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La contaminación del agua es una consecuencia de la industrialización y el desarrollo de la sociedad debido al vertido constante de aguas residuales domésticas e industria-les sin un tratamiento previo; estos hechos contribuyen al deterioro del medio ambien-te y la pérdida de la diversidad. Se estudiaron tres estaciones de muestreo del río Almendares (La Habana, Cuba) con diferente nivel de contaminación durante un año, con el objetivo de caracterizar la estructura de la comunidad bacteriana heterotrófica cultivable de rápido crecimiento. Para el aislamiento, se cultivaron diluciones seriadas de muestras de agua en Agar Nutriente y se incubaron a 30°C durante 72 h. Se aislaron y purificaron las colonias representativas de diferente morfología en el mismo medio de cultivo. Se obtuvieron un total de 60 aislados que fueron identificados por el sistema API como pertenecientes a los géneros Acinetobacter, Arthroba-cter, Bacillus, Micrococcus, Staphylococcus, Alcaligenes, Citrobacter y Pseudomonas, predominando los filos Firmicutes, Actinobacteria y Proteobacteria. Arthrobacter se aisló con mayor frecuencia en la estación Paila, en comparación con el resto de las estaciones del río Almendares, mientras los géneros Acinetobacter y Bacillus se aislaron con mayor frecuencia en las estaciones Río Cristal y Puente de Hierro. Para caracterizar la estructura de la comunidad bacteriana se utilizaron los índices de riqueza de especies (S*), Simpson (L') y Shannon-Wiener (H'). Los índices de Simpson y Shannon-Wiener mostra-ron diferencias significativas entre la diversidad bacteriana de las tres estaciones de muestreo. No se detectaron diferencias en la riqueza de especies. Los resultados mostraron la influencia de la contaminación en la diversidad bacteriana, que se ve afectada significativamente de las estaciones corrientes arriba a las estaciones corrientes abajo en el río Almendares.

El objetivo del presente estudio fue analizar la influencia de diferentes indicadores fisicoquimicos y microbiologicos de estructuras de la comunidad bacteriana en un ecosistema de agua dulce ubicado en la Reserva de la Biosfera Sierra del Rosario. La composicion de las comunidades de bacterioplancton se determino por electroforesis en gradiente desnaturalizante (DGGE) del 16S rDNA durante tres campanas en tres estaciones de muestreo en el rio San Juan. Se realizaron analisis estadisticos multivariados de los patrones de la electroforesis en relacion con parametros quimicos, biologicos y fisicos. Los analisis mostraron la variacion estacional de la comunidad bacteriana en las estaciones de muestreo menos contaminadas. Ademas, los solidos disueltos totales (TDS), la concentracion de E. coli y el oxigeno disuelto influyeron significativamente en los perfiles de DGGE en el rio San Juan, lo que indica que al menos dos de las tres estaciones de muestreo analizadas tuvieron una buena calidad del agua. Con la combinacion de variables ambientales y la DGGE es posible analizar la influencia de la contaminacion quimica y microbiana en la comunidad bacteriana del rio San Juan. En los sitios menos contaminados, las bajas concentraciones de TDS y los indicadores bacterianos de contaminacion se relacionaron con la diversidad bacteriana. La presente investigacion constituye el primer analisis independiente de cultivo de las comunidades bacterianas de ecosistemas dulceacuicolas en una reserva de la biosfera en las islas del Caribe.

Título en ingles: Influence of different factors in the growth of endophytic bacteria of sugarcaneEn Cuba, entre los esfuerzos por lograr la sostenibilidad en la agricultura se han empleado biopreparados a gran escala, los cuales han tenido un gran impacto económico, ecológico y social. La caña de azúcar constituye uno de los principales cultivos agrícolas para nuestro país y tiene gran importancia desde los puntos de vista económico y ecológico a nivel mundial. En el presente trabajo se demostró el efecto de diferentes fuentes de carbono y nitrógeno en el crecimiento de 5 cepas endófitas de caña de azúcar, 3 de Gluconacetobacter diazotrophicus, una de Bacillus licheniformis y una de Enterobacter agglomerans. De igual forma, se estudió la influencia de jugos provenientes de cinco variedades, así como diferentes concentraciones de las fitohormonas ácido 3 indolacético (AIA) y ácido giberélico (GA) en el crecimiento. Se demostró que la asparagina y el sulfato de amonio como fuentes de nitrógeno adicionadas al medio LGI posibilitan un mayor crecimiento de las bacterias endófitas estudiadas. El medio LGI suplementado con jugo de caña de azúcar favorece significativamente (p≤0,05) el crecimiento de los microorganismos endófitos y no existe relación directa entre el origen varietal del jugo y de las cepas. Por otra parte las fitohormonas en bajas concentraciones favorecieron el crecimiento, no ocurriendo así cuando se encuentran a elevadas concentraciones en el medio de cultivo. Es necesario estudiar todos los factores que pueden influir en la interacción entre la planta y los endófitos para poder utilizar sus potencialidades como promotores del crecimiento vegetal.

Genotypic and phenotypic characterization of Bacillus spp. from polluted freshwater has been poorly addressed. The objective of this research was to determine the diversity and enzymatic potentialities of Bacillus spp. strains isolated from the Almendares River. Bacilli strains from a polluted river were characterized by considering the production of extracellular enzymes using API ZYM. 14 strains were selected and identified using 16S rRNA, gyrB and aroE genes. Genotypic diversity of the Bacillus spp. strains was evaluated using pulsed field gel electrophoresis. Furthermore, the presence of genetic determinants of potential virulence toxins of the Bacillus cereus group and proteinaceous crystal inclusions of Bacillus thuringiensis was determined. 10 strains were identified as B. thuringiensis, two as Bacillus megaterium, one as Bacillus pumilus and one as Bacillus subtilis. Most strains produced proteases, amylases, phosphatases, esterases, aminopeptidases and glucanases, which reflect the abundance of biopolymeric matter in Almendares River. Comparison of the typing results revealed a spatio-temporal distribution among B. thuringiensis strains along the river. The results of the present study highlight the genotypic and phenotypic diversity of Bacillus spp. strains from a polluted river, which contributes to the knowledge of genetic diversity of Bacilli from tropical polluted freshwater ecosystems.

El aumento del uso del agua para diferentes fines y el crecimiento de la población a nivel mundial han contribuido al incremento de los niveles de contaminación de los sistemas acuáticos. La contaminación de estos ecosistemas es una problemática que se presenta en la actualidad, debido al constante vertimiento de desechos domésticos e industriales que constituyen una fuente de deterioro del medio ambiente. El control de la calidad microbiológica del agua de consumo y de vertido, requiere de análisis dirigidos a determinar la presencia de microorganismos patógenos. La alternativa para realizar un control fiable, económico y rápido de la calidad microbiológica del agua es el uso de indicadores de contaminación fecal. Entre los indicadores de contaminación fecal más utilizados se encuentran los coliformes totales y termotolerantes, Escherichia coli y enterococos. Las bacterias indicadoras permiten realizar la clasificación sanitaria de las aguas para diferentes usos, la determinación de criterios para las normas de calidad, la identificación de contaminantes, el control de procesos de tratamiento de agua y estudios epidemiológicos, etc. El presente trabajo aborda los principales aspectos que han sido reportados acerca de la utilidad de las bacterias indicadoras en la evaluación de la calidad del agua. Se exponen estudios que demuestran la factibilidad del uso de E. coli y enterococos como indicadores de contaminación fecal para la evaluación de la calidad de agua y las técnicas utilizadas para su detección, así como el uso de la relación E. coli/enterococos para determinar el origen de la contaminación. Además, se aborda brevemente la situación actual en Cuba con respecto a este tema.

The effect of chitosan was evaluated in three isolates of Rhizopus stolonifer from infected tomatoes that were harvested in different regions of the state of Morelos, Mexico. Changes in the membrane integrity of spores, modifications in pH media and the proteins released were analysed in each isolate against three different molecular weights of chitosan at three fixed concentrations. There was an observed decline in the integrity of spores in the presence of chitosan at all the concentrations evaluated. The protein released was different depending on the isolate, kind of chitosan and used concentration. There was a significant difference in the pH changes on the growth media for all the tested isolates. Chitosan of high molecular weight showed the best results to inhibit the infection caused by R. stolonifer on the tomato fruits. The severity of symptoms of soft rot was not related with the molecular weight of chitosan.

Introduction Theobroma cacao L. is economically speaking the most important species of the genus Theobroma . Cacao is cultured in tropical regions and its yield is affected by several diseases, such as black pod. Black pod rot in cacao . Cacao black pod, particularly, is an economically serious problem in all areas of the world where cacao is grown, causing significant pod losses of up to 30% and killing up to 10% of the trees annually. The disease is caused by different species of the stramenopile genus Phytophthora and, once it has infected a cacao field, its control is fairly difficult. Black pod rot control strategies . Several approaches are used to manage black pod: chemical control, phytosanitary and cultural methods, genetic resistance, and biological control. Losses in yield due to black pod could be reduced through integrated management practices, although the results may vary for each cacao-growing region. Main challenges and new approaches Black pod control could be achieved if an integrated management strategy is established, with the combination of biological and chemical methods, genetic control, and adequate cultural methods in an integrated program.

El presente trabajo es una revisión sobre el género Bacillus. Este género se encuentra ampliamente distribuido en diversos ambientes como agua y suelo debido a su amplia versatilidad metabólica y la presencia de una estructura de resistencia: la endospora. La identificación de las especies de este género, mediante las técnicas convencionales es muy compleja y su taxonomía se ha revolucionado debido a la introducción de las técnicas moleculares. Actualmente, se informan más de 100 especies dentro de este género. El género Bacillus y otros relacionados, se han aislado de numerosos cultivos de interés económico. En este trabajo, se muestran sus potencialidades en la promoción del crecimiento vegetal y el control biológico de patógenos. Se han demostrado diferentes capacidades de Bacillus en asociación a plantas como la producción de fitohormonas como las auxinas, el control biológico mediado por la producción de antibióticos, sideróforos y enzimas líticas, la solubilización de fosfatos y la fijación del nitrógeno. Por otra parte, se expone el riesgo asociado a su uso en la agricultura como biofertilizantes y los diferentes marcadores de patogenicidad que pueden ser utilizados para la detección de determinantes genéticos asociados a la virulencia en el género Bacillus. Se exponen los estudios realizados que demuestran el efecto de especies de este género en diferentes cultivos de interés económico.

The saprophytic bacterium Burkholderiacepacia has been shown to play an active role as plant growth promoting bacteria (PGPB). In this study, the ability of cell-free culture medium (CFCM) of B. cepacia to improve early developmental stages of plants has been assessed on two agronomically important crops, maize (Zeamays) and rice (Oryzasativa). Treating maize and rice seeds for 45 min before germination significantly improved seed germination and consequent seedling growth. The effect of CFCM was confirmed by the increased biomass of the shoot and, mainly, the root systems of treated seedlings. Chromatographic characterization of the CFCM revealed that the spent culture medium of B. cepacia is a complex mix of different classes of metabolites including, among others, salicylic acid, indole-3-acetic acid (IAA) and several unidentified phenolic compounds. Fractionation of the CFCM components revealed that the impressive development of the root system of CFCM-treated seedlings is due to the synergistic action of several groups of components rather than IAA alone. The data presented here suggest that a CFCM of B. cepacia can be used to improve crop germination.

Plants growth promoting bacteria (PGPB) are capable of increasing directly or indirectly crop yield. Burkholderia and Pseudomonas have been found in large populations, which inhabit in the rhizosphere of several agriculture crops. The aim of this study was to determine the antagonistic activity in vitro and in vivo of Cuban native plant growth promoting rhizobacteria against Fusarium verticillioides M1, and to assess their ability to produce IAA and to promote plant growth. The bacterial strains were tested to assess their fungal growth inhibition and plant growth stimulation. The plant growth assays were done in a modified microcosm experiment and in greenhouse conditions. The results demonstrated that these rhizobacteria produce IAA and exhibit antagonistic effect on F. verticillioides M1 inoculated in the substrate. Burkholderia sp. MBf21, MBp1, MBf15 and Pseudomonas fluorescens MPp4 stood out for their plant growth stimulation in maize and for the biological control exerted on F. verticillioides M1. The strains Burkholderia sp. MBf21 and MBf15 showed the best results in disease suppression, which was achieved up to 80%. These results have practical relevance, since potentially effective bacterial strains were selected and could be used in agriculture, for the enhancement of plant growth and disease control in maize crop.

Título en ingles: Influence of different factors in the growth of endophytic bacteria of sugarcaneEn Cuba, entre los esfuerzos por lograr la sostenibilidad en la agricultura se han empleado biopreparados a gran escala, los cuales han tenido un gran impacto económico, ecológico y social. La caña de azúcar constituye uno de los principales cultivos agrícolas para nuestro país y tiene gran importancia desde los puntos de vista económico y ecológico a nivel mundial. En el presente trabajo se demostró el efecto de diferentes fuentes de carbono y nitrógeno en el crecimiento de 5 cepas endófitas de caña de azúcar, 3 de Gluconacetobacter diazotrophicus, una de Bacillus licheniformis y una de Enterobacter agglomerans. De igual forma, se estudió la influencia de jugos provenientes de cinco variedades, así como diferentes concentraciones de las fitohormonas ácido 3 indolacético (AIA) y ácido giberélico (GA) en el crecimiento. Se demostró que la asparagina y el sulfato de amonio como fuentes de nitrógeno adicionadas al medio LGI posibilitan un mayor crecimiento de las bacterias endófitas estudiadas. El medio LGI suplementado con jugo de caña de azúcar favorece significativamente (p≤0,05) el crecimiento de los microorganismos endófitos y no existe relación directa entre el origen varietal del jugo y de las cepas. Por otra parte las fitohormonas en bajas concentraciones favorecieron el crecimiento, no ocurriendo así cuando se encuentran a elevadas concentraciones en el medio de cultivo. Es necesario estudiar todos los factores que pueden influir en la interacción entre la planta y los endófitos para poder utilizar sus potencialidades como promotores del crecimiento vegetal. Among the efforts done in Cuba to the sustainability in the agricultural system, one of them is the use of bioproducts, which have a relevant economic, ecological and social impact. The sugarcane is one of main crops in our country and it has a great importance at world level. In the present work is demonstrated the effect of different carbon and nitrogen sources in the growth of 5 entophytic bacteria (three of Gluconacetobacter diazotrophicus, one of Bacillus licheniformis and one ofEnterobacter agglomerans) were demonstrated. As the same form are studied the influence of juices from five varieties, as well as, different concentrations of fitohormones indole3acetic acid and giberelic acid on the growth. Was demonstrated that asparagine and ammonium sulfate as nitrogen sources added to LGI medium enhance the growth a major growth of the studied endophytic bacteria. The LGI medium supplied with juices of sugarcane enhance the growth of microorganisms (p≤0,05) and don't exist any relationships among the origin of the juice and the strains. On the other hand, the fitohormones at low concentrations don't affect the growth but at high levels of these hormones inhibit the growth. It's necessary to study the factors that have influence on the interaction between the plant and endophytes to use their potentialities as plant growth promoters.Key words: PGPB, Saccharum sp. hybrid, juice of cane.

Aim: To isolate and characterize rhizobacteria from Theobroma cacao with antagonistic activity against Phytophthora palmivora, the causal agent of the black pod rot, which is one of the most important diseases of T. cacao. Methods and Results: Among 127 rhizobacteria isolated from cacao rhizosphere, three isolates (CP07, CP24 and CP30) identified as Pseudomonas chlororaphis, showed in vitro antagonistic activity against P. palmivora. Direct antagonism tested in cacao detached leaves revealed that the isolated rhizobacteria were able to reduce symptom severity upon infection with P. palmivora Mab1, with Ps. chlororaphis CP07 standing out as a potential biocontrol agent. Besides, reduced symptom severity on leaves was also observed in planta where cacao root system was pretreated with the isolated rhizobacteria followed by leaf infection with P. palmivora Mab1. The production of lytic enzymes, siderophores, biosurfactants and HCN, as well as the detection of genes encoding antibiotics, the formation of biofilm, and bacterial motility were also assessed for all three rhizobacterial strains. By using a mutant impaired in viscosin production, derived from CP07, it was found that this particular biosurfactant turned out to be crucial for both motility and biofilm formation, but not for the in vitro antagonism against Phytophthora, although it may contribute to the bioprotection of T. cacao. Conclusions: In the rhizosphere of T. cacao, there are rhizobacteria, such as Ps. chlororaphis, able to protect plants against P. palmivora. Significance and Impact of the Study: This study provides a theoretical basis for the potential use of Ps. chlororaphis CP07 as a biocontrol agent for the protection of cacao plants from P. palmivora infection. © 2015 The Society for Applied Microbiology.

It has been demonstrated that rhizobacteria are able to produce metabolites having agricultural interest, including salicylic acid, the siderophores and phytohormones. Indol acetic acid (IAA) is the most well-known and studied auxin, playing a governing role in culture growth. The object of this work was to characterise rhizobacteria associated with the maize crop in terms of producing IAA, siderophores and salicylic acid metabolites. Burkholderia cepacia and Pseudomonas fluorescens strains previously isolated from maize Francisco variety rhizosphere were used. Colorimetric and chromatographic techniques for detecting these metabolites were studied; multi-variable analysis of hierarchic conglomerate and complete ligament were used for selecting the best strains for producing metabolites of interest. These results demonstrated that all rhizobacteria strains studied produced IAA, siderophores and salicylic acid metabolites. Burkholderia cepacia MBf21, MBp1, MBp2, MBf22, MBp3, MBf20, MBf 15 and Pseudomonas fluorescens MPp4strains have presented the greatest production of these metabolites, showing that these strains could be used in promoting vegetal growth in economically important cultures. Key words: Pseudomonas fluorescens, Burkholderia cepacia, IAA, siderophore, salicylic acid.

El río Luyanó recibe a lo largo de su trayectoria vertimientos de aguas residuales urbanas e industriales sin tratamiento alguno, lo que provoca un deterioro de la calidad de sus aguas. Sin embargo, en algunos tramos del río se realizan actividades recreativas y se emplea el agua para el riego de diferentes cultivos. El trabajo tuvo como objetivos determinar la magnitud de los indicadores físico-químicos temperatura y pH en un tramo de 5 km en el curso inferior del río y evaluar la calidad microbiológica de sus aguas. La medición de estos indicadores se realizó in situ en cada punto de muestreo. Para la cuantificación de los microorganismos indicadores, se utilizó la técnica de filtración por membrana y se emplearon los medios agar Lactosa Tergitol con cloruro de trifenil- 2,3,5- tetrazolio (TTC) para determinar los coliformes termotolerantes y agar Chromocult (para coliformes) para Escherichia coli. El pH y la temperatura obtenidos in situ permanecieron dentro de los rangos óptimos para el crecimiento bacteriano. Las concentraciones de E. coli y coliformes termotolerantes oscilaron entre 1,1.104- 2,9.105 y 1,2.105- 5,7.106 unidades formadoras de colonias/100 mL respectivamente, superiores al límite máximo permisible establecido (NC 22). Se encontró que existe una tendencia a la linealidad entre las concentraciones de estos indicadores y el valor medio de relación E. coli/coliformes termotolerantes fue de 0,9. Se concluyó que la calidad microbiológica de las aguas del río Luyanó es inadecuada para la realización de actividades recreativas y el riego agrícola.

N-butyl-2-cyanoacrylate based tissue adhesive, Tisuacryl, was employed as a nonsuture method for closing wounds in oral surgery. One hundred thirty patients were treated with the adhesive and 30 with suture. The surgical procedures were apicectomy, extraction of molars, and mucogingival grafting. The studied product was well tolerated by the tissue and permitted immediate hemostasis and normal healing of incisions. When Tisuacryl was used as dressing material for donor sites and mucosal ulcerations, pain relief was observed.

The genetic diversity of 29 endophytic bacterial strains isolated from apoplastic sap of the medullary parenchym of the stem of healthy sugarcane plants grown in Cuba was analysed by Two Primers-Ramdom Amplified Polymorphic DNA fingerprinting (TP-RAPD) and 16S rRNA gene sequencing. The strains were distributed into 17 groups on the basis of their TP-RAPD patterns, and a representative strain from each group was subjected to 16S rRNA gene sequencing. Analysis of these sequences showed that the isolates belong to a wide variety of phylogenetic groups being closely related to species of genera Bacillus and Staphylococcus from Firmicutes, Microbacterium, Micrococcus and Kokuria from Actinobacteria, Rhizobium and Gluconacetobacter from α -Proteobacteria, Comamonas and Xanthomonas from β -Proteobacteria, and Acinetobacter and Pantoea from γ -Proteobacteria. These results show the complexity of the bacterial populations present in inner tissues of sugarcane, and indicate the interest and relevance of the studies on microbial diversity to improve our knowledge on the plant endophytic bacterial communities. (© 2008 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim)

Aislamiento de Bacillus solubilizadores de fosfatos asociados al cultivo del arroz. El objetivo de este trabajo fue determinar la capacidad de bacterias del género Bacillus pro-venientes del cultivo del arroz (Oryza sativa L.) en solubilizar fosfatos. Los aislamientos se obtuvieron utilizando el modelo Microcosmos de los cultivares Iacuba 30 y Perla, en el año 2008 en Bauta, La Habana, Cuba. Hubo 58 aislados, tanto rizosféricos como endófitos de la raíz y de la parte aérea, que presentaban características distintivas del género Bacillus, como respuesta positiva a la tinción de Gram, forma bacilar y formación de endospora. Se realizó la detección cualitativa en cuanto a la capacidad de solubilización de fosfatos. Solo 19 aislamientos mostraron solubilización en medio sólido NBRIP y en algunos casos cambiaron la coloración del medio de azul a amarillo, lo que indica la producción de ácidos. Se seleccionaron los positivos para la cuantificación en medio líquido. Las cepas mostraron un comportamiento diferente cuando se midió el fosfato solubilizado a distintos tiempos, variando el máximo de solubilización. Phosphate solubilization by rice associate Bacillus. The objective pursued with this study was to isolate Bacillus bacteria from rice (Oryza sativa L.) and determine its potential for phosphate solubilization. Isolates were obtained using the Microcosm model from Iacuba 30 and Perla cultivar, established by Bauta (2008) in La Habana, Cuba. Fifty eight isolates were obtained from the rice rhizosphere and inside of the roots and leaves with characteristics typical of Bacillus, such as Gram positive, rod cells and endospore formation. The qualitative capacity of these isolates for phosphate solubilization was assayed in solid NBRIP medium; the results revealed that only 19 strains solubilized inorganic phosphate and some of them changed the medium color from blue to yellow, presumably due to acid excretion. Positives were selected for assay in liquid medium, and they showed different responses in terms of time and maximum phosphate solubilization.