic lymphomas, we found that p53-deficient mice also developed mature PTCLs that did not originate from conventional T cells but from CD1d-restricted NKT cells. PTCLs showed phenotypic features of activated NKT cells, such as PD-1 up-regulation and loss of NK1.1 expression. Injections of heat-killed Streptococcus pneumonia, known to express glycolipid antigens activating NKT cells, increased the incidence of these PTCLs, whereas Escherichia coli injection did not. Gene expression profile analyses indicated a significant down-regulation of genes in the TCR signaling pathway in PTCL, a common feature of chronically activated T cells. Targeting TCR signaling pathway in lymphoma cells, either with cyclosporine A or anti-CD1d blocking antibody, prolonged mice survival. Importantly, we identified human CD1d-restricted lymphoma cells within Vδ1 TCR-expressing PTCL. These results define a new subtype of PTCL and pave the way for the development of blocking anti-CD1d antibody for therapeutic purposes in humans.
Published: 2016

35. Sofosbuvir-based antiviral therapy in hepatitis C virus patients with severe renal failure

Author: Jérôme Dumortier, François Bailly, Anaïs Vallet-Pichard, Marie-Claude Gagnieu, Sylvie Radenne, Olivier Guillaud, François Habersetzer, Jean-Didier Grangé, Nassim Kamar, Anne Minello, Georges-Philippe Pageaux, Laurent Alric, Vincent Leroy, Service d'hépatogastroentérologie [Hôpital Edouard Herriot, Hospices Civils de Lyon], Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service d'hépatogastroentérologie [Hôpital de la Croix-Rousse, Hospices Civils de Lyon], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Département d'Hépato-Gastroentérologie et de Transplantation Hépatique [CHU Saint-Eloi], Université de Montpellier (UM)-CHU Saint-Eloi, Département d'hépatologie [CHU Cochin], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Pôle Hépato-digestif, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Hospices Civils de Lyon, Groupement Hospitalier Edouard Herriot, Laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire, Lyon, France, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes, Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Service de Medecine Interne, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépato-gastroentérologie [CHU Grenoble Alpes], Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes (CHU Grenoble Alpes), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Université de Montpellier ( UM ) -CHU Saint-Eloi, Institut Pasteur [Paris]-CHU Cochin [AP-HP]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Service d'hépato-gastro-entérologie [Hôpital Tenon], CHU Tenon [APHP], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Centre de Physiopathologie de Toulouse Purpan ( CPTP ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Pharmacochimie et Pharmacologie Pour le Développement ( PHARMA-DEV ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes ( CHU Grenoble Alpes ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service Médecine interne [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)
Subjects: [ SDV.MHEP.UN ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, Simeprevir, Male, medicine.medical_specialty, Daclatasvir, Sofosbuvir, Hepatitis C virus, medicine.medical_treatment, 030232 urology & nephrology, Hepacivirus, medicine.disease_cause, Gastroenterology, [SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Pegylated interferon, Internal medicine, medicine, Humans, Renal Insufficiency, Retrospective Studies, Transplantation, direct-acting antiviral, tolerance, treatment, business.industry, Ribavirin, Hepatitis C, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, haemodialysis, chemistry, Nephrology, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, Hemodialysis, hepatitis C, business, medicine.drug, Glomerular Filtration Rate
Abstract: IF 4.470; International audience; BackgroundChronic hepatitis C virus (HCV) infection is the most common chronic liver disease in patients with end-stage renal disease (ESRD). Over the last few years, second-generation direct-acting antivirals have been revolutionary in the treatment of hepatitis C, and sofosbuvir (SOF) is the backbone of most modern treatment strategies. Since SOF is eliminated through the kidney, the aim of this multicentre retrospective study was to assess its antiviral efficacy and safety in HCV-infected patients with severe renal failure [including haemodialysis (HD) patients].MethodsFifty patients (36 males, mean age ± standard deviation 60.5 ± 7.5 years) with chronic HCV infection (G1: 28/56%, cirrhosis: 27/54%) and severe renal failure [i.e. MDRD estimated glomerular filtration rate (eGFR)
Published: 2016

36. Identification of a new locus at 16q12 associated with time to asthma onset

Author: Marie-Hélène Dizier, Isabelle Pin, Raquel Granell, Medea Imboden, Markus J. Ege, Chloé Sarnowski, Maxim B. Freidin, Alan L. James, Catherine Laprise, Nicole Probst-Hensch, Mark Lathrop, A. S. Karunas, Pierre-Emmanuel Sugier, Elza Khusnutdinova, Emmanuelle Bouzigon, Miriam F. Moffatt, Ludmila M. Ogorodova, Valérie Siroux, A. John Henderson, Manolis Kogevinas, Erika von Mutius, William O.C.M. Cookson, Deborah Jarvis, Florence Demenais, Wellcome Trust, Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Variabilité Génétique et Maladies Humaines, Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), School of Social and Community Medicine [Bristol], University of Bristol [Bristol], Respiratory Epidemiology, Occupational Medicine & Public Health [London], Imperial College London- National Heart & Lung Institute - NHLI-MRC -PHE Centre for Environment & Health, MRC-PHE Centre for Environment & Health, Dr von Hauner Children's Hospital [Munich, Germany], Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), Comprehensive Pneumology Center Munich [Munich, Germany] ( CPC -M), German Center for Lung Research - DZL [Munich, Germany], Swiss Tropical and Public Health Institute [Basel], University of Basel (Unibas), Département des Sciences Fondamentales [Saguenay, QC, Canada], Université du Québec à Chicoutimi (UQAC), Institute of Biochemistry and Genetics [Bashkortostan Republic, Russia], Russian Academy of Sciences / Ufa Scientific Centre [Bashkortostan Republic, Russia]], Department of Genetics and Fundamental Medicine [Bashkortostan Republic, Russia], Bashkir State University (BASHEDU), Population Genetics Laboratory [Tomsk, Russia], Research Institute for Medical Genetics [Tomsk, Russia], National Heart and Lung Institute [London, UK], Imperial College London-British Heart Foundation, Genome Quebec Innovation Centre [Montréal, Canada], McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Equipe d'Épidémiologie Environnementale appliquée à la Reproduction et la Santé Respiratoire (CRI INSERM/UJF - U823 ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Central Research Laboratory [Tomsk, Russia], Siberian State Medical University [Tomsk, Russia], School of Population Health [Crawley, Western Australia], The University of Western Australia (UWA), Department of Pulmonary Physiology and Sleep Medicine [Nedlands, Western Australia], Busselton Population Medical Research Institute [Nedlands, Western Australia] -Sir Charles Gairdner Hospital [Nedlands, Western Australia], CIBER de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Centre for Research in Environmental Epidemiology [Barcelona, Spain] (CREAL), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF)-Municipal Institute of Medical Research - IMIM [Barcelona, Spain]-ISGlobal - Campus Clínic [Barcelona, Spain], The authors are grateful to the three CIC-Inserm of Necker, Grenoble and Marseille who supported the EGEA study and in which subjects were examined. They are also grateful to the biobanks in Lille (CIC-Inserm) and at Annemasse (Etablissement français du sang) where EGEA biological samples are stored, Bouzigon, Emmanuelle, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF)-ISGlobal - Campus Clínic [Barcelona, Spain]-Municipal Institute of Medical Research - IMIM [Barcelona, Spain]
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Adolescent, Genotype, Allergy, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, CYLD, Nod2 Signaling Adaptor Protein, IL1RL1, Genome-wide association study, Locus (genetics), Single-nucleotide polymorphism, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Biology, White People, NOD2, survival analysis, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, age of onset, medicine, Immunology and Allergy, Humans, genetics, Child, Asthma, Genetic association, Genetics, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, genome-wide association study, Tumor Suppressor Proteins, conditional analysis, Genetic Variation, medicine.disease, 3. Good health, Deubiquitinating Enzyme CYLD, respiratory tract diseases, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, 030228 respiratory system, 1107 Immunology, Expression quantitative trait loci, Female, Age of onset, Chromosomes, Human, Pair 16
Abstract: Background Asthma is a heterogeneous disease in which age of onset plays an important role. Objective We sought to identify the genetic variants associated with time to asthma onset (TAO). Methods We conducted a large-scale meta-analysis of 9 genome-wide association studies of TAO (total of 5462 asthmatic patients with a broad range of age of asthma onset and 8424 control subjects of European ancestry) performed by using survival analysis techniques. Results We detected 5 regions associated with TAO at the genome-wide significant level (P < 5 × 10−8). We evidenced a new locus in the 16q12 region (near cylindromatosis turban tumor syndrome gene [CYLD]) and confirmed 4 asthma risk regions: 2q12 (IL-1 receptor–like 1 [IL1RL1]), 6p21 (HLA-DQA1), 9p24 (IL33), and 17q12-q21 (zona pellucida binding protein 2 [ZPBP2]–gasdermin A [GSDMA]). Conditional analyses identified 2 distinct signals at 9p24 (both upstream of IL33) and 17q12-q21 (near ZPBP2 and within GSDMA). Together, these 7 distinct loci explained 6.0% of the variance in TAO. In addition, we showed that genetic variants at 9p24 and 17q12-q21 were strongly associated with an earlier onset of childhood asthma (P ≤ .002), whereas the 16q12 single nucleotide polymorphism was associated with later asthma onset (P = .04). A high burden of disease risk alleles at these loci was associated with earlier age of asthma onset (4 vs 9-12 years, P = 10−4). Conclusion The new susceptibility region for TAO at 16q12 harbors variants that correlate with the expression of CYLD and nucleotide-binding oligomerization domain 2 (NOD2), 2 strong candidates for asthma. This study demonstrates that incorporating the variability of age of asthma onset in asthma modeling is a helpful approach in the search for disease susceptibility genes.
Published: 2016

37. H1–nucleosome interactions and their functional implications

Author: Sharma, Abhishek Bharadwaj, Van Dyck, Eric, Razvi, Syed Shoeb, Hasan, Mohammed Nihal, Hassan, Mohammed, Moselhy, Said Salama, Abualnaja, Khalid Omer, Kumosani, Taha Abduallah, Halwani, Majed, Asami, Tadao, Shukla, Manu, Soueidan, Lama, Noirclerc-Savoye, Marjolaine, Le Roy, Aline, Omran, Ziad, Zamzami, Mazin, Al-Malki, Abdulrahman Labeed, Choudhry, Hani, Andronov, Leonid, Michalon, Jonathan, Orlov, Igor, Vonesch, Jean-Luc, Klaholz, Bruno, Richert, Ludovic, Ashraf, Waseem, Alhosin, Mahmoud, Zaayter, Liliyana, Ahmad, Tanveer, Mély, Yves, Mousli, Marc, Garcia-Saez, Isabel, Cutter, Amber, Reymer, Anna, Syed, Sajad, Tonchev, Ognyan, Crucifix, Corinne, Lavery, Richard, Hayes, Jeffrey, Petosa, Carlo, Ibrahim, Abdulkhaleg, Gras, Stéphanie Le, VELT, Amandine, Jost, Bernard, Bronner, Christian, Fromental-Ramain, Catherine, Ramain, Philippe, Ors, Aysegul, Favier, Bertrand, Dalkara, Defne, Ozturk, Mehmet, Naidenov, Mladen, Ramos, Lorrie, Shuaib, Muhammad, Syed, Sajad Hussain, Lone, Imtiaz Nizar, Boopathi, Ramachandran, Fontaine, Emeline, Papai, Gabor, Tachiwana, Hiroaki, Gautier, Thierry, Skoufias, Dimitrios, Padmanabhan, Kiran, Kurumizaka, Hitoshi, Schultz, Patrick, Charles Richard, John Lalith, Shukla, Manu Shubhdarshan, Menoni, Hervé, Lone, Imtiaz Nisar, Roulland, Yohan, Ben Simon, Elsa, Kundu, Tapas, Angelov, Dimitar, Latrick, Chrysa, Marek, Martin, Ouararhni, Khalid, Papin, Christophe, Stoll, Isabelle, Ignatyeva, Maria, Obri, Arnaud, Ennifar, Eric, Romier, Christophe, Bednar, Jan, Hamiche, Ali, Dimitrov, Stefan, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Fonctions et dysfonctions épithéliales - UFC (EA 4267) (FDE), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de Bioimagerie et Pathologies (UMR 7021), Université de Strasbourg (UNISTRA), Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie - UMR 7213 (LBP), Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Bioimagerie et Pathologies (LBP), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for advanced biosciences, Uiversité de Lyon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biochimie théorique [Paris] (LBT (UPR_9080)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Santé de la vigne et qualité du vin (SVQV), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre Léon Bérard [Lyon], Department of Medical Biology and Genetics, School of Medicine-Dokuz Eylul University, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut cellule souche et cerveau (U846 Inserm - UCBL1), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris sciences et lettres (PSL), Synchronous programming for the trusted component-based engineering of embedded systems and mission-critical systems (ESPRESSO), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Waseda University, Molecular Biology and Genetics Unit [Bangalore, India] (Transcription and Disease Laboratory), Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research (JNCASR)-Indian Institute of Science, Biologie moléculaire et cellulaire de la différenciation, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Albert Bonniot-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote (LBME), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Architecture et réactivité de l'ARN (ARN), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie Physique (LSP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM U823, équipe 4 (Chromatine et Epigénétique), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Strasbourg (UNISTRA), School of Medicine-Dokuz Eylül Üniversitesi = Dokuz Eylül University [Izmir] (DEÜ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Bioimagerie et Pathologie (LBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut cellule souche et cerveau / Stem Cell and Brain Research Institute (SBRI), PSL Research University (PSL), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Histone-modifying enzymes, Molecular Sequence Data, Biophysics, Biochemistry, Histones, 03 medical and health sciences, Structural Biology, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Genetics, Animals, Humans, Nucleosome, Histone code, Amino Acid Sequence, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Chromatin Fiber, 030102 biochemistry & molecular biology, biology, Chromatin Assembly and Disassembly, Linker DNA, Nucleosomes, Chromatin, 030104 developmental biology, Histone, Gene Expression Regulation, Chromatosome, biology.protein
Abstract: Linker histones are three domain proteins and consist of a structured (globular) domain, flanked by two likely non-structured NH2- and COOH-termini. The binding of the linker histones to the nucleosome was characterized by different methods in solution. Apparently, the globular domain interacts with the linker DNA and the nucleosome dyad, while the binding of the large and rich in lysines COOH-terminus results in "closing" the linker DNA of the nucleosome and the formation of the "stem" structure. What is the mode of binding of the linker histones within the chromatin fiber remains still elusive. Nonetheless, it is clear that linker histones are essential for both the assembly and maintenance of the condensed chromatin fiber. Interestingly, linker histones are post-translationally modified and how this affects both their binding to chromatin and functions is now beginning to emerge. In addition, linker histones are highly mobile in vivo, but not in vitro. No explanation of this finding is reported for the moment. The higher mobility of the linker histones should, however, have strong impact on their function. Linker histones plays an important role in gene expression regulation and other chromatin related process and their function is predominantly regulated by their posttranslational modifications. However, the detailed mechanism how the linker histones do function remains still not well understood despite numerous efforts. Here we will summarize and analyze the data on the linker histone binding to the nucleosome and the chromatin fiber and will discuss its functional consequences.
Published: 2016

38. Chauffage par effet plasmon pour la désorption localisée de cellules capturées sur une biopuce

Author: Thierry Livache, Yoann Roupioz, Dieudonné R. Baganizi, Patrice N. Marche, Roberto Calemczuk, Radoslaw Bombera, Elodie Engel, Loïc Leroy, Loïc Laplatine, Structures et propriétés d'architectures moléculaire (SPRAM - UMR 5819), Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU GRENOBLE-Inserm : U823-EFS, Chimie pour la Reconnaissance et l’Etude d’Assemblages Biologiques (CREAB), SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), CHU GRENOBLE-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Inserm : U823-EFS, Engel, Elodie, and Sciencesconf.org, CCSD
Subjects: [PHYS]Physics [physics], [SPI] Engineering Sciences [physics], Chemistry, Analytical chemistry, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, [PHYS] Physics [physics], 0104 chemical sciences, [SPI]Engineering Sciences [physics], Biophysics, Laser illumination, Surface plasmon resonance, 0210 nano-technology, Biochip, Engineering (miscellaneous), Instrumentation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; This work proposes a miniaturized system able to perform multiple cell capture followed by cell-type selective release from a biochip surface. Unlabeled lymphocytes are first specifically captured onto a DNA array by antibody-DNA conjugates. The immobilized cells are subsequently released under spatio-temporal control within local heating generated by intense Surface Plasmon Resonance (SPR) produced by laser illumination.
Published: 2016

39. Systemic antifungal therapy for proven or suspected invasive candidiasis: the AmarCAND 2 study

Author: Patrick Devos, Caroline Bensoussan, Elie Azoulay, Didier Guillemot, Philippe Montravers, Hervé Dupont, Jean-Michel Constantin, Jean-Pierre Gangneux, Jean-Paul Mira, Pierre-François Perrigault, Olivier Leroy, Jean-François Timsit, Sébastien Bailly, Olivier Lortholary, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Service de Parasitologie-Mycologie [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Réanimation polyvalente, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Département de biostatistiques, Université de Lille, Droit et Santé, CHU Amiens-Picardie, Service d'anesthésie - réanimation chirurgicale [CHU Bichat], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Anésthésie Réanimation [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Pharmacoépidémiologie et maladies infectieuses (PhEMI), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Soins Intensifs et de Maladies Infectieuses, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Hospitalier Tourcoing, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Hôpital Cochin [AP-HP], CHU Lille, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Clermont-Ferrand, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), MSD France, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPC), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de recherche, santé, environnement et travail ( Irset ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) -Université des Antilles ( UA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut Cochin ( UM3 (UMR 8104 / U1016) ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP]-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Service d'anesthésie - réanimation chirurgicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Département anesthésie et réanimation, CHU Clermont-Ferrand-Hôpital d'Estaing, Pharmacoépidémiologie et maladies infectieuses ( PhEMI ), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), AP-HP Hôpital Raymond Poincaré [Garches], Hopital Saint Louis Paris, CHU Saint Louis [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
Subjects: 0301 basic medicine, Pediatrics, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, Population, Context (language use), Critical Care and Intensive Care Medicine, 03 medical and health sciences, Candidaemia, Internal medicine, Intensive care, medicine, Critically ill, education, Candida, education.field_of_study, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Septic shock, business.industry, Research, Mortality rate, Candidiasis, Odds ratio, medicine.disease, 3. Good health, SAPS II, Cohort study, business, Fluconazole, medicine.drug
Abstract: Background In the context of recent guidelines on invasive candidiasis (IC), how French intensive care units (ICUs) are managing IC? Methods This is a prospective observational multicenter cohort study. During 1 year (2012–2013), 87 French ICUs enrolled consecutive patients with suspected or proven IC (SIC or PIC) and receiving systemic antifungal therapy (SAT). Data were collected up to 28 days after inclusion. Results We studied 835 patients, 291 with PIC and 544 with SIC. At SAT initiation, patients with SIC were significantly more severe (SAPS II 50.1 ± 18.7 vs. 46.2 ± 18.0). Severe sepsis or septic shock prompted to initiate empiric SAT in 70 % of SIC. Within 4 days in median, the initial SAT was modified in 49 % of patients with PIC vs. 33 % patients with SIC. Modifications were most often motivated by mycological results, and de-escalation was the most frequent change. Regarding compliance to IC management guidelines, echinocandin was used for 182 (62.5 %) patients with PIC, and 287 (52.7 %) of those with SIC; central venous catheter was removed in 87 (54.3 %) of patients with candidaemia, and 43 of the remaining patients received echinocandin; and de-escalation was undertaken after 5 days of SAT in 142 patients, after 10 days in 13 patients. As 20.6 % of SIC were secondarily documented, 403/835 (48 %) patients had finally a proven IC. Candida albicans was the main pathogen (65.3 %), then Candida glabrata (15.9 %). The 28-day mortality rates were 40.0 % in candidaemia, 25.4 % in cIAI, and 26.7 % in deep-seated candidiasis. In the overall population of patients with proven IC, four independent prognostic factors were identified: immunosuppression (Odds Ratio (OR) = 1.977: 1.03–3.794 95 % confidence interval (CI), p = 0.04), age (OR = 1.035; 1.017–1.053 95 % CI; p 46 on ICU admission (OR = 2.894; 1.81–4.626 95 % CI; p
Published: 2016

40. Origine développementale de la santé et des maladies (DOHaD), environnement et épigénétique [DOHaD: epidemiological researches]

Author: Delpierre , Cyrille, Lepeule , Johanna, Cordier , Sylvaine, Slama , Rémy, Heude , Barbara, Charles , Marie-Aline, Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Equipe avenir 'Environmental Epidemiology Applied to Fecundity and Reproduction', Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Épidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps, Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de recherche, santé, environnement et travail ( Irset ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) -Université des Antilles ( UA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité ( CRESS (U1153 / UMR_A 1125) ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], bacteria, complex mixtures
Abstract: National audience; Epidemiological researches in the field of DOHaD are in favor of a role of early environment, including chemical (pesticides), physical (air pollution), nutritional or psychosocial environment, on child and adult health. Disentangling the different factors of environment that may affect health, especially over time, and identifying critical periods of exposure remains a major challenge. The biological mechanisms involved remain elusive in human beings. Nevertheless, it seems that whatever the nature of the exposure, epigenetic mechanisms are currently discussed to explain how the environment may alter biological systems over time.; Les résultats épidémiologiques dans le domaine de la DOHaD (developmental origins of health and disease) sont en faveur d’un rôle de l’environnement précoce sur la santé immédiate mais aussi future, qu’il s’agisse de l’environnement physique, chimique, nutritionnel ou encore psychosocial. Faire la part des différents facteurs de l’environnement susceptibles de modifier la santé, notamment sur le long terme, et des périodes critiques d’exposition reste un enjeu majeur. De même, les multiples mécanismes biologiques impliqués restent encore, pour une grande part, à identifier chez l’homme. Il semble néanmoins que, quelle que soit la nature de l’exposition considérée, des mécanismes épigénétiques sont actuellement évoqués pour expliquer comment l’environnement est susceptible de modifier des systèmes biologiques sur le long terme.
Published: 2016

41. LIM Kinase Inhibitor Pyr1 Reduces the Growth and Metastatic Load of Breast Cancers

Author: Prunier, Chloé, Josserand, Véronique, Vollaire, Julien, Beerling, Evelyne, Koning, Leanne, Petropoulos, Christos, Destaing, Olivier, Hurbin, Amandine, Montemagno, Christopher, Prudent, Renaud, De Koning, Leanne, Kapur, Reuben, Cohen, Pascale A., Albiges-Rizo, Corinne, Coll, Jean-Luc, Rheenen, Jacco, Billaud, Marc, Lafanechere, Laurence, Hubrecht Institute for Developmental Biology and Stem Cell Research, Inserm U823, équipe 3 (Polarité, Développement et Cancer), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), INSERM U823, équipe 5 (cibles diagnostiques ou thérapeutiques et vectorisation de drogues dans le cancer du poumon), Service d'ORL et de chirurgie cervicale, CHU Grenoble-CHU Grenoble-Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Cancer Genomics Netherlands-Hubrecht Institute-KNAW, University Medical Center [Utrecht], Institut Curie [Paris], Dynamique des systèmes d'adhérence et différenciation (DySAD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Indiana University School of Medicine, Indiana University System, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pillet, Lauriane, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, Pathology, medicine.medical_specialty, Cells, Carbazoles, Motility, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Growth, Biology, Research Support, Cell morphology, Pediatrics, Microtubules, Metastasis, Lim kinase, Mice, 03 medical and health sciences, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, In vivo, Cell Line, Tumor, Journal Article, medicine, Animals, Humans, Neoplasm Invasiveness, Breast, Neoplasm Metastasis, Non-U.S. Gov't, Protein Kinase Inhibitors, Cell Proliferation, Microscopy, therapy, Kinase, Research Support, Non-U.S. Gov't, Lim Kinases, Cancer, Genomics, medicine.disease, 3. Good health, Phenotype, 030104 developmental biology, Oncology, Cell culture, Cancer research, Medicine, Female, France
Abstract: LIM kinases (LIMK) are emerging targets for cancer therapy, and they function as network hubs to coordinate actin and microtubule dynamics. When LIMKs are inhibited, actin microfilaments are disorganized and microtubules are stabilized. Owing to their stabilizing effect on microtubules, LIMK inhibitors may provide a therapeutic strategy to treat taxane-resistant cancers. In this study, we investigated the effect of LIMK inhibition on breast tumor development and on paclitaxel-resistant tumors, using a novel selective LIMK inhibitor termed Pyr1. Treatment of breast cancer cells, including paclitaxel-resistant cells, blocked their invasion and proliferation in vitro and their growth in vivo in tumor xenograft assays. The tumor-invasive properties of Pyr1 were investigated in vivo by intravital microscopy of tumor xenografts. A striking change of cell morphology was observed with a rounded phenotype arising in a subpopulation of cells, while other cells remained elongated. Notably, although Pyr1 decreased the motility of elongated cells, it increased the motility of rounded cells in the tumor. Pyr1 administration prevented the growth of metastasis but not their spread. Overall, our results provided a preclinical proof of concept concerning how a small-molecule inhibitor of LIMK may offer a strategy to treat taxane-resistant breast tumors and metastases. Cancer Res; 76(12); 3541–52. ©2016 AACR.
Published: 2016
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42. Male Infertility: Genetics, Mechanism, and Therapies

Author: Charles Coutton, Gianpiero D. Palermo, Rafael A. Fissore, Aminata Touré, Katrien Stouffs, Bos, Mireille, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Massachusetts [Boston] (UMass Boston), University of Massachusetts System (UMASS), Weill Medical College of Cornell University [New York], Universitair Ziekenhuis Brussel, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF) - CHU Grenoble - EFS - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ronald O. Perelman and Claudia Cohen Center for Reproductive Medicine, Institut Cochin (UM3 (UMR 8104 / U1016)), and Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Infertility, Male, medicine.medical_specialty, Article Subject, lcsh:Medicine, Context (language use), Biology, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Male infertility, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Intensive care medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Infertility, Male, Gynecology, 030219 obstetrics & reproductive medicine, General Immunology and Microbiology, Mechanism (biology), Public health, lcsh:R, General Medicine, medicine.disease, Causality, 3. Good health, 030104 developmental biology, Editorial, Risk assessment, Psychosocial
Abstract: The World Health Organization declaimed that infertility is a major global public health issue of the last few decades. Infertility is commonly defined as the failure to conceive after 1 year of unprotected intercourse and is estimated to concern 72.4 million people worldwide with 40.5 million currently seeking medical care. The overall burden of subfertility/infertility is significant, is likely underestimated, and has not displayed any decrease over the last 20 years. Male factors are estimated to be involved, at least partially, in half of the cases. While the diagnosis, medical treatment, and psychosocial management of infertility have rapidly evolved over the past 4 decades, some difficulties still persist. Little is known about the physiopathology of altered sperm production, its genetic causes, or the genetic and epigenetic consequences for the gamete and the forthcoming conceptus. The information generated by conventional semen analysis has historically classified patients into categories lacking knowledge of causality and leaving conventional therapy as somewhat empirical. One of the reasons for this lack of fundamental understanding is the heterogeneity of causal factors as male infertility is a typical multifactorial disorder with a strong genetic basis and additional factors such as urogenital infections, immunological or endocrine diseases, attack from reactive oxygen species (ROS), or perturbations from endocrine disruptors. Since assisted reproduction technology (ART) is widely used to achieve conception with gametes produced by compromised spermatogenesis, there is a clear need to detail the molecular pathogenesis of male infertility to improve long-term risk assessment on a case-by-case basis. In this context, research on the male partner will shed a much-needed light on the physiopathology of male reproduction, will enhance patient management, and constitutes a prerequisite for the development of new therapeutic solutions.
Published: 2016

43. Prospective evaluation of a new Aspergillus IgG EIA kit for the diagnosis of chronic and allergic pulmonary aspergillosis

Author: Dumollard , C., Bailly , S., Perriot , S., Brenier-Pinchart , M. P., Saint-Raymond , C., Camara , B., Gangneux , J. P., Persat , F., Valot , S., Grenouillet , F., Pelloux , H., Pinel , C., Cornet , M., Institut de Biologie et Pathologie, CHU Grenoble, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), CHU Pontchaillou [Rennes], Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), service de parasito-mycologie CHU Besancon, Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution ( IAME ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] ( LAPM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Institut de biologie moléculaire des plantes ( IBMP ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de recherche, santé, environnement et travail ( Irset ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) -Université des Antilles ( UA ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive ( LBBE ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), service de parasitologie mycologie CHU Jean Minjoz BESANCON, Hôpital Jean Minjoz-Hôpital Jean Minjoz, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] ( TIMC-IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Brenner, Nelly
Subjects: Chronic pulmonary aspergillosis, allergic bronchopulmonary aspe rgillosis, IgG antibodies, precipitins, [SDV.MP.MYC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, enzyme immunoassay, [ SDV.MP.MYC ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology
Abstract: International audience; Anti-Aspergillus IgG antibodies are important biomarkers for the diagnosis of chronic pulmonary aspergillosis (CPA) and allergic bronchopulmonary aspergillosis (ABPA). We compared the performance of a new commercial EIA (Bordier Affinity Products) with those of the Bio-Rad and Virion\Serion EIAs. This assay is novel in the association of two recombinant antigens with somatic and metabolic antigens of A. fumigatus. In a prospective multicentre study, 436 serum samples from 147 patients diagnosed with CPA (136 sera/104 patients) or ABPA (94 sera/43 patients) and from 205 controls (206 sera) were tested. We obtained sensitivities of 97%, 91.7%, and 86.1%, and specificities of 90.3%, 91.3%, and 81.5% for the Bordier, Bio-Rad and Virion\Serion tests, respectively. The Bordier kit was more sensitive than the Bio-Rad kit (p < 0.01), which was itself more sensitive than the Virion\Serion kit (p=0.04). The Bordier and Bio-Rad kits had similar specificities (p=0.8), both higher than that of the Virion\Serion kit (p=0.02). The areas under the ROC curves confirmed the superiority of the Bordier kit over the Bio-Rad and the Virion\Serion kits (0.977, 0.951 and 0.897, respectively; p < 0.01 for each comparison). In a subset analysis of 279 sera tested with the Bordier and Bio-Rad kits and an in-house immunoprecipitin assay (IPD), the Bordier kit had the highest sensitivity (97.7%), but the IPD tended to be more specific (71.2 and 84.7%, respectively; p=0.10).The use of recombinant, somatic and metabolic antigens in a single EIA improved the balance between sensitivity and specificity, resulting in an assay highly suitable for use in the diagnosis of chronic and allergic aspergillosis.
Published: 2016

44. Routine molecular profiling of cancer: results of a one-year nationwide program of the French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT) for advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) patients

Author: Barlesi, Fabrice, Mazières, Julien, Merlio, Jean-Philippe, Debieuvre, Didier, Mosser, Jean, Léna, Hervé, Ouafik, L'Houcine, Besse, Benjamin, Rouquette, Isabelle, Westeel, Virginie, Escande, Fabienne, Monnet, Isabelle, Lemoine, Antoinette, Veillon, Rémi, Blons, Hélène, Audigier-Valette, Clarisse, Bringuier, Pierre-Paul, Lamy, Régine, Beau-Faller, Michèle, Pujol, Jean-Louis, Sabourin, Jean-Christophe, Penault-Llorca, Frédérique, Denis, Marc G, Lantuejoul, Sylvie, Morin, Franck, Tran, Quân, Missy, Pascale, Langlais, Alexandra, Milleron, Bernard, Cadranel, Jacques, Soria, Jean-Charles, Zalcman, Gérard, Oncologie multidisciplinaire et innovations thérapeutiques [Hôpital Nord - APHM], Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital Nord [CHU - APHM]-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Rangueil-Larrey University Hospital, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Département de biologie de la tumeur, CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] (CH E.Muller Mulhouse), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de pneumologie [Rennes] = Pneumology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Département de biologie du cancer, Hôpital Nord [CHU - APHM], Institut Gustave Roussy (IGR), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) (CEF2P / CARCINO), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Microenvironnement et Physiopathologie de la Differenciation, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique (MEPPOT - U1147), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Intercommunal Toulon-La Seyne sur Mer - Hôpital Sainte-Musse, Equipe 4, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CH Bretagne Sud, Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moléculaire, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Département de Pathologie, CHU Grenoble, Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] (IFCT), Intergroupe Francophone de Cancérologie thoracique, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de pneumologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), French National Cancer Institute (INCa)., Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital Nord [CHU - APHM], Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie (CRO2), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Laboratoire de Transfert d'Oncologie Biologique [Hôpital Nord - APHM], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier de toulon, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), CH de Lorient, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Service d'Anatomie et Cytologie Pathologique [CHU Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Inserm : U823, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (UR 3181) (CEF2P / CARCINO), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital Nord [CHU - APHM], Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] ( CH E.Muller Mulhouse ), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace ( GHTHA ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de pneumologie, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -CHU Pontchaillou [Rennes], Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut Gustave Roussy ( IGR ), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole ( IUCT Oncopole - UMR 1037 ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC ( CEF2P / CARCINO ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique ( MEPPOT - U1147 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Sainte-Musse, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon ( CRCL ), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Dynamique des capacités humaines et des conduites de santé ( EPSYLON ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Jean Perrin Comprehensive Cancer Centre, Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] ( IFCT ), Service de Pneumologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Tenon [APHP], Service de pneumologie et réanimation [CHU Tenon], CHU Caen, Hôpital Larrey [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) ( CEF2P / CARCINO ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université de Montpellier ( UM ), Ouafik, L'Houcine, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Jonchère, Laurent, Service de Pneumologie = Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.PSR] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.PSR]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [ SDV.MHEP.PSR ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer
Abstract: International audience; Background: The molecular profiling of patients with advanced non-small-cell lung cancer (NSCLC) for known oncogenic drivers is recommended during routine care. Nationally, however, the feasibility and effects on outcomes of this policy are unknown. We aimed to assess the characteristics, molecular profiles, and clinical outcomes of patients who were screened during a 1-year period by a nationwide programme funded by the French National Cancer Institute. Methods This study included patients with advanced NSCLC, who were routinely screened for EGFR mutations, ALK rearrangements, as well as HER2 (ERBB2), KRAS, BRAF, and PIK3CA mutations by 28 certified regional genetics centres in France. Patients were assessed consecutively during a 1-year period from April, 2012, to April, 2013. We measured the frequency of molecular alterations in the six routinely screened genes, the turnaround time in obtaining molecular results, and patients' clinical outcomes. This study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT01700582. Findings 18 679 molecular analyses of 17 664 patients with NSCLC were done (of patients with known data, median age was 64·5 years [range 18–98], 65% were men, 81% were smokers or former smokers, and 76% had adenocarcinoma). The median interval between the initiation of analysis and provision of the written report was 11 days (IQR 7–16). A genetic alteration was recorded in about 50% of the analyses; EGFR mutations were reported in 1947 (11%) of 17 706 analyses for which data were available, HER2 mutations in 98 (1%) of 11 723, KRAS mutations in 4894 (29%) of 17 001, BRAF mutations in 262 (2%) of 13 906, and PIK3CA mutations in 252 (2%) of 10 678; ALK rearrangements were reported in 388 (5%) of 8134 analyses. The median duration of follow-up at the time of analysis was 24·9 months (95% CI 24·8–25·0). The presence of a genetic alteration affected first-line treatment for 4176 (51%) of 8147 patients and was associated with a significant improvement in the proportion of patients achieving an overall response in first-line treatment (37% [95% CI 34·7–38·2] for presence of a genetic alteration vs 33% [29·5–35·6] for absence of a genetic alteration; p=0·03) and in second-line treatment (17% [15·0–18·8] vs 9% [6·7–11·9]; p
Published: 2016

45. Prediction of traction forces of motile cells

Author: Alain Duperray, Richard Michel, Claude Verdier, Jocelyn Etienne, Clément Roux, Valentina Peschetola, Valérie M. Laurent, Etienne, Jocelyn, BLANC - Migration transendothéliale de cellules cancéreuses - - TRANSMIG2012 - ANR-12-BS09-0020 - BLANC - VALID, DYnamique des Fluides COmplexes et Morphogénèse [Grenoble] (DYFCOM-LIPhy), Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), INSERM U823, équipe 8 (Immunologie Analytique des Pathologies Chroniques), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-12-BS09-0020,TRANSMIG,Migration transendothéliale de cellules cancéreuses(2012), LIPHY-DYFCOM, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Subjects: 0301 basic medicine, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Traction (engineering), Biomedical Engineering, Biophysics, Bioengineering, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Biochemistry, Single frame, Traction force microscopy, Biomaterials, [PHYS.MECA.MEMA]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanics of materials [physics.class-ph], 03 medical and health sciences, Rheology, [PHYS.MECA.MEMA] Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanics of materials [physics.class-ph], [SDV.BC.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], [PHYS.MECA.MEFL] Physics [physics]/Mechanics [physics]/Fluid mechanics [physics.class-ph], [PHYS.MECA.MEFL]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Fluid mechanics [physics.class-ph], Simulation, Physics, Tractive force, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Mechanics, Articles, Finite element method, 030104 developmental biology, Adhesive, Biotechnology
Abstract: When crawling on a flat substrate, living cells exert forces on it via adhesive contacts, enabling them to build up tension within their cytoskeleton and to change shape. The measurement of these forces has been made possible by traction force microscopy (TFM), a technique which has allowed us to obtain time-resolved traction force maps during cell migration. This cell ‘footprint’ is, however, not sufficient to understand the details of the mechanics of migration, that is how cytoskeletal elements (respectively, adhesion complexes) are put under tension and reinforce or deform (respectively, mature and/or unbind) as a result. In a recent paper, we have validated a rheological model of actomyosin linking tension, deformation and myosin activity. Here, we complement this model with tentative models of the mechanics of adhesion and explore how closely these models can predict the traction forces that we recover from experimental measurements during cell migration. The resulting mathematical problem is a PDE set on the experimentally observed domain, which we solve using a finite-element approach. The four parameters of the model can then be adjusted by comparison with experimental results on a single frame of an experiment, and then used to test the predictive power of the model for following frames and other experiments. It is found that the basic pattern of traction forces is robustly predicted by the model and fixed parameters as a function of current geometry only.
Published: 2016

46. Ultrasmall Rigid Particles as Multimodal Probes for Medical Applications

Author: Claire Bernhard, Jean-Luc Coll, Sophie Laurent, Anna Mignot, Stéphane Roux, Olivier Tillement, Pascal Perriat, Vasile Stupar, Rodolphe Antoine, Chantal Rémy, Lucie Sancey, Frédéric Boschetti, Emmanuel L. Barbier, Franck Denat, Sandrine Dufort, Catherine Ghezzi, Robert N. Muller, Luce Vander Elst, François Lux, Claire Brunet, Véronique Josserand, Pierre Mowat, Cédric Louis, Géraldine Le Duc, Alexis Broisat, Philippe Dugourd, Laboratoire de Physico-Chimie des Matériaux Luminescents ( LPCML ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Matériaux, ingénierie et science [Villeurbanne] ( MATEIS ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Nano-H SAS, Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] ( ICMUB ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CheMatech - Macrocycle Design Technologies, Laboratoire de Spectrométrie Ionique et Moléculaire ( LASIM ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), General, Organic and Biomedical Chemistry, Université de Mons ( UMons ), NMR and Molecular Imaging Laboratory, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), INSERM U823, équipe 5 (cibles diagnostiques ou thérapeutiques et vectorisation de drogues dans le cancer du poumon), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique ( ANTE-INSERM U836, équipe 5 ), Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Radiopharmaceutiques biocliniques, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), European Synchrotron Radiation Facility ( ESRF ), Univers, Transport, Interfaces, Nanostructures, Atmosphère et environnement, Molécules ( UTINAM ), Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire de Physico-Chimie des Matériaux Luminescents (LPCML), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Matériaux, ingénierie et science [Villeurbanne] (MATEIS), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie Ionique et Moléculaire (LASIM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Mons (UMons), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Univers, Transport, Interfaces, Nanostructures, Atmosphère et environnement, Molécules (UMR 6213) (UTINAM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Dojat, Michel, and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Diagnostic Imaging, Male, Materials science, Gadolinium, Shell (structure), Mice, Nude, chemistry.chemical_element, Hepatic clearance, Nanotechnology, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, [ CHIM ] Chemical Sciences, 01 natural sciences, Catalysis, Mice, Animals, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Particle Size, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 010405 organic chemistry, Animal imaging, General Medicine, General Chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Rats, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Mice, Inbred C57BL, Core (optical fiber), chemistry, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Nanoparticles, Female, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Gadolinium oxide, Particle size, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; Ultrasmall but multifunctional: Rigid imaging particles that are smaller than 5 nm in size can be obtained in a top-down process starting from a core–shell structure (core=gadolinium oxide; shell=polysiloxane). They represent the first multifunctional silica-based particles that are sufficiently small to escape hepatic clearance and enable animal imaging by four complementary techniques.
Published: 2011

47. The investigation of asthma phenotypes

Author: Judith Garcia-Aymerich, Valérie Siroux, Boudier, Anne, Equipe 12 (Epidémiologie Environnementale appliquée à la Reproduction et la Santé Respiratoire), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Center for Research in Environmental Epidemiology (CREAL), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF)-Catalunya ministerio de salud, IMIM-Hospital del Mar, Generalitat de Catalunya, and Instituto de Salud Carlos III [Madrid] (ISC)
Subjects: Adult, MESH: Socioeconomic Factors, medicine.medical_specialty, MESH: Asthma, Asthma phenotypes, Immunology, MEDLINE, Disease, MESH: Phenotype, Severity of Illness Index, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, immune system diseases, MESH: Child, MESH: Severity of Illness Index, Severity of illness, medicine, Humans, Immunology and Allergy, Child, Psychiatry, Socioeconomic status, 030304 developmental biology, Asthma, 0303 health sciences, MESH: Humans, Evidence-Based Medicine, business.industry, MESH: Adult, Evidence-based medicine, medicine.disease, respiratory tract diseases, 3. Good health, Phenotype, Socioeconomic Factors, 030228 respiratory system, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Disease Progression, Etiology, MESH: Disease Progression, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, MESH: Evidence-Based Medicine, Clinical psychology
Abstract: International audience; PURPOSE OF REVIEW: Asthma is a heterogeneous disease constituted by overlapping separate syndromes. This review discusses recent published data relevant to asthma and severe asthma classification, resting either on the 'candidate' approach based on criteria chosen by experts or on the 'exploratory' approach based on unsupervised statistical methods. RECENT FINDINGS: Following the 'candidate' approach, groups of experts recently reviewed the classification of severe asthma to be applicable in low-income, milddle-income, and high-income countries and provided a systematic algorithm to diagnose severe refractory asthma. The concept of asthma endotypes involving different biological mechanisms has recently being proposed. Results from the 'exploratory' approach support the clinical heterogeneity in severe asthma and the need for new approaches for the classification of asthma severity. The novel childhood and adult asthma phenotypes recently identified using the exploratory approach were supported by first evidence of validity (replication in independent studies, assessment of their discriminative properties, and effect on clinical prognosis). SUMMARY: Research on asthma phenotypes has increased exponentially in the last year. The main focus has been on severe asthma, likely due to its clinical and socioeconomic burden. Interestingly, many of the phenotypes identified are stable across populations and methodological approaches. Further analyses on the asthma phenotypes are needed to address their stability over time and their relevance from clinical and etiological perspectives.
Published: 2011

48. Randomized phase II trial of gefitinib or gemcitabine or docetaxel chemotherapy in patients with advanced non-small-cell lung cancer and a performance status of 2 or 3 (IFCT-0301 study)

Author: Didier Debieuvre, Fabrice Barlesi, Bernard Lebeau, Bernard Milleron, Franck Morin, Fabien Vaylet, Jean-François Morère, Gérard Zalcman, Thierry Urban, Pierre-Jean Souquet, Virginie Westeel, Laurence Baudrin, Valérie Gounant, Jeanne-Marie Bréchot, Denis Moro-Sibilot, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) (CEF2P / CARCINO), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Oncologie thoracique, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Service de pneumologie [Centre Hospitalier Lyon Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Pneumologie, CHI de la Haute-Saône, Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] (IFCT), Intergroupe Francophone de Cancérologie thoracique, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clinique Universitaire Pneumologique, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Hôpital avicenne, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Avicenne-Université Paris 13 ( UP13 ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC ( CEF2P / CARCINO ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), CHU Côte de Nacre, Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] ( IFCT ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Tenon [APHP], Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (UR 3181) (CEF2P / CARCINO), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Male, Oncology, Cancer Research, Lung Neoplasms, medicine.medical_treatment, Docetaxel, Deoxycytidine, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer, 0302 clinical medicine, Carcinoma, Non-Small-Cell Lung, Antineoplastic Combined Chemotherapy Protocols, Clinical endpoint, 030212 general & internal medicine, Aged, 80 and over, Gefitinib, Middle Aged, 3. Good health, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, Taxoids, medicine.drug, Adult, Pulmonary and Respiratory Medicine, medicine.medical_specialty, Adolescent, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Disease-Free Survival, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Humans, Karnofsky Performance Status, Lung cancer, neoplasms, Survival analysis, Aged, Neoplasm Staging, Chemotherapy, Performance status, business.industry, medicine.disease, Survival Analysis, Gemcitabine, respiratory tract diseases, Quinazolines, business
Abstract: International audience; BACKGROUND: To compare 3 treatment strategies in chemotherapy naive patients with advanced NSCLC and a PS 2-3. PATIENTS AND METHODS: Patients were assigned to gefitinib 250mg daily (n=43) or to gemcitabine (1250mg/m(2) d 1, 8 q 21d) (n=42) or docetaxel (75mg/m(2) d 1 q 21d) (n=42). Treatments were taken until progression or toxicity. The primary endpoint was progression-free survival. Secondary end points were response and overall survival. RESULTS: Disease control rates were 20.9%, 33.4% and 38.1%, respectively. Median PFS was 1.9 months in the gefitinib arm, 2.0 months in the gemcitabine arm and 2.0 months in the docetaxel arm (HR gemcitabine versus gefitinib: 0.74, 95%CI: [0.48; 1.16], HR docetaxel versus gefitinib: 0.67, 95%CI: [0.43; 1.05]). Median survival times were 2.2, 2.4 and 3.5 months, respectively (HR gemcitabine versus gefitinib: 0.76, 95%CI: [0.48; 1.20], HR docetaxel versus gefitinib: 0.69, 95%CI: [0.44; 1.09]). There were more grade 3-4 adverse events in the docetaxel arm when compared with either the gefitinib arm or the gemcitabine arm. CONCLUSION: In unselected NSCLC patients with PS 2-3, gefitinib, gemcitabine and docetaxel achieved similar results. Docetaxel was associated with higher rates of adverse events.
Published: 2010

49. Telomere maintenance and DNA damage responses during lung carcinogenesis

Author: Sylvie Lantuejoul, Sylvie Gazzeri, Elizabeth Brambilla, Dimitri Salameire, Christian Brambilla, Denis Moro-Sibilot, Jean-Charles Soria, Christophe M. Raynaud, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), ARC'ALPIN network, Hôpital Michallon-CHU Grenolbe, INSERM U1209, Institute for Advanced Biosciences, Département de médecine oncologique [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR), INSERM U823, équipe 2 (Bases Moléculaires de la Progression des Cancers du Poumon), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Clinique de pneumologie, CHU Grenoble, Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Cancer Research, Pathology, medicine.medical_specialty, Telomerase, Lung Neoplasms, [SDV]Life Sciences [q-bio], Cell Cycle Proteins, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Ataxia Telangiectasia Mutated Proteins, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Adenocarcinoma, Protein Serine-Threonine Kinases, Biology, medicine.disease_cause, Histones, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Metaplasia, medicine, Carcinoma, Telomeric Repeat Binding Protein 2, Telomeric Repeat Binding Protein 1, Lung, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Hyperplasia, Tumor Suppressor Proteins, Cancer, Adenocarcinoma, Bronchiolo-Alveolar, Telomere, medicine.disease, Immunohistochemistry, 3. Good health, DNA-Binding Proteins, body regions, Checkpoint Kinase 2, Oncology, Dysplasia, 030220 oncology & carcinogenesis, Carcinoma, Squamous Cell, Disease Progression, medicine.symptom, Carcinogenesis, Precancerous Conditions, DNA Damage
Abstract: Purpose: Telomere shortening is an early event in bronchial carcinogenesis, preceding P53/Rb pathway inactivation and telomerase reactivation, and leading to DNA damage responses (DDR). As their inactivation in cancer increases genetic instability, our objective was to identify the chronology of telomere machinery critical events for malignant progression. Experimental Design: We have evaluated telomere length by fluorescence in situ hybridization and analyzed DDR proteins p-CHK2, p-ATM, and p-H2AX, and telomeric maintenance proteins TRF1 and TRF2 expression by immunohistochemistry in normal bronchial/bronchiolar epithelium, and in 109 bronchial preneoplastic lesions, in comparison with 32 squamous invasive carcinoma (SCC), and in 27 atypical alveolar hyperplasia (AAH) in comparison with 6 adenocarcinoma in situ (AIS; formerly bronchiolo-alveolar carcinoma) and 24 invasive adenocarcinoma (ADC). Results: Telomere length critically shortened at bronchial metaplasia stage to increase gradually from dysplasia to invasive SCC; in bronchiolo-alveolar lesions, telomere length decreased from normal to AIS and increased from stage I to II to stage III to IV ADC. Expression of TRF1 and TRF2 increased progressively from dysplasia to SCC and from AAH to invasive ADC. The expression of concomitant DDR proteins increased significantly from low- to high-grade dysplasia and from AAH to AIS and stage I to II ADC. P-CHK2 and p-H2AX expressions were highly correlated and both decreased, along with p-ATM, in SCC and advanced ADC. Conclusion: Telomere attrition occurs at the earliest stage of lung carcinogenesis as an initiating event, preceding TRF1 and TRF2 overexpression for telomere stabilization. In contrast, dismiss of DDR, through p-H2AX and p-CHK2 downregulation, represents a late progressing event associated with SCC and ADC progression. Clin Cancer Res; 16(11); 2979–88. ©2010 AACR.
Published: 2010

50. Infectious risk associated with arterial catheters compared with central venous catheters*

Author: Carole Schwebel, Arnaud Geffroy, Adrien Français, Lila Bouadma, Christophe Adrie, Jean-François Timsit, Hakim Haouache, Sebastian Pease, Jean-Christophe Lucet, Maité Garrouste-Orgeas, Marie Thuong, Marie-Christine Herault, Jean-Ralph Zahar, Vesin, Aurélien, Hôpital Bichat - Claude Bernard, Service de réanimation médicale, Hôpital Delafontaine, Epidémiologie pronostique des cancers et affections graves, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de bactériologie, virologie, parasitologie et hygiène [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Clinique de réanimation médicale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], CHU Grenoble, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Centre Hospitalier de Saint-Denis [Ile-de-France], General ICU, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Réanimation Médico-Chirurgicale, Groupe Hospitalier Paris Saint-Joseph (hpsj), INSERM U823, équipe 11 (Epidémiologie des cancers et des affections graves), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Clinique de réanimation médicale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon-Hôpital Michallon, Service de bactériologie, virologie, parasitologie et hygiène, and Groupe Hospitalier Paris Saint-Joseph
Subjects: Male, Catheterization, Central Venous, medicine.medical_specialty, education, Control (management), Critical Care and Intensive Care Medicine, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Intensive care, Catheterization, Peripheral, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Risk factor, Intensive care medicine, Aged, Proportional Hazards Models, Cross Infection, Life partner, business.industry, Chlorhexidine, 030208 emergency & critical care medicine, Middle Aged, Bandages, 3. Good health, Intensive Care Units, Catheter, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Spouse, Catheter-Related Infections, Family medicine, Anti-Infective Agents, Local, Position (finance), Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Risk assessment, business
Abstract: International audience; BACKGROUND: Scheduled replacement of central venous catheters and, by extension, arterial catheters, is not recommended because the daily risk of catheter-related infection is considered constant over time after the first catheter days. Arterial catheters are considered at lower risk for catheter-related infection than central venous catheters in the absence of conclusive evidence. OBJECTIVES: To compare the daily risk and risk factors for colonization and catheter-related infection between arterial catheters and central venous catheters. METHODS: We used data from a trial of seven intensive care units evaluating different dressing change intervals and a chlorhexidine-impregnated sponge. We determined the daily hazard rate and identified risk factors for colonization using a marginal Cox model for clustered data. RESULTS: We included 3532 catheters and 27,541 catheter-days. Colonization rates did not differ between arterial catheters and central venous catheters (7.9% [11.4/1000 catheter-days] and 9.6% [11.1/1000 catheter-days], respectively). Arterial catheter and central venous catheter catheter-related infection rates were 0.68% (1.0/1000 catheter-days) and 0.94% (1.09/1000 catheter-days), respectively. The daily hazard rate for colonization increased steadily over time for arterial catheters (p = .008) but remained stable for central venous catheters. Independent risk factors for arterial catheter colonization were respiratory failure and femoral insertion. Independent risk factors for central venous catheter colonization were trauma or absence of septic shock at intensive care unit admission, femoral or jugular insertion, and absence of antibiotic treatment at central venous catheter insertion. CONCLUSIONS: The risks of colonization and catheter-related infection did not differ between arterial catheters and central venous catheters, indicating that arterial catheter use should receive the same precautions as central venous catheter use. The daily risk was constant over time for central venous catheter after the fifth catheter day but increased significantly over time after the seventh day for arterial catheters. Randomized studies are needed to investigate the impact of scheduled arterial catheter replacement.
Published: 2010

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