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Enfants Malades [AP-HP], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre hospitalier Saint-Brieuc, Centre Hospitalier Georges Renon [Niort] (CH Georges Renon Niort), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU de Saint-Brieuc, Interactions Gènes-Risques environnementaux et Effets sur la Santé (INGRES), Université de Lorraine (UL), Unité de Recherche Environnement Physique de la plante Horticole (EPHOR), Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST, AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Hôpital Delafontaine, Centre Hospitalier de Mulhouse, site du Hasenrain (Mulhouse), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Service de réanimation néonatale [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Centre Régional de PharmacoVigilance Nord-Pas-de-Calais [CHU Lille] (CRPV), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Faculté de Médecine Henri Warembourg - Université de Lille, Centre de Recherche en Cancérologie Nantes-Angers (CRCNA), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Hôtel-Dieu de Nantes-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Laennec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Faculté de Médecine d'Angers-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU de la Martinique [Fort de France], Groupe Hospitalier du Havre Hôpital Jacques Monod (MONTIVILLIERS) (GHH), Polyclinique Médipôle Saint-Roch [Cabestany], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Aix-Marseille Université - École de médecine (AMU SMPM MED), Aix-Marseille Université - Faculté des sciences médicales et paramédicales (AMU SMPM), Aix Marseille Université (AMU)-Aix Marseille Université (AMU), Service de microbiologie [CHU Nancy], Service psychiatrique de l'enfant et de l'adolescent [CHU Hôpital Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Service de bactériologie-virologie [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Université de Tours (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Registre EPIMAD, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe Hospitalier Artois-Ternois Centre Hospitalier d’Arras, Système Nerveux Autonome - Epidémiologie, Physiologie, Ingénierie, Santé (SNA - EPIS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), ELSAN Polyclinique Majorelle, Centre Hospitalier Intercommunal Castres-Mazamet (CHIC-CM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Centre Hospitalier de Lens, Institut de Veille Sanitaire (INVS), Hôpital Trousseau, Jonchère, Laurent, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Le CHCB, Centre Hospitalier de la Côte Basque, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système Nerveux Autonome - Epidémiologie, Physiologie, Ingénierie, Santé (SNA-EPIS), Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne, CHU Saint-Etienne, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université Lille 2 - Faculté de Médecine, Université de Tours-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne, CHU Toulouse [Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire Félix-Guyon [Saint-Denis, La Réunion, France], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Department of Microbiology Brest, Department of Microbiology, Brest, CHU CLAMART, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU de Nice), Centre Hospitalier Côte Basque, Bayonne, CHU Le Havre, Laboratory of microbiology and infection control, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire Charles Nicolle, Partenaires INRAE, CHU de la Réunion, Saint-Denis, France., CHU Lens, CHU Argenteuil, Centre Hospitalier Métropole Savoie-Site de Chambéry, La Clinique du Val d'Ouest, Hôpitaux Est Hôpital Louis Pradel - Hospices Civils de Lyon, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR), Hopital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Service de virologie, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], Hôpital Antoine Béclère, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Service de Bactériologie-Virologie, Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Service de chirurgie infantile, CHU Felix Guyon, Saint Denis de La Réunion, Hôtel-Dieu, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu, Unité d'Hygiène Hospitalière, hospices civils de Lyon, Hôpital du Hasenrain, Mulhouse, CHU Valenciennes, Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP), Hôpital de Bayonne [Bayonne], CHU Kremlin-Bicétre, Anofel Cryptosporidium National Network, Polyclinique de St Roch, CHU Pau, Unité de prévention et de lutte contre les infections nosocomiales [CHU Angers], PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Division of Neonatology, La Conception Hospital, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille and Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Laboratoire de Microbiologie clinique et environnementale [Pointe-à-Pitre, Guadeloupe, France], Centre Hospitalier Universitaire de Rennes (CHU Rennes), Hôpital privé de l'Estuaire [Le Havre], Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Hôpital d'Arras, CHU Le MAns, Polyclinique Majorelle, Laboratoire de Microbiologie, Centre Hospitalier Intercommunal Castres-Mazamet, Laboratoire de bactériologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Laboratoire de Recherche Opérationnelle et Mathématiques de la Décision - LAROMAD (Alger, Algérie), Centre Hospitalier d’Arras, Unité de Méthodologie en Recherche Clinique, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL)