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1. Target enrichment sequencing coupled with GWAS identifies MdPRX10 as a candidate gene in the control of budbreak in apple

Author

Agropolis Fondation, Soriano, Álex [0000-0003-1406-4606], Rivallan, Ronan [0000-0001-6990-1606], Vignes, Hélène [0000-0002-8725-2467], Farrera, Isabelle [0000-0002-1210-5032], Huettel, Bruno [0000-0001-7165-1714], Falavigna, Vítor da Silveira [0000-0001-8466-8638], Coupel-Ledru, Aude [0000-0003-2097-5924], Segura, Vincent [0000-0003-1860-2256], Sarah, Gautier [0000-0001-5179-972X], Dufayard, Jean-François [0000-0002-7427-6822], Sidibe-Bocs, Stéphanie [0000-0001-7850-4426], Costes, Evelyne [0000-0002-4848-2745], Watson, Amy E., Guitton, Baptiste, Soriano, Álex, Rivallan, Ronan, Vignes, Hélène, Farrera, Isabelle, Huettel, Bruno, Arnaiz, Catalina, Falavigna, Vítor da Silveira, Coupel-Ledru, Aude, Segura, Vincent, Sarah, Gautier, Dufayard, Jean-François, Sidibe-Bocs, Stéphanie, Costes, Evelyne, Andrés, Fernando, Agropolis Fondation, Soriano, Álex [0000-0003-1406-4606], Rivallan, Ronan [0000-0001-6990-1606], Vignes, Hélène [0000-0002-8725-2467], Farrera, Isabelle [0000-0002-1210-5032], Huettel, Bruno [0000-0001-7165-1714], Falavigna, Vítor da Silveira [0000-0001-8466-8638], Coupel-Ledru, Aude [0000-0003-2097-5924], Segura, Vincent [0000-0003-1860-2256], Sarah, Gautier [0000-0001-5179-972X], Dufayard, Jean-François [0000-0002-7427-6822], Sidibe-Bocs, Stéphanie [0000-0001-7850-4426], Costes, Evelyne [0000-0002-4848-2745], Watson, Amy E., Guitton, Baptiste, Soriano, Álex, Rivallan, Ronan, Vignes, Hélène, Farrera, Isabelle, Huettel, Bruno, Arnaiz, Catalina, Falavigna, Vítor da Silveira, Coupel-Ledru, Aude, Segura, Vincent, Sarah, Gautier, Dufayard, Jean-François, Sidibe-Bocs, Stéphanie, Costes, Evelyne, and Andrés, Fernando

Abstract

The timing of floral budbreak in apple has a significant effect on fruit production and quality. Budbreak occurs as a result of a complex molecular mechanism that relies on accurate integration of external environmental cues, principally temperature. In the pursuit of understanding this mechanism, especially with respect to aiding adaptation to climate change, a QTL at the top of linkage group (LG) 9 has been identified by many studies on budbreak, but the genes underlying it remain elusive. Here, together with a dessert apple core collection of 239 cultivars, we used a targeted capture sequencing approach to increase SNP resolution in apple orthologues of known or suspected A. thaliana flowering time-related genes, as well as approximately 200 genes within the LG9 QTL interval. This increased the 275 223 SNP Axiom® Apple 480 K array dataset by an additional 40 857 markers. Robust GWAS analyses identified MdPRX10, a peroxidase superfamily gene, as a strong candidate that demonstrated a dormancy-related expression pattern and down-regulation in response to chilling. In-silico analyses also predicted the residue change resulting from the SNP allele associated with late budbreak could alter protein conformation and likely function. Late budbreak cultivars homozygous for this SNP allele also showed significantly up-regulated expression of C-REPEAT BINDING FACTOR (CBF) genes, which are involved in cold tolerance and perception, compared to reference cultivars, such as Gala. Taken together, these results indicate a role for MdPRX10 in budbreak, potentially via redox-mediated signaling and CBF gene regulation. Moving forward, this provides a focus for developing our understanding of the effects of temperature on flowering time and how redox processes may influence integration of external cues in dormancy pathways.

Published
2024

2. Target enrichment sequencing coupled with GWAS identifies MdPRX10 as a candidate gene in the control of budbreak in apple

Author

Watson, Amy E., Guitton, Baptiste, Soriano, Alexandre, Rivallan, Ronan, Vignes, Hélène, Farrera, Isabelle, Huettel, Bruno, Arnaiz, Catalina, da Silveira Falavigna, Vítor, Coupel-Ledru, Aude, Segura, Vincent, Sarah, Gautier, Dufayard, Jean François, Sidibe-Bocs, Stéphanie, Costes, Evelyne, Andres, Fernando, Watson, Amy E., Guitton, Baptiste, Soriano, Alexandre, Rivallan, Ronan, Vignes, Hélène, Farrera, Isabelle, Huettel, Bruno, Arnaiz, Catalina, da Silveira Falavigna, Vítor, Coupel-Ledru, Aude, Segura, Vincent, Sarah, Gautier, Dufayard, Jean François, Sidibe-Bocs, Stéphanie, Costes, Evelyne, and Andres, Fernando

Abstract

The timing of floral budbreak in apple has a significant effect on fruit production and quality. Budbreak occurs as a result of a complex molecular mechanism that relies on accurate integration of external environmental cues, principally temperature. In the pursuit of understanding this mechanism, especially with respect to aiding adaptation to climate change, a QTL at the top of linkage group (LG) 9 has been identified by many studies on budbreak, but the genes underlying it remain elusive. Here, together with a dessert apple core collection of 239 cultivars, we used a targeted capture sequencing approach to increase SNP resolution in apple orthologues of known or suspected A. thaliana flowering time-related genes, as well as approximately 200 genes within the LG9 QTL interval. This increased the 275 223 SNP Axiom® Apple 480 K array dataset by an additional 40 857 markers. Robust GWAS analyses identified MdPRX10, a peroxidase superfamily gene, as a strong candidate that demonstrated a dormancy-related expression pattern and down-regulation in response to chilling. In-silico analyses also predicted the residue change resulting from the SNP allele associated with late budbreak could alter protein conformation and likely function. Late budbreak cultivars homozygous for this SNP allele also showed significantly up-regulated expression of C-REPEAT BINDING FACTOR (CBF) genes, which are involved in cold tolerance and perception, compared to reference cultivars, such as Gala. Taken together, these results indicate a role for MdPRX10 in budbreak, potentially via redox-mediated signaling and CBF gene regulation. Moving forward, this provides a focus for developing our understanding of the effects of temperature on flowering time and how redox processes may influence integration of external cues in dormancy pathways.

Published
2024

3. Target enrichment sequencing coupled with GWAS identifies MdPRX10 as a candidate gene in the control of budbreak in apple

Author

Watson, Amy E., primary, Guitton, Baptiste, additional, Soriano, Alexandre, additional, Rivallan, Ronan, additional, Vignes, Hélène, additional, Farrera, Isabelle, additional, Huettel, Bruno, additional, Arnaiz, Catalina, additional, Falavigna, Vítor da Silveira, additional, Coupel-Ledru, Aude, additional, Segura, Vincent, additional, Sarah, Gautier, additional, Dufayard, Jean-François, additional, Sidibe-Bocs, Stéphanie, additional, Costes, Evelyne, additional, and Andrés, Fernando, additional

Published
2024
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6. Biome Reconstruction from Pollen and Plant Macrofossil Data for Africa and the Arabian Peninsula at 0 and 6000 Years

Author

Jolly, Dominique, Prentice, I. Colin, Bonnefille, Raymonde, Ballouche, Aziz, Bengo, Martin, Brenac, Patrice, Buchet, Guillaume, Burney, David, Cazet, Jean-Pierre, Cheddadi, Rachid, Edorh, Therese, Elenga, Hilaire, Elmoutaki, Saida, Guiot, Joel, Laarif, Fouzia, Lamb, Henry, Lezine, Anne-Marie, Maley, Jean, Mbenza, Muaka, Peyron, Odile, Reille, Maurice, Reynaud-Farrera, Isabelle, Riollet, Guy, Ritchie, Jim C., Roche, Emile, Scott, Louis, Ssemmanda, Immaculate, Straka, Herbert, Umer, Mohammed, van Campo, Elise, Vilimumbalo, Sikiminywa, Vincens, Annie, and Waller, Martyn

Published
1998

7. Statistical Approach to Assess Chill and Heat Requirements of Olive Tree Based on Flowering Date and Temperatures Data: Towards Selection of Adapted Cultivars to Global Warming

Author

Abou-Saaid, Omar, primary, El Yaacoubi, Adnane, additional, Moukhli, Abdelmajid, additional, El Bakkali, Ahmed, additional, Oulbi, Sara, additional, Delalande, Magalie, additional, Farrera, Isabelle, additional, Kelner, Jean-Jacques, additional, Lochon-Menseau, Sylvia, additional, El Modafar, Cherkaoui, additional, Zaher, Hayat, additional, and Khadari, Bouchaib, additional

Published
2022
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9. Distinct roles of MADS-box complexes in the control of the dormancy cycle in apple

Author

Falavigna, Vitor, Severing, Edouard, Lai, Xuelei, Hugouvieux, Véronique, Farrera, Isabelle, Garighan, Julio, Parcy, Francois, Zubieta, Chloe, Coupland, George, Costes, Evelyne, Andrés, Fernando, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Max Planck Institute for Plant Breeding Research (MPIPZ), Physiologie cellulaire et végétale (LPCV), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Grenoble Alpes (UGA)

Subjects
[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology
Abstract

International audience; Dormancy is an essential developmental program that allows tree adaptation to low temperatures by inducing a bud resting state until the end of the winter. After a prolonged cold period, buds reactivate growth in response to the warm temperatures of the spring. In many Rosaceae species, it is believed that a group of genes encoding MADS-box transcription factors controls dormancy cycle. These genes are similar to SHORT VEGETATIVE PHASE (SVP) from Arabidopsis thaliana and often referred as DORMANCY-ASSOCIATED MADS-BOX (DAM) genes. Although their potential role in tree phenology, the precise function and the mode of action of SVP-like genes during the dormancy cycle are still unknown. By making use of apple tree (Malus x domestica) as a model, we have investigated the function of rosaceous SVP-like genes. We found that most of them show patterns of expression that correlate with particular phases of the dormancy cycle. However, MdSVPa, a MADS-box gene that represses budbreak when it is overexpressed in apple, was ectopically expressed during the whole cycle. We also identified several potential complexes formed by apple MADS-box proteins and interestingly, only complexes containing MdSVPa were able to bind a DNA probe carrying two CArG boxes. In the light of these results, we hypothesized that MdSVPa is an essential component of the transcriptional complexes that regulate dormancy cycle. To unravel the roles of these complexes, we have made use of DNA Affinity Purification followed by massive parallel sequencing (DAP-seq). Our DAP-seq analyses showed that MdSVPa-containing complexes bind to gene targets involved in biological processes that could affect dormancy cycle, such as hormone signaling, cell wall and lignin modifications, sugar transport, cell cycle and flower development, among others. These results allow us to build a tentative model describing distinct roles of MADS-box complexes during the dormancy cycle in apple tree.

Published
2021

10. The Identification of Small RNAs Differentially Expressed in Apple Buds Reveals a Potential Role of the Mir159-MYB Regulatory Module during Dormancy

Author

Garighan, Julio, Dvorak, Etienne, Estevan, Joan, Loridon, Karine, Huettel, Bruno, Sarah, Gautier, Farrera, Isabelle, Leclercq, Julie, Grynberg, Priscila, Coiti Togawa, Roberto, Mota do Carmo Costa, Marcos, Costes, Evelyne, and Andrés, Fernando

Subjects
dormancy, small RNAs, QK1-989, fungi, Botany, food and beverages, apple tree, miR159, Article
Abstract

Winter dormancy is an adaptative mechanism that temperate and boreal trees have developed to protect their meristems against low temperatures. In apple trees (Malus domestica), cold temperatures induce bud dormancy at the end of summer/beginning of the fall. Apple buds stay dormant during winter until they are exposed to a period of cold, after which they can resume growth (budbreak) and initiate flowering in response to warmer temperatures in spring. It is well-known that small RNAs modulate temperature responses in many plant species, but however, how small RNAs are involved in genetic networks of temperature-mediated dormancy control in fruit tree species remains unclear. Here, we have made use of a recently developed ARGONAUTE (AGO)-purification technique to isolate small RNAs from apple buds. A small RNA-seq experiment resulted in the identification of 17 micro RNAs (miRNAs) that change their pattern of expression in apple buds during dormancy. Furthermore, the functional analysis of their predicted target genes suggests a main role of the 17 miRNAs in phenylpropanoid biosynthesis, gene regulation, plant development and growth, and response to stimulus. Finally, we studied the conservation of the Arabidopsis thaliana regulatory miR159-MYB module in apple in the context of the plant hormone abscisic acid homeostasis.

Published
2021

13. Statistical Approach to Assess Chill and Heat Requirements of Olive Tree Based on Flowering Date and Temperatures Data: Towards Selection of Adapted Cultivars to Global Warming.

Author

Abou-Saaid, Omar, El Yaacoubi, Adnane, Moukhli, Abdelmajid, El Bakkali, Ahmed, Oulbi, Sara, Delalande, Magalie, Farrera, Isabelle, Kelner, Jean-Jacques, Lochon-Menseau, Sylvia, El Modafar, Cherkaoui, Zaher, Hayat, and Khadari, Bouchaib

Subjects
OLIVE, GLOBAL warming, FLOWERING trees, FRUIT trees, CULTIVARS, PARTIAL least squares regression
Abstract

Delineating chilling and forcing periods is one of the challenging topics in understanding how temperatures drive the timing of budburst and bloom in fruit tree species. Here, we investigated this question on olive trees, using flowering data collected over six years on 331 cultivars in the worldwide collection of Marrakech, Morocco. Using a Partial Least Squares approach on a long-term phenology (29 years) of 'Picholine Marocaine' cultivar, we showed that the relevance of delineating the chilling and forcing periods depends more on the variability of inter-annual temperatures than on the long-term datasets. In fact, chilling and forcing periods are similar between those delineated by using datasets of 29 years and those of only 6 years (2014–2019). We demonstrated that the variability of inter-annual temperatures is the main factor explaining this pattern. We then used the datasets of six years to assess the chill and heat requirements of 285 cultivars. We classified Mediterranean olive cultivars into four groups according to their chill requirements. Our results, using the Kriging interpolation method, indicated that flowering dates of most of these cultivars (92%) were governed by both chilling and forcing temperatures. Our investigations provided first insights to select adapted cultivars to global warming. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2022
Full Text
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15. Study of the temperature-mediated transcriptional and post-transcriptional regulation of dormancy and budbreak in apple

Author

Garighan, Julio, Farrera, Isabelle, Sarah, Gautier, Grynberg, Priscila, Togawa, Roberto, Costa, Marcos, Huettel, Bruno, Costes, Evelyne, Andrés, Fernando, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia [Brasília], and Max Planck Institute for Plant Breeding Research (MPIPZ)

Subjects
[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology
Abstract

International audience; Dormancy is an adaptive mechanism that enables plants to survive unfavorable climatic conditions and allows budbreak and flowering to occur only when the conditions are permissive. This resting stage is defined by the absence of visible growth. In apple (Malus x domestica Borkh.) and many other Rosaceae species, winter bud dormancy can be divided in at least two phases: endo- and eco-dormancy. During endo-dormancy, growth repression is controlled by internal cues and it is released by long periods of cold (chilling requirement). Then, buds undergo into eco-dormancy phase and become competent to budbreak in response to warm temperatures. In the model plant species Arabidopsis thaliana, changes in ambient temperature regulate flowering time through mechanisms that involved the alternative splicing (AS) of MADS-box genes. We have hypothesized that a similar mechanism could operate to control the temperature dependent transition between endo- and eco-dormancy phases in apple tree. In order to address this question, we have performed a RNA-seq time-course experiment on buds of apple tree (cv. Golden delicious) during the dormancy cycle. RNA from time-points covering the endo- to eco-dormancy transition were sequenced and changes in gene expression and AS quantified. Our bioinformatics analyses showed that pathways related to cell wall modifications, cell cycle, chromatin silencing and hormones, among others, were affected during the transition between endo- to eco-dormancy. Moreover, we implemented a bioinformatics pipeline to identify differential alternatively spliced genes associated to this developmental transition. Here, we will show how these data are instrumental to isolate candidate genes potentially involved in dormancy-cycle control and describe mechanisms of post-transcriptional regulation involved in fruit tree development.

Published
2020

16. Unraveling the role of MADS transcription factor complexes in apple tree dormancy using sequential DAP-seq

Author

Falavigna, Vítor da Silveira, primary, Severing, Edouard, additional, Lai, Xuelei, additional, Estevan, Joan, additional, Farrera, Isabelle, additional, Hugouvieux, Véronique, additional, Revers, Luís Fernando, additional, Zubieta, Chloe, additional, Coupland, George, additional, Costes, Evelyne, additional, and Andrés, Fernando, additional

Published
2021
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17. Fruit Tree adaptation to environmental stresses: new challenges for studying tree physiological responses and for breeding

Author

Costes, Evelyne, Pallas, Benoit, Andres-Lalaguna, Fernando, Coupel-Ledru, Aude, Falavigna, Vitor, Kelner, Jean-Jacques, Farrera, Isabelle, Delalande, Magalie, Legave, Jean-Michel, Regnard, Jean-Luc, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
floraison induite, Vegetal Biology, stress environnemental, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, efficience d'utilisation de l'eau, adaptation au changement climatique, Biologie végétale, dormance, arbre fruitier
Abstract

As all perennial plants, fruit trees must cope with multiple environmental stresses during their life. The current progressive increase in air temperature makes fruit trees particularly fragile because of their long life during which they might accumulate stresses and the long duration of the selection process to search for more adapted materials. The progressive temperature increase directly impacts the tree phenology, especially their flowering time which results from the regulation of dormancy duration. The ongoing changes endanger the flower quality and the synchronicity of flowering among varieties that is necessary for cross-pollination. Moreover, during summer, despite the irrigation of most orchards, trees must face periods of soil water deficit and/or high temperatures during which the regulation of stomatal closure may impact the tree water use efficiency. Fruit development also depends on the climatic conditions during formation and maturation whereas floral induction occurs for the next season. In this talk, we will briefly review the threats for fruit production and the physiological mechanisms possibly involved that would deserve deep investigations for provid ing a more comprehensive knowledge of fruit tree temperature perception and responses. This knowledge is indeed crucial to draw strategies for the creation of new plant material better adapted to future climatic conditions.

Published
2018

18. Control of bud dormancy process in apple: a genetic-molecular study

Author

Falavigna, Vitor, GUITTON, Baptiste, Ahier, Célia, Farrera, Isabelle, Kelner, Jean-Jacques, Soriano, Alexandre, Revers, Luis Fernando, Costes, Evelyne, Andrés, Fernando, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento [Brasil] (MAPA), Governo do Brasil-Governo do Brasil, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], DAM genes, Apple, Dormancy, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2018

19. Characterization of dormancy-associated and flowering-time related mads-box transcription factors in apple

Author

Falavigna, Vitor, GUITTON, Baptiste, Farrera, Isabelle, Kelner, Jean-Jacques, Revers, Luis Fernando, Costes, Evelyne, Andrés, Fernando, ProdInra, Migration, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento [Brasil] (MAPA), and Governo do Brasil-Governo do Brasil

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract

National audience; Dormancy is an adaptive mechanism that enables plants to survive unfavorable climatic conditions. The production of temperate fruits, such as apple (Malus x domestica Borkh.), is closely related to bud dormancy, which is triggered by exposure to cold. Therefore, the predicted impact of the ongoing climate changes will result in difficulties for apple production. The present work aims to prospect and characterize genes encoding Dormancy-Associated (DAM) and flowering-time related MADS-box transcription factors in the dormancy process of apple. On one hand, we are exploring the allelic variation present in genes involved in bud dormancy and flowering control in an apple core collection. We have developed a target capture sequencing approach and used it for genome-wide association studies (GWAS). On the other hand, we are identifying protein-protein interactions between DAM and flowering-time proteins by yeast-two-hybrid and searching for their transcriptional targets. By making use of these approaches, we have re-defined and narrow down genomic regions associated to bud dormancy. Additionally, we have identified potential transcriptional complexes containing DAM and flowering-time related proteins that act in apple bud dormancy. These studies contribute to better characterize key processes in dormancy molecular control, as well as to identify possible biotechnological resources for breeding programs.

Published
2018

21. Historical phenological responses in apple to contrasting warming contexts may clarify future crucial responses in Europe

Author

Legave, Jean-Michel, Farrera, Isabelle, El Yaacoubi, Adnane, Malagi, Gustavo, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Architecture et Fonctionnement des Espèces Fruitières [AGAP] (AFEF), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Moulay Ismail (UMI), Faculdade de Agronomia, Universidade Federal de Pelotas = Federal University of Pelotas (UFPel), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), and Université de Moulay Ismail (UMI)

Subjects
Vegetal Biology, dormancy, changement de température, brésil, fungi, pommier, food and beverages, dormancy breaking, europe de l'ouest, levée de dormance, phenology, dormance, phénologie, modelling, maroc, modèle phénologique, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, apple tree, adaptation au changement climatique, date de floraison, Biologie végétale, modélisation
Abstract

UMR AGAP - équipe AFEF - Architecture et fonctionnement des espèces fruitières; Phenological responses to warming in temperate fruit trees have rarely been investigated in contrasting warming contexts. This framework is appropriate for highlighting varying responses that would combine chill accumulation declines and heat accumulation increases. A comprehensive overview of historical responses might clarify crucial future responses in the warmest European regions. To examine this issue, a dataset was constituted in apple from flowering dates collected for main BBCH stages in contrasting temperate regions of Western Europe and in different mild regions (Northern Morocco, Southern Brazil). Multiple change-point models were applied to series of flowering date, flowering duration and temperature, aiming to statistically analyse both flowering responses and temperature changes. Modelling of flowering date was used to understand the determinisms of warming responses. In addition, regional differences in dormancy dynamic were characterized by forcing tests. Statistical analysis provided an overview of flowering date responses at global scale, highlighting flowering advances, mainly in Europe and Morocco, but also stationary flowering date series in Brazilian and French Mediterranean regions. Modelling analysis supported the notion that flowering advances are due to heat accumulation increases, explained by marked warming during ecodormancy. Later dormancy releases due to chill declines were also supported in Europe and may explain, in long term, stationary flowering dates in the French Mediterranean region. While the flowering duration series were stationary whatever the region, the flowering duration was far longer in Moroccan and Brazilian regions compared to European. This was linked to contrasting differences in dormancy dynamic observed between these mild and temperate regions. Dormancy release was inadequate in mild due to poor chill accumulation, leading to extended flowering durations. Since later dormancy releases would already have significant impacts on flowering date in Europe, new crucial warming responses, such as extended flowering durations, could be experienced especially in Mediterranean regions in near future.

Published
2016

22. Historical phenological responses in apple tree to contrasting warming contexts may clarify future crucial responses in Europe

Author

Legave, Jean-Michel, Guédon, Yann, Malagi, Gustavo, El Yaacoubi, Adnane, Bonhomme, Marc, Farrera, Isabelle, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Faculdade de Agronomia, Universidade Federal de Pelotas = Federal University of Pelotas (UFPel), Université Moulay Ismail (UMI), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)

Subjects
Vegetal Biology, pommier, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, europe, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Biologie végétale, phénologie, Europe
Abstract

UMR AGAP - équipe AFEF - Architecture et fonctionnement des espèces fruitières; National audience

Published
2016

23. A la recherche de méthodes alternatives aux tests biologiques classiques pour la détermination de la date de sortie d'endodormance, la quête du haut débit par le Groupe de Travail Dormance de Perpheclim et d'ODS

Author

Bonhomme, Marc, Charpentier, Jean-Paul, Segura, Vincent, Pâques, Luc, Audergon, Jean Marc, Quero-Garcia, José, Dirlewanger, Elisabeth, Beauvieux, Rémi, Wenden, Bénédicte, Legave, Jean-Michel, Farrera, Isabelle, Davi, Hendrik, Jean, Frederic, Chuine, Isabelle, Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (UAGPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes (GALF), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (AGPF), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Architecture et Fonctionnement des Espèces Fruitières [AGAP] (AFEF), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, and Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)

Subjects
nirs, budwood, Vegetal Biology, dormancy, bourgeon, NIRS, callose, tige, Bourgeons végétatifs et floraux, dormance, délai moyen de débourrement (DMD), debourrement, bud break, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, stem, Biologie végétale
Abstract

UMR AGAP - équipe AFEF - Architecture et fonctionnement des espèces fruitièresUMR AGAP - équipe AFEF - Architecture et fonctionnement des espèces fruitières; Pour améliorer les modélisations de la phénologie, nous avons besoin de dates de débourrement et de floraison mais aussi de dates de levée de dormance, sur un grand nombre d’espèces. On est à la recherche de méthodes alternatives aux tests classiques, peu onéreuses et permettant de s’approcher du haut débit. Une approche en spectrométrie proche infrarouge montre une bonne corrélation entre NIRS et paramètre classique de dormance (DMD) sur poudre de bourgeons végétatifs et floraux. Une autre approche concernant la visualisation de callose au niveau de la zone méristématique, considérée comme un marqueur d’état dormant, a été entreprise.

Published
2015

24. Diversité Géographique des changements de dates de floraison chez le pommier: quel enseignement face à un réchauffement croissant ?

Author

Legave, Jean-Michel, Guédon, Yann, El Yaacoubi, Adnane, Malagi, Gustavo, Mathieu, Vincent, Christien, Danilo, Farrera, Isabelle, Bonhomme, Marc, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Université de Moulay Ismail (UMI), Universidade Federal de Pelotas = Federal University of Pelotas (UFPel), Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL), Agroscope, Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Architecture et Fonctionnement des Espèces Fruitières [AGAP] (AFEF), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Université Moulay Ismail (UMI), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
adaptation au climat, Vegetal Biology, Arbre fruitier, phénologie, température, détection de ruptures multiples, adaptation climatique, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, détection de rupture, Biologie végétale
Abstract

UMR AGAP - équipe AFEF - Architecture et fonctionnement des espèces fruitières; Les changements de dates de floraison du pommier dans un passé récent ont été étudiés à une échelle mondiale. Une modélisation statistique de séries de dates de floraison et de températures révèle une diversité géographique des changements de dates et du réchauffement de l’automne au printemps. Face à un contexte de réchauffement globalement croissant mais géographiquement variable, l’adaptation de la phénologie, notamment en Europe, doit ainsi être raisonnée à des niveaux régionaux dont les caractéristiques climatiques et les contours géographique sont à définir.

Published
2015

25. Estimation du niveau de dormance des bourgeons avec la NIRS, résultats préliminaires

Author

Bonhomme, Marc, Charpentier, Jean-Paul, Segura, Vincent, Pâques, Luc, Audergon, Jean Marc, Quero-Garcia, José, Legave, Jean-Michel, Farrera, Isabelle, Davi, Hendrik, Jean, Frédéric, Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (AGPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)

Subjects
Prunus persica, malus domestica, Vegetal Biology, Fagus sylvatica, juglans regia, bourgeon, prunus armeniaca, jugans, regia, prunus avium, larix decidua, tige, Dormance, délai moyen de débourrement (DMD), [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Biologie végétale
Abstract

Communication orale et résumé; National audience; Pour améliorer les modélisations de la phénologie, nous avons besoin de dates de débourrement et de floraison mais aussi de dates de levée de dormance, sur un grand nombre d’espèces. On est à la recherche de méthodes alternatives aux tests classiques, peu onéreuses et permettant de s’approcher du haut débit. La NIRS était potentiellement un bon candidat. Les essais préliminaires montrent une bonne corrélation entre NIRS et paramètre classique de dormance (DMD) sur poudre de bourgeons végétatifs et floraux. La corrélation est moins bonne sur poudre de tige mais pourrait cependant constituer une alternative dans le cas de screening haut débit.

Published
2015

27. A COMPARISON BETWEEN PLANT COMMUNITY COMPOSITION AND BOTANICAL SPECIESGATHERED BY HONEY BEES IN A CULTIVATED LANDSCAPE OF WESTERN FRANCE

Author

Piroux, Mélanie, Thorin, Chantal, Farrera, Isabelle, L’hostis, Monique, Vigues, Bernard, Lambert, Olivier, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Centre Vétérinaire de la Faune Sauvage et des Ecosystèmes des Pays de la Loire (CVFSE), Plateforme Environnementale Vétérinaire, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2014

30. Palaeoenvironments, palaeoclimates and landscape development in Atlantic Equatorial Africa: a review of key sites covering the last 25 kyrs.

Author

Smol, John P., Last, William M., Battarbee, Richard W., Gasse, Françoise, Stickley, Catherine E., Elenga, Hilaire, Maley, Jean, Vincens, Annie, and Farrera, Isabelle

Abstract

The pollen data available for the Atlantic equatorial African region indicate that during the Late Quaternary, major climate changes occurred and caused important modifications in tropical lowland rain-forest in terms of composition and distribution (Maley 1991; Elenga et al. 1991; 1994; Farrera et al. 1999; Vincens et al. 1999). Nevertheless, despite a wealth of proxy evidence from various disciplines, there are very few terrestrial sites dated continuously since the Last Glacial Maximum (LGM) to the Late Holocene in this area (e.g., Lanfranchi and Schwartz (1990), Servant and Servant-Vildary (2000)). The oldest radiocarbon-dated sites are from Lake Barombi Mbo in Cameroon (Brenac 1988; Maley 1991; Maley and Brenac 1998a) and the Ngamakala Pond in the Congo (Elenga et al. 1994), although most Holocene sequences from this area start during the mid-Holocene (Vincens et al. 1999). This paper reviews the results available for some key sites, allowing regional correlations for major Late Quaternary periods.We have focused on the vegetation changes and the climate related to these changes. Numerous radiocarbon dates allowprecise palaeoenvironmental reconstructions, especially since the mid-Holocene to be made. In this paper all 14C dates are uncalibrated. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2004
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