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1. Proceedings of the 23rd Paediatric Rheumatology European Society Congress: part three

Author: Riccardo Papa, Alessandro Consolaro, Francesca Minoia, Roberta Caorsi, Gianmichele Magnano, Marco Gattorno, Angelo Ravelli, Paolo Picco, Roberto Pillon, Denise Pires Marafon, Lidia Meli, Claudia Bracaglia, Andrea Taddio, Fabrizio De Benedetti, Enes Turan, Sara Sebnem Kilic, Yasuhiko Itoh, Tomoko Shigemori, Shingo Yamanishi, Hidehiko Nagasaki, Ela Tarakci, Nilay Arman, Devrim Tarakci, Yusuf S. Akgul, Ozgur Kasapcopur, Emily Wilson, Hanna Lythgoe, Eve Smith, Jenny Preston, Michael W. Beresford, Lynn R. Spiegel, Jennifer Stinson, Mark Connelly, Adam Huber, Nadia Luca, Argerie Tsimicalis, Stephanie Luca, Naweed Tajuddin, Roberta Berard, Julie Barsalou, Sarah Campillo, Brian Feldman, Shirley Tse, Paul Dancey, Ciaran Duffy, Nicole Johnson, Patrick McGrath, Natalie Shiff, Lori Tucker, Charles Victor, Chitra Lalloo, Lauren Harris, Joseph Cafazzo, Kristin Houghton, Ronald Laxer, Madeleine Rooney, Roisin Campbell, Catherine Wright, Wineke Armbrust, Otto Lelieveld, Jolanda Tuinstra, Nico Wulffraat, Joyce Bos, Jeanette Cappon, Marion van Rossum, Mariët Hagedoorn, Anna Vermé, Ylva Lampela, Ayse Huri Ozdogan, S. Ugurlu, K. Barut, A. Androvic, O. Kasapçopu, Jody Etheridge, Katie Dobson, Sue Kemp, AnnaCarin Horne, Karin Palmblad, Malin Höglund, Natalia Stepanenko, Svetlana Salugina, Evgeny Fedorov, Irina Nikishina, Maria Kaleda, Kenan Barut, Amra Adrovic, Sezgin Sahin, Laurence Toumoulin, Johnny Frossard, Stephanie Archimbaut, Anne Paitier, Rolande Guastalli, Severine Guillaume Czitrom, Sirirat Charuvanij, Chollada Chaiyadech, Takako Miyamae, Hisashi Yamanaka, Cecile Picard, Guillaume Thouvenin, Caroline Kannengiesser, Jean-Christophe Dubus, Nadia Jeremiah, Frédéric Rieux-Laucat, Bruno Crestani, Véronique Secq, Christelle Ménard, Martine Reynaud-Gaubert, Françoise Thivolet-Bejui, Philippe Reix, Alexandre Belot, Ezgi Deniz Batu, Hafize Emine Sonmez, Abdulsamet Erden, Ekim Z. Taskiran, Omer Karadag, Umut Kalyoncu, İbrahim Oncel, Berkan Kaplan, Zehra Serap Arici, Cagri Mesut Temucin, Haluk Topaloglu, Yelda Bilginer, Mehmet Alikasifoglu, Seza Ozen, Lien Van Eyck, Ellen De Langhe, Isabelle Jéru, Erika Van Nieuwenhove, Vasiliki Lagou, Paul J. Baker, Jocelyn Garcia-Perez, James Dooley, Lien De Somer, Raf Sciot, Pierre-Yves Jeandel, Julia Ruuth-Praz, Bruno Copin, Myrna Medley-Hashim, Andre Megarbane, Sinisa Savic, An Goris, Serge Amselem, Adrian Liston, Seth Masters, Carine Wouters, Nami Okamoto, Yuko Sugita, Kousuke Shabana, Takuji Murata, Hiroshi Tamai, Juliana Ferenczová, Erika Banóova, Pavol Mrážik, Veronika Vargova, Dubravko Bajramovic, Ksenija Stekic Novacki, Kristina Potocki, Marijan Frkovic, Marija Jelusic, Olga Kostareva, Svetlana Arsenyeva, Anna Shapovalenko, Lennart Jans, Nele Herregods, Jacob Jaremko, Rik Joos, Joke Dehoorne, Xenofon Baraliakos, Sofia Ramiro, Julio C. Casasola-Vargas, Désirée van der Heijde, Robert Landewé, Ruben Burgos-Vargas, Shirley M. Tse, Gerd Horneff, Kristina Unnebrink, Jaclyn K. Anderson, Aysenur Paç Kisaarslan, Betül Sözeri, Zübeyde Gündüz, Gökmen Zararsız, Hakan Poyrazoğlu, Ruhan Düşünsel, Kazutaka Ouchi, Shinji Akioka, Hiroshi Kubo, Norio Nakagawa, Hajime Hosoi, Lovro Lamot, Fran Borovecki, Sanja Kapitanovic, Kristina Gotovac, Mandica Vidovic, Mirta Lamot, Edi Paleka Bosak, Miroslav Harjacek, Ricardo A. Russo, María M. Katsicas, Ruben Burgos Vargas, Ana L. Ortiz-Peyegahud, Zhang Pingping, Mou Yikun, Qi Jun, Jiang Yutong, Gu Jieruo, Mikhail M. Kostik, Shilova Ekaterina, Ilia Avrusin, Yuriy Korin, Olga Kopchak, Eugenia Isupova, Irina Chikova, Panova Tatyana, Margarita Dubko, Vera Masalova, Ludmila Snegireva, Tatyana Kornishina, Olga Kalashnikova, Vyacheslav Chasnyk, Tatyana Likhacheva, N. Ruperto, H. I. Brunner, P. Quartier, T. Constantin, E. Alexeeva, R. Schneider, I. Kone-Paut, K. Schikler, K. Marzan, N. Wulffraat, S. Padeh, V. Chasnyk, C. Wouters, J. B. Kuemmerle-Deschner, T. Kallinich, B. Lauwerys, E. Haddad, E. Nasonov, M. Trachana, O. Vougiouka, K. Leon, A. Speziale, K. Lheritier, E. Vritzali, A. Martini, D. Lovell, PRINTO/PRCSG, Nienke Ter Haar, Rianne Scholman, Wilco de Jager, Tamar Tak, Pieter Leliefeld, Bas Vastert, Sytze de Roock, Ariane de Ganck, Nadia Ryter, Miha Lavric, Dirk Foell, Renee F. Modica, Kathleen G. Lomax, Pamela Batzel, Armelle Cassanas, Melissa E. Elder, Rina Denisova, Ekaterina Alexeeva, Saniya Valieva, Tatyana Bzarova, Kseniya Isayeva, Tatyana Sleptsova, Olga Lomakina, Alexandra Chomahidze, Margarita Soloshenko, Meyry Shingarova, Elena Kachshenko, Wilco De Jager, Sebastiaan J. Vastert, Gerdien Mijnheer, Berent J. Prakken, Nico M. Wulffraat, Hafize E. Sönmez, Asuman N. Karhan, Ezgi D. Batu, Zehra S. Arıcı, Ersin Gümüş, Hülya Demir, Aysel Yüce, Seza Özen, Jasmina Ahluwalia, Bhavneet Bharti, Sweta Rajpal, Varun Uppal, Alaknanda Walia, Surjit S. Samlok, Narender Kumar, Clarissa C. Valões, Beatriz C. Molinari, Ana Claudia G. Pitta, Natali W. Gormezano, Sylvia C. Farhat, Kátia Kozu, Adriana M. Sallum, Simone Appenzeller, Ana Paula Sakamoto, Maria T. Terreri, Rosa M. Pereira, Claudia S. Magalhães, Cássia Maria Barbosa, Francisco Hugo Gomes, Eloisa Bonfá, Clovis A. Silva, Kubra Ozturk, Zelal Ekinci, Maie Helal, Natalia Cabrera, Jean Christophe Lega, Jocelyne Drai, Rene Ecochard, O. V. Shpitonkova, N. S. Podchernyaeva, Y. O. Kostina, N. G. Dashkova, M. K. Osminina, Gozde Yucel, Ahmet Arvas, Nandini Moorthy, Paraskevi Dimou, Angela Midgley, Matthew Peak, Simon C. Satchell, Rachael D. Wright, Rachel Corkhill, Eve M. Smith, Sagar Bhattad, Amit Rawat, Surjit Singh, Anju Gupta, Deepti Suri, Martin de Boer, Taco Kuijpers, Vignesh Pandiarajan, Sapna Sandal, Sebastian Giraldo, Roy Sanguino, Adriana S. Diaz, Selcuk Uzuner, Gizem Durcan, Ali Guven Kilicoglu, Ayhan Bilgic, Kayhan Bahali, Sinem Durmus, Hafize Uzun, Nur Canpolat, Salim Caliskan, Lale Sever, Tomomi Sato, Fuminori Kimura, Wafaa Suwairi, Reem Abdwani, Abdulaziz Al Rowais, Jubran Al qanatish, Abdulrahman Al Asiri, Ekaterina Gaidar, Mikhail Kostik, Elena Serogodskaya, Tatyana Nikitina, Evgenia Isupova, Elham Sardar, Perrine Dusser, Antoine Rousseau, Marc Labetoulle, Emanuel Barreau, Bahram Bodaghi, Isabelle Kone-Paut, Ivan Foeldvari, Jordi Anton, Rosa Bou, Sheila Angeles-Han, Regitze Bangsgaard, Gabriele Brumm, Tamas Constantin, Clive Edelsten, Jens Klotsche, Kirsten Minden, Elisabetta Miserocchi, Susan Nielsen, Gabriele Simonini, Arnd Heiligenhaus, Juan Manuel Mosquera Angarita, Carmen Garcia de Vicuña, Maria Victoria Hernandez, Alfredo Adan, Victor Llorens, Rosa Alcobendas, Susana Noval, Juan Carlos Lopez Robledillo, Isabel Valls, Mari Carmen Pinedo, Alejandro Fonollosa, Jaime de Inocencio, Pilar Tejada, Beatriz Bravo, Manuel Torribio, María Jesús García de Yebenes, Jordi Antón, Uveitis Working Group of the Spanish Pediatric Rheumatology Society, Lorenza Maria Argolini, Irene Pontikaki, Maria Orietta Borghi, Laura Cesana, Barbara Castiglioni, Maurizio Gattinara, Pierluigi Meroni, Pierre Quartier, Veronique Despert, Sylvaine Poignant, Amandine Baptiste, Caroline Elie, Laurent Kodjikian, Dominique Monnet, Michel Weber, Laura Moal, LuuLy Pham, Emmanuel Barreau, Cherif Titah, Pascal Dureau, Vanessa Cecchin, Maria Elisabetta Zannin, Daniele Ferrari, Francesco Comacchio, Rolando Cimaz, Fernanda Falcini, Antonella Petaccia, Stefania Viola, Luciana Breda, Francesco La Torre, Fabio Vittadello, Giorgia Martini, Francesco Zulian, Caroline Galeotti, Guillaume Sarrabay, Olivier Fogel, Isabelle Touitou, Corinne Miceli-Richard, Isabelle Koné-Paut, Hala Etayari, Hashad Soad, Ihab El Kadry, Habibullah Eatamadi, Kais AlAlgawi, Mustafa Al Maini, Khulood Khawaja, Sophie Van den Berghe, Ilse de Schryver, Ann Raes, Lídia L. C. Teixeira, Ana Duarte, Sandra Sousa, Filipe Vinagre, Maria J. Santos, Nataly S. Shevchenko, Ludmila F. Bogmat, Marina V. Demyanenko, Navdha R. Ramchurn, Mark Friswell, Rebecca A. James, Lucy R. Wedderburn, Reshma Pattani, Clarissa A. Pilkington, Sandrine Compeyrot-Lacassagne, Ana V. Villarreal, Nydia Acevedo, Enrique Faugier, Rocio Maldonado, Dilek Yılmaz, Hilal Bektaş Uysal, Elena Kamenets, Ekaterina Zaharova, Stefka Radenska-Lopovok, Joao Nascimento, Helena Sofia, Carla Zilhão, Rui Almeida, Margarida Guedes, Murat Deveci, Svetlana Rodionovskaya, Vera Vinnikova, Irina Tsymbal, Edyta Olesińska, Jacek Postępski, Agnieszka Mroczkowska-Juchkiewicz, Agnieszka Pawłowska-Kamieniak, Beata Chrapko, Damjana Ključevšek, Nina Emeršič, Nataša Toplak, Tadej Avčin, Faina Rokhlina, Galina Glazyrina, Natalia Kolyadina, Kwangnam Kim, Sinae Eom, Daeyoung Kim, Jungwoo Rhim, Francesca Ricci, Paola Montesano, Barbara Bonafini, Veronica Medeghini, Ilaria Parissenti, Antonella Meini, Marco Cattalini, Paolo Airò, Nataliya Panko, Nataliya Shevchenko, Iryna Lebec, Yevgeniya Zajceva, Sara Rostlund, Marie André, Takuma Hara, Takayuki Kishi, Yumi Tani, Aki Hanaya, Satoru Nagata, Velma Selmanovic, Aida Omercahic-Dizdarevic, Adisa Cengic, Almira Cosickic, Aida Omerčahić Dizdarević, Gemma Lepri, Clara Malattia, Eleonora Bellucci, Marco Matucci-Cerinic, Anton Solovyev, Elena Fedotova, Ana Victoria Villarreal, Talia Diaz, Yuridiana Ramirez, Teresa Giani, Achille Marino, Daniel Hunt, Muthana Al Obaidi, Veli Veli, Charalampia Papadopoulou, Jochen Kammermeier, Anna Poluha, Gangadhara C. Bharmappanavara, Alison Kelly, Lindsay Shaw, Giovanna Ferrara, Michele Luzzati, Mattia Giovannini, Liliana Jurado, Juliana Chamorro, Lorena Sarmiento, Ester Conversano, Maria Francesca Gicchino, Giulia Macchini, Carmela Granato, Assunta Tirelli, Alma N. Olivieri, Marija Perica, Lana Tambić Bukovac, Reza Sinaei, Vadood Javadi Parvaneh, Reza Shiari, Khosro Rahmani, Fatemeh F. Mehregan, Mehrnoush Hassas Yeganeh, Inmaculada Calvo Penadés, Berta López Montesinos, Ma Isabel González Fernández, Adriana Rodríguez Vidal, Anand Prahalad Rao, Ayesha Romana, Jyothi Raghuram, Ankur Kumar, Vishali Gupta, Elif Comak, Gülşah Kaya Aksoy, Aygen Yılmaz, Atike Atalay, Mustafa Koyun, Reha Artan, Sema Akman, Maria I. Kaleda, Irina P. Nikishina, Sergei K. Soloviev, Victor A. Malievsky, Ekaterina V. Nikolaeva, Agnieszka Gazda, Beata Kołodziejczyk, Lidia Rutkowska-Sak, Angela Mauro, Pierluigi Marzuillo, Stefano Guarino, and Angela La Manna
Subjects: Pediatrics, RJ1-570, Diseases of the musculoskeletal system, RC925-935
Published: 2017
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2. Extended clinical and genetic spectrum associated with biallelic RTEL1 mutations

Author: Fabien Touzot, Laetitia Kermasson, Laurent Jullien, Despina Moshous, Christelle Ménard, Aydan Ikincioğullari, Figen Doğu, Sinan Sari, Vannina Giacobbi-Milet, Amos Etzioni, Jean Soulier, Arturo Londono-Vallejo, Alain Fischer, Isabelle Callebaut, Jean-Pierre de Villartay, Thierry Leblanc, Caroline Kannengiesser, and Patrick Revy
Subjects: Specialties of internal medicine, RC581-951
Abstract: Abstract: Telomeres are repetitive hexameric sequences located at the end of linear chromosomes. They adopt a lariat-like structure, the T-loop, to prevent them from being recognized as DNA breaks by the DNA repair machinery. RTEL1 is a DNA helicase required for proper telomere replication and stability. In particular, it has been postulated that RTEL1 is involved in the opening of the T-loop during telomere replication to avoid sudden telomere deletion and telomere circle (T-circle) formation. In humans, biallelic RTEL1 mutations cause Hoyeraal-Hreidarsson syndrome (HH), a rare and severe telomere biology disorder characterized by intrauterine growth retardation, bone marrow failure, microcephaly and/or cerebellar hypoplasia, and immunodeficiency. To date, 18 different RTEL1 mutations have been described in 19 cases of HH with short telomeres. The impaired T-loop resolution has been proposed to be a major cause of telomere shortening in RTEL1 deficiency. However, the biological and clinical consequences of this disorder remain incompletely documented. Here, we describe 4 new patients harboring biallelic RTEL1 mutations, including 2 novel missense mutations located in the C-terminal end of RTEL1 (p.Cys1268Arg and p.Val1294Phe). Clinical characteristics from these 4 patients were collected as those from 4 other RTEL1-deficient patients previously reported. In addition, we assessed whether T-circles, the product of improper T-loop resolution, were detected in our RTEL1-deficient patients. Overall, our study broadens and refines the clinical and biological spectrum of human RTEL1 deficiency.
Published: 2016
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3. First clinical description of a pedigree with complete NAF1 deletion

Author: Jean Galtier, Sophie Dimicoli-Salazar, Aurélien Trimouille, Elodie Lainey, Patrick Revy, Audrey Bidet, Yoann Vial, Edouard Forcade, Marie-Laure Negrier-Leibreich, Etienne Rivière, Julie Tinat, Nathalie Le Meur, Christelle Ménard, Arnaud Pigneux, Thibaut Leguay, Pierre-Yves Dumas, Ba Ibrahima, and Caroline Kannengiesser
Subjects: Cancer Research, Oncology, Hematology
Published: 2022
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4. Telomere-Related Gene mutations in a Greek cohort of suspected monogenic pulmonary fibrosis patients

Author: Aikaterini Markopoulou, Athina Trachalaki, Effrosyni D. Manali, Evangelos Bouros, Spyros Papiris, Nadia Nathan, Paschalis Steiropoulos, Chrysa Bazaka, Athanasios Konstantinidis, Nikolaos Malamadakis, Anna Karakatsani, Khedidja Rebah, Caroline Kannengiesser, Raphael Borie, Lykourgos Kolilekas, Theodoros P. Vassilakopoulos, Demosthenes Bouros, Evangelos Markozannes, Zoe Daniil, Ilias Papanikolaou, Aggeliki Haritou, Ioanna Korbila, Vasilios Tzilas, Panagiotis Lyberopoulos, Sofia Spyropoulou, Andriana I. Papaioannou, Ioannis Tomos, Areti Xyfteri, Konstantinos Kagouridis, Catherine Boileau, Evangelia Fouka, Despoina Papakosta, Philippe Dieudé, Elodie Lainey, Bruno Crestani, Maria Maniati, Patrick Revy, Katerina M. Antoniou, Athina Gogali, Marie Legendre, Ibrahima Ba, Claire Oudin, Argyrios Tzouvelekis, Stylianos Loukides, and Christelle Ménard
Subjects: medicine.medical_specialty, business.industry, Interstitial lung disease, Context (language use), Disease, medicine.disease, Gastroenterology, FEV1/FVC ratio, DLCO, Internal medicine, Pulmonary fibrosis, Cohort, medicine, Genetic predisposition, business
Abstract: Background: Telomere-related genes (TRG) mutations are detected in 30% of familial pulmonary fibrosis (FPF) and are also associated with personal/familial extra-pulmonary disease suggestive of short telomere syndrome (STS). Aim: to evaluate the prevalence of TRG mutations in a national cohort of interstitial lung disease (ILD) with suspected genetic predisposition in Greece and to define patients’ characteristics and impact on outcome.Methods: Genetic diagnoses made between December 2014-September 2019 in patients with FPF, pulmonary fibrosis at young age or personal and/or family extra-pulmonary disease suggestive of STS were analyzed. Results: 150 ILD patients, 73% male, age-at-diagnosis 67 years old, 33% non-smokers, 75% with definite/probable UIP or CPFE, 93% with dyspnea/cough, FVC% pred 75%, DLCO% pred 49% were tested; FPF was 65%, 19% young age, 21% personal and 17% family extra-pulmonary disease suggestive of STS; 21% were tested for more than 1 indication. TRG pathogenic variations were detected in 19 (13%): 13 in a familial, 3 in young age and 3 in extra-pulmonary disease suggestive of STS context as follows: TERT, TERC, RTEL1, PARN, NOP10, NHP2 in 8,5,2,2,1 and 1 respectively. No difference was detected in epidemiological-clinical-radiologic-functional characteristics between patients without and with mutations apart from age-at-diagnosis [69 vs 62 years, p
Published: 2020
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5. NHP2 deficiency impairs rRNA biogenesis and causes pulmonary fibrosis and Høyeraal-Hreidarsson syndrome

Author: Nicolas Pottier, Ibrahima Ba, Maname Benyelles, Emmanuelle Ollivier, Patrick Revy, Laetitia Kermasson, Elodie Lainey, Cécile Fourrage, Alicia Fernandes, Raphael Borie, Marie-Françoise O'Donohue, Caroline Kannengiesser, Chantal Lagresle-Peyrou, Hilario Nunes, Anne-Sophie Gamez, Bruno Crestani, Denis Caillaud, Fanny Morice-Picard, Jean-Pierre de Villartay, Isabelle Callebaut, Christelle Ménard, Clarisse Cazelles, Ambroise Marçais, Pierre-Emmanuel Gleizes, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hématologie Biologique, Hôpital Robert Debré, AP-HP, Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires (PHERE (UMR_S_1152 / U1152)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clinical Investigation Center in Biotherapy, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pneumologie [Avicenne], Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), The Clinical Bioinformatics laboratory (Equipe Inserm U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université - Faculté de Médecine (SU FM), Sorbonne Université (SU), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département pneumologie et addictologie [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service de Pneumologie et Allergologie, CHU Clermont-Ferrand, Impact de l'environnement chimique sur la santé humaine - ULR 4483 (IMPECS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Physiopathologie et Epidemiologie de l'Insuffisance Respiratoire, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote (LBME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Bichat - Claude Bernard, Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-16-CE11-0029,RIBOMAN,Une approche intégrative de la biogenèse des ribosomes(2016), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Hôpital Avicenne, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Impact de l'environnement chimique sur la santé humaine (IMPECS)
Subjects: 0301 basic medicine, Premature aging, Male, Telomerase, Transcription, Genetic, Pulmonary Fibrosis, Sequence Homology, Hoyeraal-Hreidarsson syndrome, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Biology, medicine.disease_cause, Dyskerin, Dyskeratosis Congenita, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Germline mutation, Intellectual Disability, Genetics, medicine, Humans, Amino Acid Sequence, Promoter Regions, Genetic, Molecular Biology, Genetics (clinical), Aged, Mutation, Fetal Growth Retardation, Infant, Newborn, Nuclear Proteins, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, General Medicine, Middle Aged, medicine.disease, Ribonucleoproteins, Small Nuclear, 3. Good health, Telomere, Pedigree, 030104 developmental biology, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, [SDV.IMM.IA]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Adaptive immunology, RNA, Ribosomal, 030220 oncology & carcinogenesis, Cancer research, Microcephaly, Female, Dyskeratosis congenita
Abstract: Telomeres are nucleoprotein structures at the end of chromosomes. The telomerase complex, constituted of the catalytic subunit TERT, the RNA matrix hTR and several cofactors, including the H/ACA box ribonucleoproteins Dyskerin, NOP10, GAR1, NAF1 and NHP2, regulates telomere length. In humans, inherited defects in telomere length maintenance are responsible for a wide spectrum of clinical premature aging manifestations including pulmonary fibrosis (PF), dyskeratosis congenita (DC), bone marrow failure and predisposition to cancer. NHP2 mutations have been so far reported only in two patients with DC. Here, we report the first case of Høyeraal–Hreidarsson syndrome, the severe form of DC, caused by biallelic missense mutations in NHP2. Additionally, we identified three unrelated patients with PF carrying NHP2 heterozygous mutations. Strikingly, one of these patients acquired a somatic mutation in the promoter of TERT that likely conferred a selective advantage in a subset of blood cells. Finally, we demonstrate that a functional deficit of human NHP2 affects ribosomal RNA biogenesis. Together, our results broaden the functional consequences and clinical spectrum of NHP2 deficiency.
Published: 2019
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6. Regulator of telomere length 1 ( RTEL1 ) mutations are associated with heterogeneous pulmonary and extra-pulmonary phenotypes

Author: Arturo Londoño-Vallejo, Clément Gauvain, Julie Traclet, Tristan Dégot, Vincent Cottin, Marie Wislez, Raphael Borie, Bruno Crestani, Stéphane Dominique, Lidwine Wemeau-Stervinou, Patrick Revy, Aurélie Cazes, Caroline Kannengiesser, Pierre-Antoine Juge, Hilario Nunes, Christelle Ménard, Diane Bouvry, Catherine Boileau, Jacques Cadranel, Marie-Pierre Debray, Sébastien Quétant, Anne Sophie Gamez, Hervé Mal, Grégoire Prévot, Philippe Dieudé, Madeleine Jaillet, Arnaud Mailleux, Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires (PHERE (UMR_S_1152 / U1152)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Rétrovirus et Pathologie Comparée (RPC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Département de Radiologie [Bichat] (DR- Bichat), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de pneumologie et réanimation [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Tenon [APHP], Service de Rhumatologie, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité-AP-HP, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Département pneumologie et addictologie [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Telomeres and Cancer Laboratory, Institut Curie, Service de pneumologie B, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service de cardiologie, Service de Pneumologie Pédiatrique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Trousseau [APHP], Hypoxie et Poumon : pneumopathologies fibrosantes, modulations ventilatoires et circulatoires (H&P), Université Paris 13 (UP13)-UFR SMBH, Service de pneumologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Larrey, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infections Virales et Pathologie Comparée - UMR 754 (IVPC), Université de Lyon-Université de Lyon, Service de pneumologie. Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Theranoscan, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiopathologie et Epidemiologie de l'Insuffisance Respiratoire, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Service de Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité, Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Larrey [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), UFR SMBH-Université Paris 13 (UP13), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Subjects: 0301 basic medicine, Pulmonary and Respiratory Medicine, Pathology, medicine.medical_specialty, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Gene mutation, 03 medical and health sciences, Idiopathic pulmonary fibrosis, 0302 clinical medicine, Fibrosis, Pulmonary fibrosis, Medicine, Telomerase reverse transcriptase, Exome, Exome sequencing, business.industry, Interstitial lung disease, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, respiratory system, medicine.disease, 3. Good health, respiratory tract diseases, 030104 developmental biology, 030228 respiratory system, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, [SDV.IMM.IA]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Adaptive immunology, business
Abstract: Regulator of telomere length 1 (RTEL1) mutations have been evidenced in 5–9% of familial pulmonary fibrosis; however, the phenotype of patients with interstitial lung disease (ILD) and RTEL1 mutations is poorly understood.Whole exome sequencing was performed in 252 probands with ILD and we included all patients with ILD and RTEL1 mutation. RTEL1 expression was evaluated by immunochemistry in the lungs of controls, as well as in RTEL1 and telomerase reverse transcriptase (TERT) mutation carriers.We identified 35 subjects from 17 families. Median age at diagnosis of ILD was 53.1 years (range 28.0–80.6). The most frequent pulmonary diagnoses were idiopathic pulmonary fibrosis (n=20, 57%), secondary ILD (n=7, 20%) and unclassifiable fibrosis or interstitial pneumonia with autoimmune features (n=7, 20%). The median transplant-free and overall survival periods were 39.2 months and 45.3 months, respectively. Forced vital capacity at diagnosis was the only factor associated with decreased transplant-free survival. Extra-pulmonary manifestations were less frequent as compared to other telomere-related gene mutation carriers. A systematic analysis of the literature identified 110 patients with ILD and RTEL1 mutations (including this series) and confirmed the heterogeneity of the pulmonary phenotype, the prevalence of non-idiopathic diseases and the low prevalence of extra-pulmonary manifestations.Immunohistochemistry showed that RTEL1 was expressed by bronchial and alveolar epithelial cells, as well as by alveolar macrophages and lymphocytes, but not by fibroblasts.
Published: 2019
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7. AB0007 Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis–interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis

Author: Serge Amselem, Marie-Christophe Boissier, Catherine Boileau, Benoit Wallaert, Aurélien Justet, Gabriel Thabut, Baptiste Coustet, A Clément, Bruno Crestani, Martin Soubrier, Yannick Allanore, Vincent Cottin, S. Ottaviani, Nadia Nathan, Christelle Ménard, Olivier Sand, Steven Gazal, Hilario Nunes, Lidwine Wemeau-Stervinou, H. Lioté, Isabelle Callebaut, Philippe Dieudé, Pierre-Antoine Juge, Marie-Pierre Debray, P. Richette, R.M. Flipo, Patrick Revy, Dominique Valeyre, Dlm Florence, S. Marchand-Adam, J. Sibilia, T. Schaeverbeke, Aline Frazier, Christophe Richez, Caroline Kannengiesser, Raphael Borie, Claire Dromer, and N. Saidenberg
Subjects: 0301 basic medicine, Oncology, medicine.medical_specialty, Pathology, Mutation, business.industry, Interstitial lung disease, Odds ratio, respiratory system, medicine.disease, medicine.disease_cause, respiratory tract diseases, Pathogenesis, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, 0302 clinical medicine, Usual interstitial pneumonia, 030220 oncology & carcinogenesis, Rheumatoid arthritis, Internal medicine, Pulmonary fibrosis, medicine, Genetic predisposition, business
Abstract: Background Despite its high prevalence and mortality, little is known about the pathogenesis of RA–associated interstitial lung disease (RA-ILD). Given that familial pulmonary fibrosis (FPF) and RA–ILD frequently share the usual interstitial pneumonia pattern and common environmental risk factors, we hypothesized that the two diseases may share additional risk factors including FPF-linked genes. Objectives Our aim was to identify coding mutations of FPF-risk genes associated with RA-ILD. Methods We used whole-exome sequencing (WES) followed by restricted analysis of a discrete number of FPF-linked genes and performed a Burden test to assess the excess number of mutations in RA–ILD patients compared to controls. Results Among the 101 RA–ILD patients included, 12 (11.9%) had 13 WESidentified heterozygous mutations in the TERT, RTEL1, PARN or SFTPC coding regions. The burden test, based on 81 RA–ILD patients and 1010 controls of European ancestry, revealed an excess of TERT, RTEL1, PARN or SFTPC mutations for RA–ILD patients (p=9.45’10-4, odds ratio [OR] 3.17 95% CI 1.53 – 6.12). Telomeres were shorter for RA-ILD patients with a TERT, RTEL1 or PARN mutation than controls (p=2.87x10-2). Conclusions Our results support the contribution of FPF-linked genes to RA–ILD susceptibility. Disclosure of Interest None declared
Published: 2017
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8. Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis-interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis

Author: Steven Gazal, Hilario Nunes, Jean Sibilia, Christelle Ménard, Aurélien Justet, Philippe Dieudé, Isabelle Callebaut, Amélie Bonnefond, Martin Soubrier, Patrick Revy, Catherine Boileau, Pierre-Antoine Juge, Thierry Schaeverbeke, Aline Frazier, Nathalie Saidenberg, Sébastien Ottaviani, Nadia Nathan, Bruno Crestani, Christophe Béroud, Baptiste Coustet, Vincent Cottin, Lidwine Wemeau-Stervinou, Jean-Pierre Desvignes, Marie-Christophe Boissier, Florence Dastot-Le Moal, Serge Amselem, Philippe Froguel, Yannick Allanore, Annick Clement, Olivier Sand, Gabriel Thabut, Marie-Pierre Debray, Pascal Richette, Caroline Kannengiesser, Benoit Wallaert, Christophe Richez, Dominique Valeyre, Sylvain Marchand-Adam, Huguette Lioté, Nicolas Leulliot, René-Marc Flipo, Raphael Borie, Claire Dromer, David Salgado, Service de Rhumathologie, Hôpital Bichat - Claude Bernard, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Service de Pneumologie, Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), UMR 1152, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Génétique, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), UMR 1149, Centre de Recherches sur l'Inflammation, Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Plateforme de génomique constitutionnelle, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle], Pole Cardio-vasculaire et pulmonaire [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université de Lille, Service de Radiologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), UMR 1100, Université Francois Rabelais [Tours], Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Rhumatologie, CH Belfort-Montbéliard, UMR 5164, Immuno ConcEpT Lab, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB), Sorbonne Université (SU), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université de Lille, Droit et Santé, Institut Européen de Génomique du Diabète - European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508 (EGID), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 1132, Service de Rhumatologie, Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283 (EGENODIA (GI3M)), Department of Genomics of Common Diseases, Imperial College London, Service Rhumatologie A, Hôpital Cochin [AP-HP], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Imagerie, service de Rhumatologie, Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU de Lille), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques (LGMR), Université Montpellier 1 (UM1)-IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service Rhumatologie, Hôpital La Rabta [Tunis], FMTS, CRHI, Laboratoire Immunologie Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA), Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE, Rétrovirus et Pathologie Comparée (RPC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Maladie Pulmonaires Rares, Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], UMR U1125 Service rhumatologie, service de rhumatologie, CHU Clermont-Ferrand, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Hôpital Avicenne [AP-HP], service de génétique, Societe Francaise de Rhumatologie, Club Rhumatismes Inflammation, la Chancellerie des Universites de Paris (legs Poix), Sorbonne Paris Cite (FPI-SPC Program), Agence Nationale de la Recherche ANR-10-LABX-46 ANR-10-EQPX-07-01 ANR-14-CE10-0006 ANR-10-INBS-09, France Genomique National Infrastructure, Pfizer, Chugai, Centre de Resources Biologiques Hopital Bichat Paris France, ANR-14-CE10-0006,GENEXGERTEL,Rôles génomiques et extragénomiques de RTEL1(2014), Hôpital Bichat - Claude Bernard, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris ( AP-HP ), Université Paris Diderot (Paris 7), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Saint-Etienne, UMR 1137, Fac Sci, Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Service de Pneumologie Pédiatrique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux ( UB ), Sorbonne Universités, Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie ( IMPMC ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Muséum National d’Histoire Naturelle ( MNHN ), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques ( LCRB - UMR 8015 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Université Droit et Santé (Lille 2) ( UDSL ), European Genomic Institute for Diabetes ( EGID ), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hôpital Lariboisière, Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques ( EGID ), Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), CHU Cochin [AP-HP], Institut Cochin ( UM3 (UMR 8104 / U1016) ), Centre Hospitalier Universitaire de Lille ( CHU de Lille ), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -IFR3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Hôpital La Rabta [Tunis), Université de Strasbourg ( UNISTRA ), Rétrovirus et Pathologie Comparée ( RPC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ), Département Génétique, Institut de l'Elevage, Centre Reference Maladies Respiratoires Rares, Hôpital Armand Trousseau, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris ( AP-HP ), Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne ( UNH ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne ( CRNH d'Auvergne ), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris ( AP-HP ), European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508 (EGID), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283 (GI3M), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École pratique des hautes études (EPHE), Institut de l'élevage (IDELE), ProdInra, Archive Ouverte, Centre de référence national pour les maladies respiratoires rares de l’enfant RespiRare [CHU Trousseau], Service de Pneumologie pédiatrique [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique et embryologie médicales [CHU Trousseau], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Trousseau [APHP], Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), European Genomic Institute for Diabetes [Lille] (EGID), Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques (EGID), Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Hôpital Armand Trousseau, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, Pathology, medicine.disease_cause, Arthritis, Rheumatoid, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Pulmonary fibrosis, Exome, Telomerase, Exome sequencing, Mutation, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Interstitial lung disease, Middle Aged, 3. Good health, Europe, Polyarthrite rhumatoïde, maladie pulmonaire, Phenotype, Rheumatoid arthritis, Female, Pulmonary and Respiratory Medicine, Adult, medicine.medical_specialty, Heterozygote, fibrose pulmonaire, 03 medical and health sciences, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine, Genetic predisposition, Humans, Genetic Predisposition to Disease, respiratory system diseases, Genetic Association Studies, Aged, 030203 arthritis & rheumatology, pulmonary fibrosis, business.industry, Case-control study, DNA Helicases, Sequence Analysis, DNA, medicine.disease, 030228 respiratory system, Case-Control Studies, Immunology, business, Lung Diseases, Interstitial, Software, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Despite its high prevalence and mortality, little is known about the pathogenesis of rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease (RA-ILD). Given that familial pulmonary fibrosis (FPF) and RA-ILD frequently share the usual pattern of interstitial pneumonia and common environmental risk factors, we hypothesised that the two diseases might share additional risk factors, including FPF-linked genes. Our aim was to identify coding mutations of FPF-risk genes associated with RA-ILD.We used whole exome sequencing (WES), followed by restricted analysis of a discrete number of FPF-linked genes and performed a burden test to assess the excess number of mutations in RA-ILD patients compared to controls.Among the 101 RA-ILD patients included, 12 (11.9%) had 13 WES-identified heterozygous mutations in the TERT, RTEL1, PARN or SFTPC coding regions. The burden test, based on 81 RA-ILD patients and 1010 controls of European ancestry, revealed an excess of TERT, RTEL1, PARN or SFTPC mutations in RA-ILD patients (OR 3.17, 95% CI 1.53–6.12; p=9.45×10−4). Telomeres were shorter in RA-ILD patients with a TERT, RTEL1 or PARN mutation than in controls (p=2.87×10−2).Our results support the contribution of FPF-linked genes to RA-ILD susceptibility.
Published: 2017
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9. Prevalence and characteristics of TERT and TERC mutations in suspected genetic pulmonary fibrosis

Author: Lidwine Wemeau-Stervinou, Julie Mankikian, Patrick Revy, Martine Reynaud Gaubert, Christelle Ménard, Jacques Cadranel, Dominique Israel-Biet, Hervé Mal, Grégoire Prévot, Bruno Crestani, Caroline Kannengiesser, Hilario Nunes, Abdellatif Tazi, Dominique Valeyre, Gabriel Thabut, Vincent Cottin, Marion Reocreux, Raphael Borie, Clément Picard, Stéphane Jouneau, Bernard Grandchamp, Anne Bergeron Lafaurie, Laure Tabèze, Sylvain Marchand-Adam, Jean-François Cordier, Jean-Marc Naccache, Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires (PHERE (UMR_S_1152 / U1152)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Pneumologie A, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Service de pneumologie B, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service de médecine nucléaire [Bobigny], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Référence des Maladies Pulmonaires Rares [Hôpital Louis Pradel - HCL], Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Department of Pneumology [Lyon], Hospices Civils de Lyon (HCL), Pathologies Respiratoires : Protéolyse et Aérosolthérapie, Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Larrey [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Service de pneumologie [Saint-Louis], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Theranoscan, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Service d'oncologie médicale (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, Service de Pneumologie, Paris, Etablissement Français du Sang - Alpes-Méditerranée (EFS - Alpes-Méditerranée), Etablissement Français du Sang, Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé (ADES), Aix Marseille Université (AMU)-EFS ALPES MEDITERRANEE-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Marseille, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Microenvironnement et cancer (MiCa), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Service des maladies respiratoires, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Avicenne-Jean Verdier-René Muret, Hôpital Bichat - Claude Bernard, OMMIC S.A.S., OMMIC SAS, Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiopathologie et Epidemiologie de l'Insuffisance Respiratoire, Département Hospitalo-universtaire FIRE (Fibrosis, Inflammation and Remodeling), LabEx Inflamex, Service de pneumologie A, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Bichat, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), OMMIC, Chard-Hutchinson, Xavier, Service de Pneumologie = Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Avicenne-Université Paris 13 ( UP13 ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU, Hôpital Larrey, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Service de pneumologie et réanimation [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Tenon [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Etablissement Français du Sang - Alpes-Méditerranée ( EFS - Alpes-Méditerranée ), Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé ( ADES ), Aix Marseille Université ( AMU ) -EFS ALPES MEDITERRANEE-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de recherche, santé, environnement et travail ( Irset ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) -Université des Antilles ( UA ), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Microenvironnement et cancer ( MiCa ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Groupe Hospitalier Avicenne-Jean Verdier-René Muret, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Bichat, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: Pulmonary and Respiratory Medicine, Adult, Male, Pathology, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], Macrocytosis, 030204 cardiovascular system & hematology, Gene mutation, medicine.disease_cause, Gastroenterology, [ SDV.EE ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, 03 medical and health sciences, Young Adult, 0302 clinical medicine, Internal medicine, Cause of Death, Pulmonary fibrosis, Telomerase rna, medicine, Humans, Interstitial pneumonia, Telomerase reverse transcriptase, Telomerase, Aged, Retrospective Studies, Aged, 80 and over, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Mutation, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Middle Aged, Telomere, medicine.disease, Survival Analysis, Idiopathic Pulmonary Fibrosis, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.EE] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Logistic Models, 030228 respiratory system, Multivariate Analysis, RNA, Female, France, business
Abstract: Telomerase reverse transcriptase (TERT) or telomerase RNA (TERC) gene mutation is a major monogenic cause of pulmonary fibrosis. Sequencing of TERT/TERC genes is proposed to patients with familial pulmonary fibrosis. Little is known about the possible predictors of this mutation and its impact on prognosis.We retrospectively analysed all the genetic diagnoses made between 2007–2014 in patients with pulmonary fibrosis. We evaluated the prevalence of TERT/TERC disease-associated variant (DAV), factors associated with a DAV, and the impact of the DAV on survival.237 patients with pulmonary fibrosis (153 with familial pulmonary fibrosis, 84 with telomere syndrome features without familial pulmonary fibrosis) were tested for TERT/TERC DAV. DAV was diagnosed in 40 patients (16.8%), including five with non-idiopathic interstitial pneumonia. Prevalence of TERT/TERC DAV did not significantly differ between patients with familial pulmonary fibrosis or with only telomere syndrome features (18.2% versus 16.4%). Young age, red blood cell macrocytosis, and low platelet count were associated with the presence of DAV; the probability of DAV was increased for patients 40–60 years. Transplant-free survival was lower with than without TERT/TERC DAV (4.2 versus 7.2 years; p=0.046).TERT/TERC DAV were associated with specific clinical and biological features and reduced transplant-free survival.
Published: 2016
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10. Extended clinical and genetic spectrum associated with biallelic RTEL1 mutations

Author: Laurent Jullien, Patrick Revy, Fabien Touzot, Alain Fischer, Laetitia Kermasson, Arturo Londoño-Vallejo, Isabelle Callebaut, Sinan Sari, Christelle Ménard, Figen Dogu, Vannina Giacobbi-Milet, Aydan Ikinciogullari, Amos Etzioni, Thierry Leblanc, Jean-Pierre de Villartay, Jean Soulier, Caroline Kannengiesser, Despina Moshous, Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Estación Experimental Agropecuaria Mendoza (EEA), Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'hématologie pédiatrique [Robert-Debré, Paris], AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Processus d'Activation Sélective par Transfert d'Energie Uni-électronique ou Radiatif (UMR 8640) (PASTEUR), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Genetics, Microcephaly, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, biology, DNA repair, Hematopoiesis and Stem Cells, [SDV]Life Sciences [q-bio], Bone marrow failure, Helicase, Hematology, medicine.disease, Telomere, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, hemic and lymphatic diseases, biology.protein, medicine, Missense mutation, Cerebellar hypoplasia, Immunodeficiency, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Telomeres are repetitive hexameric sequences located at the end of linear chromosomes. They adopt a lariat-like structure, the T-loop, to prevent them from being recognized as DNA breaks by the DNA repair machinery. RTEL1 is a DNA helicase required for proper telomere replication and stability. In particular, it has been postulated that RTEL1 is involved in the opening of the T-loop during telomere replication to avoid sudden telomere deletion and telomere circle (T-circle) formation. In humans, biallelic RTEL1 mutations cause Hoyeraal-Hreidarsson syndrome (HH), a rare and severe telomere biology disorder characterized by intrauterine growth retardation, bone marrow failure, microcephaly and/or cerebellar hypoplasia, and immunodeficiency. To date, 18 different RTEL1 mutations have been described in 19 cases of HH with short telomeres. The impaired T-loop resolution has been proposed to be a major cause of telomere shortening in RTEL1 deficiency. However, the biological and clinical consequences of this disorder remain incompletely documented. Here, we describe 4 new patients harboring biallelic RTEL1 mutations, including 2 novel missense mutations located in the C-terminal end of RTEL1 (p.Cys1268Arg and p.Val1294Phe). Clinical characteristics from these 4 patients were collected as those from 4 other RTEL1-deficient patients previously reported. In addition, we assessed whether T-circles, the product of improper T-loop resolution, were detected in our RTEL1-deficient patients. Overall, our study broadens and refines the clinical and biological spectrum of human RTEL1 deficiency.
Published: 2016
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11. Pleuroparenchymal fibroelastosis associated with telomerase reverse transcriptase mutations

Author: Christelle Ménard, Hilario Nunes, Florence Jeny, Pierre-Yves Brillet, Caroline Kannengiesser, Clément Picard, Jean-François Bernaudin, Dominique Valeyre, Diane Bouvry, and Marianne Kambouchner
Subjects: Pulmonary and Respiratory Medicine, Mutation, Telomerase, Lung, business.industry, medicine.disease, medicine.disease_cause, Article, Idiopathic pulmonary fibrosis, 03 medical and health sciences, Text mining, medicine.anatomical_structure, 0302 clinical medicine, 030228 respiratory system, 030220 oncology & carcinogenesis, Mutation (genetic algorithm), Cancer research, Medicine, Telomerase reverse transcriptase, 030212 general & internal medicine, business, Gene
Abstract: A diagnosis of PPFE is linked to pathogenic variants in three different telomere-related genes http://ow.ly/eGOq30aPkgx
Published: 2016

12. Severe Pulmonary Fibrosis as the First Manifestation of Interferonopathy (TMEM173 Mutation)

Author: Christelle Ménard, Martine Reynaud-Gaubert, Cécile Picard, Nadia Jeremiah, Bruno Crestani, Philippe Reix, Frédéric Rieux-Laucat, Alexandre Belot, Jean-Christophe Dubus, Françoise Thivolet-Béjui, Véronique Secq, Caroline Kannengiesser, Guillaume Thouvenin, Etablissement Français du Sang - Alpes-Méditerranée ( EFS - Alpes-Méditerranée ), Etablissement Français du Sang, Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé ( ADES ), Aix Marseille Université ( AMU ) -EFS ALPES MEDITERRANEE-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Pneumologie Pédiatrique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de recherche sur l'Inflammation ( CRI ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratory of Excellence GR-Ex ' The red cell : from genesis to death ', PRES Sorbonne Paris Cité, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes ( URMITE ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Service de Pneumologie et Centre de Compétence des Maladies Pulmonaires Rares [AP-HP Hôpital Bichat, Paris], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Genetic Medicine, University of Manchester [Manchester]-Faculty of Human and Medical Sciences, Service de néphrologie, rhumatologie et dermatologie pédiatriques, Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital Mère Enfant, Centre International de Recherche en Infectiologie ( CIRI ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre national référent cancers rares - mésothéliomes malins pleuraux et tumeurs péritonéales rares ( MESOPATH ), CHU Caen-Hôpital côte de nacre, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille ( CRCM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), APHP Service de Génétique, Hôpital Bichat, Hôpital Nord [CHU - APHM], Service de pneumologie [Centre Hospitalier Lyon Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL), Réponse immunitaire innée dans les maladies infectieuses et auto-immunes – Innate immunity in infectious and autoimmune diseases, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hopital Bichat, Departement de Genetique, Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires (PHERE (UMR_S_1152 / U1152)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Mère Enfant, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), RespiRare - Centre pédiatrique de pneumologie et de référence pour les maladies pulmonaires rares [AP-HP Hôpital Armand-Trousseau], AP-HP Hôpital Armand-Trousseau [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Pulmonary and Respiratory Medicine, Adult, Male, medicine.medical_specialty, Pathology, medicine.medical_treatment, Pulmonary Fibrosis, Primary Graft Dysfunction, Disease, Critical Care and Intensive Care Medicine, Gastroenterology, Severity of Illness Index, Autoimmune Diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Fatal Outcome, Fibrosis, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Internal medicine, Pulmonary fibrosis, medicine, Lung transplantation, Humans, Child, 030203 arthritis & rheumatology, Inflammation, business.industry, Interstitial lung disease, Infant, Membrane Proteins, medicine.disease, 3. Good health, Transplantation, Chilblains, [ SDV.MHEP.MI ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, 030104 developmental biology, Mutation, Female, Cardiology and Cardiovascular Medicine, business, Vasculitis, Tomography, X-Ray Computed
Abstract: International audience; We report three cases of pulmonary disease suggesting fibrosis in two familial and one sporadic case. Pulmonary symptoms were associated with various clinical features of systemic inflammation and vasculitis involving the skin, and appeared at different ages. A strong interferon signature was found in all three cases. Disease was not responsive to corticosteroids, and lung transplantation was considered for all three subjects at an early age. One of them underwent double-lung transplantation, but she immediately experienced a primary graft dysfunction and died soon after. Recognized causes of familial interstitial lung disease were all excluded. All three subjects had a mutation in the previously described autoinflammatory disease called SAVI (stimulator of interferon genes [STING]-associated vasculopathy with onset in infancy). These cases emphasize the need to consider this possibility in children and young adults with lung fibrosis after common causes have been ruled out.
Published: 2016
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13. Fond génétique partagé entre la pneumopathie interstitielle diffuse associée à la polyarthrite rhumatoïde et la fibrose pulmonaire idiopathique

Author: Sylvain Marchand-Adam, Christophe Béroud, Huguette Lioté, Nicolas Leulliot, Christelle Ménard, Nadia Nathan, Aline Frazier, P. Richette, Benoit Wallaert, J. Sibilia, Patrick Revy, Martin Soubrier, Steven Gazal, Bruno Crestani, Sébastien Ottaviani, Jean-Pierre Desvignes, Hilario Nunes, S. Amselem, Y. Allanore, Dominique Valeyre, N. Saidenberg, Aurélien Justet, Gabriel Thabut, Annick Clement, Vincent Cottin, Olivier Sand, Christophe Richez, P.A. Juge, Philippe Froguel, Catherine Boileau, Isabelle Callebaut, R.M. Flipo, T. Schaeverbeke, Amélie Bonnefond, Marie-Christophe Boissier, Marie-Pierre Debray, Baptiste Coustet, Philippe Dieudé, F. Dastot Le Moal, Caroline Kannengiesser, Lidwine Wemeau-Stervinou, Raphael Borie, Claire Dromer, and David Salgado
Subjects: Pulmonary and Respiratory Medicine, Rheumatology
Abstract: Introduction La pneumopathie interstitielle diffuse (PID) est l’une des causes majeure de mortalite chez les patients atteints de polyarthrite rhumatoide (PR). Malgre une prevalence et une mortalite importante, la physiopathologie de la PID associee a la PR (PR-PID) reste meconnue. La PR-PID partage plusieurs caracteristiques phenotypiques avec la fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) telles que l’aspect de pneumopathie interstitielle commune sur le scanner et un pronostic tres severe. Enfin, les similitudes entre PR-PID et FPI concernent egalement les facteurs environnementaux (tabac,…) suggerant que ces deux pathologies pourraient egalement partager des facteurs de risques genetiques tels que ceux predisposant a la FPI familiale (FPF). Methodes Nous avons utilise des donnees d’exome obtenue par whole-exome sequencing (WES) de patients atteints de PR-PID provenant de differents centres de rhumatologie et de pneumologie francais. L’ensemble des patients PR-PID+ repondaient aux criteres ACR/EULAR 2010. Le diagnostic de PID etait realise apres analyse de scanner thoracique de haute resolution. Apres une analyse restrictive de 9 genes rapportes comme etant associes aux FPF, nous avons compare le nombre de mutations retrouvees parmi les patients PR-PID au nombre de mutations retrouvees chez des individus temoins. Un burden test a ete effectue pour definir l’exces de mutations chez les patients PR-PID au sein de ces 9 genes d’interet. Resultats Parmi les 101 patients PR-PID inclus, 12 (11,9 %) presentaient des mutations au sein des regions codantes des genes TERT, RTEL1, PARN et SFTPC. Le burden test comparant 81 patients PR-PID a 1010 individus temoins caucasiens europeens a confirme un exces de mutations parmi ces genes chez les patients PR-PID (P = 9,45 × 10−4 ; OR = 3,17 ; IC 95 % 1,53–6,12). Chez les patients PR-PID porteurs de mutations des genes TERT, RTEL1 et PARN, appartenant au complexe telomerase, la taille des telomeres etait significativement plus petite que celle observees chez les temoins (P = 2,87 × 10−2). Conclusion Ces resultats sont en faveur d’un fond genetique commun entre FPI et PR-PID, suggerant une physiopathologie commune entre ces deux pathologies. En cas de confirmation de ces resultats, les avancees therapeutiques realisees dans la prise en charge des FPI pourraient alors beneficier aux patients atteints de PR-PID.
Published: 2016
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13 results on '"Christelle Ménard"'

1. Proceedings of the 23rd Paediatric Rheumatology European Society Congress: part three

2. Extended clinical and genetic spectrum associated with biallelic RTEL1 mutations

3. First clinical description of a pedigree with complete NAF1 deletion

4. Telomere-Related Gene mutations in a Greek cohort of suspected monogenic pulmonary fibrosis patients

5. NHP2 deficiency impairs rRNA biogenesis and causes pulmonary fibrosis and Høyeraal-Hreidarsson syndrome

6. Regulator of telomere length 1 ( RTEL1 ) mutations are associated with heterogeneous pulmonary and extra-pulmonary phenotypes

7. AB0007 Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis–interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis

8. Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis-interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis

9. Prevalence and characteristics of TERT and TERC mutations in suspected genetic pulmonary fibrosis

10. Extended clinical and genetic spectrum associated with biallelic RTEL1 mutations

11. Pleuroparenchymal fibroelastosis associated with telomerase reverse transcriptase mutations

12. Severe Pulmonary Fibrosis as the First Manifestation of Interferonopathy (TMEM173 Mutation)

13. Fond génétique partagé entre la pneumopathie interstitielle diffuse associée à la polyarthrite rhumatoïde et la fibrose pulmonaire idiopathique

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