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1. Quantification of Detergents Complexed with Membrane Proteins

Author

Martin Picard, Jean-Michel Jault, Renaud Wagner, Olivier Bornert, Pierre Falson, Cédric Orelle, Morgane Agez, Vincent Chaptal, Cédric Montigny, Marc le Maire, Charlène Prier, Arnaud Kilburg, Luca Monticelli, H. Ronald Kaback, Eva Pebay-Peyroula, Anass Jawhari, Stéphanie Ravaud, Sandrine Magnard, Frédéric Delolme, Isabelle Broutin, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Central d'Analyse (SCA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biotechnologie et signalisation cellulaire (BSC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbiologie moléculaire et biochimie structurale / Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (MMSB), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biotechnologie et Signalisation Cellulaire, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire d'enzymologie et biochimie structurales (LEBS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Protéines et Systèmes Membranaires (LPSM), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut cellule souche et cerveau (U846 Inserm - UCBL1), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Biologie et de Technologies de Saclay (IBITECS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, CHEM2STAB, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Chaptal, Vincent, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] ( IBCP ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service Central d'Analyse du CNRS, Université de Lille, Sciences Humaines et Sociales, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biotechnologie et signalisation cellulaire ( BSC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire ( IGBMC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de biologie structurale ( IBS - UMR 5075 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques ( LCRB - UMR 8015 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut cellule souche et cerveau (SBRI), Institut de biologie structurale [1992-2019] (IBS - UMR 5075 [1992-2019]), and Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG)

Subjects
0301 basic medicine, Models, Molecular, [SDV]Life Sciences [q-bio], Detergents, Aucun, [SDV.BBM.BP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Bioengineering, Mass spectrometry, Micelle, Sensitivity and Specificity, Article, 03 medical and health sciences, Broad spectrum, Models, Membrane protein crystallization, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization, Ionization mass spectrometry, Micelles, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Liposome, Multidisciplinary, 030102 biochemistry & molecular biology, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Chemistry, Spectrometry, Molecular, Membrane Proteins, Reproducibility of Results, Mass, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], 030104 developmental biology, Membrane protein, Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization, Liposomes, Biophysics, Generic health relevance, [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract

International audience; Most membrane proteins studies require the use of detergents, but because of the lack of a general, accurate and rapid method to quantify them, many uncertainties remain that hamper proper functional and structural data analyses. To solve this problem, we propose a method based on matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-TOF MS) that allows quantification of pure or mixed detergents in complex with membrane proteins. We validated the method with a wide variety of detergents and membrane proteins. We automated the process, thereby allowing routine quantification for a broad spectrum of usage. As a first illustration, we show how to obtain information of the amount of detergent in complex with a membrane protein, essential for liposome or nanodiscs reconstitutions. Thanks to the method, we also show how to reliably and easily estimate the detergent corona diameter and select the smallest size, critical for favoring protein-protein contacts and triggering/promoting membrane protein crystallization, and to visualize the detergent belt for Cryo-EM studies. Detergents play a major role in handling membrane proteins. They are indispensable tools for extracting membrane proteins from the membrane and maintaining them in a soluble and active state for further study. A typical problem that arises during extraction, purification and crystallization is difficulty in controlling detergent concentration and composition, especially when detergent mixtures are used. Indeed, little is known about the fundamentals of detergent behavior around membrane proteins. Pioneering and important studies were conducted with radioactive detergents, which allowed estimation of the ratio of detergent to hydrophobic area 1,2. Moreover, use of radiolabeled detergents led to crystallization of the bovine ADP/ATP carrier and sarcoplasmic reticulum Ca 2+-ATPase, which was found to be highly dependent on the detergent:membrane protein ratio 3,4. However, only a few types of radioactive detergents are available, making this approach generally untenable. Other methods developed to measure detergent concentrations include: (i) colorimetric assays to estimate the sugar moiety for specific detergents 5,6 ; (ii) Fourier transform Infrared spectroscopy 7 ; (iii) plain thin layer chromatography coupled with densitometric quantification, or more recently coupled with laser densitometry 8,9 ; drop-shape based quantification 10 ; (iv) liquid chromatography/ESI-MS 11 ; (v) size-exclusion chromatography coupled with multi-angle laser light scattering 12,13 and analytical ultracentrifugation 14. Although useful, these methods are laborious, difficult to implement routinely, limited to a given type of detergent or inapplicable to detergent mixtures. Moreover, hundreds of detergents are now commercially available, rendering these methods generally impractical.

Published
2017

2. Innovative Tools for the Structural and Functional Investigation of a Multidrug Efflux Pump from Pseudomonas Aeruginosa

Author

Philippe Minard, Manuela Dezi, Jean-Luc Popot, Martin Picard, Ange Polidori, Alice Verchère, Isabelle Broutin, Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe Chimie Bioorganique et Systèmes Amphiphiles, Avignon Université (AU), Physico-chimie moléculaire des membranes biologiques (PCMMB), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques ( LCRB - UMR 8015 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Physico-chimie moléculaire des membranes biologiques ( PCMMB ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), and Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
biology, Chemistry, Chemiosmosis, Biophysics, Bacteriorhodopsin, Periplasmic space, [ CHIM ] Chemical Sciences, Membrane, Membrane protein, Biochemistry, biology.protein, [CHIM]Chemical Sciences, Efflux, Electrochemical gradient, Bacterial outer membrane, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

Efflux pumps are macromolecular assemblies that allow for proton-driven transport across both membranes in Gram-negative bacteria. In Pseudomonas aeruginosa, transport is made possible by the reversible assembly of a tripartite protein complex consisting of MexB, a membrane protein responsible for the active transport (energized by the proton motive force), MexA, a periplasmic protein whose putative role is to stabilize the whole complex and OprM an exit channel composed of a s-barrel inserted in the outer membrane and of a bundle of α-helices running along the periplasmic space.Such complexes are involved in the resistance against antibiotics, a field where new tools are needed for a better understanding of substrate transport. We have decided to investigate these pumps on two front lines.First, we have set up methodological developments for the design and production of a new set of synthetic scaffolds (dubbed α-reps for “artificial alpha repeat protein”) as membrane protein stabilizers and crystallization ortheses. Such interactants are selected through in vitro screening of the membrane proteins targets. We make use of amphipathic polymers (amphipols) to stabilize and immobilize the proteins onto solid support so that the library of possible interactants can be screened.As a complementary approach, we are working on the functional reconstitution of the pumps into proteoliposomes. Very recently we have designed a functional test for MexB. This original activity assay uses bacteriorhodopsin (BR), a light-activated proton pump, to generate a tunable, robust and reversible proton gradient. In this system, upon illumination with visible light, the photo-induced proton gradient created by the BR is shown to be coupled to the active transport of substrates through the pump. We are now working on the reconstitution of the whole efflux pump.

Published
2013

3. Cell uptake of a biosensor detected by hyperpolarized 129Xe NMR: The transferrin case

Author

Nadège Jamin, Thierry Brotin, Nawal Tassali, Patrick Berthault, Céline Boutin, Yves Boulard, Gaspard Huber, Fatimazohra Lenda, Marie Carrière, Aurore Bogaert-Buchmann, Alain Sanson, Jean-Pierre Dutasta, François Leteurtre, Antoine Stopin, Hervé Desvaux, Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Laboratoire de Chimie - UMR5182 (LC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CNR-ISTEC, National Research Council of Italy, Service de Biologie Intégrative et Génétique Moléculaire (SBIGeM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique des systèmes biologiques (CRMSB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Service de Chimie Inorganique et Biologique (SCIB - UMR E3), Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), National Research Council of Italy | Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Rayonnement Matière de Saclay ( IRAMIS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Laboratoire de Chimie - UMR5182 ( LC ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] ( IBMM ), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier ( ENSCM ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Biologie Intégrative et Génétique Moléculaire ( SBIGeM ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Résonance magnétique des systèmes biologiques ( RMSB ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Chimie Inorganique et Biologique ( SCIB - UMR E3 ), Institut Nanosciences et Cryogénie ( INAC ), and Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )

Subjects
Magnetic Resonance Spectroscopy, Clinical Biochemistry, Pharmaceutical Science, Transferrin receptor, Biosensing Techniques, macromolecular substances, 010402 general chemistry, Endocytosis, 01 natural sciences, Biochemistry, Cryptophane, Cell membrane, Cell Line, Tumor, Drug Discovery, Fluorescence microscope, medicine, Humans, Hyperpolarization (physics), Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, 010405 organic chemistry, Organic Chemistry, Transferrin, 0104 chemical sciences, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, medicine.anatomical_structure, chemistry, [ CHIM.THEO ] Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Biophysics, Xenon Isotopes, Molecular Medicine, Biosensor, Protein Binding
Abstract

International audience; For detection of biological events in vitro, sensors using hyperpolarized 129Xe NMR can become a powerful tool, provided the approach can bridge the gap in sensitivity. Here we propose constructs based on the non-selective grafting of cryptophane precursors on holo-transferrin. This biological system was chosen because there are many receptors on the cell surface, and endocytosis further increases this density. The study of these biosensors with K562 cell suspensions via fluorescence microscopy and 129Xe NMR indicates a strong interaction, as well as interesting features such as the capacity of xenon to enter the cryptophane even when the biosensor is endocytosed, while keeping a high level of polarization. Despite a lack of specificity for transferrin receptors, undoubtedly due to the hydrophobic character of the cryptophane moiety that attracts the biosensor into the cell membrane, these biosensors allow the first in-cell probing of biological events using hyperpolarized xenon.

Published
2011

4. Le silicium nanocristallin: un candidat possible comme agent d'imagerie

Author

Maurice, V., Sublemontier, O., Herlin, N., Eric Doris, Raccurt, O., Jamin, N., Sanson, A., Laboratoire Francis PERRIN (LFP - URA 2453), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Biophysique des Fonctions Membranaires, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Département des Technologies des NanoMatériaux (DTNM), Laboratoire d'Innovation pour les Technologies des Energies Nouvelles et les nanomatériaux (LITEN), Institut National de L'Energie Solaire (INES), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de L'Energie Solaire (INES), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Francis PERRIN ( LFP - URA 2453 ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Département des Technologies des NanoMatériaux ( DTNM ), Laboratoire d'Innovation pour les Technologies des Energies Nouvelles et les nanomatériaux ( LITEN ), Institut National de L'Energie Solaire ( INES ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre Scientifique et Technique du Bâtiment ( CSTB ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre Scientifique et Technique du Bâtiment ( CSTB ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de L'Energie Solaire ( INES ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre Scientifique et Technique du Bâtiment ( CSTB ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre Scientifique et Technique du Bâtiment ( CSTB ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Lebe, Caroline, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de L'Energie Solaire (INES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [CHIM.THEO] Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [ CHIM.THEO ] Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry
Published
2010

5. Delineation of the Xrcc4-interacting Region in the Globular Head Domain of Cernunnos/XLF

Author

Patrick Revy, Raphael Guerois, Guilhem Faure, Isabelle Callebaut, Virginie Ropars, Pascal Drevet, Laurent Malivert, Jean-Pierre de Villartay, Jean-Baptiste Charbonnier, Jean-Paul Mornon, Marcela Nunez, Simona Miron, Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie Structurale et Radiobiologie (LBSR), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), the Integrative Imaging Unit, INSERM 759, Institut Curie, Institut Curie, Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Référence des Maladies Héréditaires du Métabolisme de l'Enfant et de l'Adulte [CHU Necker] (MaMEA Necker), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Integrative Imaging Unit-INSERM 759, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut Curie [Paris], Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biologie Structurale et Radiobiologie ( LBSR ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), INSTITUT CURIE, Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés ( IMPMC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 )

Subjects
Protein Folding, Protein Structure, Ku80, DNA Repair, DNA repair, Protein Conformation, Protein domain, Biology, LIG4, Crystallography, X-Ray, XLF, Biochemistry, DNA-binding protein, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Protein structure, Protein Domains, Humans, Computer Simulation, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Amino Acids, Molecular Biology, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, NHEJ, 030304 developmental biology, Genetics, 0303 health sciences, Cernunnos, Binding Sites, 030302 biochemistry & molecular biology, Cell Biology, Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, Protein Structure, Tertiary, DNA-Binding Proteins, DNA Repair Enzymes, chemistry, Protein Structure and Folding, Mutagenesis, Site-Directed, DNA, Protein Binding
Abstract

International audience; In mammals, the majority of DNA double-strand breaks are processed by the Non Homologous End-Joining pathway (NHEJ), composed of seven factors: Ku70, Ku80, DNA-PKcs, Artemis, Xrcc4 (X4), DNA Ligase IV (L4) and Cernunnos/XLF. Cernunnos is part of the ligation complex, constituted by X4 and L4. In order to improve our knowledge on the structure and function of Cernunnos, we performed a systematic mutagenesis study on positions selected from an analysis of the recent 3D structures of this factor. Ten out of 27 screened mutants were non functional in several DNA repair assays. Outside amino acids critical for the expression and stability of Cernunnos, we identified three amino acids (Arg$^{64}$, Leu$^{65}$, and Leu$^{115}$) essential for the interaction with X4 and the proper function of Cernunnos. Docking the crystal structures of the two factors further validated this probable interaction surface of Cernunnos with X4.

Published
2010

6. iNTRAMOLECULAR LIGHT INDUCED ACTIVATION OF A SALEN MN III COMPLEX BY A RUTHENIUM PHOTOSENSITIZER

Author

Herrero , C., L Hughes , J., Quaranta , A., Cox , N., W Rutherford , A., Leibl , W., Aukauloo , A., Lentz, Celine, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[ CHIM.CATA ] Chemical Sciences/Catalysis, [CHIM.CATA] Chemical Sciences/Catalysis, [CHIM.CATA]Chemical Sciences/Catalysis
Published
2010

7. Redox Effects on the Coordination Geometry and Heme Conformation of Bis(N-methylimidazole) Complexes of Superstructured Fe-Porphyrins. A Spectroscopic Study

Author

Alain Desbois, Thierry Picaud, Michel Momenteau, Carole Le Moigne, Alain Boussac, Bernard Loock, Protéines membranaires transductrices d'énergie ( PMTE ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Conception, synthèse et vectorisation de biomolécules. ( CSVB ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -INSTITUT CURIE-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Protéines membranaires transductrices d'énergie (PMTE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Conception, synthèse et vectorisation de biomolécules. (CSVB), Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris], Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Inorganic chemistry, Heme, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Redox, Ferrous, law.invention, Inorganic Chemistry, symbols.namesake, chemistry.chemical_compound, law, [ CHIM.ORGA ] Chemical Sciences/Organic chemistry, Physical and Theoretical Chemistry, Methylene, Electron paramagnetic resonance, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Coordination geometry, Atropisomer, Methylene Chloride, Molecular Structure, 010405 organic chemistry, Chemistry, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, Electron Spin Resonance Spectroscopy, Imidazoles, Resonance (chemistry), 0104 chemical sciences, 3. Good health, Crystallography, symbols, Raman spectroscopy, Oxidation-Reduction
Abstract

Electronic absorption, electron paramagnetic resonance (EPR), and Soret-excited resonance Raman (RR) spectra are reported for bis(N-alkylimidazole) complexes of various iron(III)-"basket-handle" (Fe(III)BHP(+)) and "picket-fence" (Fe(III)PFP(+)) porphyrins in methylene chloride. The Fe(III)BHP(+) derivatives consist of four cross-trans (CT) and two adjacent-cis (AC) -linked in which the composition and the length of the handles are variable (CT Fe(III)[(C(11)Im)(2)(+)], CT and AC Fe(III)[((C(4))(2)phi)(2)](+), CT Fe(III)[((C(3))(2)phi)(C(12))](+), CT and AC Fe(III)[((C(3))(2)phi)(2)](+)). The meso-alphaalpha betabeta and meso-alphabeta alphabeta atropisomers of Fe(III)-tetrakis(o-pivalamidophenyl)-porphyrins represents the Fe(III)PFP(+) derivatives (Fe(III)alphaalpha betabeta-T(piv)PP(+) and Fe(III)alphabeta alphabeta-T(piv)PP(+), respectively). The absorption and RR data obtained for these ferric compounds were compared to those previously published for the homologous ferrous complexes (Picaud, T., Le Moigne, C., Loock, B., Momenteau, M. and Desbois, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11616 and Le Moigne, C., Picaud, T., Boussac, A., Loock, B., Momenteau, M. and Desbois, A. Inorg. Chem. 2003, 42, 6081). The Soret band position of the eight investigated ferric compounds is observed between 417 and 424 nm, indicating that none of the complexes possesses a planar heme. The EPR spectra show that most of the Fe(III)BHP(+) complexes and all the Fe(III)PFP(+) complexes are rhombic B-type hemichromes (g(max) = 2.86-2.96). Notable exceptions concern the bis(N-methylimidazole) complexes of two CT Fe(III)BHP(+). The Fe(III)BHP(+) with the shortest handles (Fe(III)[((C(3))(2)phi)(2)](+)) exhibits a g value at 2.80. When the handles are lengthened by two methylene units (Fe(III)[((C(3))(2)phi)(2)](+)), the EPR spectrum corresponds to a mixture of two "highly anisotropic low-spin " or "large g(max)" type I EPR signals, a major species at g = 3.17 and a minor species at g = 3.77. All these EPR data were converted in terms of dihedral angle formed by the rings of the axial ligands. The RR spectra of the Fe(III)BHP(+) and Fe(III)PFP(+) complexes exhibited variable frequencies for the structure-sensitive nu(2) and nu(8) lines (1558-1563 cm(-1) and 386-401 cm(-1), respectively). In considering the ability of the different superstructures to stabilize particular out-of-plane distortions, this vibrational information was analyzed in terms of heme structure through changes in core size and Fe-N(pyrrole) bond length, in relation to changes in coordination geometry. The bis(N-methylimidazole) complex of Fe(III)[((C(3))(2)phi)(2)](+) was found to be the most distorted with a strongly ruffled tetrapyrrole. Because of a handle asymmetry, the heme conformation of the bis(N-methylimidazole) complex of Fe(III)[((C(3))(2)phi)(C(12))](+) was deduced to be a composition of ruffled and domed structures. The heme structure of the other complexes is a mixture of ruffled and saddled or ruffled and waved conformations. Taking into account our previous data on the ferrous series, this investigation provides information about the reorganization of the heme structure upon iron oxidation. The general trend is a decrease of either the core-size, or the Fe-N(pyrrole) bond length, or both. However, we demonstrated that the heme superstructures precisely control the nature and the extent of the tetrapyrrole reshaping. These results point out similar possible effect in the heme proteins, considering both an analogy between porphyrin superstructures and amino acids forming the heme sites and the diversity of the heme environments in the proteins.

Published
2009

8. Direct and indirect CeO2 nanoparticles toxicity for Escherichia coli and Synechocystis

Author

Zeyons, Ophélie, Thill, Antoine, Chauvat, Franck, Menguy, N., Cassier-Chauvat, Corinne, Oréar, Cédric, Daraspe, Jean, Auffan, Melanie, Rose, Jérôme, Spalla, Olivier, Laboratoire Interdisciplinaire sur l'Organisation Nanométrique et Supramoléculaire (LIONS), Nanosciences et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie (ex SIS2M) (NIMBE UMR 3685), Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Biologie Intégrative et Génétique Moléculaire (SBIGeM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Trafic Membranaire (LTM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Interdisciplinaire sur l'Organisation Nanométrique et Supramoléculaire ( LIONS ), Nanosciences et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie (ex SIS2M) ( NIMBE UMR 3685 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut Rayonnement Matière de Saclay ( IRAMIS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut Rayonnement Matière de Saclay ( IRAMIS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Service de Biologie Intégrative et Génétique Moléculaire ( SBIGeM ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés ( IMPMC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Trafic Membranaire ( LTM ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Centre européen de recherche et d'enseignement de géosciences de l'environnement ( CEREGE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Collège de France ( CdF ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Thomas, Danielle

Subjects
adsorption isotherm, microscopy, electrophoretic mobility, Nanoparticles, toxicity, cerium oxide, Extracellular Polymeric Substances (EPS), survival tests
Abstract

International audience; Physico-chemical interactions between nanoparticles and cell membranes play a crucial role in determining the cytotoxicity of nanoparticles, which may thereby vary depending on the nature of the target microorganisms. We investigated the responses of two different models of unicellular bacteria to cerium oxide (CeO2) nanoparticles. These organisms are: Synechocystis PCC6803 a representative of environmentally important cyanobacterial organisms (producer of biomass for aquatic food chains), and Escherichia coli a representative of intestine-colonizing bacteria. Coupling physico-chemical (adsorption isotherms and electrophoretic mobility), biological (survival tests), microscopical (SEM, TEM and EDS) and spectroscopic (XANES) methods, we enlightened two distinct mechanisms for the CeO2 nanoparticles toxicological impact: A 'direct' mechanism that requires a close contact between nanoparticles and cell membranes, and an 'indirect' influence elicited by the acidity of nanoparticles stabilizing agents. We showed that E. coli is sensitive to the 'direct' effects of nanoparticles, whereas Synechocystis being protected by extracellular polymeric substances preventing direct cellular contacts is sensitive only to the 'indirect' mechanism. Consequently, our findings demonstrate the importance of the 'direct/indirect' effects of nanoparticles on cell fitness, a phenomenon that should be systematically investigated with appropriate techniques and dose metrics to make meaningful environmental and/or health recommendations.

Published
2009

9. Molecular origin of the self-assembly of lanreotide into nanotubes : a mutational approach

Author

Maïté Paternostre, Jean-Marc Verbavatz, Franck Artzner, Anjali Pandit, Laurent Bordes, Céline Valéry, Isabelle Boisdé, Roland Cherif-Cheikh, Emilie Pouget, Groupe matière condensée et matériaux ( GMCM ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie et de Technologies de Saclay ( IBITECS ), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut des Sciences Chimiques de Rennes ( ISCR ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Groupe matière condensée et matériaux (GMCM), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie et de Technologies de Saclay (IBITECS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lentz, Celine, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)

Subjects
Halobacterium salinarum, Nanotubes, Peptide, Nanotube, Amyloid, [ SDV.BBM.BP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Stereochemistry, Protein Conformation, Dispersity, Molecular Sequence Data, Biophysics, Supramolecular Assemblies, [SDV.BBM.BP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Peptide, 02 engineering and technology, Lanreotide, Spectrum Analysis, Raman, Peptides, Cyclic, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Residue (chemistry), Amino Acids, Aromatic, Spectroscopy, Fourier Transform Infrared, Side chain, Molecule, Amino Acid Sequence, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Microscopy, Binding Sites, Lysine, Water, 021001 nanoscience & nanotechnology, Solutions, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Directed mutagenesis, chemistry, Mutation, 0210 nano-technology, Somatostatin, Hydrophobic and Hydrophilic Interactions
Abstract

Lanreotide, a synthetic, therapeutic octapeptide analog of somatostatin, self-assembles in water into perfectly hollow and monodisperse (24-nm wide) nanotubes. Lanreotide is a cyclic octapeptide that contains three aromatic residues. The molecular packing of the peptide in the walls of a nanotube has recently been characterized, indicating four hierarchical levels of organization. This is a fascinating example of spontaneous self-organization, very similar to the formation of the gas vesicle walls of Halobacterium halobium. However, this unique peptide self-assembly raises important questions about its molecular origin. We adopted a directed mutation approach to determine the molecular parameters driving the formation of such a remarkable peptide architecture. We have modified the conformation by opening the cycle and by changing the conformation of a Lys residue, and we have also mutated the aromatic side chains of the peptide. We show that three parameters are essential for the formation of lanreotide nanotubes: i), the specificity of two of the three aromatic side chains, ii), the spatial arrangement of the hydrophilic and hydrophobic residues, and iii), the aromatic side chain in the β-turn of the molecule. When these molecular characteristics are modified, either the peptides lose their self-assembling capability or they form less-ordered architectures, such as amyloid fibers and curved lamellae. Thus we have determined key elements of the molecular origins of lanreotide nanotube formation.

Published
2008

10. Fine tuning of the spectral properties of LH2 by single amino acid residues

Author

Adela Garcia-Martin, Bruno Robert, Brigitte Strohmann, Paula Braun, Günther Gabriel, Martina V. Silber, Lentz, Celine, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Protein Denaturation, [ SDV.BBM.BP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Protein Conformation, Stereochemistry, 030303 biophysics, Light-Harvesting Protein Complexes, [SDV.BBM.BP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Rhodobacter sphaeroides, macromolecular substances, Plant Science, Biochemistry, Serine, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Residue (chemistry), Bacterial Proteins, Asparagine, Amino Acids, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, biology, Chemistry, Cell Biology, General Medicine, biology.organism_classification, Amino acid, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Glutamine, Mutation, Mutagenesis, Site-Directed, Bacteriochlorophyll, Isoleucine
Abstract

The peripheral light-harvesting complex, LH2, of Rhodobacter sphaeroides consists of an assembly of membrane-spanning alpha and beta polypeptides which assemble the photoactive bacteriochlorophyll and carotenoid molecules. In this study we systematically investigated bacteriochlorophyll-protein interactions and their effect on functional bacteriochlorophyll assembly by site-directed mutations of the LH2 alpha-subunit. The amino acid residues, isoleucine at position -1 and serine at position -4 were replaced by 12 and 13 other residues, respectively. All residues replacing isoleucine at position -1 supported the functional assembly of LH2. The replacement of isoleucine by glycine, glutamine or asparagine, however, produced LH2 complex with significantly altered spectral properties in comparison to LH2 WT. As indicated by resonance Raman spectroscopy extensive rearrangement of the bacteriochlorophyll-B850 macrocycle(s) took place in LH2 in which isoleucine -1 was replaced by glycine. The replacement results in disruption of the H-bond between the C3 acetyl groups and the aromatic residues +13/+14 without affecting the H-bond involving the C13(1) keto group. In contrast, nearly all amino acid replacements of serine at position -4 resulted in shifting of the bacteriochlorophyll-B850 red most absorption maximum. Interestingly, the extent of shifting closely correlated with the volume of the residue at position -4. These results illustrate that fine tuning of the spectral properties of the bacteriochlorophyll-B850 molecules depend on their packing with single amino acid residues at distinct positions.

Published
2008

11. A photoactive carotenoid protein acting as light intensity sensor

Author

Bruno Robert, Rienk van Grondelle, Cheryl A. Kerfeld, Andrew Gall, Diana Kirilovsky, John T. M. Kennis, Claire Punginelli, Adjélé Wilson, Jean-Marc Routaboul, Maxime T. A. Alexandre, Cosimo Bonetti, Lentz, Celine, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Biologie et Technologies de Saclay, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Physics and Astronomy [Amsterdam], Vrije Universiteit Amsterdam [Amsterdam] (VU), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, United States Department of Energy, Joint Genome Institute (JGI), Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Biophysics Photosynthesis/Energy, Protéines membranaires transductrices d'énergie ( PMTE ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Institut de Biologie et de Technologies de Saclay ( IBITECS ), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), University of California (UC), Protéines membranaires transductrices d'énergie (PMTE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Institut de Biologie et de Technologies de Saclay (IBITECS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0106 biological sciences, Cyanobacteria, Models, Molecular, [ SDV.BBM.BP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Light, Photochemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Color, [SDV.BBM.BP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, cyanobactérie, Biology, Photosynthesis, 01 natural sciences, cyanobacteria, 03 medical and health sciences, Bacterial Proteins, photosynthèse, Carotenoid, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Orange carotenoid protein, Synechocystis, organisme, Chromophore, Biological Sciences, biology.organism_classification, Carotenoids, phycobilisome, intensité lumineuse, Protein Structure, Tertiary, nonphotochemical quenching, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Light intensity, photoprotection, chemistry, Photoprotection, Phycobilisome, 010606 plant biology & botany
Abstract

Intense sunlight is dangerous for photosynthetic organisms. Cyanobacteria, like plants, protect themselves from light-induced stress by dissipating excess absorbed energy as heat. Recently, it was discovered that a soluble orange carotenoid protein, the OCP, is essential for this photoprotective mechanism. Here we show that the OCP is also a member of the family of photoactive proteins; it is a unique example of a photoactive protein containing a carotenoid as the photoresponsive chromophore. Upon illumination with blue-green light, the OCP undergoes a reversible transformation from its dark stable orange form to a red "active" form. The red form is essential for the induction of the photoprotective mechanism. The illumination induces structural changes affecting both the carotenoid and the protein. Thus, the OCP is a photoactive protein that senses light intensity and triggers photoprotection. © 2008 by The National Academy of Sciences of the USA.

Published
2008

12. Metabolism of Phenylahistin Enantiomers by Cytochromes P450 : a possible Explanation for their Different Cytotoxicity

Author

Caroline Aninat, Véronique Hamon, Yoshio Hayashi, Catherine Abadie, Marcel Delaforge, François André, Lionel Perrin, Bruno Heyd, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lentz, Celine, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), and Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 )

Subjects
Stereochemistry, [CHIM.THER] Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Pharmaceutical Science, Stereoisomerism, Diketopiperazines, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, [ CHIM.CHEM ] Chemical Sciences/Cheminformatics, Piperazines, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Catalytic Domain, [CHIM.CHEM] Chemical Sciences/Cheminformatics, Cytochrome P-450 CYP3A, Humans, Cytotoxicity, 030304 developmental biology, Pharmacology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, CYP3A4, biology, Cytochrome P450, [ CHIM.THER ] Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Metabolism, Isoenzymes, Enzyme, Biochemistry, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, Microsomes, Liver, Microsome, biology.protein, Enantiomer, [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics
Abstract

Phenylahistin is a fungal diketopiperazine derived from isoprenylated (Phe-DeltaHis) cyclodipeptide. The (-)-enantiomer is a cell cycle inhibitor, which can be potentially used as an antitumor agent. By contrast, the (+)-enantiomer exhibits no antimicrotubule activity. To better understand the differences that could arise from a difference of bioavailability, we investigated the interaction and metabolism of both enantiomers with mammalian cytochromes P450 (P450s). We found that both enantiomers were metabolized by various isoforms of mammal P450 with a noticeable activity for the (+)-enantiomer. P450 3A isoforms were mainly responsible for this metabolism, the bioactive (-)-enantiomer being 1.5 to 8 times less metabolized than the (+)-enantiomer. Spectral analysis of the interaction with P450s revealed that (-)-phenylahistin led to a hydrophobic type I signature, whereas the (+)-isomer yielded a Fe-N type II one. Structural analysis of metabolites by liquid chromatography-tandem mass spectrometry allowed us to characterize two major metabolites (P1 and P3) for both enantiomers. In human liver microsomal preparations, P1 was predominant in the (-)-phenylahistin metabolic profile. In contrast, (+)-phenylahistin mainly produced P3 in human microsomes and CYP3A human expressed P450s. (-)-Phenylahistin proved to be less toxic on P450-rich hepatocytes than on P450-deprived KB lines. The slower metabolism of this enantiomer could account for its higher toxicity. This is strengthened by the fact that isolated metabolites of (-)-phenylahistin showed no toxic effects toward KB lines. Finally, differences of metabolism and interaction mode between both phenylahistin enantiomers and CYP3A4 were supported by in silico molecular docking calculations.

Published
2008

13. Elimination and exchange of trifluoroacetate counter-ion from cationic peptides : a critical evaluation of different approaches

Author

Jean-Christophe Cintrat, Elisabeth Zékri, Stéphane Roux, Maïté Paternostre, Bernard Rousseau, Nicolas Fay, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Lentz, Celine

Subjects
[ SDV.BBM.BP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, [SDV.BBM.BP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Infrared spectroscopy, Peptide, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Biochemistry, 03 medical and health sciences, Acetic acid, chemistry.chemical_compound, Deprotonation, Structural Biology, Cations, Drug Discovery, Trifluoroacetic acid, Organic chemistry, Trifluoroacetic Acid, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Pharmacology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Ion exchange, Organic Chemistry, Cationic polymerization, General Medicine, Iontophoresis, Combinatorial chemistry, 0104 chemical sciences, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, chemistry, Molecular Medicine, Counterion, Peptides
Abstract

Most synthesized peptides are nowadays produced using solid-phase procedures. Due to cleavage and purification conditions, they are mainly obtained in the presence of trifluoroacetic acid (TFA) and, for cationic peptides, as trifluoroacetate (TF-acetate) salts. However, TF-acetate interferes with physicochemical characterizations using infrared spectroscopy and might significantly affect the in vivo studies. Thus, TF-acetate exchange by another counter-ion is often required. Up to now, the classical procedure has consisted of freeze-drying the peptide several times in the presence of an excess of a stronger acid than TFA (pKa approximately 0): generally HCl (pKa = - 7). This approach means that working at pH < 1 can induce peptide degradation. We therefore tested three different approaches to exchange the tightly bound TF-acetate counter-ion from the dicationic octapeptide lanreotide: (i) reverse-phase HPLC, (ii) ion-exchange resin, and (iii) deprotonation/reprotonation cycle of the amino groups. The first two approaches allow the partial to almost complete exchange of the TF-acetate counter-ion by another ion from an acid weaker than TFA, such as acetic acid (pKa = 4.5), and the third requires a basic solution that permits the complete removal of TF-acetate counter-ion. The efficiency of these three procedures was tested and compared by using different analytical techniques such as 19F-NMR, 1H-NMR and attenuated total reflectance Fourier transformed infrared spectroscopy (ATR FT-IR). We also show that ATR-IR can be used to monitor the TFA removal. The counter-ion exchange procedures described in this study are easy to carry out, fast, harmless and reproducible. Moreover, two of them offer the very interesting possibility of exchanging the initial TF-acetate by any other counter-ion.

Published
2008

14. Secondary and tertiary strutures of the transmembrane domains of the translocator protein TSPO determined by NMR. Stabilization of the TSPO tertiary fold upon ligand binding

Author

Mariano A. Ostuni, Yves-Marie Coïc, Samuel Murail, Vassilios Papadopoulos, Jean-Claude Robert, Zhin-Xing Yao, Jean-Michel Neumann, Jean-Jacques Lacapère, Nadège Jamin, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lentz, Celine, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Circular dichroism, [SDV.BBM.BS] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Biophysics, Steroid biosynthesis, Biochemistry, Protein Structure, Secondary, 03 medical and health sciences, Mice, Structure-Activity Relationship, 0302 clinical medicine, [ SDV.BBM.BC ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], PBR, Receptors, GABA, Translocator protein, Animals, Humans, NMR and CD spectroscopy, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Protein Structure, Quaternary, Protein secondary structure, Nuclear Magnetic Resonance, Biomolecular, [SDV.BBM.BC] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Chemistry, Biological Transport, Cell Biology, Ligand (biochemistry), Drug ligand binding, Protein tertiary structure, Protein Structure, Tertiary, Transmembrane domain, Cholesterol, Membrane protein, Mitochondrial Membranes, biology.protein, Cattle, TSPO, 030217 neurology & neurosurgery, [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract

Numerous biological functions are attributed to the peripheral-type benzodiazepine receptor (PBR) recently renamed translocator protein (TSPO). The best characterized function is the translocation of cholesterol from the outer to inner mitochondrial membrane, which is a rate-determining step in steroid biosynthesis. TSPO drug ligands have been shown to stimulate pregnenolone formation by inducing TSPO-mediated translocation of cholesterol. Until recently, no direct structural data on this membrane protein was available. In a previous paper, we showed that a part of the mouse TSPO (mTSPO) C-terminal region adopts a helical conformation, the side-chain distribution of which provides a groove able to fit a cholesterol molecule. We report here on the overall structural properties of mTSPO. This study was first undertaken by dissecting the protein sequence and studying the conformation of five peptides encompassing the five putative transmembrane domains from 1 H-NMR data. The secondary structure of the recombinant protein in micelles was then studied using CD spectroscopy. In parallel, the stability of its tertiary fold was probed using 1 H– 15 N NMR. This study provides the first experimental evidence for a five-helix fold of mTSPO and shows that the helical conformation of each transmembrane domain is mainly formed through local short-range interactions. Our data show that, in micelles, mTSPO exhibits helix content close to what is expected but an unstable tertiary fold. They reveal that the binding of a drug ligand that stimulates cholesterol translocation is able to stabilize the mTSPO tertiary structure.

Published
2008

15. Ultrafast Hem-residue Bond Formation in Six-Coordinate Heme Proteins : Implications for Functional Ligand Exchange

Author

Michael C. Marden, Laurent Kiger, Christophe Lechauve, Alain Desbois, Eve de Rosny, Eric Pilet, Ursula Liebl, Marten H. Vos, Andrea Battistoni, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'optique et biosciences (LOB), École polytechnique (X)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dipartimento de Biologia, Università degli Studi di Roma Tor Vergata [Roma], Pathologie de la polymérisation des protéines. Substitut du sang et pathologie moléculaire du globule rouge, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-IFR93-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Cristallographie et Cristallogénèse des Protéines (LCCP), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vos, Marten, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), and Lentz, Celine

Subjects
MESH: Drosophila, Ligands, 01 natural sciences, Biochemistry, Dissociation (chemistry), Haemophilus ducreyi, chemistry.chemical_compound, Spinacia oleracea, MESH: Ligands, MESH: Animals, MESH: Nerve Tissue Proteins, Heme, MESH: Superoxide Dismutase, 0303 health sciences, biology, MESH: Escherichia coli, Cytochrome c, MESH: Spinacia oleracea, Superoxide Dismutase, Animals, Humans, Horses, Nerve Tissue Proteins, Oxygen, Globins, Cytochromes c, Escherichia coli, Hemeproteins, Drosophila, MESH: Cytochromes c, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Neuroglobin, MESH: Heme, MESH: Oxygen, [ SDV.BBM.BP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Hemeprotein, Stereochemistry, [SDV.BBM.BP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, MESH: Haemophilus ducreyi, 010402 general chemistry, 03 medical and health sciences, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH: Globins, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Settore BIO/10, MESH: Horses, Histidine, 030304 developmental biology, MESH: Humans, MESH: Hemeproteins, Ligand, MESH: Biochemistry, 0104 chemical sciences, chemistry, 13. Climate action, biology.protein, Cysteine
Abstract

International audience; A survey is presented of picosecond kinetics of heme-residue bond formation after photolysis of histidine, methionine, or cysteine, in a broad range of ferrous six-coordinate heme proteins. These include human neuroglobin, a bacterial heme-binding superoxide dismutase (SOD), plant cytochrome b 559, the insect nuclear receptor E75, horse heart cytochrome c and the heme domain of the bacterial sensor protein Dos. We demonstrate that the fastest and dominant phase of binding of amino acid residues to domed heme invariably takes place with a time constant in the narrow range of 5-7 ps. Remarkably, this is also the case in the heme-binding SOD, where the heme is solvent-exposed. We reason that this fast phase corresponds to barrierless formation of the heme-residue bond from a configuration close to the bound state. Only in proteins where functional ligand exchange occurs, additional slower rebinding takes place on the time scale of tens of picoseconds after residue dissociation. We propose that the presence of these slower phases reflects flexibility in the heme environment that allows external ligands (O2, CO, NO, . . .) to functionally replace the internal residue after thermal dissociation of the heme-residue bond.

Published
2008

16. Class-B GPCR activation : is ligand helix-capping the key ?

Author

Alain Couvineau, Samuel Murail, Jean-Michel Neumann, Nadège Jamin, Jean-Jacques Lacapère, Marc Laburthe, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM, U773, Biomedical Research Center Bichat Beaujon, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[ SDV.BBM.BP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Vasoactive intestinal peptide, Molecular Sequence Data, Biology, Ligands, Biochemistry, Models, Biological, Protein Structure, Secondary, Secretin, Receptors, G-Protein-Coupled, 03 medical and health sciences, [ SDV.BBM.BC ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], Animals, Humans, Amino Acid Sequence, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Structural motif, Receptor, Molecular Biology, 030304 developmental biology, G protein-coupled receptor, 0303 health sciences, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], 030302 biochemistry & molecular biology, Rational design, Ligand (biochemistry), 3. Good health, Protein Structure, Tertiary, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, Alpha helix, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, Protein Binding, [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract

The class B family of G-protein-coupled receptors (GPCRs) regulates essential physiological functions such as exocrine and endocrine secretions, feeding behaviour, metabolism, growth, and neuro- and immuno-modulations. These receptors are activated by endogenous peptide hormones including secretin, glucagon, vasoactive intestinal peptide, corticotropin-releasing factor and parathyroid hormone. We have identified a common structural motif that is encoded in all class B GPCR-ligand N-terminal sequences. We propose that this local structure, a helix N-capping motif, is formed upon receptor binding and constitutes a key element underlying class B GPCR activation. The folded backbone conformation imposed by the capping structure could serve as a template for a rational design of drugs targeting class B GPCRs in several diseases.

Published
2008

17. Self-assembly by the octapeptide lanreotide and lanreotide-based derivatives : the role of the aromatic residues

Author

Pandit, A., Fay, N., Laurent Bordes, Valéry, C., Cherif-Cheikh, R., Robert, B., Franck ARTZNER, Paternostre, M., Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe matière condensée et matériaux (GMCM), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication ( SMPSD ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Groupe matière condensée et matériaux ( GMCM ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut des Sciences Chimiques de Rennes ( ISCR ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), and Lentz, Celine

Subjects
[SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], [SDV.BBM.BS] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Published
2008

18. Pierre Chardin, un pionnier de la découverte des gènes et protéines de la superfamille Ras

Author

Alfred Wittinghofer, Jean de Gunzburg, Hélène Barelli, Ahmed Zahraoui, Françoise Moreau-Gachelin, Jacques Camonis, Bruno Goud, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Curie [Paris], Transduction du signal et oncogénèse, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), PSL Univ, Inst Curie, CNRS UMR 144, F-75005 Paris, France, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology (MPI-MP), Max-Planck-Gesellschaft, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Biologie Cellulaire et Cancer, and Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030220 oncology & carcinogenesis, General Medicine, Biology, Molecular biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 030304 developmental biology
Abstract

International audience; No abstract available

Published
2020

19. Temperature Unmasks Allosteric Propensity in a Thermophilic Malate Dehydrogenase via Dewetting and Collapse

Author

Marina Katava, Fabio Sterpone, Marco Maccarini, Michael Sztucki, Massimo Marchi, Dominique Madern, Laboratoire de biochimie théorique [Paris] (LBT (UPR_9080)), Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Institut de Biologie Physico-Chimique, Fondation Edmond de Rothschild, PSL Research University, Paris 75000 France, Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Synchroton Radiation Facility [Grenoble] (ESRF), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Systèmes Nanobiotechnologiques et Biomimétiques (TIMC-IMAG-SyNaBi), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Systèmes Nanobiotechnologiques et Biomimétiques (TIMC-SyNaBi ), Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525 (TIMC ), Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-16-CE11-0011,AlloAnc,Allostérie Ancestrale(2016)

Subjects
[PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Allosteric regulation, Working temperature, Molecular Dynamics Simulation, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Malate dehydrogenase, Cofactor, Molecular dynamics, Allosteric Regulation, Malate Dehydrogenase, 0103 physical sciences, Materials Chemistry, Active state, Dewetting, Physical and Theoretical Chemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 010304 chemical physics, biology, Chemistry, Thermophile, Temperature, 0104 chemical sciences, Surfaces, Coatings and Films, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Methanocaldococcus, Biophysics, biology.protein
Abstract

In this work, we combine experiments and molecular simulations to unveil the hidden allosteric propensity of a thermophilic malate dehydrogenase protein (MDH). We provide evidence that, at its working temperature, the nonallosteric MDH takes a compact structure because of internal dewetting and reorganizes the active state toward functional conformations similar to its homologous allosteric LDHs. Moreover, a single-point mutation confers on the MDH a cooperative behavior that mimics an allosteric LDH. Our work not only demonstrates that thermophilic MDHs use temperature as an external parameter to regulate its functionality in a similar way allosteric LDHs use substrates/cofactors binding but also shows that the scaffold of MDHs possesses an intrinsic and hidden allosteric potentiality.

Published
2020

20. Cross‐compartment metabolic coupling enables flexible photoprotective mechanisms in the diatom Phaeodactylum tricornutum

Author

Yusuke Matsuda, Maxwell A. Ware, Graham Peers, Yoshinori Tsuji, Jared T. Broddrick, Denis Jallet, Andrew E. Allen, Christopher L. Dupont, Bernhard O. Palsson, B. Greg Mitchell, Niu Du, Sarah R. Smith, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Biology [Fort Collins], Colorado State University [Fort Collins] (CSU), Infection et inflammation (2I), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Scripps Institution of Oceanography (SIO), University of California [San Diego] (UC San Diego), University of California-University of California, Department of Bioengineering, Scripps Institution of Oceanography (SIO - UC San Diego), and University of California (UC)-University of California (UC)

Subjects
0106 biological sciences, 0301 basic medicine, photorespiration, Light, analysis, Physiology, Acclimatization, Cell Respiration, flux balance, Metabolic network, Plant Science, Photosynthesis, Models, Biological, Phaeodactylum tricornutum, 01 natural sciences, Electron Transport, 03 medical and health sciences, Pyruvic Acid, energy metabolism, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Computer Simulation, Biomass, Diatoms, 2. Zero hunger, Full Paper, biology, Chemistry, Research, genome‐scale modeling, Metabolism, Compartment (chemistry), Full Papers, biology.organism_classification, diatom, Circadian Rhythm, Mitochondria, Chloroplast, genome-scale modeling, Alcohol Oxidoreductases, Metabolic pathway, 030104 developmental biology, Biophysics, Photorespiration, Metabolic Networks and Pathways, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience; Photoacclimation consists of short-and long-term strategies used by photosynthetic organisms to adapt to dynamic light environments. Observable photophysiology changes resulting from these strategies have been used in coarse-grained models to predict light-dependent growth and photosynthetic rates. However, the contribution of the broader metabolic network , relevant to species-specific strategies and fitness, is not accounted for in these simple models. We incorporated photophysiology experimental data with genome-scale modeling to characterize organism-level, light-dependent metabolic changes in the model diatom Phaeodactylum tricornutum. Oxygen evolution and photon absorption rates were combined with condition-specific biomass compositions to predict metabolic pathway usage for cells acclimated to four different light intensities. Photorespiration, an ornithine-glutamine shunt, and branched-chain amino acid metabolism were hypothesized as the primary intercompartment reductant shuttles for mediating excess light energy dissipation. Additionally, simulations suggested that carbon shunted through photorespiration is recycled back to the chloroplast as pyruvate, a mechanism distinct from known strategies in photosynthetic organisms. Our results suggest a flexible metabolic network in P. tricornutum that tunes intercompart-ment metabolism to optimize energy transport between the organelles, consuming excess energy as needed. Characterization of these intercompartment reductant shuttles broadens our understanding of energy partitioning strategies in this clade of ecologically important primary producers.

Published
2019

21. Dynamic contrast with reversibly photoswitchable fluorescent labels for imaging living cells

Author

Annie Lemarchand, Agnès Pellissier-Tanon, Ludovic Jullien, Thomas Le Saux, Agathe Espagne, Raja Chouket, Processus d'Activation Sélective par Transfert d'Energie Uni-électronique ou Radiatif (UMR 8640) (PASTEUR), Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0303 health sciences, Computer science, Nanotechnology, General Chemistry, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Fluorescence, 0104 chemical sciences, Chemistry, 03 medical and health sciences, Dynamic contrast, [CHIM]Chemical Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract

Interrogating living cells requires sensitive imaging of a large number of components in real time. The state-of-the-art of multiplexed imaging is usually limited to a few components. This review reports on the promise and the challenges of dynamic contrast to overcome this limitation., Interrogating living cells requires sensitive imaging of a large number of components in real time.

Published
2020

22. Kaposi sarcoma among people living with HIV in the French DAT'AIDS cohort between 2010 and 2015

Author

Obry-Roguet, Véronique, Duvivier, Claudine, Lions, Caroline, Huleux, Thomas, Jacomet, Christine, Ferry, Tristan, Cheret, Antoine, Allavena, Clotilde, Bani-Sadr, Firouzé, Palich, Romain, Cabié, André, Pugliese, Pascal, Delobel, Pierre, Lamaury, Isabelle, Hustache-Mathieu, Laurent, Bregigeon, Sylvie, Makinson, Alain, Rey, David, Poizot-Martin, Isabelle, Hustache‐Mathieu, Laurent, Drobacheff‐Thiébaut, C., Foltzer, A., Bouiller, K., Hustache‐ Mathieu, L., Chirouze, C., LEPILLER, Q., Bozon, F., Babre, O, Brunel, A.S., Muret, P., Laurichesse, H., Lesens, O., Vidal, M., Mrozek, N., Aumeran, C., Baud, O., Corbin, V., Letertre‐Gibert, P., Casanova, S., Prouteau, J., Fabre, I., Curlier, E., Ouissa, R., Herrmann‐Storck, C., Tressieres, B., Bonijoly, T., Receveur, M.C., Boulard, F., Daniel, C., Clavel, C., Merrien, D., Perré, P., Guimard, T., Bollangier, O., Leautez, S., Morrier, M., Laine, L., Ader, F., Becker, A., Biron, F., Boibieux, A., Cotte, L., Miailhes, P., Perpoint, T., Roux, S., Triffault‐Fillit, C., Degroodt, S., Brochier, C., Valour, F., Chidiac, C., Ménard, A., Belkhir, A.Y., Colson, P., Dhiver, C., Madrid, A., Martin‐Degioanni, M., Meddeb, L., Mokhtari, M., Motte, A., Raoux, A., Ravaux, I., Tamalet, C., Tomei, C., Tissot Dupont, H., Zaegel‐Faucher, O., Obry‐Roguet, Véronique, Laroche, H, Orticoni, M., Soavi, M.J., Geneau de Lamarlière, P, Ressiot, E, Ducassou, M.J., Jaquet, I., Galie, S., Galinier, A., Martinet, P., Landon, M., Ritleng, A.S., Ivanova, A., Debreux, C., Poizot‐Martin, I., Abel, S., Cabras, O., Cuzin, L., Guitteaud, K., Illiaquer, M., Pierre‐François, S., Osei, L., Pasquier, J., Rome, K., Sidani, E., Turmel, JM, Varache, C., Atoui, N., Bistoquet, M., Delaporte, E., Le Moing, V., Meftah, N., Merle de Boever, C., Montes, B., Montoya Ferrer, A., Tuaillon, E., Reynes, J., André, M., Boyer, L., Bouillon, MP., Delestan, M., Rabaud, C., May, T., Hoen, B., Bernaud, C., Billaud, E., Biron, C., Bonnet, B., Bouchez, S., Boutoille, D., Brunet‐Cartier, C., Deschanvres, C., Hall, N., Morineau, P., Reliquet, V., Sécher, S., Cavellec, M., Soria, A., Paredes, E., Ferre, V., André‐Garnier, E., Rodallec, A., Lefebvre, M., Grossi, O., Aubry, O., Raffi, F., Breaud, S., Ceppi, C., Chirio, D., Cua, E., Dellamonica, P., Demonchy, E., De Monte, A., Durant, J., Etienne, C., Ferrando, S., Garraffo, R., Michelangeli, C., Mondain, V., Naqvi, A., Oran, N., Perbost, I., Pillet, S., Pradier, C., Prouvost‐Keller, B., Risso, K., Rio, V., Roger, PM., Rosenthal, E., Sausse, S., Touitou, I., Wehrlen‐Pugliese, S., Zouzou, G., Hocqueloux, L., Prazuck, T., Gubavu, C., Sève, A., Maka, A., Boulard, C., Thomas, G., Lerolle, N., Landman, R., Joly, V., Ghosn, J., Rioux, C., Lariven, S., Gervais, A., Lescure, F.X., Matheron, S., Louni, F., Julia, Z., Mackoumbou‐Nkouka, C., Le Gac, S., Charpentier, C., Descamps, D., Peytavin, G., Yazdanpanah, Y., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G., Bossi, P., Cessot, G., Charlier, C., Consigny, P.H., Danion, F., Dureault, A., Goesch, J., Guery, R., Henry, B., Jidar, K., Lanternier, F., Loubet, P., Lortholary, O., Louisin, C., Lourenco, J., Parize, P., Pilmis, B., Touam, F, Valantin, M.A., Tubiana, R., Agher, R, Seang, S., Schneider, L., Blanc, C., Katlama, C., Berger, J.L., N'guyen, Y., Lambert, D., Kmiec, I., Hentzien, M., Brunet, A., Brodard, V., Bani‐Sadr, Firouze, Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat‐Delon, S., Chapplain, J.M., Bénézit, F., Dupont, M., Poinot, M., Maillard, A., Pronier, C., Lemaitre, F., Guennoun, C., Poisson‐Vanier, M., Jovelin, T., Sinteff, J.P., Arvieux, C., Botelho‐Nevers, E., Gagneux‐Brunon, A., Frésard, Anne, Ronat, V., Lucht, F., Fischer, P., Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M, Batard, ML, Bernard‐Henry, C, de Mautort, E, Fafi‐Kremer, S., Alvarez, M., Biezunski, N., Debard, A., Delpierre, C., Lansalot, P., Lelievre, L., Martin‐Blondel, G., Piffaut, M., Porte, L., Saune, K., Ajana, F., Aïssi, E., Alcaraz, I., Baclet, V., Bocket, L., Boucher, A., Choisy, P., Lafon‐Desmurs, B., Meybeck, A., Pradier, M., Robineau, O., Viget, N., Valette, M., Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Tourcoing, Département des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Gabriel-Montpied, Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Services des maladies infectieuses [CH Turcoing], Centre Hospitalier de Tourcoing, Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Alliance for International medical Action (ALIMA), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Service de Maladies Infectieuses [Nice], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire d'Ingénierie Circulation Transport (LICIT), Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Université de Lyon, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Universitaire de Besançon (CHU Besançon), Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Gabriel Montpied, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Gabriel Montpied (CHU), CHU Clermont-Ferrand, CCLIN Sud-Est – Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales Sud-Est, Montpellier Research in Management (MRM), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathologies Pulmonaires et Plasticité Cellulaire - UMR-S 1250 (P3CELL), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurobiologie, plasticité tissulaire et métabolisme énergétique (NPTME), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CECIL, Space Research Institute of the Russian Academy of Sciences (IKI), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre IRD de Montpellier (IRD), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Service de virologie [CHU Nantes], Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, Public Health Department, Hôpital de l'Archet, Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Infectious Diseases Department, Université Montpellier 1 (UM1), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Régional de recherche et de Formation à la prise en charge Clinique de Fann (CRCF), CHNU Fann, Registre EPIMAD, CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Laboratoire d'aérologie (LA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], SEV, Groupe d'Etudes et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES), Service de virologie [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), University Hospital and University Jean Monnet, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virologie et pathogenèse virale (VPV), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Département d'Hématologie Clinique [CHU Nantes] (Hôtel-Dieu), Hôtel-Dieu de Nantes-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Dermatologie et Maladies infectieuses [Pointe-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre de Gestion du Risque Infectieux Nosocomial [Pointe-à-Pitre] (CGRIN), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dat'AIDS study group: C Drobacheff-Thiébaut, A Foltzer, K Bouiller, C Chirouze, Q Lepiller, F Bozon, O Babre, A S Brunel, P Muret, H Laurichesse, O Lesens, M Vidal, N Mrozek, C Aumeran, O Baud, V Corbin, P Letertre-Gibert, S Casanova, J Prouteau, I Fabre, E Curlier, R Ouissa, C Herrmann-Storck, B Tressieres, T Bonijoly, M C Receveur, F Boulard, C Daniel, C Clavel, D Merrien, P Perré, T Guimard, O Bollangier, S Leautez, M Morrier, L Laine, F Ader, A Becker, F Biron, A Boibieux, L Cotte, P Miailhes, T Perpoint, S Roux, C Triffault-Fillit, S Degroodt, C Brochier, F Valour, C Chidiac, A Ménard, A Y Belkhir, P Colson, C Dhiver, A Madrid, M Martin-Degioanni, L Meddeb, M Mokhtari, A Motte, A Raoux, I Ravaux, C Tamalet, C Toméi, H Tissot Dupont, O Zaegel-Faucher, H Laroche, M Orticoni, M J Soavi, P Geneau de Lamarlière, E Ressiot, M J Ducassou, I Jaquet, S Galie, A Galinier, P Martinet, M Landon, A S Ritleng, A Ivanova, C Debreux, S Abel, O Cabras, L Cuzin, K Guitteaud, M Illiaquer, S Pierre-François, L Osei, J Pasquier, K Rome, E Sidani, J M Turmel, C Varache, N Atoui, M Bistoquet, E Delaporte, V Le Moing, N Meftah, C Merle de Boever, B Montes, A Montoya Ferrer, E Tuaillon, J Reynes, M André, L Boyer, M P Bouillon, M Delestan, C Rabaud, T May, B Hoen, C Bernaud, E Billaud, C Biron, B Bonnet, S Bouchez, D Boutoille, C Brunet-Cartier, C Deschanvres, N Hall, T Jovelin, P Morineau, V Reliquet, S Sécher, M Cavellec, A Soria, E Paredes, V Ferré, E André-Garnier, A Rodallec, M Lefebvre, O Grossi, O Aubry, F Raffi, S Breaud, C Ceppi, D Chirio, E Cua, P Dellamonica, E Demonchy, A De Monte, J Durant, C Etienne, S Ferrando, R Garraffo, C Michelangeli, V Mondain, A Naqvi, N Oran, I Perbost, S Pillet, C Pradier, B Prouvost-Keller, K Risso, V Rio, P M Roger, E Rosenthal, S Sausse, I Touitou, S Wehrlen-Pugliese, G Zouzou, L Hocqueloux, T Prazuck, C Gubavu, A Sève, A Maka, C Boulard, G Thomas, C Goujard, Y Quertainmont, E Teicher, N Lerolle, O Deradji, A Barrail-Tran, R Landman, V Joly, J Ghosn, C Rioux, S Lariven, A Gervais, F X Lescure, S Matheron, F Louni, Z Julia, C Mackoumbou-Nkouka, S Le Gac, C Charpentier, D Descamps, G Peytavin, Y Yazdanpanah, K Amazzough, G Benabdelmoumen, P Bossi, G Cessot, C Charlier, P H Consigny, F Danion, A Dureault, J Goesch, R Guery, B Henry, K Jidar, F Lanternier, P Loubet, O Lortholary, C Louisin, J Lourenco, P Parize, B Pilmis, F Touam, M A Valantin, R Tubiana, R Agher, S Seang, L Schneider, C Blanc, C Katlama, J L Berger, Y N'Guyen, D Lambert, I Kmiec, M Hentzien, A Brunet, V Brodard, P Tattevin, M Revest, F Souala, M Baldeyrou, S Patrat-Delon, J M Chapplain, F Benezit, M Dupont, M Poinot, A Maillard, C Pronier, F Lemaitre, C Guennoun, M Poisson-Vanier, T Jovelin, J P Sinteff, C Arvieux, E Botelho-Nevers, A Gagneux-Brunon, A Frésard, V Ronat, F Lucht, P Fischer, M Partisani, C Cheneau, M Priester, M L Batard, C Bernard-Henry, E de Mautort, S Fafi-Kremer, M Alvarez, N Biezunski, A Debard, C Delpierre, P Lansalot, L Lelièvre, G Martin-Blondel, M Piffaut, L Porte, K Saune, F Ajana, E Aïssi, I Alcaraz, V Baclet, L Bocket, A Boucher, P Choisy, B Lafon-Desmurs, A Meybeck, M Pradier, O Robineau, N Viget, M Valette., Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Institut Pasteur [Paris], Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, and Dupuis, Christine

Subjects
0301 basic medicine, Pediatrics, medicine.medical_specialty, MESH: Sarcoma, Kaposi* / epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, HIV Infections, Dermatology, Skin Infectiology, Venereology and Sexual Health, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), medicine, Humans, MESH: HIV Infections* / complications, 030212 general & internal medicine, Sarcoma, Kaposi, Retrospective Studies, Response rate (survey), MESH: Acquired Immunodeficiency Syndrome, MESH: Herpesvirus 8, Human, Acquired Immunodeficiency Syndrome, MESH: Humans, business.industry, Kaposi sarcoma, HIV, Retrospective cohort study, MESH: Retrospective Studies, MESH: HIV Infections* / drug therapy, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], medical dermatology, Regimen, Infectious Diseases, Clinical research, clinical research, Herpesvirus 8, Human, Cohort, oncology, Original Article, Sarcoma, business, Viral load, MESH: HIV Infections* / epidemiology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract

International audience; Background - Although antiretroviral therapy (ART) has reduced the risk of Kaposi sarcoma (KS), KS cases still occur in HIV-infected people. Objective - To describe all KS cases observed between 2010 and 2015 in a country with high ART coverage. Methods - Retrospective study using longitudinal data from 44 642 patients in the French Dat'AIDS multicenter cohort. Patients' characteristics were described at KS diagnosis according to ART exposure and to HIV-plasma viral load (HIV-pVL) (≤50 or >50) copies/mL. Results - Among the 209 KS cases diagnosed during the study period, 33.2% occurred in ART naïve patients, 17.3% in ART-experienced patients and 49.5% in patients on ART, of whom 23% for more than 6 months. Among these patients, 24 (11.5%) had HIV-pVL ≤50 cp/mL, and 16 (66%) were treated with a boosted-PI-based regimen. The distribution of KS localization did not differ by ART status nor by year of diagnosis. Limitations - Data on human herpesvirus 8, treatment modalities for KS and response rate were not collected. Conclusion - Half of KS cases observed in the study period occurred in patients not on ART, reflecting the persistence of late HIV diagnosis. Factors associated with KS in patients on ART with HIV-pVL ≤50 cp/mL remain to be explored.

Published
2020

23. Visible light-driven simultaneous water oxidation and quinone reduction by a nano-structured conjugated polymer without co-catalysts

Author

Ally Aukauloo, Stéphanie Mendes Marinho, Winfried Leibl, Jully Patel, Hynd Remita, Xiaojiao Yuan, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Photocatalyse et Biohydrogène (LPB), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Physique (ICP), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay, Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-10-INBS-0005,FRISBI,Infrastructure Française pour la Biologie Structurale Intégrée(2010)

Subjects
nanosheets, Photosystem II, [SDV]Life Sciences [q-bio], Plastoquinone, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, Photochemistry, chemistry, 01 natural sciences, Redox, Artificial photosynthesis, oxygen evolution, chemistry.chemical_compound, [CHIM]Chemical Sciences, Chemistry, Oxygen evolution, General Chemistry, [CHIM.CATA]Chemical Sciences/Catalysis, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, Photoelectrochemical cell, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0104 chemical sciences, Quinone, hydrogen, Water splitting, nanoparticles, 0210 nano-technology, photocatalysis
Abstract

Place: Cambridge Publisher: Royal Soc Chemistry WOS:000550969100002; In artificial photosynthesis, chemists are aiming to borrow principles from natural photosynthesis to develop photoelectrochemical cells (PEC) for water splitting. The water plastoquinone photo-oxidoreductase enzyme, also known as photosystem II, uses light to perform the four-electron, four-proton oxidation of water to dioxygen and stores reducing equivalents in reduced forms of quinones which are ultimately used in dark reactions for the synthesis of energy-rich molecules. We report a nano-structured semiconducting conjugated polymer based on poly(diphenylbutadiyne) (nano-PDPB) and its photocatalytic activities towards the water oxidation reaction under visible light irradiation when dispersed in water in the absence of any sacrificial agents or co-catalysts. Charge recovery at the nano-PDPB directly or delayed in time was exemplified by the reduction of quinone acting as a hydrogen reservoir. In the absence of quinones as electron acceptors H(2)O(2)formation was detected, stemming from the partial reduction of O-2.

Published
2020

24. Dynamic contrast for overcoming spectral interferences in fluorescence imaging

Author

T. Le Saux, Agathe Espagne, Annie Lemarchand, Ludovic Jullien, Agnès Pellissier-Tanon, Raja Chouket, Processus d'Activation Sélective par Transfert d'Energie Uni-électronique ou Radiatif (UMR 8640) (PASTEUR), Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)

Subjects
0303 health sciences, Fluorescence-lifetime imaging microscopy, Materials science, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Atomic and Molecular Physics, and Optics, 0104 chemical sciences, Electronic, Optical and Magnetic Materials, 03 medical and health sciences, Dynamic contrast, Nuclear magnetic resonance, Fluorescence microscope, [CHIM]Chemical Sciences, Electrical and Electronic Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract

International audience

Published
2020

25. Multimorbidity in Elderly Persons According to the Year of Diagnosis of Human Immunodeficiency Virus Infection: A Cross-sectional Dat’AIDS Cohort Study

Author

Demontès, Marie, Eymard Duvernay, Sabrina, Allavena, Clotilde, Jovelin, Thomas, Reynes, Jacques, Hentzien, Maxime, Ravaux, Isabelle, Delobel, Pierre, Bregigeon, Sylvie, Rey, David, Ferry, Tristan, Gagneux-Brunon, Amandine, Robineau, Olivier, Pugliese, Pascal, Duvivier, Claudine, Cabié, André, Chirouze, Catherine, Jacomet, Christine, Lamaury, Isabelle, Merrien, Dominique, Hoen, Bruno, Hocqueloux, Laurent, Cheret, Antoine, Katlama, Christine, Arvieux, Cédric, Krolak-Salmon, Pierre, Makinson, Alain, Drobacheff-Thiébaut, C, Foltzer, A, Bouiller, K, Hustache- Mathieu, L, Chirouze, C, Lepiller, Q, Bozon, F, Babre, O, Brunel, S, Muret, P, Laurichesse, H, Lesens, O, Vidal, M, Mrozek, N, Aumeran, C, Baud, O, Corbin, V, Letertre-Gibert, P, Casanova, S, Prouteau, J, Jacomet, C, Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Herrmann-Storck, C, Tressieres, B, Bonijoly, T, Receveur, C, Boulard, F, Daniel, C, Clavel, C, Merrien, D, Perré, P, Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Laine, L, Ader, F, Becker, A, Biron, F, Boibieux, A, Cotte, L, Ferry, T, Miailhes, P, Perpoint, T, Roux, S, Triffault-Fillit, C, Degroodt, S, Brochier, C, Valour, F, Chidiac, C, Ménard, A, Belkhir, Y, Colson, P, Dhiver, C, Madrid, A, Martin-Degiovani, M, Meddeb, L, Mokhtari, M, Motte, A, Raoux, A, Ravaux, I, Tamalet, C, Toméi, C, Tissot Dupont, H, Brégigeon, S, Zaegel-Faucher, O, Obry-Roguet, V, Laroche, H, Orticoni, M, Soavi, J, Geneau de Lamarlière, P, Ressiot, E, Ducassou, J, Jaquet, I, Galie, S, Galinier, A, Martinet, P, Landon, M, Ritleng, S, Ivanova, A, Debreux, C, Lions, C, Poizot-Martin, I, Abel, S, Cabras, O, Cuzin, L, Guitteaud, K, Illiaquer, M, Pierre-François, S, Osei, L, Pasquier, J, Rome, K, Sidani, E, Turmel, M, Varache, C, Cabié, A, Atoui, N, Bistoquet, M, Delaporte, E, Le Moing, V, Makinson, A, Meftah, N, Merle de Boever, C, Montes, B, Montoya Ferrer, A, Tuaillon, E, Reynes, J, André, M, Boyer, L, Bouillon, P, Delestan, M, Rabaud, C, May, T, Hoen, B, Allavena, C, Bernaud, C, Billaud, E, Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D, Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Hall, N, Jovelin, T, Morineau, P, Reliquet, V, Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A, Ferré, V, André-Garnier, E, Rodallec, A, Lefebvre, M, Grossi, O, Aubry, O, Raffi, F, Pugliese, P, Breaud, S, Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P, Demonchy, E, de Monte, A, Durant, J, Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V, Naqvi, A, Oran, N, Perbost, I, Pillet, S, Pradier, C, Prouvost-Keller, B, Risso, K, Rio, V, Roger, P, Rosenthal, E, Sausse, S, Touitou, I, Wehrlen-Pugliese, S, Zouzou, G, Hocqueloux, L, Prazuck, T, Gubavu, C, Sève, A, Maka, A, Boulard, C, Thomas, G, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E, Lerolle, N, Deradji, O, Barrail-Tran, A, Landman, R, Joly, V, Ghosn, J, Rioux, C, Lariven, S, Gervais, A, Lescure, F, Matheron, S, Louni, F, Julia, Z, Mackoumbou-Nkouka, C, Le Gac, S, Charpentier, C, Descamps, D, Peytavin, G, Yazdanpanah, Y, Amazzough, K, Avettand-Fenoël, V, Benabdelmoumen, G, Bossi, P, Cessot, G, Charlier, C, Consigny, P, Danion, F, Dureault, A, Duvivier, C, Goesch, J, Guery, R, Henry, B, Jidar, K, Lanternier, F, Loubet, P, Lortholary, O, Louisin, C, Lourenco, J, Parize, P, Pilmis, B, Touam, F, Valantin, M, Tubiana, R, Agher, R, Seang, Sophie, Schneider, L, Palich, R, Blanc, C, Katlama, C, Berger, J, N’guyen, Y, Lambert, D, Kmiec, I, Hentzien, M, Brunet, A, Brodard, V, Bani-Sadr, F, Tattevin, P, Revest, M, Souala, F, Baldeyrou, M, Patrat-Delon, S, Chapplain, J, Benezit, F, Dupont, M, Poinot, M, Maillard, A, Pronier, C, Lemaitre, F, Guennoun, C, Poisson-Vanier, M, Sinteff, J, Arvieux, C, Botelho-Nevers, E, Gagneux-Brunon, A, Frésard, A, Ronat, V, Lucht, F, Fischer, P, Partisani, M, Cheneau, C, Priester, M, Batard, L, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S, Rey, D, Alvarez, M, Biezunski, N, Debard, A, Delpierre, C, Lansalot, P, Lelièvre, L, Martin-Blondel, G, Piffaut, M, Porte, L, Saune, K, Delobel, P, Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A, Choisy, P, Huleux, T, Lafon-Desmurs, B, Meybeck, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M, Hospices Civils de Lyon (HCL), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université de Nantes (UN), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Saint-Etienne, Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing], Centre Hospitalier Tourcoing, Service de Maladies Infectieuses [Nice], Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Département des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Gabriel-Montpied, Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre Hospitalier Compiègne-Noyon, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR), Services des maladies infectieuses [CH Turcoing], Centre Hospitalier de Tourcoing, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Besançon (CHU Besançon), Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Gabriel Montpied, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), CCLIN Sud-Est – Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales Sud-Est, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales (SMIT), CHU de Treichville, Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Mécanique et Technologie (LMT), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre interrégional de référence Rhône-Alpes - Auvergne des infections ostéo-articulaires complexes, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Space Research Institute of the Russian Academy of Sciences (IKI), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), DDSIS 76, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre IRD de Montpellier (IRD), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Océan du Large et Variabilité Climatique (OLVAC), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Hôtel-Dieu de Nantes, Service de virologie [CHU Nantes], Département Etude des Réacteurs (DER), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, Public Health Department, Hôpital de l'Archet, Institut de génétique humaine (IGH), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infectious Diseases Department, Université Montpellier 1 (UM1), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Régional de recherche et de Formation à la prise en charge Clinique de Fann (CRCF), CHNU Fann, Registre EPIMAD, CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille, Sciences et Technologies, Laboratoire de Virologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], McGill University, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de Physique des Particules de Marseille (CPPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Aix Marseille Université (AMU), CHU Pontchaillou [Rennes], SEV, Groupe d'Etudes et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES), Service de virologie [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Saint-Etienne, University Hospital and University Jean Monnet, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Virologie et pathogenèse virale (VPV), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, CHU de Fort de France, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université de Montpellier (UM), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] (SMIT), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION ), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP - U1043 INSERM - UMR5282 CNRS - UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Strasbourg, Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes (GIMAP), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Centre d'investigation clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU de la Martinique [Fort de France]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], CHD Vendee (La Roche Sur Yon), Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), Institut Pasteur [Paris] (IP), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre Hospitalier Départemental - Hôpital de La Roche-sur-Yon (CHD Vendée), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Médical de l'Institut Pasteur, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes], Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire Marseille, CHU Marseille, School of Civil and Environmental Engineering [Sydney], University of New South Wales [Sydney] (UNSW), Laboratoire d'Ingénierie Circulation Transport (LICIT UMR TE ), École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Université de Lyon-Université Gustave Eiffel, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), CHU de la Martinique [Fort de France], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Clermont-Ferrand, Stratégies thérapeutiques contre l'infection VIH et les maladies virales associées [iPLesp] (THERAVIR), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)

Subjects
Male, 0301 basic medicine, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, multimorbidity, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, comorbidities, elderly, Cachexia, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Internal medicine, Diabetes mellitus, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Aged, 2. Zero hunger, Acquired Immunodeficiency Syndrome, business.industry, [SDV.MHEP.GEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Geriatry and gerontology, aging, virus diseases, HIV, medicine.disease, 030112 virology, Comorbidity, Obesity, CD4 Lymphocyte Count, 3. Good health, Cross-Sectional Studies, Infectious Diseases, Cohort, Coinfection, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Cohort study
Abstract

Background We assessed prevalence of multimorbidity (MM) according to year of human immunodeficiency virus (HIV) diagnosis in elderly people living with HIV (PLWH). Methods This was a cross-sectional study of MM in PLWH aged ≥70 years from the Dat’AIDS French multicenter cohort. MM was defined as at least 3 coexistent morbidities of high blood pressure, diabetes mellitus, osteoporosis, non-AIDS cancer, chronic renal failure, cardiovascular and cerebrovascular disease, obesity, undernutrition, or hypercholesterolemia. Logistic regression models evaluated the association between MM and calendar periods of HIV diagnosis (1983–1996, 1997–2006, and 2007–2018). The secondary analysis evaluated MM as a continuous outcome, and a sensitivity analysis excluded PLWH with nadir CD4 count Results Between January 2017 and September 2018, 2476 PLWH were included. Median age was 73 years, 75% were men, median CD4 count was 578 cells/μL, and 94% had controlled viremia. MM prevalence was 71%. HBP and hypercholesterolemia were the most prevalent comorbidities. After adjustment for age, gender, smoking status, hepatitis C and hepatitis B virus coinfection, group of exposure, nadir CD4 count, CD4:CD8 ratio, and last CD4 level, calendar period of diagnosis was not associated with MM (P = .169). MM was associated with older age, CD4/CD8 ratio Conclusions MM prevalence was high and increased with age, low CD4/CD8 ratio, and nadir CD4 count

Published
2019

26. Glycolate Induces Redox Tuning Of Photosystem II in Vivo: Study of a Photorespiration Mutant

Author

Andrea Fantuzzi, Hermann Bauwe, A. William Rutherford, Wolfram Weckwerth, Anja Krieger-Liszkay, Marine Messant, Stefan Timm, Department of Life Sciences, Imperial College London, Molecular Systems Biology, universite de Vienne, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mécanismes régulateurs chez les organismes photosynthétiques (MROP), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Photosystem II, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Bicarbonate, Arabidopsis, Plant Science, Photosynthesis, Photosystem I, Thylakoids, 01 natural sciences, Fluorescence, Electron Transport, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Spinacia oleracea, Genetics, Chlorophyll fluorescence, Singlet Oxygen, Arabidopsis Proteins, Chemistry, Photosystem II Protein Complex, food and beverages, Articles, Electron transport chain, Glycolates, Plant Leaves, Bicarbonates, 030104 developmental biology, Thylakoid, Luminescent Measurements, Mutation, Biophysics, Photorespiration, MROP, B3S, 010606 plant biology & botany
Abstract

Bicarbonate removal from the nonheme iron at the acceptor side of photosystem II (PSII) was shown recently to shift the midpoint potential of the primary quinone acceptor Q(A) to a more positive potential and lowers the yield of singlet oxygen ((1)O(2)) production. The presence of Q(A)(−) results in weaker binding of bicarbonate, suggesting a redox-based regulatory and protective mechanism where loss of bicarbonate or exchange of bicarbonate by other small carboxylic acids may protect PSII against (1)O(2) in vivo under photorespiratory conditions. Here, we compared the properties of Q(A) in the Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) photorespiration mutant deficient in peroxisomal HYDROXYPYRUVATE REDUCTASE1 (hpr1-1), which accumulates glycolate in leaves, with the wild type. Photosynthetic electron transport was affected in the mutant, and chlorophyll fluorescence showed slower electron transport between Q(A) and Q(B) in the mutant. Glycolate induced an increase in the temperature maximum of thermoluminescence emission, indicating a shift of the midpoint potential of Q(A) to a more positive value. The yield of (1)O(2) production was lowered in thylakoid membranes isolated from hpr1-1 compared with the wild type, consistent with a higher potential of Q(A)/Q(A)(−). In addition, electron donation to photosystem I was affected in hpr1-1 at higher light intensities, consistent with diminished electron transfer out of PSII. This study indicates that replacement of bicarbonate at the nonheme iron by a small carboxylate anion occurs in plants in vivo. These findings suggested that replacement of the bicarbonate on the nonheme iron by glycolate may represent a regulatory mechanism that protects PSII against photooxidative stress under low-CO(2) conditions.

Published
2018

27. 3rd ESO–ESMO international consensus guidelines for Advanced Breast Cancer (ABC 3)

Author

Cardoso, E, Costa, E, Senkus, E., Aapro, B, Andre, D., Barrios, B, Bergh, B, Bhattacharyya, B., Biganzoli, L., Cardoso, L., Carey, L., Corneliussen-James, E, Curigliano, E, Dieras, D, El Saghir, E, Eniu, E, Fallowfield, L., Fenech, E, Francis, D, Gelmon, B, Gennari, D, Harbeck, B, Hudis, B, Kaufman, B., Krop, B, Mayer, B, Meijer, D, Mertz, B, Ohno, B, Pagani, B, Papadopoulos, E., Peccatori, E, Penault-Llorca, L, Piccart, L, Pierga, D, Rugo, B, Shockney, L., Sledge, A, Swain, L, Thomssen, E, Tutt, L, Vorobiof, D., Xu, B., Norton, L., Winer, E., Cardoso, F., Costa, A., Aapro, M., Andre, F., Barrios, C., Bergh, J., Bhattacharyya, G., Cardoso, M.J., Corneliussen-James, D., Curigliano, G., Dieras, V., El Saghir, N., Eniu, A., Fenech, D., Francis, P., Gelmon, K., Gennari, A., Harbeck, N., Hudis, C., Krop, I., Mayer, M., Meijer, H., Mertz, S., Ohno, S., Pagani, O., Peccatori, F., Penault-Llorca, F., Piccart, M.J., Pierga, J.Y., Rugo, H., Sledge, G., Swain, S., Thomssen, C., Tutt, A., Jodrell Bank Centre for Astrophysics, University of Manchester [Manchester], Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Division of Medical Oncology, and European Institute of Oncology [Milan] (ESMO)

Subjects
Male, 0301 basic medicine, Oncology, Palliative care, Receptor, ErbB-2, Consensus Development Conferences as Topic, medicine.medical_treatment, Triple Negative Breast Neoplasms, 0302 clinical medicine, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Randomized Controlled Trials as Topic, Palliative Care, General Medicine, Hematology, Corrigenda, Metastatic breast cancer, Women's cancers Radboud Institute for Health Sciences [Radboudumc 17], 3. Good health, Observational Studies as Topic, Receptors, Estrogen, Geriatric oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Special Articles, Female, medicine.medical_specialty, Breast surgery, RC0280.B8, Antineoplastic Agents, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Breast Neoplasms, Male, RC0254, 03 medical and health sciences, Breast cancer, Internal medicine, medicine, Humans, Chirurgie, business.industry, Evidence-based medicine, medicine.disease, Cancérologie, Clinical trial, Editor's Choice, Oncology nursing, 030104 developmental biology, Family medicine, Surgery, business, Hématologie
Abstract

0, SCOPUS: ar.j, info:eu-repo/semantics/published

Published
2017
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28. An Emerin LEM-Domain Mutation Impairs Cell Response to Mechanical Stress

Author

Camille Samson, Ana-Andreea Arteni, Nada Essawy, Isaline Herrada, Agathe Marcelot, Sophie Moog, Sophie Zinn-Justin, Catherine Coirault, Ambre Petitalot, Anne Bigot, Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de génétique et biologie des cancers (U830), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Biologie et de Technologies de Saclay (IBITECS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Coirault, Catherine, Centre de recherche en myologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Institut de Myologie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU), Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Enveloppe Nucléaire, Télomères et Réparation de l’ADN (INTGEN), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université - Faculté de Médecine (SU FM), Thérapie des maladies du muscle strié, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre de Recherche en Myologie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), and Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], LINC complex, Mutant, Emerin, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, medicine.disease_cause, Mechanotransduction, Cellular, Article, mechano-transduction, Cell Line, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Protein Domains, medicine, Humans, Missense mutation, Inner membrane, BAF, Muscular dystrophy, lcsh:QH301-705.5, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Cytoskeleton, Actin, 030304 developmental biology, atrial cardiac defects, 0303 health sciences, Mutation, emerin, Chemistry, Intracellular Signaling Peptides and Proteins, Membrane Proteins, Nuclear Proteins, General Medicine, Fibroblasts, Lamin Type A, medicine.disease, Muscular Dystrophy, Emery-Dreifuss, Protein Structure, Tertiary, Cell biology, DNA-Binding Proteins, [SDV] Life Sciences [q-bio], cell_developmental_biology, lcsh:Biology (General), Stress, Mechanical, Dimerization, actin, 030217 neurology & neurosurgery, Protein Binding
Abstract

Emerin is a nuclear envelope protein that contributes to genome organization and cell mechanics. Through its N-terminal LAP2-emerin-MAN1 (LEM)-domain, emerin interacts with the DNA-binding protein barrier-to-autointegration (BAF). Emerin also binds to members of the linker of the nucleoskeleton and cytoskeleton (LINC) complex. Mutations in the gene encoding emerin are responsible for the majority of cases of X-linked Emery-Dreifuss muscular dystrophy (X-EDMD). Most of these mutations lead to an absence of emerin. A few missense and short deletion mutations in the disordered region of emerin are also associated with X-EDMD. More recently, missense and short deletion mutations P22L, ∆K37 and T43I were discovered in emerin LEM-domain, associated with isolated atrial cardiac defects (ACD). Here we reveal which defects, at both the molecular and cellular levels, are elicited by these LEM-domain mutations. Whereas K37 mutation impaired the correct folding of the LEM-domain, P22L and T43I had no impact on the 3D structure of emerin. Surprisingly, all three mutants bound to BAF, albeit with a weaker affinity in the case of K37. In human myofibroblasts derived from a patient&rsquo, s fibroblasts, emerin ∆K37 was correctly localized at the inner nuclear membrane, but was present at a significantly lower level, indicating that this mutant is abnormally degraded. Moreover, SUN2 was reduced, and these cells were defective in producing actin stress fibers when grown on a stiff substrate and after cyclic stretches. Altogether, our data suggest that the main effect of mutation K37 is to perturb emerin function within the LINC complex in response to mechanical stress.

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2019
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29. Integrase strand transfer inhibitors and neuropsychiatric adverse events in a large prospective cohort

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Cuzin, Lise, Pugliese, Pascal, Katlama, Christine, Bani-Sadr, Firouzé, Ferry, Tristan, Rey, David, Lourenco, Jeremy, Bregigeon, Sylvie, Allavena, Clotilde, Reynes, Jacques, Cabié, André, Drobacheff-Thiébaut, C, Foltzer, A, Bouiller, K, Hustache-Mathieu, L, Chirouze, C, Lepiller, Q, Bozon, F, Babre, O, Muret, P, Laurichesse, H, Lesens, O, Vidal, M, Mrozek, N, Aumeran, C, Baud, O, Corbin, V, Letertre, P, Casanova, S, Jacomet, C, Hoen, B, Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Schepers, K, Herrmann-Storck, C, Dournon, N, Merrien, D, Perré, P, Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Ader, F, Biron, F, Boibieux, A, Cotte, L, Ferry, T, Miailhes, P, Perpoint, T, Roux, S, Degroodt, S, Brochier, C, Valour, F, Chidiac, C, Dhiver, C, Mokhtari, M Saadia, Ménard, A, Dupont, H Tissot, Toméi, C, Meddeb, L, Belkhir, A, Ravaux, I, Brégigeon, S, Zaegel-Faucher, O, Obry-Roguet, V, Orticoni, M, Soavi, M, Luquet-Besson, I, Ressiot, E, Carta-Padovani, M, Ducassou, M, Bertone, H, Galie, S, Galinier, A, Monclar, M, Ritleng, A, Ivanova, A, Blanco-Betancourt, C, Lions, C, Poizot-Martin, I, Abel, S, Césaire, R, Cuzin, L, Santos, G Dos, Fagour, L, Illiaquer, M, Najioullah, F, Nguyen, D, Ouka, M, Pierre-François, S, Pasquier, J, Pircher, M, Rozé, B, Cabié, A, Atoui, N, Moing, V Le, Makinson, A, Meftah, N, de Boever, C Merle, Montes, B, Ferrer, a Montoya, Reynes, J, André, M, Boyer, L, Bouillon, M, Delestan, M, May, T, Allavena, C, Bernaud, C, Billaud, E, Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D, Brunet-Cartier, C, Hall, N, Jovelin, T, Morineau, P, Reliquet, V, Hue, H, Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A, Ferré, V, André-Garnier, E, Rodallec, A, Guen, L Le, Lefebvre, M, Grossi, O, Point, P, Aubry, O, Khatchatourian, L, Raffi, F, Pugliese, P, Breaud, S, Ceppi, C, Courjon, J, Cua, E, Cottalorda, J, Dellamonica, P, Demonchy, E, Monte, a De, Durant, J, Etienne, C, Ferrando, S, Fuzibet, J, Garraffo, R, Joulie, A, Risso, K, Mondain, V, Naqvi, A, Oran, N, Perbost, I, Pillet, S, Prouvost-Keller, B, Pradier, C, Wehrlen-Pugliese, S, Rio, V, Rosenthal, E, Sausse, S, Zouzou, G, Hocqueloux, L, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E, Lerolle, N, Vittecoq, D, Deradji, O, Fourreau, F, Pallier, C, Barrail-Tran, A, Landman, R, Joly, V, Rioux, C, Lariven, S, Gervais, A, Lescure, F, Matheron, S, Louni, F, Godard, C, Julia, Z, Chansombat, M, Rahli, D, Mackoumbou-Nkouka, C, Charpentier, C, Descamps, D, Peytavin, G, Yazdanpanah, Y, Consigny, P, Cessot, G, Bossi, P, Goesch, J, Gilquin, J, Benabdelmoumen, G, Lanternier, F, Charlier, C, Amazzough, K, Henry, B, Pilmis, B, Rouzaud, C, Morgand, M, Touam, F, Louisin, C, Duvivier, C, Lortholary, O, Guery, R, Danion, F, Lourenco, J, Parize, P, Etienne, N, Launay, M, Rouzioux, C, Avettand Fenoel, V, Valantin, M, Flandre, P, Caby, F, Tubiana, R, Agher, R, Seang, Sophie, Schneider, L, Palich, R, Blanc, C, Katlama, C, Berger, J, N’guyen, Y, Lambert, D, Lebrun, D, Kmiec, I, Hentzien, M, Brodard, V, Bani-Sadr, F, Botelho-Nevers, E, Gagneux-Brunon, A, Frésard, A, Lucht, F, Fischer, P, Partisani, M, Cheneau, C, Priester, M, Batard, M, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Rey, D, Alvarez, M, Biezunski, N, Debard, A, Delpierre, C, Lansalot, P, Lelièvre, L, Martin-Blondel, G, Metsu, D, Piffaut, M, Porte, L, Saune, K, Delobel, P, Ajana, F, Alcaraz, I, Baclet, V, Boucher, A, Choisy, P, Huleux, T, Lafon-Desmurs, B, Melliez, H, Meybeck, A, Pasquet, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M, Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de Maladies Infectieuses [Nice], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (CardioVir), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV), CHU Strasbourg, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, CCLIN Sud-Est – Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales Sud-Est, Montpellier Research in Management (MRM), Université Montpellier 1 (UM1)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare [Sezione di Roma 1] (INFN), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare, Service d'immuno-hématologie clinique (CISIH), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Clinique Pasteur [Toulouse], Neurobiologie, plasticité tissulaire et métabolisme énergétique (NPTME), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), DDSIS 76, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Fort de France, Virologie et pathogenèse virale (VPV), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, CHU Fort de France-CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France], Cliniques Universitaires UCL Mont-Godinne, CHU Pontchaillou [Rennes], Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Hôtel-Dieu de Nantes, Service de virologie [CHU Nantes], Chercheur indépendant, Service de chirurgie pédiatrique [Hôpital Lapeyronie-Arnaud de Villeneuve], Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, Evelina London Children's Hospital, Hôpital Bicêtre, Hôpital Bicêtre-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bicêtre], AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Neuroimagerie cognitive (LCogn), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Registre EPIMAD, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie, Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Laboratoire de Virologie [CHU Necker], Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Saint-Etienne, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], Centre Hospitalier Tourcoing, CHU de Fort de France, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université de Bordeaux (UB)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université de Montpellier (UM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service de Médecine interne, Maladies Infectieuses et Immunologie Clinique [Reims], Stratégies thérapeutiques contre l'infection VIH et les maladies virales associées [iPLesp] (THERAVIR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière]

Subjects
Male, 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Integrase inhibitor, HIV Infections, Quinolones, Piperazines, Cohort Studies, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Abacavir, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Public Health Surveillance, Pharmacology (medical), Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, Antiinfective agent, Elvitegravir, Mental Disorders, Cobicistat, Viral Load, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Dolutegravir, Female, France, Heterocyclic Compounds, 3-Ring, medicine.drug, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, Pyridones, 030106 microbiology, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Raltegravir Potassium, Internal medicine, Oxazines, medicine, Humans, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, HIV Integrase Inhibitors, Pharmacology, business.industry, [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, Raltegravir, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, CD4 Lymphocyte Count, Discontinuation, chemistry, Nervous System Diseases, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract

OBJECTIVES To analyse the frequency and causes of treatment discontinuation in patients who were treated with an integrase strand transfer inhibitor (INSTI), with a focus on neuropsychiatric adverse events (NPAEs). METHODS Patients in 18 HIV reference centres in France were prospectively included in the Dat'AIDS cohort. Data were collected from all patients starting an INSTI-containing regimen between 1 January 2006 and 31 December 2016. All causes of INSTI-containing regimen discontinuations were analysed, and patients' characteristics related to discontinuation due to NPAEs were sought. RESULTS INSTIs were prescribed to 21315 patients: 6274 received dolutegravir, 3421 received elvitegravir boosted by cobicistat, and 11620 received raltegravir. Discontinuation was observed in 12.5%, 20.2% and 50.9% of the dolutegravir-, elvitegravir- and raltegravir-treated patients, respectively (P

Published
2019

30. Conjugated Polymer Nanostructures for Photocatalysis under Visible-Light

Author

Remita, H., Yuan, X., Floresyona, F., Mendes Marinho, S., Ghosh, S., Aukauloo, A., Leibl, W., Remita, S., Goubard, F., Aubert, P.H., Laboratoire de Chimie Physique D'Orsay (LCPO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Princeton, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Indian Institute of Technology Madras (IIT Madras), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Nanosciences de Paris (INSP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physico-chimie des Polymères et des Interfaces (LPPI), Fédération INSTITUT DES MATÉRIAUX DE CERGY-PONTOISE (I-MAT), Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, and Pernot, Pascal

Subjects
[CHIM] Chemical Sciences, [CHIM]Chemical Sciences
Abstract

International audience

Published
2019

31. Conjugated Polymer Nanostructures for Photocatalysis under Visible-Light (Plenary lecture)

Author

Remita, H., Xiaojiao Yuan, X., Floresyona, D., Mendes Marinho, S., Ghosh, S., Aukauloo, A., Leibl, W., Remita, S., Fabrice Goubard, F., Aubert, P.-H., Laboratoire de Chimie Physique D'Orsay (LCPO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Indian Institute of Technology Madras (IIT Madras), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Nanosciences de Paris (INSP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physico-chimie des Polymères et des Interfaces (LPPI), Fédération INSTITUT DES MATÉRIAUX DE CERGY-PONTOISE (I-MAT), CY Cergy Paris Université (CY)-CY Cergy Paris Université (CY), and Pernot, Pascal

Subjects
[CHIM] Chemical Sciences, [CHIM]Chemical Sciences
Abstract

International audience

Published
2019

32. Biochemical Reconstitution and Characterization of Multicomponent Drug Efflux Transporters

Author

Martin Picard, Shuo Lu, Elena B. Tikhonova, Alice Verchère, Isabelle Broutin, Helen I. Zgurskaya, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), and Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0301 basic medicine, biology, Membrane transport protein, Pseudomonas aeruginosa, Chemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, Transporter, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, medicine.disease_cause, biology.organism_classification, 3. Good health, Multiple drug resistance, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, Biochemistry, biology.protein, medicine, Efflux, Cell envelope, Escherichia coli, Bacteria, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

Efflux pumps are the major determinants in bacterial multidrug resistance. In Gram-negative bacteria, efflux transporters are organized as macromolecular tripartite machineries that span the two-membrane cell envelope of the bacterium. Biochemical data on purified proteins are essential to draw a mechanistic picture of this highly dynamical, multicomponent, efflux system. We describe protocols for the reconstitution and the in vitro study of transporters belonging to RND and ABC superfamilies: the AcrAB-TolC and MacAB-TolC efflux systems from Escherichia coli and the MexAB-OprM efflux pump from Pseudomonas aeruginosa.

Published
2018

33. Importing Manganese into the Chloroplast: Many Membranes to Cross

Author

Sébastien Thomine, Anja Krieger-Liszkay, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mécanismes régulateurs chez les organismes photosynthétiques (MROP), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Approches intégratives du Transport Ionique (MINION), Département Biologie Cellulaire (BioCell), and ANR-16-CE20-0019,ISISTOR,Amélioration du contenu en fer de la graine(2016)

Subjects
0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Chloroplasts, Photosystem II, [SDV]Life Sciences [q-bio], Golgi Apparatus, chemistry.chemical_element, Plant Science, Manganese, Photosynthesis, Thylakoids, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Arabidopsis, homeostasis, BIOCELL, MINION, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Plant Proteins, photosynthesis, biology, Photosystem II Protein Complex, Biological Transport, Intracellular Membranes, biology.organism_classification, Chloroplast, arabidopsis, 030104 developmental biology, Membrane, Biochemistry, chemistry, photosystem-ii, Minion, Vacuoles, cells, MROP, protein, B3S, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience

Published
2018

34. Expansion of allogeneic NK cells with efficient antibody-dependent cell cytotoxicity against multiple tumors

Author

Sanchez, Diego, Allende-Vega, Nerea, Orecchioni, Stefania, Talarico, Giovanna, Cornillon, Amélie, Vo, Dang-Nghiem, René, Céline, Lu, Zhao-Yang, Krzywinska, Ewelina, Anel, Alberto, Galvez, Eva, Pardo, Julián, Robert, Bruno, Martineau, Pierre, Hicheri, Yosr, Bertolini, Francesco, Cartron, Guillaume, Villalba, Martin, Université de Montpellier, Ligue Nationale contre le Cancer (France), Institut National du Cancer (France), Université de Tours, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (France), Centre National de la Recherche Scientifique (France), Institut National de la Recherche Agronomique (France), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours, Institut du Cancer de Montpellier, European Commission, Région Occitanie / Pyrénées-Méditerranée, Ministerio de Economía y Competitividad (España), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Montpellier, Allende-Vega, Nerea, Orecchioni, Stefania, Talarico, Giovanna, Anel Bernal, Luis Alberto, Gálvez Buerba, Eva Mª, Martineau, Pierre, Bertolini, Francesco, Cartron, Guillaume, Villalba, Martín, Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), European Institute of Oncology [Milan] (ESMO), Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (CIML), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques (LGMR), IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Zaragoza - Universidad de Zaragoza [Zaragoza], Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'hématologie et oncologie médicale, Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Lapeyronie-Université de Montpellier (UM), Département d’Hématologie Clinique [CHRU Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), This work was supported by an AOI from the CHU Montpellier (N°221826, GC/MV), La Ligue Regionale contre le Cancer (GC), Fondation de France (0057921, MV), the PRT-K program 2018 (MV/GC/BR) and 'Investissements d’avenir' Grant LabEx MAbImprove:ANR-10-LABX-53., ANR-10-LABX-0053,MAbImprove,Optimization of therapeutic monoclonal antibodies development Better antibodies, better developed AND better used(2010), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 1 (UM1)-IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Allende-Vega, Nerea [0000-0001-5569-6461], Orecchioni, Stefania [0000-0002-6781-7002], Talarico, Giovanna [0000-0001-5051-6468], Anel Bernal, Luis Alberto [0000-0002-5175-8394], Gálvez Buerba, Eva Mª [0000-0001-6928-5516], Martineau, Pierre [0000-0002-7993-7183], Bertolini, Francesco [0000-0001-5660-3255], Cartron, Guillaume [0000-0003-0659-9635], Villalba, Martín [0000-0002-4385-4888], villalba, martin, and Laboratoires d'excellence - Optimization of therapeutic monoclonal antibodies development Better antibodies, better developed AND better used - - MAbImprove2010 - ANR-10-LABX-0053 - LABX - VALID

Subjects
antibody-dependent cell cytotoxicity (ADCC), Antibody-Dependent Cell Cytotoxicity, Antibodies, Monoclonal, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Mice, SCID, NK cells, Monoclonal antibodies (mAbs), Leukemia, Lymphocytic, Chronic, B-Cell, monoclonal antibodies (mAbs), Killer Cells, Natural, Disease Models, Animal, Antibody-dependent cell cytotoxicity (ADCC), Antineoplastic Agents, Immunological, Treatment Outcome, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Animals, Humans, Transplantation, Homologous, cancer, Immunotherapy, Cancer, Research Paper
Abstract

6 Figuras, Monoclonal antibodies (mAbs) have significantly improved the treatment of certain cancers. However, in general mAbs alone have limited therapeutic activity. One of their main mechanisms of action is to induce antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC), which is mediated by natural killer (NK) cells. Unfortunately, most cancer patients have severe immune dysfunctions affecting NK activity. This can be circumvented by the injection of allogeneic, expanded NK cells, which is safe. Nevertheless, despite their strong cytolytic potential against different tumors, clinical results have been poor. Methods: We combined allogeneic NK cells and mAbs to improve cancer treatment. We generated expanded NK cells (e-NK) with strong in vitro and in vivo ADCC responses against different tumors and using different therapeutic mAbs, namely rituximab, obinutuzumab, daratumumab, cetuximab and trastuzumab. Results: Remarkably, e-NK cells can be stored frozen and, after thawing, armed with mAbs. They mediate ADCC through degranulation-dependent and -independent mechanisms. Furthermore, they overcome certain anti-apoptotic mechanisms found in leukemic cells. Conclusion: We have established a new protocol for activation/expansion of NK cells with high ADCC activity. The use of mAbs in combination with e-NK cells could potentially improve cancer treatment., This work was supported by an AOI from the CHU Montpellier (N°221826;GC/MV), La Ligue Regionale contre le Cancer (GC), Fondation de France (0057921;MV), the PRT-K program 2018 (MV/GC/BR), the “Investissements d’avenir” Grant LabEx MAbImprove: ANR-10-LABX-53 (GC/PM/BR) and the NK 001 projet financed by the "Fonds Europeen de Developpement Regional (FEDER-FSE-IEJ 2014/2020) et par la region Occitanie Pyrénées-Méditerranée, SAF2014- 54763-C2-1-R (JP), SAF2017-83120-C2-1-R (JP) and SAF2014-54763-C2-2-R (EMG) from Spanish Ministry of Economy and Competitiveness.

Published
2018

35. Safety study and therapeutic drug monitoring of the oral tablet formulation of posaconazole in patients with haematological malignancies

Author

Lemaitre, Florian, Le Guillou, Adrien, Pugliese, Pascal, Raffi, François, Cuzin, Lise, Katlama, Christine, Allavena, Clotilde, Dramé, Moustapha, Cotte, Laurent, Bani-Sadr, Firouzé, Orticoni, M, Soavi, M, Luquet- Besson, I, Ressiot, E, Carta- Padovani, M, Ducassou, M, Bertone, H, Galie, S, Galinier, A., Monclar, M, Ritleng, A, Ivanova, A., Blanco-Betancourt, C, Lions, C., Poizot-Martin, I., Dhiver, C, Saadia Mokhtari, M, Menard, A., Tissot Dupont, H, Toméi, C, Meddeb, L., Belkhir, A., Ravaux, I., Alvarez, M., Biezunski, N, Debard, A., Delpierre, C, Lansalot, P, Lelievre, L., Martin-Blondel, G., Piffaut, M, Porte, L., Saune, K, Delobel, P., Breaud, S., Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P., Demonchy, E, De Monte, A, Durant, J., Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V., Bernaud, C, Billaud, E., Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D., Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Gaborit, B., Hall, N, Le Turnier, P., Morineau, P, Reliquet, V., Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A., Ferre, V., André-Garnier, E., Rodallec, A., Lefebvre, M, Grossi, O, Aubry, O., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G, Bossi, P, Cessot, G, Charlier, C., Consigny, P, Danion, F., Dureault, A, Duvivier, C., Goesch, J, Guery, R., Henry, B., Jidar, K, Lanternier, F., Loubet, P., Lortholary, O., Louisin, C, Lourenco, J, Parize, P., Pilmis, B., Touam, F, Valantin, M, Tubiana, R., Agher, R, Seang, S, Schneider, L, PaLich, R, Blanc, C, Cabié, André, Abel, S., Pierre-François, S, Pasquier, J., Guitteaud, K, Turmel, J, Illiaquer, M, Fischer, P., Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M, Batard, M, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S., Rey, D., Chirouze, C., Gardiennet, Q, Berger, J, N’Guyen, Y, Lambert, D., Hentzien, M., Lebrun, D., Brunet, A, Kmiec, I, Brodard, V, Chidiac, C., Ferry, T., Ader, F., Biron, F., Boibieux, A., Miailhes, P., Perpoint, T., Schlienger, I, Lippmann, J, Braun, E, Koffi, J, Longuet, C., Guéripel, V, Augustin-Normand, C, Brochier, C, Degroodt, S, Atoui, N, Le Moing, V., Makinson, A., Meftah, N., de Boever, C Merle, Montes, B, Montoya Ferrer, A, Reynes, J., Andre, M., Boyer, L, Bouillon, M, Delestan, M, May, T, Hocqueloux, L, Prazuck, T., Gubavu, C, Sève, A, Maka, A, Boulard, C., Thomas, G, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E., Lerolle, N., Deradji, O, Barrail-Tran, A, Landman, R, Joly, V, Rioux, C., Lariven, S, gervais, a, Lescure, F., Matheron, S., Louni, F, Godard, C, Julia, Z, Chansombat, M, Rahli, D, Mackoumbou-Nkouka, C, Charpentier, c, Descamps, D., Peytavin, G., Yazdanpanah, Y., Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat-Delon, S, Chapplain, J, Bénézit, F., Dupont, M., Poinot, M., MAILLARD, A, Pronier, C., Guennoun, C, Poisson-Vanier, M, Jovelin, T., Sinteff, J, Arvieux, C, Botelho-Nevers, E., Gagneux-Brunon, A., Frésard, A., Lucht, F., Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A, Choisy, P, Huleux, T., Lafon-Desmurs, B., Meybeck, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M., Hoen, B., Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Schepers, K, Herrmann-Storck, C, Dournon, N, Merrien, D, Perré, P., Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Boglione-Kerrien, C., Picard, S., Tron, C., Nimubona, S., Gangneux, J.-P., Lalanne, S., Lemaître, F., Bellissant, E., Verdier, M.-C., Petitcollin, A., Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Immunité et Infection, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), DDSIS 76, Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) (INRS ( Vandoeuvre lès Nancy)), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] (SMIT), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION ), Laboratoire de Physique et Chimie Quantique, Université Mouloud Mamerri, Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Département de Physique Nucléaire (ex SPhN) (DPHN), Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers (IRFU), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Institut des Matériaux, de Microélectronique et des Nanosciences de Provence (IM2NP), Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Etude des Réacteurs (DER), CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôtel-Dieu de Nantes, Service de virologie [CHU Nantes], Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut des Sciences du Mouvement Etienne Jules Marey (ISM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Weill Cornell Medicine [Qatar], Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], GEOMA, Université de Vigo, Universidate de Vigo, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Laboratoire d'aérologie (LA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service des Maladies Infectieuses, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France, parent, Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Faculté des Mathématiques et des Sciences de la Matière, Université Kasdi Merbah Ouargla, Laboratoire de Géochimie Isotopique Environnementale (GIS) / Université de Nîmes (GIS), Université de Nîmes (UNIMES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU UCL Namur, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et tropicales, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Université de Bordeaux (UB)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Unité des Rickettsies et pathogènes émergents (URPE), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Etienne, University Hospital and University Jean Monnet, Centre Hospitalier Tourcoing, CHU de Fort de France, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Laboratoire de Génie des Procédés et Matériaux - EA 4038 (LGPM), CentraleSupélec, Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )

Subjects
0301 basic medicine, Male, Cancer Research, Posaconazole, Antifungal Agents, [SDV]Life Sciences [q-bio], Administration, Oral, Dat’AIDS cohort, Pharmacology, 030226 pharmacology & pharmacy, Gastroenterology, 0302 clinical medicine, MESH: Drug Monitoring, Medicine, Prospective Studies, Haematological malignancies, media_common, MESH: Aged, Hematology, MESH: Middle Aged, medicine.diagnostic_test, General Medicine, Middle Aged, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, 90-90-90 target, 3. Good health, Posaconazole oral tablet, Oncology, Quartile, MESH: Young Adult, Hematologic Neoplasms, MESH: Administration, Oral, Female, Drug Monitoring, Antifungal prophylaxis, Safety, medicine.drug, Tablets, Drug, Adult, medicine.medical_specialty, media_common.quotation_subject, 030106 microbiology, Therapeutic drug monitoring, 03 medical and health sciences, Young Adult, Pharmacokinetics, Invasive fungal infections, Internal medicine, Pharmacovigilance, primary HIV infection, cascade of care, Humans, Aged, MESH: Humans, business.industry, MESH: Adult, TasP, Triazoles, MESH: Antifungal Agents, MESH: Prospective Studies, MESH: Male, MESH: Triazoles, MESH: Tablets, business, Liver function tests, MESH: Female, MESH: Hematologic Neoplasms
Abstract

International audience; PurposePosaconazole is a triazole antifungal widely used for prophylaxis of invasive fungal disease (IFI). Posaconazole tablets allow reaching higher plasma levels than the oral suspension, but safety data with this formulation in real life are scarce. This study aimed at evaluating the safety profile, the pharmacokinetic variability, and the concentration–toxicity relationship of posaconazole tablets in patients with haematological malignancies.MethodsSixty neutropenic patients treated with posaconazole tablets for prophylaxis of IFI were prospectively included in the study. Adverse drug reactions (ADR) were recorded and analyzed by the Regional Pharmacovigilance Centre to assess posaconazole implication. Blood samples were drawn once a week and plasma trough concentrations (C min) were assayed by LC–MS/MS. The rates of ADR by quartile of C min were compared.ResultsEighteen patients (30%) experienced at least one ADR attributed to posaconazole. Liver function test (LFT) abnormalities were encountered in 20% of patients and resulted in four (6.7%) treatment discontinuations. Posaconazole median (range) C min was 1.36 (< 0.1–3.44) µg/mL (inter-patient CV = 43.9%). During follow-up, 28.6% of patients had at least one concentration < 0.7 µg/mL, and 35.7% had at least one concentration > 2 µg/mL. Rates of ADR by quartile of C min were not different.ConclusionsPosaconazole was well tolerated; however, LFT abnormalities were frequent. ADR occurrence was not linked to posaconazole exposure. Because posaconazole concentrations were highly variable, TDM can be helpful to avoid underexposure to the drug and increase its efficacy in preventing IFI. Conversely, a large proportion of patients was overexposed and might have benefited of a dose reduction.

Published
2018

36. Interorganelle Communication: Peroxisomal MALATE DEHYDROGENASE 2 Connects Lipid Catabolism to Photosynthesis through Redox Coupling in Chlamydomonas

Author

Saleh Alseekh, Gilles Peltier, Alisdair R. Fernie, Bertrand Legeret, Fantao Kong, Anja Krieger-Liszkay, Fred Beisson, Adrien Burlacot, Yuanxue Liang, Yariv Brotman, Yonghua Li-Beisson, Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bioénergie et Microalgues (EBM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology (MPI-MP), Max-Planck-Gesellschaft, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-13-JSV5-0005,MUsCA,Ingénierie métabolique d'une microalgue verte en vue de la production d'alcanes à chaine moyenne(2013), ANR-11-IDEX-0001,Amidex,INITIATIVE D'EXCELLENCE AIX MARSEILLE UNIVERSITE(2011), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), and Environnement, Bioénergie, Microalgues et Plantes (EBMP)

Subjects
0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Photosystem II, Chlamydomonas reinhardtii, Plant Science, Biology, Photosynthesis, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Malate Dehydrogenase, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Research Articles, Chlamydomonas, Hydrogen Peroxide, Cell Biology, Metabolism, Carbon Dioxide, Peroxisome, biology.organism_classification, Electron transport chain, Chloroplast, [SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding, 030104 developmental biology, Biochemistry, Mutation, Oxidation-Reduction, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience; Plants and algae must tightly coordinate photosynthetic electron transport and metabolic activities given that they often face fluctuating light and nutrient conditions. The exchange of metabolites and signaling molecules between organelles is thought to be central to this regulation but evidence for this is still fragmentary. Here we show that knocking out the peroxisome-located MALATE DEHYDROGENASE 2 (MDH2) of Chlamydomonas reinhardtii results in dramatic alterations not only in peroxisomal fatty acid breakdown but also in chloroplast starch metabolism and photosynthesis. mdh2 mutants accumulated 50% more storage lipid and twofold more starch than wild type during nitrogen deprivation. In parallel, mdh2 showed increased PSII yield and photosynthetic CO 2 fixation. Metabolite analyses revealed a >60% reduction in malate, together with increased levels of NADPH and H 2 O 2 in mdh2. Similar phenotypes were found upon high light exposure. Furthermore, based on the lack of starch accumulation in a knockout mutant of the H 2 O 2-producing peroxisomal ACYL-COA OXIDASE 2 and on the effects of H 2 O 2 supplementation, we propose that peroxisome-derived H 2 O 2 acts as a regulator of chloroplast metabolism. We conclude that peroxisomal MDH2 helps photoautotrophs cope with nitrogen scarcity and high light by transmitting the redox state of the peroxisome to the chloroplast by means of malate shuttle-and H 2 O 2-based redox signaling.

Published
2018

37. Conjugated Polymer Nanostructures for Photocatalysis under Visible-Light (Key Note)

Author

Remita, H., Floresyona, D., Yuan, X., Mendes Marinho, S., Ghosh, S., Aukauloo, A., Leibl, W., Remita, S., Goubard, F., Aubert, P.H., Laboratoire de Chimie Physique D'Orsay (LCPO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Princeton, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Indian Institute of Technology Madras (IIT Madras), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Nanosciences de Paris (INSP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physico-chimie des Polymères et des Interfaces (LPPI), Fédération INSTITUT DES MATÉRIAUX DE CERGY-PONTOISE (I-MAT), Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, and Pernot, Pascal

Subjects
[CHIM] Chemical Sciences, [CHIM]Chemical Sciences
Abstract

International audience

Published
2018

38. Photoinduced electron transfer in a molecular dyad by nanosecond pump-pump-probe spectroscopy

Author

Christophe Lefumeux, Ally Aukauloo, Van-Thai Pham, Winfried Leibl, V. Maslova, Minh-Huong Ha-Thi, Annamaria Quaranta, Thomas Pino, Institut des Sciences Moléculaires d'Orsay (ISMO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Photophysique Moléculaire, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Photocatalyse et Biohydrogène (LPB), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Photonique Biomédicale (CPBM), Centre Laser Université Paris Sud, Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre Laser de l'Université Paris Sud (CLUPS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Materials science, photosensitizer, [SDV]Life Sciences [q-bio], reduction, 010402 general chemistry, Photochemistry, 7. Clean energy, 01 natural sciences, Redox, Photoinduced electron transfer, photocatalysts, Electron transfer, catalytic water oxidation, solar-energy, Molecule, Physical and Theoretical Chemistry, chemistry.chemical_classification, 010405 organic chemistry, accumulative charge separation, Electron acceptor, Chromophore, Nanosecond, 0104 chemical sciences, LPB, Photoinduced charge separation, chemistry, artificial photosynthesis, photosystem-ii, co2, B3S, complex
Abstract

International audience; The design of robust and inexpensive molecular photocatalysts for the conversion of abundant stable molecules like H2O and CO2 into an energetic carrier is one of the major fundamental questions for scientists nowadays. The outstanding challenge is to couple single photoinduced charge separation events with the sequential accumulation of redox equivalents at the catalytic unit for performing multielectronic catalytic reactions. Herein, double excitation by nanosecond pump-pump-probe experiments was used to interrogate the photoinduced charge transfer and charge accumulation on a molecular dyad composed of a porphyrin chromophore and a ruthenium-based catalyst in the presence of a reversible electron acceptor. An accumulative charge transfer state is unattainable because of rapid reverse electron transfer to the photosensitizer upon the second excitation and the low driving force of the forward photodriven electron transfer reaction. Such a method allows the fundamental understanding of the relaxation mechanism after two sequential photon absorptions, deciphering the undesired electron transfer reactions that limit the charge accumulation efficiency. This study is a step toward the improvement of synthetic strategies of molecular photocatalysts for light-induced charge accumulation and more generally, for solar energy conversion.

Published
2018

39. Lycopene crystalloids exhibit singlet exciton fission in tomatoes

Author

Mikas Vengris, Manuel J. Llansola-Portoles, Bruno Robert, Andrew A. Pascal, Alison Telfer, Simona Streckaite, Kipras Redeckas, Cristian Ilioaia, Leonas Valkunas, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Bioénergétique Membranaire et Stress (LBMS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IMSAR, and Vilnius University [Vilnius]

Subjects
0301 basic medicine, Fission, [SDV]Life Sciences [q-bio], Singlet exciton, General Physics and Astronomy, 010402 general chemistry, Photochemistry, 01 natural sciences, LBMS, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Lycopene, Solanum lycopersicum, Chromoplast, Ultrafast laser spectroscopy, Plastids, Physical and Theoretical Chemistry, Carotenoid, chemistry.chemical_classification, Crystalloid Solutions, Carotenoids, 3. Good health, 0104 chemical sciences, 030104 developmental biology, chemistry, Excited state, Singlet fission, Isotonic Solutions, B3S
Abstract

Transient absorption studies conducted on in vitro lycopene aggregates, as well as on lycopene crystalloids inside tomato chromoplasts, reveal the appearance of a long-lived excited state, which we unambiguously identified as lycopene triplet. These triplet states must be generated by singlet exciton fission, which occurs from the lycopene 2Ag state. This is the first time the singlet fission process has ever been shown to occur in a biological material. We propose that the formation of carotenoid assemblies in chromoplasts may constitute a photoprotective process during chromoplast maturation, in addition to their function in signaling processes.

Published
2018
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40. The plastid-nucleus located DNA/RNA binding protein WHIRLY1 regulates microRNA-levels during stress in barley (Hordeum vulgare L.)

Author

Aleksandra Świda-Barteczka, Goetz Hensel, Zofia Szweykowska-Kulinska, Wolfgang Bilger, Karin Krupinska, Anja Krieger-Liszkay, Ulrike Voigt, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mécanismes régulateurs chez les organismes photosynthétiques (MROP), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

Subjects
0106 biological sciences, 0301 basic medicine, retrograde signaling, Small RNA, Chloroplasts, [SDV]Life Sciences [q-bio], RNA-binding protein, Biology, Brief Communication, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Gene Expression Regulation, Plant, Stress, Physiological, microRNA, Gene Knockdown Techniques, medicine, small RNA, Molecular Biology, Plant Proteins, Cell Nucleus, Gene knockdown, RNA-Binding Proteins, food and beverages, Hordeum, Cell Biology, stress response, Plants, Genetically Modified, Cell biology, DNA-Binding Proteins, Plant Leaves, Cell nucleus, MicroRNAs, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, RNA, Plant, Seedlings, Retrograde signaling, Hordeum vulgare, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience; In this article a novel mechanism of retrograde signaling by chloroplasts during stress is described. This mechanism involves the DNA/RNA binding protein WHIRLY1 as a regulator of microRNA levels. By virtue of its dual localization in chloroplasts and the nucleus of the same cell, WHIRLY1 was proposed as an excellent candidate coordinator of chloroplast function and nuclear gene expression. Comparison of wild-type and transgenic plants with an RNAi-mediated knockdown of WHIRLY1 showed, that the transgenic plants were unable to cope with continuous high light conditions. They were impaired in production of several microRNAs mediating post-transcriptional responses during stress. The results support a central role of WHIRLY1 in retrograde signaling and also underpin a so far underestimated role of microRNAs in this process.

Published
2018

41. A tribute to Ulrich Heber (1930–2016) for his contribution to photosynthesis research: understanding the interplay between photosynthetic primary reactions, metabolism and the environment

Author

G. Heinrich Krause, Karl-Josef Dietz, Anja Krieger-Liszkay, Katharina Siebke, Universität Bielefeld = Bielefeld University, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mécanismes régulateurs chez les organismes photosynthétiques (MROP), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

Subjects
0106 biological sciences, 0301 basic medicine, History, Chlorophyll a, Chloroplasts, [SDV]Life Sciences [q-bio], Lichen, Plant Science, Xanthophylls, Photosynthesis, Chloroplast, 01 natural sciences, Biochemistry, History, 21st Century, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Chlorophyll a fluorescence, Freezing, Fluorometry, Plant Physiological Phenomena, chemistry.chemical_classification, Quenching (fluorescence), Photorespiration, Carbon metabolism, Cyclic electron transport, Light scattering, food and beverages, Plant physiology, Cell Biology, General Medicine, 15. Life on land, History, 20th Century, 21st Century, Electron transport chain, 20th Century, 030104 developmental biology, chemistry, Xanthophyll, Biophysics, 010606 plant biology & botany
Abstract

The dynamic and efficient coordination of primary photosynthetic reactions with leaf energization and metabolism under a wide range of environmental conditions is a fundamental property of plants involving processes at all functional levels. The present historical perspective covers 60 years of research aiming to understand the underlying mechanisms, linking major breakthroughs to current progress. It centers on the contributions of Ulrich Heber who had pioneered novel concepts, fundamental methods, and mechanistic understanding of photosynthesis. An important first step was the development of non-aqueous preparation of chloroplasts allowing the investigation of chloroplast metabolites ex vivo (meaning that the obtained results reflect the in vivo situation). Later on, intact chloroplasts, retaining their functional envelope membranes, were isolated in aqueous media to investigate compartmentation and exchange of metabolites between chloroplasts and external medium. These studies elucidated metabolic interaction between chloroplasts and cytoplasm during photosynthesis. Experiments with isolated intact chloroplasts clarified that oxygenation of ribulose-1.5-bisphosphate generates glycolate in photorespiration. The development of non-invasive optical methods enabled researchers identifying mechanisms that balance electron flow in the photosynthetic electron transport system avoiding its over-reduction. Recording chlorophyll a (Chl a) fluorescence allowed one to monitor, among other parameters, thermal energy dissipation by means of 'nonphotochemical quenching' of the excited state of Chl a. Furthermore, studies both in vivo and in vitro led to basic understanding of the biochemical mechanisms of freezing damage and frost tolerance of plant leaves, to SO2 tolerance of tree leaves and dehydrating lichens and mosses.

Published
2018

42. Constraints on the Ediacaran inertial interchange true polar wander hypothesis: A new paleomagnetic study in Morocco (West African Craton)

Author

S. Meslouh, O. Blein, Boris Robert, Thierry Baudin, Marianne Greff-Lefftz, M. Belbadaoui, Francisco J. P. Lopes, Jean Besse, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Chimie Moléculaire et Environnement (LCME), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-IPG PARIS-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Rabat Inst 6208 (MEMEE), Office National des Hydrocarbures & Mines (ONHYM), ONHYM, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Grenoble Alpes (UGA)

Subjects
Paleomagnetism, geography, geography.geographical_feature_category, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Lava, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Geology, Apparent polar wander, 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, Paleontology, Gondwana, Craton, 13. Climate action, Geochemistry and Petrology, Laurentia, Baltica, True polar wander, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract

We conducted a paleomagnetic study on late Ediacaran and early Cambrian volcanic deposits and lava flows from the Ouarzazate and Taroudannt groups in the Anti-Atlas, Morocco. Four stable magnetic mean directions have been isolated using thermal demagnetization technique. A first component “A” is most probably a remagnetization acquired during the Hercynian related tectonic phases, and yields a paleomagnetic pole (λ = −29.3° N, ϕ = 56.6° E, A95 = 4.1°) indistinguishable from the 330–300 Ma segment of the Gondwana apparent polar wander path (APWP). The Cambrian Djebel Boho formation of the Taroudannt group and the Ediacaran Tadoughast and Fajjoud formations of the Ouarzazate group yield two poles of similar directions respectively “B1” (λ = 21.9° N, ϕ = 31.0° E, A95 = 15.6°) and “B2” (λ = 27.3° N, ϕ = 27.1° E, A95 = 14.9°). In the Adrar-n-Takoucht formation (oldest part of the Ouarzazate group), another component is observed, yielding a paleomagnetic pole “C” (λ = −57.6° N, ϕ = 295.6° E, A95 = 15.7°). The primary nature of these last three magnetizations is supported by paleomagnetic tests and we interpreted them as magnetizations acquired during or shortly after the deposit of volcaniclastics or emplacement of lava flows. Using these new data, we reappraised the West African Craton (WAC) APWP and found two large paleomagnetic shifts of some 90°, the first one between 615 and 571 Ma and the second one between 571 and 565 Ma. A comparison with already published paleomagnetic data from Laurentia, Baltica and Gondwana, along with a discussion on their paleogeographic relationships, showed that our WAC APWP loop is likely recorded in the APWP’s of these blocks. The superimposition of these APWP’s leads to a geologically consistent paleogeography which may be explained by two rapid inertial interchange true polar wander even if we cannot exclude that magnetic field perturbations may have also occurred during the Ediacaran.

Published
2017

43. What are the predictive factors of caecal perforation in patients with obstructing distal colon cancer?

Author

François Mauvais, Brice Robert, Jean-Marc Regimbeau, N. Siembida, François Browet, Charles Sabbagh, C. Chivot, Thierry Yzet, Simplification des soins chez les patients complexes - UR UPJV 7518 (SSPC), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Chirurgie digestive [CHU Amiens], CHU Amiens-Picardie, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Bioénergétique Membranaire et Stress (LBMS), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Département de chirurgie maxillofaciale et stomatologie [CHU d'Amiens-Picardie]

Subjects
Male, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], animal diseases, medicine.medical_treatment, Perforation (oil well), Computed tomography, 030230 surgery, General status, digestive system, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Internal medicine, Laparotomy, medicine, Ascitic Fluid, Cecal Diseases, Humans, In patient, Pneumatosis Cystoides Intestinalis, Aged, Aged, 80 and over, Univariate analysis, medicine.diagnostic_test, business.industry, digestive, oral, and skin physiology, food and beverages, Cancer, Organ Size, Middle Aged, bacterial infections and mycoses, medicine.disease, ROC Curve, Intestinal Perforation, 030220 oncology & carcinogenesis, Colonic Neoplasms, Female, Distal colon, business, Tomography, X-Ray Computed, Intestinal Obstruction
Abstract

International audience; AimIn the presence of large bowel obstruction, the choice of treatment is determined by the patient's general status, the tumour characteristics and the perceived risk of caecal perforation. This study was designed to evaluate the predictive factors of impending caecal perforation, and also investigated the use of caecal volumetry. MethodFrom January 2011 to June 2016, patients with obstructive distal colon cancer undergoing emergency laparotomy, for whom a pretreatment CT scan was available, were included in this retrospective, case-control, two-centre study. Two patient groups were defined: patients with and without impending caecal perforation. The primary end-point of the study was a determination of predictive factors for caecal perforation. ResultsA total of 72 patients (45 men, 62.5%) were included. Univariate analysis revealed that the presence of pericaecal fluid (P9cm (P=0.002) and a caecal diameter at the ileocaecal junction >7.5cm (P=0.001) were associated with impending caecal perforation. In multivariate analysis, only caecal volume >400cm(3) (P=0.001) was correlated with the risk of impending caecal perforation. ConclusionCaecal volumetry is an easy and useful tool to predict impending caecal perforation in patients with large bowel obstruction.

Published
2017

44. La simulation en formation : nouveauté ou mode ?

Author

F. André, M. Galaup, S. Alava, F. Andre, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Education, Formation, Travail, Savoirs (EFTS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA), École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), and ANDRE, FREDERIC

Subjects
030506 rehabilitation, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SHS.EDU]Humanities and Social Sciences/Education, Rehabilitation, [SHS.EDU] Humanities and Social Sciences/Education, Physical Therapy, Sports Therapy and Rehabilitation, 030229 sport sciences, 0305 other medical science, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

Introduction La simulation est presente depuis un certain temps dans le domaine medical, en soins infirmiers et en soins dentaires [1] . Historiquement, les pratiques d’apprentissage simulees ont ete integrees dans la formation initiale essentiellement sous forme de jeu de roles et de pratique par les pairs [2] . La simulation couvre un grand nombre de disciplines. Parmi elles, nous retrouvons principalement l’anesthesie, la reanimation, la medecine d’urgence et les soins infirmiers, mais aussi dans une moindre mesure la physiotherapie. Materiel, population et methode La formation par la simulation est utilisee dans les pays nord americain, la Suisse et le Royaume-Uni. En France, ce mode d’apprentissage est encore peu utilise pour des raisons multiples. L’apprentissage simule a ete utilise dans les champs cardio-respiratoires et musculosquelettiques [3] , mais aussi pour diminuer le risque dans la prise en charge des patients. « Jamais la premiere fois sur le patient » est le principe fondamental pour permettre aux futurs professionnels d’avoir une experience sur des mannequins et ainsi reduire les ecarts de pratique [4] . Il est recense un nombre croissant de recherches concernant l’apprentissage par simulation dans l’enseignement de la physiotherapie au niveau international [5] . Ces recherches publiees presentent l’utilisation de patients standardises, l’environnement d’apprentissage simule, les simulateurs de patients humains [6] et les salles de formation clinique [7] . D’autres etudes ont rapporte l’utilisation de simulation procedurale specifiquement concue pour reproduire une seule tâche ou une seule habilite technique. Resultats Les environnements d’apprentissage de simulation, lorsqu’ils sont utilises de facon appropriee, peuvent fournir un contexte securitaire pour l’acquisition des competences techniques, psychomotrices, relationnelles ou communicationnelles, mais aussi de raisonnement clinique [8] necessaire pour la pratique de la physiotherapie. Cependant, bien qu’il y ait un interet croissant dans l’utilisation de cette nouvelle technologie pour l’enseignement, nous devons rappeler que la simulation reste un des moyens possibles permettant le transfert des connaissances ( Fig. 1 , Fig. 2 ). Conclusion ou discussion La simulation permet a l’apprenant de participer pleinement et etre un acteur de sa propre formation [9] . Integrer la simulation dans les programmes universitaires des kinesitherapeutes exige une comprehension de ses nombreuses utilisations et une planification minutieuse avec comme fil conducteur, l’objectif pedagogique souhaite [10] .

Published
2017

45. Evidencing 98 secondary metabolites of Penicillium verrucosum using substrate isotopic labeling and high-resolution mass spectrometry

Author

Isabelle P. Oswald, Michel Pean, Olivier Puel, Thaïs Hautbergue, Emilien L. Jamin, Souria Tadrist, Marcel Delaforge, Lauriane Meneghetti, Laurent Debrauwer, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Axiom Platform, MetaToul-MetaboHUB, National Infrastructure of Metabolomics and Fluxomics, Groupe de Recherches Appliquées en Phytotechnologie (GRAP), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Microbiologie Environnementale et Moléculaire (MEM), Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French National Infrastructureof Metabolomics and Fluxomics (MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010), ANR-15-CE21-0010,Newmyco,Metabolome de deux contaminants fongiques du blé d'importance majeure: identification de nouveaux métabolites toxiques(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Puel, Olivier, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
0301 basic medicine, penicillium verrucosum, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, mass spectrum analysis, toxicologie alimentaire, stable isotope labeling, Fungus, secondary metabolite, Secondary metabolite, Mass spectrometry, Biochemistry, Analytical Chemistry, Isotopic labeling, 03 medical and health sciences, Metabolomics, spectrométrie de masse, medicine, Penicillium verrucosum, Metabolome, Chromatography, High Pressure Liquid, mass spectrometry, molecular networking, Chromatography, biology, Chemistry, public health, fungus, Penicillium, Cell Biology, General Medicine, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, métabolite secondaire, santé publique, Isotope Labeling, secondary plant products, medicine.drug
Abstract

Industrial applications of fungal compounds, coupled with the emergence of fungal threats to natural ecosystems and public health, have increased interest in filamentous fungi. Among all pathogenic fungi, Penicillium verrucosum is one of the most common mold-infecting stored cereals in temperate regions. However, it is estimated that 80% of fungal secondary metabolites remain unknown. To detect new P. verrucosum compounds, an untargeted metabolomic approach was applied to fungus grown on wheat grains labeled with stable isotopes: (i) natural grains (99% 12C); (ii) grains enriched with 97% of 13C; and (iii) grains enriched with 53% of 13C and 97% of 15N. Analyses performed by high-performance liquid chromatography coupled with high-resolution mass spectrometry (HPLC-HRMS) enabled the specific detection of fungal metabolites, and the unambiguous characterization of their chemical formulas. In this way, 98 secondary metabolites were detected and their chemical formulas were determined. Of these, only 18 identifications could be made based on databases, the literature and mass spectrometry fragmentation experiments, with the result that 80 were totally unknown. Molecular networks were generated to analyze these results, leading to the characterization by MSn experiments of a new fungisporin produced by P. verrucosum. More generally, this article provides precise mass spectrometric data about all these compounds for further studies of the Penicillium metabolome.

Published
2017

46. Inhibitory signalling to the Arp2/3 complex steers cell migration

Author

Roman Gorelik, Laurent Blanchoin, Ivan Bièche, Susan Fetics, Goran Lakisic, Fabienne Pierre, Violaine David, Anne-Gaëlle Planson, Klemens Rottner, Valérie Campanacci, Adeline Boyreau, Jacqueline Cherfils, Anika Steffen, Isaline Herrada, Julien G. Dumortier, Nicolas B. David, Antonina Y. Alexandrova, J. Victor Small, Tamara A. Chipysheva, Sophie Vacher, Ksenia Oguievetskaia, Joern Linkner, Christophe Guérin, Irene Dang, Florence A. Giger, Emmanuel Derivery, Maria Nemethova, Carla Sousa-Blin, Jan Faix, Nadine Peyriéras, V. D. Ermilova, Alexis Gautreau, Sophie Zinn-Justin, Véronique Henriot, Laboratoire d'Enzymologie et Biochimie Structurales (LEBS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de physiologie cellulaire végétale (LPCV), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Biophysical Chemistry, Hannover Medical School [Hannover] (MHH), Institute of Molecular Biotechnology, Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Carcinogenesis, Russian Academy of Medical Sciences, Oncogenetic Laboratory, Institut Curie [Paris], Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Genetics, Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Neurobiologie et Développement (N&eD), Institut des Systèmes Complexes - Paris Ile-de-France (ISC-PIF), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École polytechnique (X)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF), Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Curie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École polytechnique (X)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris

Subjects
MESH: Signal Transduction, Embryo, Nonmammalian, Arp2/3 complex, MESH: Dictyostelium, Dictyostelium discoideum, Gene Knockout Techniques, Mice, 0302 clinical medicine, Cell Movement, MESH: Animals, MESH: Proteins, Pseudopodia, MESH: Cell Movement, Zebrafish, MESH: Gene Knockout Techniques, dynamic, 0303 health sciences, Multidisciplinary, actin polymerization, biology, Actin-Related Protein 2-3 Complex, Cell migration, leading edge, Cell biology, motility, MESH: HEK293 Cells, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Lamellipodium, Signal Transduction, Cell signaling, macromolecular substances, Cell Line, 03 medical and health sciences, Animals, Humans, endocytosis, dictyostelium, MESH: Zebrafish, MESH: Mice, Actin, 030304 developmental biology, MESH: Humans, MESH: Proto-Oncogene Proteins c-akt, Proteins, MESH: Embryo, Nonmammalian, biology.organism_classification, MESH: Cell Line, MESH: Actin-Related Protein 2-3 Complex, HEK293 Cells, filament, MESH: Pseudopodia, network, lamellipodia, biology.protein, Carrier Proteins, Proto-Oncogene Proteins c-akt, wasp scar protein, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract

International audience; Cell migration requires the generation of branched actin networks that power the protrusion of the plasma membrane in lamellipodia. The actin-related proteins 2 and 3 (Arp2/3) complex is the molecular machine that nucleates these branched actin networks. This machine is activated at the leading edge of migrating cells by Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-family verprolin-homologous protein (WAVE, also known as SCAR). The WAVE complex is itself directly activated by the small GTPase Rac, which induces lamellipodia. However, how cells regulate the directionality of migration is poorly understood. Here we identify a new protein, Arpin, that inhibits the Arp2/3 complex in vitro, and show that Rac signalling recruits and activates Arpin at the lamellipodial tip, like WAVE. Consistently, after depletion of the inhibitory Arpin, lamellipodia protrude faster and cells migrate faster. A major role of this inhibitory circuit, however, is to control directional persistence of migration. Indeed, Arpin depletion in both mammalian cells and Dictyostelium discoideum amoeba resulted in straighter trajectories, whereas Arpin microinjection in fish keratocytes, one of the most persistent systems of cell migration, induced these cells to turn. The coexistence of the Rac-Arpin-Arp2/3 inhibitory circuit with the Rac-WAVE-Arp2/3 activatory circuit can account for this conserved role of Arpin in steering cell migration.

Published
2013

47. Antimalarial screening via large-scale purification ofPlasmodium falciparumCa2+-ATPase 6 andin vitrostudies

Author

John Bondo Hansen, Anne-Marie Lund Winther, Isabelle Florent, Christine Jaxel, Paul Machillot, Marc le Maire, Morten J. Buch-Pedersen, Stéphanie David-Bosne, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Robust Speech Systems (CRSS), University of Texas at Dallas [Richardson] (UT Dallas), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Systèmes membranaires, photobiologie, stress et détoxification (SMPSD - UMR 8221), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Ca 2+ -ATPase activity, SERCA, ATPase, Blotting, Western, Plasmodium falciparum, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, Calcium-Transporting ATPases, Saccharomyces cerevisiae, antiplasmodial activity, In Vitro Techniques, Pharmacology, [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, [SDV.MP.PRO]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Protistology, Biochemistry, Sarcoplasmic Reticulum Calcium-Transporting ATPases, law.invention, Chemical library, Small Molecule Libraries, Antimalarials, chemistry.chemical_compound, law, Animals, Humans, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Malaria, Falciparum, Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, biology, Endoplasmic reticulum, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Cell Biology, biology.organism_classification, In vitro, PfATP6, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Enzyme, chemistry, biology.protein, Recombinant DNA, Rabbits, Saccharomyces cerevisiae Correspondence, recombinant protein
Abstract

International audience; The most severe form of human malaria is caused by the parasite Plasmo-dium falciparum. Despite the current need, there is no effective vaccine and parasites are becoming resistant to most of the antimalarials available. Therefore, there is an urgent need to discover new drugs from targets that have not yet suffered from drug pressure with the aim of overcoming the problem of new emerging resistance. Membrane transporters, such as P. falciparum Ca 2+-ATPase 6 (PfATP6), the P. falciparum sarcoplasmic/ endoplasmic reticulum Ca 2+-ATPase (SERCA), have been proposed as potentially good antimalarial targets. The present investigation focuses on: (a) the large-scale purification of PfATP6 for maintenance of its enzymatic activity; (b) screening for PfATP6 inhibitors from a compound library; and (c) the selection of the best inhibitors for further tests on P. falciparum growth in vitro. We managed to heterologously express in yeast and purify an active form of PfATP6 as previously described, although in larger amounts. In addition to some classical SERCA inhibitors, a chemical library of 1680 molecules was screened. From these, we selected a pool of the 20 most potent inhibitors of PfATP6, presenting half maximal inhibi-tory concentration values in the range 1-9 lM. From these, eight were chosen for evaluation of their effect on P. falciparum growth in vitro, and the best compound presented a half maximal inhibitory concentration of 2 lM. We verified the absence of an inhibitory effect of most of the compounds on mammalian SERCA1a, representing a potential advantage in terms of human toxicity. The present study describes a multidisciplinary approach allowing the selection of promising PfATP6-specific inhibitors with good antimalarial activity.

Published
2013

48. Tripartite assembly of RND multidrug efflux pumps

Author

Isabelle Broutin, Laura Monlezun, Olivier Lambert, Ravi K. R. Marreddy, Martin Picard, Alice Verchère, Klaas M. Pos, François Orange, Jean-Christophe Taveau, Laetitia Daury, Céline Gounou, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote (LBME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de chimie moléculaire et thioorganique (LCMT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU), Imagerie Moléculaire et Nanobiotechnologies - Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie et Biologie des Membranes et des Nanoobjets (CBMN), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Membrane Transport Machinerie, Goethe-University Frankfurt am Main, Ecole Nationale Vétérinaire Agroalimentaire et de l'Alimentation Nantes Atlantique (ONIRIS), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Normandie Université (NU)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Le Havre Normandie (ULH), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0301 basic medicine, Science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Lipoproteins, 030106 microbiology, General Physics and Astronomy, Article, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, Microscopy, Electron, Transmission, Drug Resistance, Multiple, Bacterial, Escherichia coli, Inner membrane, Outer membrane efflux proteins, Nanodisc, Multidisciplinary, biology, Membrane transport protein, Escherichia coli Proteins, Membrane Transport Proteins, Signal transducing adaptor protein, General Chemistry, Periplasmic space, Nanostructures, Cell biology, Native Polyacrylamide Gel Electrophoresis, Multiprotein Complexes, Pseudomonas aeruginosa, biology.protein, bacteria, Multidrug Resistance-Associated Proteins, Periplasmic Proteins, Bacterial outer membrane, Bacterial Outer Membrane Proteins
Abstract

Tripartite multidrug efflux systems of Gram-negative bacteria are composed of an inner membrane transporter, an outer membrane channel and a periplasmic adaptor protein. They are assumed to form ducts inside the periplasm facilitating drug exit across the outer membrane. Here we present the reconstitution of native Pseudomonas aeruginosa MexAB–OprM and Escherichia coli AcrAB–TolC tripartite Resistance Nodulation and cell Division (RND) efflux systems in a lipid nanodisc system. Single-particle analysis by electron microscopy reveals the inner and outer membrane protein components linked together via the periplasmic adaptor protein. This intrinsic ability of the native components to self-assemble also leads to the formation of a stable interspecies AcrA–MexB–TolC complex suggesting a common mechanism of tripartite assembly. Projection structures of all three complexes emphasize the role of the periplasmic adaptor protein as part of the exit duct with no physical interaction between the inner and outer membrane components., Tripartite efflux systems consist of inner membrane, outer membrane and periplasmic components. Here, Daury et al. reconstitute native versions of RND transporters in nanodiscs and present projection structures emphasizing the role of the periplasmic adaptor in linking the inner and outer membrane proteins.

Published
2016

49. Focus on the Outer Membrane Factor OprM, the Forgotten Player from Efflux Pumps Assemblies

Author

Gilles Phan, Martin Picard, Isabelle Broutin, Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)

Subjects
lcsh:Therapeutics. Pharmacology, antibiotic resistance, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:RM1-950, Pseudomonas aeruginosa, Review, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, OMF membrane protein, 3D structure
Abstract

International audience; Antibiotics have been used extensively during several decades and we are now facing the emergence of multidrug resistant strains. It has become a major public concern, urging the need to discover new strategies to combat them. Among the different ways used by bacteria to resist antibiotics, the active efflux is one of the main mechanisms. In Gram-negative bacteria the efflux pumps are comprised of three components forming a long edifice crossing the complete cell wall from the inside to the outside of the cell. Blocking these pumps would permit the restoration of the effectiveness of the current antibiotherapy which is why it is important to increase our knowledge on the different proteins involved in these complexes. A tremendous number of experiments have been performed on the inner membrane protein AcrB from Escherichia coli and, to a lesser extent, the protein partners forming the AcrAB-TolC pump, but less information is available concerning the efflux pumps from other virulent Gram-negative bacteria. The present review will focus on the OprM outer membrane protein from the MexAB-OprM pump of Pseudomonas aeruginosa, highlighting similarities and differences compare to the archetypal AcrAB-TolC in terms of structure, function, and assembly properties.

Published
2015

50. The small CAB-like proteins of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803: Their involvement in chlorophyll biogenesis for Photosystem II

Author

Imre Vass, Diana Kirilovsky, Christiane Funk, Miguel A. Hernández-Prieto, Leyla Abasova, Tania Tibiletti, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Chlorophyll, Photosystem II, Mutant, Biophysics, macromolecular substances, Light-harvesting-like proteins, Photochemistry, Photosystem I, Biochemistry, chemistry.chemical_compound, Bacterial Proteins, Photosystem, Synechocystis sp. PCC 6803, Orange carotenoid protein, Synechocystis, Photosystem II Protein Complex, food and beverages, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Cell Biology, High-light inducible proteins, Spectrometry, Fluorescence, chemistry, Non-photochemical quenching, Electrophoresis, Polyacrylamide Gel, Phycobilisome, Biogenesis
Abstract

The five small CAB-like proteins (ScpA-E) of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 belong to the family of stress-induced light-harvesting-like proteins, but are constitutively expressed in a mutant deficient of Photosystem I (PSI). Using absorption, fluorescence and thermoluminescence measurements this PSI-less strain was compared with a mutant, in which all SCPs were additionally deleted. Depletion of SCPs led to structural rearrangements in Photosystem II (PSII): less photosystems were assembled; and in these, the QB site was modified. Despite the lower amount of PSII, the SCP-deficient cells contained the same amount of phycobilisomes (PBS) as the control. Although the excess PBS were functionally disconnected, their fluorescence was quenched under high irradiance by the activated Orange Carotenoid Protein (OCP). Additionally the amount of OCP, but not of the iron-stress induced protein (isiA), was higher in this SCP-depleted mutant compared with the control. As previously described, the lack of SCPs affects the chlorophyll biosynthesis (Vavilin, D., Brune, D. C., Vermaas, W. (2005) Biochim Biophys Acta 1708, 91–101). We demonstrate that chlorophyll synthesis is required for efficient PSII repair and that it is partly impaired in the absence of SCPs. At the same time, the amount of chlorophyll also seems to influence the expression of ScpC and ScpD.

Published
2011

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