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1. Biotic predictors complement models of bat and bird responses to climate and tree diversity in European forests

Author: Luc Barbaro, Monique Carnol, Julia Koricheva, Kris Verheyen, Hans De Wandeler, Bastien Castagneyrol, Hervé Jactel, Michael Scherer-Lorenzen, Fons van der Plas, Yohan Charbonnier, Aude Vialatte, Evy Ampoorter, Bart Muys, Christian Kerbiriou, Marc Deconchat, Pallieter De Smedt, Isabelle Le Viol, Eric Allan, Harriet Milligan, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Plant Ecology Group, Institute of Plant Sciences, University of Bern, Forest & Nature Laboratory, Department of Forest and Water Management, Ghent University, Biodiversité, Gènes et Communautés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of Earth and Environmental Sciences, Université Catholique de Louvain (UCL), CESCO, Museum National d’Histoire Naturelle, CNRS, Université Paris-Sorbonne (UP4), School of Biological Sciences, Royal Holloway University of London (RHUL), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Laboratory of Plant and Microbial Ecology, Institute of Plant Biology B22, Faculty of Biology, Geobotany, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Department of Systematic Botany and Functional Biodiversity, Leipzig University, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation (CESCO), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, earthworms, Biology, Environment, Forests, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Models, Biological, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Birds, spiders, Abundance (ecology), Chiroptera, Forest ecology, Animals, Ecosystem, General Environmental Science, Trophic level, trophic interactions, Biotic component, defoliating insects, General Immunology and Microbiology, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, Species diversity, General Medicine, Biodiversity, 15. Life on land, functional diversity, Europe, Habitat, 13. Climate action, Species evenness, ungulate browsing, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, General Agricultural and Biological Sciences
Abstract: Bats and birds are key providers of ecosystem services in forests. How climate and habitat jointly shape their communities is well studied, but whether biotic predictors from other trophic levels may improve bird and bat diversity models is less known, especially across large bioclimatic gradients. Here, we achieved multi-taxa surveys in 209 mature forests replicated in six European countries from Spain to Finland, to investigate the importance of biotic predictors (i.e. the abundance or activity of defoliating insects, spiders, earthworms and wild ungulates) for bat and bird taxonomic and functional diversity. We found that nine out of 12 bird and bat diversity metrics were best explained when biotic factors were added to models including climate and habitat variables, with a mean gain in explained variance of 38% for birds and 15% for bats. Tree functional diversity was the most important habitat predictor for birds, while bats responded more to understorey structure. The best biotic predictors for birds were spider abundance and defoliating insect activity, while only bat functional evenness responded positively to insect herbivory. Accounting for potential biotic interactions between bats, birds and other taxa of lower trophic levels will help to understand how environmental changes along large biogeographical gradients affect higher-level predator diversity in forest ecosystems.
Published: 2019

2. On the potentiality of UAV multispectral imagery to detect flavescence dorée and grapevine trunk diseases

Author: Gérard Dedieu, Michel Goulard, Harold Clenet, Johanna Albetis, Hervé Poilvé, Jacques Rousseau, Sylvie Duthoit, Anne Jacquin, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Airbus Defence and Space, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Groupe ICV, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Centre d'études spatiales de la biosphère (CESBIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TerraNIS, Airbus (FRANCE), Centre National d'Études Spatiales - CNES (FRANCE), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Ecole d'Ingénieurs de Purpan - EIP (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Institut Coopératif du Vin - Groupe ICV (FRANCE), TerraNIS (FRANCE), Centre d'Etudes Spatiales de la Biosphère - CESBIO (Toulouse, France), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE)
Subjects: 0106 biological sciences, Vine, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Multispectral image, Flavescence dorée, disease detection, biophysical parameters, 01 natural sciences, Vineyard, Vegetation indices, Biophysical parameters, medicine, unmanned aerial vehicle, Cultivar, grapevine trunk diseases, lcsh:Science, 0105 earth and related environmental sciences, Mathematics, 2. Zero hunger, Ecologie, Environnement, vegetation indices, food and beverages, Spectral bands, Unmanned aerial vehicle, 15. Life on land, Grapevine trunk diseases, Disease detection, flavescence dorée, Horticulture, General Earth and Planetary Sciences, lcsh:Q, medicine.symptom, Viticulture, Vegetation (pathology), 010606 plant biology & botany
Abstract: Among grapevine diseases affecting European vineyards, Flavescence dorée (FD) and Grapevine Trunk Diseases (GTD) are considered the most relevant challenges for viticulture because of the damage they cause to vineyards. Unmanned Aerial Vehicle (UAV) multispectral imagery could be a powerful tool for the automatic detection of symptomatic vines. However, one major difficulty is to discriminate different kinds of diseases leading to similar leaves discoloration as it is the case with FD and GTD for red vine cultivars. The objective of this paper is to evaluate the potentiality of UAV multispectral imagery to separate: symptomatic vines including FD and GTD (Esca and black dead arm) from asymptomatic vines (Case 1) and FD vines from GTD ones (Case 2). The study sites are localized in the Gaillac and Minervois wine production regions (south of France). A set of seven vineyards covering five different red cultivars was studied. Field work was carried out between August and September 2016. In total, 218 asymptomatic vines, 502 FD vines and 199 GTD vines were located with a centimetric precision GPS. UAV multispectral images were acquired with a MicaSense RedEdge® sensor and were processed to ultimately obtain surface reflectance mosaics at 0.10 m ground spatial resolution. In this study, the potentiality of 24 variables (5 spectral bands, 15 vegetation indices and 4 biophysical parameters) are tested. The vegetation indices are selected for their potentiality to detect abnormal vegetation behavior in relation to stress or diseases. Among the biophysical parameters selected, three are directly linked to the leaf pigments content (chlorophyll, carotenoid and anthocyanin). The first step consisted in evaluating the performance of the 24 variables to separate symptomatic vine vegetation (FD or/and GTD) from asymptomatic vine vegetation using the performance indicators from the Receiver Operator Characteristic (ROC) Curve method (i.e., Area Under Curve or AUC, sensibility and specificity). The second step consisted in mapping the symptomatic vines (FD and/or GTD) at the scale of the field using the optimal threshold resulting from the ROC curve. Ultimately, the error between the level of infection predicted by the selected variables (proportion of symptomatic pixels by vine) and observed in the field (proportion of symptomatic leaves by vine) is calculated. The same methodology is applied to the three levels of analysis: by vineyard, by cultivar (Gamay, Fer Servadou) and by berry color (all red cultivars). At the vineyard and cultivar levels, the best variables selected varies. The AUC of the best vegetation indices and biophysical parameters varies from 0.84 to 0.95 for Case 1 and 0.74 to 0.90 for Case 2. At the berry color level, no variable is efficient in discriminating FD vines from GTD ones (Case 2). For Case 1, the best vegetation indices and biophysical parameter are Red Green Index (RGI)/ Green-Red Vegetation Index (GRVI) (based on the green and red spectral bands) and Car (linked to carotenoid content). These variables are more effective in mapping vines with a level of infection greater than 50%. However, at the scale of the field, we observe misclassified pixels linked to the presence of mixed pixels (shade, bare soil, inter-row vegetation and vine vegetation) and other factors of abnormal coloration (e.g., apoplectic vines).
Published: 2019

3. Tree diversity drives associational resistance to herbivory at both forest edge and interior

Author: Guyot, Virginie, Jactel, Herve, Imbaud, Baptiste, Burnel, Laurent, Castagneyrol, Bastien, Heintz, Wilfried, Deconchat, Marc, Vialatte, Aude, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Biodiversité, Gènes et Communautés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: lcsh:QH540-549.5, ecosystem functioning, [SDV]Life Sciences [q-bio], insect herbivory, forest edge, plant diversity, lcsh:Ecology, Original Research
Abstract: Tree diversity is increasingly acknowledged as an important driver of insect herbivory. However, there is still a debate about the direction of associational effects that can range from associational resistance (i.e., less damage in mixed stands than in monocultures) to the opposite, associational susceptibility. Discrepancies among published studies may be due to the overlooked effect of spatially dependent processes such as tree location within forests. We addressed this issue by measuring crown defoliation and leaf damage made by different guilds of insect herbivores on oaks growing among conspecific versus heterospecific neighbors at forest edges versus interior, in two closed sites in SW France forests. Overall, oaks were significantly less defoliated among heterospecific neighbors (i.e., associational resistance), at both forest edge and interior. At the leaf level, guild diversity and leaf miner herbivory significantly increased with tree diversity regardless of oak location within stands. Other guilds showed no clear response to tree diversity or oak location. We showed that herbivore response to tree diversity varied among insect feeding guilds but not between forest edges and interior, with inconsistent patterns between sites. Importantly, we show that oaks were more defoliated in pure oak plots than in mixed plots at both edge and forest interior and that, on average, defoliation decreased with increasing tree diversity from one to seven species. We conclude that edge conditions could be interacting with tree diversity to regulate insect defoliation, but future investigations are needed to integrate them into the management of temperate forests, notably by better understanding the role of the landscape context.
Published: 2019

4. A conceptual framework for the governance of multiple ecosystem services in agricultural landscapes

Author: Floriane Clement, Emilie Andrieu, Jean-Philippe Choisis, Cécile Barnaud, Annie Ouin, Diane Esquerre, Julien Blanco, Aude Vialatte, Marc Deconchat, Clélia Sirami, David Sheeren, Sylvie Ladet, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201: Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, and Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
Subjects: 0106 biological sciences, spatio-temporal scales, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], Geography, Planning and Development, agricultural practices, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, stakeholders, Ecosystem services, companion modeling, remote sensing, ecological functions, mapping, Environmental planning, Nature and Landscape Conservation, media_common, biodiversity, 2. Zero hunger, Sustainable development, Operationalization, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, Corporate governance, 15. Life on land, Interdependence, trade-offs, Conceptual framework, 13. Climate action, social interactions, Business, Landscape ecology, Social structure
Abstract: Context: While the concept of ecosystem services (ES) is well established in the scientific and policy arenas, its operationalization faces many challenges. Indeed, ES supply, demand and flow are related to ecological and social processes at multiple space and time scales, leading to complex interactions in the provision of multiple ES.Objectives: To develop a conceptual framework (CF) to facilitate the study and governance of multiple ES in agricultural social-ecological landscapes.Method: We examined the ecological and social literatures to identify how approaches at the landscape level contribute to a better understanding of ES supply, demand and flow in agricultural systems. After detailing our CF, we use a case study to illustrate how methods from different disciplines can be combined to operationalize our CF.Results: The literature suggests that the landscape level is likely to be the level of organization that will make it possible to (i) integrate different components of ES co-production, i.e. ecological processes, agricultural practices and social structures, (ii) understand interactions between stakeholders, including ES co-producers and beneficiaries, (iii) explicit ES trade-offs, i.e. social choices between ES.Conclusion: The production of multiple ES at the landscape level involves different types of interdependencies among ES co-producers and beneficiaries. These need to be addressed in concerted and integrated ways to achieve sustainable and equitable governance of agricultural landscapes.
Published: 2019

5. Nonparametric regression on contaminated functional predictor with application to hyperspectral data

Author: Anthony Zullo, Frédéric Ferraty, Mathieu Fauvel, Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: Statistics and Probability, Economics and Econometrics, supervised classification, hyperspectral image, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], 01 natural sciences, 010104 statistics & probability, remote sensing, high dimensional setting, random curve, Covariate, 0101 mathematics, functional data, 0105 earth and related environmental sciences, Mathematics, business.industry, Hyperspectral imaging, Estimator, Pattern recognition, nonparametric functional regression, Regression, Nonparametric regression, ComputingMethodologies_PATTERNRECOGNITION, Rate of convergence, Sample size determination, Errors-in-variables models, errors in variables, Artificial intelligence, Statistics, Probability and Uncertainty, business
Abstract: Regressing nonparametrically a scalar response on a contaminated random curve observed at some measurement grid may be a hard task. To address this common statistical situation, a kernel presmoothing step is achieved on the noisy functional predictor. After that, the kernel estimator of the regression operator is built using the smoothed functional covariate instead of the original corrupted one. The rate of convergence is stated for this nested-kernel estimator with special attention to high-dimensional setting (i.e. the size of the measurement grid is much larger than the sample size). The proposed method is applied to simulated datasets in order to assess its finite-sample properties. Our methodology is further illustrated on a real hyperspectral dataset involving a supervised classification problem.
Published: 2019

6. Application of PROSPECT for estimating total petroleum hydrocarbons in contaminated soils from leaf optical properties

Author: Anthony Credoz, Dominique Dubucq, Arnaud Elger, Guillaume Lassalle, Sophie Fabre, Georges Bertoni, Rémy Hédacq, Pole Etud & Rech Lacq, TOTAL SA, ONERA / DOTA, Université de Toulouse [Toulouse], ONERA-PRES Université de Toulouse, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pole Etud & Rech, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Chlorophyll, PROSPECT, Environmental Engineering, Light, Health, Toxicology and Mutagenesis, 0211 other engineering and technologies, Soil science, 02 engineering and technology, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Models, Biological, leaf optical properties, chemistry.chemical_compound, Soil, pigment, Environmental Chemistry, Soil Pollutants, Petroleum Pollution, Pigment Alterations, Waste Management and Disposal, 0105 earth and related environmental sciences, 021110 strategic, defence & security studies, Contaminated soils, Spectral signature, Hyperspectral imaging, Contamination, Pollution, Soil contamination, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, Hydrocarbons, Plant Leaves, total petroleum hydrocarbons, Biodegradation, Environmental, Petroleum, chemistry, Oil production, Environmental science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Environmental Monitoring, soil contamination
Abstract: Recent advances in hyperspectral spectroscopy suggest making use of leaf optical properties for monitoring soil contamination in oil production regions by detecting pigment alterations induced by Total Petroleum Hydrocarbons (TPH). However, this provides no quantitative information about the level of contamination. To achieve this, we propose an approach based on the inversion of the PROSPECT model. 1620 leaves from five species were collected on a site contaminated by 16 to 77 g.kg(-1) of TPH over a 14-month period. Their spectral signature was measured and used in PROSPECT model inversions to retrieve leaf biochemistry. The model performed well for simulating the spectral signatures (RMSE < 2%) and for estimating leaf pigment contents (RMSE = 0.74) for three of them, allowing accurate predictions of TPH (RMSE = 3.20 g.kg(-1) and RPD = 5.17). The accuracy of predictions varied by season and improved after the growing period. This study demonstrates the capacity of PROSPECT to estimate oil contamination and opens up promising perspectives for larger-scale applications.
Published: 2019

7. Poplar plantations monitoring with Sentinels products: combination of optical and radar remote sensing data

Author: Hamrouni, Yousra, Sheeren, David, Paillassa, Eric, CHERET, Véronique, Monteil, Claude, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CNPF-IDF, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Session 4 – Forest; Poplar plantations monitoring with Sentinels products: combination of optical and radar remote sensing data. THEIA Workshop for Sentinel-2 L2A MAJA products
Published: 2018

8. Experimental comparison of functional and multivariate spectral-based supervised classification methods in hyperspectral image

Author: Mathieu Fauvel, Frédéric Ferraty, Anthony Zullo, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Statistics and Probability, functional multinomial logit model, Multivariate statistics, Computer science, hyperspectral profile, [SDV]Life Sciences [q-bio], 0211 other engineering and technologies, 02 engineering and technology, 01 natural sciences, support vector machines, Image (mathematics), 010104 statistics & probability, nonparametric functional discrimination, Spectral dimension, 0101 mathematics, mixture models, 021101 geological & geomatics engineering, business.industry, Hyperspectral imaging, Pattern recognition, Mixture model, Random forest, Support vector machine, Classification methods, Artificial intelligence, Statistics, Probability and Uncertainty, business, random forest
Abstract: The aim of this article is to assess and compare several statistical methods for hyperspectral image supervised classification only using the spectral dimension. Since hyperspectral profiles may be viewed either as a random vector or a random curve, we propose to confront various multivariate discriminating procedures with functionalalternatives. Eight methods representing three important statistical communities (mixture models, machine learning and functional data analysis) have been applied on three hyperspectral datasets following three protocols studying the influence of size and composition of the learning sample, with or without noised labels. Besides this comparative study, this work proposes a functional extension of multinomial logit model as well as a fast computing adaptationof the nonparametric functional discrimination. As a by-product, this work provides a useful comprehensive bibliography and also supplemental material especially oriented towards practitioners.
Published: 2018

9. Biotic interactions between saproxylic insect species

Author: Antoine Brin, Christophe Bouget, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture (IRSTEA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: 0106 biological sciences, education.field_of_study, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Parasitism, 15. Life on land, Biology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Competition (biology), Predation, Habitat, 13. Climate action, Facilitation, Ecosystem, Semiochemical, education, media_common
Abstract: A better understanding of biotic interactions in species-rich saproxylic insect communities can provide essential information for biodiversity conservation and ecosystem functioning enhancement. Evidence in the literature mainly relates to beetle species, in particular scolytines, at tree—or even smaller—spatial scales and mostly refers to antagonistic interactions. We here present an overview of competition, predation/parasitism and facilitation among saproxylic insects. We first underline segregation patterns between wood consumers, resulting from competition processes, such as spatial and temporal resource partitioning, competitive displacement via interference and even enemy-mediated “apparent competition.” Considering natural history facts about prey-predator and host-parasitoid relationships, we then emphasize processes regulating the pressure of top-down influences on prey/host population dynamics. Facilitative interactions, including mechanisms of habitat location, creation, and improvement, are thereafter considered. The implications of some findings for pest management strategies (biocontrol, semiochemical-based methods) and for ecosystem functioning (deadwood decomposition) are highlighted meanwhile. Approaches based on life-history traits or indirect mediated interactions finally move the focus from the responses of paired species to multispecific community-level changes. Ecological network analysis should help increase our understanding of biotic interactions and investigate the consequences of environmental changes for those interactions and ecosystem functioning.
Published: 2018

10. Behavioural response of xerophilous land snail and slug species to chemical cues from ground-beetle predators: the role of ecological relevance

Author: Eva Teruel, Céline Lafont-Lecuelle, Julien Leclercq, Patrick Pageat, Antoine Brin, Piotr Bursztyka, Platform of Animal Experimentation, Institut de Recherche en Sémiochimie et Ethologie Appliquée (IRSEA ), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: 0106 biological sciences, 0303 health sciences, biology, Ecology, Slug, [SDV]Life Sciences [q-bio], 05 social sciences, Land snail, Introduced species, Aquatic Science, biology.organism_classification, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Invasive species, Predation, Chemical ecology, 03 medical and health sciences, Ground beetle, 0501 psychology and cognitive sciences, Animal Science and Zoology, 050102 behavioral science & comparative psychology, Natural enemies, 030304 developmental biology
Abstract: Chemical cues allow prey to avoid predators without direct contact, which may greatly improve chances of survival, but may be costly if threat is overestimated. Hence, the threat-sensitive predator avoidance hypothesis predicts that prey response to predation threat cues should match the level of danger posed by the predators. While the behavioural response of prey to chemical cues betraying the presence of predators has been observed and well documented in numerous taxa, few studies have been carried out on terrestrial gastropods, despite olfaction being their primary sense. In a previous study, the authors found that the slug Deroceras reticulatum, which inhabits wet environments, responds to chemical cues from specific ground-beetle species. In order to determine whether this observation can be extended to other species of terrestrial gastropods, we examined the response of the xerophilous land snail, Xeropicta derbentina, to the presence of chemical cues from several predacious ground beetles (Carabus auratus, C. auronitens, C. nemoralis, C. coriaceus and C. morbillosus). Only C. morbillosus, a potent snail-eater from sunny habitats, significantly altered the snails’ choice of climbing area whereas, in another experiment, it did not modify the shelter choice of the slug D. reticulatum. These results are consistent with a species-specific perception of predation threat in terrestrial gastropods, which may be based on a combination of ecological and biological features in both predator and prey.
Published: 2018

11. Variabilité des ressources et impacts sur les SE rendus par les systèmes pastoraux en zone subsaharienne

Author: Ickowicz, Alexandre, Corniaux, Christian, ASSOUMA, Mohamed Habibou, Lecomte, Philippe, Vayssieres, Jonathan, Blanfort, Vincent, Bernoux, Martial, Bocoum, O., Bakhoum, Amy, Balent, Gerard, Sheeren, David, Decruyenaere, Virginie, Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux ( UMR SELMET ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), UMR 0868 Systèmes d'Elevage Méditerranéens et Tropicaux, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Université Cheikh Anta Diop ( UCAD ), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural ( DYNAFOR ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan ( INPT - EI Purpan ), Walloon Agricultural Research Center, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), ProdInra, Archive Ouverte, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], agricultural activity, aménagement pastoral, [SDV]Life Sciences [q-bio], sahel, range management, drought, activité agricole, service écosystémique, sécheresse
Abstract: Dans les zones semi-arides du Sahel (200-400mm pluies/an), l’élevage pastoral mobile est l’activité agricole dominante en raison des conditions climatiques et agro-écologiques qui sont marquées par une forte variabilité et incertitude sur la pluviosité et les ressources qui en dépendent. L’accroissement moyen continu de cette activité au cours des dernières décennies malgré des périodes de crises de sécheresse sévères, pose la question de la durabilité de cette activité et des écosystèmes de parcours pastoraux peu productifs qui la soutiennent. L’exploitation de cet espace pastoral basé sur la gestion de ressources collectives (parcours, eaux de surfaces) et son aménagement sous forme de points d’eaux permanents modernes est fortement structuré par les pratiques des pasteurs (campements, points d’eau saisonniers, mobilité). Ainsi, la pression exercée par le bétail sur l’espace est fortement liée à cette structuration et nous avons cherché à évaluer l’impact de cette activité pastorale sur les écosystèmes à travers l’évaluation de services éco-systémiques de régulation et d’approvisionnement. Les résultats encore partiels montrent l’impact de l’hétérogénéité spatiale et temporelle des ressources sur les caractéristiques des systèmes fourragers, des régimes alimentaires et des performances des troupeaux pastoraux sub-sahariens. Cela permet aussi d’estimer l’impact de ces aménagements, de la variabilité des ressources et des pratiques des pasteurs sur le fonctionnement et la durabilité de ces écosystèmes et d’approcher un bilan élargi des services écosystémiques liés à ces systèmes de vie et de production.
Published: 2017

12. Phoracantha semipunctata (Fabricius, 1775) en région toulousaine. Actualisation de son expansion et remarques sur P. recurva Newman, 1840 (Coleoptera, Cerambycidae)

Author: Valladares, Lionel, Courtin, Olivier, Brustel, Hervé, Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Chercheur indépendant, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Fauré, Philippe
Subjects: France Coleoptera, [SDE] Environmental Sciences, Eucalyptus, coleoptera, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biodiversité et Ecologie, Biogéographie, biogéographie, Coleoptera, eucalyptus, distribution, Cerambycidae, Phoracantha, phoracantha, France, cerambycidae, france
Abstract: Phoracantha semipunctata has been part of the French fauna for a few decades and is undergoing a range expansion in this country. It is indicated here for the first time in Haute-Garonne (France). We provide alist of beetles observed on infested Eucalyptus trees in Toulouse together with some reminders on the biology of P.semipunctata and its distribution in France., Phoracantha semipunctata fait partie de la faune de France continentale depuis quelques décennies et poursuit son expansion. Nous le signalons pour la première fois en Haute-Garonne. Une liste des coléoptères observés sur Eucalyptus à Toulouse, quelques rappels sur la biologie du P. semipunctata et sur la présence en France du P. recurva sont donnés.
Published: 2017

13. Insuring forage through satellites: testing alternative indices against grassland production estimates for France

Author: Antoine Roumiguie, Anton Vrieling, Grégoire Sigel, Bruno Bouchard, Hervé Poilvé, Anne Jacquin, Department of Natural Resources, Faculty of Geo-Information Science and Earth Observation, UT-I-ITC-FORAGES, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Airbus Defence and Space, CEntre de REcherches en MAthématiques de la DEcision (CEREMADE), Université Paris Dauphine-PSL-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fac Geoinformat Sci & Earth Observat, Twente University, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Dauphine-PSL, and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
Subjects: fcover time-series, Coefficient of determination, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], 0211 other engineering and technologies, Growing season, Forage, 02 engineering and technology, 01 natural sciences, Remote Sensing, Statistics, biomass estimation, crop, Imaging Science & Photographic Technology, Productivity, 021101 geological & geomatics engineering, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, Hydrology, validation, model, Primary production, use efficiency, food security, 15. Life on land, gross primary production, 22/4 OA procedure, Ancillary data, 13. Climate action, Photosynthetically active radiation, ITC-ISI-JOURNAL-ARTICLE, General Earth and Planetary Sciences, Environmental science, Moderate-resolution imaging spectroradiometer, production, ecosystems, insurance
Abstract: To mitigate impacts of climate-related reduced productivity of French grasslands, a new insurance scheme bases indemnity payouts to farmers on a Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS)-derived forage production index (FPI). The objective of this study is to compare several approaches for deriving FPI from satellite data to assess whether better relationships with forage productivity can be attained. The approaches assess pasture productivity using as five input factors estimated from remote sensing and ancillary data, i.e.: (1) fraction of absorbed photosynthetically active radiation (fAPAR); (2) radiation use efficiency estimates; (3) PAR estimates; (4) leaf senescence modelling; and (5) growing season modelling. All the possible combinations from these five factors, including different modalities to estimate some of them, lead to 768 models. Model outputs are compared to reference grassland production estimates provided by a mechanistic model (Information et Suivi Objectif des Prairies – ISOP – system) for a sample of 25 forage regions across France for the years 2003, 2007, 2009, 2011, and 2012 (containing one humid, two normal, and two dry years). Results revealed that: (1) the baseline model based on the fraction of green vegetation cover (fCover) seasonal integral has a reasonable linear relationship to production estimates (standardized root mean square error - SRMSE = 0.57 and coefficient of determination – R2 = 0.68); (2) performance of the baseline model improved with a quadratic function (SRMSE = 0.54 and R2 = 0.71); (3) 34 models outperform the baseline model. We, therefore, suggest to replace the baseline model with the best-performing model (SRMSE = 0.42 and R2 = 0.83) in the insurance product. This model integrates daily fCover with a water stress index and sums these over a variable monitoring period in space and time characterized by the phenological indicators start of season and end of season derived from the fCover annual profile.
Published: 2017

14. Simulating spatially-explicit crop dynamics of agricultural landscapes: The ATLAS simulator

Author: Hazel R. Parry, Hugo Thierry, Aude Vialatte, Jean-Philippe Choisis, Claude Monteil, Benoit Gaudou, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut de recherche en informatique de Toulouse (IRIT), Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Ecosci Precinct, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Université Toulouse - Jean Jaurès - UT2J (FRANCE), Université Toulouse 1 Capitole - UT1 (FRANCE), Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation - CSIRO (AUSTRALIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Systèmes Multi-Agents Coopératifs (IRIT-SMAC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), and Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE)
Subjects: 0106 biological sciences, Crop phenology, Landscape dynamics, Relation (database), Population, crop management, Ingénierie de l'environnement, Crop rotations, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Spatially-explicit, Crop, crop rotations, Cluster analysis, education, landscape dynamics, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Simulation, education.field_of_study, Ecology, business.industry, Atlas (topology), Applied Mathematics, Ecological Modeling, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, Crop rotation, crop phenology, spatially-explicit, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, Computer Science Applications, Computational Theory and Mathematics, Agriculture, Modeling and Simulation, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, Environnement et Société, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business, Scale (map), Crop management
Abstract: The spatially-explicit AgriculTural LandscApe Simulator (ATLAS) simulates realistic spatial-temporal crop availability at the landscape scale through crop rotations and crop phenology. Intended to be linked to organism population dynamics, the simulator is developed in a multi-agent platform. The model relies on initial GIS inputs for landscape composition and configuration. Users define typical rotations and crop phenology stages to be included, according to their objectives. In the study, we present two applications to contrasting landscapes, where ATLAS is capable of simulating accurate composition (crop area) and configuration (crop clustering) dynamics. ATLAS has potential applicability to a range of contrasting agricultural landscapes. The benefits of such a simulator are the possibility to study the effects of various simulated management scenarios of crop spatial-temporal availability in relation to target organisms and/or specific ecological processes (e.g. pest, biological control), within a single model framework.
Published: 2017

15. Low-Input maize-based cropping systems implementing IWM match conventional maize monoculture productivity and weed control

Author: Guillaume Adeux, Lionel Alletto, Jean-Marie Savoie, Simon Giuliano, Stéphane Cordeau, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), UMR : AGroécologie, Innovations, TeRritoires, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement - AgroSup Dijon (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université de Bourgogne - UB (FRANCE), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), UMR 1248 AGroécologie, Innovations, teRritoires, Ecole d'Ingénieurs de Purpan ( INPT - EI Purpan ), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural ( DYNAFOR ), and Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
Subjects: 0106 biological sciences, Irrigation, business.product_category, [SDV]Life Sciences [q-bio], weed biomass, Integrated weed management, Plant Science, Ingénierie de l'environnement, zea mays L, yield loss, 01 natural sciences, Plough, cropping system experiment, Echinochloa crus-galli (L.), Zea mays L, echinochloa crus-galli (L.), Weed biomass, Yield loss, integrated weed management, weed competition, conservation tillage, Echinochloa crus-galli (L.) P.Beauv, Cropping system, lcsh:Agriculture (General), Cover crop, Conservation tillage, Mathematics, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Cropping system experiment, Weed competition, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, Weed control, lcsh:S1-972, 6. Clean water, Tillage, Agronomy, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Monoculture, business, Weed, Agronomy and Crop Science, 010606 plant biology & botany, Food Science
Abstract: Conventional Maize Monoculture (MM), a dominant Cropping System in South-Western France, is now questioned for environmental reasons (nitrate leaching, pesticide use and excessive irrigation). Three low-input Cropping Systems (CS) using diverse weeding strategies (MMLI, a Low-Input MM implementing ploughing, a combination of on-row spraying and in-between row cultivation and cover crops; MMCT, Conservation Tillage MM implementing chemical control and cover crops; Maize-MSW, maize managed similar to MMLI but rotated with soybean & wheat) were compared to a reference system (MMConv, a conventional MM with tillage and a high quantity of inputs). Potential of Infestation of weeds (PI), weed biomass and crop production of these CS were compared during the first five years after their establishment. Yields were also assessed in weed-free zones hand-weeded weekly in 2014 and 2015. Weed communities did not drastically differ among CS. PI and weed biomass were higher in MMCT, especially for Echinochloa crus-galli (L.) P.Beauv. and were comparable between MMConv, MMLI and Maize-MSW. Analysis of covariance between CS and weed biomass did not reveal a significant interaction, suggesting that weed biomass affected yield similarly among the CS. Comparison between weedy and weed-free zones suggested that weeds present at maize maturity negatively affected yields to the same extent for all four CS, despite having different weed biomasses. Grain yields in MMConv (11.3 ± 1.1 t ha−1) and MMLI (10.6 ± 2.3 t ha−1) were similar and higher than in MMCT (8.2 ± 1.9 t ha−1. Similar yields, weed biomasses and PI suggest that MMLI and Maize-MSW are interesting alternatives to conventional MM in terms of weed control and maize productivity and should be transferred to farmers to test their feasibility under wider, farm-scale conditions.
Published: 2017

16. Distribution de Peltis grossa (Linnaeus, 1758) en France (Coleoptera, Trogossitidae)

Author: Lionel Valladares, Gouix Nicolas, Cyrille Van-Meer, Benjamin Calmont, Hervé Brustel, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Conservatoire Régional des Espaces Naturels Midi-Pyrénées (CREN Midi-Pyrénées), Office National des Forêts (ONF), Société d'Histoire Naturelle Alcide d'Orbigny (SHNAO), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: coleoptera, saproxylique, [SDV]Life Sciences [q-bio], conservation, insecta, Biodiversity, bois mort, [SDV] Life Sciences [q-bio], arthropoda, forêt, animalia, france, Taxonomy, coléoptère
Abstract: Distribution of Peltis grossa (Linnaeus, 1758) in France (Coleoptera, Trogossitidae). Peltis grossa (Linnaeus, 1758) is a rare species whose distribution is poorly known. Based on a com-pilation of data from the literature or private collections together with recent unpublished data (18 new localities). This species is present in 12 French department, but fresh data are known in only seven of them. This article aims at reviewing and discussing the distribution of this species in France., Cet article fait le point sur la distribution en France de Peltis grossa (Linnaeus, 1758), une espèce rare de Coléoptère (Trogossitidae Latreille, 1802). Il compile à la fois des données anciennes issues de la littérature ou de collections et des observations originales récentes (18 nouveaux sites). L’espèce est présente dans 12 départements français, dont sept bénéficient de données récentes. Les facteurs déterminant la distribution actuelle de l’espèce sont discutés.
Published: 2017

17. Improved forest-cover mapping based on MODIS time series and landscape stratification

Author: Jean-Philippe Denux, Mar Bisquert, Emmanuelle Cano, Véronique Chéret, Laurence Hubert-Moy, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dept Appl Phys, Yale University [New Haven], Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique (LETG - Rennes), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 (LETG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, 0211 other engineering and technologies, 02 engineering and technology, Stratification (vegetation), Land cover, algorithms, 01 natural sciences, phenology, Normalized Difference Vegetation Index, information, Correlation, metrics, Cohen's kappa, Segmentation, land-cover, remote-sensing imagery, 021101 geological & geomatics engineering, 0105 earth and related environmental sciences, Remote sensing, accuracy assessment, 15. Life on land, classification, efficiency, General Earth and Planetary Sciences, Environmental science, Spatial variability, Moderate-resolution imaging spectroradiometer, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, resources
Abstract: Detailed forest-cover mapping at a regional scale by supervised classification is technically limited by various factors. This study evaluates the ability of a landscape stratification method to improve classification accuracy. An object-based segmentation technique (OBIA) was performed to delineate radiometrically homogeneous regions into the study area, used as strata for the classification of a time series of Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) normalized difference vegetation index (NDVI) data. As a reduction of the spatial variability of the signatures of the vegetation classes is expected, Maximum Likelihood Classifier (MLC) was used to analyse potential effects on classification accuracy. Accuracy assessment was based on the calculation of kappa coefficient (.) and reject fraction (RF). The values obtained with and without stratification were compared, to assess their global and per-stratum influence on the quality of a detailed forest-cover map (20 different classes). To study the influence of topographical and landscape stratum characteristics on classification accuracy, eight indicators were calculated. Their correlation with. and RF differences due to stratification was analysed. Our study showed that stratification improved global and per-stratum classification accuracy and in parallel caused an RF increase. Both these evolutions are not conditioned by the stratum topographical and landscape characteristics but strongly influenced by stratum and classified vegetation area.
Published: 2017

18. Bilan des connaissances, inventaires 2016 et cartographie de cinq coléoptères saproxyliques d’intérêt communautaire dans les sites Natura 2000 de la région PACA

Author: Yoan Braud, Hervé Brustel, Lionel Valladares, Stéphane Bence, Gouix Nicolas, Jérémy Cuvelier, Bureau d'études entomologie ENTOMIA, Entomia, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Conservatoire d'Espaces Naturels de Provence-Alpes-Côte d'Azur (CEN PACA ), Conservatoire d'Espaces Naturels Midi Pyrénées (CEN MP), Cartographie et système d'information géographique (SIG), O2Terre, Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement, Commanditaire : Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement (France), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: natura 2000, inventaire de la population, Coléoptère saproxylique, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, paca
Abstract: Bilan des connaissances, inventaires 2016 et cartographie de cinq coléoptères saproxyliques d’intérêt communautaire dans les sites Natura 2000 de la région PACA. Stephanopachys linearis, Stephanopachys substriatus, Limoniscus violaceus, Osmoderma eremita et Rosalia alpina
Published: 2017

19. A participatory Bayesian Belief Network approach to explore ambiguity among stakeholders about socio-ecological systems

Author: Nicolas Salliou, Claude Monteil, Aude Vialatte, Ccile Barnaud, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, Environmental Engineering, landscape ecology, Computer science, Management science, Ecological Modeling, media_common.quotation_subject, Bayesian probability, Conditional probability, Bayesian network, biological control, Citizen journalism, Ambiguity, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, 010601 ecology, subjectivity, sort, Landscape ecology, uncertainty, Research question, Software, 0105 earth and related environmental sciences, media_common
Abstract: Participatory modelling must often deal with the challenge of ambiguity when diverse stakeholders do not share a common understanding of the problem and measures for its solution. In this paper, we propose a framework and a methodology to elicit ambiguities among different stakeholders by using a participatory Bayesian Belief Network (BBN) modelling approach. Our approach consists of four steps undertaken with stakeholders: (1) co-construction of a consensual conceptual model of their socio-ecological system, (2) translation of the model into a consensual Bayesian Net structure, (3) individual parametrization of conditional probabilities, and (4) elicitation of ambiguity through the use of scenarios. We tested this methodology on the ambiguity surrounding the effect of an ecological process on a potential innovation in biological control, and it proved useful in eliciting ambiguity. Further research could explore more conflictual or controversial ambiguities to test this methodology in other settings. A participatory Bayesian Belief network method is proposed to sort out ambiguities among different stakeholders.The method is based on participation of stakeholders all along, from framing the research question to scenario exploration.The case study explored the ambiguities between local agricultural stakeholders and a landscape ecology scientist.
Published: 2017

20. Detection of flavescence dorée grapevine disease using unmanned aerial vehicle (UAV) multispectral imagery

Author: Michel Goulard, Gérard Dedieu, Hervé Poilvé, Johanna Albetis, Jean-Baptiste Féret, Fabio Güttler, Sylvie Duthoit, Anne Jacquin, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), TerraNIS, Airbus Defence and Space, Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale (UMR TETIS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'études spatiales de la biosphère (CESBIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut national de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture - IRSTEA (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Institut national des sciences de l'Univers - INSU (FRANCE), Pôle d'Etudes et Recherches AFB-Irstea Hydroécologie des Plans d'eau (France), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT), and albetis de la cruz, Johanna
Subjects: Multivariate statistics, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Biodiversité et Ecologie, Multispectral image, precision viticulture, disease detection, unmanned aerial vehicle (UAV), flavescence dorée grapevine disease, vegetation indices, biophysical parameters, 0211 other engineering and technologies, Context (language use), 02 engineering and technology, 01 natural sciences, Biodiversity and Ecology, Vegetation indices, Biophysical parameters, Flavescence dorée grapevine disease, 021101 geological & geomatics engineering, 0105 earth and related environmental sciences, Remote sensing, Precision viticulture, Ground truth, Spectral signature, Univariate, 15. Life on land, Disease detection, Geography, Unmanned aerial vehicle (UAV), General Earth and Planetary Sciences, Flavescence dorée, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: [Departement_IRSTEA]Territoires [TR1_IRSTEA]SYNERGIE [Axe_IRSTEA]TETIS-ATTOS; Flavescence dorée is a grapevine disease affecting European vineyards which has severe economic consequences and containing its spread is therefore considered as a major challenge for viticulture. Flavescence dorée is subject to mandatory pest control including removal of the infected vines and, in this context, automatic detection of Flavescence dorée symptomatic vines by unmanned aerial vehicle (UAV) remote sensing could constitute a key diagnosis instrument for growers. The objective of this paper is to evaluate the feasibility of discriminating the Flavescence dorée symptoms in red and white cultivars from healthy vine vegetation using UAV multispectral imagery. Exhaustive ground truth data and UAV multispectral imagery (visible and near-infrared domain) have been acquired in September 2015 over four selected vineyards in Southwest France. Spectral signatures of healthy and symptomatic plants were studied with a set of 20 variables computed from the UAV images (spectral bands, vegetation indices and biophysical parameters) using univariate and multivariate classification approaches. Best results were achieved with red cultivars (both using univariate and multivariate approaches). For white cultivars, results were not satisfactory either for the univariate or the multivariate. Nevertheless, external accuracy assessment show that despite problems of Flavescence dorée and healthy pixel misclassification, an operational Flavescence dorée mapping technique using UAV-based imagery can still be proposed.
Published: 2017

21. Improving grassland use via new technologies

Author: Pottier, Eric, Jacquin, Anne, Roumiguie, Antoine, Fougère, Marc, Institut de l'élevage (IDELE), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Airbus Defence and Space, Chambre d'agriculture de la Loire Atlantique (CDA), Institut de l'Elevage, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], gestion du pâturage, gestion des prairies, télédétection par satellite, [SDV]Life Sciences [q-bio], prairie, indice foliaire, herbomètre, production fourragère, innovation
Abstract: Grasslands can help provide solutions to the current economic and environmental challenges faced by livestock farmers. Farmers have high standards as they seek out methods for improving grassland management and forage system security. In the 1980s, a variety of tools were developed to facilitate and enhance grazing management. Today, they are little used because they are often time intensive, difficult to employ, and expensive. Recently developed measurement and communication tools (e.g., WIFI-enabled smartphones and tablets with integrated bluetooth and GPS technologies) show great potential in helping farmers manage their grasslands with greater efficacy and precision. In the intermediate term, remote sensing and access to high-resolution images from satellites or drones present new possibilities., Si les prairies apparaissent aujourd'hui comme les surfaces en capacité de répondre aux enjeux économiques et environnementaux de l'élevage, les attentes des éleveurs sont fortes en matière d'outillage pour les accompagner dans la gestion du pâturage et sécuriser leur système fourrager.Des outils destinés à faciliter et améliorer la conduite du pâturage ont été développés dès les années 1980 ; ils sont aujourd'hui peu utilisés en routine pour des raisons de temps, de facilité de mise en œuvre mais également de coût. Le développement récent de nouvelles technologies de mesure mais aussi et peut être tout autant de communication (smartphones et tablettes équipés de bluetooth, wifi et GPS) laissent entrevoir de nouvelles perspectives pour une gestion efficace et de précision. A moyen terme, la télédétection et la possibilité de disposer d'images haute résolution qu'elles soient obtenues pas satellite ou par drone ouvrent des perspectives nouvelles.
Published: 2017

22. Spiders in caves: the CAWEB project

Author: Mammola , Stefano, Gasparo , Fulvio, Komenov , Marjan, Růžička , Vlastimil, Déjean, Sylvain, Danflous , Samuel, Brustel, Hervé, Vargovitsh , Robert S., Rozwałka , Robert, Moldovan , Oana, Pavlek, Martina, Deltshev, Christo, Petrov , Boyan, Naumova , Maria, Ćurčić , Srećko, Mock , Andrej, Kovac , Lubomir, Cardoso, Pedro, Dányi , László, Angyal , Dorottya, Balázs , Gergely, Ribera , Carles, Prieto , Carlos E., Fernández , Jon, Komposch , Christian, Carter , Julian, Isaia, Marco, Bulgarian Academy of Sciences (BULGARIA), Conservatoire Régional des Espaces Naturels Midi-Pyrénées - CREN (FRANCE), University of Helsinki (FINLAND), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Università degli studi di Torino - UNITO (ITALY), Universitat de Barcelona - UB (SPAIN), Croatian Biospeleological Society (CROATIA), Eotvos Lorand University (HUNGARY), Hungarian Natural History Museum (HUNGARY), Institute for Bioengineering of Catalonia - IBEC (SPAIN), Institute of Speleology (ROMANIA), Institut für Tierökologie und Naturbildung (GERMANY), National Academy of Sciences of Ukraine (UKRAINE), National Museum of Natural History (BULGARIA), National Museum of Wales (UNITED KINGDOM), Pavol Jozef Šafárik University (SLOVAKIA), Società Alpina delle Giulie (ITALY), Maria Curie-Skłodowska University – UMCS (POLAND), University of Belgrade (SERBIA), University of the Basque Country - UPV/EHU (SPAIN), Chercheur indépendant, Dynamiques et Ecologie des Paysages Agriforestiers - DYNAFOR (Castanet-Tolosan, France), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Department of Life Sciences and Systems Biology, University of Turin, Società Alpina delle Giulie, Blwd Kuzman Josifovski Pitu, Independent, Institute of Entomology, Conservatoire Régional des Espaces Naturels Midi-Pyrénées (CREN Midi-Pyrénées), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), National Academy of Sciences, 2101 Constitution Ave. NW, Zakład Zoologii (UMCS), Institute of Speleology, Croatian Biospelological Society, Ruder Boskovic Institute, National Museum of Natural History, Institut Biodiversity and Ecosystem Research, Faculty of Biology, Adam Mickiewicz University in Poznań (UAM), Pavol Jozef Šafárik University, University of Helsinki, Hungarian Natural History Museum (Magyar Természettudományi Múzeum), Department of Systematic Zoology and Ecology, Institute of Biology [Budapest], Faculty of Sciences [Budapest], Eötvös Loránd University (ELTE)-Eötvös Loránd University (ELTE)-Faculty of Sciences [Budapest], Eötvös Loránd University (ELTE)-Eötvös Loránd University (ELTE), Animal Cell Biology, University of the Basque Country, University of Barcelona, Institut für Tierökologie und Naturbildung, and National Museum of Wales
Subjects: Model organisms, araignée, araneae, Ecology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biodiversité et Ecologie, biogeography, ecology, model organisms, subterranean taxa, Biogeography, Subterranean taxa, Araneae, Spider, spider
Abstract: session 01 - Diversity and faunistics; World experts of different disciplines, from molecular biology to macroecology, recognize the value of cave ecosystems as ideal ecological and evolutionary laboratories. Among other subterranean taxa, spiders stand out as intriguing model organisms for their ecological role of top-predators, their unique adaptations to the hypogean medium and their sensitivity to anthropogenic disturbance. Here, we provide a general overview of the spider families recorded in hypogean habitats in Europe–20 families including nearly 500 species, most of them with restricted distributions. We also review the different adaptations of hypogean spiders to subterranean life and summarize the information gathered so far about their origin, population structure, ecology and conservation status. Taxonomic knowledge on subterranean spiders in Europe appears to be well, but not exhaustively documented. The origin of the European assemblages is mostly explained by past climate dynamics, although other factors are likely to be involved. Most of the macroecological issues related to spiders in European caves are based on qualitative assessments or have been quantified only at a sub-regional scale. In order to shed light on cave spiders’ biogeography and the macroecological patterns driving the diversity of European subterranean spiders we created the CAWEB network, a spontaneous collaboration between subterranean arachnologists from 30 different European countries. We here present the team and provide some preliminary results, which highlight Southern Europe as an important hot-spot for the European subterranean spider diversity.
Published: 2017

23. Interactive effects of landscape-wide intensity of farming practices and landscape complexity on wild bee diversity

Author: Emilie Andrieu, Romain Carrié, Annie Ouin, Ingolf Steffan-Dewenter, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Department of Animal Ecology and Tropical Biology, Biocenter, Julius-Maximilians-Universität Würzburg [Wurtzbourg, Allemagne] (JMU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Geography, Planning and Development, Biodiversity, intensity index, farmland, wild bees, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Abundance (ecology), annual crops, Nature and Landscape Conservation, 2. Zero hunger, Ecology, Agroforestry, business.industry, 010604 marine biology & hydrobiology, landscape complexity, 15. Life on land, Habitat destruction, Landscape architecture, Habitat, Agriculture, landscape scale, Species richness, Landscape ecology, business
Abstract: Context: The local intensity of farming practices is considered as an important driver of biodiversity inagricultural landscapes and its effect on biodiversity has been shown to interact with landscape complexity.But the influence of landscape-wide intensity of farming practices on biodiversity and its combinedeffect with landscape complexity have been little explored. Objective: In this study, we tested the interactiveeffect of the landscape-wide intensity of farming practices and landscape complexity on the localspecies richness and abundance of farmland wild bee communities. Methods: We captured wild bees in 96 crop fields and explored the effect of landscape-wide intensity of various farming practices along a gradient of land-scape complexity (proportion of semi-natural habitats). Results: We found that species richness and abun-dance of wild bees were more positively influenced by landscape complexity in highly insecticide-sprayedlandscapes than in less intensively managed landscapes. In contrast, we found that the positive effect oflandscape complexity on bee species richness only occurred in landscapes with low nitrogen inputs.Conclusions: Our study demonstrates the interactive effects of landscape-wide farming intensity and land-scape complexity in shaping the diversity of farmland wild bee communities. We conclude that the manage-ment of farming intensity at the landscape-scale could mitigate the effects of habitat loss on wild bee declineand would help to maintain pollination services in agricultural landscapes.
Published: 2017

24. Une nouvelle espèce de Geotrogus Guérin-Méneville pour la faune du Maroc et catalogue actualisé des espèces du genre (Coleoptera: Scarabaeoidea: Melolonthidae: Rhizotrogini)

Author: Miessen, Geoffrey, Benyahia, Yousra, Brustel, Hervé, Chercheur indépendant, Laboratoire d’Ecologie et Environnement, Université de Bab Ezzouar, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université Hassan II Mohammedia - Casablanca - UH2MC (MOROCCO), and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)
Subjects: coleoptera, rif, Biodiversité et Ecologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], new species, palaearctic, morocco, scarabaeoidea, melolonthidae, geotrogus, catalogue, Catalogue, faune, maroc, Scarabaeoidea, faunal survey, Rif, Melolonthidae, chafers, New species, Coleoptera, Maroc, Palaearctic, Morocco, Ecosystèmes, Geotrogus, Faune
Abstract: A new species of Geotrogus Guérin-Méneville, 1842 is described from Talassemtane National Park (Western Rif, Chefchaouen district, Morocco). The genus includes actually 43 species for which we will give an updated catalogue., Une nouvelle espèce de Geotrogus Guérin-Méneville, 1842 est décrite du Parc National de Talassemtane (Rif occidental, district de Chefchaouen, Maroc). Le genre regroupe à présent 43 espèces dont nous donnons un catalogue actualisé.
Published: 2017

25. Les forêts dans des territoires agricoles : nouveaux atouts d’une relation bénéfique

Author: Deconchat, Marc, Blanco, Julien, Sourdril, Anne, Andrieu, Emilie, Nangwa Kwetchou, Angel'S, Vigan, Martin, Corcher, Ama Corinne, Vialatte, Aude, Bounab, Mehdi, Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR Ladys, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Chambre d'Agriculture de l'Ariège (CA 09), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Laboratoire Dynamiques Sociales et Recomposition des Espaces (LADYSS), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris 8 Vincennes-Saint-Denis (UP8)-Université Paris Nanterre (UPN)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Intégration territoriale, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biodiversité et Ecologie, intégration territoriale, Territoire rural, territoire rural, Agroécologie, Valeur culturelle, cultural value, Agroecology, valeur culturelle
Abstract: Contexte et enjeux: Les espaces arborés peuvent prendre différentes formes dans les paysages à dominante agricole en France et en Europe tempérée : bois, bosquets et plantations, mais aussi haies, alignements d’arbres et plantations agroforestières. Ils sont en interaction étroite avec les activités agricoles, de culture ou d’élevage dans dynamiques particulières. Il peut s’agir (1) d’interactions socio-techniques entre acteurs et ressources lorsque des agriculteurs possèdent, gèrent ou utilisent des portions de forêt, (2) d’interactions biophysiques spatiales entre ressources quand l’activité agricole est influencée par la proximité des forêts, mais aussi (3) d’interactions sociales entre acteurs agriculteurs et forestiers qui vont parfois déterminer certains modes de gestion forestière. Ces différents points de vue expliquent la difficulté à bien délimiter les forêts des paysages ruraux agricoles, ainsi que le manque de connaissance à leur égard. Ces espaces arborés sont dynamiques et, durant les 2 derniers siècles, leur répartition spatiale a fortement changé, avec des processus de fragmentation par endroits et de défragmentation dans les zones de déprise agricole. Néanmoins, comparativement aux espaces agricoles environnants soumis aux rotations de cultures, ils apparaissent relativement stables et constituent de ce fait ce qu’on appelle des infrastructures écologiques influant très significativement les caractéristiques des milieux voisins. Ils sont ainsi souvent vus comme des réservoirs de biodiversité dans les paysages agricoles. Problématique: Etudier les relations entre ces espaces arborés des paysages et l’agriculture est crucial pour aider à concevoir des territoires ruraux valorisant au mieux et de façon durable l’ensemble de leurs ressources, agricoles et forestières, et des services qui y sont liés. Cette problématique s’inscrit dans les priorités nationales pour une agriculture plus agroécologique. Méthodes: A partir de plusieurs exemples de travaux récents en écologie, géographie, agronomie et ethnologie, la présentation montre les différents aspects de ces interactions entre espaces arborés et agriculture, comment elles influent sur des propriétés clés des territoires et comment elles pourraient être mieux valorisée. Ces exemples s’appuient sur des recherches interdisciplinaires et conduites en partenariat, combinant des approches écologiques avec des analyses socio-techniques. Résultats: De nombreux travaux ont largement montré les rôles clés des espaces arborés dans la dynamique de population d’espèces contribuant à des services écosystémiques importants pour l’agriculture comme la régulation des bioagresseurs ou la pollinisation. Ainsi des suivis spatialisés de la répartition des carabiques, prédateurs auxiliaires des cultures de part et d’autre de lisières forestières montrent clairement que les bois peuvent fournir un surcroit d’individus qui vont chasser dans les cultures adjacentes. De plus, plusieurs résultats laissent penser que cet effet est crucial surtout quand des évènements extrêmes réduisent drastiquement les populations déjà présentes dans les champs. Les espaces arborés joueraient ainsi un rôle de réservoir pour contribuer à reconstituer les populations d’auxiliaires. Des travaux similaires montrent des phénomènes comparables pour les pollinisateurs, en particulier sur l’intérêt des lisières dans la fourniture de ressources florales tout au long de l'année et de leur capacité à abriter des sites de nidification et d'hivernation. Les caractéristiques des lisières jouent un rôle important et mal connu dans ces échanges ; on peut supposer qu’ils pourraient être favorisés par une gestion particulière de ces interfaces. Les espaces arborés sont à l’origine d’un grand nombre de services écosystémiques. Le projet Terafor, soutenu par la Fondation de France, en a ainsi identifié près de 70 ; ils ont été intégrés dans un système d’analyse multi-critères destiné à aider à élaborer des projets de territoires agri-forestiers valorisant l’ensemble de ces services. Parallèlement, des recherches exploratoires tentent d’utiliser les données satellitaires nouvelles pour fournir des cartographies de niveaux potentiels de services. Enfin, il convient de signaler que si les espaces arborés sont sources de services pour l’agriculture, l’inverse est aussi vrai : les bois et forêts bénéficient de services issus des autres composantes des paysages ; la régulation des insectes défoliateurs des arbres s’avère par exemple plus élevée en lisière, tandis que les mouvements de chevreuils entre les cultures où ils se nourrissent et les bois semblent contribuer à la fertilisation du sol forestier. Le bois produit par les espaces arborés contribue à satisfaire l’accroissement de l’usage de la biomasse pour se substituer aux énergies fossiles, ou les compléter. Il existe maintenant de multiples formes de valorisation du bois qui s’adaptent aux conditions locales et aux possibilités des opérateurs. L’association Bois Paysan en Ariège a ainsi développé des circuits courts de vente de bûches aux particuliers. En réponse à une demande croissante, des filières nouvelles et originales se mettent en place, avec l’émergence, parfois, de véritables « ateliers bois » dans des exploitations agricoles qui diversifient ainsi leurs activités. Les usages du bois se sont aussi élargis et l’agriculture commence à en utiliser plus fréquemment, pas seulement comme source d’énergie ou de matériaux de construction. Dans le APIL en Ariège, par exemple, les multiples usages du bois en exploitation agricole sont testés : litière pour les animaux ou paillage pour les plantations. Au-delà du bilan matériel et économique pour les exploitations, ces démarches de valorisation des produits des espaces arborés des paysages agricoles contribuent aussi à renforcer des projets de territoires en valorisant des ressources dispersées par des usages les plus proches possibles. Grâce aux possibilités de communication actuelles et de mise en réseau, la dispersion des ressources en bois n’est plus toujours un handicap et devrait contribuer à une relocalisation d’une partie des approvisionnements en énergie et matériaux. Enfin, des recherches en sciences sociales ont clairement montré que les espaces arborés sont associés à une dimension culturelle particulière dans la perception qu’ont les habitants de leur environnement et de son devenir. Ainsi, dans le Sud-Ouest de la France, nous avons montré que les bois sont un marqueur social fort qui relie les familles d’aujourd’hui à leur histoire et s’inscrivent dans une tradition de transmission des patrimoines et de gestion à objectif d’autosuffisance particulière. Connaitre ces dimensions sociales est essentiel, tant pour les respecter et les préserver comme partie d’un patrimoine culturel spécifique, que pour pouvoir les faire évoluer et lever des blocages qui limiteraient des développements durables. A cet égard, les démarches participatives de co-construction de ces projets de développement semblent une façon pertinente de prendre en compte les multiples attentes des habitants d’un territoire agricole et forestier. Discussion et conclusion: Ces exemples soulignent combien la séparation entre gestion forestière et agriculture dans bien des régions est artificielle et mériterait d’être remise en cause dans les projets d’aménagement des territoires. Pourtant, les politiques actuelles, comme le récent Plan National Forêt Bois, semblent tourner le dos à la valorisation de ces interactions, privilégiant des approches par filières cloisonnées. La foresterie tout comme l’agriculture, et d’autres activités humaines, tireraient un bénéfice à mieux coordonner leurs objectifs et leurs actions. Des initiatives locales vont dans ce sens et la recherche montre comment ces interactions écologiques, techniques et socio-culturelles s’avèrent importantes dans une perspective de développement plus durable.
Published: 2017

26. Les Lycidae d’Europe: État des connaissances pour la France (Coleoptera)

Author: Calmont, Benjamin, Valladares, Lionel, Brustel, Hervé, Société d'Histoire Naturelle Alcide d'Orbigny (SHNAO), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], coleoptera, [SDV]Life Sciences [q-bio], cartographie, chafers, mapping, europe
Abstract: A key of European Lycidae is given. Biological and chorological elements and maps of the distribution ofspecies, in France, are proposed., Une clé des Lycidae d’Europe est donnée. Des éléments biologiques et chronologiques ainsi qu’une synthèsecartographique de la répartition des espèces en France sont proposés.
Published: 2017

27. Influence of traditional management and environmental variables on mediterranean saproxylic beetle assemblages

Author: Pablo Ramilo, Hervé Brustel, Estefanía Micó, Ana Paola Martínez-Falcón, Alejandra García-López, Eduardo Galante, Centro Iberoamericano de la Biodiversidad (CIBIO), Universidad de Alicante, Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo (UAEH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Universidad de Alicante. Departamento de Ciencias Ambientales y Recursos Naturales, Universidad de Alicante. Centro Iberoamericano de la Biodiversidad, and Biodiversidad y Biotecnología aplicadas a la Biología de la Conservación
Subjects: 0106 biological sciences, Mediterranean climate, Food Chain, coleoptera, Fauna, Population Dynamics, Forest management, Biodiversity, forest management, Forests, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Quercus pyrenaica, Quercus, quercus pyrenaica, Animals, Zoología, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, biodiversity, Ecology, biology, Agroforestry, Forestry, 15. Life on land, biology.organism_classification, Biota, Pollarding, Coleoptera, 010602 entomology, iberian peninsula, Habitat, Spain, Insect Science, Species richness, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Iberian Peninsula
Abstract: Mediterranean oak forests of the Iberian Peninsula host a great diversity of saproxylic beetles. For centuries, humans have carried out traditional management practices in this area, at both habitat and tree level, causing changes in forest structure. The aim of this study was to evaluate the anthropic effect of these traditional practices on saproxylic beetle diversity by measuring a set of environmental variables related to forest structure at both plot and tree level. Fauna was collected using window traps over a period of 12 mo. Multiple regression procedures showed which variables significantly affected the diversity of the studied assemblage. Our results demonstrated that the different metrics used to assess the diversity of assemblages responded variably depending on the management strategies applied and the level at which they were carried out. Certain management practices that disrupted the landscape from its natural state, such as the introduction of livestock or the local removal of particular trees, maximized species richness but, nevertheless, had a negative effect on the rest of diversity metrics analyzed. However, other practices such as pollarding, which involves the suppression of the main branch of the tree, had a positive effect on all diversity metrics evaluated as it promoted the formation of potential microhabitats for saproxylic fauna. We concluded that not all types and degrees of traditional forest management favor saproxylic beetle diversity and that different diversity metrics should be taken into consideration in future strategies for the protection and conservation of this fauna. Financial support was provided by the “Ministerio de Ciencia e Innovación and fondos EU FEDER” (CGL 2012–31669) and “Generalitat Valenciana” (PROMETEO/2013/034). This research is part of Pablo Ramilo Ríos PhD studies, funded by “Ministerio de Educación, Cultura y Deporte”, through the fellowship FPU13/00096.
Published: 2017

28. Aplicaciones de la teledetección espacial para el manejo del agua

Author: Denux, Jean-Philippe, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: space remote sensing, eau, water, [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, télédétection spatiale, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing
Abstract: Sesión 3: Experiencias, lecciones aprendidas y propuestas / MESA N°5: Centro de data, innovacion y technologia; Aplicaciones de la teledetección espacial para el manejo del agua. 1. Simposio Internacional del Agua - HidrICA 2016
Published: 2016

29. Historical Map : un plug-in expérimental QGIS pour la vectorisation de l'occupation des sols dans les minutes de la carte d’État-Major datant du 19ème siècle

Author: Nicolas Karasiak, Anne-Claire Dereclenne, Pierre Alexis Herrault, Mathieu Fauvel, Sylvie Ladet, David Sheeren, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Image, Ville, Environnement (LIVE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR LIVE, Université de Strasbourg (UNISTRA), Centre National d'Études Spatiales - CNES (FRANCE), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)
Subjects: Plugin qgis, géomatique, carte ancienne, Géomatique, [SDV]Life Sciences [q-bio], Bio-informatique, plugin qgis, Carte ancienne, Géographie
Abstract: Le Centre Automatisé de Traitement de l’Information Acteurs, Changements Techniques, Informatique et Outils Numériques piloté par le département SAD est un collectif de travail (surtout des informaticiens) labellisé pour 4 ans ayant pour objectif de produire des outils informatiques techniques (logiciels, applications), et logiques (modèles, aide à la décision) aidant à la compréhension des interactions entre agroécosystèmes et systèmes sociaux et à l’accompagnement de l’innovation. Plusieurs chantiers lancés depuis 2012 dont celui en géo - informatique. C’est dans ce cadre que nous organisons annuellement des journées techniques mélangeant présentation de travaux réalisés dans nos unités et travaux dirigés sur ordinateur pour la montée en compétences/mutulalisation des compétences.
Published: 2016

30. Influences of climate change on Moroccan fir forest biodiversity: coleoptera and hymenoptera as indicators

Author: Benyahia, Yousra, Brustel, Hervé, El Antry, Salwa, Maatouf, Noureddin, Valladares, Lionel, Rohi, Latifa, Laboratory of Ecology and Environment, Université Abderahmane Mira, Centre de Recherche Forestière, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: changement climatique, coleoptera, fir, fir forest, chafers, bio-indicators, sapin, biodiversité forestière, [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, climate change, hymenoptera, insects, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, global change, biodiversity
Abstract: Climate change is a real and actual phenomenon, which threat nature stability and human life; their effects are already felt in some region of the planet. Southern and eastern parts of the Mediterranean basin are amongst those regions, increased extreme weather events and strong climate fluctuations that exceed the global average like heat waves, heavy rainfall of short duration and recurring storms were recorded recently.Considered as the major component of an ecosystem since they play a critical role in soil protection, air quality, flood reduction, and a significant economic role in rural areas and for the national economy as a whole; forest ecosystems have been central to the debate and climate change issues. In Morocco, this high significance is added to their crucial role in the hydrological balance and cross-cutting implications for socio-economic and human development. In fact, Morocco has a complex and important floristic and faunistic diversity mainly represented by forest ecosystems. It conceals valuable genetic resources both for the country itself and for the Mediterranean countries community. However, biodiversity and genetic resources are in increased threat especially in the absence of specific studies on climate change impacts in vulnerable areas such as forests.In addition to forests, insects are amongst the most affected and responding organisms to climate change because of its strong direct influence on their development, reproduction, and survival. Moreover, insects have short generation times and high reproductive rates, so they are more like to respond quicker to climate change than long-lived organisms, such as plants and vertebrates. Warming can potentially affect several aspects of insect life-cycle and ecology, especially those directly controlled by energy availability variables such as degree. Consequently, potential responses include changes in phenological patterns, changes in habitat selection, and expansion and contraction of geographic and altitudinal ranges. Their ability to quick response makes them good indicators of current human- driven climate change. In this context fits our study which aims the inventory of Coleoptera and Hymenoptera associated with the Moroccan relict fir forests of Talassemtane National Park, in a way to reveal their response and their use as bioindicators in biomonitoring of forests. The sampling was led in 2 successive years (2013-2014), during 7 months (from April to October) using PolytrapTM and colored traps placed in 20 plots in the Talassemtane Fir and oak forest, combined with active field research;74 family of Coleoptera and 34 families of Hymenoptera were recorded. Among those families are bio-indicators specially saproxylic beetles, parasitoid wasps, rare and endemic species. A First statistical test proves that there is a significant correlation between Temperature degrees and insects’ arrival; also, an altitudinal effect on insects’ distribution is demonstrated. In spite of the fact that the integration of insects in forest monitoring in Morocco still innovative, due to the lack of knowledge and the taxonomic obstacle related to this group of invertebrates; such studies are necessary to establish new management policy and improve actual forest management practices.
Published: 2016

31. Inventaire et évaluation des vieilles forêts des Pyrénées de Midi-Pyrénées

Author: Jean-Marie Savoie, Antoine Brin, Eugénie Cateau, Sylvain Dejean, Carole Hannoire, Laurent Larrieu, Lionel Valladares, Frédéric Blanc, Hervé Brustel, Gilles Corriol, Gouix Nicolas, Marta Infante Sanchez, Yanis Marcillaud, Carolie Victoire, Michel Bartoli, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Conservatoire Régional des Espaces Naturels Midi-Pyrénées (CREN Midi-Pyrénées), Conservatoire Botanique National de Midi-Pyrénées (CBNMP), Centre National de la Propriété Forestière, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Office National des Forêts (ONF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Conservatoire d'Espaces Naturels Midi Pyrénées (CEN MP), Conservatoire Botanique National des Pyrénées et de Midi-Pyrénées (CBNP MP), Conservatoire Botanique National des Pyrénées et de Midi-Pyrénées - CBNPMP (FRANCE), Conservatoire Régional des Espaces Naturels Midi-Pyrénées - CREN (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Centre National de la Propriété Forestière - CNPF (FRANCE), Office National des Forêts - ONF (FRANCE), and Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE)
Subjects: Forêt ancienne, Pyrénées, Biodiversity and Ecology, midi pyrénées, Biodiversité et Ecologie, Inventaire forestier, Midi Pyrénées, pyrénées, forest inventory, forêt ancienne, inventaire forestier, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: National audience; Les 11, 12 et 13 février 2016, ce sont déroulées les 5e Rencontres Naturalistes de Midi-Pyrénées dans le Gers, à Auch. Tous les 3 ans, ce rendez-vous incontournable des amateurs et professionnels de la biodiversité de Midi-Pyrénées et d’ailleurs, a rassemblé plus de 600 participants sur les 3 jours. Le succès de cet événement n’aurait pas été aussi complet sans l’aide des bénévoles et des associations partenaires. Les 5e Rencontres Naturalistes se sont ouvertes sur les discours de Nadia Baïtiche-Moine, Adjointe au Maire d’Auch, de Jérôme Calas, Président de Nature Midi-Pyrénées et de Ronny Guardia-Mazzoleni, Conseiller régional Languedoc-Roussillon-Midi-Pyrénées. Au cours de ces 3 jours, ce sont près de 35 communications sur la faune, la flore et les espaces naturels, agricoles et forestiers qui ont été présentées : une véritable synthèse des différents travaux menés en Midi-Pyrénées depuis 3 ans dans le domaine de la connaissance et de la préservation de notre riche patrimoine naturel régional. Les nombreux participants d’horizons divers (associations, conservatoires, services de l’Etat, laboratoires de recherche, établissements scolaires, PNR ou collectivités) ont eu également l’occasion de profiter des temps de pause pour échanger autour d’une vingtaine de posters scientifiques et de différentes expositions.
Published: 2016

32. Improved forest cover mapping based on MODIS time series and landscape stratification

Author: Denux, Jean-Philippe, CHERET, Véronique, CANO, Emmanuelle, Bisquert, Mar, Hubert-Moy, Laurence, ProdInra, Archive Ouverte, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Department of Applied Physics, Universidad de Huelva, Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique (LETG - Rennes), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 (LETG), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)
Subjects: metrics, [SDV] Life Sciences [q-bio], classification, efficiency, [SDV]Life Sciences [q-bio], land-cover, algorithms, resources, remote-sensing imagery, phenology, accuracy assessment, information
Abstract: Detailed forest-cover mapping at a regional scale by supervised classification is technically limited by various factors. This study evaluates the ability of a landscape stratification method to improve classification accuracy. An object-based segmentation technique (OBIA) was performed to delineate radiometrically homogeneous regions into the study area, used as strata for the classification of a time series of Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) normalized difference vegetation index (NDVI) data. As a reduction of the spatial variability of the signatures of the vegetation classes is expected, Maximum Likelihood Classifier (MLC) was used to analyse potential effects on classification accuracy. Accuracy assessment was based on the calculation of kappa coefficient (κ) and reject fraction (RF). The values obtained with and without stratification were compared, to assess their global and per-stratum influence on the quality of a detailed forest-cover map (20 different classes). To study the influence of topographical and landscape stratum characteristics on classification accuracy, eight indicators were calculated. Their correlation with κ and RF differences due to stratification was analysed. Our study showed that stratification improved global and per-stratum classification accuracy and in parallel caused an RFincrease. Both these evolutions are not conditioned by the stratum topographical and landscape characteristics but strongly influenced by stratum and classified vegetation area.
Published: 2016

33. Liste provisoire des Anthribidae (Coleoptera Anthribidae) de Gironde

Author: Sébastien Labatut, Sandy Barberis, William Batifoix, Antoine Brin, Patrick Dauphin, David Genoud, Régis Lapeyre, David Lessieur, Alain Royaud, Jean-Philippe Tamisier, Hervé Thomas, Gérard Tiberghien, Cyrille van Meer, Chercheur indépendant, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], anthribidae, [SDV]Life Sciences [q-bio], coléoptères, département de la gironde, liste d’espèces, sud-ouest de la france
Abstract: Les auteurs proposent une liste provisoire des Coléoptères Anthribidae de Gironde en compilant les données présentes dans leurs collections. Ce travail permet ainsi de constituer une liste de quinze espèces observées récemment de ce département.
Published: 2016

34. Flightless saproxylic beetles' response to human impact on forest and landscape

Author: CATEAU, Eugénie, Brustel, Hervé, ProdInra, Archive Ouverte, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, forest, Coléoptère saproxylique, forêt, impact sur le paysage, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: Flightless saproxylic beetles' response to human impact on forest and landscape. 9. Symposium on the conservation of saproxylic beetles
Published: 2016

35. Influences de l’exploitation forestière sur les coléoptères saproxyliques aptères de litière

Author: Cateau, Eugénie, Verneuil, Baptiste, Savoie, Jean-Marie, Brustel, Hervé, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, forest enterprise, exploitation forestière, Coléoptère saproxylique, beech forests, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, beetle diversity
Abstract: Influence of forest management on litter wingless saproxylic beetles. Saproxylic beetles are dependent of maturity attributes such as large trees, dead wood, microhabitats. Current forest management suppresses those attributes. Knowledge about the wingless saproxylic beetles is rare but, because of their inability to flight, these species could be indicators of past and present forest exploitation. The goal of this paper is to study the impact of forest management on those species. Fourteen forests have been sampled in the central French Pyrenees, in three different valleys : Vallée du Biros (in the department of Ariège), Haute-vallée de la Garonne (Haute-Garonne) and Basse Vallée d’Aure (Hautes-Pyrénées). In these forests we measured topographical variables, structural variables and maturity variables such as number of large trees (diameter > 70 cm), volume of dead wood, diversity of microhabitat. Beetles were sampled by litter sieving in front of 10 trees per forest. Five wingless saproxylic beetles species have been sampled by litter sieving, in front of 10 trees per forest. All these species are in their biogeographical area. For the community as for four (over five) wingless beetles sampled, the impact of actual forest management is not significant. On the other hand, for some species and the community, there is significant difference between valleys. Indeed, during last centuries, Ariège forests have been intensively exploited and pastured. Species richness of those forests is significantly inferior and most of the species are absent of this valley. These results suggest that even if wingless saproxylic beetles may not be affected by current forest management, long and intensive exploitation and/ or particular practice such as pasture can cause the local disappearance of the species., Les coléoptères saproxyliques sont dépendants d’attributs de maturité (arbres de très gros diamètre, abondance de bois mort et diversité des dendromicrohabitats) qui sont supprimés par la sylviculture traditionnelle. Certains coléoptères saproxyliques aptères de litière sont aujourd’hui peu connus et pourraient, de par leur aptérisme, être des indicateurs de la gestion forestière passée et récente. Nous étudions ici l’impact de l’exploitation forestière sur ces espèces. Sept couples forêt exploitée – forêt mature ont été inventoriés dans la zone centrale des Pyrénées, côté français. Ces forêts sont réparties dans trois vallées : Vallée du Biros (Ariège), Haute-vallée de la Garonne (Haute-Garonne) et Basse Vallée d’Aure (Hautes-Pyrénées). L’échantillonnage est effectué par tamisage de litière au pied de 10 arbres par forêt. À l’échelle de la communauté et à l’échelle de l’espèce, pour quatre des cinq espèces inventoriées, l’exploitation forestière actuelle n’a d’influence significative ni sur leur richesse spécifique, ni sur leur abondance. À ces deux échelles en revanche, des différences apparaissent en fonction de la vallée. Les forêts ariégeoises, qui ont été plus intensivement exploitées et plus pâturées durant les derniers siècles, sont significativement plus pauvres en coléoptères saproxyliques aptères de litière. Ceci laisse à penser que même si les espèces étudiées supportent bien l’exploitation sylvicole traditionnelle, un impact anthropique dépassant une certaine ampleur (en termes d’intensité de prélèvement, de durée ou d’étendue spatiale) pourrait amener à la disparition locale de ces espèces., Cateau Eugénie,Verneuil Baptiste,Savoie Jean-Marie,Brustel Hervé. Influences de l’exploitation forestière sur les coléoptères saproxyliques aptères de litière. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 71, n°1, 2016. pp. 59-67.
Published: 2016

36. Évaluation de la biodiversité entomologique des vieilles forêts de la Réserve de biosphère Luberon-Lure

Author: Valladares, Lionel, Frapa, Pierre, Brustel, Hervé, Courtin, Olivier, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Parc Naturel Régional du Luberon (PNRL), Independent, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Parc Naturel Régional du Luberon - PNRL (FRANCE), Chercheur indépendant, and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)
Subjects: parc naturel régional du luberon, Biodiversité et Ecologie, inventaire faunistique, coléoptères saproxyliques, inventory, saproxylic beetles, luberon natural regional park, [SDV]Life Sciences [q-bio], Inventory, Saproxylic beetles, Luberon natural regional park, Coléoptères saproxyliques, Parc naturel régional du luberon, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Inventaire faunistique
Abstract: Les auteurs donnent une liste de 350 coléoptères (espèces non saproxyliques incluses) déterminés dans le cadre d’un inventaire réalisé pour le Parc naturel régional du Lubéron en 2015, sur plusieurs forêts anciennes. Quelques espèces remarquables font l’objet de commentaires faunistiques., The authors give a check-list of 350 beetles species (including non saproxylic species ) collected in several old forest in the Luberon region in 2015. Records are listed as tables including some faunistic comments.
Published: 2016

37. Bilan des connaissances, inventaire et cartographie de deux coléoptères d'intérêt communautaire (stephanopachys linearis et S. substriatus) dans les sites Natura 2000 de la région PACA

Author: Braud, Yoan, Brustel, Hervé, Valladares, Lionel, Cuvelier, Jérémy, Bureau d'études entomologie ENTOMIA, Entomia, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Cartographie et système d'information géographique (SIG), O2Terre, Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Commanditaire : Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement (France), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], natura 2000, inventaire de la population, Coléoptère saproxylique, [SDV]Life Sciences [q-bio], cartographie, mapping, paca
Abstract: Bilan des connaissances, inventaire et cartographie de deux coléoptères d'intérêt communautaire ([i]stephanopachys linearis et S. substriatus[/i]) dans les sites Natura 2000 de la région PACA
Published: 2016

38. Mapeo de los bosques tipo varillal utilizando imágenes de satélite rapideye en la provincia maynas, loreto, Perú

Author: José T. Maco-García, Anita Rocio Jarama-Vilcarromero, George P. Gallardo, María Marín, Angela Cuadros, Tony J. Mori, Franco García, Jean P. Denux, Jhon Rengifo, Juan Palacios, Ricardo Zárate, Guiuseppe Torres-Reyna, Instituto de Investigaciones de la Amazonía Peruana (IIAP), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centro para el Desarrollo del Indígena Amazónico (CEDIA ), Gobierno Regional de Loreto, Organismo de Supervisión de los Recursos Forestales y de Fauna Silvestre (OSINFOR ), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Centro para el Desarrollo del Indígena Amazónico - CEDIA (PERU), Gobierno Regional de Loreto (PERU), Instituto de Investigaciones de la Amazonía Peruana - IIAP (PERU), Organismo de Supervisión de los Recursos Forestales y de Fauna Silvestre - OSINFOR (PERU), Dynamiques et Ecologie des Paysages Agriforestiers - DYNAFOR (Castanet-Tolosan, France), Instituto de Investigaciones de la Amazonía Peruana, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)
Subjects: 0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Biodiversité et Ecologie, télédétection, [SDV]Life Sciences [q-bio], white-sand forest, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, sig, gis, remote sensing, Sylviculture, foresterie, Teledetección, teledetección, bosques sobre arena blanca, rapideye, varillal hidromórfico, pole forest, Pole forest, 0105 earth and related environmental sciences, Varillal hidromórfico, Bosques sobre arena blanca, White-sand forest, 15. Life on land, Remote sensing, Sig, Gis, Rapideye
Abstract: Los bosques tipo varillal albergan una diversidad biológica endémica y varias especies monodominantes, cuando estos bosques se ubican en los pantanos acumulan gran cantidad de carbono en el suelo. El objetivo del presente estudio fue elaborar el mapa de distribución espacial de los varillales sobre arena blanca y sobre pantano en la provincia Maynas, Loreto, a escala 1/100,000, utilizando imágenes de satélite RapidEye y aplicando el algoritmo clasificador de Máxima Verosimilitud (MVS) en el programa ArcGIS versión 10.1. Usamos siete categorías de clasificación en tres escenas RapidEye y definimos las firmas espectrales respectivas basadas en 32 áreas de entrenamiento de muestreo en campo. Se clasificaron las 206 escenas restantes utilizando el algoritmo MVS. El mapa fue validado utilizando 57 puntos de control entre varillales y otros tipos de bosque. Se determinaron 51,025 ha de varillales que representan 0.67% de la superficie de la provincia Maynas, distribuidas principalmente entre las cuencas de los ríos Napo y Nanay y entre la ciudad de Iquitos y la boca del Río Amazonas. Obtuvimos un 91.2% de exactitud en la clasificación de los varillales. Las bandas borde rojo (BR) e ifrarrojo cercano (IRC) de las imágenes RapidEye diferenciaron mejor los varillales de los otros bosques. Se reportan nuevas áreas de bosque de varillales sobre arena blanca y pantanos. En conclusión, las imágenes RapidEye son útiles para clasificar y diferenciar los varillales de otros tipos de bosque, siendo el mapa de los varillales útil para la exploración de nuevos sitios en el estudio de almacenamiento de carbono en el suelo., The varillal forest type has an endemic biodiversity and several monodominant species, when occurring in swampy areas these forests have great amounts of carbon accumulated in the soil. The aim of this study was to develop a distribution map of varillales occurring on white sand and swamps in the province of Maynas, Loreto at scale of 1/100,000, using RapidEye satellite imagery and applying the classifier algorithm of Maximum Likelihood (ML) in the program ArcGIS version 10.1. We used seven classification classes in three RapidEye scenes, and defined the respective spectral signatures based on 32 training areas with reference plots sampled in the field. The remaining 206 scenes were classified using the ML algorithm. The map was validated using 57 check points of varillales and other forest types. We determined 51,025 ha of varillales representing 0.67% of the province of Maynas; these areas are distributed mainly between the basins of the Napo and Nanay rivers, and between Iquitos and the mouth of the Amazon River. The map of varillales was validated to 91.2%. The red-edge and near infrared bands of the RapidEye images differentiated varillales from other forest types. New areas of varillales on white sand and swamps are reported. In conclusion, RapidEye images are useful to classify and differentiate varillales from other forest types, while this map of varillales is useful for the exploration of new study areas of below-ground carbon.
Published: 2016
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39. Tree diversity improves forest resistance to insect defoliators

Author: GUYOT, Virginie, DECONCHAT, Marc, VIALATTE, Aude, CASTAGNEYROL, Bastien, JACTEL, Hervé, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), (OATAO), Open Archive Toulouse Archive Ouverte, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Biodiversité, Gènes et Communautés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université de Bordeaux (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)
Subjects: Biodiversity and Ecology, Sylviculture, foresterie, [SDV.SA.SF]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry, Biodiversité et Ecologie, Biological control, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.SA.SF] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry, Tree diversity, Forest resistance, Defolation, European forests
Abstract: International audience; Whether increasing forest diversity should result in less insect damage (Associational Resistance, AR) or more damage (Associational Susceptibility, AS) is still debated. Moreover little is known about diversity - resistance relationships in mature forests due to methodological constraints. To address this question we used the FundivEurope exploratory platform. In this network of 209 mature forest plots, sampled along two orthogonal gradients of increasing tree species richness (from one to five species mixtures) and latitude (spanning from the Mediterranean to the boreal forest biomes), we assessed insect defoliation in tree crown. Focusing on eleven broadleaved species, we could for the first time demonstrate a global pattern of reduced defoliation (AR) in mature forests across Europe. We replicated the comparison of insect herbivory in pure vs. mixed plots of oak trees, at the edge or within forest patches. Here we found again significantly less damage on oaks surrounded by heterospecific neighbors, and showed that the magnitude of AR was larger at forest edge than in forest interiors. Last we tested the AR hypothesis with an invasive alien species, the Asian chestnut gall wasp, in Italy. Based on the same methodological approach, our study showed a significant decrease in gall damage with increasing tree species richness in mixed chestnut stands. Our work therefore provides new experimental evidence supporting the Associational Resistance hypothesis with three original contributions: i) AR does apply to mature forests, ii) irrespective of the identity of insect herbivores, iii) including alien pest species. These findings may have important implications for pest management in forest with the maintenance or improvement of tree species diversity being a promising tool for preventing insect damage.
Published: 2015

40. Butterflies and landscape connectivity: Do effects depend on species traits and conservation value?

Author: VILLEMEY, Anne, VAN HALDER, Inge, OUIN, Annie, BARBARO, Luc, CHENOT, Julie, TESSIER, Pauline, CALATAYUD, Francois, HILAIRE, Martin, ROCHE, Philipp, ARCHAUX, Frédéric, Ecosystèmes forestiers (UR EFNO), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Biodiversité, Gènes et Communautés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Ecosystèmes méditerranéens et risques (UR EMAX), Program DIVA 3, LEVANA project, French Ministry of the Environment, Ecole d'Ingénieurs de Purpan - EIP (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut national de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture - IRSTEA (FRANCE), Université de Bordeaux 1 (FRANCE), Biodiversité Gènes et Communautés - BIOGECO (Bordeaux, France), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: Biodiversity and Ecology, Biodiversité et Ecologie, [SDE]Environmental Sciences, Conservation, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Butterflies, Habitats
Abstract: International audience; Linear elements: - Not sufficient to preserve butterfly communities Woodlands: - Positive effect even on grassland specialists Species of conservation concern most impacted: - Homogenization of communities Connectivity metrics: - Using multiple metrics help to understand population/community functioning
Published: 2015

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