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The understanding of the molecular mechanisms that allows the rapid adaptation of mollusks that are vector of parasites, to new environments is important for disease control. Rapid adaptation is difficult to explain by traditional Mendelian genetics and there is strong evidence supporting that epigenetic mechanisms, are behind rapid adaptations in other species. I studied one epigenetic mark called DNA methylation that has demonstrated to be environmentally modulated and to play a role in phenotypic plasticity in many species, principally plants and vertebrates. Nevertheless, the role of DNA methylation in generating phenotypic variation in invertebrates has been poorly studied. I addressed the question of the role of DNA methylation in the generation of phenotypic plasticity and its heritability in the snail Biomphalaria glabrata, the intermediate host of the parasite Schistosoma mansoni, the causal agent of schistosomiasis, a neglected tropical disease. DNA methylation in B. glabrata has been found to be modulated by the infection of the parasite S. mansoni and by environmental stress, furthermore, it was demonstrated that DNA methylation affects its gene expression, suggesting that DNA methylation can affect phenotypic variation and therefore the adaptation of the snail to new environments. To study the role of DNA methylation in the generation of phenotypic variation, experimental manipulation of the DNA methylation in the snail was necessary. Therefore, two approaches were proposed in this thesis to introduce epimutations in the snail B. glabrata: 1) Random epi-mutagenesis using chemical DNA methyltransferase (DNMT) inhibitors and by consequent segregation of epimutations in self-fertilization lines and 2) Methylate the cytosines of a targeted locus with a targeted epigenome editing tool consisting in the use of the DNA methyltransferase (DNMT3) construct fused to the nuclease-inactivated dCas9. For the random epi-mutagenesis approach, a novel DNMT inhibitor has shown methylation inhibiting effects in two subsequent generations, showing a2multigenerational epigenetic effect and without showing toxic effects in either survival nor fecundity of the snail B. glabrata. In addition, the inhibitor Flv1 has been shown to be effective in other two mollusk species, the freshwater snail Physa acuta and the pacific oyster Crassostrea gigas, which suggests that this inhibitor represents a molecular tool to modulate the methylation of DNA in other mollusks. In the case of the targeted epimutagenesis approach, I used a transfection method that allows introducing two plasmid vectors with an SV40 viral promoter in vivo in embryos of the snail B. glabrata. The transfection was performed at the gastrula stage, which resulted in mosaic incorporation of the vector into the transfected cells. However, the method was able to methylate some CpG sites of the targeted gene.; La compréhension des mécanismes moléculaires qui permettent l'adaptation rapide des mollusques vecteurs de parasites à de nouveaux environnements est importante pour le contrôle des maladies. L'adaptation rapide est difficile à expliquer par la génétique mendélienne traditionnelle et il existe des preuves solides qui soutiennent que les mécanismes épigénétiques sont à l'origine des adaptations rapides chez plusieurs espèces. Je me suis focalisée sur une marque épigénétique appelée la méthylation de l’ADN, qui est modulée par l'environnement et joue un rôle dans la plasticité phénotypique chez de nombreuses espèces, principalement les plantes et les vertébrés. Néanmoins, le rôle de la méthylation de l'ADN dans la génération de variations phénotypiques chez les invertébrés a été très peu étudié. J'ai abordé la question du rôle de la méthylation de l'ADN dans la génération de la plasticité phénotypique et de son héritabilité chez l'escargot B. glabrata, l'hôte intermédiaire du parasite Schistosoma mansoni, l'agent pathogène de la schistosomiase, une maladie tropicale négligée. La méthylation de l'ADN chez B. glabrata est régulée par l'infection3du parasite S. mansoni et par le stress environnemental, de plus, il a été démontré que la méthylation de l'ADN affecte son expression génique, suggérant que la méthylation de l'ADN peut affecter la variation phénotypique et donc l'adaptation de l'escargot à de nouveaux environnements. Pour étudier le rôle de la méthylation de l'ADN dans la génération de la variation phénotypique, une manipulation expérimentale de la méthylation de l'ADN chez l'escargot était nécessaire. Par conséquent, deux approches ont été proposées dans cette thèse pour introduire des épimutations chez l'escargot B. glabrata: 1) Épi-mutagenèse aléatoire en utilisant des inhibiteurs chimiques des enzymes ADN methyltransferases (DNMT) et par ségrégation conséquente des épimutations dans des lignées d'autofécondation et 2) Par la méthylation des cytosines d'un locus ciblé avec un outil d'édition épigénétique qui consiste à l'utilisation d'une vecteur plasmidique codant pour l’ADN méthyltranférase (DNMT3) fusionnée avec l’enzyme dCas9 (Cas9 avec l’activité nucléase désactivé). Pour l’approche d’épimutagenèse aleatoire, un nouvel inhibiteur des enzymes DNMT a montré des effets d’inhibition de la méthylation dans deux générations consécutives, en montrant un effet épigénétique multigénérationnelle et sans montrer d’effet toxique ni dans la survie ni dans la fécondité de l’escargot B. glabrata. De plus l’inhibiteur Flv1 a montré être efficace dans deux autres espèces de mollusques, l’escargot d’eau douce Physa acuta et l’huître creuse Crassostrea gigas, ce qui suggère que cet inhibiteur représente un potentiel outil moléculaire pour moduler la méthylation de l’ADN chez d’autres mollusques. Dans le cas de l’approche ciblée, j’ai utilisé une méthode de transfection qui permet d’introduire deux vecteurs plasmidiques avec un promoteur viral SV40 de façon in vivo dans des embryons de l’escargot B. glabrata. La transfection a été effectuée au stade gastrula, ce qui a entrainé une incorporation mosaïque du vecteur dans les cellules transfectées. Toutefois, la méthode a permis de méthyler certains sites CpG du gène ciblé.

National audience; La détection des micropolluants dans l’eau repose classiquement sur une méthode d’analyse chimique très performante en terme de sensibilité, mais inadaptée à un suivi régulier sur site : manque de rapididité et coût élevé. CARBATOX propose une approche innovante avec la réalisation simultanée de deux objectifs : la détection sensible et rapide, à l’aide d’une biopuce à molécules d’ADN uniques originale et la caractérisation de l’impact sur l’environnement de médicaments en mélange (ex. carbamazépine, diclofénac, valsartan).

National audience; La schistosomiase (ou bilharziose) est une maladie chronique causée par des trématodes (vers parasites) du genre Schistosoma. Après la première émergence de l’été 2013 où 106 cas autochtones ont été diagnostiqués en Corse (rivières Cavu, Solenzara, Osu et Tarcu), de nouveaux cas ont été décrits chaque année de 2015 à 2019. Pour améliorer la surveillance environnementale, le projet MOLRISK propose donc de détecter l’ADN du mollusque vecteur et du parasite dans l’eau. À ce jour, cette technique dite de « recherche d’ADN environnemental » existe pour différents parasites comme les trématodes , les dinophytes ou dinoflagellés , les champignons…

International audience; Diarrheic shellfish poisoning (DSP) is caused by the consumption of shellfish contaminated with a group of phycotoxins that includes okadaic acid (OA), dinophysistoxin-1 (DTX-1), and dinophysistoxin-2 (DTX-2). These toxins are inhibitors of serine/threonine protein phosphatases 1 (PP1) and 2A (PP2A), but show distinct levels of toxicity. Aside from a difference in protein phosphatases (PP) inhibition potency that would explain these differences in toxicity, others mechanisms of action are thought to be involved. Therefore, we investigated and compared which mechanisms are involved in the toxicity of these three analogues. As the intestine is one of the target organs, we studied the transcriptomic profiles of human intestinal epithelial Caco-2 cells exposed to OA, DTX-1, and DTX-2. The pathways specifically affected by each toxin treatment were further confirmed through the expression of key genes and markers of toxicity. Our results did not identify any distinct biological mechanism for OA and DTX-2. However, only DTX-1 induced up-regulation of the MAPK transduction signalling pathway, and down-regulation of gene products involved in the regulation of DNA repair. As a consequence, based on transcriptomic results, we demonstrated that the higher toxicity of DTX-1 compared to OA and DTX-2 was consistent with certain specific pathways involved in intestinal cell response.

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La bilharziose, 2ème pathologie parasitaire au monde, touche majoritairement des pays tropicaux cependant des cas autochtones persistent depuis presque 5 ans. Dans cette thèse, après quelques notions sur le parasite incriminé, nous dresserons un état des lieux de la situation en France. En Corse la persistance des cas a entrainé des recherches qui révèlent que certains schistosomes en cause seraient des hybrides. Nous nous pencherons alors sur les caractéristiques de ces espèces de schistosomes émergents. Pour finir nous évoquerons les moyens de préventions et traitements possibles à ce jour ainsi que d’éventuels candidats vaccins.

Human activities introduce multiple harmful pressures on the marine ecosystem. Chemical pollution, climate change, acidification risk, plastic debris and radioactive wastes have significant effects on marine wildlife. Noise pollution is now recognized as a major source of pollution at sea. Seismic exploration, pile driving and marine traffic, among other activities, generate noise at high sound pressure levels altering the underwater acoustic landscape. Many marine mammals and fish hear the noise generated by these activities which have the potential to alter their physiology and ethology. However, very few studies among marine invertebrates had assessed their ability to hear and the impact of noise pollution on them has yet to be determined. We approached the problem by studying sound perception ability in the pacific oyster Magallana gigas using behavioural and physiological techniques. We have shown that M. gigas is sensitive to sound in the frequency range from 10 to 1000 Hz. This characterization allowed us to define sound sources that contribute to their sound landscape. In the laboratory, in an environment contaminated with (i) cadmium, a metal that we considered to be both a toxic agent and an indirect marker of ventilatory activity, and (ii) cargo ship noise, we showed a depressant or repressant effect of noise characterized by a decrease in valve activity, ventilatory activity and growth rate. We also report a decrease in Cd bioaccumulation and some modulation of gene expression. Finally, we studied a 2-year behavioural record performed in the commercial port of Santander (including spawning events and growth) on 3 groups of oysters exposed to high noise pressure levels. In the port of Santander, the "water quality" is otherwise considered by the literature as good to very good for a heavily modified water body. We found in these records different changes that we previously induced and/or produced in the laboratory. We conclude that the noise pollution load occurring within a commercial port must reduce the fitness of oysters by modifying their valve activity, the hierarchy of their biological rhythms and their growth rate. Our results strongly suggest that noise pollution can have significant consequences on invertebrates and presents a high risk in terms of ecosystem productivity.; Les activités humaines font peser sur l’écosystème marin de multiples pressions délétères. Pollution chimique, changement climatique, risque d’acidification, débris de plastique et déchets radioactifs ont des impacts sans précèdent. Une pollution de plus en plus reconnu comme majeur est la pollution sonore. La prospection sismique, le battage de pieux et le trafic maritime génèrent des niveaux sonores qui peuvent être extrêmement forts, modifiant fondamentalement le paysage acoustique sous-marin. On sait que de nombreux mammifères marins et poissons entendent le bruit généré par ces activités et que cela altère leur physiologie et leur éthologie. Par contre, chez les invertébrés marins très peu d’études avaient évalué leur capacité à entendre et l’impact de cette pollution sur eux reste à déterminer. Nous avons abordé le problème par une étude de la capacité de perception du son chez l'huître creuse Magallana gigas en utilisant une approche comportementale et physiologique. Nous avons montré que M. gigas entend dans la gamme de fréquences entre 10 et 1000 Hz. Cette analyse nous a permis de caractériser les sources de sons qui contribuent à leur environnement auditif. Au laboratoire, dans un milieu contaminé (i) au cadmium, un métal que nous avons considéré à la fois comme une substance toxique et un marqueur indirect de l'activité ventilatoire, et (ii), par des bruits de cargo, nous montrons un effet répresseur du bruit caractérisé par une diminution de l'activité valvaire, de l'activité ventilatoire et du taux de croissance. Nous rapportons également une diminution de la bioaccumulation du Cd dans les branchies et une modulation de l'expression de certains gènes. Nous avons enfin étudié sur un enregistrement de 2 ans dans le port commercial de Santander, le comportement (incluant les pontes et la croissance) de 3 groupes d’huitres exposés à une forte pollution sonore et à une « qualité de l’eau » considérée dans la littérature comme bonne à très bonne pour une masse d’eau fortement modifiée. Nous avons retrouvé dans notre analyse différents effets que nous avions provoqués ou prédits à partir du travail de laboratoire où nous avions manipulé le bruit seul. Nous concluons que la pollution sonore au sein du port doit diminuer le fitness des huîtres en modifiant leur activité valvaire, la hiérarchie de leurs rythmes biologiques et la croissance. Nos résultats suggèrent que la pollution sonore peut avoir des conséquences importantes sur les invertébrés et présente un risque fort en termes de productivité de l'écosystème.

Des investigations de terrain ont été réalisées pendant 30 années en mars ou avril dans 361 fermes élevant des bovins ou des ovins afin de recenser les plantes indicatrices pour chaque type d’habitat colonisé par le mollusque Galba truncatula et établir des corrélations avec deux paramètres caractérisant ces sites (superficie du gîte, densité des mollusques). Sept types d’habitat et six espèces de plantes indicatrices ont été reconnus dans les 7.709 sites étudiés. Les habitats les plus fréquents se situent à l’extrémité périphérique des rigoles de drainage superficiel (84,1 % des sites sont colonisés) et autour des sources (81,4 %). Les gîtes dont la superficie inférieure à 3 m2 sont principalement localisés à l’extrémité des rigoles de drainage, le long des fossés correspondants et autour des sources lorsque Juncus acutiflorus, Juncus effusus et Lotus uliginosus sont les plantes indicatrices. Dans les fossés de route et le long des berges de rivière ou d’étang, des superficies plus élevées ont été notées dans la plupart des cas. Les plus fortes densités en mollusques (> 25/m2) ont été observées dans le cas de J. acutiflorus (52,5 % des habitats) et de L. uliginosus (56,7 %). Des densités plus faibles (< 25 mollusques/m2) ont été notées dans le cas de J. effusus (88,8 % des habitats) alors que celles trouvées dans le cas de Glyceria fluitans, d’Agrostis stolonifera et de Dactylis glomerata sont souvent inférieures à 10 mollusques/m2. Le Jonc acutiflore est une bonne espèce indicatrice pour les habitats de G. trun-catula situés dans les prairies et les fossés de route qui les bordent. Même s’il est moins représentatif dans les autres types de gîtes, sa large distribution en Europe permet de l’utiliser pour identifier la plupart des habitats de la limnée sur l’ensemble des sols acides présents dans les pays européens., Field investigations in 361 cattle- or sheep-breeding farms on acid soil were carried out during thirty years in March-April to record indicator plants in relation to the category of habitat colonized by the snail Galba truncatula and to establish correlations with two parameters characterizing these sites (habitat area, snail density). Seven types of snail habitats and six species of indicator plants were listed in the 7,709 sites studied. The most frequent habitats were located at the peripheral extremities of open drainage furrows (84.1 % of places colonized) and around spring heads (81.4 %). Lower than 3-m2 sites were essentially found at the extremities of drainage furrows, along drainage ditches or around spring heads when Juncus acutiflorus, Juncus effusus, or Lotus uliginosus are indicator plants. In road ditches and along pond or river banks, greater values were found in most cases. The highest snail densities (>25 snails/m2) were observed in the case of J. acutiflorus (52.5 % of habitats) and L. uliginosus (56.7 %). Lower snail densities (, Annales Scientifiques du Limousin, Tome 20 | 2009

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In the current context of global change and the associated need to provide forecasts on the future evolution of the climate as precise as possible, it is crucial to have a deep understanding of the earth climate system. Pacific Ocean is an important compartment of this system. It is the place of strong ocean-atmosphere interactions and the birthplace of the El Niño Southern Oscillation (ENSO), the impacts of which are catastrophic for the environments and the populations. The current knowledge on ENSO partly relies on observations which are however limited in time. To increase this dataset and understand the natural climate variability, additional data are acquired for past periods, based on various type of archives. Because ENSO occurrences are connected with the seasonal variability and last several months, high temporal resolution information, are necessary. In this manuscript I shall describe how I tried to develop, and to apply, environmental proxies from biocarbonate archives in the tropical Pacific Ocean to reconstruct the monthly or infra-monthly variability of the sea surface temperatures (SSTs) and the evaporation/precipitation balance. To do that, I focused my works on the mollusk shells and Porites sp coral skeleton. These archives contain various tracers (growth and geochemical variations) of the sought environmental variables. I will show that the thicknesses of growth decreases of the Protothaca thaca bivalve shells (East Pacific) indicate occurrences of El Nino events. In the Western part of the Pacific basin, changes in daily increment thicknesses in two Tridacnidae species, Tridacna maxima and Hippopus hippopus are related to SST changes but also depend on physiological condition of the animals. While certain geochemical tracers (Sr/Ca, δ18O) within Porites sp. Skeleton can be used with a certain confidence, this is not always the case for the mollusk shells. I will show that the use of Mg/Ca as a SST proxy depends on the species and that physiology and very early diagenesis are obstacles in the use of this proxy. In T. maxima and H hippopus, δ18O can be used as a tracer of SST and of the evaporation/precipitation balance. To reconstruct variations of these parameters during the Mid-Holocene, I worked on fossil giant clams and corals, after diagenesis assessment. I will show how various types of diagenesis impact the microstructure, the geochemistry, and the reconstructed environmental parameter. I will also propose hypotheses on the diagenesis process itself. Based on results obtained from Mid-Holocene archives, I will show that the post-glacial SST rise was reached at around 6.5-6 ka BP in the Southwest Pacific, that the South Pacific Convergence Zone influence was more probably reduced, the Hadley circulation enhanced, and that ENSO variability was probably reduced. The work done on Lapita (3 ka BP) Tridacnidae confirmed that the Lapita migration has probably been favored by an increase in climatic variability.The last chapter deals with the future directions I would like to give to my research that include i/ better understand the incorporation of proxies in mollusk and ii/ try to propose solution for sustainable management of tropical ecosystems based on the use of biocarbonate as recorder of the environment and its disturbances.; Dans le contexte actuel du changement climatique et la nécessité de fournir des prédictions du climat futur aussi précises que possible, il est primordial de connaître au mieux notre système climatique. L'Océan Pacifique est un compartiment important de ce système, lieu d'interactions océan-atmosphère fortes et où naît l'Oscillation australe El Niño (ENSO), dont les impacts sont catastrophiques pour l'environnement et les populations. Nos connaissances de ce phénomène sont basées en partie sur des observations, qui restent cependant limitées dans le temps. Pour pallier le manque de données et mieux comprendre la variabilité naturelle du climat, des données supplémentaires sont acquises pour des périodes passées à partir de différentes archives. Comme les occurrences ENSO sont liées à la variabilité saisonnière et durent quelques mois, il est nécessaire d'obtenir des données de l'environnement à haute résolution temporelle. Dans ce manuscrit je montrerai comment j'ai tenté de développer, puis d'appliquer, différents traceurs présents au sein d'archives biocarbonatés (mollusques et coraux) pour obtenir des données de la température de surface de l'eau (SST) et de la balance précipitation/évaporation à une échelle mensuelle à infra-mensuelle. Je montrerai que les diminutions de croissance des coquilles du bivalve Protothaca thaca (Pacifique Est) indiquent des occurrences d'événements El Niño. Dans l'ouest du Pacifique, les variations d'épaisseur des incréments journaliers des coquilles de Tridacna maxima et Hippopus hippopus (Tridacnidae) sont liées aux changements de SST mais dépendent également de l'état physiologique des animaux. Alors que certains traceurs géochimiques (Sr/Ca, δ18O) au sein du squelette de Porites sp. peuvent être utilisés avec une certain confiance, ce n'est pas toujours le cas pour les coquilles de mollusques. Je montrerai que l'utilisation du rapport Mg/Ca comme traceur de la SST dépend de l'espèce considérée et que la physiologie et la diagenèse très précoce sont un obstacle à l'utilisation de ce proxy. Au sein de T. maxima and H hippopus, le δ18O peut être utilisé comme traceur des variations de SST et de la balance précipitation/évaporation. Pour reconstruire les variations passées de ces paramètres, des archives fossiles sont utilisées. Je montrerai comment différents types de diagenèse impactent la microstructure, la géochimie, et les paramètres environnementaux reconstruits. Je proposerai également des hypothèses concernant les processus diagénétiques eux-mêmes. A partir d'archives datant de l'Holocène moyen, je montrerai que la remontée des SSTs, après la dernière époque glaciaire, était terminée à partir de 6.5-6 ka BP dans le Sud-ouest Pacifique, que l'influence de la zone de convergence du Pacifique Sud était très probablement réduite, la circulation de Hadley plus importante, et la variabilité ENSO réduite. Les travaux faits à partir de Tridacnidae de sites Lapita (3 ka BP) confirment que la migration Lapita a été favorisée par une augmentation de la variabilité climatique.Le dernier chapitre est consacré aux futures directions que j'aimerai donner à mes travaux de recherches qui incluent entre autres de i/ mieux comprendre les processus d'incorporation des proxies au sein des coquilles de mollusques et ii/ tenter de proposer des solutions pour une gestion durable des écosystèmes tropicaux en utilisant les archives biocarbonatés comme enregistreurs de l'environnement et de ses perturbations.

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Cette étude part de l’idée qu’il faut se diviser pour créer, et que tout poète se voit nécessairement comme un autre. J’examine trois poèmes américains écrits à cent ans d’écart où cet « autre » se trouve être un mollusque marin : O. Wendell Holmes se compare à un nautile, M. Moore à un argonaute, et H.D. à un bivalve. Les trois poètes s’approprient un héritage culturel filtré par la coquille, et construisent une image d’eux-mêmes à travers un dialogisme interdiscursif (intentionnel ou non) et interlocutif et à travers une logique onirique engendrée par l’image du mollusque marin. Suivant Paul Valéry dans « L’homme et la coquille », je suggère que la coquille suscite des questions naïves, mais fondamentales (qui donc a fait ceci ? Pourquoi cet objet fut-il fait ?), questions indissolublement liées à toute réflexion sur l’éthos. This study stems from the idea that writing entails a division of the self and that the poet necessarily sees his or her own self as another. It focuses on three American poems written within a hundred year in which this “other” happens to be a sea mollusk: O. Wendell Holmes compares himself to a chambered nautilus, M. Moore to a paper nautilus and H.D. to a bivalve. The three poets appropriate the cultural inheritance filtered through shells and construct an image of themselves through an interdiscursive and interlocutive dialogism which can be either intentional or not and through oneiric associations prompted by the image of seashells. In the wake of Paul Valéry in his “Man and the Seashell”, I suggest that seashells raise naive but fundamental questions such as “who made this” or “why was that object made” which are intimately connected to any investigation of what “ethos” might be understood to be.

National audience; En lien avec l’eutrophisation des milieux, les développements massifs de cyanobactéries se sont révélés responsables de différents malaises et décès chez l’homme avec des symptomatologies diverses selon les cyanotoxines incriminées. Se posent les questions du danger lié à la bioaccumulation de cyanotoxines dans les organismes aquatiques et du risque de transfert de contamination par ces toxines entre les eaux douces stagnantes et les milieux estuariens.

National audience; La mémoire des évènements personnellement vécus est appelé mémoire épisodique, elle se distingue de la mémoire sémantique qui permet le stockage de nos connaissances générales sur le monde. Elle nous permet de nous remémorer ce qu'il s'est passé, où et quand, lors d'un évènement que nous avons vécu. Depuis une vingtaine d'années, il y a un consensus général sur le fait que pour tester ce type de mémoire chez l'animal, il est nécessaire d'intégrer le "quoi", le "quand" et le "où" d'un évènement unique. En l'absence de preuve de conscience autonétique chez l'animal (i.e. capacité permettant de revivre mentalement un évènement de son passé), les chercheurs parlent alors de mémoire de type épisodique. Pendant longtemps, les seules études démontrant clairement ce type de mémoire chez l'animal concernaient les oiseaux et les mammifères. Au cours de cette étude, nous avons montré que la seiche, un mollusque céphalopode, était capable de savoir ce qu'elle avait mangé, où et depuis combien de temps, afin d'ajuster son comportement de recherche de nourriture au délai de renouvellement de différents types d'items alimentaires. Cette recherche de nourriture répond aux critères du "quoi", "quand" et "où" d'un évènement unique et apporte la première preuve comportementale claire de ce type de mémoire chez un invertébré.

L’opération de diagnostic menée sur l’espace Saint-Jacques à Bonifacio, a livré un ensemble de vestiges allant de la préhistoire à la période contemporaine. Toujours dans une stratigraphie peu dilatée, les séquences stratigraphiques, n’ont pas montré de transition lente entre l’occupation néolithique, la mise en place des inhumations modernes/contemporaine et la phase de militarisation du XIXe siècle. Ceci est du aux aménagements massifs qui ont supprimé une partie de la séquence stratigraphique en place.Les informations recueillies à l’occasion de ce diagnostic confirment l’intérêt majeur de cet établissement de la fin du Néolithique de la Corse (terre architecturale, industrie lithique, céramique, vestiges fauniques).Les inhumations apparaissent à des altitudes très disparates entre les sondages, qui peuvent plaider soit pour une occupation en plusieurs phases, soit pour une limite des espaces funéraires très marquée et donc une gestion très stratifiée des sépultures. La datation radiocarbone réalisée sur l’une des sépultures a fourni une datation la plaçant en plein Moyen Âge (1190-1275), montrant ainsi pour la première fois sur le plateau la présence de sépultures médiévales hors des édifices de cultes.Enfin, les aménagements militaires de l’époque contemporaine ayant détruit une partie des séquences stratigraphiques ont aussi pu être observés.

article i nfo There is a critical need to document the long-term variability of the West African Monsoon (WAM) in the Sahel region. We present here a multidecadal proxy record of the past hydrology from AD 460 to 1090 in the Saloum Delta, Senegal. The Saloum Delta is a hypersaline estuary where the salinity and the water isoto- pic composition are highly sensitive to rainfall variations. The past hydrology was studied using the oxygen isotopic ratio of Anadara senilis fossil shells, since mollusk shell isotopic composition (δ 18

In hermaphrodites, traits that influence the selfing rate can coevolve with inbreeding depression, leading to the emergence of evolutionary syndromes. Theory predicts a negative correlation between inbreeding depression and selfing rate across species. This prediction has only been examined and validated in vascular plants. Furthermore, selfing rates are often influenced by environmental conditions (e.g., lack of mates or pollinators), and species are predicted to evolve mechanisms to buffer this variation. We extend previous studies of mating-system syndromes in two ways. First, we assembled a new dataset on Basommatophoran snails (17 species, including new data on 12 species). Second, we measured how species responded to variation in mate availability. Specifically, we quantified the waiting time before selfing (i.e., how long the onset of reproduction is delayed in the absence of mates). Selfing rates were negatively correlated with both inbreeding depression and the waiting time. Species with stronger inbreeding depression exhibited longer waiting times. These patterns obtained on Basommatophorans still hold when including eight other hermaphroditic animals. Our results support the hypothesis that selection drives the evolution of mating-system syndromes in animals. The reaction norm of selfing rates to mate availability is a key target of natural selection in this context. © 2011 The Author(s). Evolution© 2011 The Society for the Study of Evolution.

Les biomarqueurs sont des outils mis en oeuvre pour établir un diagnostic de risque environnemental. Leurs usages et leur intérêt, notamment dans la détermination du risque de pollution, sont devenus incontournables surtout depuis que la directive cadre européenne sur l'eau a imposé la surveillance de l'état écologique des cours d'eau.Cependant, le manque de connaissances sur la biochimie, la physiologie et le comportement des organismes aquatiques sentinelles utilisés limitent fortement l'utilisation optimale de ces outils. Quelles sont les connaissances disponibles sur les biomarqueurs ? Comment les utiliser et quelles sont les limites actuelles ? Autant de questions auxquelles cet article tente de répondre.

Science has evolved since the 19th century. New tools have appeared such as optical microscopy which gives us the vision of cells and electronic microscopy which leads us into their hearts. The magnetic resonance imaging appeared in the seventies. Evolving over time, the MRI has taken us farther and farther into the secret depths of our brains. The possibility of observing the neuronal activity thanks to the functional imaging is a major evolution. This thesis will show the possibility we have to observe the activity of a single neuron without modification of its network thanks to the manganese enhanced magnetic resonance imaging technique. The study was done on the Aplysia at very high field magnet (17T). These animals are marine gastropod mollusks with a peculiarity: their neurons are of important size and can reach 1 mm in diameter. Their neurons are grouped into several ganglia. My study concerns the buccal ganglion which is the most studied ganglia in the research in electrophysiology. Before making any acquisitions, I had to conceive several microscopic coils adapted to the size of the ganglions. By reducing the size of the coils, the signal of the noise ratio increases. Then, a double coil allowing the simultaneous acquisition of two samples was built. This antenna required the construction of pre-amplifiers operating at 730 MHz. The first series of experiments helped observe the evolution of the neuronal activity according to different stimuli linked to the eating habits of the Aplysia in vivo. Thanks to the technique implemented, I shall show that, using MRI, it is possible to distinguish the activity of each neuron with respect to a stimulus. Afterwards, to continue this work, a second series of experiments was made in vitro. I studied the behavior of neurons when perfused with neural stimulators: dopamine and serotonin, both naturally present in the Aplysia. Generally, all neurons were activated but when observing them individually, I noticed some differences. Studies in electrophysiology will allow us to get a better understanding and a confirmation of the results of this study. The MEMRI technique can be used in the future to study various disorders such as compulsive behaviors, which are present in the Aplysia, and probably have the same origins as in humans, given that many fundamental processes (such as memory studied by Eric Kandel who he demonstrated that human and Aplysia memories works with the same mechanism) are similar between the two species., La science a avancé depuis le XIX ème siècle. Des nouveaux outils sont apparus : la microscopie optique nous donne la vision des cellules, la microscopie électronique nous entraine au cœur de celles-ci. L’imagerie par résonance magnétique est apparue dans les années soixante-dix. Depuis son évolution, l’IRM nous entraine de plus en plus loin dans les profondeurs secrètes de nos cerveaux. La possibilité d’observer l’activité neuronale à l’aide de l’imagerie fonctionnelle est une grande révolution. Cette thèse montrera la possibilité que l’on a d’observer l’activité d’un neurone individuel sans modification de son réseau grâce à l’imagerie rehaussée au manganèse. L’étude sera effectuée sur des Aplysies à très haut champ (17T). Ces animaux sont des mollusques marins gastropodes qui possèdent une particularité : leurs neurones sont de tailles importantes, ils peuvent atteindre 1 mm de diamètre. Leurs neurones sont regroupés en plusieurs ganglions. Mon étude portera sur le ganglion buccal, qui est le ganglion le plus étudié dans les recherches en électrophysiologie. Avant de réaliser les acquisitions, j’ai dû concevoir plusieurs antennes de tailles microscopiques adaptées à la taille des ganglions. En réduisant la taille des antennes, le rapport signal sur bruit augmente. Dans un deuxième temps, une double antenne a été développée permettant l’acquisition de deux échantillons simultanément. Cette antenne a nécessité de créer des préamplificateurs fonctionnant à 730 MHz. La première série d’expériences a permis d’observer l’évolution de l’activité neuronale selon différents stimulus liés au comportement alimentaire des aplysies in-vivo. J’ai montré grâce à la technique mise en place que l’on peut distinguer par IRM l’activité de chaque neurone face à un stimulus. Par la suite, pour continuer ce travail, une deuxième série d’expériences a été effectuée in-vitro. J’ai étudié le comportement des neurones selon les neuro-stimulateurs perfusés : la dopamine et la sérotonine, tous les deux présents naturellement dans l’aplysie. Globalement les neurones ont été activés mais après les avoir observés individuellement, j’ai remarqué quelques différences selon les neurotransmetteurs. Cette technique peut maintenant être utilisée pour étudier d’autres conduites de l’aplysie comme le comportement compulsif. L’étude sur la mémoire peut être aussi envisagée. Les origines comportementales ont probablement des mécanismes identiques entre les différentes espèces animales et donc avec l’Homme comme l’a démontré les études d’Eric Kandel sur la mémoire.

La fouille faisant l'objet de ce rapport fait suite à une opération de diagnostic réalisée par le Service Archéologique des Yvelines (SADY), pour un projet de construction de logements collectifs et individuels, sur la parcelle 97 de la section HA (année 2011). L'opération s'est déroulée du 17 septembre au 21 décembre 2012, sur l'emprise de 12 000 m2.Tout comme l'avait mis en évidence le diagnostic, la fouille a permis la découverte de trois principaux sites superposés : des amas de silex taillés datés du Paléolithique moyen, une occupation antique et un habitat médiéval. Le site préhistorique est exceptionnel tant par l'excellence de sa conservation (18 amas/locus) que par la composition de l'assemblage lithique. Grâce à l'étude géomorphologique, on peut raisonnablement dater l'occupation préhistorique d'Houdan dans une fourchette chronologique large, entre 70 et 40 ka, que l'on appelle communément le Paléolithique moyen récent. Les éléments découverts sont représentatifs d'une chaîne opératoire complète de débitage et traduisant une exploitation de la matière première présente sur place, depuis les phases de test jusqu'à l'obtention des produits finis (production d'éclats supports de type Levallois sous plusieurs formes : éclats préférentiels, récurrents, pointes).La présence de fosses et fossés, au tournant de notre ère (La Tène finale et Ier siècle), atteste de la mise en place d'un parcellaire. Mais la principale occupation antique date des IIe et IIIe siècles, et se présente sous la forme de structures liées à l'activité agropastorale. Scellées par des colluvions récentes, elles se caractérisent par la présence de trois bâtiments, s'articulant autour d'une vaste zone empierrée interprétée comme une possible cour de ferme, et qui seraient dédiés à l'élevage d'ovins. Ces bâtiments sont de construction modeste (solins liés à la terre, couverture en matériaux périssables, mobilier peu nombreux). Le bâtiment 1 pourrait être un habitat, agrémenté d'une soue à cochon, le second une bergerie (pour environ 160 moutons ?) et le troisième une grange. Le site semble être abandonné à la fin du IIIe siècle ou au début du IVe siècle. Un ensemble de structures, daté de la fin de la période mérovingienne jusqu'au IXe siècle, de faible densité, est présent sur l'ensemble de l'emprise. Une zone de concentration des vestiges est visible dans la partie nord de la parcelle. Elle se caractérise par une forte représentation des structures liées à l'activité artisanale ou domestique, (9 fours domestiques, un possible pressoir sous abris, une possible fosse d'extraction et surtout une importante activité de forge). Cependant aucun plan de bâtiment ou d'habitat n'a clairement été identifié. Enfin la découverte d'une sépulture isolée est à mettre en regard d'un important cimetière, contemporain de cette période, qui est attesté 200 m plus à l'est, sous le donjon.Dans la continuité, l'occupation du site durant les Xe et XIe siècle se caractérise par la présence de 5 bâtiments, dont 4 pourraient correspondre à des unités d'habitation. Autour d'eux, rayonnent plusieurs fonds de cabane et de silos. Au moins 2 des 5 fonds de cabane semblent consacrés à l'activité de tissage. Il est notable de constater la disparition des fours domestiques pour cette période. La diminution global des déchets métallurgiques, mais leur présence sur deux secteurs circonscrits attestent la persistance de cette activité aux Xe-XIe siècles sur le site.La disparition du site médiévale pourrait s'opérer au XIIe siècle et semble contemporaine de la construction du donjon et du développement du bourg à son emplacement actuel.

National audience; Spurilla neapolitanaest un mollusque gastéropode de la famille des Aeo-lidiidae. La distribution de ce nudibranche de grande taille s’étend des eauxchaudes de la Méditerranée à l’Atlantique Nord-Est. Plus précisément, on notela présence deS. neapolitanadu golfe de Gascogne (au nord), juqu’au Séné-gal (limite sud) et aux Açores (à l’ouest). En France métropolitaine,Spurillaneapolitanaest commune dans le bassin d’Arcachon principalement, mais a étérégulièrement recensée au Croisic. Sa récente découverte en presqu’île de Cro-zon (mer d’Iroise), étend son aire de distribution d’une centaine de kilomètresvers le nord, à proximité immédiate de l’entrée de la Manche.

This paper is devoted to the reconstruction of the palaeoenvironment of the surroundings of the Piégu archaeological site located in Brittany (France). For the first time a full set of the onshore and offshore stratigraphical subdivisions is described following three sections. These fundamental data were remaining unpublished up to now. The Western, Eastern and Offshore sections are illustrated by many different figures. The malacological determinations developed for this study are compared with preexisting palaeontological and geochronological data. The results of the determination of the continental malacofauna have been used to restore the original palaeoenvironments prevailing in this area during the sediments deposition. The complete stratigraphic history of the site, as well as the fauna, demonstrates the existence of three glacial / interglacial cycles contemporaneous with a human occupation. Cet article est consacré à la reconstruction des paléoenvironnements pléistocènes et holocènes du site archéologique de Piégu en Bretagne (France). Pour la première fois des données lithostratigraphiques émanant de trois sections complémentaires sont décrites et font l’objet de corrélations. Les déterminations malacologiques récentes développées dans le cadre de la présente publication sont comparées avec les données paléontologiques et géochronologiques disponibles. Les résultats de la détermination de la malacofaune continentale ont été utilisés pour reconstruire les paléoenvironnements contemporains du dépôt des sédiments. L’histoire stratigraphique complète du site, aussi bien que la faune, démontre l’existence de trois cycles glaciaire-interglaciaire avec des présences humaines bien affirmées.

La métallothionéine (MT) est un ligand protéinique intracellulaire important à cause de son implication dans les processus de régulation des métaux traces essentiels et non-essentiels. Bon nombre de travaux ont été conduits en laboratoire pour bien comprendre les mécanismes de synthèse de cette protéine, mais les études réalisées en milieu aquatique sont beaucoup plus rares, particulièrement dans les rivières (milieu lotique). Dans ce contexte, la présente étude avait deux objectifs principaux : (1) identifier en milieu lotique les métaux traces (argent "Ag", cadmium "Cd", cuivre "Cu", nickel "Ni", plomb "Pb" et zinc "Zn") susceptibles d'induire la synthèse de la MT chez trois espèces sentinelles, soit le mollusque bivalve Pyganodon grandis, la larve d'éphémère Hexagenia limbata et le grand brochet du nord Esox lucius ; (2) définir les variables physico-chimiques ou toxicologiques pouvant influencer la prise en charge des métaux traces et conséquemment les concentrations en MT chez le mollusque P. grandis et l'éphémère H. limbata. Deux rivières de la région de l'Abitibi ont été échantillonnées à l'été 2001 afin de récolter les espèces sentinelles à 21 stations. Les concentrations en métaux traces, ainsi qu'en métallothionéine, ont été mesurées dans les branchies des mollusques, dans le rein des brochets et dans le corps entier des éphémères. La métallothionéine a été mesurée à l'aide d'une technique de saturation au mercure. D'après nos résultats, le cadmium tissulaire semble être le meilleur prédicteur de la concentration de MT chez les trois espèces sentinelles. Cependant, l'implication d'autres métaux est également possible. Dans le cas de P. grandis, la concentration de manganèse (Mn) dans les sédiments pourrait influencer la prise en charge du Cd et la synthèse de MT., Metallothionein (MT), an intracellular metal binding protein, is recognized for its role in the regulation of essential and non-essential trace metals. The mechanisms of synthesis of this protein have been studied in the laboratory but much less work has been carried out in the field, particularly in lotic environments. According to the literature, metallothionein protects tissues from metal damage, and may be used as a direct measure of the biochemical state of the affected tissue. Metallothionein shows high affinity for group IB and IIB metals ions (e.g. Cd, Cu, Zn), and consequently can sequester and detoxify metals. The use of MT as a biomarker for elevated levels of trace metals in aquatic environments has therefore been proposed as a tool in ecotoxicological studies. Changes at the biochemical level offer distinct advantages as biomarkers, since molecular alterations are normally the first detectable responses to environmental changes.The present study focused on two objectives, the first of which was to identify which trace metals (silver "Ag", cadmium "Cd", copper "Cu", nickel "Ni", lead "Pb" and zinc "Zn") may induce MT synthesis in three sentinel species collected in two northern Quebec rivers (Colombière River, close to Val d'Or, and Matagami River close to the town of Matagami) in a mining region (Abitibi, Québec). The three sentinel species were the adult bivalve Pyganodon grandis, the larval mayfly Hexagenia limbata, and the adult great northern pike Esox lucius. The second objective was to define variables that could influence the uptake of these trace metals and consequently the concentrations of MT in the sentinel species. The selection of these sentinel species was based on the following criteria: their relative abundance in the aquatic systems studied; their relative immobility; the ease of sampling; metal tolerance; metal bioaccumulation capacity; dynamics of metal accumulation; capacity to synthesize metallothionein; and availability of physiological and behavioural data.In 2001, physico-chemical conditions (e.g.: temperature, oxygen, transparency, phosphorus, chlorophyll a, etc.) were monitored during two sampling campaigns at 21 stations. Trace metals were measured in water and sediment in all stations, and in tissues of the sentinel species that were collected when present at the station (P. grandis - gills; H. limbata - whole body; E. lucius - kidney). Dialysis cells were used to collect water samples for the determination of concentrations of total dissolved metals, major anions and cations, humic and fulvic acids, and dissolved organic carbon. At each sampling site, divers collected three replicate sub-samples from two sediment cores for metal analyses. The cores were extruded in the boat and samples taken from the uppermost 0.5 cm, i.e. from the oxidized layer.The two rivers differ in their morphometry, their physico-chemistry, and their biology. The Allard River is larger (200 m vs. 7 m) and deeper (30 m vs. 3 m) than the Colombière River. The Colombière River is slightly more acid (pH: 6.2 - 6.7) and less productive (14 - 32 µg total P L-1) than the Allard River (pH: 6.7 - 7.4; 24 - 45 µg total P L-1). However, the rivers present some similarities such as slow current conditions and limited water transparencies. The range of Ag, Cu and Ni concentrations in water and sediment was greater in the Colombière River, whereas Pb concentrations were higher in the Allard River and Cd concentrations were similar in the two rivers. Zinc was the dominant metal in both rivers, but variations were more significant in water in the Colombière River. Although trace metal and MT concentrations were highly variable among species, stations and rivers, no consistent spatial gradients were detected in animals collected downstream from mining activities.As was the case for the ambient environment, Zn was also the dominant metal in organisms of both rivers. Zinc concentrations were similar in mayflies from the two rivers, but higher in molluscs and lower in pike collected from the Colombière River than in comparable animals from the Allard River. Following Zn, Cu was the second metal in importance in species from the two rivers, whereas the concentrations of Ag were low in all organisms and were undetectable in pike. Cadmium was more concentrated in mayflies and molluscs from the Colombière River than in those from Allard River, and also higher in the pike collected in the contaminated zone of the Colombière River. The concentrations of Ni in all species were comparable between rivers, but were more elevated in mayflies than in the other sentinel species.The range of Pb concentrations was comparable between rivers for all species, but concentrations were lower in the pike (kidney). The concentration of MT was higher in the pike than in the two other species. Mayflies had higher MT levels in the Allard River, while MT concentrations were higher in molluscs of the Colombière River. The relationships between metals and MT were very variable between rivers and species. Nevertheless, MT concentrations were most strongly related to those of accumulated Cd in the three sentinel species. The relationships between MT and Cd for all three species were stronger in the Allard River than in the Colombière River. In the case of P. grandis, because the number of stations where the bivalves could be collected from the Colombière River was low (n=4), no statistically significant relationship was observed between MT and Cd in the tissues, in spite of the high correlation coefficient (r=0.98). For the bivalves, manganese (Mn) concentrations in the sediment were negatively correlated with accumulated Cd concentrations and with MT levels. In H. limbata, in addition to Cd, other metals such as Cu (-) and Zn (+) also exhibited weak relationships with MT. Finally, in bivariate analyses, Pb concentrations in pike liver were significantly correlated with those of MT in this species, but based on multiple regression models, no variable other than Cd affected the level of MT in E. lucius.

Among the gastropods, some muricid shells are composed of an inner aragonitic crossed lamellar layer and a calcitic prismatic outer layer. The analysis of the structure and composition of the two layers of Concholepasshows that the crossed lamellar layer is similar to those of other Mollusc taxa. Sr, Mg and S contents are low in both layers. According to infrared spectrometry, the organic content of the outer calcitic layer is higher than that of the aragonitic crossed lamellar layer. The study of the nanostructure allows for the proposal of a new 3D interpretation of the fine structure of the crossed lamellar layer. The calcitic prismatic layer is compared with the outer calcitic prismatic layer of an archaeogastropod genus: Haliotis.

This paper presents changes in mollusc assemblages in the two largest peri-Alpine French lakes, i.e. Lakes Bourget and Annecy, in eastern France during the late Holocene. It is based on new mollusc data obtained in Lake Bourget: i) from three sediment cores spanning the late Holocene period; and ii) from modern samples taken around 1930 and in 2001. These new results are compared with those obtained from the neighbouring Lake Annecy and published in a previous paper. Results show that the modern period is characterised by unprecedented changes in the mollusc assemblages in Lakes Bourget and Annecy over the last 4500 years. The main drivers of the observed changes may be related to: i) the recent arrival of native and exotic species; ii) the considerable regression of lacustrine macrophytes following increased anthropic pressure on these ecosystems from the 1940s onwards; and iii) modifications of the nature and quality of the fine littoral sediments of Lake Bourget, probably linked to the regulation of its water level. In addition, the arrival of new species has led to the creation of no-analogue communities, i.e. which consist of species that are extant today, but in combinations not found until now. As a result, a return to the initial state in terms of community structures is thus difficult to envisage. On the contrary, re-establishing the dominance of charophytes and thus the dominance of gastropods, characteristic of the littoral malacocenoses of the Holocene, is a conceivable objective. Nonetheless, the persistence and extension of the period of hypoxic hypolimnion associated with warmer winters expected in the northern hemisphere could affect the recovery process negatively.

Among the variety of microstructural types that can be found within Molluscs shells, intercrossed structures (crossed-lamellar, complex crossed-lamellar and cross-foliated) are by far the most commonly found. They are, however, still poorly documented - mainly due to their complex 3D organization. The majority of biomineralization studies, and the resulting models, are indeed essentially based on simple architectures (such as nacreous or prismatic layers). In order to achieve a better understanding of the fundamental mechanisms that drive the mineralization of such biocarbonates, it is therefore mandatory to check to which extent models developed from « simple » shells stay consistent when applied to more complex microstructural organizations. The present study focuses on intercrossed layers of several Mollusk shells, in order to highlight the various levels of biological control exerted by the organism on their formation and growth. In-situ techniques are used to characterize biochemical compositions, in close correlation with microstructural patterns, as well as fine-scale biocrystallization processes. Some peculiar features of the diagenesis of these microstructures are illustrated, through the study of fossil shells from Patella sp (~100 ky) and Velates perversus (~50 My)., Parmi la diversité des types microstructuraux que l’on peut trouver dans les coquilles des Mollusques, les architectures entrecroisées (lamellaire-croisé, lamellaire-croisé complexe, folié-croisé) sont de loin les plus abondantes. Mais elles restent, de par leurs organisations tridimensionnelles complexes, peu documentées : la majorité des études de biominéralisation, et les différents modèles qui en découlent, sont en effet essentiellement basés sur des architectures plus simples (telles que les couches nacrées ou prismatiques). Or il convient, si l'on souhaite aboutir à une meilleure compréhension des mécanismes fondamentaux qui dirigent la minéralisation de ces biocarbonates, de vérifier dans quelle mesure les modèles développés à partir de coquilles ”simples” sont aussi applicables à des organisations microstructurales plus complexes. Cette étude se focalise donc sur les couches entrecroisées des coquilles de quelques Mollusques, dans le but de mettre en évidence les différents niveaux du contrôle biologique que l'organisme exerce sur leur formation et leur croissance. À cette fin, des techniques de caractérisation in-situ des assemblages organiques sont privilégiées, en relation étroite avec l’analyse des organisations microstructurales et des mécanismes de biocristallisation à fine échelle. Quelques aspects de la diagénèse de ces microstructures seront aussi abordés, à travers l’étude de coquilles fossiles de Patella sp (~100 ka) et Velates perversus (~50 Ma).

International audience; The analysis of literary made highlight that the distribution of the glutinous snail, Myxas glutinosa has declined drastically in France during the 20th century (Fig. 2). Since 1950, this species only inhabits 6 departments vs more of 30 previously. As the anthropogenic pressure on freshwater ecosystems is increasing, to locate and protect any remaining populations is a priority for the conservation of this species threaten by extinction in France.; L'étude de la bibliographie a mis en évidence une dramatique régression de la répartition de la limnée cristalline Myxas glutinosa (O. F. Müller, 1774), en France au cours du XXe siècle (Fig. 2). A partir de 1950, cette espèce n'a été recensée que dans 6 départements vs plus de 30 précédemment. L'impact anthropique sur les hydrosystèmes s'étant accru, localiser et protéger les populations restantes constituent une priorité pour la conservation de cette espèce en danger d'extinction dans notre pays.

L’opération menée sur l’ensemble désigné Caserne Montlaur, a livré de nombreux vestiges s’étalant de la période néolithique jusqu’à la période contemporaine.Pour les structures archéologiques elles ont principalement été retrouvées aux abords des trois édifices, que sont les anciennes églises de Sainte Marie-Madeleine, Saint Barthélémy, et Sainte Croix.L’occupation la plus ancienne concerne donc la période du néolithique et a été surtout observée dans un périmètre proche de l’église Saint Barthélémy, au nord et au nord/est de cette dernière. Les vestiges des occupations néolithiques se trouvent en position secondaire et primaire dans neuf sondages. L’occupation du Néolithique ancien semble peu intense et mal conservée à la base de la stratigraphie. Néanmoins elle présente un intérêt évident par la rareté de ce type d’occupation (chronologie et nature de l’établissement). Le Néolithique récent, à l’inverse, livre des structures variées associées à des sols (localement matérialisés par des petits amas coquilliers) et renvoie à l’existence d’un vaste établissement de plein air. L’étude céramologique démontre en première analyse une certaine originalité des productions céramiques, avec notamment l’introduction de vases polypodes.La période médiévale n’est présente quant à elle qu’en filigrane, à travers le mobilier céramique retrouvé notamment dans l’église de Sainte Croix et dans les traces agraires identifiées au nord de Saint Barthélmy. Les bâtiments, identifiés comme des églises ou oratoires des congrégations religieuses ne sont pas dénués d’intérêt, en particulier ceux dédié à Sainte Marie Madeleine et à Sainte Croix. Quant à Saint Barthélémy, sa position plus excentrée par rapport à la ville lui confère une image particulière et il fait partie du cortège des édifices de confréries bonifaciennes qui est le seul pour l’instant à avoir montré un espace cimetérial, dont les inhumations les plus récentes remontent vraisemblablement au XVIIIe siècle.

In order to better assess the risk associated with nonylphenol, a lipophilic contaminant of the aquatic environment having a strong tendency to bioaccumulate in organisms and exerting estrogenic effects in fish and invertebrates, we have investigated the capability of three types of freshwater species to metabolize labelled 4-n-nonylphenol. Reverse-phase radio-HPLC was used to isolate and quantify the metabolites. The identification of residues was based on co-chromatography with available standards or authenfified metabolites and when possible by electrospray ionization LC-MS analyses. The residues found in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), pond snails (Lymnea stagnalis) and duckweeds (Lemna minor) were identified. These freshwater organisms are able to extensively biotransform 4-n-nonylphenol. Our attempts to draw the metabolic pathways of nonlyphenol evidenced oxidative attack on the alkyl chain with the production of several hydroxylated compounds and related carboxylic acids. In addition, trout and duck-weeds were able to conjugate the phenol moiety to glucuronic acid and carbohydrates respectively. Traces of sulphate conjugates were also detected in trout tissues whereas no conjugate was detected in pond snails.

National audience; La cryoconservation des ressources génétiques pour l'aquaculture se développe pour soutenir la biodiversité lors de la domestication de nouvelles espèces, et pour sécuriser les programmes de sélection génétique, en plein essor depuis les années 1990. La morphologie et la biologie des gamètes chez les espèces aquacoles sont extrêmement diversifiées. Certains spermatozoïdes ne possèdent pas d'acrosome (poissons), d'autres n'ont pas de flagelle (crustacés).s Tous sont immobiles dans le tractus génital et sont archivés par les propriétés physico-chimiques de l'eau dans laquelle ils sont émis. Des méthodes classiques de congélation du sperme donnent des taux de fécondation le plus souvent élevés, et le diméthyl sulfoxide est le cryoprotecteur perméant le plus utilisé. La congélation des ovules et des embryons est possible chez les mollusques, mais pas chez les poissons où la grande taille et l'imperméabilité des réserves embryonnaires empêchent leur cryoconservation. La conservation du génome des deux parents passe alors par la cryoconservation de cellules embryonnaires isolées, de cellules germinales souches, ou de cellules somatiques différenciées. Les méthodes de régénération des individus avec ces cellules font l'objet de recherches prometteuses, même si elles ne sont pas encore applicables aujourd'hui en cryoconservatoires.

Onchidin B (4) is a cyclic depsipeptide isolated from the pulmonate mollusc Onchidium sp. Its structure was determined by extensive 2D-NMR, FABMS, tandem FAB MS/MS, selective hydrolysis, and synthesis. It contains four α-amino acids [two units of N-methyl valine (MeVal), two units of proline (Pro)], four α-hydroxy acids [two 2-hydroxyisovaleric acids (Hiv), two 2-hydroxy-3-methylpentanoic acid moieties (Hmp)] and two units of the new β-hydroxy acid: 3-hydroxy-2-methyloct-7-ynoic acid (Hymo)]. Selective hydrolysis and direct comparison by chiral GC-MS with authentic samples of the α-amino and α-hydroxy acids allowed us the assignment of the entire absolute stereochemistry of onchidin B. In this way, the α-hydroxy acids were found to be (S)-Hiv and (S,S)-Hmp, and the α-amino acids (R)-proline, (S)-proline, and (R)-MeVal. In order to establish the absolute configuration of the new β-hydroxy acid, Hymo, its four possible stereoisomers were stereoselectively synthesized using chiral N-propionyl oxazolidinones...

© 2012 Lockyer et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited. The outcome of infection in the host snail Biomphalaria glabrata with the digenean parasite Schistosoma mansoni is determined by the initial molecular interplay occurring between them. The mechanisms by which schistosomes evade snail immune recognition to ensure survival are not fully understood, but one possibility is that the snail internal defence system is manipulated by the schistosome enabling the parasite to establish infection. This study provides novel insights into the nature of schistosome resistance and susceptibility in B. glabrata at the transcriptomic level by simultaneously comparing gene expression in haemocytes from parasite-exposed and control groups of both schistosome-resistant and schistosome-susceptible strains, 2 h post exposure to S. mansoni miracidia, using an novel 5 K cDNA microarray. Differences in gene expression, including those for immune/stress response, signal transduction and matrix/adhesion genes were identified between the two snail strains and tests for asymmetric distributions of gene function also identified immune-related gene expression in resistant snails, but not in susceptible. Gene set enrichment analysis revealed that genes involved in mitochondrial electron transport, ubiquinone biosynthesis and electron carrier activity were consistently up-regulated in resistant snails but down-regulated in susceptible. This supports the hypothesis that schistosome-resistant snails recognize schistosomes and mount an appropriate defence response, while in schistosome-susceptible snails the parasite suppresses this defence response, early in infection. This work was carried out with funding from the Wellcome Trust (068589/Z/02/Z). CMA and BH acknowledge support from the United States National Institutes of Health (NIH), USA R01AI052363 (CMA) and COBRE 1P20RR018754 IdEA, NCRR.

This guide presents the rules for measuring fi shes, mollusks, shellfi shes, reptiles and marine mammals applicable to the fisheries surveys coordinated by Ifremer, including tasks carried out at the international level, in particular within the European regulation related to the fishery data collection., Ce guide présente les règles de mensuration des poissons, mollusques, crustacés, reptiles et mammifères marins applicables aux observations halieutiques coordonnées par l’Ifremer, y compris les actions conduites dans le cadre de réseaux de surveillance coordonnés au niveau international, en particulier en application du règlement européen relatif à la collecte des données halieutique., Esta guía presenta las reglas para la medición de peces, muluscos, crustáceos, reptiles y mamíferos marinos aplicables a los programas de vigilancia en pesquerías coordinadas por el Ifremer, incluyendo las tareas llevadas a cabo a nivel internacional, en particular dentro del reglamento europeo de la toma de datos.

Although viruses have been associated with mortality outbreaks in different mollusc species, little information is available on their exact affiliation and taxonomic position. Herpes viruses have attracted particular attention because of their economic and ecological impact on both farmed and wild marine molluscs over the past 20 years. Investigations based on molecular approaches have been carried out on the herpes virus infecting Pacific oysters in France. Molecular and ultra-structural data were used to classify the virus under the name ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), as the first known species in the family Malacoherpesviridae. Since 2008, massive mortality outbreaks were reported in several Crassostrea gigas oyster farms in France, Ireland, and the United Kingdom. The outbreaks were attributed to adverse environmental conditions associated with a particular variant of OsHV-1, called OsHV-1 μVar., Bien que des épisodes de mortalité associés à la détection de virus aient été rapportés chez différentes espèces de mollusques, peu d’informations sont aujourd’hui disponibles concernant l’affiliation exacte de ces virus et leur position taxinomique. Parmi les virus infectant les coquillages, les herpèsvirus ont fait l’objet d’une attention particulière du fait de leurs impacts économiques et écologiques sur les animaux en élevage et sauvages. Des recherches par des approches de biologie moléculaire ont été menées en France sur le virus infectant les huîtres creuses, Crassostrea gigas. Sur la base des données moléculaires et ultra-structurales, ce virus a été classé, sous le nom d’ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), comme première espèce virale de la famille Malacoherpesviridae. Depuis 2008, des épisodes de surmortalité ont été rapportés dans différentes régions de production des huîtres creuses C. gigas, en France, en Irlande et au Royaume Uni. Ils ont été attribués à des conditions environnementales défavorables associées à la découverte d’un variant génotypique viral particulier, appelé OsHV-1 μVar., Renault Tristan. Les virus infectant les mollusques marins: un exemple d'actualité, les herpèsvirus. In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 164 n°4, 2011. pp. 359-364.

Patterns of bivalve larvae dispersal in the deep Ahe atoll lagoon was studied by using a numerical 3D transport model (MARS3D) coupled with a vertical swimming sub-model, forced mainly by tide and wind-induced currents. The simulations were validated against observations of larval dispersal monitored several days throughout the lagoon. Connectivity matrices describing larval exchanges inside the lagoon were inferred. Larvae displayed a significant dispersal capacity at the lagoon scale, especially with dominant eastern winds. With southeastern winds, larvae mostly remained in their origin sector. The total export rate of the larvae, toward the ocean through the pass and shallow lagoon borders, was independent of the wind conditions, with 1% of the total concentration exported per day. However, the tide-driven currents efficiently flushed larvae in sectors close to the pass. Connectivity matrices suggest that the south and west sectors were more suitable for spat collecting and that central sectors would be efficient sanctuaries if genitors were accumulated.