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Staphylococcus capitis isolated from bloodstream infections: a nationwide 3-month survey in 38 neonatal intensive care units

Authors :
Sylvie Joron
Stéphane Marret
Fabrice Lapeyre
Jérôme Larche
Jacqueline Grando
David Leyssene
Jean Nakhleh
Clarisse Dupin
Tania Foucan
Stéphanie Bordes-Couecou
Géraldine Abadie
Franck Labbe
Marie Kempf
Manuel Petitfrere
Audrey Robine
Marie Decalonne
Chantal Chaplain
Philippe Jouvencel
Florent Goube
Benjamin Cotte
Laurent Villeneuve
Adeline Lacazette
Raoul Baron
Jean-Marc Jellimann
Anne-Sophie Trentesaux
Nathalie Chautemps
Laurent Mereghetti
Olivier Dauwalder
Nicolas Fortineau
Christine Roques Ceschin
Rafik Ben Ammar
Sandra Bourdon
Alain Gravet
Audrey Glanard
Olivier Belmonte
Jacques Gilquin
Arnaud Florentin
Souad Slimani
Annick Lefebvre
Jérôme Guinard
Edith Malpote
Céline Chatelet
Isabelle Bauvin
Alain Lozniewski
Anaëlle Muggeo
Geneviève Héry-Arnaud
Stéphane Le Vu
Isabelle Ligi
Anne Le Pourhiennec
Christian Cattoen
Olivier Join-Lambert
Bruno Pozetto
Carole De Chillaz
Amine Siali
Pascale Martres
Michel Drancourt
Claire Lesteven
Sandra C. dos Santos
Nadège Bourgeois-Nicolaos
Aude Davy
Claude Olive
Rémi Gimenes
Laure Gibert
Raymond Ruimy
Virginie Morange
Antoine Bouissou
Julien Mourdie
Emmanuelle Bille
Marie-Noëlle Noulard
Vincent Cattoir
Martine Delorme
Dominique Trivier
Luc Desfrere
Hugues Patural
Patrick Barthelemy
Nadia Idri
Florence Lemann
Franck-Olivier Mallaval
Sophie Ketterer-Martinon
Christian Vandenbussche
Pierre Frange
Sylvie Ledru
Mouna Khecharem
Pierre Lureau
Sophie Boyer
Philippe Berthelot
Salma Ben Hadj Yahia
Clément Legeay
Emilie Benabid
Guillaume Menard
Marion Levast-Raffin
Céline Coroller-Bec
Claire Huart
Maryvonne Demasure
Pascal Bolot
Yasmina Berrouane
Hélène Cormier
Pascale Minery
Pascale Penn
Peggy Larroude
Evelyne Werner
Géraldine Gascoin
Virginie Forget
Nathalie van der Mee-Marquet
Stéphanie Soive
Karine Gambarotto
Vanina Ambrogi
Aurore Claudinon
Serge Klosowski
Brigitte Riviere
Véronique Merle
Laura Menvielle
Véronique Faraut-Derouin
Saïd Aberrane
Alain Beuchee
Nolwenn Le Sache
Hôpital Bretonneau
CHU Trousseau [Tours]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Centre hospitalier Félix-Guyon [Saint-Denis, La Réunion]
Centre Hospitalier René Dubos [Pontoise]
Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC)
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)
Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION)
Centre hospitalier de Pau
Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion)
AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Centre Hospitalier de Calais
Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)
Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)
CHU Pontchaillou [Rennes]
Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151))
Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre Hospitalier de Saint-Denis [Ile-de-France]
Centre Hospitalier de la Côte Basque (CHCB)
Groupe Hospitalier du Havre
Hôpital Charles Nicolle [Rouen]
CHU Rouen
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)
Centre hospitalier [Valenciennes, Nord]
Centre Hospitalier Universitaire [Rennes]
GHT de l'Artois
Centre Hospitalier Victor Dupouy
Centre Hospitalier Métropole Savoie [Chambéry]
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers)
PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)
Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans)
Clinique du Val d'Ouest
CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Hospices Civils de Lyon (HCL)
Centre hospitalier Saint-Brieuc
Centre Hospitalier Georges Renon [Niort] (CH Georges Renon Niort)
Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO)
Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes]
Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
CHU de Saint-Brieuc
Interactions Gènes-Risques environnementaux et Effets sur la Santé (INGRES)
Université de Lorraine (UL)
Unité de Recherche Environnement Physique de la plante Horticole (EPHOR)
Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST
AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre)
CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe]
Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0)
Université de Caen Normandie (UNICAEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)
Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]
Hôpital Delafontaine
Centre Hospitalier de Mulhouse, site du Hasenrain (Mulhouse)
Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM)
Université de Brest (UBO)
Service de réanimation néonatale [CHRU Nancy]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)
Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570)
Centre Régional de PharmacoVigilance Nord-Pas-de-Calais [CHU Lille] (CRPV)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Faculté de Médecine Henri Warembourg - Université de Lille
Centre de Recherche en Cancérologie Nantes-Angers (CRCNA)
PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Hôtel-Dieu de Nantes-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Laennec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Faculté de Médecine d'Angers-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)
CHU de la Martinique [Fort de France]
Groupe Hospitalier du Havre Hôpital Jacques Monod (MONTIVILLIERS) (GHH)
Polyclinique Médipôle Saint-Roch [Cabestany]
Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)
CHU Caen
Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)
Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)
Aix-Marseille Université - École de médecine (AMU SMPM MED)
Aix-Marseille Université - Faculté des sciences médicales et paramédicales (AMU SMPM)
Aix Marseille Université (AMU)-Aix Marseille Université (AMU)
Service de microbiologie [CHU Nancy]
Service psychiatrique de l'enfant et de l'adolescent [CHU Hôpital Robert Debré]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré
Service de bactériologie-virologie [Tours]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau
Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP)
Université de Tours (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Registre EPIMAD
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)
Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath)
Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI)
École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Groupe Hospitalier Artois-Ternois Centre Hospitalier d’Arras
Système Nerveux Autonome - Epidémiologie, Physiologie, Ingénierie, Santé (SNA - EPIS)
Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)
ELSAN Polyclinique Majorelle
Centre Hospitalier Intercommunal Castres-Mazamet (CHIC-CM)
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique]
Centre Hospitalier de Lens
Institut de Veille Sanitaire (INVS)
Hôpital Trousseau
Jonchère, Laurent
Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne)
Le CHCB, Centre Hospitalier de la Côte Basque
Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI)
École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Système Nerveux Autonome - Epidémiologie, Physiologie, Ingénierie, Santé (SNA-EPIS)
Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne
CHU Saint-Etienne
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université Lille 2 - Faculté de Médecine
Université de Tours-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne
CHU Toulouse [Toulouse]
Centre Hospitalier Universitaire Félix-Guyon [Saint-Denis, La Réunion, France]
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
Department of Microbiology Brest
Department of Microbiology, Brest
CHU CLAMART
Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU de Nice)
Centre Hospitalier Côte Basque, Bayonne
CHU Le Havre
Laboratory of microbiology and infection control, Assistance publique-Hôpitaux de Paris
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Centre Hospitalier Universitaire Charles Nicolle
Partenaires INRAE
CHU de la Réunion, Saint-Denis, France.
CHU Lens
CHU Argenteuil
Centre Hospitalier Métropole Savoie-Site de Chambéry
La Clinique du Val d'Ouest
Hôpitaux Est Hôpital Louis Pradel - Hospices Civils de Lyon
Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR)
Hopital Louis Mourier - AP-HP [Colombes]
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)
Service de virologie
Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]
Hôpital Antoine Béclère, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
Service de Bactériologie-Virologie
Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker]
Service de chirurgie infantile, CHU Felix Guyon, Saint Denis de La Réunion
Hôtel-Dieu
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu
Unité d'Hygiène Hospitalière
hospices civils de Lyon
Hôpital du Hasenrain, Mulhouse
CHU Valenciennes
Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)
Hôpital de Bayonne [Bayonne]
CHU Kremlin-Bicétre
Anofel Cryptosporidium National Network
Polyclinique de St Roch
CHU Pau
Unité de prévention et de lutte contre les infections nosocomiales [CHU Angers]
PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)
Division of Neonatology, La Conception Hospital, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille and Faculté de Médecine
Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2
Laboratoire de Microbiologie clinique et environnementale [Pointe-à-Pitre, Guadeloupe, France]
Centre Hospitalier Universitaire de Rennes (CHU Rennes)
Hôpital privé de l'Estuaire [Le Havre]
Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis
Hôpital d'Arras
CHU Le MAns
Polyclinique Majorelle
Laboratoire de Microbiologie
Centre Hospitalier Intercommunal Castres-Mazamet
Laboratoire de bactériologie
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Laboratoire de Recherche Opérationnelle et Mathématiques de la Décision - LAROMAD (Alger, Algérie)
Centre Hospitalier d’Arras
Unité de Méthodologie en Recherche Clinique
Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL)
Source :
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2020, 39 (11), pp.2185-94. ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩, European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2020, 39 (11), pp.2185-94. ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩, European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2020, ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩
Publication Year :
2020
Publisher :
HAL CCSD, 2020.

Abstract

To increase the knowledge about S. capitis in the neonatal setting, we conducted a nationwide 3-month survey in 38 neonatal intensive care units (NICUs) covering 56.6% of French NICU beds. We demonstrated 14.2% of S. capitis BSI (S.capBSI) among nosocomial BSIs. S.capBSI incidence rate was 0.59 per 1000 patient-days. A total of 55.0% of the S.capBSIs were late onset catheter-related BSIs. The S. capitis strains infected preterm babies (median gestational age 26 weeks, median birth weight 855 g). They were resistant to methicillin and aminoglycosides and belonged to the NRCS-A clone. Evolution was favorable in all but one case, following vancomycin treatment.

Subjects

Subjects :
Male
0301 basic medicine
Pediatrics
Clone (cell biology)
NRCS-A clone
030501 epidemiology
Staphylococcus capitis
Medical microbiology
[SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases
Drug Resistance, Multiple, Bacterial
Medicine
[SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
[SDV.MHEP.ME] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases
[SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases
biology
Brief Report
Gestational age
General Medicine
Staphylococcal Infections
Anti-Bacterial Agents
3. Good health
[SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system
Nationwide active surveillance
Infectious Diseases
[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
[SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases
Vancomycin
Female
France
0305 other medical science
Infant, Premature
[SDV.MP.PAR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology
medicine.drug
Microbiology (medical)
medicine.medical_specialty
Bloodstream catheter-related infection
Birth weight
Preterm babies
030106 microbiology
Late onset
03 medical and health sciences
[SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system
Intensive Care Units, Neonatal
Sepsis
Intensive care
Humans
[SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology
business.industry
Neonatal Intensive Care Unit (NICU)
Infant, Newborn
Neonates
biology.organism_classification
[SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology
Catheter-Related Infections
[SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology
business

Details

Language :
English
ISSN :
09349723 and 14354373
Database :
OpenAIRE
Journal :
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2020, 39 (11), pp.2185-94. ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩, European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2020, 39 (11), pp.2185-94. ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩, European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2020, ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....3dfaafedb7b1955f5f0bb8ab2b56b304
Full Text :
https://doi.org/10.1007/s10096-020-03925-5⟩