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Buisson, Anthony, Sokol, Harry, Hammoudi, Nassim, Nancey, Stéphane, Treton, Xavier, Nachury, Maria, Fumery, Mathurin, Hebuterne, Xavier, Rodrigues, Michael, Hugot, Jean-Pierre, Boschetti, Gilles, Stefanescu, Carmen, Wils, Pauline, Seksik, Philippe, Le Bourhis, Lionel, Bezault, Madeleine, Sauvanet, Pierre, Pereira, Bruno, Allez, Matthieu, Barnich, N., CHU Clermont-Ferrand, Service de rhumatologie [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, CHU Amiens-Picardie, Périnatalité et Risques Toxiques - UMR INERIS_I 1 (PERITOX), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Département de Gastroentérologie, Hôpital de l'Archet 2, Beaujon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Sorbonne Université (SU), Theraptosis S.A., Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre de Recherche en Nutrition Humaine, Service de chirurgie digestive, Hôpital Saint-André, Hôpital Saint-Louis, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), DESSAIVRE, Louise, Service d'Hépatologie Gastro-entérologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Servcie Hépato-gastroentérolgie et Nutrition clinique [CHU Nice], Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Remind Study Group, Unité de Biostatistiques [CHU Clermont-Ferrand], Direction de la recherche clinique et de l’innovation [CHU Clermont-Ferrand] (DRCI), and European Crohn’s and Colitis Organisation

Marion Tilmant, Romain Altwegg, Laurent Peyrin-Biroulet, Lucine Vuitton, Anthony Buisson, Mélanie Serrero, Pierre Vanelslander, Adnane Lamrani, Franck Brazier, Mathurin Fumery, Guillaume Bouguen, Lucile Boivineau, Laurent Poincloux, Guillaume Savoye, Florian Poullenot, David Laharie, Maria Nachury, Jérôme Filippi, Ariane Desjeux, P Basile, Clara Yzet, Xavier Hébuterne, Eric Le Balch, Benjamin Pariente, Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie], CHU Amiens-Picardie, Hôpital Nord [CHU - APHM], Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Polyclinique Saint-Claude, CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Nutrition, inflammation et dysfonctionnement de l'axe intestin-cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)

Adrien Lemaignen, Céline Nourrisson, Virginie Bonnin, Virginie Morange, Florent Morio, Marie-Alix De Kyvon, Maxime Moniot, Philippe Poirier, Guillaume Desoubeaux, E. Bailly, Marjan Ertault De La Bretonniére, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100 (CEPR), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (CHU de Clermont-Ferrand), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Université Clermont Auvergne (UCA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (Institut de biologie, CHU de Nantes), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Gabriel Montpied (CHU), CHU Clermont-Ferrand, Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Parasitologie et Mycologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Arnaud Bourreille, Julien Branche, Laurent Beaugerie, Yoram Bouhnik, Stéphane Nahon, Mathurin Fumery, Benoit Coffin, Philippe Marteau, Matthieu Allez, Guillaume Savoye, Javier P. Gisbert, Martine De Vos, Jean-Yves Mary, Jacques Moreau, Elena Ricart, Laurent Peyrin-Biroulet, Xavier Roblin, Jérôme Filippi, Franck Carbonnel, Maria Esteve, Olivier Dewit, Aurelien Amiot, David Laharie, Martti Färkkilä, Lucine Vuitton, Anthony Buisson, Antonio López-Sanromán, Gert Van Assche, Frank Zerbib, CHU Bordeaux [Bordeaux], CIC Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Hôtel-Dieu de Nantes, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Hôpital Beaujon [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hôpital l'Archet, Nutrition, inflammation et dysfonctionnement de l'axe intestin-cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Hôpital JeanMinjoz, CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital Henri Mondor, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de Gastroentérologie et nutrition [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centro de Investigación Biomédica en Red en el Área temática de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), Liver Unit, Clínica Universitaria, CIBER-EHD, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Hospital Universitario Ramón y Cajal [Madrid], Universidad de Alcalá - University of Alcalá (UAH), CHU Amiens-Picardie, Périnatalité et Risques Toxiques - UMR INERIS_I 1 (PERITOX), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Service d'Hépato-gastro-entérologie [APHP Kremlin-Bicêtre], AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Infection Inflammation et Interaction Hôtes Pathogènes [CHU Clermont-Ferrand] (3IHP ), Direction de la recherche clinique et de l’innovation [CHU Clermont-Ferrand] (DRCI), CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Hôpital Nord (Saint Etienne), University Hospitals Leuven [Leuven], University of Helsinki, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU), Groupe Hospitalier Intercommunal Le Raincy-Montfermeil, Ghent University Hospital, Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Equipe 2 : ECSTRA - Epidémiologie Clinique, STatistique, pour la Recherche en Santé (CRESS - U1153), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre of Excellence in Complex Disease Genetics, HUS Abdominal Center, Department of Medicine, Gastroenterologian yksikkö, Helsinki University Hospital Area, Hôpital Archet 2 [Nice] (CHU), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Service de Gastro-Entérologie [CHRU Besançon], Service de Gastro-entérologie et Nutrition[Rangueil], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Service de gastro-entérologie [Henri Mondor AP-HP, Créteil], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor, Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS), Universitat de Barcelona (UB), Hospital Clínic de Barcelona, Cliniques Universitaires Saint-Luc [Bruxelles], Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie], Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie-Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service d'Hépato-gastroentérologie [CHU Saint-Etienne], Hospital Universitario Mutua de Terrassa, Helsinki University Central Hospital [Finland] (HUCH), Universidad Autonoma de Madrid (UAM), Hospital Universitario de la Princesa, Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHU Tenon], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Association Francois Aupetit, CHU Rouen, Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service d'Hépatologie Gastro-entérologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), DESSAIVRE, Louise, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)

J. Ross Miller, Anke Liebert, Claire Fraser, Mariana Portovedo, Marco Aurélio Ramirez Vinolo, Raphaël Mattiuz, Payal Jain, Marc Veldhoen, Claudia Stellato, Juri Kazakevych, Patrick Varga-Weisz, Jérémy Denizot, Marina Célestine, Mia Mosavie, Hanneke Okkenhaug, Renan O. Corrêa, The Babraham Institute [Cambridge, UK], Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), The Francis Crick Institute [London], University of Campinas (UNICAMP), School of Biological Sciences [Colchester], University of Essex, Laboratory of Lymphocyte Signalling and Development [Cambridge, UK] (Babraham Research Campus), Instituto de Medicina Molecular (iMM), Faculdade de Medicina [Lisboa], Universidade de Lisboa (ULISBOA)-Universidade de Lisboa (ULISBOA), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) [BBS/E/B/000C0404], [BBS/E/B/000C0405], BBSRC-Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado de Sao Paulo/FAPESP-Brazil [BB/N013565/1, 2015/50379-1], Medical Research Council UK (MRC) [MR/N009398/1], Newton Advanced Fellowship from the Royal Society [NAF\R1\180116], Repositório da Universidade de Lisboa, ROSSI, Sabine, Universidade Estadual de Campinas = University of Campinas (UNICAMP), Universidade de Lisboa = University of Lisbon (ULISBOA)-Universidade de Lisboa = University of Lisbon (ULISBOA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (CIML), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Division of Molecular Immunology, and Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC)BBS/E/B/000C0404BBS/E/B/000C0405Medical Research Council UK (MRC)MR/N009398/1BBSRC-Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado de Sao Paulo/FAPESP-Brazil BB/N013565/12015/50379-1Newton Advanced Fellowship from the Royal Society NAF\R1\180116

Hyungjun Yang, Sébastien G. Gouin, Nicolas Barnich, Wayne Vogl, Gregor S. D. Reid, Bruce A. Vallance, Else S. Bosman, Hengameh Chloé Mirsepasi-Lauridsen, Caixia Ma, Karen A. Krogfelt, Adeline Sivignon, Xiaoxia Li, Carsten Struve, Andreas Petersen, Hongbing Yu, Kevan Jacobson, Abbas Fotovati, Joannie M. Allaire, BC Children's Hospital Research Institute [Vancouver, BC, Canada] (BCCHR), University of British Columbia (UBC), Statens Serum Institut [Copenhagen], Department of Biology [Copenhagen], Faculty of Science [Copenhagen], University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Immunology [Lerner Research Institute, Cleveland Clinic], Lerner Research Institute [Cleveland, OH, USA], Cleveland Clinic-Cleveland Clinic, Copenhagen University Hospital, Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Crohn's and Colitis Canada (CCC), Canadian Institutes of Health Research (CIHR), BCHRI Clinician Scientists Award Program, University of British Columbia, CH.I.L.D. Foundation, University of Copenhagen, Statens Serum Institute, Torben and Alice Frimodts Foundation, BC Children's Hospital Research Institute (BCHRI), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Department of Immunology [Cleveland Clinic Lerner Research Institute], Cleveland Clinic Lerner Research Institute, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and gouin, sébastien

Benoit Chassaing, Nicolas Barnich, Emilie Viennois, Philip E. Dubé, Alexis Bretin, Alexander C. Maue, Charlène J.G. Dauriat, Andrew T. Gewirtz, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Georgia State University, University System of Georgia (USG), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Kenneth Rainin Foundation European Commission Research Executive Agency European Research Council (ERC)ERC-2018-StG-804135Crohn's and Colitis Foundation United States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USADK099071DK083890, ANR-18-IDEX-0001,Université de Paris,Université de Paris(2018), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Simon Le Hello, Racha Beyrouthy, François Gravey, Richard Bonnet, François Guérin, Laetitia Fabre, Frédéric Ethuin, Vincent Cattoir, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Bactéries pathogènes entériques (BPE), Institut Pasteur [Paris] (IP), CHU Clermont-Ferrand, Région Normandie, Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut Pasteur [Paris], Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Jonchère, Laurent

Agnès Burel, Vincent Cattoir, Caroline Leyer, Mohamed Sassi, Samer Kayal, Richard Bonnet, Racha Beyrouthy, Frédéric Gourmelen, CHU Pontchaillou [Rennes], ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CH de Saint-Malo [Broussais], Biosit : biologie, santé, innovation technologique (SFR UMS CNRS 3480 - INSERM 018), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre de Microscopie de Rennes (MRic), Université de Rennes (UR)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques [CHU Clermont-Ferrand] (CNR), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques [CHU Rennes] (CNR), No relevant financial disclosures or funding to declare, Jonchère, Laurent, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )

Victor Judith, Devaux Mathilde, Corre Clémence, Morin Franck, Ebstein Esther, Desmurs Marie, Juillard Laurent, Descamps Elise, Galland Joris, Gahier Penhoat Mélanie, Hellier Jean-Pierre, Mariette Xavier, Poix Elsa, Hudry Christophe, Constant Elodie, Trijau Sophie, Moranne Olivier, Diot Elisabeth, Hie Miguel, Guilpain Philippe, Boussoualim Karima, Mathian Alexis, Pouchot Jacques, Rohmer Julien, Senet Patricia, Michaud Martin, Tieulie Nathalie, Liote Frédéric, Ducornet Angélique, Couret Marie, Revuz Sabine, Morel Hugo, Moly Marie, Direz Guillaume, Milesi-Lecat Anne-Marie, Meinzer Ulrich, Bader-Meunier Brigitte, Steib Sarah, Gauthier-Prieur Maud, Bertolini Ewa, Gombert Bruno, Dumel Anne-Elisabeth, Henriot Basile, Froissart Antoine, Smets Perrine, Robin Sophie, Rousselin Clémentine, Moulinier Laurence, Mazet-Guillaume Betty, Brondino Regine, Malochet-Guinamand Sandrine, Balandraud Nathalie, Gibert Christelle, Godeau Bertrand, Aeschlimann Florence, Bonnet Christine, Plassard Samira, Lebrun Agnès, Mehsen-Cetre Nadia, Arlet Jean-Benoît, Gagneux-Lemoussu Laurence, Kemiche Farid, Michon Mathilde, Szafors Paulina, Werle Claude, Guillaud Constance, La Batide Alanore Sylvain, Borie Raphaël, Chazerain Pascal, Puyraimond-Zemmour Déborah, Barrelet Audre, Bach-Bunner Maxime, Flaisler Françoise, Euvrard Romain, Evon Philippe, Feurer Elodie, Gerard Nathalie, Gervais Elisabeth, Sordet Christelle, Bally Stéphane, Mazouyez Arnaud Angers, Guillot Xavier, Comarmond Chloé, Leloire Olivier, Fauconier Marion, Bouhour Françoise, Woessner Juliette, Jaccard Clara, Langlois Vincent, Sicaud Aurélie, Rolland Michel, Kabala Anna, Atlan Lucie, Amador-Borreiro Blanca, Jan Catherine, Leturcq Tifenn, Gonnet-Gracia Camille, Lanot Sylvain, Hachulla Eric, Bonidan Olivier, Domont Fanny, Dumaine Cécile, Bouiller Kévin, Senbel Eric, Comparon Céline, Huguenel Serge, Despaux Jacques, Roth Olivier, Berthoux Emilie, Dehimat Sarahe, Costedoat-Chalumeau Nathalie, Bayer Guillaume, Melki Isabelle, Toussirot Eric, Buchlin Pierre, Baumier Vincent, Charcot Agnès, Durand Géraldine, Garraud Thomas, Richez Christophe, Gillard Jérôme, Chaigne Benjamin, Rousiere Mickaël, Le Guen Guegan Sophie, Chertok Pascale, Lucas Virginie, Sadji Fatiha, Garnier Nicole, Sailler Laurent, Garrot Jean-François, Taffignon-Clave Séverine, Charles Pierre, Bernoux-Manat Brigitte, Salliot Carine, Fechtenbaum Jacques, Quenet Marion, Le Guenno Guillaume, Lanteri Aurélia, Hermet Marion, Delahousse Michel, Basch André, Grateau Gilles, Chevalier Xavier, Nocturne Gaétane, Schmidt Jean, Pacaud-Vitoux Isabelle, Roumier Mathilde, Rozenberg Sylvie, Veillard Eric, Roux Nicolas, Marhadour Thierry, Colette-Cedoz Marie-Eve, Cohen Gregory, Foltz Violaine, Fouque-Aubert Anne, Havard Marie-Noelle, Molto Anna, Chevreau Maxime, Strotz Victor, Allanore Yannick, Grardel Bruno, Francois-Pradier Hélène, Devauchelle-Pensec Valérie, Hennequin Pascal, Warzocha Ursula, Collercandy Nived, Bayle Sophie, Audren Victor, Virone Alexandre, Bennet Pascal, Grados Franck, Charpin Caroline, Fuzibet Piera, Albert Jean-David, Larbre Jean-Paul, Coutarel Cécile, Nicolas-Vullierme Sabine, Gastaldi Romain, Guyot Marie-Hélène, Georgescu Dana, Clavel Gaëlle, Tison Alice, Viallard Jean-François, Maria Alexandre, Glanowski Camille, Leroux Christophe, Vidon Mathias, Banal Frédéric, Fulpin Jean, Chotard Emilie, Gaud-Listrat Véronique, Jean Sylvie, Seguier Julie, Jacquemier Jean-Michel, Chatelus Emmanuel, Djeddi Djamal-Dine, Contamine-Sur-Arve Mazyad Hassan, Georgin-Lavialle Sophie, Belot Alexandre, Seve Pascal, Willems Alexandra, Moulis Guillaume, Latourte Augustin, Roux Marielle, Bolla Gilles, Renard Myriam, Xerri-Campano Bernadette, Bisson-Vaivre Aurélia, Fichet Amandine, Dufauret-Lombard Carine, Nielly Hubert, Ledoult Emmanuel, Alcais Didier, Giraudet-Le Quintrec Jeanine-Sophie, Wendling Daniel, Govindaraju-Audouard Sophie, Claudepierre Pascal, Fritz Pierre, Fougerousse Anne-Claire, Marotte Hubert, Fabre Sylvie, Banneville Béatrice, Quartier-Dit-Maire Pierre, Juge Pierre-Antoine, Moura Bertrand, Maillet Thibault, Messer Laurent, Thomachot Benoît, Giraud-Morelet Aude, Sparsa Lætitia, Kabchou Abdelkrim, Grasland Anne, Maurier François, Belin Véronique, Grenoble Gimonnet Pauline, Balblanc Jean-Charles, Andre Emma, Veillard Ericveillard Marie-Eliseeric, Chu Miow Lin, Pugnet Grégory, Wisniewski Michel, Carbasse Aurélia, Rene Jessica, Economu-Dubosc Andra, Bouldoires Bastien, Glace Baptiste, Benhamou Mathilde, Legoupil Nathalie, Morel Jacques, Castel Brice, Lafforgue Pierre, Carteni Maurizio, Lohse Anne, Detree Frédérick, Celant Annalisa, Trefond Ludovic, Maillard Hélène, Remy Philippe, Barnetche Thomas, Servettaz Amélie, Vigne Camille, Ferreira-Maldent Nicole, Mangon Quentin, Keraen Jérémy, Fautrel Bruno, Frantzen Léa, Legrand Erick, Sellam Jérémie, Tenenbaum Nora, Sene Thomas, Duc Catherine, Bouvard Eric, Dieudonne Yannick, Ollagnon Henri-Olivier, Deslandre Chantal, Gury Aline, Desplats Marie, Karman Françoise, Drouet Béatrice, Vidon Claire, Kone-Paut Isabelle, Groza Monica, Jamard Bénédicte, Parrot Antoine, Vial Guillaume, Ebbo Mikaël, Ait-Abdallah Nassim, Veillon Laurent, Roriz Mélanie, Chaillous Benoît, Rouidi Sid-Ahmed, Sobanski Vincent, Poulet Antoine, Clavel-Osorio Cyril, Nguyen Minh, Felten Renaud, Goulenok Tiphaine, Audoin-Pajot Christine, Foret Jennifer, Arniaud Denis, Benammar Mohammed, Boudou Laurence, Pascaud-Mansour Yasmina, Pavy Stephan, Sornay-Rendu Elisabeth, Pascart Tristan, Madelon Aurélie, Koreichi Abdeldajallil, Flipo René-Marc, El Mahou Soumaya, Benmansour Ahmed, Arty-Hue Herliette, Pers Yves-Marie, Hittinger-Roux Ambre, Sacco Isabelle, Fernandes Fanny, Gandjbakhch Frédérique, Maury Frédéric, Hacquard-Bouder Cécile, Foutrier-Morello Catherine, Rossi Linda, Belkhir Rakiba, Riviere Etienne, Drumez Elodie, Avouac Jérôme, Benainous Ruben, Champy Romuald, Florens Nans, Pichon Maud, Gibert Eric, Benhamou Ygal, Portier Agnès, Riviere Sébastien, Pham Thao, Blaison Gilles, Colombey Antoine, Marchou-Lopez Sylvie, Roux Fabienne, Leroy Rémi, Lejeune Charlotte, Bacquet-Deschryver Hélène, Romier Mélanie, Simoens Justine, Caumont Hervé, Arnaud Laurent, Paulin Lætitia, Duret Pierre-Marie, Dieude Philippe, Coury-Lucas Fabienne, Pha Micheline, Herasse Muriel, Mahevas Matthieu, Roitg Isabelle, Karkowski Ludovic, Dhote Robin, Chaudier Bernard, Gourmelen Olivier, Trouillier Sébastien, Henry Julien, Daver-Malaterre Laurence, Cathebras Pascal, Goupille Philippe, Seror Raphaële, Thomas Thierry, Pertuiset Edouard, Amoura Zahir, Richard-Colmant Gaëlle, Souchaud-Debouverie Odile, Lahalle Sophie, Jouvray Mathieu, Hentgen Véronique, Courvoisier Natacha, Charlot-Lambrecht Isabelle, Damade Richard, Argenteuil Pizana Gabrielle, Fontanges Elisabeth, Morel Gautier, Roux Christian, Perard Laurent, Gaches Francis, Cacoub Patrice, Mekinian Arsène, Cohen Fleur, Margarit Nathalie, Salmon Jean-Hugues, Guillaume Séverine, Gilson Mélanie, Coutier Fabrice, Rouzaud Diane, Duhamel Alain, Combe Bernard, Jullien Denis, Gill Ghislaine, Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Pontchaillou [Rennes], Service de rhumatologie [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Université Paris Cité - UFR Médecine Paris Centre [Santé] (UPCité Médecine Paris Centre), Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], CH Belfort-Montbéliard, Service de néphrologie - dialyse [Centre hospitalier Métropole Savoie - Chambéry], Centre Hospitalier Métropole Savoie [Chambéry], Hôpital d'Instruction des Armées Begin, Service de Santé des Armées, Service de Rhumatologie [CHU Pitié Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Hôpital Avicenne [AP-HP], Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de rééducation et de réadaptation de l'appareil locomoteur et des pathologies du rachis [CHU Cochin], CHU Rouen, Normandie Université (NU), Centre hospitalier Saint Joseph - Saint Luc [Lyon], Médecine interne [Hôpitaux civils de Colmar], Hôpitaux Civils de Colmar, Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap), Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires (PHERE (UMR_S_1152 / U1152)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Service d'Electroneuromyographie et Service de Neurologie C [Hôpital Pierre Wertheimer - HCL], Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Département de médecine interne et immunologie clinique [CHU Pitié-Salpêtrière] (DMIIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Hôpital Cochin [AP-HP], PSA Peugeot Citroën (PSA), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Hôpital d'Instruction des Armées Laveran, Service de rhumatologie [Groupe Hospitalier Diaconesses Croix Saint Simon], Groupe Hospitalier Diaconesses Croix Saint-Simon, Service de rhumatologie [CHU Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor, Université Grenoble Alpes - UFR Médecine (UGA UFRM), Université Grenoble Alpes (UGA), Université Paris Descartes - Faculté de Médecine (UPD5 Médecine), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Epidemiology in Dermatology and Evaluation in Therapeutics (EpiDermE), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rotschild, Service de Médecine Intensive et Réanimation [Tours], Service de médecine interne [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Département de Rhumatologie[Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Lapeyronie, Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Université de Bordeaux (UB)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AGROCAMPUS OUEST, Hôpital Foch [Suresnes], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHRU Brest - Service de Rhumatologie (CHU - BREST - Rhumato), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Service de Médecine Interne [CHI Poissy-Saint-Germain], Centre Hospitalier Intercommunal de Poissy-Saint Germain-en-Laye (CHI Poissy-Saint Germain-en-Laye), Service de médecine interne [Avicenne], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Bretonneau, Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (METRICS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Service de rhumatologie [Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de rhumatologie (Hôpitaux Civils de Colmar), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de rhumatologie [CH Gustave Dron, Tourcoing], Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Chimie Agro-Industrielle (CAI), Ecole nationale supérieure des ingénieurs en arts chimiques et technologiques-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service d'immuno-rhumatologie[Montpellier], Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Lapeyronie, CHU Trousseau [Tours], Physiopathologie, diagnostic et traitements des maladies osseuses / Pathophysiology, Diagnosis & Treatments of Bone Diseases (LYOS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de rhumatologie[Lille], Hôpital Roger Salengro [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier de Dax, Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Hôpital Joseph Ducuing - Varsovie [Toulouse] (HJD), Hôpitaux Privés de Metz (HPMetz), Service de rhumatologie [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de Médecine Interne = Hôpital de jour de médecine [CHU Tenon], Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Service de médecine interne [Centre hospitalier Lons le Saunier], Centre hospitalier Lons le Saunier, Service de Rhumatologie [CHU de Grenoble], Hôpital Sud de Grenoble, Centre d'Investigation Clinique Henri Mondor (CIC Henri Mondor), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hopital saint louis (LA ROCHELLE - Hôpital Saint Louis), CH La Rochelle, Service de Médecine Interne [AP-HP, CHU Beaujon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Beaujon [AP-HP], CHU Trousseau [APHP], CHU Amiens-Picardie, Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Langues et civilisations à tradition orale (LACITO), Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3-Institut National des Langues et Civilisations Orientales (Inalco)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Études Pharmaco-Immunologie (EPI), Université de La Réunion (UR), Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 (INFINITE (Ex-Liric)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance publique-Hôpitaux de Paris - Espace éthique (AP-HP Espace éthique), Centre de Référence des Maladies Auto-Inflammatoires et des Amyloses [CH Versailles] (CeRéMAIA - Hôpital André Mignot), Centre Hospitalier de Versailles André Mignot (CHV), Physiopathologie et thérapie du muscle strié, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR14-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Maison Blanche, CHU Toulouse [Toulouse], Département de Pédiatrie [Rennes] = Paediatrics [Rennes], Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Club Rhumatismes et Inflammation, Service de Rhumatologie [CHU Bicêtre], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Arthrites autoimmunes (AA), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Intercommunal Alençon-Mamers (CHICAM), Service de Médecine interne [CH Antibes Juan-Les-Pins], Centre Hospitalier d’Antibes Juan-les-Pins (CH Antibes Juan-Les-Pins), Centre de référence des rhumatismes inflammatoires et maladies auto-immunes systémiques rares de l’enfant / National Referee Centre for Rheumatic and AutoImmune and Systemic Diseases in Children [Lyon] (RAISE), Biologie de l'Os et du Cartilage : Régulations et Ciblages Thérapeutiques (BIOSCAR (UMR_S_1132 / U1132)), CHU Clermont-Ferrand, Université de Lille, Groupe d'Études Remodelage Osseux et bioMatériaux (GEROM), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Victor Jousselin de Dreux, Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Centre Hospitalier de Belfort (Service de Rhumatologie), Oncology, Regional Hospital of Orleans, IMRB - 'Transfusion et Maladies du Globule Rouge' [Créteil] (U955 Inserm - UPEC), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de médecine interne et immunologie clinique (SOC 1) [CHU de Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Center for Immunology of Viral Infections and Autoimmune Diseases, Le Kremlin Bicêtre, INSERM U1059, SAINBIOSE - Santé, Ingénierie, Biologie, Saint-Etienne (SAINBIOSE-ENSMSE), Centre Ingénierie et Santé (CIS-ENSMSE), École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de rhumatologie, CHU Saint-Etienne, Paediatrics, Paediatric Internal Medicine, Rheumatology and Infectious Diseases [Paris], Centre de référence des rhumatismes inflammatoires et maladies autoimmunes systémiques rares de l'enfant [Paris] (RAISE), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Service de rhumatologie [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Service de Rhumatologie [CHRU Montpellier], Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] (IFCT), Intergroupe Francophone de Cancérologie thoracique, Histoire, Archéologie et Littératures des mondes chrétiens et musulmans médiévaux (CIHAM), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Consultation Marfan, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bichat, Columbia University Irving Medical Center (CUIMC), Immunologie des Maladies Virales et Autoimmunes (IMVA - U1184), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Rhumatologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Institut du Mouvement et de l'appareil Locomoteur (IML), Service d'Anesthésie réanimation [CHU Tenon], Marrow Adiposity & Bone Lab - Adiposité Médullaire et Os - ULR 4490 (MABLab (ex-pmoi)), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), CHU Le Kremlin-Bicêtre (Rheumatology Department), Department of Rheumatology, Hopital Réné Dubos, Laboratoire d'Economie de Dauphine (LEDa), Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de médecine interne - hôpital européen Georges-Pompidou, Aix Marseille Université (AMU), Sorbonne Université (SU), Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199 (LMN), Service MIRCEN (MIRCEN), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lorraine (UL), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Composantes innées de la réponse immunitaire et différenciation (CIRID), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Université de La Réunion - Faculté de Lettres et Sciences humaines (UR FLSH), Centre de Référence National des Syndromes Hyperéosinophiliques (CEREO), Service de Médecine Interne [Hôpital Foch, Suresnes] (SMI), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Grenoble Alpes - École supérieure du professorat et de l'éducation - Académie de Grenoble (UGA ESPE Grenoble), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Groupe ENergie Electrique et SYStémique (LAPLACE-GENESYS), LAboratoire PLasma et Conversion d'Energie (LAPLACE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Cabinet Médical de Rhumatologie, Marseille, Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris], Service de dermatologie et allergologie [CHU Tenon], Immunologie des maladies virales, auto-immunes, hématologiques et bactériennes (IMVA-HB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Service de Médecine Interne [CHU Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Centre Hospitalier de Mulhouse (Service de Rhumatologie), Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] (CH E.Muller Mulhouse), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA)-Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA), Thèses d'exercice et mémoires - UFR de Médecine Montpellier-Nîmes, Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), FHU 'Integrated center for research in inflammatory diseases - InCREASe', Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté]), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Hôpital Saint-André, Biologie des maladies cardiovasculaires = Biology of Cardiovascular Diseases, Université de Bordeaux (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB), Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Université de Paris - UFR Médecine Paris Centre [Santé] (UP Médecine Paris Centre), Université de Paris (UP), Service de rhumatologie [CHU Pitié Salpêtrière] (GRC-08 EEMOIS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de médecine interne et d'immunologie clinique [CHU Pitié-Salpêtrière], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Joseph Ducuing, Service de Médecine Interne [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Laboratoire Navier (NAVIER UMR 8205), École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Gustave Eiffel, Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Service MIRCEN (MIRCEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UFR Médecine [Santé] - Université Paris Cité (UFR Médecine UPCité), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Ecole nationale supérieure des ingénieurs en arts chimiques et technologiques (ENSIACET), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Maladies génétiques d'expression pédiatrique (U933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Trousseau [APHP], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne (SAINBIOSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UNICANCER-UNICANCER-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC), Université Paris Cité - UFR Médecine [Santé] (UPCité UFR Médecine), Université Paris Cité - UFR Médecine Paris Centre [Santé] (UPC Médecine Paris Centre), Université Paris Cité (UPC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPC), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Dalmasso, Guillaume, Faïs, Tiphanie, Cougnoux, A, Barnich, Nicolas, Delmas, Julien, Bonnet, Richard, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)

Anthony Buisson, Constance Hordonneau, Marion Goutte, Bruno Pereira, Felix Goutorbe, Gilles Bommelaer, Maud Reymond, C. Allimant, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Service de Radiologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Département Gastroentérologie, Centre Hospitalier Universitaire Estaing, CHU Clermont-Ferrand, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Service d’Imagerie Médicale et Radiologie Interventionnelle [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], and CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand

Delphine Boucher, Elisabeth Billard, Johan Gagnière, Nicolas Barnich, Mathilde Bonnet, Julie Veziant, Romain Villeger, Amélie Lopès, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Centre Hospitalier Universitaire Clermont Ferrand, CHU Clermont-Ferrand, Service Chirurgie Disgestive, Centre Hospitalier Universitaire Estaing, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Inserm, Universite Clermont Auvergne UMR 1071, INRA (USC), Conseil regional Auvergne-Rhones-Alpes, and FDER/CPER

Gilles Nevez, Joerg Steinmann, Laurence Delhaes, Ludovic Duvaux, Jean-Philippe Bouchara, Wieland Meyer, Ludwig Sedlacek, Maxime Fleury, Nicolas Papon, Loïc Favennec, Patrick Vandeputte, Javier Pemán, Amandine Gastebois, Françoise Botterel, Jose A. Vazquez, Stéphane Ranque, Sharon C.-A. Chen, Ana Alastruey-Izquierdo, Solène Le Gal, Craig Williams, Marie-Elisabeth Bougnoux, Carsten Schwarz, Françoise Symoens, Estrella Martin Mazuelos, Guillermo Quindós, Thomas Dugé de Bernonville, Josep Cano, Amparo Solé, Amandine Rougeron, Sandrine Giraud, María Teresa Martín-Gómez, Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Université d'Angers (UA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), University of Sheffield [Sheffield], Facultat de Medicina i Ciències de la Salut, Universitat Rovira i Virgili, Anofel Cryptosporidium National Network, Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de Microbiologie, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Parasitologie et de Mycologie [Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Appareil Digestif Environnement Nutrition (ADEN ), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Augusta University, University System of Georgia (USG), The Westmead Institute for Medical Research, Centre for Infectious Disease and Microbiology (CIDM), Hôpital de la Cavale Blanche - CHRU Brest (CHU - BREST ), APP1031943, National Health and Medical Research Council, 2010/IC1003, Vaincre la Mucoviscidose, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Parasite (GEIHP), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Groupe d’Etude des Interactions Hôte-Pathogène, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Jonathan Clark, Willian R. Ribeiro, Claudia Stellato, Szabina Balázsi, Renan O. Corrêa, Mariangela Spagnuolo, Zoltán Hajnády, Marc Veldhoen, Csaba Matolcsi, Alessandro Cuomo, Jérémy Denizot, Fabio Takeo Sato, Raphaël Mattiuz, Rachel Fellows, Caroline M. Ferreira, Tiziana Bonaldi, Joana Guedes, Patrick Varga-Weisz, Juri Kazakevych, Elena Stoyanova, Marco Aurélio Ramirez Vinolo, Hector Blackburn, Hélène Perée, Payal Jain, Anke Liebert, José Luís Fachi, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), European Institute of Oncology [Milan] (ESMO), Division of Molecular Immunology, UK Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), UK Medical Research Council MR/N009398/1, Brazil-BBSRC Pump-priming award BB/N013565/1, Science Policy Committee, Babraham Institute, NC3R NC/L001217/1, FAPESP 2012/10653-9 2015/50379-1 2015/14105-4, Italian Association for Cancer Research (AIRC), Italian Ministry of Health RF-GR2011, EPIGEN flagship project grant, Erasmus+ programme, BBSRC, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and European Institute of Oncology

Carolina Palmela, Zhilu Xu, Siew C. Ng, Caroline Chevarin, Robert Hirten, Nicolas Barnich, Jean-Frederic Colombel, Joana Torres, Gwladys Sevrin, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Centro de Geologia da Universidade do Porto, The Chinese University of Hong Kong [Hong Kong], Service d'Hépato-gastroentérologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Universidade do Porto = University of Porto, Universidade do Porto, Centre de Psychiatrie et Neurosciences (CPN - U894), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universidade Nova de Lisboa (UNINOVA), Département Microbiologie et Chaîne Alimentaire (MICA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Thierry Mom, Marc André, Laurent Gilain, Olivier Aumaître, B. Jean, A. Couturier, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Service de Radiologie, Unité de Neuroradiologie, CHU Clermont-Ferrand, Swedish Institute of Space Physics [Kiruna] (IRF), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)

Kai Zhou, Baohong Wang, Vincent Cattoir, Richard Bonnet, Wei Yu, Yonghong Xiao, John W. A. Rossen, Ping Shen, Zhejiang University, Brunel University London [Uxbridge], SYNAPSE, Laboratoire Images, Signaux et Systèmes Intelligents (LISSI), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), School of Engineering and Design, University Medical Center Groningen [Groningen] (UMCG), Atmospheric and Environmental Research, Inc. (AER), CHU Clermont-Ferrand, USC2018 Microbes, Intestine, Inflammation and Host Susceptibility, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Unité de Recherche Risques Microbiens (U2RM), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre Hospitalier Universitaire Clermont Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and Microbes in Health and Disease (MHD)

Messaoudi, Rim, Jaziri, Faouzi, Mtibaa, Achraf, Grand-Brochier, Manuel, Ali, Hawa Mohamed, Ali, Ali, Fourati, Hela, Gargouri, Faiez, Vacavant, Antoine, Poincloux, Laurent, Mulliez, Aurélien, Genes, Julien, Abergel, Armando, Ardellier, François-Daniel, d’Ostrevy, Nicolas, Cassagnes, Lucie, Ouchchane, Lemlih, Dubots, Emilie, Boyer, Pascal, Camilleri, Pascal, Le Roy, Bertrand, Perrey, Antoine, Fontarensky, Mikael, Gagniere, Johan, Abergel, Armand, Pereira, Bruno, Lambert, Celine, Boyer, Louis, Pezet, Denis, Chabrot, Pascal, Buc, Emmanuel, Image Science for Interventional Techniques (ISIT), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Clermont Université, École Nationale d'Électronique et des Télécommunications de Sfax (ENET'COM), Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Multimedia, InfoRmation systems and Advanced Computing Laboratory (MIRACL), Faculté des Sciences Economiques et de Gestion de Sfax (FSEG Sfax), Université de Sfax - University of Sfax-Université de Sfax - University of Sfax, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Département de Gastroentérologie, Private Practice, Department of Digestive and Hepatobiliary Medecine, University Medical Hospital, chirurgie thoracique et cardio-vasculaire, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Equipe de Recherche en Signal et Imagerie Medicale (ERIM-ERI 14), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Radiologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service Chirurgie Disgestive, Centre Hospitalier Universitaire Estaing, Biostat Unit, Unité Biostatistique, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Chirurgie digestive et hépatobiliaire, CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, service de Biostatistiques, DRCI, Institut de Recherche sur les Phénomènes Hors Equilibre (IRPHE), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Service de radiologie, ISIT Image Science for Interventional Techniques, Université d'Auvergne (Clermont Ferrand 1) (UdA), École Nationale d'Electronique et des Télécommunications de Sfax (.) (ENET'COM), Institut Pascal - Clermont Auvergne (IP), Sigma CLERMONT (Sigma CLERMONT)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)

Philippe Seksik, Xavier Treton, Mathurin Fumery, Claire Auzolle, Nicolas Barnich, Lionel Le Bourhis, Benjamin Pariente, Anthony Buisson, Loic Brot, Stéphane Nancey, Harry Sokol, Carmen Stefanescu, Matthieu Allez, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), INSERM, U1160, Département de Gastroentérologie, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHU Clermont-Ferrand, CHU Amiens-Picardie, Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Autophagie infection et immunité - Autophagy Infection Immunity (APY), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Saint-Louis, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), INSERM UMR-S 606, Hôpital Lariboisière, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, PRES Sorbonne Paris-Cité, and Université Paris Denis Diderot, This study has been supported by grants from MSD France, Association Francois Aupetit, the Helmsley Charitable Trust and Inserm., Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), AgroParisTech, Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Centre Hospitalier Universitaire Clermont Ferrand, Centre hospitalier universitaire d'Amiens (CHU Amiens-Picardie), Hôpital Claude Huriez, Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Autophagie infections immunité – Autophagy Infection Immunity, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)

L. Barbier, Emmanuel Boleslawski, J.-M. Siksik, E. Savier, A. Mulliri, K. Boudjema, Gabriella Pittau, René Adam, O. Boilot, Jean-Yves Mabrut, A. Sepulveda, Astrid Herrero, G.-P. Pageaux, J.-L. Golmard, Christophe Laurent, Philippe Bachellier, F. Dondero, François Faitot, Emilie Gregoire, C. Salloum, E. Salame, Laurence Chiche, Jean Hardwigsen, Christian Letoublon, M. Rayar, R. Brustia, Philippe Compagnon, F. Jeune, Y.P. Le Treut, Jean Gugenheim, Samir Jaber, Bertrand Suc, Olivier Scatton, A. Mallet, J. Abba, P. Houssel-Debry, C. Maulat, E. Buc, C B Lim, F. Perdigao, Safi Dokmak, François-René Pruvot, M. Chirica, Oriana Ciacio, B. Trechot, G. Rousseau, S. Branchereau, C. Chardot, Pietro Addeo, K. Mohkam, Jean-Christophe Vaillant, Francis Navarro, A. Merdignac, T. Dao, Olivier Soubrane, Daniel Cherqui, B. Heyd, MORNET, Dominique, Service de Chirurgie Digestive, Hépato-Bilio-pancréatique et Transplantation Hépatique [CHU Pitié-Salpétrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Département de Biostatistiques [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Paul Brousse, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Physiologie & médecine expérimentale du Cœur et des Muscles [U 1046] (PhyMedExp), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département d'Hépato-Gastroentérologie et de Transplantation Hépatique [CHU Saint-Eloi], Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de pédiatrie médicale et médecine de l'adolescent [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital Henri Mondor, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Département de chirurgie digestive et de l'urgence, CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hôpital Bicêtre, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Agence de la Biomédecine, Service de chirurgie digestive et hépato-bilio-pancréatique [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], CHU Pitié Salpêtrière, CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Unité de Transplantation, CHU Cochin [AP-HP], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon, CHU Saint-Eloi-Université de Montpellier (UM), Department of Hepatobiliary Surgery, Hôpital Conception, Hôpital Claude Huriez, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse], UPMC Université Paris 06, 75012 Paris, France., Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Mère Enfant Edouard Herriot, 69677 Bron, France. 2, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université Clermont Auvergne, and Hôpital Bicêtre, AP-HP, 94275 Le Kremlin-Bicêtre, France.

Anaïs Larabi, Hang Thi Thu Nguyen, Nicolas Barnich, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ministere de la Recherche et de la Technologie Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (Inserm) UMR1071 INRA (USC 2018) French National Research Agency European Union FP7 People Marie Curie International Incoming Fellowship, ANR-16-IDEX-0001,CAP 20-25,CAP 20-25(2016), OUERTANI, jeannette, CAP 20-25 - - CAP 20-252016 - ANR-16-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Ministere de la Recherche et de la Technologie Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (Inserm) UMR1071INRA (USC 2018) French National Research AgencyEuropean Union FP7 People Marie Curie International Incoming Fellowship, and ANR: 16-IDEX-0001,CAP 20-25,CAP 20-25 (I-Site)(2017)

Mathias Choquer, Adeline Simon, Lucie Chandat, Nathalie Poussereau, François Villalba, Pascal Bally, Cindy Dieryckx, Sophie Kaiser, Julia Schumacher, Guillaume Morgant, Jean-William Dupuy, Marie-Pascale Latorse, Eytham Souibgui, Christophe Bruel, Amélie de Vallée, Muriel Viaud, Elise Loisel, Géraldine Mey, Christine Rascle, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génomique fonctionnelle des champignons pathogènes des plantes (FungiPath), Microbiologie, adaptation et pathogénie (MAP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génomique fonctionnelle des Champignons Phytopathogènes (GFCP), Bayer Cropscience, Ingénierie des Matériaux Polymères (IMP), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon, BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Bernstein Center for Computational Neuroscience [Berlin], Humboldt-Universität zu Berlin, ANR-08-KBBE-0003,BotBank,Creation of a mapped database of Botrytis cinerea T-DNA and transposon transformants allowing pathogenic development and plant defence studies(2008), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Humboldt Universität zu Berlin, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Humboldt University Of Berlin, and Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Benjamin Pariente, Azucena Salas, Xavier Treton, Matthieu Allez, Stéphane Nancey, Victor Chardiny, Anthony Buisson, Mathurin Fumery, Harry Sokol, Nicolas Barnich, Marjolaine Ngollo, Hugo Bottois, Carmen Stefanescu, Philippe Seksik, Ana Maria Corraliza, Claire Auzolle, Lionel Le Bourhis, Kevin Perez, Service d'hépato-gastro-entérologie, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), INSERM, U1160, Département de Gastroentérologie, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centro de Investigación Biomédica en Red en el Área temática de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), Liver Unit, Clínica Universitaria, CIBER-EHD, Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon, Autophagie infections immunité – Autophagy Infection Immunity, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département d'Hépato-Gastroentérologie, Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université de Clermont-Ferrand, Service d'Hépato-gastroentérologie, Hôpital Huriez-Université de Lille, Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie], CHU Amiens-Picardie, Service de Gastroentérologie et nutrition [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Autophagie infection et immunité - Autophagy Infection Immunity (APY), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Helmsley Charitable Trust Association Francois Aupetit MSD France laboratories, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), and Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Buisson, Anthony, Douadi, Clara, Ouchchane, Lemlhi, Goutte, Marion, Hugot, Jean-Pierre, Dubois, Anaëlle, Minet-Quinard, Régine, Bouvier, Damien, Bommelaer, Gilles, Vazeille, Emilie, Barnich, Nicolas, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service d'Hépatologie Gastro-entérologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Clermont-Ferrand, Broad medical program-Crohn's Colitis Foundation of America, 'Societe Nationale Francaise de Gastroenterologie' (SNFGE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette

Sivignon, Adeline, Cauwel, Madeleine, Bridot, Clarisse, Nongbe, Medy C., Deniaud, David, Roubinet, Benoit, Landemarre, Ludovic, Felpin, Francois-Xavier, Bouckaert, Julie, Barnich, Nicolas, Gouin, Sebastien, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), GLYcoDIAG, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and GLYcoDiag

Barnich, Nicolas, Sevrin, Gwladys, Gibold, Lucie, Bonnet, Richard, Delmas, Julien, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), CHU Gabriel Montpied (CHU), CHU Clermont-Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand]

Dalmasso, Guillaume, Cougnoux, Antony, Faïs, Tiphanie, Barnich, Nicolas, Delmas, Julien, Bonnet, Richard, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and CHU Gabriel Montpied (CHU)

Romain Carrière, Nicolas Mouton, Iulia Macavei, Olivier Dauwalder, François Vandenesch, Richard Bonnet, Frédéric Robin, Patrick Plésiat, Jérôme Lemoine, ANABIO-MS - Analyse biomoléculaire par spectrométrie de masse - Biological Analysis by Mass Spectrometry, Institut des Sciences Analytiques (ISA), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM) et la Société Française d’Electrophorèse et Analyse Protéomique (SFEAP), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), and Bussy, Agnès

Gimier, Elodie, Barnich, Nicolas, Denizot, Jérémy, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), OUERTANI, jeannette, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)

Poirot, Karine, Veziant, Julie, Chevarin, Caroline, Cassagnes, Lucie, Sauvanet, Pierre, Chassaing, Benoit, Robin, Frederic, Godfraind, Catherine, Barnich, Nicolas, Pezet, Denis, Pereira, Bruno, Gagniere, Johan, Bonnet, Mathilde, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CHU Clermont-Ferrand, Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Georgia State University, University System of Georgia (USG), Laboratoire de Pathologie, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL)-Clinique Saint-Luc, Chirurgie digestive et hépatobiliaire, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Centre Hospitalier Universitaire Clermont Ferrand, Institut Pascal - Clermont Auvergne (IP), Sigma CLERMONT (Sigma CLERMONT)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Catholique de Louvain (UCL)-Clinique Saint-Luc, Centre Hospitalier Universitaire Estaing, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette

Billard, Elisabeth, Boccon, Pierre, Pugeat, Mathilde, Agus, Allison, Martinez-Medina, Margarita, Barnich, Nicolas, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette

Sébastien Massier, Brandon ROBIN, Pascal Cosette, Jouenne, T., Emmanuelle Dé, Julie Hardouin, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Plate-forme de Protéomique PISSARO, Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Fédératif de Recherches Multidisciplinaires sur les Peptides (IFRMP 23), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-CRLCC Henri Becquerel-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Polymères Biopolymères Surfaces (PBS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Normandie Université (NU), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Université Le Havre Normandie (ULH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-High-tech Research Infrastructures for Life Sciences (HeRacLeS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

David Deniaud, Medy C. Nongbe, Ludovic Landemarre, Benoît Roubinet, Madeleine Cauwel, Sébastien G. Gouin, Julie Bouckaert, Adeline Sivignon, François-Xavier Felpin, Nicolas Barnich, Clarisse Bridot, Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GLYcoDiag, Institut des Sciences Moléculaires (ISM), Université Montesquieu - Bordeaux 4-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-École Nationale Supérieure de Chimie et de Physique de Bordeaux (ENSCPB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Adaptations Métaboliques à l'Exercice en Conditions Physiologiques et Pathologiques (AME2P), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-UFR Sciences et Techniques des Activités Physiques et Sportives - Clermont-Auvergne (UFR STAPS - UCA), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Laboratoire de Synthèse Organique (Hétérochimie organique, organoéléments et matériaux) (LSOHOOM), Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille, CNRS, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF], Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 [UGSF], Bouckaert, Julie, Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF), CNRS, UMR 8576, GLYcoDIAG, Université d'Orléans (UO), Université Montesquieu - Bordeaux 4-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-École Nationale Supérieure de Chimie et de Physique de Bordeaux (ENSCPB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire des Adaptations Métaboliques à l’Exercice en conditions Physiologiques et Pathologiques (AME2P), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Montesquieu - Bordeaux 4-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-École Nationale Supérieure de Chimie et de Physique de Bordeaux (ENSCPB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Elise Madeuf, Geoffroy Delcros, Emilie Vazeille, Vincent Pialoux, Nicolas Barnich, Pierre Sauvanet, Florie Maillard, Allison Teixeira, Pascal Sirvent, Nathalie Boisseau, Monique Etienne, Carole Groussard, Antoine Sourdrille, Yolanda F. Otero, Lydie Combaret, Laboratoire Mouvement Sport Santé (M2S), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Laboratoire des Adaptations Métaboliques à l'Exercice en Conditions Physiologiques et Pathologiques - Clermont Auvergne (AME2P), Faculté des Sciences du SportFaculté des Sciences du Sport, UFR STAPS-Université Clermont Auvergne (UCA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Interuniversitaire de Biologie de la Motricité (LIBM ), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Institut Universitaire de France (IUF), Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.), USC-2018, Institut National de la Recherche Agronomique, Université de Rennes (UR)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Laboratoire des Adaptations Métaboliques à l'Exercice en Conditions Physiologiques et Pathologiques (AME2P), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-UFR Sciences et Techniques des Activités Physiques et Sportives - Clermont-Auvergne (UFR STAPS - UCA), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Service d'Hépatologie Gastro-entérologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Auvergne [CHU Clermont-Ferrand] (CRNH A), Direction de la recherche clinique et de l’innovation [CHU Clermont-Ferrand] (DRCI), Region AuvergneRhone-Alpes (PREVAMIC project), I-SITE project of the University of Clermont Auvergne (CAP 2025), INSERM (U1071), INRA (USC-2018), Association F. Aupetit (AFA), ANR-16-IDEX-0001,CAP 20-25,CAP 20-25(2016), Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH Auvergne), and Pialoux, V.

Veziant, Julie, CHU Clermont-Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Centre Hospitalier Universitaire Clermont Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)

Deval, Christiane, Calonne, Julie, Coudy-Gandilhon, Cécile, Vazeille, Emilie, Béchet, Daniel, Polge, Cécile, Taillandier, Daniel, Attaix, Didier, Combaret, Lydie, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Deparment Endocrinology Metabolism & Cardiovascular System, Faculty of Science and Medicine, Université de Fribourg, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro Entérologie, CHU Fattouma Bourguiba [Monastir] (HFB), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA), Centre Hospitalier Universitaire, ProdInra, Archive Ouverte, University of Fribourg, and Université de Fribourg = University of Fribourg (UNIFR)

Xu, Zhilu, ZHANG, Jingwan, ZUO, Tao, Chevarin, Caroline, CHU, Lok Cheung, CHANG, Francis KL, JY, Joseph, Yu, Jun, Barnich, Nicolas, WONG, Sunny Hei, Ng, Siew C, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), The Chinese University of Hong Kong [Hong Kong], Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette

Dumych, Tetiana, Sivignon, Adeline, Bongiovanni, Antonio, Yamakawa, Nao, Bray, Fabrice, Lafont, Franck, Rolando, Christian, Bilyy, Rostyslav, Bouckaert, Julie, institute of cell biology, national academy of sciences of ukraine, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Chimie Organique et Macromoleculaire (UMR CNRS 8009), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Lille (ENSCL)-Université de Lille, Sciences et Technologies, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Université de Lille, Sciences et Technologies-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Lille (ENSCL), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Raphaële Gresse, Benoit Chassaing, Lucie Etienne-Mesmin, Nathalie Juge, Kim De Paepe, Mickaël Desvaux, Stéphanie Blanquet-Diot, Thomas Sauvaitre, Tom Van de Wiele, Evelyne Forano, Stephanie Schüller, Microbiologie Environnement Digestif Santé - Clermont Auvergne (MEDIS), Université Clermont Auvergne (UCA)-INRA Clermont-Ferrand-Theix, Infection, Immunity and Inflammation, Georgia State University, University System of Georgia (USG)-University System of Georgia (USG), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Quadram Institute, Microbiologie Environnement Digestif Santé (MEDIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), North Georgia College & State University, Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), University of East Anglia [Norwich] (UEA), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) BBS/E/F/00044452, INRA Clermont-Ferrand-Theix-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), and Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Sophie Potrel, Sarrah Boukthir, Loren Dejoies, François Guérin, Vincent Cattoir, Anaïs Collet, Richard Bonnet, Gabriel Auger, Mohamed Sassi, Asma Zouari, Racha Beyrouthy, Michel Auzou, Marguerite Fines-Guyon, Université de Rennes (UNIV-RENNES), Service de Microbiologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques [CHU Rennes] (CNR), CHU Pontchaillou [Rennes], Faculty of Public Health [Lebanese University] (FSP III), Lebanese University [Beirut] (LU), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Modes, espaces et processus de socialisation (MEPS), Centre Max Weber (CMW), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Santé Publique France, Université de Rennes (UR), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Département de Physique et Instrumentation, Laboratoire MMA, Université de Carthage - University of Carthage-Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie - Carthage (INSAT Carthage), Faculty of Public Health [Tripoli, Liban] (FSP III), Lebanese University [Beirut], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)

Barnich, Nicolas, Denizot, Jérémy, Agus, Allison, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), OUERTANI, jeannette, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)

Marion Goutte, Felix Goutorbe, Anthony Buisson, Damien Bouvier, Guillaume Bouguen, Régine Minet Quinard, Gilles Bommelaer, Bruno Pereira, Elisa Sollelis, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), CHU Clermont-Ferrand, CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier de la Côte Basque (CHCB), Jonchère, Laurent, Centre Hospitalier Côte Basque, Bayonne, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Sandrine Brugiroux, Thomas Sauvaitre, Gwenaelle Roche, Célia Ledieu, Caroline Chevarin, Catherine Godfraind, Christophe Massard, Komla Oscar Awitor, Nicolas Barnich, Mathilde Bonnet, Delphine Boucher, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Institut Universitaire de Technologie - Clermont-Ferrand (IUT Clermont-Ferrand), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), OUERTANI, jeannette, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), IUT de Clermont-Ferrand (IUT de Clermont-Ferrand), Université Clermont Auvergne (UCA), and Massard, Christophe

Villeger, Romain, Diémé, Binta, Lagrée, Marie, Roche, Gwenaëlle, Delmas, Julien, Barnich, Nicolas, Jousse, Cyril, Bonnet, Mathilde, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Imagerie et cerveau, Université Clermont Auvergne (UCA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Sigma CLERMONT (Sigma CLERMONT), and OUERTANI, jeannette

Brugiroux, Sandrine, Sauvaitre, Thomas, Roche, Gwenaelle, Ledieu, Célia, Chevarin, Caroline, Godfraind, Catherine, Massard, Christophe, Awitor, Oscar, Barnich, Nicolas, Bonnet, Mathilde, Boucher, Delphine, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette

Paul-Olivier Rouzaire, A. Buisson, Gilles Bommelaer, Michel D'Incan, M C Ferrier le Bouëdec, J Thévenot, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques - Clermont Auvergne (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])

Alexandra Traverse-Glehen, Nassim Hammoudi, Olivier Corcos, Philippe Marteau, Julien Loreau, Mariane Maillet, Martine Leconte, Jonathan Catry, Yves Francois, Najim Chafai, Xavier Dray, Marjolaine Ngollo, Philippe Seksik, Pierre Cattan, Benjamin Pariente, Nicolas Munoz-Bongrand, Peggy Falgon, Stéphane Nancey, Nathan Beaupel, Isabelle Nion-Larmurier, Andrée Nisard, Christophe Attencourt, Emmanuel Tiret, Ulrika Chaput, Denis Chatelain, Marion Chauvenet, Dominique Cazals-Hatem, Eddy Cotte, Laurent Beaugerie, Madeleine Bezault, Mircea Chirica, Gilles Boschetti, Sarah Boyer, Loic Brot, Julien Kirchgesner, Hugo Bottois, Anne Dubois, Magali Svrcek, Yoram Bouhnik, Jean-Marc Gornet, Rachid Kaci, Brice Gergaud, Carmen Stefanescu, Helene Corte, Claire Auzolle, Jean-Louis Dupas, Juliette Joubert Zakeyh, Leila Chedouba, Amine Rahili, Elodie Quévrain, Charles Sabbagh, Lionel Le Bourhis, Maria Nachury, Anne Bourrier, Nathalie Guedj, Florence Renaud, Helena Hadjisavvas, Charlotte Gardair, Gilles Bommelaer, Céline Grand, Xavier Treton, Xavier Jouven, Anthony Buisson, Jérémie H. Lefevre, Paul Hofmann, Stéphanie Patouraux, Jérôme Filippi, Xavier Hébuterne, Driffa Moussata, Clotilde Baudry, Nelson Lourenco, Marion Goutte, Harry Sokol, Victor Chardiny, My-Linh Tran-Minh, Bernard Flourié, Pierre Desreumaux, Catherine Godfraind, Coralie Sommeville, Mathurin Fumery, Nicolas Barnich, Joëlle Bonnet, Anne-Laure Charlois, Dilek Coban, Leon Magiorri, Yves Panis, Matthieu Allez, Jean-François Fléjou, Franck Brazier, M. Ferron, Ecotaxie, microenvironnement et développement lymphocytaire (EMily (UMR_S_1160 / U1160)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépato-gastro-entérologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Département de Pathologie [Hôpital Beaujon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Laboratoire de pathologie [AP-HP Hôpital Saint-Louis], Hopital Saint-Louis, Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP), Autophagie infections immunité – Autophagy Infection Immunity, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Hépato-gastroentérologie, Hôpital Huriez-Université de Lille, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon, Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie], CHU Amiens-Picardie, Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Pathologie [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Autophagie infection et immunité - Autophagy Infection Immunity (APY), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Hôpital Beaujon [AP-HP], Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Barnich, Nicolas, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette

Larabi, Anaïs, Dalmasso, Guillaume, Delmas, Julien, Barnich, Nicolas, Nguyen, Hang Thi Thu, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), and OUERTANI, jeannette