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2. Clonamiento, expresión y seroreactividad de la proteína recombinante de ensamblaje de lipopolisacáridos – D (LptD) de Bartonella bacilliformis
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Astrid Flores-Nuñez, Gladis Ventura, Henri Bailon, Adolfo Marcelo, Gustavo Sandoval, and Carlos Padilla-Rojas
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infecciones por bartonella ,proteína lptd ,bartonella bacilliformis ,proteínas recombinantes ,antigenicidad vacunal, biología computacional ,Medicine ,Medicine (General) ,R5-920 - Abstract
Objetivo. Evaluar in silico y a nivel serológico el potencial antigénico del dominio extracelular recombinante de la proteína de ensamblaje de lipopolisacáridos - D (LptD) de Bartonella bacilliformis (dexr_LptD). Materiales y métodos. Mediante el análisis in silico se realizó la selección de una proteína de B. bacilliformis con potencial antigénico e inmunogénico. El gen de la proteína seleccionada se clonó en Escherichia coli TOP10 y se expresó en Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. La proteína recombinante fue expresada usando isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido (IPTG) y se optimizaron las condiciones de inducción. Por último, se purificó con resina Ni-IDA (His60 Ni Superflow) y se realizó un ensayo de Western Blot. Resultados: In silico, la proteína seleccionada fue LptD por estar localizada en la membrana externa y ser antigénica e inmunogénica. Las condiciones optimizadas para la inducción del dexr_LptD fueron 0,5 mM IPTG, 16 h, medio TB (Terrific Broth), etanol al 3% (v/v), 28 ºC, OD600: 1-1,5 y 200 r.p.m. La purificación se realizó en condiciones denaturantes a pequeña escala y se obtuvo 2,6 μg/mL de dexr_LptD parcialmente purificada. El ensayo de Western Blot mostró una reacción positiva entre los sueros provenientes de pacientes con la enfermedad de Carrión y dexr_LptD, ello evidencia la antigenicidad del dexr_LptD. Conclusiones. El dexr_LptD muestra antigenicidad in silico y a nivel serológico, estos resultados son base para posteriores estudios sobre candidatos vacunales contra la enfermedad de Carrión.
- Published
- 2022
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3. Organophosphorus compounds biodegradation by novel bacterial isolates and their potential application in bioremediation of contaminated water
- Author
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Santillan, Julia Yamila, Rojas, Natalia Lorena, Ghiringhelli, Pablo Daniel, Nóbile, Matías Leonardo, Lewkowicz, Elizabeth Sandra, and Iribarren, Adolfo Marcelo
- Published
- 2020
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4. Diseño y evaluación de una proteína multiepitópica como candidata para vacuna contra la enfermedad de Carrión
- Author
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Carlos Patricio Padilla Rojas, Priscila Nayu Lope Pari, Lorena Santos Solis, Cleidy Osorio Mogollón, Lisbet Inga Angulo, Henri Bailon Calderon, Adolfo Marcelo Ñique, Jackeline Morales, and Gladis Esther Ventura Egusquiza
- Subjects
infecciones por bartonella ,bartonella bacilliformis ,biología computacional ,epítopes ,adn recombinante ,inmunogenicidad vacunal ,Medicine ,Medicine (General) ,R5-920 - Abstract
Objetivos. Diseñar y evaluar una proteína multiepítope como candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión. Materiales y métodos. Mediante herramientas bioinformáticas se seleccionó epítopes de proteínas de membrana externa y se diseñó una proteína multiepítope. El gen de la proteína multiepítope fue subclonado en el plásmido de expresión pET28b y transformado en E. coli BL21 pLys. La proteína multiepítope fue expresada usando isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido y purificada usando resina. Esta proteína purificada fue utilizada para inmunizar ratones BALB/c y se obtuvo anticuerpos policlonales. Se realizaron ensayos de invasión in vitro usando una cepa de Bartonella bacilliformis (B. bacilliformis) a eritrocitos humanos. Resultados. La proteína multiepítope M1 presenta epítopes conservados entre aislamientos de B. bacilliformis, no tóxicos, no homólogos a proteínas humanas y superficiales. Los ratones inmunizados presentaron niveles de anticuerpos IgG capaces de reducir in vitro la tasa de invasión de B. bacilliformis a eritrocitos humanos. Conclusiones. La proteína multiepítope M1 podría servir como candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión; sin embargo, se requiere de más estudios para caracterizar el uso de este antígeno como vacuna.
- Published
- 2019
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5. Desarrollo y validación del método de amplificación isotérmica mediada en lazo para la detección del virus Zika
- Author
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Oscar Escalante-Maldonado, Ronnie Gustavo Gavilán, Maria Paquita García, Adolfo Marcelo, Edson Pacheco, César Cabezas, and Wataru Yamazaki
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virus zika ,diagnóstico ,adn polimerasa dirigida por arn ,reacción en cadena de la polimerasa ,Medicine ,Medicine (General) ,R5-920 - Abstract
Se desarrolló un método de amplificación isotérmica mediada en lazo de transcriptasa inversa (RT-LAMP) para detectar Zika. Los primers se diseñaron basándose en la región NS5 de 64 genomas completos. Se usó reactivo LAMP liofilizado. Inicialmente, se probaron siete arbovirus diferentes y solo las muestras de Zika resultaron positivas. Además, las diluciones seriadas de una de los ARN de Zika se compararon mediante RT-LAMP y qRT-PCR, demostrando que RTLAMP es 1000 veces más sensible. También se evaluó 300 muestras de suero usando RT-LAMP y los resultados se compararon con los métodos de qRT-PCR estándar y obtuvimos un 99,3% (IC95%: 97,7 - 100,0) de sensibilidad, 100% (IC95%: 99,7 - 100,0) de especificidad, 100% (IC95%: 99,7 -100,0) de valor predictivo positivo y 99,3% (IC95%: 97,7 - 100,0) de valor predictivo negativo. En conclusión, este método brinda una alternativa de bajo costo, alto rendimiento, viabilidad y confiabilidad para el diagnóstico rápido de Zika en instalaciones de atención primaria de salud.
- Published
- 2019
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6. A faster and less costly alternative for RNA extraction of SARS-CoV-2 using proteinase k treatment followed by thermal shock.
- Author
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Adolfo Marcelo Ñique, Fiorella Coronado-Marquina, Jairo Andrés Mendez Rico, María Paquita García Mendoza, Nancy Rojas-Serrano, Paulo Vitor Marques Simas, Cesar Cabezas Sanchez, and Jan Felix Drexler
- Subjects
Medicine ,Science - Abstract
One of the biggest challenges during the pandemic has been obtaining and maintaining critical material to conduct the increasing demand for molecular tests. Sometimes, the lack of suppliers and the global shortage of these reagents, a consequence of the high demand, make it difficult to detect and diagnose patients with suspected SARS-CoV-2 infection, negatively impacting the control of virus spread. Many alternatives have enabled the continuous processing of samples and have presented a decrease in time and cost. These measures thus allow broad testing of the population and should be ideal for controlling the disease. In this sense, we compared the SARS-CoV-2 molecular detection effectiveness by Real time RT-PCR using two different protocols for RNA extraction. The experiments were conducted in the National Institute of Health (INS) from Peru. We compared Ct values average (experimental triplicate) results from two different targets, a viral and internal control. All samples were extracted in parallel using a commercial kit and our alternative protocol-samples submitted to proteinase K treatment (3 μg/μL, 56°C for 10 minutes) followed by thermal shock (98°C for 5 minutes followed by 4°C for 2 minutes); the agreement between results was 100% in the samples tested. In addition, we compared the COVID-19 positivity between six epidemiological weeks: the initial two in that the Real time RT-PCR reactions were conducted using RNA extracted by commercial kit, followed by two other using RNA obtained by our kit-free method, and the last two using kit once again; they did not differ significantly. We concluded that our in-house method is an easy, fast, and cost-effective alternative method for extracting RNA and conducing molecular diagnosis of COVID-19.
- Published
- 2021
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7. Novel fungal organophosphorus hydrolases in acidic media: an application to apples decontamination
- Author
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Julia Yamila Santillan, Natalia Lorena Rojas, Elizabeth Sandra Lewkowicz, and Adolfo Marcelo Iribarren
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Health, Toxicology and Mutagenesis ,Environmental Chemistry ,General Medicine ,Pollution - Abstract
Organophosphorus pesticides bring significant improvements in agriculture, but their toxicity causes environmental and health negative impacts. The aim of this work was the development of robust biocatalysts to be applied in bioremediation. Four fungi were evaluated as hydrolase sources capable of degrading organophosphorus pesticides: Aspergillus niger, Fusarium sp., Penicillium chrysogenum, and Penicillium nalgiovense. The hydrolysis rates of methyl paraoxon obtained under acidic conditions were in the range of 10 to 21 mg L
- Published
- 2022
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8. Novel fungal organophosphorus hydrolases in acidic media: an application to apples decontamination
- Author
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Santillan, Julia Yamila, primary, Rojas, Natalia Lorena, additional, Lewkowicz, Elizabeth Sandra, additional, and Iribarren, Adolfo Marcelo, additional
- Published
- 2022
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9. Modified Nucleoside Triphosphates for in-vitro Selection Techniques
- Author
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Adolfo Marcelo Iribarren, María eDellafiore, and Javier Marcelo Montserrat
- Subjects
aptamers ,SELEX ,modified nucleotides ,Functional oligonucleotides ,DNAzymes and ribozymes ,Chemistry ,QD1-999 - Abstract
The development of SELEX (Selective Enhancement of Ligands by Exponential Enrichment) provides a powerful tool for the search of functional oligonucleotides with the ability to bind ligands with high affinity and selectivity (aptamers) and for the discovery of nucleic acid sequences with diverse enzymatic activities (ribozymes and DNAzymes). This technique has been extensively applied to the selection of natural DNA or RNA molecules but, in order to improve chemical and structural diversity as well as for particular applications where further chemical or biological stability is necessary, the extension of this strategy to modified oligonucleotides is desirable. Taking into account these needs, this review intends to collect the research carried out during the past years, focusing mainly on the use of modified nucleotides in SELEX and the development of mutant enzymes for broadening nucleoside triphosphates acceptance. In addition, comments regarding the synthesis of modified nucleoside triphosphate will be briefly discussed.
- Published
- 2016
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10. Expresión y sororreactividad de la lipoproteína recombinante de 43-kda de Bartonella bacilliformis
- Author
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Carlos Padilla R, Karen Gallegos V, Adolfo Marcelo Ñ, Stella Chenet C, and Christian Baldeviano V
- Subjects
Bartonella bacilliformis ,Diagnóstico ,Test de ELISA ,Proteínas Recombinantes ,Enfermedad de Carrión ,Medicine ,Medicine (General) ,R5-920 - Abstract
Objetivo: La lipoproteína de 43-kDa de Bartonella bacilliformis fue obtenida en su forma recombinante (rBbLppB) y purificada para evaluar su serorreactividad mediante ELISA. Materiales y métodos: Los niveles de anticuerpos IgG e IgM humanos en los sueros de pacientes con Bartonelosis confirmada y sueros de otras enfermedades (salmonelosis, Brucelosis y leptospirosis) frente a rBbLppB fueron evaluados por ELISA, se utilizó sueros de personas sanas como controles. Resultados: La sensibilidad y la especificidad del ELISA IgG fueron 70,4% y 90% respectivamente. Asimismo, la sensibilidad y especificidad de ELISA IgM fueron 85,2% y 90% respectivamente. Conclusiones: Estos resultados demuestran que el ELISA usando rBbLppB tiene una buena sensibilidad y especificidad y puede ser considerada como un buen antígeno para el diagnóstico de Bartonelosis causada por B. bacilliformis.
- Published
- 2006
11. Clonamiento, expresión y seroreactividad del antígeno recombinante flagelina de Bartonella bacilliformis
- Author
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Karen Gallegos V, Christian Baldeviano V, Adolfo Marcelo Ñ, and Carlos Padilla R
- Subjects
Bartonella bacilliformis ,Diagnóstico ,Flagelina ,Test de ELISA ,Proteínas Recombinantes ,Enfermedad de Carrión ,Medicine ,Medicine (General) ,R5-920 - Abstract
Objetivos. Clonar el gen de la flagelina A (flaA) de Bartonella bacilliformis, expresar y evaluar preliminarmente la seroreactividad de la proteína recombinante a sueros de pacientes con Bartonelosis por B. bacilliformis. Materiales y Métodos. Se diseñó una pareja de oligonucleótidos iniciadores -BbFlaA1 y BbFlaA2- para la amplificación del gen completo de la flagelina flaA de B. bacilliformis. El producto de amplificación obtenido se clonó en pGEM y luego se subclonó en el vector de expresión pGEX4T-1. Se indujo la expresión de la proteína de fusión rBbFlaA-GST con isopropil tio-β -D-galactosido (IPTG). La proteνna de fusiσn producida fue digerida con trombina para liberarla de GST. Finalmente, una prueba de ELISA fue estandarizada para detectar los anticuerpos IgG contra la proteína de fusión rBbFlaA-GST y rBbflaA libre de GST. Se evaluaron sueros de pacientes con diagnóstico de Bartonelosis por B. Bacilliformis (n= 30), sueros de individuos sanos (n= 20) y sueros de pacientes con otras enfermedades de posible reactividad cruzada; entre ellas, Brucelosis (n= 3), leptospirosis (n= 3) y salmonelosis (n=7). Resultados. Se determinó que para la expresión óptima en E. coli BL21 de la proteína de fusión rBbFlaA se requiere que el cultivo crezca en caldo LB/ampicilina a 30 °C suplementado con 2% de glucosa a partir de un preinóculo de 100 µL (crecido por toda la noche), hasta que alcance una densidad óptica de 1 OD600 y se induzca por dos horas con 2,5 mM de IPTG. Finalmente, el 57,6 % (17 de 30) sueros de pacientes con diagnóstico confirmado de bartonelosis reaccionaron con la proteína recombinante BbFlaA en el formato de ELISA. Conclusiones. Se logró expresar exitosamente en E. coli la proteína recombinante BbFlaA de B. bacilliformis, determinándose un protocolo de expresión y de purificación de rBbFlaA para la producción de esta proteína. Así también, el antígeno rBbFlaA es reconocido por anticuerpos de sueros de pacientes con Bartonelosis causada por B. bacilliformis.
- Published
- 2005
12. Cloning, expression and seroreactivity of the recombinant lipopolysaccharide assembly protein - D (LptD) from Bartonella bacilliformis
- Author
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Astrid, Flores-Nuñez, Gladis, Ventura, Henri, Bailon, Adolfo, Marcelo, Gustavo, Sandoval, and Carlos, Padilla-Rojas
- Subjects
Bartonella bacilliformis ,Isopropyl Thiogalactoside ,Lipopolysaccharides ,Bartonella Infections ,Escherichia coli Proteins ,Escherichia coli ,Humans ,Cloning, Molecular ,Recombinant Proteins ,Bacterial Outer Membrane Proteins - Abstract
To evaluate in silico and at the serological level the antigenic potential of the recombinant extracellular domain of the lipopolysaccharide assembly protein - D (LptD) of Bartonella bacilliformis (dexr_LptD).Through in silico analysis, we selected a B. bacilliformis protein with antigenic and immunogenic potential. The selected protein gene was cloned into Escherichia coli TOP10 and expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. Recombinant protein was expressed using isopropyl-β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) and induction conditions were optimized. Finally, it was purified with Ni-IDA resin (His60 Ni Superflow) and a Western Blot assay was conducted.In silico, the selected protein was LptD because it is located in the outer membrane and is antigenic and immunogenic. Optimized conditions for dexr_LptD induction were 0.5 mM IPTG, 16 hours, TB (Terrific Broth) medium, 3% (v/v) ethanol, 28 ºC, OD600: 1-1.5 and 200 rpm. Purification was carried out under denaturating conditions on a small scale and we obtained 2.6 μg/mL of partially purified dexr_LptD. The Western Blot assay showed a positive reaction between the sera from patients with Carrión's Disease and dexr_LptD, which shows the antigenicity of dexr_LptD.The dexr_LptD shows antigenicity both in silico and at the serological level, these results are the basis for further studies on vaccine candidates against Carrion's Disease.Evaluar in silico y a nivel serológico el potencial antigénico del dominio extracelular recombinante de la proteína de ensamblaje de lipopolisacáridos - D (LptD) de Bartonella bacilliformis (dexr_LptD).Mediante el análisis in silico se realizó la selección de una proteína de B. bacilliformis con potencial antigénico e inmunogénico. El gen de la proteína seleccionada se clonó en Escherichia coli TOP10 y se expresó en Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. La proteína recombinante fue expresada usando isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido (IPTG) y se optimizaron las condiciones de inducción. Por último, se purificó con resina Ni-IDA (His60 Ni Superflow) y se realizó un ensayo de Western Blot.In silico, la proteína seleccionada fue LptD por estar localizada en la membrana externa y ser antigénica e inmunogénica. Las condiciones optimizadas para la inducción del dexr_LptD fueron 0,5 mM IPTG, 16 h, medio TB (Terrific Broth), etanol al 3% (v/v), 28 ºC, OD600: 1-1,5 y 200 r.p.m. La purificación se realizó en condiciones denaturantes a pequeña escala y se obtuvo 2,6 µg/mL de dexr_LptD parcialmente purificada. El ensayo de Western Blot mostró una reacción positiva entre los sueros provenientes de pacientes con la enfermedad de Carrión y dexr_LptD, ello evidencia la antigenicidad del dexr_LptD.El dexr_LptD muestra antigenicidad in silico y a nivel serológico, estos resultados son base para posteriores estudios sobre candidatos vacunales contra la enfermedad de Carrión.
- Published
- 2021
13. Detection of Oropouche viral circulation in Madre de Dios region, Peru (December 2015 to January 2016)
- Author
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María P. García, Nancy S. Merino, Dana Figueroa, Adolfo Marcelo, Edwin Tineo V., Carlos Manrique, Fernando Donaires, Manuel Céspedes, Rufino Cabrera, and César Cabezas
- Subjects
Medicine ,Medicine (General) ,R5-920 - Published
- 2016
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14. Diseño y evaluación de una proteína multiepitópica como candidata para vacuna contra la enfermedad de Carrión
- Author
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Gladis Esther Ventura Egusquiza, Cleidy Osorio Mogollón, Jackeline Morales, Adolfo Marcelo Ñique, Lisbet Inga Angulo, Henri Bailon Calderon, Carlos Patricio Padilla Rojas, Priscila Nayu Lope Pari, and Lorena Santos Solis
- Subjects
adn recombinante ,lcsh:Medicine ,Epitope ,law.invention ,bartonella bacilliformis ,Antigen ,law ,infecciones por bartonella ,biología computacional ,lcsh:R5-920 ,Expression vector ,biology ,inmunogenicidad vacunal ,lcsh:R ,Public Health, Environmental and Occupational Health ,General Medicine ,biology.organism_classification ,Molecular biology ,In vitro ,epítopes ,Membrane protein ,Polyclonal antibodies ,Recombinant DNA ,biology.protein ,Bartonella bacilliformis ,lcsh:Medicine (General) - Abstract
Objetivos. Diseñar y evaluar una proteína multiepítope como candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión. Materiales y métodos. Mediante herramientas bioinformáticas se seleccionó epítopes de proteínas de membrana externa y se diseñó una proteína multiepítope. El gen de la proteína multiepítope fue subclonado en el plásmido de expresión pET28b y transformado en E. coli BL21 pLys. La proteína multiepítope fue expresada usando isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido y purificada usando resina. Esta proteína purificada fue utilizada para inmunizar ratones BALB/c y se obtuvo anticuerpos policlonales. Se realizaron ensayos de invasión in vitro usando una cepa de Bartonella bacilliformis (B. bacilliformis) a eritrocitos humanos. Resultados. La proteína multiepítope M1 presenta epítopes conservados entre aislamientos de B. bacilliformis, no tóxicos, no homólogos a proteínas humanas y superficiales. Los ratones inmunizados presentaron niveles de anticuerpos IgG capaces de reducir in vitro la tasa de invasión de B. bacilliformis a eritrocitos humanos. Conclusiones. La proteína multiepítope M1 podría servir como candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión; sin embargo, se requiere de más estudios para caracterizar el uso de este antígeno como vacuna.
- Published
- 2019
15. Evaluación nutricional de Lepidium meyenii (MACA) en ratones albinos y su descendencia
- Author
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Marco Canales, José Aguilar, Ana Prada, Adolfo Marcelo, Cecilia Huamán, and Luz Carbajal
- Subjects
Maca ,Lepidium meyenii ,Brassicaceas ,nutrición ,desnutrición ,Brassicaceae ,nutrition ,malnutrition ,Nutrition. Foods and food supply ,TX341-641 ,Biology (General) ,QH301-705.5 - Abstract
La Maca (Lepidium meyenii) es un hipocotilo peruano que crece exclusivamente entre los 3700 y 4500 msnm en los andes peruanos. Tradicionalmente se le atribuyen propiedades nutricionales, energizantes, fertilizantes, entre otras. Con la finalidad de evaluar científicamente la capacidad nutricional de la Maca, realizamos un estudio controlado en dos generaciones de ratones Swiss (padres y crías). Los padres fueron aleatoriamente asignados a uno de tres esquemas alimenticios. El alimento de cada grupo fue preparado en base a polvo de un alimento balanceado comercial (ABC), al cual se le reemplazó un 30 % (peso/peso) por Maca Cruda o Cocida según el grupo correspondiente o ABC puro en el grupo control. Así los grupos fueron: 1) Grupo Maca Cruda; 2) Grupo Maca Cocida; y 3) Grupo ABC, grupo control. Los resultados mostraron curvas de crecimiento similares y adecuadas para los tres grupos. Ninguno de los grupos mostró signos de desnutrición ni sobrepeso. Sin embargo, el grupo Maca Cocida mostró mejores curvas de crecimiento incluso que el grupo ABC, mejor observable en la segunda generación de animales, con diferencias estadísticamente significativas. El grupo control, tuvo un crecimiento superior al grupo Maca Cruda. Los ratones del grupo Maca Cocida tuvieron valores de proteínas totales y albúmina séricas superiores al de los grupos Maca Cruda y grupo control. Este estudio demuestra en un modelo científico la capacidad nutricional de la Maca.Nutritional evaluation of Lepidium meyenii (MACA) in albino mice and their descendant. The Maca (Lepidium meyenii) is a Peruvian hypocotyl that grows exclusively between the 3700 and 4500 masl at the Peruvian Andes. Traditionally it is attributed nutritional, energizing, fertilizing properties among others. With the purpose of evaluate scientifically the nutritional property of Maca, we carried out a controlled study in two generations of albino Swiss mice (parents and breeding). The parents were aleatorily assigned lo one of three nutritional schedules. The food of each group was prepared based on powder from a commercial balanced food (CBF) of which 30 % was replaced by raw or cooked Maca according to the corresponding group or pure CBF in the control group. The groups were this way: 1) Raw Maca Group; 2) Cooked Maca Group; and, 3) Control Group. The results showed that the curves of growth were similar and adequate for the three groups. However, the cooked Maca group showed the best curve. These data were better observable in the second generation of animals, with significant statistical difference (p
- Published
- 2000
16. Biocatalysed halogenation of nucleobase analogues
- Author
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Médici, Rosario, Garaycoechea, Juan Ignacio, Dettorre, Lucas Andrés, Iribarren, Adolfo Marcelo, and Lewkowicz, Elizabeth Sandra
- Published
- 2011
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17. A faster and less costly alternative for RNA extraction of SARS-CoV-2 using proteinase k treatment followed by thermal shock
- Author
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Cesar Cabezas Sanchez, María Paquita García Mendoza, Jairo Andrés Mendez Rico, Nancy Rojas-Serrano, Jan Felix Drexler, Adolfo Marcelo Ñique, Paulo Vitor Marques Simas, and Fiorella Coronado-Marquina
- Subjects
0301 basic medicine ,RNA viruses ,Viral Diseases ,Coronaviruses ,Artificial Gene Amplification and Extension ,Polymerase Chain Reaction ,Biochemistry ,Geographical locations ,0302 clinical medicine ,COVID-19 Testing ,Medical Conditions ,Sense (molecular biology) ,Peru ,030212 general & internal medicine ,Pathology and laboratory medicine ,Mathematics ,Virus Testing ,Alternative methods ,education.field_of_study ,Multidisciplinary ,biology ,Proteases ,Medical microbiology ,Enzymes ,Nucleic acids ,Infectious Diseases ,Viruses ,Medicine ,RNA, Viral ,RNA extraction ,Endopeptidase K ,SARS CoV 2 ,Pathogens ,Research Article ,Coronavirus disease 2019 (COVID-19) ,SARS coronavirus ,Science ,Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ,Population ,Real-Time Polymerase Chain Reaction ,Microbiology ,03 medical and health sciences ,Extraction techniques ,Diagnostic Medicine ,Genetics ,Humans ,education ,Molecular Biology Techniques ,Pandemics ,Molecular Biology ,Medicine and health sciences ,Chromatography ,Biology and life sciences ,Clinical Laboratory Techniques ,Diagnostic Tests, Routine ,SARS-CoV-2 ,Organisms ,Viral pathogens ,RNA ,COVID-19 ,Proteins ,Covid 19 ,Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction ,South America ,Proteinase K ,Microbial pathogens ,Research and analysis methods ,030104 developmental biology ,biology.protein ,Enzymology ,Gene expression ,People and places ,RNA transport - Abstract
One of the biggest challenges during the pandemic has been obtaining and maintaining critical material to conduct the increasing demand for molecular tests. Sometimes, the lack of suppliers and the global shortage of these reagents, a consequence of the high demand, make it difficult to detect and diagnose patients with suspected SARS-CoV-2 infection, negatively impacting the control of virus spread. Many alternatives have enabled the continuous processing of samples and have presented a decrease in time and cost. These measures thus allow broad testing of the population and should be ideal for controlling the disease. In this sense, we compared the SARS-CoV-2 molecular detection effectiveness by Real time RT-PCR using two different protocols for RNA extraction. The experiments were conducted in the National Institute of Health (INS) from Peru. We compared Ct values average (experimental triplicate) results from two different targets, a viral and internal control. All samples were extracted in parallel using a commercial kit and our alternative protocol–samples submitted to proteinase K treatment (3 μg/μL, 56°C for 10 minutes) followed by thermal shock (98°C for 5 minutes followed by 4°C for 2 minutes); the agreement between results was 100% in the samples tested. In addition, we compared the COVID-19 positivity between six epidemiological weeks: the initial two in that the Real time RT-PCR reactions were conducted using RNA extracted by commercial kit, followed by two other using RNA obtained by our kit-free method, and the last two using kit once again; they did not differ significantly. We concluded that our in-house method is an easy, fast, and cost-effective alternative method for extracting RNA and conducing molecular diagnosis of COVID-19.
- Published
- 2020
18. A faster and less costly alternative for RNA extraction of SARS-CoV-2 using proteinase k treatment followed by thermal shock
- Author
-
Ñique, Adolfo Marcelo, primary, Coronado-Marquina, Fiorella, additional, Mendez Rico, Jairo Andrés, additional, García Mendoza, María Paquita, additional, Rojas-Serrano, Nancy, additional, Simas, Paulo Vitor Marques, additional, Cabezas Sanchez, Cesar, additional, and Drexler, Jan Felix, additional
- Published
- 2021
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19. [DESIGN AND EVALUATION OF A MULTIEPITOPIC PROTEIN AS A CANDIDATE FOR A CARRION DISEASE VACCINE]
- Author
-
Carlos Patricio Padilla, Rojas, Priscila Nayu Lope, Pari, Lorena Santos, Solis, Cleidy Osorio, Mogollón, Lisbet Inga, Angulo, Henri Bailon, Calderon, Adolfo Marcelo, Ñique, Jackeline, Morales, and Gladis Esther Ventura, Egusquiza
- Subjects
Epitopes ,Mice, Inbred BALB C ,Bacterial Proteins ,Bartonella Infections ,Drug Design ,Bacterial Vaccines ,Animals ,Computational Biology ,Female - Abstract
To design and assess a multiepitopic protein as a candidate for a vaccine against Carrion disease.Using bioinformatics tools, epitopes of external membrane proteins were selected and a multiepitopic protein was designed. The multiepitopic protein gene was subcloned into the expression plasmid pET28b and transformed into E. coli BL21 pLys. The multiepitopic protein was expressed using isopropyl-β-D-1-thiogalactopyranoside and purified using resin. This purified protein was used to immunize BALB/c mice obtaining polyclonal antibodies. In vitro invasion assays were conducted using a strain of Bartonella bacilliformis (B. bacilliformis) in human red blood cells.The multiepitopic protein M1 presents preserved epitopes between isolates of B. bacilliformis with are non-toxic, and not homologous to human and surface proteins. Immunized mice presented IgG antibody levels capable of reducing in vitro the rate of invasion of B. bacilliformis into human red blood cells.Multiepitopic protein M1 may serve as a candidate for a Carrion disease vaccine; however, more studies are needed to characterize the use of this antigen as a vaccine.Diseñar y evaluar una proteína multiepítope como candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión.Mediante herramientas bioinformáticas se seleccionó epítopes de proteínas de membrana externa y se diseñó una proteína multiepítope. El gen de la proteína multiepítope fue subclonado en el plásmido de expresión pET28b y transformado en E. coli BL21 pLys. La proteína multiepítope fue expresada usando isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido y purificada usando resina. Esta proteína purificada fue utilizada para inmunizar ratones BALB/c y se obtuvo anticuerpos policlonales. Se realizaron ensayos de invasión in vitro usando una cepa de Bartonella bacilliformis (B. bacilliformis) a eritrocitos humanos.La proteína multiepítope M1 presenta epítopes conservados entre aislamientos de B. bacilliformis, no tóxicos, no homólogos a proteínas humanas y superficiales. Los ratones inmunizados presentaron niveles de anticuerpos IgG capaces de reducir in vitro la tasa de invasión de B. bacilliformis a eritrocitos humanos.La proteína multiepítope M1 podría servir como candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión; sin embargo, se requiere de más estudios para caracterizar el uso de este antígeno como vacuna.
- Published
- 2019
20. [Development and validation of loop-mediated isothermal amplification for the detection of the Zika virus]
- Author
-
Oscar, Escalante-Maldonado, Ronnie Gustavo, Gavilán, Maria Paquita, García, Adolfo, Marcelo, Edson, Pacheco, César, Cabezas, and Wataru, Yamazaki
- Subjects
Molecular Diagnostic Techniques ,Zika Virus Infection ,Humans ,Zika Virus ,Nucleic Acid Amplification Techniques - Abstract
A Reverse Transcription Loop-mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) method was developed to detect Zika. The primers were designed based on the NS5 region of 64 complete genomes. Lyophilized LAMP reagent was used. Initially, seven different arboviruses were tested and only Zika samples tested positive. Additionally, serial dilutions of one of Zika's RNA were compared using RT-LAMP and qRT-PCR, demonstrating that RT-LAMP is 1,000 times more sensitive. We also evaluated 300 serum samples with RT-LAMP comparing the results with standard qRT-PCR methods, and we obtained a 99.3% sensitivity, 100% specificity, 100% positive predictive value, and 99.3% negative predictive value. In conclusion, this method provides a low-cost, high-performance, viable, and reliable alternative for the rapid diagnosis of Zika in primary health-care facilities.Se desarrolló un método de amplificación isotérmica mediada en lazo de transcriptasa inversa (RT-LAMP) para detectar Zika. Los primers se diseñaron basándose en la región NS5 de 64 genomas completos. Se usó reactivo LAMP liofilizado. Inicialmente, se probaron siete arbovirus diferentes y solo las muestras de Zika resultaron positivas. Además, las diluciones seriadas de una de los ARN de Zika se compararon mediante RT-LAMP y qRT-PCR, demostrando que RTLAMP es 1000 veces más sensible. También se evaluó 300 muestras de suero usando RT-LAMP y los resultados se compararon con los métodos de qRT-PCR estándar y obtuvimos un 99,3% (IC95%: 97,7 - 100,0) de sensibilidad, 100% (IC95%: 99,7 - 100,0) de especificidad, 100% (IC95%: 99,7 -100,0) de valor predictivo positivo y 99,3% (IC95%: 97,7 - 100,0) de valor predictivo negativo. En conclusión, este método brinda una alternativa de bajo costo, alto rendimiento, viabilidad y confiabilidad para el diagnóstico rápido de Zika en instalaciones de atención primaria de salud.
- Published
- 2018
21. Anti-inflammatory activity of two different extracts of Uncaria tomentosa (Rubiaceae)
- Author
-
Rudolf Bauer, José Aguilar, Christoph A. Klaas, Percy A. Rojas, Irmgard Merfort, Alberto Plaza, Eveline Reininger, and Adolfo Marcelo
- Subjects
medicine.drug_class ,Pharmacognosy ,Anti-inflammatory ,law.invention ,Jurkat Cells ,Mice ,In vivo ,law ,Drug Discovery ,Uncaria tomentosa ,medicine ,Animals ,Edema ,Humans ,Electrophoretic mobility shift assay ,Cat's Claw ,Enzyme Inhibitors ,Pharmacology ,Mice, Inbred BALB C ,biology ,Traditional medicine ,Plant Extracts ,Anti-Inflammatory Agents, Non-Steroidal ,NF-kappa B ,Membrane Proteins ,Biological activity ,biology.organism_classification ,Isoenzymes ,Mechanism of action ,Cyclooxygenase 2 ,Prostaglandin-Endoperoxide Synthases ,Cyclooxygenase 1 ,Plant Bark ,Female ,medicine.symptom ,Phytotherapy - Abstract
We assessed in vivo the anti-inflammatory activity of two Cat's claw bark extracts, by comparing a spray-dried hydroalcoholic extract against an aqueous freeze-dried extract, to determine which extract was more effective. We used the carrageenan-induced paw edema model in mice. In addition, to assess the molecular mechanism of action, we determined the inhibition of NF-kappa B through the Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) and the effects on cycloxygenase-1 and -2. Results showed that the anti-inflammatory activity was significantly higher using the hydroalcoholic compared with the aqueous extract (P
- Published
- 2002
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22. Activity of core modified 10-23 DNAzymes against HCV
- Author
-
Robaldo, Laura, Berzal Herranz, Alfredo, Montserrat, Javier Marcelo, and Iribarren, Adolfo Marcelo
- Subjects
10-23 DNAzyme ,viruses (HCV) ,Química Orgánica ,2?-O-methyl nucleosides ,Ciencias Químicas ,2?-C-methylnucleosides ,CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Abstract
The highly conserved untranslated regions of the hepatitis C virus (HCV) play a fundamental role in viral translation and replication and are therefore attractive targets for drug development. A set of modified DNAzymes carrying (2′R)-, (2′S)-2′-deoxy-2′-C-methyl- and -2′-O-methylnucleosides at various positions of the catalytic core were assayed against the 5′-internal ribosome entry site element (5′-IRES) region of HCV. Intracellular stability studies showed that the highest stabilization effects were obtained when the DNAzymes′ cores were jointly modified with 2′-C-methyl- and 2′-O-methylnucleosides, yielding an increase by up to fivefold in the total DNAzyme accumulation within the cell milieu within 48 h of transfection. Different regions of the HCV IRES were explored with unmodified 10–23 DNAzymes for accessibility. A subset of these positions was tested for DNAzyme activity using an HCV IRES-firefly luciferase translation-dependent RNA (IRES-FLuc) transcript, in the rabbit reticulocyte lysate system and in the Huh-7 human hepatocarcinoma cell line. Inhibition of IRES-dependent translation by up to 65 % was observed for DNAzymes targeting its 285 position, and it was also shown that the modified DNAzymes are as active as the unmodified one. Fil: Robaldo, Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina Fil: Berzal Herranz, Alfredo. Instituto de Parasitología y Biomedicina “López-Neyra”; España Fil: Montserrat, Javier Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; Argentina Fil: Iribarren, Adolfo Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología. Area Química. Laboratorio de Biotransformaciones; Argentina
- Published
- 2014
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23. ¿Querés llevarte un libro? : Oportunidades para nuevas lecturas
- Author
-
Lamas, Adolfo Marcelo
- Subjects
libros ,Humanidades ,lectura ,Literatura ,práctica cotidiana ,Letras - Abstract
El presente texto tiene como propósito dar cuenta de las voces, actitudes y percepciones manifestadas durante el desarrollo de una actividad previa a la maratón de lectura realizada en el colegio durante el mes de septiembre de 2011. La propuesta consistió en disponer en los pasillos de la escuela de una mesa de lectura. Sobre la mesa se colocaron textos literarios diversos con el fin de que los alumnos los eligieran y se los llevaran a sus casas para leerlos. Resulta interesante señalar que, si bien la actividad fue positiva, fueron las palabras, los silencios y las acciones de la comunidad escolar frente a los objetos libros y al espacio en sí mismo lo que me motivó al registro de esta experiencia que quisiera compartir., Sección: La gambeta didáctica. Propuesta de enseñanza., Departamento de Letras
- Published
- 2013
24. An improved microbial synthesis of purine nucleosides
- Author
-
Lewkowicz, Elizabeth Sandra, Martínez, Natalia, Rogert, María C., Porro, Silvia, and Iribarren, Adolfo Marcelo
- Subjects
PURINE NUCLEOSIDES ,BIOTRANSFORMATIONS ,Otras Ciencias Químicas ,Ciencias Químicas ,NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASES ,ESCHERICHIA COLI ,CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Abstract
E. coli BL21 synthesized purine nucleosides from pyrimidine ones. A 94% yield of adenosine from uridine was reached within 1 h. Fil: Lewkowicz, Elizabeth Sandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina Fil: Martínez, Natalia. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina Fil: Rogert, María C.. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina Fil: Porro, Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina Fil: Iribarren, Adolfo Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
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- 2000
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25. Trypanosoma cruzi arginine kinase characterization and cloning. A novel energetic pathway in protozoan parasites
- Author
-
Pereira, Claudio Alejandro, Alonso, Guillermo Daniel, Paveto, Maria Cristina, Iribarren, Adolfo Marcelo, Cabanas, María Laura, Torres, Hector Norberto, and Flawia, Mirtha Maria
- Subjects
Trypanosoma Cruzi ,purl.org/becyt/ford/1 [https] ,Otras Ciencias Químicas ,Ciencias Químicas ,purl.org/becyt/ford/1.4 [https] ,Arginine Kinase ,CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Abstract
This work contains the first description of a guanidino kinase in a flagellar unicellular parasite. The enzyme phosphorylates L-arginine and was characterized in preparations from Trypanosoma cruzi, the ethiological agent of Chagas' disease. The activity requires ATP and a divalent cation. Under Standard assay conditions (1 mM L-arginine), the presence of 5-fold higher concentrations of canavanine or histidine produced a greater than 50% enzyme inhibition. The base sequence of this enzyme revealed an open reading frame of 357 amino acids and a molecular weight of 40,201. The amino acid sequence shows all of the characteristic consensus blocks of the ATP:guanidino phosphotransferase family and a putative 'actinin-type' actin-binding domain. The highest amino acid identities of the T. cruzi sequence, about 70%, were with arginine kinases from Arthropoda. Southern and chromosome blots revealed that the kinase is encoded by a single-copy gene. Moreover, Northern blot analysis showed an mRNA subpopulation of about 2.0 kilobases, and Western blotting of T. cruzi-soluble polypeptides revealed a 40-kDa band. The finding in the parasite of a phosphagen and its biosynthetic pathway, which are totally different from those in mammalian host tissues, points out this arginine kinase as a possible chemotherapy target for Chagas' disease. Fil: Pereira, Claudio Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina Fil: Alonso, Guillermo Daniel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina Fil: Paveto, Maria Cristina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina Fil: Iribarren, Adolfo Marcelo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina Fil: Cabanas, María Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina Fil: Torres, Hector Norberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina Fil: Flawia, Mirtha Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
- Published
- 2000
26. Complete and regioselective deacetylation of peracetylated uridines using a lipase
- Author
-
Iglesias, Luis Emilio, Zinni, Maria Alejandra, Gallo, Mariana, and Iribarren, Adolfo Marcelo
- Subjects
NUCLEOSIDES ,DEACETYLATION ,Otras Ciencias Químicas ,Ciencias Químicas ,LIPASE ,TRIACETYLURIDINES ,CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS ,ACETYLURIDINES - Abstract
Lipase-catalysed alcoholysis and hydrolysis of 2',3',5-tri-O- acetyluridine (1a) and 2',3',5'-tri-O-acetyl-2'-C-methyluridine (1b) were studied. Conditions for full and regioselective deacetylation of 1a and 1b are shown in the present work. New compound 2',3'-di-O-acetyl-2'-C- methyluridine (3b) was prepared by regioselective lipase-catalysed deacetylation. Fil: Iglesias, Luis Emilio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina Fil: Zinni, Maria Alejandra. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina Fil: Gallo, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina Fil: Iribarren, Adolfo Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina
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- 2000
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27. Estudio químico de Bauhinia candicans Benth.(Familia : Leguminosae)
- Author
-
Iribarren, Adolfo Marcelo and Pomilio, Alicia Beatriz
- Abstract
El objetivo de este trabajo fue aislar e identificar los componentes orgánicos de Bauhinia candicans Benth. (Familia: Legwmlnosae). Esta planta argentina es ampliamente conocida en la medicina popular ya que se le atribuyen propiedades antidiabéticas. En la presente tesis se desarrollan los siguientes temas: 1°) Introducción a la familia Leguminosae teniendo en cuenta los aspectos botánicos y fitoquímicos de ésta describiéndose, particularmente, el género Bauhinia. 2°) Análisis de los espectros de masas de los 3-cetoesteroides mono-y di-insaturados, remarcando las fragmentaciones diagnóstico que permiten determinar la ubicación de la/s insaturacion/es. Se analizan, además, en forma genérica los espectros de masas, 1H-RMN y 13C-RMN que son de utilidad para la elucidación estructural de los glicósidos de esteroles. Lo desarrollado en el punto 2° contribuye al esclarecimiento de los temas principales tratados en la discusión de los resultados obtenidos en esta tesis. 3°) Acción hipoglucemiante; se realiza una breve introducción sobre las causas y consecuencias de la diabetes, asi como también sobre los medios disponibles para contrarrestar sus efectos. Se incluye, también, una corta reseña histórica sobre productos naturales hipoglucemiantes. 4°) Discusión de los resultados obtenidos en esta tesis, comprendiendola identificación de los componentesde los extractos de éter de petróleo y etanólico de la especie vegetal antes mencionada. Se indican las técnicas separativas utilizadas en las etapas de aislamiento y purificación, analizándose en cada caso los espectros UV, IR, EM, 1H-RMN y 13C-RMN y/o los métodos químicos que condujeron a la determinación estructural de: a) triacontanol I b) alcoholes lineales de C26H540 a C31H64O c) estigmasta-1,3,5—trieno II d) estigmasta-3,5-dieno III e) campesterol IV f) estigmasterol V g) sitosterol VI h) estigmast-4-en-3-ona VII i) estigmasta-4,6-dien-3-ona VIII j) estigmasta-3,5-dien-7-ona IX k) hidrocarburos lineales de C21H44 a C33H68 l) sitosterol-3-O-β—D-xilopiranósido X m) sitosterol-3-O-α-D-riburonofuranósido XI n) sitosterol-3-O-β-D-glucopiranósido XII ñ) canferol-3-O-β-rutinósido XIII o) canferol-3-O-β-rutinósido-7-0-α-L-ramnopiranósido XIV p) colina XV q) trigonelina XVI r) los aminoánidos: ácido aspártico XVII, treonina XVIII, serina XIX, ácido glutámico XX, prolina XXI;, glicina XXII, alanina XXIII, valina XXIV, metionina XXV, isoleucina XXVI, leucina XXVII, tirosina XXVIII, fenilalanina XXIX e histidina XXX. Los glicósidos de esteroles X y XI no habian sido desCriptos previamente,y del cetoesteroide VIII; se conocen sólo dos informes previos a este trabajo. Se realizó, además, el estudio conformacional del azúcar del glicósido Xb (X acetilado). En el extracto etanólico de flores de Bauhinia candicans, además de los glicósidos de flavonoles XIII y XIV, se identificó a: s) D-inositol-3-metiléter XXXI;. Se realizó, también, un estudio quimico comparativo entre las especies B. candicans, B. variegata y B. forficata, observándose gran similitud entre las mismas. Además, de los compuestos mencionados anteriormente, este estudio quimico permitió caracterizar a: t) colesterol XXXII u) brasicasterol XXXIII Por último se describen los ensayos realizados para determinar la acción antimicrobiana de los extractos de éter de petróleo y etanólico de B. candicans. Se analiza además, la actividad hipoglucémica e hipocolesterolémica del extracto acuoso, cuyo componente trigonelina (XVI) demostró ser responsable de estos efectos. 5°) Parte experimental del trabajo realizado, que incluye los datos numéricos de los espectros de cada uno de los componentes identificados. Fil: Iribarren, Adolfo Marcelo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
- Published
- 1984
28. Estudio Geológico Económico de las Minas de Cobre, Yalguaraz I y II, Departamento de Las Heras, Provincia de Mendoza
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
cobre ,Yalguaraz I y II (Las Heras, Mendoza, Argentina) ,33 + 622 (825.1) (047) [55] ,mina ,geología económica - Abstract
Carpeta 603, inéditos SEGEMAR Fil: Mezzetti, Adolfo Marcelo. Ministerio de Economía. Secretaría de Industria y Minería. Dirección Nacional de Geología y Minería; Argentina.
- Published
- 1964
29. Informe Final Zona Cerro Mercedario. Área de Reserva N°50. Plan Cordillerano. Provincia de San Juan, República Argentina
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
Cerro Mercedario (Calingasta, San Juan, Argentina) ,cinc ,cobre ,Calingasta (San Juan, Argentina) ,San Juan (Argentina) ,plomo ,molibdeno ,551 (825.2) (047) ,geología - Abstract
Fil: Mezzetti, A. M. Gobierno Argentino. Dirección General de Fabricaciones Militares. Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo; Argentina
- Published
- 1968
30. Reconocimiento Expeditivo de los Yacimientos de Plomo de la Quebrada de Toroyoc. Cerro Minero, Vizcarra, Iruya, Salta
- Author
-
Reverberi, Oscar Valentín and Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
Quebrada de Toroyoc (Cerro Minero, Viscarra, Iruya, Salta, Argentina) ,plomo ,minería ,yacimiento ,55 (826.7) (047) ,geología - Abstract
Carpeta 585, inéditos SEGEMAR Fil: Reverberi, Oscar. Ministerio de Industria y Comercio. Secretaría de Minería. Dirección Nacional de Geología y Minería; Argentina. Fil: Mezzetti, Adolfo M. Ministerio de Industria y Comercio. Secretaría de Minería. Dirección Nacional de Geología y Minería; Argentina.
- Published
- 1959
31. Distrito Minero Talampaya. Baritina. Departamento Chilecito, Provincia de La Rioja
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
baritina ,La Rioja (Argentina) ,Sierra de Sañogasta (Chilecito, La Rioja, Argentina) ,622 (825.3) (047) ,yacimiento ,Chilecito (La Rioja, Argentina) - Abstract
Fil: Mezzetti, A. Ministerio de Economía de la Nación. Secretaría de Estado de Industria y Minería. Subsecretaría de Minería; Argentina.
- Published
- 1960
32. Informe sobre la Prospección Geoquímica Realizada en Yalguaraz Central, Mendoza
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
plan de exploración geológico minera ,prospección ,550.42 (825.1) (047) ,Yalguaraz (Mendoza, Argentina) ,Plan Cordillerano ,geoquímica ,Mendoza (Argentina) ,Área de Reserva nro. 2 (Mendoza, Argentina) - Abstract
Fil: Mezzetti, A.M.; Argentina.
- Published
- 1967
33. Plan Cordillerano. Informe Final. Zona Puesto la Peña, Área de Reserva N°5, Provincia de Mendoza, República Argentina
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
andesita ,piroxenita ,cuarzo ,magnetita ,geoquímica ,Mendoza (Argentina) ,geofísica ,cobre ,pirita ,titanita ,pórfido ,Plan Cordillerano ,diorita ,551 (825.1) (047) ,limonita - Abstract
Fil: Mezzetti, Adolfo Marcelo. Ministerio de Defensa. Dirección General de Fabricaciones Militares; Argentina / Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo y Argentina
- Published
- 1968
34. Distrito Minero La Puntilla. Baritina. Departamento de General Lamadrid, La Rioja
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
baritina ,La Rioja (Argentina) ,La Puntilla, mina (General Lamadrid, La Rioja, Argentina) ,General Lamadrid (La Rioja, Argentina) ,622 (825.3) (047) ,yacimiento ,geología - Abstract
Fil: Mezzetti, A. M. Ministerio de Economía de la Nación. Secretaría de Estado de Industria y Minería. Subsecretaría de Minería. Instituto Nacional de Geología Minera; Argentina
- Published
- 1960
35. Estudio Geológico Minero del Yacimiento de Antimonio San José. Departamento Rinconada, Provincia de Jujuy
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
antimonio ,622 (826.9) (047) ,San José, mina (Coyaguaina, Rinconada, Jujuy, Argentina) ,Rinconada (Jujuy, Argentina) ,Jujuy (Argentina) ,Coyaguaina (Rinconada, Jujuy, Argentina) ,yacimiento ,geología económica - Abstract
Fil: Mezzetti, A.M. Ministerio de Economía de la Nación. Secretaría de Estado de Industria y Minería. Subsecretaría de Minería; Argentina
- Published
- 1965
36. Bosquejo Minero de la Sierra Brava. Las Pegmatitas. Departamento Capital, Provincia de La Rioja
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
Sierra Brava (Departamento Capital, La Rioja, Argentina) ,551 (825.3) (047) ,La Rioja (Argentina) ,pegmatita ,Departamento Capital (La Rioja, Argentina) ,yacimiento ,geología - Abstract
Fil: Mezzetti, A. M. Ministerio de Economía de la Nación. Secretaría de Estado de Industria y Minería. Subsecretaría de Minería; Argentina
- Published
- 1960
37. Informe Geológico Minero de los Afloramientos Ferríferos de El Cebilar. Departamento Iruya. Provincia de Salta
- Author
-
Mezzetti, Adolfo Marcelo
- Subjects
hierro ,El Cebilar (Iruya, Salta, Argentina) ,minería ,geología ,55 + 622 (826.7) (047) - Abstract
Carpeta 593, inéditos SEGEMAR Fil: Mezzetti, Adolfo Marcelo. Ministerio de Economía. Secretaría de Industria y Minería. Dirección Nacional de Geología y Minería; Argentina.
- Published
- 1965
38. Fosfohidrolasas aplicadas en biocatálisis y biorremediación
- Author
-
Santillan, Julia Yamila and Iribarren, Adolfo Marcelo
- Subjects
Biocatálisis ,purl.org/becyt/ford/2 [https] ,purl.org/becyt/ford/2.9 [https] ,INGENIERÍAS Y TECNOLOGÍAS ,Fosfotriesterasas ,Bioprocesamiento Tecnológico, Biocatálisis, Fermentación ,Biorremediación ,Compuestos Organofosforados ,Biotecnología Industrial - Abstract
Las fosfotriesterasas son esterasas capaces de escindir el enlace P-O y han sido halladas en mamíferos, peces, aves, moluscos y bacterias. Estas enzimas demostraron ser biocatalizadores útiles en la degradación de compuestos organofosforados, siendo estos ampliamente utilizados en la actualidad como pesticidas en agricultura, en jardines y en la industria veterinaria. En particular, en nuestro país el organofosforado clorpirifós es el segundo pesticida más utilizado. Si bien estos pesticidas son muy eficientes, son también altamente tóxicos para mamíferos. Así, la intoxicación por organofosforados se ha convertido en un problema importante en todo el mundo. Considerando lo antes dicho, en el presente trabajo de tesis doctoral se propuso como primer objetivo el desarrollo de un sistema para la biorremediación de aguas contaminadas con pesticidas organofosforados empleando catalizadores con actividad fosfotriesterasa. Por otra parte y desde el punto de vista de la biocatálisis, como las enzimas no están limitadas a su actividad natural, es posible utilizarlas empleando una variedad de sustratos, pudiendo además catalizar las reacciones en ambas direcciones de su equilibrio termodinámico. Es por ello que las fosfotriesterasas pueden ser aplicadas en el sentido sintético para la obtención de fosfotriesteres, siendo de particular importancia los correspondientes derivados de nucleósidos y análogos. Estos compuestos, conocidos como pronucleótidos, son productos farmacológicamente útiles como antivirales y anticancerígenos ya que inhiben enzimas específicas (transcriptasa reversa, ARN replicasa, ADN polimerasa, IMP deshidrogenasa) o actúan como terminadores de cadena en la biosíntesis de ARN o ADN. En este marco, se propuso como segundo objetivo efectuar una primer aproximación a la síntesis de pronucleótidos a través de reacciones biocatalizadas. A continuación se hará un breve resumen de lo desarrollado a lo largo de cada capítulo del presente trabajo de tesis doctoral:En el capítulo 1, se presenta una introducción sobre biocatálisis y biorremediación. Ambas tecnologías tienen en común el empleo de sistemas biológicos para llevar a cabo una biotransformación. En este marco también se describen las fosfotriesterasas, enzimas de interés y objeto de estudio del presente trabajo, como así también los compuestos organofosforados (usos y tipos) y los análogos de nucleósidos. En el capítulo 2, se describen las metodologías desarrolladas para llevar a cabo la búsqueda, estudio e implementación en los procesos biocataliticos de fuentes microbianas con actividad fosfotriesterásica. Adicionalmente, se detallan los métodos de detección, análisis y cuantificación de los sustratos y productos de cada reacción biocatalizada estudiada.En el capítulo 3, se exponen los resultados obtenidos a partir del estudio de la actividad hidrolítica de seis fuentes bacterianas wild type frente a metil paraoxón. También se muestran los resultados de la optimización de las condiciones de reacción de dichos biocatalizadores, a partir de las cuales se evaluó la actividad fosfotriesterásica frente a diferentes sustratos, seleccionando un biocatalizador capaz de degradar cada uno de los compuestos organofosforados propuestos.En el capítulo 4, se presenta un trabajo realizado en colaboración con el laboratorio de LIGBCM-AVI de la Universidad Nacional de Quilmes que permitió la identificación de dos bacterias aisladas de suelo. Posteriormente, aplicando una metodología rápida y sencilla, se describe el estudio y la optimización de las condiciones de reacción, obteniéndose biocatalizadores capaces de degradar eficientemente sustratos más voluminosos como coroxón, cumafós y clorpirifós, para los que las fosfotriesterasas wild type reportadas suelen tener baja actividad hidrolítica.En el capítulo 5, se presentan los resultados del estudio de los extractos enzimáticos provenientes de los microorganismos estudiados en los capítulos 3 y 4. Adicionalmente tanto las células enteras como dichos extractos fueron inmovilizados por atrapamiento en perlas de alginato de calcio. Tras su ensayo en la hidrólisis de compuestos organofosforados, se seleccionó una forma de biocatalizador inmovilizado que fuera capaz de degradar con mayor eficiencia cada uno de dichos compuestos. Asimismo, se emplearon los biocatalizadores seleccionados para la degradación de paraoxón y clorpirifós en un biorreactor del tipo lecho empacado con los que se alcanzó la degradación completa de dichos compuestos en 56 y 17 h respectivamente. Se caracterizaron los biocatalizadores determinado la posible existencia de problemas de transferencia de masa, como así también su reutilización. En cuanto al biorreactor, se determinó la distribución de los tiempos de residencia y tipo de flujo.En el capítulo 6, con la finalidad de hallar nuevas fuentes de fosfotriesterasas, se presenta el estudio de cuatro hongos, los que fueron capaces de degradar metil paraoxón llevando a cabo la reacción en growing. Además, se determinó que las enzimas responsables de dicha hidrólisis eran extracelulares, por lo que se obtuvieron los respectivos extractos enzimáticos, que se concentraron y finalmente liofilizaron, analizándose su actividad. Se optimizaron también las condiciones de reacción en cuanto a la cantidad de biocatalizador y pH del medio. Finalmente, en el capítulo 7, se describe la búsqueda de alternativas para mejorar los rendimientos obtenidos previamente en nuestro laboratorio en la reacción de transesterificación para la síntesis de 5´-dimetilfosfato de inosina usando como biocatalizador la fosfotriesterasa de Brevundimonas diminuta. Se exploró la actividad sintética de Streptomyces setonii (microorganismo wild type) y de los microorganismos fúngicos estudiados en el capítulo 6, utilizando las condiciones puestas a punto en la reacción de hidrólisis. Fil: Santillan, Julia Yamila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología. Área Química. Laboratorio de Biotransformaciones; Argentina
- Published
- 2019
39. INMUNOGENICIDAD DE UNA PROTEÍNA MULTI-EPITÓPICA COMO CANDIDATA PARA VACUNA CONTRA LA ENFERMEDAD DE CARRIÓN.
- Author
-
Rojas, Carlos Padilla, Pari, Priscila Lope, Mogollon, Cleidy Osorio, Angulo, Lisbet Inga, Solis, Lorena Santos, Calderon, Henri Bailon, Ñique, Adolfo Marcelo, Tarazona, Jackeline Morales, and Egusquiza, Gladis Ventura
- Abstract
Objetivo: evaluar la inmunogenicidad de un antígeno multiepitope candidato a vacuna contra la enfermedad de Carrión usando bioinformática. Métodos: estudio básico experimental. Mediante herramientas bioinformáticas se seleccionó segmentos de antígenos de membrana o epítopes del patógeno que interaccionen con MHC clase I y II. Así mismo, se evaluó el grado de toxicidad de los epítopos y su ubicación superficial en la estructura de los antígenos. Con los epítopes seleccionados se diseñó una proteína multi-epitópica, la cual fue sintetizada, clonada y expresada en E. coli BL21. La proteína recombinante fue purificada usando cromatografia de afinidad basada en la resina de Ni-NTA. Ratones BalB/C fueron inmunizados con la proteína multi-epítope y se evaluó los niveles de anticuerpos IgG mediante ELISA indirecto. Resultados: los epítopes seleccionados se unen con MHC clase I y II más prevalentes de la población peruana. Estos epítopes son conservados entre aislamientos de B. bacilliformis. Los epítopes seleccionados se encuentran en la superficie de las proteínas. La proteína multi-epitópica presenta una cobertura poblacional peruana teórica de 99,9%. Esta proteína ha sido clonada, expresada y purificada en E. coli BL21 en condiciones nativas. Asimismo, la proteína es inmunogénica debido a que induce títulos de anticuerpos en ratones inmunizados. Conclusiones: las herramientas bioinformáticas son útiles para el diseño racional de vacunas. La proteína multi-epitópica demostró ser inmunogénica, y puede ser la base de una futura vacuna contra la enfermedad de Carrión. Financiamiento: Este proyecto es financiado por INNOVATEPERU Convenio N° 306-INNOVATEPERU-PIAP-2015. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2017
40. FACTORES AMBIENTALES COMO DETERMINANTES EN EL AUMENTO DE CASOS DE DENGUE EN PIURA, CONTEXTO EL NIÑO COSTERO 2017.
- Author
-
Rivera, Bianca Layali Obregón, Minchán, Ana Paula López, Mendoza, María Paquita García, Zambrano, Manuel Céspedes, Luisa Sterponi, Luisa, Osambela, Julio Villafuerte, López, Pedro Riega, Merino, Nancy Susy, Ñique, Adolfo Marcelo, Romero, Dana Figueroa, Mamani, Marco Coaguila, Mauricci, Carlos Holguín, Tapia, Brenda Milagros Morales, and Sánchez, César Cabezas
- Abstract
Objetivo: identificar factores ambientales y sus patrones espacio-temporales asociados al incremento de casos de dengue en Piura en 2016 - 2017. Métodos: estudio descriptivo comparativo enmarcado en el método epidemiológico que busca la causalidad entre factores ambientales (temperatura máxima, precipitaciones e inundaciones) y el número de casos de dengue mediante la asociación estadística, en el periodo enero a setiembre del 2016 y 2017. El análisis espacial se llevó a cabo utilizando el Índice de Moran y el análisis temporal mediante el coeficiente de correlación de Spearman, ambos desarrollados en los softwares ArcGIS 10.4 y SPSS, respectivamente. Se utilizaron los datos registrados en el sistema informático NETLAB, cuyo diagnóstico fue realizado por el laboratorio de Metaxénicas Virales del INS; información de los registros históricos de estaciones meteorológicas del SENAMHI ubicadas en Piura, e imágenes satelitales de zonas de inundación del satélite Copernicus de la de la Unión Europea. Resultados: se identificó un incremento al 81% de casos con diagnóstico positivo a Dengue en el periodo enero-setiembre del 2017, la precipitación acumulada aumentó en un 370% y las temperaturas variaron mínimamente respecto al 2016. Las áreas de inundación en marzo-abril del 2017 se encuentran cerca de distritos de mayor reporte. Existe correlación alta directamente proporcional entre los casos positivos ocurridos 4 semanas posteriores a las precipitaciones y la precipitación acumulada pues los resultados del coeficiente de Spearman para el 2016(r2=0,453) y 2017 (r2=0,839) son mayores a 0 con más del 95% de confianza. La variable temperatura máxima mostró una correlación alta en el 2017(r2=0,789) mas no en 2016 (r2=0,298). Existe auto correlación espacial estadísticamente significativa en la distribución de casos de Dengue en 2016 (Índice de Moran: z=3,61 y p<0,01), caso contrario en el 2017 hay una distribución aleatoria (z=-0,16 y p=0,86) que evidencia la mayor propagación de Dengue. Conclusiones: el fenómeno del Niño Costero implicó un aumento de precipitación acumulada al 370% y un aumento de casos positivos al 81% en el periodo enero-setiembre del 2017. La precipitación presenta una asociación mayor a la de la temperatura, siendo la primera un determinante en la ocurrencia del incremento de casos. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2017
41. ANÁLISIS GEOESPACIAL DE LOS CASOS CONFIRMADOS DE ZIKA EN EL DEPARTAMENTO DE LIMA, 2017.
- Author
-
Chinarro, Mónica Pun, López, Pedro Riega, García Mendoza, María Paquita, Merino, Nancy Susy, Ñique, Adolfo Marcelo, Romero, Dana Figueroa, Mamani, Marco Coaguila, Cajahuanca, Gloria Yale, Lizama, Juan, Wagner, Wilder Eguiluz, Cuzcano, Jessica Guzmán, Rivera, Bianca Obregón, Cahuaya, Cristian Obregón, Peceros, Arnold Cabana, Gonzales, Sonia Gutiérrez, Sánchez, César Cabezas, and Ognio, Luis Suárez
- Abstract
Objetivo: describir el patrón de distribución geográfica de los casos mediante la georreferenciación domiciliaria. Métodos: se realizó un estudio descriptivo de la distribución espacial de los casos confirmados de Zika por georreferenciación utilizando el programa ArcMap 10.1; empleándose la metodología del análisis temporal de la distribución espacial de los casos. La confirmación de los casos se realizó por RT-PCR, Elisa IgM y Aislamiento viral por el Laboratorio de Referencia Nacional de Metaxénicas Virales del INS. Los datos fueron obtenidos de las fichas epidemiológicas ingresadas al sistema NETLAB del INS, el cual consigna la dirección de residencia actual del paciente. La información de calles, localización de asentamientos humanos y urbanizaciones del catastro de Lima Metropolitana fue obtenida de COFOPRI. Resultados: desde la semana epidemiológica N°1 hasta la N°41 se han confirmado un total de 97 casos positivos a virus de Zika en el departamento de Lima, 94 de los casos procedían del distrito de Comas y 3 del distrito de El Rímac. El 61% (59) fueron mujeres y 39% (38) son varones. Del número total de mujeres en edad fértil, 42 fueron positivas a Zika, el 92% (39) son mujeres no gestantes y el 7% (3) son mujeres gestantes. Se encontró una dispersión de los casos confirmados en las zonas correspondientes a los asentamientos humanos 9 de octubre, Cerro Peruano La Libertad, Cerro Sinai, Pasaje Nueva Esperanza y el pueblo joven Pampas de Comas, lo que permitió conocer la extensión geográfica del brote y orientar las medidas de control al área afectada. Conclusiones: la georreferenciación de los casos confirmados es una estrategia que permite identificar la extensión del área afectada por un brote y orienta a los servicios de salud pública sobre el área donde se debe intensificar las medidas de vigilancia y control. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2017
42. CLONAMIENTO PARA LA EXPRESIÓN UNA PROTEÍNA ADHESINA RECOMBINANTE DE BARTONELLA BACILLIFORMIS CANDIDATA A VACUNA CONTRA LA ENFERMEDAD DE CARRIÓN.
- Author
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Osorio Mogollón, Cleidy Mirela, Padilla Rojas, Carlos Patricio, Lope Pari, Priscila, Ventura Egusquiza, Gladys, Calderon, Henri Bailon, Ñique, Adolfo Marcelo, and Tarazona, Jackeline Morales
- Abstract
Objetivo: analizar una proteína adhesina candidata a vacuna que influye en la patogenicidad de Bartonella bacilliformis. Métodos: estudio es de tipo básico experimental. Se realizó la amplificación por PCR del gen que expresa a la proteína adhesina, de la cepa KC583 de Bartonella bacilliformis, producto que fue utilizado para insertarlo en el plásmido pET28a. Previo a la inserción, preparamos tanto al inserto como al plásmido con enzimas de restricción (NcoI y XhoI), y luego ligamos ambos con la enzima ADN Ligasa. El plásmido recombinante formado se transformó en la cepa TOP10 de Escherichia coli. Para la expresión de la proteína se usó una cepa de expresión BL21DE3 de Escherichia coli. Resultados: para comprobar la presencia del gen adhesina se amplificó mediante PCR del gen que expresa la proteína adhesina, el cual posee 2852 pb. Se obtuvo una correcta purificación del plásmido pET28a en una banda que corresponde a 5639 pb. Se obtuvieron bandas que evidencian la purificación y preparación del inserto y del plásmido. En placas de Agar LB Kanamicina se hicieron dos transformaciones (A y B) y se obtuvieron 285 colonias transformadas en A (plásmido con inserto) y 126 colonias transformadas en B (como control, sólo el plásmido), todas con las características típicas de la cepa TOP10. Para la última transformación se obtuvieron 143 colonias, todas con las características típicas de las células BL21DE3. Conclusiones: se logró obtener el plásmido recombinante el cual contiene el gen adhesina. Se logró la transformación exitosa del plásmido a una cepa de Escherichia coli. La colonia transformada está lista para la expresión de la proteína adhesina recombinante. Financiamiento: Este trabajo es financiado por INNOVATE PERÚ. CONVENIO N° 306-INNOVATEPERU-PIAP-2015. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2017
43. [DESIGN AND EVALUATION OF A MULTIEPITOPIC PROTEIN AS A CANDIDATE FOR A CARRION DISEASE VACCINE].
- Author
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Rojas CPP, Pari PNL, Solis LS, Mogollón CO, Angulo LI, Calderon HB, Ñique AM, Morales J, and Egusquiza GEV
- Subjects
- Animals, Computational Biology, Epitopes, Female, Mice, Inbred BALB C, Bacterial Proteins biosynthesis, Bacterial Vaccines biosynthesis, Bartonella Infections prevention & control, Drug Design
- Abstract
Objectives.: To design and assess a multiepitopic protein as a candidate for a vaccine against Carrion disease., Materials and Methods.: Using bioinformatics tools, epitopes of external membrane proteins were selected and a multiepitopic protein was designed. The multiepitopic protein gene was subcloned into the expression plasmid pET28b and transformed into E. coli BL21 pLys. The multiepitopic protein was expressed using isopropyl-β-D-1-thiogalactopyranoside and purified using resin. This purified protein was used to immunize BALB/c mice obtaining polyclonal antibodies. In vitro invasion assays were conducted using a strain of Bartonella bacilliformis (B. bacilliformis) in human red blood cells., Results.: The multiepitopic protein M1 presents preserved epitopes between isolates of B. bacilliformis with are non-toxic, and not homologous to human and surface proteins. Immunized mice presented IgG antibody levels capable of reducing in vitro the rate of invasion of B. bacilliformis into human red blood cells., Conclusions.: Multiepitopic protein M1 may serve as a candidate for a Carrion disease vaccine; however, more studies are needed to characterize the use of this antigen as a vaccine.
- Published
- 2019
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