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International audience

La résistance quantitative du tournesol (Helianthus annuus) au mildiou (Plasmopara halstedii), mise en évidence récemment, est difficile à évaluer. Un réseau de onze expérimentations associant la GEVESSNES, deux laboratoires de l’INRA et Terres Inovia a été construit afin de proposer une méthodologie permettant de mieux caractériser et quantifier cette résistance. En plus de lignées témoins, 17 lignées recombinantes obtenues par l’INRA et portant entre 0 et 3 QTL (quantitative trait loci) impliqués dans la résistance quantitative du tournesol au mildiou ont été testées face à 5 pathotypes de mildiou : 710, 704, 714, 304 et 334. Bien que des différences aient été observées entre laboratoires, les résultats ont permis de poser les bases d’un futur protocole utilisable en routine pour valoriser ce type de résistance dès la création variétale jusqu’à l’inscription puis la post-inscription des variétés., A quantitative resistance of sunflower (Helianthus annuus) to downy mildew (Plasmopara halstedii) has been identified a few years ago. An experimental network involving several labs (GEVES-SNES, INRA and Terres Inovia) over several years aimed at describing and quantifying such a quantitative response. It was hoped to propose a methodology useable to improve sustainable resistance. In addition to check varieties and breeding lines, 17 recombinant inbred lines carrying 0 to 3 quantitative trait loci alleles for quantitative resistance were tested with five downy mildew pathotypes (710, 704, 714, 304, 334). While the experimental results revealed some discrepancies between experiments, this study provided a first experimental protocol to evaluate quantitative resistance both for breeding and for variety registration and development

National audience; La sclérotiniose du colza représente la maladie la plus dommageable pour la culture du colza en France, et fait, à ce titre, l’objet d’un à 2 traitements annuels. L’utilisation de fongicides inhibant la succinate deshydrogénase (SDHI), principalement représentés par le boscalid, ont conduit à la sélection de souches faiblement à fortement résistantes in vitro, selon la molécule utilisée, en progression rapide dans les populations françaises. Cette résistance est corrélée systématiquement dans notre échantillonnage à une des sept substitutions détectées dans les sous-unités protéiques B, C et D de la succinate deshydrogénase, cible des SDHIs. Ces altérations ont été détectées par séquençage mais également par un outil de diagnostique utilisable en routine et basé sur la technologie HRM.

Publié dans : Integrated Control in Oilseed Crops IOBC-WPRS Bulletin Vol. 92, 2013, ISBN : 978-92-9067-271-5; Des données expérimentales agronomiques sont utilisées pour simuler certaines incidences économiques, liées à une gestion intégrée concernant le sclerotinia, qui est un champignon pouvant endommager la culture du colza. Cette gestion intégrée utilise un test de diagnostic permettant aux agriculteurs de réduire leur application de fongicide sur le colza. Des estimations des bénéfices pour les agriculteurs sont utilisées pour déterminer si oui ou non les agriculteurs adopteraient cette gestion intégrée concernant le sclérotinia. Avant 2007, les simulations montrent que l'utilisation du test de diagnostic apporte des gains économiques pour les agriculteurs proches, mais légèrement inférieurs, aux gains liés à la pratique d'une pulvérisation systématique de fongicide. Cependant, comme le prix du colza a fortement augmenté en 2007, le test de diagnostic devient beaucoup moins attrayant en 2007-2008 pour les agriculteurs par rapport à la pulvérisation systématique de fongicide.

International audience; Weather-based models (Improved Blackleg Sporacle and SporacleEzy) to predict the date of onset of seasonal release from oilseed rape debris of ascospores of Leptosphaeria maculans or L. biglobosa, causes of phoma stem canker, were devel-oped and tested with data from diverse environments in Australia, Canada, France, Poland and the UK. Parameters were estimated, using the same datasets from experiments in the UK and Poland, with an accuracy of root mean squared deviation (RMSD) of 7·4 (with a bias of −4·54, L. maculans) and 8·5 (with a bias of 0·30, L. biglobosa) days for Improved Blackleg Sporacle, and of 2·9 (with a bias of −0·06, L. maculans) and 7·3 (with a bias of −1·18, L. biglobosa) days for SporacleEzy. When tested with data independent of those used for parameter estimation, overall predictions agreed well with observed data in five countries, both for Improved Blackleg Sporacle (R2 = 0·96, slope = 1·00, standard error = 0·03, P > 0·05, n = 46) and SporacleEzy (R2 = 0·96, slope = 0·98, standard error = 0·03, P > 0·05, n = 46). How-ever, SporacleEzy performed better in Australia, Canada, Poland and the UK (RMSD = 10·6, 9·7, 5·4 and 3·4 days, respectively) than Improved Blackleg Sporacle (RMSD = 11·7, 11·0, 5·6 and 6·5 days, respectively). In contrast, the prediction from Improved Blackleg Sporacle (RMSD = 8·0 days) was better in France than that from SporacleEzy (RMSD =15·9 days). Sensitivity analysis showed that better parameter estimation could improve the quality of pre- diction of SporacleEzy (RMSD = 7·6 days) under French conditions. These models are capable of estimating the first seasonal release of ascospores of organisms causing phoma stem canker on oilseed rape under many climates and thus could contribute to development of strategies for control of the disease.

International audience; Le travail du sol joue un rôle important sur le contrôle des pathogènes dont l'accomplissement du cycle est lié à la présence de résidus de cultures plus ou moins décomposés à la surface du sol. Ceci est tout particulièrement vrai pour ce qui concerne le phoma du colza. En effet, l’initiation de cette maladie a lieu en automne, à partir des spores d'un champignon (Leptosphaeria maculans) produites sur des résidus infectés. La production de spores, dont la dispersion par le vent peut atteindre plusieurs kilomètres, n'a lieu que sur des résidus totalement ou partiellement exposés aux rayons du soleil. Ces débris peuvent être issus de la récolte précédente, si celle-ci n'est pas suivie d'un travail du sol permettant l'enfouissement complet des débris végétaux, en général des morceaux de tiges. Mais la production de spores pourrait également concerner des résidus remontés en surface par le travail du sol et plus particulièrement la partie supérieure du pivot, résidu particulièrement dangereux pour la dissémination du phoma car, étant de décomposition lente du fait de sa richesse en lignine, il est le support privilégié de la conservation à long terme du mycélium. Ainsi, l'optimisation de la gestion de la maladie par le travail du sol nécessite de connaître l'effet des différentes méthodes de travail du sol, tant sur l'enfouissement des résidus que sur la remontée en surface de ceux qui sont présents dans l'horizon 0-10 cm. Ces deux mécanismes dépendent du type d'outil de travail du sol, des réglages (vitesse, profondeur) et de l'état du sol au moment des passages. Mais ils dépendent également des caractéristiques des débris végétaux eux-mêmes, et tout particulièrement de leur taille. Par ailleurs, l’âge des résidus peut également influencer la capacité à produire de l’inoculum primaire.

National audience

International audience; Bien qu'elle soit largement pratiquée dans tous les essais phoma d'évaluation variétale du CETIOM et du CTPS, la note G2 a fait l'objet d'études pour mieux cerner ses avantages et ses limites. Sa fiabilité dépend en effet de la date de réalisation, du mode d'observation de la nécrose et de la taille de l'échantillon à observer.