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1. Dominant plasmids carrying extended spectrum β-lactamases blaCTX-M genes in genetically diverse Escherichia coli from slaughterhouse and urban wastewaters

Author

Dupouy-Guiraute, Véronique, Doublet, Benoît, Arpaillange, Nathalie, Praud, Karine, Bibbal, Delphine, Brugère, Hubert, Oswald, Eric, Cloeckaert, Axel, Toutain, Pierre-Louis, Bousquet‐Mélou, Alain, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CHU Toulouse [Toulouse], ProdInra, Migration, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, ESBL-producing E. coli, plasmid, Escherichia coli, blaCTX-M, slaughterhouse, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, wastewater, WWTP
Abstract

International audience; Wastewater treatment plants (WWTP) receiving effluents from food-producing animals and humans may contribute to the spread of ESBL-carrying plasmids. This study was designed to investigate extended-spectrum cephalosporin resistant E. coli strains, CTX-M distributions and the genetic lineage of blaCTX-M -carrying plasmids from urban and slaughterhouse wastewaters. The level of extended-spectrum cephalosporin-resistant E. coli in slaughterhouse wastewater entering the WWTP was negligible compared to that of urban wastewater. The blaCTX-M-1 gene was predominant in slaughterhouse wastewater whereas diverse blaCTX-M genes were encountered in urban wastewater and WWTP outlet. Characterization of the main CTX-M-producing E. coli isolates by antibiotic resistance phenotyping, genotyping and typing of plasmids carrying blaCTX-M genes revealed that blaCTX-M-1 and blaCTX-M-15 genes were harbored by the predominant blaCTX-M-1 IncI1/ST3 and blaCTX-M-15 F31:A4:B1 plasmids, which were recovered from unrelated E. coli genotypes in both slaughterhouse and urban wastewaters. This study highlighted the spread of predominant blaCTX-M-1 and blaCTX-M-15 plasmid lineages in diverse E. coli genotypes from humans and food-producing animals, their mixing in WWTP and final release into the aquatic environment. This could have a serious negative impact on public health and requires further evaluation.

Published
2016
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2. Etat des lieux de l'antibiorésistance en élevage cunicole français et application du concept d'exclusion compétitive pour limiter la transmission d'un microbiote maternal antibiorésistant

Author

Achard, Caroline, Dupouy-Guiraute, Véronique, Siviglia, Susanna, Arpaillange, Nathalie, Gabinaud, Beatrice, Combes, Sylvie, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Denis, Catherine, Ballester, Maria, Boucher, Stéphane, Dile, B., Chatellier, S., Le Normand, Bernadette, Chaubet, Adeline, Esquerre, Diane, Ghozlane, Amine, Ruppe, Etienne, Bousquet‐Mélou, Alain, Estelle, Jordi, Zemb, Olivier, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Labovet Conseil, Clinique Vétérinaire des Marchés de Bretagne, Département de Génétique Animale [Toulouse], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MetaGenoPolis, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
antibiotique, microbiote, élevage cunicole, [SDV]Life Sciences [q-bio], antibiorésistance, transmission, [INFO]Computer Science [cs], résistance
Abstract

National audience; In order to fight against antibiotic resistance in livestock, we need to know which antibiotic resistance genes (ARGs) are relevant in France and then lower their abundance. Out of the 102 ARGs identified by metagenomics across 30 French rabbit husbandries, 5 genes leading to tetracycline resistance belonged to the 10 most abundant ARGs. Quantitative PCR on tetO confirmed that the abundance using metagenomics is relevant. To lower ARGs abundance in kits, a control group was raised in standard conditions (n=5), a NF group had the maternal feces removed from the nest (n=4) and 3 groups were inoculated regularly with suspensions of fecal bacteria originating from farms using less antibiotics. The proportion of enterobacteria resistant to tetracyline was lower in the inoculated groups (45%, 48% and 10%) than in the control group (94%). This trend has to be confirmed in a second trial but competitive exclusion opens interesting means to fight against antibiotic resistant bacteria in livestock.; Afin de proposer un système de maîtrise de l'antibiorésistance microbienne en élevage cunicole, nous avons identifié les gènes d'antibiorésistance stratégiques en France et testé une solution potentielle pour limiter le niveau d’antibiorésistance dans la flore digestive des lapins d’élevage. 102 gènes d’antibiorésistance ont été identifiés par analyse métagénomique des gènes microbiens issus de fèces de 30 lapines provenant d’élevages différents. Cinq des 10 gènes d’antibiorésistance les plus abondants confèrent une résistance à la tétracycline, antibiotique le plus utilisé dans le panel d’élevages. Les gènes de résistance aux tétracyclines sont plus abondants dans les échantillons issus d’élevages consommateurs d’antibiotiques. Les résultats de la PCR quantitative du gène tetO sont cohérents avec l’analyse métagénomique. Nous avons utilisé l'exclusion compétitive pour limiter la transmission d’antibiorésistance. Les lapereaux de 24 mères traitées à la tétracycline ont été utilisés dans les conditions standards d’élevage (n=5), dans des conditions de retrait des fèces maternelles (n=4) et dans le cas d’inoculation de 3 suspensions fécales pauvres en bactéries résistantes (n=5, 5 et 5). Le taux d’entérobactéries résistantes à la tétracycline dans les fèces de lapereaux après sevrage est moindre (45%, 48% et 10%) dans les lapereaux inoculés que dans le groupe contrôle (94%). Cette tendance doit être confirmée à l’aide d’un deuxième essai. L’exclusion compétitive appliquée pour limiter le niveau de résistance aux antibiotiques de la flore fécale ouvre des perspectives d’action en termes de techniques d’élevages reposant sur la coprophagie.

Published
2015

3. Impact of a cephalosporin treatment on the selection and transfer of blacTX-M résistance gene in pig intestine

Author

Dupouy-Guiraute, Véronique, Arpaillange, Nathalie, Tapie, Edwige, Dimbimanana, Vona, Bousquet‐Mélou, Alain, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2015

4. Resistome of pig and rabbit gut microbiota using high-troughput sequencing and qPCR approaches

Author

Achard, Caroline, Dupouy-Guiraute, Véronique, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Gabinaud, Beatrice, Denis, Catherine, Ballester, Maria, Dile, Benoit, Boucher, Samuel, Chatellier, Stéphane, Le Normand, Bernadette, Manceau, Patrick, Ferchaud, Stephane, Chaubet, Adeline, Esquerre, Diane, Combes, Sylvie, Le Floc'h, Natalie, Bousquet-Mélou, Alain, Zemb, Olivier, Estelle, Jordi, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, LABOVET Conseil, Réseau Cristal, Clinique Vétérinaire des Marchés de Bretagne, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Département Génétique Animale (DEPT GA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, digestive system, humanities
Abstract

Resistome of pig and rabbit gut microbiota using high-troughput sequencing and qPCR approaches. 6. Symposium on Antimicrobial Résistance in Animals and the Environment (ARAE)

Published
2015

5. Influence of marbofloxacin on the selection of bacterial resistances in the gut microbiota of veal calves. Investigation of a strategy aiming at reducing both selective pressure and resistance selection

Author

Abdelli, Mouni, Roques, Amandine, Dupouy-Guiraute, Véronique, Ferran, Aude, Toutain, Pierre-Louis, De Gunzburg, Jean, Bousquet‐Mélou, Alain, Da Volterra [Paris, France], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Antimicrobial Agents in Veterinary Medicine (AAVM). DEU., and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2014

6. Antimicrobial resistan ce of shiga toxin gene (stx)-positive and initimin gene (eae)-positive Escherichia coli isolates from wastewaters of an urban wastewater treatment plant (WWTP) collecting slaughterhouse effluents

Author

Bibbal, Delphine, Dupouy-Guiraute, Véronique, Diallo, Alpha Amadou, Kérourédan, Monique, Arpaillange, Nathalie, Toutain, Pierre-Louis, Oswald, Eric, Bousquet‐Mélou, Alain, Brugère, Hubert, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Sénégalais de Recherches Agricoles [Dakar] (ISRA), Centre Hospitalier Universitaire de Purpan (CHU Purpan), and American Society for Microbiology. USA.

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2012

8. Evidence for compensatory mechanisms within the thyroid gland in response to fibronil-induced tyroid disruption: transcriptional response of the thyroid gland

Author

Viguié, Catherine, Dupouy-Guiraute, Véronique, Leghait, Julien, Lasserre, Frédéric, Toutain, Pierre-Louis, Roques, Béatrice, Pineau, Thierry, Martin, Pascal G.P., ProdInra, Migration, Exposition, Perturbation Endocrino-métabolique et Reproduction (ToxAlim-EXPER), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Département Santé Animale (DEPT SA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Environmental Endocrine Disruptors.

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

9. Prevalence and molecular characterization of CTX- M- producing Escherichia coli isolates from wastewaters of a couple slaughterhouse/wastewater treatment plant

Author

Dupouy-Guiraute, Véronique, Bibbal, Delphine, Arpaillange, Nathalie, Brugère, Hubert, Oswald, Eric, Toutain, Pierre-Louis, Bousquet‐Mélou, Alain, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Chercheur indépendant

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, bacteria, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition
Abstract

Prevalence and molecular characterization of CTX- M- producing Escherichia coli isolates from wastewaters of a couple slaughterhouse/wastewater treatment plant. 4. Symposium on Antimicrobial Resistance in Animals and the Environment

Published
2011

10. Impact of ampicillin administration on blaTEM genes excretion in swine stool

Author

Bibbal, Delphine, Bousquet‐mélou, Alain, Dupouy-Guiraute, Véronique, Ferré, Jean-Pierre, Laroute, Valerie, Toutain, Pierre-Louis, Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales (UPTE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2006

11. Prevalence of Beta-Lactam and Quinolone/Fluoroquinolone Resistance in Enterobacteriaceae From Dogs in France and Spain—Characterization of ESBL/pAmpC Isolates, Genes, and Conjugative Plasmids

Author

Alain Bousquet-Mélou, Nathalie Arpaillange, Sakina Sayah-Jeanne, Diego Lopez-Pulin, Gabriel Moyano, Nathalie Saint-Lu, Mouni Abdelli, Bruno Gonzalez-Zorn, Antoine Andremont, Véronique Dupouy, Delphine Bibbal, Jean de Gunzburg, Marie-Christine Cadiergues, Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Da Volterra [Paris, France], Universidad Complutense de Madrid = Complutense University of Madrid [Madrid] (UCM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centro Veterinario Loranca, Partenaires INRAE, and Dupouy-Guiraute, Véronique

Subjects
antibiotic resistance, Cefotaxime, Nalidixic acid, 040301 veterinary sciences, medicine.drug_class, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biology, fluoroquinolone, Microbiology, 0403 veterinary science, 03 medical and health sciences, ESBL/pAmpC, dog, feces, plasmid, Antibiotic resistance, Plasmid, polycyclic compounds, medicine, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, lcsh:Veterinary medicine, General Veterinary, 04 agricultural and veterinary sciences, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, bacterial infections and mycoses, Quinolone, biology.organism_classification, Enterobacteriaceae, 3. Good health, Ciprofloxacin, lcsh:SF600-1100, Multilocus sequence typing, medicine.drug
Abstract

International audience; Quantitative data on fecal shedding of antimicrobial-resistant bacteria are crucial to assess the risk of ansmission from dogs to humans. Our first objective was to investigate the prevalence of quinolone/fluoroquinolone-resistant and beta-lactam-resistant Enterobacteriaceae in dogs in France and Spain. Due to the particular concern about possible transmission of extended-spectrum cephalosporin (ESC)-resistant isolates from dogs to their owners, we characterized the ESBL/pAmpC producers collected from dogs. Rectal swabs from 188 dogs, without signs of diarrhea and that had not received antimicrobials for 4 weeks before the study, were quantified for total and resistant Enterobacteriaceae on selective media alone or containing relevant antibiotic concentrations. Information that might explain antibiotic resistance was collected for each dog. Extended-spectrum cephalosporin-resistant isolates were subjected to bacterial species identification (API20E), genetic lineage characterization (MLST), ESBL/pAmpC genes identification (sequencing), and plasmid characterization (pMLST). Regarding beta-lactam resistance, amoxicillin- (AMX) and cefotaxime- (CTX) resistant Enterobacteriaceae were detected in 70 and 18% of the dogs, respectively, whereas for quinolone/fluoroquinolone-resistance, Nalidixic acid- (NAL) and ciprofloxacin- (CIP) resistant Enterobacteriaceae were detected in 36 and 18% of the dogs, respectively. Medical rather than preventive consultation was a risk marker for the presence of NAL and CIP resistance. CTX resistance was mainly due to a combination of specific ESBL/pAmpC genes and particular conjugative plasmids already identified in human patients: bla(CTX-M-1)/IncI1/ST3 (n = 4), bla(CMY-2)/IncI1/ST12 (n = 2), and bla(CTX-M-15)/IncI1/ST31 (n = 1). bla(SHV-12) ( n = 3) was detected in various plasmid lineages (InI1/ST3, IncI1/ST26, and IncFII). ESBL/pAmpC plasmids were located in different genetic lineages of E coil, with the exception of two strains in France (ST6998) and two in Spain (ST602). Our study highlights dogs as a potential source of Q/FQ-resistant and ESBL/pAmpC-producing bacteria that might further disseminate to humans, and notably a serious risk of future acquisition of CTX-M-1 and CMY-2 plasmids by the owners of dogs.

Published
2019
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