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International audience; Cet article de nature principalement méthodologique concerne l’étude d’un point de vue didactique des modalités d’intervention du professeur dans des petits groupes menant une activité collaborative en physique. Les études de ce type aboutissent en effet souvent à des conclusions divergentes sur la nature des interventions réputées efficaces à la fois pour la réalisation de la tâche et l’apprentissage correspondant. Nous estimons que cette divergence peut être en bonne partie liée à la nature très différente des situations dans lesquelles le professeur est amené à intervenir dans les petits groupes, ainsi qu’à la manière dont les élèves réagissent à ces interventions. Aussi nous proposons une méthode prenant en compte, dans les analyses et les descriptions des activités en petits groupes, non pas les types d’intervention du professeur mais les formes d’interactions professeur-élèves tout en les associant aux caractéristiques des situations dans lesquelles elles sont initiées. Ces activités, comme toute activité humaine complexe, se développant à différentes échelles temporelles, cette méthode combine une approche analytique de l’action didactique développée à une échelle microscopique, et une approche holistique développée à une échelle supérieure, chacune étant fondée sur des outils théoriques spécifiques. Nous illustrons sa mise en œuvre sur une activité relative aux phénomènes périodiques en 10e année d’étude. La discussion aborde la pertinence de la méthode proposée, les spécificités de chacune de ses approches ainsi que la validité des résultats obtenus.

L’objectif de cet article est d’exposer le développement d’une méthode d’analyse du suivi longitudinal des troubles musculo-squelettiques (TMS) qui consiste en l’identification d’indicateurs et de profils. La démarche repose sur des approches complémentaires (qualitatives et quantitatives) et séquentielles d’analyses de schémas corporels complétés, au début et à la fin de chaque quart de travail, par 16 travailleuses saisonnières au cours de deux saisons de travail (135 000 scores de douleur). Les indicateurs obtenus sont, entre autres, le nombre de régions corporelles atteintes, la présence de douleurs spécifiques et/ou diffuses, la présence de chronicité ou encore la trajectoire temporelle des douleurs. Les indicateurs permettent de caractériser l’évolution des TMS et de décrire, sous ses diverses formes, la variabilité de la fluctuation des TMS au cours du temps. Cette méthode de suivi longitudinal des TMS représente également une modalité d’évaluation qui pourrait être réinvestie dans d’éventuelles études interventionnelles en milieux de travail. The aim of this article is to illustrate the development of an analysis method for the longitudinal follow-up of musculoskeletal symptoms (WMSD) based on the identification of indicators and profiles. The overall approach to developing these indicators entailed complementary approaches (qualitative and quantitative) and sequential analyses of body maps completed by 16 seasonal workers at the start and end of each work shift for two work seasons (135,000 pain scores). The indicators comprised, among other elements, WMSD chronicity, specificity (profiles of diffuse and/or specific pains), temporal trajectories, anatomical location and number of anatomical locations. More specifically, these indicators and the overall approach of this methodological development made it possible to characterize the evolution and to analyse, in different ways, the variability of the fluctuating character of WMSDs over time. Studying the evolution of pain longitudinally could also be usefully integrated into an evaluative framework for ergonomic intervention studies conducted in the workplace.

International audience; Les exosquelettes sont une solution pour soulager physiquement les travailleurs tout en leur permettant de contrôler l'exécution de leurs tâches et de les assister (Baltrusch et al 2018).L’étude présentée ici se base sur la recherche d’éléments capables de quantifier l’action d’un dispositif d’assistance physique (DAP) sur le corps humain pour des mouvements responsables de pathologies reconnues comme des maladies professionnelles.L’évaluation d’un DAP permet de déterminer dans quel cadre l'exosquelette peut être utile à la réalisation du mouvement. On précise qu’il est pertinent d’insérer des exosquelettes en entreprise en mettant toujours au préalable en place une étude ou analyse permettant d’assurer sa bonne intégration. L’objectif de l’étude est de réaliser plusieurs tâches avec et sans le Harnais de Posture (HAPO) afin d’analyser la cinématique et la physiologie des mouvements, notamment à travers l’activité́ électrique de muscles érecteurs du rachis, concernés par le port de charge au travail pour comprendre ses effets sur le corps humain.

La science du sport a permis de comprendre les adaptations de l’humain face à des efforts extrêmes. Pour obtenir des informations précises, la technologie a ouvert le champ des possibles. Avec l’arrivée du microscope, on a pu voir les virus et les microbes invisibles à l’œil nu. Cependant, ces outils scientifiques onéreux ne peuvent être utilisés sans compréhension des résultats. L’apparition de la chronophotographie a favorisé la quantification du mouvement et le développement de la cinématique moderne. Ces nouvelles méthodes ont fait apparaître de nouvelles informations amenant à d’autres perspectives. Toutefois, la capture cinématique en laboratoire est contraignante pour le sportif et celui-ci ne se retrouve plus dans son « milieu naturel ». Pour répondre à cela, scientifiques et ingénieurs ont mis au point, à l’aide des technologies actuelles, des systèmes afin de recueillir des données sur le terrain. À travers l’arrivée des smartphones et des appareils photos intégrés, ils ont amélioré la portabilité du système et l’obtention des variables. De cela, de nouvelles données émergent et complètent les connaissances déjà obtenues. Ainsi, la quantité d’informations devient importante et le choix de la pertinence ou des variable(s) clé(s) peut être altérée. Sports Science has made it possible to study human performance during extreme efforts. The arrival of the microscope gave scientists the opportunity to see viruses and microscopic organisms previously invisible to the naked eye. However, these scientific tools are expensive and require specialized skills for their use. With chronophotography human movement could be quantified and kinematic studies carried out. Nevertheless, the drawback to cinematic images taken in the laboratory is that athletes are no longer in real life situations. To overcome this problem, scientists and engineers are using modern technological advances to collect data. Smart phones and integrated cameras have the advantage of both portability and data recording. As a result, new information has been acquired which supplements the knowledge already obtained. In this way the amount of data has increased and consequently relevant key variables can be modified.

Dans cet article, nous cherchons à documenter les représentations des professeurs stagiaires de français à travers leurs choix méthodologiques concernant la lecture de l’image en lien avec le texte littéraire ainsi que le type de difficultés qu’ils rencontrent.En convoquant les cadres théoriques de la sémiotique post-structurale, nous nous sommes interrogées sur ce que signifie « lire » une image quand les outils préconisés par les programmes de français depuis 1985 relèvent généralement des pratiques littéraires. Quelle didactisation de la relation entre arts visuels et littérature ces programmes mettent-ils alors en œuvre ? Et quelle place accordent-ils à l’expression de la sensibilité et de la subjectivité du spectateur ? Une étude exploratoire (corpus de questionnaires et de séances de lecture de l’image entre 2018 et 2020 auprès de professeurs stagiaires de lettres) relativise les difficultés énoncées par les enseignants. Elle interroge également le sens des activités mises en place et leur exploitation littéraire dans le cadre de la séquence de français. In this article we seek to document the representations of trainee French teachers through their methodological choices concerning the reading of the image in connection with the literary text as well as the type of difficulties they encounter. By summoning the theoretical frameworks of post-structural semiotics, we wonder what it means to “read” an image when the tools advocated by French programs since 1985 generally relate to literary practices. What didactization of the relationship between visual arts and literature do these programs implement? And what place do they give to the expression of the viewer's sensitivity and subjectivity? An exploratory study (corpus of questionnaires and image reading sessions between 2018 and 2020 with trainee humanities teachers) puts the difficulties mentioned by teachers into perspective. It also questions the meaning of the activities implemented and their literary exploitation within the framework of the French sequence.

1 - Énoncé de la problématique - La thèse s’articule sur le thème de la prospective et du rôle que peut jouer la prospective dans le contexte des études de conflits. Comment la prospective, en tant que méthode, discipline ou attitude, peut être perçue comme un outil au service de l’imagination permettant de parcourir le champ des futurs ? Des évidences mises en lumière par des études prospectives permettent-elles d’affirmer l’efficacité et la clairvoyance de la prospective ? 2 - Résumé de la méthode - La méthode d’analyse utilisée consiste en une revue de la littérature. Les trajectoires prospectivistes dans les sciences humaines sont autant de reconnaissance pour une discipline en recherche de considération. Les axes de recherche utilisés sont la démographie et l’environnement qui sont des domaines dans lesquels les écrits prospectivistes abondent, même si leurs interprétations peuvent être aussi souvent alarmistes que controversées. 3 - Principaux points soulevés dans la thèse - Les principaux points soulevés dans la thèse sont ceux de la pertinence de la prospective en qualité de discipline des sciences humaines, vecteur de la pensée rationaliste, et outil de recherche pour une sociologie de l’imagination. 4 - Conclusion générale - La prospective a pu être distanciée de pratiques non scientifiques visant à la prédiction des événements du futur. Les avancées scientifiques et technologiques permettent désormais d’équiper les chercheurs et scientifiques avec des outils de prévision et d’invention du futur.

International audience

This methodological contribution provides the researcher or educational engineer interested in studying or exploiting personal learning environments (PLE) with a method for analyzing and modeling them. Through a research-development approach, a generic model and an PLE modeling language were designed with the following quality criteria in mind : Expressiveness of PLE instances represented by the modeling, simplicity of interpretation by learners, ontological significance, pragmatism of use as a research method and as an educational engineering tool. The method was developed through a longitudinal study with 15 university students for which we modeled 60 instances of PLEs. We illustrate it with an application case and discuss its quality, limitations and perspectives., Cette contribution méthodologique fournit au chercheur ou à l’ingénieur pédagogique désireux d’étudier ou d’exploiter les environnements personnels d’apprentissage (EPA) une méthode pour les analyser et les modéliser. Par une démarche de recherche-développement, un modèle générique et un langage de modélisation des EPA ont été conçus en visant les critères de qualité suivants : expressivité des instances d’EPA figurées par la modélisation, simplicité d’interprétation par les apprenants, portée ontologique, pragmatisme d’usage comme méthode de recherche et comme outil d’ingénierie pédagogique. La méthode a été développée dans le cadre d’une recherche longitudinale auprès de 15 étudiants universitaires, pour laquelle nous avons modélisé 60 instances d’EPA. Nous l’illustrons par un cas d’application et nous discutons sa qualité, ses limites et ses perspectives., Felder Joris. Méthode d’analyse et de modélisation des environnements personnels d’apprentissage. In: Sciences et Technologies de l'Information et de la Communication pour l'Éducation et la Formation, volume 26, 2019. pp. 9-37.

In the current context where didactic research and methodologies are the target of many critics, we study a research method frequently used in didactics of biology and geology: the case study. This approach seems almost unavoidable in research in science didactics so that researchers sometimes forget to justify its use. We propose to clarify the questions posed by the use of this approach in research in didactics of biology and geology. Our purpose is to better understand the function of case studies in this type of research and to indicate their contributions to improving student learning. In this contribution, we analyze ten research papers published in three different reviews in order to examine the status that authors grant to case studies in the construction of knowledge as well as in the arguments developed. We present the main results of our analyses and identify elements for discussion with regard to our issues., Dans le contexte actuel où les recherches en didactique et leurs méthodologies sont la cible de nombreux détracteurs, nous mettons à l’étude une méthode de recherche fréquemment utilisée en didactique des Sciences de la vie et de la Terre (SVT) : l’étude de cas. Cette approche paraît presque incontournable dans les recherches en didactique des sciences si bien que les chercheurs oublient parfois de justifier son emploi. Nous proposons de clarifier les questions que pose l’uti- lisation des études de cas dans les recherches en didactique des SVT. Il s’agit pour nous de mieux comprendre la fonction qui leur est attribuée dans ce type de recherche et d’indiquer en quoi elles peuvent contribuer à l’amélioration des apprentissages des élèves. Dans cette contribution, nous analysons dix articles publiés dans trois revues différentes afin d’examiner le statut que les auteurs accordent aux études de cas dans la construction de connaissances ainsi que dans les argumentations développées. Nous présentons les principaux résultats issus de nos analyses et nous dégageons des éléments de réflexion au regard de notre problématique.

Les pièces calcifiées ont des origines ontogéniques et des propriétés différentes. C’est pourquoi, dans le but d’évaluer les utilisations potentielles des otolithes, des écailles et des tissus squelettiques pour les études de sclérochronologie, il est important de bien comprendre la nature et la formation des accroissements dans ces différentes structures. Dans ce chapitre, nous décrirons la fonction, la morphologie et la structure des différentes pièces calcifiées. Puis, nous ferons une revu...

H. de Pontual, J. Panfili, P.J. Wright, H. Troadec Étymologiquement, le terme « sclérochronologie » est dérivé des racines grecques sklêros « dur », khronos « temps » et logos « étude ». Littéralement, cette science vise à reconstruire l’histoire vécue par les organismes vivants à partir de l’étude de leurs pièces calcifiées (PC). Elle couvre ainsi non seulement les problèmes d’estimation de l’âge mais aussi ceux de l’estimation de la période et de la durée d’événements marquants de l’histoir...

Les chapitres précédents ont montré que les écailles, les otolithes et les os du squelette sont utilisés pour estimer l’âge des poissons en année, en saison ou en jour. La préparation des pc nécessite une série d’étapes de traitement qui peuvent être longues et complexes. Préalablement au démarrage d’une étude de sclérochronologie, il est nécessaire d’identifier les contraintes en termes de temps et de coûts et surtout les objectifs finaux et les résultats attendus (chap. III). Le choix d’une...

Il est impossible de connaître l’âge absolu, « âge véritable », d’un poisson prélevé au hasard dans son environnement naturel. De nombreuses analyses de pêcheries dépendent cependant d’estimations exactes et fiables des structures en âge des captures. La constatation de nombreuses erreurs dans les estimations d’âge a relancé l’intérêt des méthodes de validation. « Valider » signifie qu’il faut prouver qu’une technique est exacte. Ceci peut être démontré ou estimé. Une estimation a bien sûr mo...

L’importance des risques climatiques en agriculture est connue. Qui n’a vu une culture complètement déchiquetée par la grêle ? Qui n’a pu constater les dégâts d’une gelée tardive sur des arbres fruitiers en pleine floraison ? Qui n’a entendu parler des conséquences dramatiques de la sécheresse au Sahel, en Éthiopie ou dans le Nordeste brésilien ? On se propose d’examiner ici quelques moyens d’analyse des risques climatiques susceptibles de guider la prise de décisions en agriculture. Il peut ...

Contrairement aux idées reçues, la sclérochronologie, en particulier l’estimation de l’âge chez les poissons, n’est pas une science aisée. Elle implique une série de processus et de traitements de données qui sont souvent complexes et consommateurs de temps. Avant même de commencer de telles études, il est nécessaire de connaître à l’avance les contraintes sur le temps disponible et sur les coûts et, particulièrement, les objectifs de l’étude ainsi que les résultats attendus. Ce chapitre va a...

L’estimation de l’âge à partir de pièces calcifiées est, avant tout, basée sur un processus répétitif d’interprétation de zones de croissance associant des mécanismes de perception visuelle et des connaissances biologiques. Devant la multiplicité des sources de biais et la subjectivité de certains critères d’interprétation, les sclérochronologues ont cherché à introduire une certaine objectivité à la fois dans l’acquisition des informations de base, essentiellement visuelles, et dans les sché...

A. Introduction Depuis le début des années soixante-dix, un effort de recherche croissant a été consenti pour utiliser la composition chimique des pièces calcifiées (pc) comme source d’information permettant d’aborder un large éventail de questions en halieutique. Cette approche suppose que la composition chimique des tissus durs des poissons reflète les caractéristiques physico-chimiques de l’environnement au sein duquel ces poissons évoluent. Les otolithes en particulier ont été qualifiés d...

International audience; Understanding the environmental profile of a product computed from the Life Cycle Assessment (LCA) framework is sometimes challenging due to the high number of environmental indicators involved. The objective here, in guiding interpretation of LCA results, is to highlight the importance of each impact category for each product alternative studied. For a given product, the proposed methodology identifies the impact categories that are worth focusing on, relatively to a whole set of products from the same cumulated database. The approach extends the analysis of Representativeness Indices (RI) developed by Esnouf et al. (2018). It proposes a new operational tool for calculating RIs at the level of impact categories for a Life Cycle Inventory (LCI) result. Impact categories and LCI results are defined as vectors within a standardized vector space and a procedure is proposed to treat issues coming from the correlation of impact category vectors belonging to the same Life Cycle Impact Assessment (LCIA) method. From the cumulated ecoinvent database, LCI results of the Chinese and the German electricity mixes illustrate the method. Relevant impact categories of the EU-standardized ILCD method are then identified. RI results from all products of a cumulated LCI database were therefore analysed to assess the main tendencies of the impact categories of the ILCD method. This operational approach can then significantly contribute to the interpretation of the LCA results by pointing to the specificities of the inventories analysed and for identifying the main representative impact categories.

Background The PIWI/piRNA pathway is a conserved machinery important for germ cell development and fertility. This piRNA-guided molecular machinery is best known for repressing derepressed transposable elements (TE) during epigenomic reprogramming. The extent to which piRNAs are involved in modulating transcripts beyond TEs still need to be clarified, and it may be a stage-dependent event. We chose chicken germline as a study model because of the significantly lower TE complexity in the chicken genome compared to mammalian species. Results We generated high-confidence piRNA candidates in various stages across chicken germline development by 3′-end-methylation-enriched small RNA sequencing and in-house bioinformatics analysis. We observed a significant developmental stage-dependent loss of TE association and a shifting of the ping-pong cycle signatures. Moreover, the stage-dependent reciprocal abundance of LINE retrotransposons, CR1-C, and its associated piRNAs implicated the developmental stage-dependent role of piRNA machinery. The stage dependency of piRNA expression and its potential functions can be better addressed by analyzing the piRNA precursors/clusters. Interestingly, the new piRNA clusters identified from embryonic chicken testes revealed evolutionary conservation between chickens and mammals, which was previously thought to not exist. Conclusions In this report, we provided an original chicken RNA resource and proposed an analytical methodology that can be used to investigate stage-dependent changes in piRNA compositions and their potential roles in TE regulation and beyond, and also revealed possible conserved functions of piRNAs in developing germ cells. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s12864-018-4820-9) contains supplementary material, which is available to authorized users.

As a result of a qualitative study of hermeneutical type, we present a proposal for implementation in organizations of the clinical method. The basis of this work is a theoretical foundation on which we review some classic concepts underlying the ability to articulate the clinical and organizational fields. The clinical-analytical method is not exclusive to health and disease issues; conversely, it has been used in such diverse fields as law, sociology, pedagogy, among others. This method involves the decomposition of discourse into its constituent elements. If it is accepted that organizations are concretions of founding speeches (institutions) it will be accepted that the clinical-analytical method is relevant for its study and intervention. Furthermore, it is argued that also humans are constituted by institutions. Accepting these premises, it is possible to speak of a human management analytically orientated, based on a philosophy of integrative management, that provides spaces for individual and group verbalization. As a consequence, it is proposed that this human management of analytically orientated tends to enhance the development of human beings, groups and the organization itself. RESUMEN: Como producto de una investigación cualitativa de tipo hermenéutico, se presenta una propuesta para la aplicación en las organizaciones del método clínico. La base de este trabajo es un fundamento teórico en el cual se revisan algunos conceptos clásicos que sustentan la posibilidad de articular los campos clínico y organizacional. El método clínico-analítico no es exclusivo del ámbito de la salud y la enfermedad, por el contrario, ha sido utilizado en campos tan diversos como el derecho, la sociología, la pedagogía, entre otros. Este método consiste en la operación de descomposición de discursos en sus elementos constitutivos. Si se acepta que las organizaciones son concreciones de discursos fundantes (instituciones), se aceptará que el método clínico-analítico es pertinente para su estudio e intervención. Además, se argumenta que también el ser humano está constituido por instituciones. Aceptando estas premisas, se puede hablar de una gestión humana de orientación analítica, cuya esencia son los espacios de verbalización individuales y grupales, basados en una filosofía de gestión integradora. Como consecuencia, se propone que esta gestión humana de orientación analítica propende al desarrollo humano individual, grupal y organizacional.

International audience; Objectives: A better understanding of the subnational variations could be paramount to the efficiency and effectiveness of the response to the HIV epidemic. The purpose of this study is to describe the methodology used to produce the first estimates at second subnational level released by UNAIDS. Methods: We selected national population-based surveys with HIV testing and survey clusters geolocation, conducted in 2008 or later. A kernel density estimation approach (prevR) with adaptive bandwidths was used to generate a surface of HIV prevalence. This surface was combined with LandScan global population distribution grid to estimate the spatial distribution of people living with HIV (PLWHIV). Finally, results were adjusted to national UNAIDS's published estimates and merged per second subnational administrative unit. An indicator of the quality of the estimates was computed for each administrative unit. Results: These estimates combine two complementary approaches: the prevR method, focusing on spatial variations of HIV prevalence, as well as national estimates published by UNAIDS, taking into account trends of HIV prevalence over time. Seventeen country reports have been produced. However, quality of the estimates at second subnational level is highly heterogonous between countries, depending on the number of units and the survey sampling size. In some countries, estimates at second subnational level are very uncertain and should be interpreted with caution. Conclusion: These estimates at second subnational level constitute a first step to help countries to better understand their HIV epidemic and to inform programming at lower geographical levels. Further developments are needed to better match local needs.

Classifying patients according to longitudinal measures, or trajectory classification, has become frequent in clinical research. The k-means algorithm is increasingly used for this task in case of continuous variables with standard deviations that do not depend on the mean. One feature of count and binary data modeled by Poisson or logistic regression is that the variance depends on the mean; hence, the within-group variability changes from one group to another depending on the mean trajectory level. Mixture modeling could be used here for classification though its main purpose is to model the data. The results obtained may change according to the main objective. This article presents an extension of the k-means algorithm that takes into account the features of count and binary data by using the deviance as distance metric. This approach is justified by its analogy with the classification likelihood. Two applications are presented with binary and count data to show the differences between the classifications obtained with the usual Euclidean distance versus the deviance distance.

From the moment they appeared, French punk, rap and ragga music distinguished themselves from the French song which remains intimately linked to singing. Indeed, at the heart of those three styles, vocal expression is closer to speaking than singing, and shows itself to be more rhythmical than melodic. Because there are few harmonic relations between the voice and the instruments, because of the speed of vocal rhythms and the absence of score, those musical styles are resistant to traditional musical analysis tools. In this context, analyzing musical prosody conceived as the sum of the rules regarding the relationship of quantities, stress and intensity between the syllables of the lyrics and the musical beats appears suitable as it is adapted to the scarcity or even absence of melodiousness in the vocal phrasings. Our initial hypothesis is that it constitutes a central element of characterization and differentiation of those styles.The aim of this thesis is to offer an analysis method for musical prosody based on the acoustic content of recordings. In order to do so, we use IT tools and more specifically softwares for the processing and analysis of sound developed by the Musical Representations and the Sound Analysis Synthesis Ircam teams. Thus, Audiosculpt and OpenMusic have allowed for the extraction of data from the musical prosody as well as the production of representations adapted to its analysis. After the presentation of our method, we apply it to some characteristic pieces of French punk, rap and ragga. Thanks to the highlighting of the specific prosodico- musical features of the three styles, we show the relevance of musical prosody analysis to differentiate and characterize popular music styles using phrasings closer to speaking than to singing., Dès leur apparition, le punk, le rap et le ragga français se distinguent de la chanson française qui demeure intimement liée au chant. En effet, au sein des trois styles, l’expression vocale est plus proche de la parole que du chant et s’y révèle plus rythmique que mélodique. En raison du peu de relations harmoniques entre la voix et les instruments, de la vélocité des rythmes vocaux et de l’absence de partition, ces musiques résistent aux outils traditionnels de l’analyse musicale. Dans ce contexte, analyser la prosodie musicale – conçue comme l’ensemble des règles concernant les rapports de quantité, d’accentuation et d’intensité entre les syllabes des paroles et les temps de la mesure – apparaît approprié car adapté au peu, voire à l’absence de mélodicité des phrasés vocaux. Notre hypothèse de départ est qu’elle constitue un élément central de caractérisation et de différenciation de ces styles. L’objet principal de cette thèse est d’élaborer et de mettre en œuvre une méthode d’analyse de la prosodie musicale fondée sur la réalité sonore d’enregistrements. Pour cela, nous utilisons l’outil informatique et plus spécifiquement des logiciels de traitement et d’analyse du son développés par les équipes Représentations Musicales et Analyse et synthèse des sons de l’Ircam. Ainsi, Audiosculpt et OpenMusic ont permis l’extraction des données de la prosodie musicale et la production de représentations adaptées à son analyse. Après avoir présenté notre méthode, nous l’appliquons à des morceaux représentatifs du punk, du rap et du ragga français. Grâce à la mise en lumière des spécificités prosodico-musicales des trois styles, nous montrons l’intérêt d’analyser la prosodie musicale pour différencier et caractériser des styles de musiques populaires utilisant des phrasés plus proches de la parole que du chant.

Des simulations de pluies menées sur des sols d'un transect de l'Afrique de l'Ouest ont permis de quantifier et comparer leurs ruissellements et érosions par domaines pédoclimatiques. La première partie décrit les milieux expérimentaux sahéliens, soudaniens et guinéens des vingt-six sites échelonnés des 15° N aux 05° N, présente le matériel, les protocoles et les méthodes d'analyses des données. La deuxième partie est consacrée à une représentation spatialisée des données en fonction des énergies érosives des averses ainsi qu'à une explication des évolutions des comportements en relation avec les traits pédologiques les plus efficients. Cette synthèse traite, avec les moyens informatiques et statistiques actuels, de données expérimentales collectées entre 1975 et 1980 ; il en ressort une nouvelle vision sur la distribution géographique des comportements des sols liée aux différenciations des domaines pédologiques et au développement d'organisations superficielles qui peuvent contrôler l'hydraulicité des sols. Ces organisations résultent de la dissipation des énergies des pluies sur des surfaces de stabilités variables. Ces organisations sont quasi pérennes dans le nord aride aux surfaces peu déclives, aux sols souvent sableux, à faible activité biologique et aux couverts végétaux contractés. Vers le sud humide, le couvert végétal devient continu et l'activité biologique y restaure une porosité donc une percolation profonde et un stockage hydrique dans des sols plus argileux. Cette étude à base expérimentale est une valorisation dynamique de documents cartographiques, mêmes anciens, pour des enseignants et les développeurs. Elle fournit aussi de nouvelles strates d'informations pouvant s'insérer dans des modèles à discrétisation spatiale et dans des systèmes d'information géographique.

International audience; The characterization of soil aggregate stability is an important step for assessing the susceptibility of soil to water erosion. A normalized international method has recently been proposed for estimating soil aggregate stability indexes (ISO/FDIS 10930, 2012), but extensive measurements of the soil aggregate stability for mapping erosion risks on the regional scale remain a fastidious enterprise. This paper explores three different approaches as an alternative to the normalized international measurements. The first, called the PTFs Approach, estimates aggregate stability indexes via elementary soil properties using multiple linear regression. The second one, called the RS Approach, estimates aggregate stability indexes via Laboratory (Lab) Visible-Near Infrared (Vis-NIR) spectra using multivariate linear regressions. The third, called the RS + PTFs Approach first used the Lab Vis-NIR spectra to predict the elementary soil properties using multivariate linear regressions, which are then used to predict the soil aggregate stability indexes using multiple linear regression. These tests were performed on a collection of 113 soil samples from the Mediterranean region of Northern Tunisia. Four soil aggregate stability indexes were considered: three indexes calculated using three disruptive tests that correspond to various wetting conditions and energies, and the fourth index was the mean of the first three. This study shows that Lab Vis-NIR spectroscopy may be used directly in multivariate regression models to estimate two soil aggregate stability indexes (R-val(2), between 0.52 and 0.57, RPD between 1.47 and 1.61) with accuracy comparable to the multiple linear models in the PTFs Approach. Further investigations on various soil types, especially those for which the soil aggregate stability indexes were strongly correlated to organic carbon content, are encouraged to extend the utility and applicability of Lab Vis-NIR spectroscopy as an alternative method for soil aggregate stability indexes estimates. (C) 2013 Elsevier B.V. All rights reserved.

Honey bee diet surveys require an accurate knowledge of the pollen supply and a rapid counting method for microscopic analyses. Referring to the literature, we aimed at reducing the number of pollen grains counted in order to decrease the time spent for each sample. For this, we compared counts on whole transects to alternative methods of counting by sub-sampling, using the non-acetolysed palynological method. For each pellet sample, a drop of a homogenized suspension was dried, degreased, and mounted onto a slide dressed with glycerol gelatin. The counting was performed through a digital camera fitted on a microscope. The study was carried out in two phases. Phase 1 was a test of slide homogeneity, carried out on a 10-slide set with one replicate. For each slide, we compared an exhaustive count of each present taxon on a whole transect divided in four quarters. Phase 2 was a search for an alternative counting method. The work was performed over the first six samples with replicates retaining exactly the same transect, but counting only one microscope field in three, then four, and finally one in five. Data analyses were carried out with Chi-square tests on taxa that were present in more than 5% of the sample. Phase 1 showed some cases of heterogeneity in microscope slides, leading to an error hazard when counting in a continuous mode up to a defined grain number. In phase 2, the comparison of alternative countings to full transects verified the linearity of the counting results. Suitable results were given by the reading method “one in three”. We improved the accuracy of this method for the particular case of samples containing large pollen grains, e.g., Zea mays, which are unevenly disseminated on the slide.; La evaluación de la dieta de la abeja de la miel requiere un conocimiento exacto del suministro de polen y un método de conteo rápido para los análisis microscópicos. En referencia a la literatura, tuvimos como objetivo reducir el número de granos de polen contados con el fin de disminuir el tiempo empleado para cada muestra. Para ello, se compararon los recuentos en transectos enteros con otros métodos de conteo mediante submuestreos usando el método palinológico no acetolisado. Para cada muestra de precipitado, se secó una gota de una suspensión homogeneizada, desengrasada y montada en un portaobjetos impregnado con gelatina de glicerol. El recuento se llevó a cabo a través de una cámara digital montada en un microscopio. El estudio se llevó a cabo en dos fases. Fase 1 fue una prueba de homogeneidad del portaobjetos, llevado a cabo en una serie de 10 portaobjetos con un replicado. Para cada portaobjetos, se comparó un recuento exhaustivo de cada taxón presente en todo un transecto dividido en cuatro cuartos. Fase 2 fue la búsqueda de un método de recuento alternativo. El trabajo se llevó a cabo en las primeras seis muestras con réplicas usando exactamente el mismo transecto, pero contando sólo un campo al microscopio de tres, luego cuatro, y finalmente uno de cada cinco. Los análisis de datos se llevaron a cabo con las pruebas de Chi-cuadrado sobre taxa que estaban presentes en más de 5% de la muestra. Fase 1 mostró algunos casos de heterogeneidad en los portaobjetos de microscopio, dando lugar a un riesgo de error cuando se cuentan en un modo continuo hasta un número definido de grano. En la fase 2, la comparación de recuentos alternativos para transectos completos verificó la linealidad de los resultados del recuento. Los resultados más adecuados se obtuvieron con el método de lectura “uno de cada tres”. Hemos mejorado la exactitud de este método para el caso particular de las muestras que contienen grandes granos de polen, por ejemplo, Zea mays, que se difunde de manera desigual en el portaobjetos.

International audience; The accurate determination of light absorption coefficients of particles in water, especially in very oligotrophic oceanic areas, is still a challenging task. Concentrating aquatic particles on a glass fiber filter and using the Quantitative Filter Technique (QFT) is a common practice. Its routine application is limited by the necessary use of high performance spectrophotometers, distinct problems induced by the strong scattering of the filters and artifacts induced by freezing and storing samples. Measurements of the sample inside a large integrating sphere reduce scattering effects and direct field measurements avoid artifacts due to sample preservation. A small, portable, Integrating Cavity Absorption Meter setup (QFT-ICAM) is presented, that allows rapid measurements of a sample filter. The measurement technique takes into account artifacts due to chlorophyll-a fluorescence. The QFT-ICAM is shown to be highly comparable to similar measurements in laboratory spectrophotometers, in terms of accuracy, precision, and path length amplification effects. No spectral artifacts were observed when compared to measurement of samples in suspension, whereas freezing and storing of sample filters induced small losses of water-soluble pigments (probably phycoerythrins). Remaining problems in determining the particulate absorption coefficient with the QFT-ICAM are strong sample-to-sample variations of the path length amplification, as well as fluorescence by pigments that is emitted in a different spectral region than that of chlorophyll-a.

Demographic surveys and censuses often record pregnancy-related deaths, defined as those occurring during the maternal risk period (pregnancy, delivery, and six weeks postpartum), but do not include cause of death. This study presents a method for estimating obstetric mortality from pregnancy-related deaths data. Calculations are based on multiple-decrement life tables, and data needed are simply age-specific fertility and mortality rates that are commonly available in Demographic and Health Survey (DHS) or census data, and an estimate of the relative risk of death from nonobstetric causes during the maternal risk period. The method is tested on 59 DHS surveys from Africa. Results show that, on average, less than half of the pregnancy-related deaths are attributable to obstetric causes. This proportion varies with the level of mortality and fertility, and in particular with the prevalence of HIV in the population.

One of the major characteristics of HIV-1 is its extreme genetic diversity. A key factor in assessing the sensitivity of a molecular-based assay measuring HIV-1 RNA viral load (VL) in plasma is its ability to detect/quantify all (or most of) relevant HIV-1 genetic subtype/recombinant forms accurately.This review provides an overview of the current commercially available quantitative real-time assays (the Abbott RealTime HIV-1, Roche TaqMan HIV-1 versions 1.0 and 2.0, BioMérieux Nuclisens EasyQ HIV-1, Siemens VERSANT HIV-1 RNA 1.0 kinetic PCR, and Biocentric Generic HIV Viral Load assays). For each assay, studies from 2005 to 2010 assessing the impact of HIV-1 genetic diversity on the reliability of HIV-1 RNA quantification are described.In light of HIV-1 genetic diversity, a general recommendation to favor one test over the other cannot categorically be made. Larger field evaluations of HIV-1 RNA assays should be conducted in areas where HIV-1 genetic diversity is the highest. The large-scale implementation of HIV-1 VL testing is urgently required in the developing world to change HIV infection from a likely death sentence into a manageable chronic infection, as done in Northern countries.

International audience; Reliable measurements of the 3D distribution of Leaf Area Density (LAD) in forest canopy are crucial for describing and modelling microclimatic and eco-physiological processes involved in forest ecosystems functioning. To overcome the obvious limitations of direct measurements, several indirect methods have been developed, including methods based on Terrestrial LiDAR scanning (TLS). This work focused on various LAD estimators used in voxel-based approaches. LAD estimates were compared to reference measurements at branch scale in laboratory, which offered the opportunity to investigate in controlled conditions the sensitivity of estimations to various factors such as voxel size, distance to scanner, leaf morphology (species), type of scanner and type of estimator. We found that all approaches to retrieve LAD estimates were highly sensitive to voxel size whatever the species or scanner and to distance to the FARO scanner. We provided evidence that these biases were caused by vegetation heterogeneity and variations in the effective footprint of the scanner. We were able to identify calibration functions that could be readily applied when vegetation and scanner are similar to those of the present study. For different vegetation and scanner, we recommend replicating our method, which can be applied at reasonable cost. While acknowledging that the test conditions in the laboratory were very different from those of the measurements taken in the forest (especially in terms of occlusion), this study revealed existence of strong biases, including spatial biases. Because the distance between scanner and vegetation varies in field scanning, these biases should occur in a similar manner in the field and should be accounted for in voxel-based methods but also in gap-fraction methods. This article belongs to the Special Issue Remote Sensing Techniques for Precision Forestry.

当研究ノートは、現在まで著者が使用した外国語教授法と教材・結果を分析し、外国語教授についてより効果的な方法についての考え方の基礎となる部分を明らかにする試みである。この作業の中で最近の一般的な言語習得論、特に第二言語習得論の考え方にのっとり、セオリーの分析方法の開発を試みる。自身の30年以上の外国語教授の経験（4つの国での4つの異なる言語）・第二言語習得論講義・これまでの研究成果により、現在の外国語教授について、セオリーと実際の間の関係と応用の仕方について総括をする。著者は、外国語学習（教授）における現在の世界の関心事である「コミュニケーション能力」や「外国語の口頭運用能力」を培うべく、いくつかのメソドを使用してきた。1つ目のダイレクトメソド（直接法）と呼ばれる方法は、自身の外国語学習経験もあり、初期のころ使用した。次いで、機能的シラバスによるThreshold/SAPLとMethode Immediateを導入した。ところで、第二言語習得論において大きな影響を与えたのはスティーブン・クラッシェンと彼のナチュラルアプローチである。第二言語習得においては、セオリー上も実際も、彼の5つの仮説と6つ目の脳の「響き合い」説が、外国語教授法の分析上、シンプルで使いやすいガイドラインをなしている。しかし、反対に、外国語教授の実際においても、セオリーの評価することが可能となるわけだが、本来ならば厳重にコントロールされた条件下において、そのセオリーの評価が行われるべきである。すなわち、ここでは、実際をセオリーに照らし合わせてみる、と同時に、逆にセオリーを実際に照らし合わせるのである。

Soils are important components of ecosystem and their functioning is of great importance for human well-being. Describing, understanding, foreseeing, and controlling biological activities and functions in soil in the context of global change are major objectives for scientists. Modelling soil bioturbation by soil engineers is of great importance although it is faced with the difficulty to describe the soil physical environment. Creating a model of a soil leads to complexity problems: a soil is a multi-scale heterogeneous, three-dimensional and dynamic environment that cannot be modelled and simulated without defining a suitable and optimized representation and taking assumptions about the studied system. An approach based on fractal theory (often used in soil sciences) was chosen to model such a real complex environment; it was integrated into a multi-agent system (MAS). MAS allows to simulate situated agents (earthworms) in an virtual world. The originality of this present MAS is that it is based on a dynamic environment which builds itself, on demand, according to an abstract canvas tree and agent movements. The aim of this paper is to present this approach and its originality, and to describe the model and the simulator. A theoretical view of the approach is given and applied to a case study: the impact of earthworms on soil structure and organic matter dynamics.

Selective dissolution methods have been largely used to get insight on trace element association with solid phases. Modern instrumental techniques offer many tools to test the validity of selective dissolution methods and should be systematically used to this end. The association of trace elements with Fe- and Mn-oxides in soil nodules has been studied here by electron probe microanalysis. The results were compared with findings from an earlier study on selective dissolution of the same nodules by hydroxylamine hydrochloride, acidified hydrogen peroxide, and Na-citrate-bicarbonate-dithionite. Electron probe microanalysis results were consistent with previous findings using selective dissolution and showed that P, As and Cr were mainly present in Fe-oxides, while Co was mainly associated with Mn-oxide phases. These results support the applicability of the studied selective dissolution methods for fractionation of trace elements in soils and sediments containing appreciable amounts of Fe and Mn-oxide phases.

International audience; This note describes a new technique for in situ sampling of fine particulate matter (PM) including colloids in natural environments. The technique is based on a microlysimeter which is easy to move between field and laboratory and can be routinely used for in situ monitoring. The design of the device aims at limiting bias and artefacts encountered with current sampling methods based on successive field collection of liquid samples, transport, storage and filtration in the laboratory. Samples are directly collected on transmission electron microscopy (TEM) grids, thus totally eliminating the modifications classically due to handling of samples from collection to analysis. Detailed physical and chemical microscopic studies of individual particles can then be performed in order to fully characterize PM in natural media such as soil solutions, atmospheric fallout, rainfall and any aquatic system. This technique can be applied in a number of research fields, such as the characterization and determination of pollution vectors, the tracing of sources of emissions, or investigations on particle interactions.

The use of DNA microarrays for detection and identification of bacteria and genes of interest from various environments (e.g. soil, sediment, water column...) is a major challenge for microbiologists working on functional diversity. So far, most of the genomic methods that have been described rely on the use of taxonomic markers (such as 16S rRNA) that can be easily amplified by PCR prior to hybridization on microarrays. However, taxonomical markers are not always informative on the functions present in these bacteria. Moreover, genes for which sequence database is limited or that lack any conserved regions will be difficult to amplify and thus to detect in unknown samples. Furthermore, PCR amplification often introduces biases that lead to inaccurate analysis of microbial communities. An alternative solution to overcome these strong limitations is to use genomic DNA (gDNA) as target for hybridisation, without prior PCR amplification. Though hybridization of gDNA is already used for comparative genome hybridization or sequencing by hybridization, yet to the high cost of tiling strategies and important data filtering, its adaptation for use in environmental research poses great challenges in terms of specificity, sensitivity and reproducibility of hybridization. Considering the very faint number of publications that have described hybridization of gDNA to microarrays for environmental applications, we confront in this review the different approaches that have been developed so far, and propose alternative strategies that may contribute to improve the development of microarrays for studying the microbial genetic structure and composition of samples of high environmental and ecological value.

Blé dur : vers une nouvelle approche dans la détermination du taux de mitadinage. Colloque ACTIA sur les UMT

Elaboration d'outils et méthodes d'analyse de la dynamique des espaces cultivés. Groupe de Travail Captage ONEMA

Agaricus is a genus of saprobic basidiomycetes including species of nutritional and medicinal interest. Historically the temperate species have been grouped into eight classical sections. Recent phylogenetic analyses however, revealed that two-thirds of the tropical taxa do not cluster in these sections, but form exclusively tropical clades. Seven (TR I to TR VII) strongly supported tropical clades have been revealed and it was hypothesized that clade TR I might represent Agaricus section Brunneopicti. This section was initially characterized by the presence of punctiform squamules, the remains of the veil, on the pileus and stipe. The present morphological study and phylogenetic ML, MP and Bayesian analyses based on ITS1+2 sequences show that clade TR I corresponds to Agaricus section Brunneopicti and includes 16 taxa grouped in four strongly supported subclades and two isolated branches. The six species with punctiform squamules which initially characterized the section constitute one of these subclades. We propose the new replacement name Agaricus brunneopunctatus for the illegitimate name Agaricus brunneopictus. All 16 species are discussed, full descriptions are provided for five, among them, A. brunneosquamulosus, A. niveogranulatus, A. sordidocarpus and A. toluenolens are described as new species. We also report on certain members of section Brunneopicti traits which generally characterize species belonging to other sections. These shared characters raise the issue of their origin and complicate the systematics and the identification of the tropical Agaricus species. An artificial dichotomous key is presented for species identification. Section Brunneopicti is the first reconstructed section of tropical Agaricus. Its known geographical distribution range is strictly palaeotropical. We predict that the species richness of other somewhat forgotten or new tropical sections will also increase in coming years.

National audience; Les matériaux de référence, certifiés ou non, sont indispensables pour développer une nouvelle méthode d’analyse, la valider et vérifier la justesse d’une méthode en production. Les matériaux de référence certifiés existants sur le marché pour l’analyse des éléments minéraux dans les végétaux sont rarement totalement adaptés à une problématique : ils peuvent avoir une matrice éloignée de la matrice des échantillons à analyser; souvent, seulement quelques-uns des éléments cibles ont des valeurs certifiées, ils sont disponibles en petites quantités (de 15 g à 60 g) pour des tarifs élevés et il y a un risque fort de ne plus pouvoir s’approvisionner lorsque le producteur de l’échantillon a totalement écoulé son stock. Dans le cadre de son implication dans des projets de suivi à long terme de placettes forestières, l’Unité de Service et de Recherche en Analyses Végétales et Environnementales de l’INRA (USRAVE) a décidé d’élaborer un échantillon de référence certifié d’aiguilles d’épicéa pour l’analyse des éléments majeurs et en traces. Nous présentons ici la conception de cet échantillon, sa préparation ainsi que les précautions prises et enfin l’élaboration des plans d’expérience de certification.

National audience; L’étape de préparation des échantillons est une étape cruciale de l’analyse. Toutes les manipulations réalisées doivent permettre de conserver l’intégrité de l’échantillon et ne pas induire de perte ou de contamination en éléments d’intérêt. Une précédente étude a mis en évidence les contaminations pouvant être apportées par l’utilisation des broyeurs. Il est apparu que le broyeur M20 pouvait être contaminant en Cr et Ni pour les végétaux abrasifs (type molinie ou grains). Or le M20 a l’avantage d’être refroidi (diminuant le risque de perte d’éléments volatils) et d’être facilement manipulable et lavable (diminuant le risque de contaminations croisées). Le fournisseur ne propose pas de revêtements adaptés à nos besoins. Nous avons identifié une entreprise pouvant réaliser la transformation de nos M20 en remplaçant les parties en contact avec l’échantillon en inox (cuve, couteaux, visserie) par un alliage de titane. Dans cet article nous donnons les références complètes afin que cette expérience puisse bénéficier à d’autres laboratoires.

The abandonment of land is a global problem with environmental and socioeconomic implications. An approach to assess the relationship between land abandonment and a large set of indicators was illustrated in the present study by using data collected in the framework of the European Union DESIRE research project from 808 field sites located in 10 study sites in the Mediterranean region, Eastern Europe, Latin America, Africa and Asia. A total of 48 indicators provided information for biophysical conditions and socioeconomic characteristics measured at the plot level. The selected indicators refer to farm characteristics (family status, land tenure, present and previous types of land-use, soil depth, slope gradient, tillage operations) and to site-specific characteristics including annual rainfall, rainfall seasonality and water availability. Classes were designated for each indicator and a sensitivity score was assigned to each class based on existing research or empirically assessing the importance of each indicator to the land abandonment issue. Questionnaires for each process of land degradation were prepared and data were collected at field site level in collaboration with land users. Based on correlation statistics and multivariate analyses more than ten indicators out of 48 resulted as significant in affecting land abandonment in the studied field sites. Among them, the most important were rainfall seasonality, elderly index, land fragmentation, farm size, selected soil properties, and the level of policy implementation. Results contribute to the development of appropriate tools for assessing the effectiveness of land management practices for contrasting land abandonment.

International audience; Given the high numbers of deaths and the debilitating nature of diseases caused by the use of unclean water it is imperative that we have an understanding of the factors that control the dispersion of water borne pathogens and their respective indicators. This is all the more important in developing countries where significant proportions of the population often have little or no access to clean drinking water supplies. Moreover, and notwithstanding the importance of these bacteria in terms of public health, at present little work exists on the persistence, transfer and proliferation of these pathogens and their respective indicator organisms e.g. fecal indicator bacteria (FIB) such as Escherichia coli and fecal coliforms in humid tropical systems, such as are found in South East Asia or in the tropical regions of Africa. Both FIB and the waterborne pathogens they are supposed to indicate are particularly susceptible to shifts in water flow and quality and the predicted increases in rainfall and floods due to climate change will only exacerbate the problems of contamination. This will be furthermore compounded by the increasing urbanization and agricultural intensification that developing regions are experiencing. Therefore, recognizing and understanding the link between human activities, natural process and microbial functioning and their ultimate impacts on human health are prerequisites for reducing the risks to the exposed populations. Most of the existing work in tropical systems has been based on the application of temperate indicator organisms, models and mechanisms regardless of their applicability or appropriateness for tropical environments. Here we present a short review on the factors that control FIB dynamics in temperate systems and discuss their applicability to tropical environments. We then highlight some of the knowledge gaps in order to stimulate future research in this field in the tropics.