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203 results on '"Roupioz, Yoann"'

3. Functionalization of Gold Nanoparticles for a Color-Based Detection of Adenosine in a Bioassay

Author

Roupioz, Yoann

Abstract

A simple bioassay was designed for the detection of adenosine, a human metabolite involved in several physiological processes, on the basis of the functionalization of gold nanoparticles with DNA oligonucleotides selectively binding adenosine. The test was possible thanks to the selective and sensitive binding of adenosine by two DNA oligonucleotides forming an aptamer. Each DNA strand was grafted on the surface of gold nanoparticles, which formed an insoluble aggregate within a few minutes in the presence of millimolar concentrations of adenosine. The experiments described are suitable for undergraduate and graduate students developing skills in handling and functionalizing nanomaterials for use in biosensors. Besides the handling of nanomaterials, this laboratory training enabled the students to familiarize themselves with the use of nucleic acids in novel techniques, for example, as efficient probes for biosensing purposes.

Published
2019
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4. Protections anti-microbiennes : combinaison de la fonctionnalisation et de la nano-structuration pour explorer les interactions cellule/surface

Author

Charette, Paul G., Canva, Michael, Roupioz, Yoann, Leroy, Loïc, Convert, Laurence, Stalet, Marion, Charette, Paul G., Canva, Michael, Roupioz, Yoann, Leroy, Loïc, Convert, Laurence, and Stalet, Marion

Abstract

Les micro-organismes, omniprésents et résilients, détiennent le titre incontestable d’organismes vivants les plus tenaces de notre planète. Présents sur Terre depuis environ 4 milliards d'années, leurs remarquables mécanismes d'adaptation leur ont permis de coloniser tous les environnements, même les plus extrêmes, et d’y jouer un rôle essentiel. Bien que leur prolifération rapide et leur capacité de résistance aux antibiotiques soient établies depuis au moins un siècle, la fin de l'ère dorée des antibiotiques dans les années 1960 a ravivé les préoccupations en matière de santé publique. Afin de faire face à la recrudescence de cette résistance, de nouvelles solutions technologiques ont été explorées pour limiter la contamination d’environnements et de surfaces sensibles, notamment dans le domaine médical. Parmi elles, la fabrication de surfaces activement antimicrobiennes est particulièrement pertinente. Les approches de fonctionnalisation chimique de surface et de relargage d’agents antimicrobiens ont été explorées intensivement ces dernières années mais souffrent encore de limites liées à la durabilité de leur activité. Des approches plus récentes dans le développement de matériaux dits « fonctionnels », comme la nano-fabrication de surfaces bio-inspirées, se révèlent également prometteuses et pourraient compléter les approches existantes. Cependant, les mécanismes d'interaction entre les micro-organismes et les surfaces sont complexes et, pour chaque approche, de nombreux paramètres comme les conditions d’étude ou les caractéristiques physico-chimiques des matériaux employés peuvent influencer l'efficacité des surfaces. En outre, le manque de protocoles standards pour caractériser l'ensemble des propriétés antimicrobiennes des surfaces fonctionnelles complique la mise en commun des connaissances et la compréhension des mécanismes. En utilisant la fonctionnalisation chimique avec des peptides antimicrobiens et la nano-structuration par électro-dépôt, cette thèse, Microorganisms, ubiquitous and resilient, hold the undisputed title of the most persistent inhabitants of our planet. Present on Earth for approximately 4 billion years, their remarkable adaptive mechanisms have enabled them to colonize all environments, even the most extreme, and to play an essential role in them. Although their virulent proliferation and antibiotic resistance capabilities have been established for at least a century, the end of the golden age of antibiotics in the 1960s has revived concerns. To address the resurgence of this resistance, new technological solutions have been explored to limit contamination in sensitive environments and surfaces, particularly in the medical field. Among these, the fabrication of actively antimicrobial surfaces is particularly relevant. Approaches involving chemical surface functionalization and the release of antimicrobial agents have been extensively explored in recent years but still suffer from disadvantages related to the sustainability of their activity. Newer approaches, such as the nanofabrication of bioinspired surfaces, also show promise and could complement existing methods. However, the interaction mechanisms between microorganisms and surfaces are complex, and for each approach, numerous parameters can influence surface effectiveness. Additionally, the lack of standardized protocols to characterize the full antimicrobial properties of surfaces complicates the sharing of knowledge and understanding of mechanisms. This thesis aims to highlight the impact of specific surface design parameters and the importance of taking them into account to design effective solutions, utilizing chemical functionalization with antimicrobial peptides and nanostructuring through electrodeposition. Drawing on the study of Escherichia coli and Staphylococcus epidermidis, two bacterial strains relevant for their impact on human health and their morphological differences, a comprehensive protocol for microbiological cha

Published
2024

23. Contactless Bio‐Electrofunctionalization of Planar Micropores

Author

Ismail, Abdulghani, primary, Pham, Pascale, additional, Descamps, Lucie, additional, Maziz, Ali, additional, Descamps, Emeline, additional, Leïchlé, Thierry, additional, Marche, Patrice N., additional, Livache, Thierry, additional, Raillon, Camille, additional, Roupioz, Yoann, additional, Mailley, Pascal, additional, Buhot, Arnaud, additional, Leroy, Loïc, additional, and Bouchet‐Spinelli, Aurélie, additional

Published
2021
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27. Chemistry of the 2-deoxyribonolactone lesion in oligonucleotides: cleavage kinetics and products analysis

Author

Roupioz, Yoann, Lhomme, Jean, and Kotera, Mitsuhara

Subjects
Ribose -- Structure, Ribose -- Chemical properties, DNA -- Observations, Lactones -- Chemical properties, Chemistry
Abstract

The chemistry of degradation of deoxyribonolactone-containing DNA was investigated using oligonucleotides of different length (5-, 11-, 23-, 34- mers) in which the lactone was photochemically generated from oligonucleotide precursors containing a photoactive nitroindole residue. The influence of pH and temperature on the lesion was evaluated and it was shown that the deoxyribonolactone site creates greater instability in DNA than its regular abasic site counterpart.

Published
2002

29. Nonlinear free energy relationship in the general-acid-catalyzed acylation of rat kidney gama-glutamyl transpeptidase by a series of gamma-glutamyl anilide substrate analogues

Author

Menard, Annie, Castonguay, Roselyne, Lherbet, Christian, Rivard, Caroline, Roupioz, Yoann, and Keillor, Jeffrey W.

Subjects
Enzymes -- Structure-activity relationship, Proteases -- Physiological aspects, Enzyme kinetics -- Analysis, Gibbs' free energy -- Analysis, Biological sciences, Chemistry
Abstract

Research describes the kinetic mechanism of the acyl transfer reactions catalyzed by the gamma-glutamyl transpeptidase from rat kidney. Data on the kinetic isotope effects, substituent effects, and pH and temperature effects on the enzyme reaction are presented.

Published
2001

33. Controlled regioselective anilide formation from aspartic and glutamic acid anhydrides

Author

Huang, Xicai, Luo, Xuehong, Roupioz, Yoann, and Keillor, Jeffrey W.

Subjects
Aniline -- Research, Aspartate -- Research, Glutamate -- Research, Anhydrides -- Research, Peptides -- Synthesis, Biological sciences, Chemistry
Abstract

Research was conducted to examine the controlled regioselective anilide formation from aspartic and glutamic acid anhydrides. Controlled regioselectivity was performed on aniline with a series of N-protected aspartic and glutamic acid anhydrides through the choice of reaction solvent. The formation of either aspartic acid beta-anilide or glutamic acid gamma-anilide was favored in DMSO while aspartic or glutamic acid alpha-anilides were favored in benzene. Results indicate the efficiency of the method for the formation of glutamic and aspartic acid anilide bonds.

Published
1997

36. Multiplexed Remote SPR Detection of Biological Interactions through Optical Fiber Bundles

Author

Desmet, Cloé, primary, Vindas, Karim, additional, Alvarado Meza, Ricardo, additional, Garrigue, Patrick, additional, Voci, Silvia, additional, Sojic, Neso, additional, Maziz, Ali, additional, Courson, Rémi, additional, Malaquin, Laurent, additional, Leichle, Thierry, additional, Buhot, Arnaud, additional, Roupioz, Yoann, additional, Leroy, Loic, additional, and Engel, Elodie, additional

Published
2020
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37. Polarization Induced Electro-Functionalization of Pore Walls: A Contactless Technology

Author

Bouchet-Spinelli, Aurélie, primary, Descamps, Emeline, additional, Liu, Jie, additional, Ismail, Abdulghani, additional, Pham, Pascale, additional, Chatelain, François, additional, Leïchlé, Thierry, additional, Leroy, Loïc, additional, Marche, Patrice Noël, additional, Raillon, Camille, additional, Roget, André, additional, Roupioz, Yoann, additional, Sojic, Neso, additional, Buhot, Arnaud, additional, Haguet, Vincent, additional, Livache, Thierry, additional, and Mailley, Pascal, additional

Published
2019
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39. Immunological detection of Cronobacter and Salmonella in powdered infant formula by plasmonic label-free assay

Author

Morlay, A., Piat, F., Mercey, T., Roupioz, Yoann, SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ROUPIOZ, Yoann

Subjects
[SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, [CHIM.ORGA] Chemical Sciences/Organic chemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology
Abstract

International audience

Published
2016

41. Coupled optical technics for the Study of Bacteria Behavior near Surface

Author

Morlay, Alexandra, Livache, Thierry, Roupioz, Yoann, Canva, Michael, Charette, Paul G., Leroy, Loic, BOULADE, Marine, Chimie pour la Reconnaissance et l’Etude d’Assemblages Biologiques (CREAB), SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structures et propriétés d'architectures moléculaire (SPRAM - UMR 5819), Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Nanotechnologies Nanosystèmes (LN2 ), Université de Sherbrooke (UdeS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-École supérieure de Chimie Physique Electronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])

Subjects
[PHYS.PHYS.PHYS-OPTICS] Physics [physics]/Physics [physics]/Optics [physics.optics], [PHYS.PHYS.PHYS-OPTICS]Physics [physics]/Physics [physics]/Optics [physics.optics], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

43. Cell-Based Microarrays

Author

Roupioz, Yoann, Palmer, Ella, SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ROUPIOZ, Yoann, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)

Subjects
[SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, [CHIM.ORGA] Chemical Sciences/Organic chemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology
Abstract

International audience

Published
2014

44. Plasmonique avancée pour l'étude et la détection précoce de bactéries

Author

Boulade, Marine, Morlay, Alexandra, Livache, Thierry, Roupioz, Yoann, Piat, Félix, Leroy, Loic, Canva, Michael, Charette, Paul G., BOULADE, Marine, Chimie pour la Reconnaissance et l’Etude d’Assemblages Biologiques (CREAB), SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structures et propriétés d'architectures moléculaire (SPRAM - UMR 5819), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Prestodiag, Laboratoire Nanotechnologies Nanosystèmes (LN2 ), Université de Sherbrooke (UdeS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-École supérieure de Chimie Physique Electronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut Nanosciences et Cryogénie (INAC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon)

Subjects
[PHYS.PHYS.PHYS-OPTICS] Physics [physics]/Physics [physics]/Optics [physics.optics], [PHYS.PHYS.PHYS-OPTICS]Physics [physics]/Physics [physics]/Optics [physics.optics], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2016

47. Covalent schiff base catalysis and turnover by a DNAzyme: A M -independent AP-Endonuclease mimic

Author

May, Jonathan P., Ting, Richard, Lermer, Leonard, Thomas, Jason M., Roupioz, Yoann, and Perrin, David M.

Subjects
Nucleotides -- Research, Imidazole -- Research, Enzyme activation -- Research, Schiff bases -- Research, Bioelectrochemistry, Chemistry
Abstract

The synthetically modified primary amines and imidazoles for DNAzyme, acts as a M -independent AP lyase-endonuclease. The DNAzymes which are capable of catalyzing aldol condensation reactions are described.

Published
2004

49. Toward an RNaseA mimic: A DNAzyme with imidazoles and cationic amines

Author

Lermer, Leonard, Roupioz, Yoann, Ting, Richard, and Perrin, David M.

Subjects
DNA -- Atomic properties, DNA -- Research, Catalysts -- Research, Chemistry, Organic -- Chemical properties, Proteins -- Atomic properties, RNA -- Research, RNA -- Atomic properties, Chemistry
Abstract

Researchers are working with protein nucleases to know more about the design of small molecules that chelated metals to mimic the active RNAaseA. Studies were conducted, to show how synthetic organic chemistry when combined with combinatorial selection gives rise to a new class of DNAzymes to keep pace with small biomimetic catalysts.

Published
2002

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