Search

The dissemination of knowledge and encouraging inventors to substantiate the emergence of the intellectual property system. The protection of intellectual assets is not neutral in their effects on firms and countries: requirements and costs involved in the search and enforcement of protection have differential impacts across firms and countries, tend to enhance the asymmetry of innovativeness between developed countries. The advance of this debate is essential the establishment of a framework and appropriate stimulator for the development of innovation-based biotechnology in Brazil. The intellectual property on living beings and new biological processes is one of the most controversial aspects of the process of setting up international markets and the “modernization” of the economy. This is an extremely controversial issue in which there are many issues unresolved and subject to a heated debate involving conflicting interests in economic, political, social, cultural and technical, not to speak on moral and religious aspects, equally important. In this context, this work aims to make a conceptual analysis of terms used in biotechnology, making an interpretation of provisions in the law that governs the rights and obligations relating to industrial property. It is opposed to the law of protection of cultivars, establishing intellectual property protection sui generis, analyzing what are the main economic consequences that may result from mistaken interpretation of legislation.A difusão do conhecimento e o estímulo aos inventores fundamentaram o surgimento do sistema de propriedade intelectual. A proteção aos ativos intelectuais não é neutra em seus efeitos sobre empresas e países: exigências e custos envolvidos na busca e no enforcement da proteção têm impactos diferenciados entre empresas e países e tendem a reforçar a assimetria de capacidade de inovação entre países desenvolvidos. O avanço deste debate é essencial para o estabelecimento de um arcabouço adequado e estimulador para o desenvolvimento da inovação de base biotecnológica no Brasil. A propriedade intelectual sobre seres vivos e novos processos biológicos é um dos aspectos mais controvertidos do processo de constituição de mercados internacionais e da “modernização” da economia baseada em conhecimento. Trata-se de um tema extremamente polêmico, no qual muitas questões encontram-se sem solução e sujeitas a um acalorado debate envolvendo interesses conflitantes nos âmbitos econômico, político, social, cultural e técnico, para não falar em aspectos morais e religiosos, igualmente importantes. O presente trabalho tem por objetivo fazer uma análise conceitual aos termos empregados em biotecnologia, interpretando o disposto na legislação que regula os direitos e obrigações relativos à propriedade industrial. Estabelece-se contraponto com a legislação de proteção de cultivares, que institui a proteção da propriedade intelectual sui generis, analisando quais as principais consequências econômicas que podem advir de interpretação equivocada da legislação.

A biorremediação é um processo do qual se utilizam micro-organismos na remoção de contaminantes tóxicos do meio ambiente. Essa técnica é bastante promissora, pois visa à minimização dos impactos antrópicos e à reestruturação dos habitats naturais. Relativamente nova, essa tecnologia tem sido alvo de inúmeras pesquisas, pois oferece uma maior segurança, uma menor perturbação ao meio ambiente e também é uma ferramenta eficiente a custos baixos. A biorremediação possui grande aplicabilidade e a otimização do seu processo depende das condições ambientais, do tipo de contaminante e da técnica empregada. Os tratamentos se diferenciam por ser “in situ” (quando é realizado no próprio local) ou “ex situ” (quando há remoção do contaminante para tratamento em outro ambiente). A biorremediação é uma técnica inovadora que merece atenção e incentivo nos processos de recuperação ambiental. O objetivo dessa revisão é conhecer o processo de biorremediação, suas técnicas e aplicabilidades.

Objective: Performing a screening of Amazonian species as antimicrobial action of oral biofilm micro-organisms in vitro. Methods: Determining the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for solid medium diffusion and Minimum Inhibitory Concentration of Adherence (MICA). The strains tested were S. sobrinus (ATCC 27609), S. mutans (ATCC 25175), S. mitis (ATCC 9811); S. sanguis (ATCC10556), L. casei (ATCC 7469).Results: Juca, Crajiru, Alfavaca and Copaiba presented MIC with halos of inhibition for all strains tested, with values of 62.5, 500, 1000 and 1000 mg/mL, respectively. In MICA, extracts of Juca, Jambu and Crajiru inhibited the adherence in all strains tested. Conclusions: Extracts of Juca, Crajiru, Alfavaca and Copaiba essential oil had antimicrobial activity against the strains tested and extracts of Juca, Crajiru, Alfavaca, Jambu and Copaiba and Andiroba oils inhibited microbial adherence. Objetivo: Realizar um screening de espécies amazônicas quanto à ação antimicrobiana sobre micro-organismos formadores do biofilme dental in vitro. Metodologia: Através da determinação da Concentração Inibitória Mínima (CIM) por difusão em meio sólido e a Concentração Inibitória Mínima de Aderência (CIMA). As cepas ensaiadas foram S. sobrinus (ATCC 27609); S. mutans (ATCC 25175); S. mitis (ATCC 9811); S. sanguis (ATCC10556); L. casei (ATCC 7469). Resultados: Demonstraram que Jucá, Crajiru, Alfavaca e Copaíba apresentaram CIM com halos de inibição para todas as cepas ensaiadas, com valores de 62.5, 500, 1000 e 1000 mg/mL, respectivamente. Na CIMA, os extratos de Jucá, Jambu e Crajiru inibiram a aderência em todas as cepas ensaiadas.Conclusão: Os extratos de Jucá, Crajiru, Alfavaca e o óleo essencial de Copaíba tiveram atividade antimicrobiana sobre as cepas ensaiadas e os extratos de Jucá, Crajiru, Alfavaca, Jambu e os óleos de Copaíba e Andiroba inibiram a aderência microbiana.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O petróleo é a principal fonte de energia no Brasil, onde o consumo de óleo continua subindo desde 2013, atingindo atualmente 2.2% do total de energia consumida no mundo. A descoberta recente de petróleo nas baias do Espirito Santo, Campos e Santos, pode representar uma excelente oportunidade para atender as demandas energéticas nacionais. Entretanto, a exploração de petróleo oferece riscos a microbiota e toda a vida marinha. Microrganismos são responsáveis pela ciclagem de nutrientes, podem degradar compostos orgânicos recalcitrantes e muitas espécies são reportadas como sensíveis à contaminação por hidrocarbonetos do petróleo. Esse trabalho teve o objetivo de avaliar as alterações na comunidade microbiana em solos sob a contaminação por petróleo e avaliar os efeitos do Co-produto de biodiesel (BCP) como um agente protetor da microbiota do solo perante a adição de petróleo. Foram utilizados solos da Ilha da Trindade, e da estação de pesquisa Highfield no Rothamsted Research, UK. Foram montados microcosmos com 20 gramas de solo e os tratamentos utilizaram petróleo intemperizado. Os solos foram incubados a 26° C com correção da umidade para cerca de 60% da capacidade de retenção de água dos solos. Foi utilizada a medição de evolução de CO2 para avaliar a atividade do solo, durante o período de incubação, e a extração de DNA genômico do solo, ao final do período de incubação, para avaliar as mudanças nas comunidades microbianas dos tratamentos e controles. O DNA foi submetido para o sequenciamento de amplicons de 16S rDNA para a avaliação de Bacteria e Archaea e de amplicons da região ITS1 para a avaliação de Fungos utilizando a plataforma Illumina HiSeq. Foi feita a comparação das diversidades alpha e beta e análise das alterações taxonômicas. Essa tese está dividida em dois capítulos. O primeiro descreve os efeitos do petróleo nas comunidades microbianas do solo da Ilha da Trindade. No segundo capítulo foi testado o efeito protetor do BCP sobre a microbiota dos solos da Ilha da Trindade, do campo Bare Fallow e do campo Grassland do Rothamsted Research contra a adição de óleo. O petróleo teve um grande efeito negativo sobre a diversidade microbiana da Ilha da Trindade, mas não mudou a diversidade microbiana dos solos agrícolas do Rothamsted. A comparação taxonômica mostrou aumento do filo Actinobacteria, mudanças em várias classes de Proteobacteria e redução da classe Nitrosphaerales do filo Archaea. Esse é o primeiro esforço para aquisição de conhecimento sobre o efeito da contaminação de solos de uma ilha oceânica brasileira com petróleo. Essa informação é importante para guiar qualquer futura estratégia de biorremediação que se faça necessária. Crude oil is still the dominant energy source in Brazil where oil consumption keeps rising since 2013, reaching nowadays 2.2% of the world‟s energy consumption. A recent discovery of crude oil reservoirs at the Espirito Santo, Campos and Santos basins, can represent an excellent opportunity to meet the country‟s economic and energetic demands. However, offshore exploration offers risks to the microbiota and the whole sea life. Microbes are responsible for nutrient cycling can degrade recalcitrant organic compounds and several species have been reported as sensitive to petroleum hydrocarbons. This work aimed to evaluate microbial community shifts in soils under crude oil contamination and assess the effects of Biodiesel co-product (BCP) as a protecting agent of soil microbiota under crude oil addition. We used soils from the Trindade Island and from the Highfield research station at Rothamsted Research, UK. We assembled microcosms of 20 grams and contaminated the soils using weathered crude oil. Soils were incubated at 26° C with moisture correction to ca. 60% water holding capacity. We used CO2 evolution measurements to evaluate soil activity, during the incubation, and soil genomic DNA extraction, at the end of incubation period, to evaluate microbial community changes from treatments and controls. DNA was submitted to amplicon sequencing of 16S rDNA for Bacteria and Archaea and the ITS1 region for Fungi using Illumina MiSeq platform. We compared alpha and beta-diversity and taxonomic shifts. This thesis is divided in two chapters. The first describes the effects of crude oil on Trindade Island‟s soil microbial communities. In the second chapter we tested the protective effects of BCP on Trindade Island, Rothamsted‟s Bare Fallow and Grassland soils, against the amendment with crude oil. Crude oil had a major negative effect on microbial diversity for Trindade Island, but didn‟t change the diversity of Rothamsted agricultural soils. Taxonomy comparisons showed rise of the Actinobacteria phylum, shifts in several Proteobacteria classes and reduction of the Archaea class Nitrososphaerales. This is the first effort in acquiring knowledge concerning the effect of crude oil contamination in soils of a Brazilian oceanic island. This information is important to guide any future bioremediation strategy that can be required.

The objective of the current work was to evaluate the use of oral probiotics comprised of viable and inactivated Lactobacillus spp. (referred to herein as "pool" of Lactobacillus spp.) on the performance, intestinal microbiota and blood parameters of piglets from birth to 35 days of age. Lactation piglets (n=108), with an average initial weight of 1.41kg, and nursery piglets (n=72), with an average initial weight of 5.47kg, were included in the study and distributed in a randomized complete block design. The treatments were as follows: Control: 1mL MRS broth + 1mL sterile saline; Active: 1 mL probiotics ("pool" of Lactobacillus spp. and Lactobacillus plantarum) activated in MRS broth + 1 ml saline; Inactive: 1 mL inactivated probiotics containing MRS broth + 1mL saline. Treatments were not observed to affect total and daily weight gain of piglets during lactation. Differences were observed between treatments for feed intake, daily feed intake as well as total and daily weight gain from 21 to 35 days of age. Counts of lactic acid bacteria and coliforms were not affected by treatment or age. With the exception of globulin, blood parameters are also not affected. In the nursery phase the probiotic treatment with inactivated cells means a viable alternative for use primarily by the performance obtained for weight gain; however probiotics supplementation did not influence the microbiological counts and blood parameters. Objetivou-se com este trabalho avaliar o uso oral de probióticosLactobacillus spp viáveis e inativadas ("pool" deLactobacillus spp.), sobre o desempenho, a microbiota intestinal, e parâmetros sanguíneos de leitões do nascimento aos 35 dias de idade. Foram utilizados na fase de aleitamento 108 leitões com peso médio inicial de 1,41kg e, na creche, 72 leitões com peso médio inicial de 5,47kg, distribuídos em um delineamento experimental de blocos ao acaso. Os tratamentos foram: Controle: 1 mL de caldo MRS + 1 mL de solução salina estéril; Ativo: 1 mL de probiótico ("pool" de Lactobacillus spp. e Lactobacillus plantarum) ativados no caldo MRS + 1 mL de solução salina; Inativo: 1mL de probiótico contendo células inativadas no caldo MRS + 1 mL de solução salina. Os tratamentos não influenciaram o ganho de peso total e diário dos leitões no aleitamento. Dos 21 aos 35 dias de idade, observou-se diferença entre os tratamentos para consumo de ração, consumo de ração diário, ganho de peso total e diário. As contagens de bactérias ácido-láticas e coliformes não foram influenciadas pelos tratamentos e idades. Com exceção da globulina, os demais parâmetros sanguíneos analisados não são influenciados. Na fase de creche o tratamento probiótico com células inativadas significa uma alternativa viável para uso principalmente pelo desempenho obtido para ganho de peso; no entanto os tratamentos probióticos não influenciam as contagens microbiológicas e os parâmetros sanguíneos.

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-05-22. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:13Z : No. of bitstreams: 1 000849801_20170522.pdf: 175785 bytes, checksum: 9d44a0ca420f55c02bfd38b62024ab6b (MD5) Bitstreams deleted on 2017-05-26T12:43:55Z: 000849801_20170522.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-05-26T12:44:51Z : No. of bitstreams: 1 000849801.pdf: 146050357 bytes, checksum: b503de7f186b4ea8591a7b7267f9f315 (MD5) Senna spectabilis é uma planta medicinal detentora de inumeras aplicações terapêuticas tradicionais. Como uma fonte rica de metabólitos com atividades biológicas a rizosfera de S. spectabilis foi o objeto de estudo neste trabalho. O conhecimento da população da microbiota da rizosfera contribuiu para a compreensão das interações que poderiam ocorrer nessa região dinâmica e rica do solo. Um número de métodos moleculares têm sido desenvolvidos nos últimos anos para o estudo da comunidade microbiana utilizando PCR no sequenciamento das regiões de rRNA 16S e ITS. Os objetivos deste estudo foram identificar a população microbiana da rizosfera de mudas de S. spectabilis e em sequência selecionar algumas linhagens e submetê-las a cultivos mistos em meio sólido. A identificação foi conseguida através do 454-pyrosequenciamento das raízes e sequenciamento por iluminaseq das soluções nutritivas em que as plantas foram cultivadas. Os resultados mostraram uma população rica e variada de bactérias e fungos, com destaque aos filos Verrucomicrobia, Proteobacterias, Firmicutes para as bactérias e para os fungos os filos Basidiomycota e Ascomycota. Espécies selecionadas de fungos foram cultivados em meio Czapek-dox líquido e uma análise do perfil metabólico foi conduzido utilizando HPLC-DAD e HPLC-DAD/MS. Entre os metabólitos detectados nessa pré-avaliação estão os derivados policetidicos produzidos por Fusarium: zearalenonas, conhecidas micotoxinas produzidas por uma grande quantidade de espécies deste gênero. Estes resultados induziram a seleção de cinco fungos de Fusarium, Paecilomyces e uma espécie de bactéria, Burkholderia sp para o cultivo misto em meio de agar sólido. O objetivo foi detectar mudanças na produção metabólica e analisar as alterações esperadas por RMN de 1H associados aos métodos quimiométricos de análise PCA e PLS e tambem por LC/MS. Uma série de... Senna spectabilis is a medicinal plant with innumeral traditional therapeutic applications. As a source of rich metabolites with biological activities S. spectabilis' rhizosphere was the object of study in this work. The knowledge of the population of the microbiota of the rhizosphere contributes to the understanding of the interactions that may occur in this dynamic and rich region of the soil. A number of molecular methods have been developed in recent years to study the microbial community using PCR associated in the sequencing of 16S and ITS regions of rRNA. The objectives of this study were to identify the microbial population of rhizosphere seedlings of S. spectabilis and in sequence to select a few strains and submit them to co-cultures in a solid medium. Identification was achieved with 454- pyrosequencing of roots and iluminaseq sequencing of the hydroponic solutions, in which the seedlings were cultivated. Results showed a rich and varied population of bacteria and fungi notably the bacteria phyla Verrucromiobia, Proteobacteria, Firmicutes and for the fungi the phyla Basidiomycota and Ascomycota. Selected species of fungi were cultivated in liquid Czapek-dox medium and a screening of the metabolic profile was conducted using HPLC-DAD and HPLC-DAD/MS. Among the metabolites detected in this previous evaluation are the polyketides derivates produced by Fusarium: zearalenones known as mycotoxins produced by many species of this genus. These results have induced to the selection of five fungi from Fusarium, Paecilomyces and one specie of bacteria, Burkholderia sp for mix cultivation in agar solid medium. The aim was to detect changes in the metabolic production and analyse the expected alterations by 1H NMR associated with chemometric method PCA and PLS and LC/MS. A series of enniatin could be detected by LC/MS indicating that co-culturing induced the modifications in the...

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:30:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:34:11Z : No. of bitstreams: 1 000857377.pdf: 1866796 bytes, checksum: 83e072efd615d5585f2008373b9ff113 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) As coleções de culturas de micro-organismos apresentam importante contribuição para a preservação, manutenção e disponibilização de material microbiológico para uso acadêmico e em pesquisa. A Central de Recursos Microbianos da UNESP (CRM-UNESP) tem como missão dar suporte ao conhecimento da biodiversidade microbiana, bem como ao desenvolvimento científico e tecnológico, apoiando projetos de relevância. A CRM-UNESP possui um acervo associado de fungos filamentosos e leveduras de ambientes incomuns e/ou extremos. Neste contexto, o presente estudo tem como objetivo reorganizar o acervo de fungos marinhos da costa brasileira, marinhos e terrestres da Antártica e prospectar as enzimas xilanase e L-asparaginase. Para tanto, cerca de 696 fungos marinhos oriundos da costa brasileira e 185 fungos isolados de ambientes antárticos foram avaliados quanto à viabilidade e pureza, fotografados e preservados por dois métodos distintos: criopreservação e Castellani. Destes, 71% dos isolados foram considerados puros e viáveis e submetidos às triagens quantitavas e qualitativas para enzima xilanase e L-asparaginase. Na triagem qualitativa (meio sólido) 112 fungos produtores de xilanase foram isolados de ambiente marinho da costa brasileira e 19 de ambiente antártico. Estes foram submetidos à triagem quantitativa (meio liquído), na qual, o fungo LAMAI 31 identificado como Aspergillus tubingensis apresentou o melhor resultado de produção enzimática (49,41 U/mL). Para a enzima L-asparaginase além dos 622 isolados, 17 fungos filamentosos adicionais foram analisados na triagem qualitativa, totalizando 510 de origem marinha da costa brasileira e 129 de origem Antártica. Dentre estes, 407 fungos foram positivos para L-asparaginase em meio sólido e foram submetidos à triagem em meio liquido. A L-asparaginase foi produzida na faixa de 0,02 a 1,65 U/mL por 103 isolados. Delineamentos experimentais foram aplicados aos isolados que... Microbial culture collections have an important contribution to the preservation, maintenance, and availability of the microbial material for academic and research pourpose. The mission of the Central of Microbial Resources of the UNESP (CRM-UNESP) is to provide support for the knowledge of the microbial biodiversity, as well as for the scientific and technological development, supporting relevant projects. CRM-UNESP has an associated collection of filamentous fungi and yeast from uncommon and/or extreme environments. In this context, the present study aims to reorganize the marine-derived fungal collection from brasilian coast and the marine and terrestrial collection from Antarctica and to prospect the enzymes xylanase and L-asparaginase. For that end, about 696 marine fungi originating from brasilian coast and 185 isolated from antarctic environments had their viability and purity assessed and were photographed and preserved by two different methods: criopreservation and Castellani. Among them, 71% isolated were considered pure and viable and were submitted to the quantitative and qualitative screening for the production of xylanase and L-asparaginase. In the qualitative quantitative screening (solid medium) 112 filamentous fungi able to produce xilanases were isolated from marine environment (brasilian coast) and 19 from the antartic environment. These isolates were submitted to quantitative screening (liquid medium), in which, the fungus LAMAI 31 indentified as Aspergillus tubingensis presented the best result of enzymatic production (49.41 U/mL). For L-asparaginase besides the 622 isolates, 17 additional filamentous fungi were analysed, being 510 originated from the brasilian marine coast and 129 from Antarctica. Among them, 407 fungi were positive for L-asparaginase in solid medium and were submitted to the screening in liquid medium. L-asparaginase was produced in a range of 0.02 to 1.65 U/mL by 103 isolated. Experimental designs ...

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-09. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:30Z : No. of bitstreams: 1 000856515.pdf: 1748390 bytes, checksum: 16f3b487acd5253a70d9bf0a84f4fc36 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) As coleções de culturas são importantes pilares na preservação, catalogação e prospecção da biodiversidade microbiana. Com o propósito de atender ao depósito e fornecimento de material biológico de qualidade, a Central de Recursos Microbianos da UNESP (CRM-UNESP) iniciou sua adequação para alcançar os padrões internacionais de operação e gerenciamento; o que inclui a autenticação taxonômica das culturas mantidas na coleção. Utilizando um método de triagem molecular adaptado nesse estudo (microssatélites), aliado ao uso de marcadores morfológicos e moleculares, realizamos a identificação taxonômica de 189 isolados, de um total de 201 fungos filamentosos selecionados com base na diversidade de fontes de isolamento e mantidos no acervo de pesquisa da CRM-UNESP. Com o intuito de agregar informações sobre o potencial biotecnológico desses isolados, também avaliamos a produção de compostos antimicrobianos. Após a reativação e purificação dos isolados, foram identificados 66 gêneros e 116 espécies, sendo que os gêneros mais abundantes foram: Fusarium (18,9%), Clonostachys (11,4%), Trichoderma (7%) e Penicillium (6,5%). Todos os 201 isolados foram avaliados quanto à produção de metabólitos secundários com propriedade antibacteriana e antifúngica, segundo um método de alto desempenho (também adaptado neste estudo), frente a micro-organismos de interesse agrícola (Xanthomonas citri subsp. citri) e clínico (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Candida albicans, Candida krusei e Candida parapsilosis). Do total dos cultivos brutos avaliados, a maioria (62,7%) apresentou atividade antagonista frente, a pelo menos, um dos micro-organismos de referência. Os cultivos brutos dos fungos Penicillium aurantiogriseum LESF 194, Clonostachys rosea LESF 389, Penicillium dodgei LESF 487, Xylaria sp. 4 LESF 502 e de um isolado não identificado LESF 227 inibiram o crescimento de todos os micro-organismos de... Culture collections are keystones in the preservation, cataloging and exploration of microbial diversity. In order to meet international standards of deposit and supply of biological materials, the UNESP-Microbial Resources Center (CRM-UNESP) started their suitability for functioning and management to reach international standards; which include taxonomic authentication of cultures preserved in the collection. Using an adapted molecular screening protocol (microsatellites) coupled with morphological and molecular markers, we obtained the taxonomic identification of 189 out of 201 filamentous fungi from the CRM-UNESP research collection. In order to gather information on the biotechnological potential of these isolates, we also evaluated the production of antimicrobial compounds. After revival and purification of fungal isolates, we identified 66 genera and 116 species; comprehending the most abundant genera: Fusarium (18.9%), Clonostachys (11.4%), Trichoderma (7%) and Penicillium (6.5%). All isolates were evaluated for the production of secondary metabolites with antibacterial and antifungal properties, according to a high-throughput method (also adapted in this study), towards agricultural (Xanthomonas citri subsp. citri) and clinical-relevant (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Candida albicans, Candida krusei and Candida parapsilosis) reference strains. The majority of culture broths (62.7%) showed antagonist activity against at least one of the reference strains. Culture broths of Penicillium aurantiogriseum LESF 194, Clonostachys rosea LESF 389, Penicillium dodgei LESF 487, Xylaria sp. 4 LESF 502 and from the non-identified fungus LESF 227 inhibited the growth of all reference strains. Our results contributed for the establishment of two screening approaches in the routine of CRM-UNESP. These methods allowed the identification of the various fungal isolates examined as well as the evaluation of the antimicrobial potential of ...

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:30:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:34:12Z : No. of bitstreams: 1 000857416.pdf: 1591098 bytes, checksum: 6fd4a38ebaddd22010dc5357625b6055 (MD5) A microbiota bacteriana encontrada nos peixes vivos está diretamente relacionada à microbiota do ambiente, ou seja, os microrganismos presentes em sua superfície corporal, brânquias, trato gastrointestinal e musculatura estão relacionados aos mesmos do ambiente em que está inserido. Os peixes possuem naturalmente uma vasta gama de bactérias, que também podem ser comumente encontradas na água. Porém, as bactérias de origem fecal, como E.coli e Enterococos, não são habitantes comuns da flora intestinal dos peixes, sendo sua presença atrelada à contaminação por fezes humanas ou de outros animais de sangue quente na água de captura. Sendo assim, o monitoramento da qualidade microbiológica tanto da água, quanto dos organismos retirados dela para consumo humano, tornam-se necessários, já que podem causar prejuízo a saúde do homem, provocando problemas de saúde pública. O objetivo deste estudo foi avaliar a qualidade microbiológica do peixe (Eugerres brasilianus, Curvier 1830) e das águas do estuário do Rio Itanhaém, SP (Brasil). Três bactérias foram utilizadas para avaliar a qualidade microbiológica da água e dos peixes, duas de origem fecal humana, Escherichia coli e Enterococcus sp. e uma de origem não fecal, Staphylococcus aureus, todas obtidas pela técnica da membrana filtrante. Nos peixes foram avaliados suas brânquias e músculo. Os resultados obtidos mostraram que durante todo o período do estudo, as águas do rio Itanhaém apresentaram-se dentro dos limites estabelecidos pela legislação CONAMA 357/05, porém o uso de E.coli, demonstrou ser insuficiente para avaliar a qualidade da água, visto que a densidade de Enterococcus sp. foi alta durante todo o estudo em todos os pontos analisados. Na análise dos peixes, foram encontradas altas concentrações para as três bactérias utilizadas, com as brânquias se apresentando com maior número em relação ao músculo. De acordo com a legislação RDC 12/01,... The bacterial microbiota found in live fish is directly related to the microbiota of the environmente, in the words, the microorganisms present in their body surface, gills, gastrointestinal tract and muscle are related to the same environment in which it is inserted. Fish naturally have a wide range of bacteria, which may also be commonly found in the water. However, the bacteria of fecal origin, such as E.coli and Enterococci, are not common inhabitants of the intestinal flora of fish, being his presence linked to contamination by human feces or other warm-blooded animals in the water capture. Thus, the monitoring of the microbiological quality of the water and the fish caught for human consumption, it is necessary, since they can cause harm to human health, causing public health problems. The objective of this study was to evaluate the microbiological quality of fish (Eugerres brasilianus, Curvier 1830) and waters of the estuary of the River Itanhaém, SP (Brazil). Three bacteria were used to assess the microbiological quality of water and fish, two of human fecal origin, Escherichia coli and Enterococci, and a source not fecal, Staphylococcus aureus, all obtained by membrane filtration. The fish were evaluated for their gills and muscle. The results showed that during the entire period of the study, the waters of the river Itanhaém presented within the limits set by legislation CONAMA resolution 357/05, however the use of E.coli, proved to be insufficient to assess the quality of the water, since the density of Enterococci was high throughout the study in all points analyzed. The analysis of fish, were found high concentrations for the three bacteria used, with the gills presenting with greater number in relation to the muscle. According to the RDC 12/05, the fish were evaluated during the study were unfit for consumption. In the proximity of the ETE-Anchieta, located to the left boarder of the river, the bacteria S.aureus was more ...

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The production of a bioherbicida for the biological control of weeds requires the development of a series of steps ranging from the selection of a suitable microbial strain for the production of product having herbicidal action until final formulation. Thus, this study aimed to select microorganisms from biological resources of the Pampa biome with potential for producing phytotoxins. Systematic samplings were performed with infectious symptoms in rice-growing areas and natural pastures of the Pampa biome. The first stage of the research was to select isolates with pathogenic potential inhibition test plants seedlings (Cucumis sativus L. var wisconsin.). The fungus that showed the best inhibitory effect was the VP51, identified through the use of molecular biology techniques, classified as Diaporthe sp. For optimization studies by means of submerged fermentation, industrial waste corn steep liquor were used (AMM) and sorghum (MAS), compared to synthetic medium. The means of submerged fermentation industry (AMM) showed better growth of fungal biomass and effect on test plant germination. In submerged fermentation bioreactor STR type, the rotation effect is significant, and the best results were obtained in tests with less rotation. In the pre-germination tests plants dormant and hard seeds were recorded, with a satisfactory result as biocontrol potential germination. A produção de um bioherbicida para o controle biológico de plantas daninhas requer o desenvolvimento de uma série de etapas que vão desde a seleção de uma cepa microbiana apropriada para a produção do produto com ação herbicida até a sua formulação final. Nesse sentido, esse trabalho teve como objetivo selecionar micro-organismos a partir dos recursos biológicos do bioma Pampa com potencial na produção de fitotoxinas. Foram realizadas coletas sistemáticas de plantas com sintomas infecciosos em áreas de cultivo de arroz irrigado e pastagens naturais do bioma Pampa. A primeira etapa da pesquisa foi selecionar isolados fitopatogênicos com potencial de inibição de plântulas de plantas-teste (Cucumis sativus L. var wisconsin.). O fungo que apresentou o melhor efeito inibitório foi o VP51, identificado através do uso de técnicas de biologia molecular, classificado como Diaporthe sp. Para estudos de otimização do meio de fermentação submersa, foram utilizados resíduos industriais de água de maceração de milho (AMM) e de sorgo (MAS), comparando com o meio sintético. O meio de fermentação submersa em meio industrial (AMM) apresentou melhor crescimento de biomassa fúngica e efeito na germinação de plantas-teste. Na fermentação submersa em biorreator do tipo STR, o efeito da agitação foi significativo, sendo que os melhores resultados foram obtidos nos ensaios com menor agitação. Na germinação das plantas testes foram registradas sementes dormentes e duras, sendo um resultado satisfatório como potencial biocontrole da germinação.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-19. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:55Z : No. of bitstreams: 1 000856531_20180401.pdf: 178192 bytes, checksum: 5fe4091ff282788eb99786be5db51eb4 (MD5) Bitstreams deleted on 2018-04-02T12:47:07Z: 000856531_20180401.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-04-02T12:47:58Z : No. of bitstreams: 1 000856531.pdf: 1016357 bytes, checksum: 391d3a986bfc56d254337889ab8e974e (MD5) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) É sabido que grande parte da produção primária global ocorre nos oceanos, e que um problema fundamental é entender como os organismos usam este carbono e quais são os padrões das variações espaço-temporais do carbono e do fluxo de energia. Deste modo, o interesse no ciclo do carbono vem aumentando nos últimos anos devido ao aumento recente de problemas mundiais, tais como mudanças climáticas e antropização de zonas costeiras. A alça microbiana conduz energia e carbono por meio das bactérias, para os níveis tróficos superiores, além de promover a assimilação de elementos inorgânicos biologicamente importantes, como nitrogênio e fósforo, em matéria orgânica na coluna d'água, elementos estes que são de extrema importância biológica. O presente estudo teve por objetivo estudar a estrutura e o funcionamento da alça microbiana nos sedimentos da Baía do Araça, quantificar seus elementos, verificar as flutuações nas densidades e correlacionar com outros fatores analisados, tais como contaminantes metálicos, matéria orgânica e hidrocarbonetos. Foram coletadas amostras de sedimento em 37 pontos, divididos em duas regiões (entremarés e sublitoral), durante o período de um ano. As amostras foram analisadas quanto a granulometria, conteúdo de matéria orgânica, carbonos orgânicos totais, hidrocarbonetos, além da análise dos componentes microbiológicos. Foi observado que as maiores densidades de microrganismos foram observadas na região do sublitoral. Houve uma correlação negativa entre as densidades de bactérias heterotróficas e nano flagelados, podendo indicar bacterivoria. As variações de matéria orgânica ao longo do estudo afetaram diretamente as populações de bactérias heterotróficas It is known that great part of the global primary occurs in the oceans, and a problem is to understand how the organisms use this carbon, what are the patterns of the spatial-temporal variations of carbon and of the energy flow. Thus, the interest in the carbon cycle is increasig in recent years due to the increase of global problems, such as climate change and the increase of population in coastal areas. The microbial loop leads energy and carbon, by bacteria, to the other trophic levels, and it also promotes the assimilation of inorganic elements biologically relevants, such as nitrogen and phosphorus, in organic matter in the water column, which are extremely biologically importants. This study aims to analyze the structure and the functioning of the microbial loop, quantifying its elements, check the densities variations and correlate with other analyzed factors, such as metal contaminants, organic matter and hydrocarbons. Sediment samples were collected at 37 points, divided into two regions (intertidal and subcoastal), during the period of one year. The samples were processed for granulometric analyzis, organic matter, total organic carbons, hydrocarbons, and microbiological components. It was observed that the highest densities of microrganisms were at the subcoastal region. There was a negative correlation between the densities of heterotrophic bacteria and nanoflagellates, which may indicate bacterivory. Variations of organic matter throughout the study directly affected the heterotrophic bacteria populations

Made available in DSpace on 2019-10-29T15:23:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-02. Added 1 bitstream(s) on 2019-10-29T15:25:31Z : No. of bitstreams: 1 000897535.pdf: 4315198 bytes, checksum: 30c880a679d1e6427b5b7549cb7c6858 (MD5) Made available in DSpace on 2019-10-29T15:23:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-02. Added 1 bitstream(s) on 2019-10-29T15:25:31Z : No. of bitstreams: 1 000897535.pdf: 4315198 bytes, checksum: 30c880a679d1e6427b5b7549cb7c6858 (MD5) Made available in DSpace on 2019-10-29T15:23:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-02. Added 1 bitstream(s) on 2019-10-29T15:25:31Z : No. of bitstreams: 1 000897535.pdf: 4315198 bytes, checksum: 30c880a679d1e6427b5b7549cb7c6858 (MD5) A biomembrana de látex da seringueira (Hevea brasiliensis) tem sido utilizada como curativo para úlceras cutâneas e os estudos de sua utilização como sistema de liberação prolongada para carrear compostos bioativos capazes de acelerar e estimular o processo de cicatrização tecidual estão em ascendência. A cicatrização lenta caracteriza a cronicidade da lesão e se dá na ocorrência da ausência ou insuficiência do fechamento da ferida, excedendo o período fisiológico da cicatrização de 2 a 3 semanas. As razões para esta alteração são os distúrbios locais ou sistêmicos (DEALEY, 2008). O objetivo deste estudo foi avaliar a eficácia e segurança do tratamento das úlceras crônicas com a utilização da biomembrana de látex natural da seringueira Hevea brasiliensis incorporada com extrato de Stryphnodendron barbatimam Mart (barbatimão). Foram selecionados 45 pacientes com úlceras crônicas de diferentes etiologias com idade entre 35 e 90 anos, cadastrados no Sistema Único de Saúde (SUS) e em sua respectiva unidade de atendimento. Estes sujeitos foram divididos em três grupos de 15 indivíduos cada e foram tratados por um período mínimo de 30 dias que se iniciou em abril de 2014, sendo apresentados como: grupo teste G1- Biomembrana de látex natural incorporada com extrato de barbatimão, tendo ocorrido 1 exclusão; grupo controle G2- Biomembrana de látex natural, tendo ocorrido 7 exclusões; e grupo controle G3- extrato de barbatimão, tendo ocorrido 10 exclusões. Além dos curativos, foram realizadas coleta de amostras para semeadura em meios seletivos, demonstrando que mesmo com a presença de microrganismos não houve interferência na cicatrização. Os curativos realizados com biomembrana incorporada apresentaram melhores resultados na cicatrização, além de controle e até redução da colonização microrgânica ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) Latex biomembrane derived from the (Hevea brasiliensis) rubber tree has been used as dressing for cutaneous ulcers and studies on its utilization as an extended liberation system to carry bioactive compounds capable of accelerating and activating the process of tissue wound healing, are increasingly being undertaken. The slow healing features the chronicity of the wound and it occurs in the wound closure absence or failure, exceeding the physiological healing period of 2 to 3 weeks. The reasons for such change are local and systemic disorders. This study was carried out to assess the effectiveness and safety of chronic ulcer treatment by using the natural latex biomembrane derived from the Hevea brasiliensis rubber tree incorporated with the Stryphnodendron barbatimam Mart (barbatimão) extract. In the research 45 patients were selected, they were suffering from chronic ulcers of different etiologies, age between 35 and 90, registered in the National Health System (SUS) and under the care of their respective health care unit. Those subjects were divided into three groups comprising 15 patients each who were treated along a minimum period of 30 days which began in April 2014, and they were characterized as G1 test group- natural latex biomembrane combined with barbatimão extract, with 1 exclusion; G2- natural latex biomenbrane, with 7 exclusions; and G3- barbatimão extract, with 10 exclusions. Besides the dressings, sample collections were carried out for sowing in selective environments, showing that despite the presence of microorganisms there was no interference in wound healing. The dressings made from combined biomembrane yielded better results not only in wound healing, but also in controlling and reducing microorganism colonies, in comparison with the other control groups. The results found surely provide subsidies for future ... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:29:19Z : No. of bitstreams: 1 000851881.pdf: 1966900 bytes, checksum: f12318e1992f89b39d28775a2373ebce (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Comunidades microbianas desempenham papéis cruciais em todos ecosistemas da Terra, uma vez que metabolizam compostos essenciais. Essa característica torna importantes alvos de pesquisas em diversas áreas como médica, ambiental, alimentícia e biotecnológica. Entretanto, somente 1% de todas espécies de micro-organismos conhecidos podem ser cultivadas in vitro, dificultando o estudo de suas funções e de sua classificação taxonômica. Com o surgimento de novas tecnologias de sequenciamento, o genoma inteiro de micro-organismos de um habitat pode ser experimentalmente extraído, mas em pequenos fragmentos (¡1500 pb), tornando o processamento dos dados um grande desafio. As ferramentas de análise de metagenômica mais utilizadas classificam as sequências por homologia. Entretanto, o tempo computacional aumenta exponencialmente conforme o tamanho dos fragmentos diminuem. Isso mostra uma necessidade evidente de métodos alternativos que possam analisar dados de metagenômica de maneira rápida e precisa. Esse estudo propõe um novo método de identificação de sequências de bactérias que analisa esses dados. Os genomas de 2164 linhagens de bactérias foram obtidos pelo GenBank e fragmentados em grupos de teste e controle. Cada grupo foi aleatóriamente fragmentado em sequências de 64, 128, 256, 512, 1024, 2048 e 4096 pares de base. As medidas de organização de sequências aplicadas nos fragmentos foram: conteúdo GC, abundância de dinucleotídeos e entropias de dipletes, tripletes e tetrapletes. Foram calculados a média e o desvio padrão dos valores das sequências controle para cada espécie, gênero e família de bactéria. Foram feitas combinações de medidas para classificar as sequências em famílias, gêneros e espécies. A performance da metodologia foi determinada por medidas de sensibilidade, especificidade, precição e média harmônica para conjuntos de... Microbial communities play a crucial role in all ecosystems on Earth since they metabolize essential compounds. Given this relevant role they are investigated in Medicine, Biotechnology, Ecology, Food Sciences among other fields. However, only 1% of all known micro-organisms species can be cultivated in vitro. The unravelling of their functions and taxonomic classification demands the development of new approaches. With the advent of new sequencing strategies, the entire genome of microrganisms on a given habitat can be experimentally extracted, but the fragments obtained are small (

Submitted by Maicon Juliano Schmidt (maicons) on 2015-06-16T17:44:18Z No. of bitstreams: 1 Débora Gastaldello_.pdf: 698623 bytes, checksum: 52b02eaa2ca0593784940f8ac7a28ae5 (MD5) Made available in DSpace on 2015-06-16T17:44:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Débora Gastaldello_.pdf: 698623 bytes, checksum: 52b02eaa2ca0593784940f8ac7a28ae5 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 UNISINOS - Universidade do Vale do Rio dos Sinos Nos últimos anos, com a globalização do mercado, o consumidor passou a ter acesso a uma grande diversidade de produtos. Isso tem provocado uma mudança no perfil alimentar do consumidor, o qual busca no mercado produtos diferenciados. Em relação ao mercado cervejeiro, a produção da cerveja artesanal também vem crescendo, oportunizando a produção de diferentes tipos de cervejas para um público cada vez mais exigente. Pensando nesse mercado, este trabalho teve por objetivo avaliar a presença de micro-organismos em equipamentos utilizados no processo de produção da cerveja, bem como avaliar as microcervejarias nos requisitos de Boas Práticas. A pesquisa foi realizada em três microcervejarias, denominadas A, B e C, onde foram pesquisados quatro equipamentos que entram em contato com a cerveja direta ou indiretamente após a fervura do mosto cervejeiro. Foram identificados diferentes micro-organismos em duas microcervejarias, e o percentual de adequação dos requisitos legais referente às Boas Práticas de Fabricação foram respectivamente 77%, 93% e 91%. Os resultados mostram que a aplicação de Boas Práticas é essencial na garantia de um produto de qualidade, em especial, a sanitização dos equipamentos e utensílios. In recent years, the market globalization promoted wide access to new products to consumers. This has caused a shift in consumer food profile, who seeks to differentiated products. Craft beer production is also growing in quantity and variety, influenced by the new consumer increasingly demanding. Thinking in this market, this study aimed to evaluate the presence of microorganisms in equipment of the beer production process and evaluate the microbreweries in Good Manufacturing Practices. This work was conducted in three microbreweries, named A, B and C, analyzing four equipment that comes into contact directly or indirectly with beer after brewing the beer wort. The research identified different microorganisms in the two microbreweries, which showed percentage of adequacy of legal requirements relating to Good Manufacturing Practices respectively of 77%, 93% and 91%. The results show that the application of Good Practices of Manufactory is essential to quality insurance, especially the sanitization of equipment and utensils.

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2020-11-08T17:23:34Z No. of bitstreams: 1 Carlos Eduardo Bezerra dos Santos_PROFMAT.pdf: 2384470 bytes, checksum: f9efcb4e77190570bf17f823169be61f (MD5) Made available in DSpace on 2020-11-08T17:23:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carlos Eduardo Bezerra dos Santos_PROFMAT.pdf: 2384470 bytes, checksum: f9efcb4e77190570bf17f823169be61f (MD5) Previous issue date: 2015-01-10 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior This research was conducted in an attempt to motivate the study of exponential and logarithmic functions, showing that mathematics is present in several areas of knowledge, particularly biology. This paper analyzes the deterministic mathematical models that describe the population growth, focusing on populations of microorganisms. Are showed some utilities of microorganisms, in addition to its health hazards through a growth modeling of these in the human body, with adjustments to the mathematical models of Malthus, Verhults and Gompertz for microorganisms: Escherichia coli, Salmonella enteritidis and Giardia lamblia. Finally, activity suggestions are presented in the classroom, with a multidisciplinary approach and making use of the Crescimento Populacional software M3 Matemática Multimídia collection. Esta pesquisa foi realizada na intenção de motivar o estudo de funções exponenciais e logarítmicas, mostrando que a Matemática se faz presente em diversas áreas de conhecimento, em particular na Biologia. Este trabalho analisa os modelos matemáticos determinísticos que descrevem o crescimento populacional, focando populações de micro-organismos. São apresentadas algumas utilidades dos micro-organismos, os seus perigos à saúde e uma modelagem do seu crescimento no corpo humano, com adaptações dos modelos matemáticos de Malthus, Verhults e Gompertz para os micro-organismos: Escherichia coli, Salmonella enteritidis e Giardia lamblia. Por fim, são apresentadas sugestões de atividades em sala de aula, com uma visão multidisciplinar e fazendo uso do software Crescimento Populacional da coleção M3 Matemática Multimídia. A interdisciplinaridade aliada a novas tecnologias evidenciou que o estudante apresenta maior interesse em aprender um novo conteúdo quando percebe uma aplicação prática deste

O petróleo é um composto orgânico originado a partir de deposições fósseis. Como um dos principais componentes da matriz energética mundial, sua intensa exploração ocasiona acidentes ambientais como os derramamentos no solo que comprometem a biodiversidade e a saúde humana. Entre as estratégias desenvolvidas para a descontaminação de ambientes poluídos, a biorremediação destaca-se como uma alternativa viável e, dentro desta, a rizodegradação destaca-se por apresentar uma elevada concentração de micro-organismos associados à rizosfera de plantas fitorremediadoras. As Poaceae possuem grande potencial para a fitorremediação de solos contaminados com petróleo por intermédio de microorganismos rizosféricos que realizam a biodegradação do petróleo. Assim, o objetivo da presente pesquisa foi de selecionar bactérias com potencial de degradação de petróleo, a partir da rizosfera de Panicum aquaticum Poir., a qual demostrou tolerância ao crescer em solos contaminados com petróleo. Foram isoladas nove bactérias, sendo caracterizadas morfologicamente por meio da Coloração de Gram e identificadas molecularmente a nível genérico. As bactérias 3, 6 e 7 foram selecionadas por apresentarem diferentes tempos de crescimento e analisadas quanto ao potencial de degradação de petróleo por meio de testes de degradação, sendo mensurados parâmetros como: pH, temperatura, oxigênio dissolvido, condutividade elétrica, biomassa por gravimetria e densidade ótica, e cromatografia a gás (GC). Das nove bactérias isoladas, sete são Gram-positivas e duas são Gram-negativas apresentando diferentes morfologias. Cinco bactérias foram identificadas molecularmente, pertencendo aos gêneros Sporosarcina sp. (bactéria 2), Bacillus sp. (bactérias 3 e 6), Microbacterium sp. (bactéria 4) e Rhodococcus sp. (bactéria 7). Resultados obtidos nos testes de degradação e GC revelaram que as três bactérias são promissoras quanto à degradação de petróleo ao reduzirem a concentração dos compostos de petróleo, podendo ser utilizadas em processos de biorremediação. A presente dissertação está dividida em três capítulos. O primeiro capítulo consiste em uma revisão de literatura sobre os efeitos da contaminação de petróleo sobre o crescimento e desenvolvimento das plantas, o segundo capítulo é uma revisão de literatura sobre o potencial de uso da rizosfera na biorremediação de solos contaminados com petróleo e o terceiro refere-se ao artigo científico resultante da presente pesquisa. Petroleum is an organic compound originated from fossil deposits. As a major component of global energy, its intense exploitation causes environmental accidents such as spills on the ground that compromise biodiversity and human health. Among the strategies developed for the decontamination of polluted environments, bioremediation stands out as a viable alternative and, within this, the rizodegradation stands out by having a high concentration of micro-organisms in the rhizosphere of plants phytoremediator. The Poaceae have great potential for phytoremediation of soils contaminated with petroleum through rhizosphere microorganisms that carry out petroleum biodegradation. The objective of this research was to select bacteria with petroleum degradation potential, from the rhizosphere of Panicum aquaticum Poir., which demonstrated tolerance to grow with petroleum contaminated soil. Nine bacteria were isolated, characterized morphologically by Gram staining and molecularly identified to generic level. Bacteria 3, 6 and 7 were selected because they presented different periods of growth and were analyzed for petroleum degradation potential through degradation tests, measuring parameters such as pH, temperature, dissolved oxygen, conductivity, biomass gravimetrically and by optical density, and gas chromatography (GC). Of the nine bacterial isolates, five are Gram-positive and four are Gram-negative, presenting different morphologies. Five bacteria were identified molecularly belonging to the genera Sporosarcina sp. (bacteria 2), Bacillus sp. (bacterias 3 and 6), Microbacterium sp. (bacteria 4) and Rhodococcus sp. (bacteria 7). Results of degradation and GC tests revealed that the three bacteria are promising for petroleum degradation by reducing concentracion of the petroleum compounds and may be used in bioremediation processes. This dissertation is divided in three chapters. The first chapter consists of a literature review on the effects of petroleum pollution on the growth and development of plants, the second chapter is a literature review on the potential use of rhizosphere in bioremediation with petroleum contaminated soil and the third relates to the resulting scientific article of this research.

Para determinar la variedad y resistencia frente a antibacterianos, durante un periodo productivo en el cual no se utilizaron antibióticos, en dos piscícolas del departamento del Meta, se obtuvieron muestras de agua y sedimento de donde se aislaron bacterias pertenecientes al grupo de heterótrofas Gram negativas. Las muestras se sembraron en medios selectivos Agar TCBS, McConkey, Citófaga, Cetrimide y Plate Count Agar para hacer recuentos bacterianos con las Técnicas de Análisis Microbiológico de la ICMSF y el Standart Methods. Las colonias diferentes de cada medio se repicaron para identificación bioquímica con kit comercial BBL-cristal®, y para el estudio de resistencia a seis antibacterianos se empleó el procedimiento descrito por Kirby-Bauer. La multi-resistencia, se estimó con el índice resistencia múltiple a antibióticos (MAR), y el índice de abundancia relativa (IAR) se calculó de acuerdo con Latorre (2007). Se identificaron 19 cepas bacterianas, seis correspondieron a Klebsiella pneumoniae, cinco a Enterobacter sp y cloacae, y las demás a Pseudomonas fluorescens y aerouginosa, Chryseobacterium sp. y gleum, Sphingobacterium multivorum, Serratia marcescens y Tetrathiobacter mimigardefordensis. Todas las cepas aisladas fueron resistentes a Eritromicina y el mayor índice de multi- resistencia lo presentó Enterobacter cloacae con 1.00 y 0.8. El mayor IAR correspondió a enterobacterias (≥800ufc/g). El encontrar seis cepas de Klebsiella pneumonidae y cinco de Enterobacter spcondiferentes índices de resistencia en los dos ambientes analizados, indica la gran variabilidad de estas especies. La resistencia de todos los microorganismos a Eritromicina, y el alto IMR de Enterobacter, demuestran que el uso de antibióticos en acuicultura, sumado a la alta concentración de enterobacterias puede tener efectos ambientales adversos que podrían repercutir en la salud pública. Bacterial aerobic gram negative heterotrophic community was isolated from water and sediment to determine the variety and antibacterial resistance during a productive period in which no antibiotics were used in two fish farms of Meta country. Samples were plated on selective medium TCBS Agar, McConkey, Citófaga, Cetrimide and Plate Count Agar toperform bacterial counts with the Technical Analysis of Microbiological ICMSF and the Standard Methods. The different colonies were replicated to each medium biochemical identification BBL-Cristal® commercial kit, and for the study of the six antibacterial resistance was used the procedure described by Kirby -Bauer. The multi - resistance was estimated by the multiple antibiotic resistance index (MAR) and the relative abundance index (RAI) was calculated according to Latorre (2007).19 bacterial strains were identified, six were for Klebsiella pneumoniaeand five Enterobacter sp cloacae, and others: aerouginosa Pseudomonas and fluorescens, Chryseobacterium sp. and gleum, Sphingobacterium multivorum, Serratia marcescens and Tetrathiobacter mimigardefordensis. All isolates were resistant to erythromycin and the highest rate of multi- resistant Enterobacter cloacae presented him with 1.00 and 0.8. The biggestRAI accounted enterobacteria (≥800 cfu/g). Finding six strains of Klebsiella pneumonidae five Enterobacter sp with different resistance rates in both environments analyzed, indicates the great variability of these species. The resistance of all microorganisms to erythromycin, and high MAR Enterobacter show that the use of antibiotics in aquaculture coupled with the high concentration of enterobacter may have adverse environmental impacts that could affect public health. A comunidade bacteriana heterótrofa aeróbica gram negativa, foi isolada de água e sedimento para determinar a variedade resistência a antibacteriano se em duas granjas piscícolas do estado do Meta, durante um período produtivo no qual não foram utilizados antibióticos. As amostras de água e sedimento foram sermeadas em meios seletivos de Agar TCBS, McConkey, Citófaga, Cetrimide e Plate Count Agar para fazer as contagens bacterianas com as Técnicas de Análises Microbiológico da ICMSF e o Standard Methods. As colônias diferentes de cada meio foram replicadas para identificação bioquímica com kit comercial BBL-cristal®, e para o estudo da resistência os seis antibacterianos foi empregado o procedimento descrito por Kirby-Bauer. A multirresistência, foi estimada pelo Índice resistência múltipla a antibióticos (IMAR) e o Índice de abundância relativa (IAR), foi calculado de acordo com Latorre (2007). Foram identificadas 19 cepas bacterianas, seis corresponderam a Klebsiella pneumoniae, cinco a Enterobacter sp y cloacae, e as demais a Pseudomonasfluorescens e aerouginosa, Chryseobacterium sp. e gleum, Sphingobacterium multivorum, Serratia marcescens e Tetrathiobacter mimigardefordensis. Todas as cepas isoladas foram resistentes a Eritromicina e o maior índice de multirresistência apresentou Enterobacter cloacae com 1.00 e 0.8. O maior IAR correspondeu às enterobacterias (≥800 ufc/g). As seis cepas de Klebsiella pneumonidae e cinco de Enterobacter sp comdiferentes índices de resistência encontrada em todos os ambientes analisados, indica a grande variabilidade destas espécies. A resistência de todos os micro-organismos a Eritromicina, e o alto IMR de Enterobacter demostram que o uso de antibióticos na aquicultura aliado a alta concentração de enterobacterias pode ter efeitos ambientais adversos e repercutir na saúde pública.

Made available in DSpace on 2015-08-26T19:21:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-01. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-31T13:04:28Z : No. of bitstreams: 1 S0102-09352014000601703.pdf: 201650 bytes, checksum: 345a359b14f5dab51efd3ab8daed7979 (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) O objetivo do presente estudo foi avaliar a contagem de células somáticas, aprevalência e a etiologia da mastite bubalina nas estações seca e chuvosa em umrebanho de bubalinos do município de Analândia, estado de São Paulo, Brasil.Adicionalmente, verificou-se o perfil de sensibilidade antimicrobiana domicro-organismos isolados nas amostras de leite das búfalas. Foram avaliadas 1.042amostras de leite de búfalas da raça Murrah pertencentes a uma propriedade rurallocalizada no município de Analândia-SP, obtidas no período de maio de 2011 enovembro de 2012. Após o exame físico da glândula mamária, foram realizados o testeda caneca de fundo escuro e o California Mastits Test (CMT); em seguida, foramcolhidas, de forma asséptica, amostras de 50mL de leite de cada quarto mamário, paraa contagem de células somáticas (CCS) em aparelho automático e exame microbiológico.Também, foi avaliado o perfil de sensibilidade antimicrobiana a ampicilina,cefoperazona, ceftiofur, enrofloxacina, gentamicina, neomicina, oxacilina, penicilinae sulfametoxazol/trimetoprim, pelo método de difusão em disco. A temperatura média eo índice pluviométrico mensais foram obtidos no Centro Integrado de InformaçõeAgrometeorológicas (CIIAGRO) do Instituto Agronômico de Campinas (IAC). Notou-se queas amostras de leite com resultado positivo no exame microbiológico apresentaram CCSmédia de 137.720 células/mL, no período seco, e 190.309 células/mL, no períodochuvoso. Embora tenha se constatado maior índice de isolamentos de micro-organismonas amostras de leite obtidas no período chuvoso (69/600) do que no período seco(50/442), a frequência de isolamentos não foi influenciada significativamente pelaestação do ano. Os principais gêneros de micro-organismos isolados durante o períodoseco foram Staphylococcus coagulase negativa (38,4%), Streptococcu agalactiae (28,8%) e Bacillus spp. (7,56%), e no períodochuvoso Corynebacterium sp. (23,5%), Streptococcuspp. (32,3%) e Streptococcus agalactiae (9,24%). Verificou-seresistência a três ou mais antimicrobianos em 30,1% dos micro-organismoisolados. The aim of this study was to evaluate somatic cell count (SCC), prevalence andetiology of mastitis in a dairy buffalo herd from Analândia, São Paulo State, Brazil,in the dry and rainy seasons. Additionally, antimicrobial susceptibility profile ofmicroorganisms isolated from milk samples was also evaluated. 1,042 milk samples fromfemale Murrah buffaloes in a dairy farm located in Analândia, São Paulo State,Brazil, collected between May 2011 and November 2012 were analyzed. After the mammarygland physical examination, strip cup test and California Mastitis Test (CMT) wereperformed. Afterwards, 50mL of milk samples from each mammary quarter were collectedaseptically for SCC in automatic equipment and microbiological examination. Theantimicrobial sensitivity profile to ampicillin, cefoperazone, ceftiofur,enrofloxacin, gentamicin, neomycin, oxacillin, penicillin, andsulfamethoxazole/trimethoprim was evaluated by disk diffusion method. The monthlyaverage temperature and pluviometric index were obtained from Centro Integrado deInformações Agrometeorológicas (CIIAGRO) of Instituto Agronômico de Campina(IAC). Milk samples with positive results in the microbiological test showed averageSCC of 137,720 cells/mL in the dry period and 190,309 cells/mL in the rainy period.Although a higher number of isolated microorganisms was observed in buffalo milksamples during the rainy period (69/600) compared to the dry period (50/442), theseason had no significant effect on the frequency of isolation of microorganisms. Themain genera of microorganisms isolated were coagulase-negative Staphylococcus (38.4%), Streptococcus agalactiae(28.8%), and Bacillus spp. (7.56%) during the dry season and Corynebacterium sp. (23.5%), Streptococcus spp.(32.3%), and Streptococcus agalactiae (9.24%) during the rainyperiod. Multidrug resistance was observed in 30.1% of the isolatedmicroorganisms. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Unesp Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Unesp FAPESP: 2011/03514-0 FAPESP: 2011/19480-7

The aim of this study was to evaluate somatic cell count (SCC), prevalence and etiology of mastitis in a dairy buffalo herd from Analândia, São Paulo State, Brazil, in the dry and rainy seasons. Additionally, antimicrobial susceptibility profile of microorganisms isolated from milk samples was also evaluated. 1,042 milk samples from female Murrah buffaloes in a dairy farm located in Analândia, São Paulo State, Brazil, collected between May 2011 and November 2012 were analyzed. After the mammary gland physical examination, strip cup test and California Mastitis Test (CMT) were performed. Afterwards, 50mL of milk samples from each mammary quarter were collected aseptically for SCC in automatic equipment and microbiological examination. The antimicrobial sensitivity profile to ampicillin, cefoperazone, ceftiofur, enrofloxacin, gentamicin, neomycin, oxacillin, penicillin, and sulfamethoxazole/trimethoprim was evaluated by disk diffusion method. The monthly average temperature and pluviometric index were obtained from "Centro Integrado de Informações Agrometeorológicas" (CIIAGRO) of "Instituto Agronômico de Campinas" (IAC). Milk samples with positive results in the microbiological test showed average SCC of 137,720 cells/mL in the dry period and 190,309 cells/mL in the rainy period. Although a higher number of isolated microorganisms was observed in buffalo milk samples during the rainy period (69/600) compared to the dry period (50/442), the season had no significant effect on the frequency of isolation of microorganisms. The main genera of microorganisms isolated were coagulase-negative Staphylococcus (38.4%), Streptococcus agalactiae(28.8%), and Bacillus spp. (7.56%) during the dry season and Corynebacterium sp. (23.5%), Streptococcus spp. (32.3%), and Streptococcus agalactiae (9.24%) during the rainy period. Multidrug resistance was observed in 30.1% of the isolated microorganisms. O objetivo do presente estudo foi avaliar a contagem de células somáticas, a prevalência e a etiologia da mastite bubalina nas estações seca e chuvosa em um rebanho de bubalinos do município de Analândia, estado de São Paulo, Brasil. Adicionalmente, verificou-se o perfil de sensibilidade antimicrobiana dos micro-organismos isolados nas amostras de leite das búfalas. Foram avaliadas 1.042 amostras de leite de búfalas da raça Murrah pertencentes a uma propriedade rural localizada no município de Analândia-SP, obtidas no período de maio de 2011 e novembro de 2012. Após o exame físico da glândula mamária, foram realizados o teste da caneca de fundo escuro e o California Mastits Test (CMT); em seguida, foram colhidas, de forma asséptica, amostras de 50mL de leite de cada quarto mamário, para a contagem de células somáticas (CCS) em aparelho automático e exame microbiológico. Também, foi avaliado o perfil de sensibilidade antimicrobiana a ampicilina, cefoperazona, ceftiofur, enrofloxacina, gentamicina, neomicina, oxacilina, penicilina e sulfametoxazol/trimetoprim, pelo método de difusão em disco. A temperatura média e o índice pluviométrico mensais foram obtidos no Centro Integrado de Informações Agrometeorológicas (CIIAGRO) do Instituto Agronômico de Campinas (IAC). Notou-se que as amostras de leite com resultado positivo no exame microbiológico apresentaram CCS média de 137.720 células/mL, no período seco, e 190.309 células/mL, no período chuvoso. Embora tenha se constatado maior índice de isolamentos de micro-organismos nas amostras de leite obtidas no período chuvoso (69/600) do que no período seco (50/442), a frequência de isolamentos não foi influenciada significativamente pela estação do ano. Os principais gêneros de micro-organismos isolados durante o período seco foram Staphylococcus coagulase negativa (38,4%), Streptococcus agalactiae (28,8%) e Bacillus spp. (7,56%), e no período chuvoso Corynebacterium sp. (23,5%), Streptococcusspp. (32,3%) e Streptococcus agalactiae (9,24%). Verificou-se resistência a três ou mais antimicrobianos em 30,1% dos micro-organismos isolados.

Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária As mastites bovinas constituem uma das doenças mais frequentes e com maior impacto económico nas explorações leiteiras. O presente trabalho procurou descrever a relação entre a contagem de células somáticas (CCS) e a incidência de mastites clínicas, e foi realizado numa exploração de bovinos leiteiros da região do Ribatejo, com cerca de 400 vacas em lactação da raça Holstein Friesian. A exploração foi caracterizada para um conjunto de fatores que podem influenciar a dinâmica de infeções intramamárias: animal, ambiente e/ou maneio, nutrição, ordenha e micro-organismos. A contagem de células somáticas de leite de tanque anual do efetivo aumentou de 2007 para 2008. Com base no limiar das 200 000 células somáticas/ml de leite de vacas individuais determinou-se a percentagem de animais infetados e não infetados; com infeções crónicas, com infeções recentes, com auto-cura de infeções recentes e sem infeção; e a eficácia da terapêutica de secagem. De uma forma geral, tendo em conta estes parâmetros, constatou-se que a situação do efetivo piorou de 2007 para 2008. Em termos de mastites clínicas, as taxas de mastites e de recorrência foram mais elevadas em 2008 do que em 2007. As incidências médias de mastites clínicas por mês foram iguais em 2007 e em 2008. A incidência de mastites clínicas (IMC) por lactação, tanto em 2007 como em 2008, aumentou com o aumento do número de lactações, à exceção da transição da 3.ª para 4.ª lactação. Em 2008, a IMC por períodos de lactação de 60 dias, foi mais elevada nos primeiros 60 dias pós-parto, e, posteriormente foi diminuindo com o decorrer da lactação. Os micro-organismos mais frequentemente isolados, tanto de casos de mastite clínica como de mastite subclínica, foram Streptococcus uberis e Staphylococcus coagulase negativos. De casos de mastite clínica de grau II isolaram-se sobretudo bactérias de Gram positivo, enquanto nas de grau III foram, predominantemente, bactérias de Gram negativo. Relativamente ao estudo caso-controlo: relação entre a CCS de casos (animais diagnosticados com mastite clínica) e controlos (animais sem sinais visíveis de mastite clínica), verificou-se que a média de CCS dos casos foi mais elevada do que a dos controlos. No entanto, as diferenças registadas apenas foram estatisticamente significativas para a última e penúltima CCS antes do diagnóstico de mastite clínica. ABSTRACT - UNDERSTANDING BOVINE MASTITIS: RELATIONSHIP BETWEEN SOMATIC CELL COUNTS AND CLINICAL MASTITIS INCIDENCE - Bovine mastitis remains one of the most frequent diseases and with the greatest economic impact in commercial dairy farms. The present work describes the relationship between somatic cell count (SCC) and clinical mastitis incidence, and was conducted in a dairy herd in the Ribatejo region, with around 400 lactating Holstein Friesian cows. The farm was characterized for a group of factors that can influence the dynamics of intramammary infections: animal, environment and/or management, nutrition, milking and microorganisms. The annual bulk milk somatic cell count of the herd increased from 2007 to 2008. Based on the threshold of 200,000 cells/ml we determined the proportion of animals that were infected and not infected; with chronic infections, recent infections self-cure of recent infections and without infections; and the efficacy of dry cow therapy. In general, these parameters showed that the situation of the herd worsened from 2007 to 2008. Regarding clinical mastitis, the rate of mastitis and the recurrence rate were higher in 2008 than in 2007. The mean incidences of clinical mastitis per month were the same in 2007 and 2008. In 2007 and 2008, the clinical mastitis incidence (CMI) per lactation number, increased with increasing number of lactation, except in the transition from 3rd to 4th lactation. In 2008, CMI per lactation period of 60 days was higher during the first 60 days post-partum, and subsequently decreased over the course of lactation. The most frequently isolated microrganisms, both from clinical and subclinical mastitis cases were Streptococcus uberis and coagulase-negative Staphylococcus. Gram-positive bacteria were isolated mainly from grade II clinical mastitis cases, while Gram-negative bacteria were predominantly isolated from grade III clinical mastitis cases. For the case-control study: relationship between SCC of cases (animals diagnosed with clinical mastitis) and controls (animals without visible signs of clinical mastitis), we found that the average SCC of the cases was higher than that of controls; the difference observed was statistically significant for the last and penultimate SCC before the diagnosis of clinical mastitis.

The objective of this study was to assess if larvae of Phylloicus spp. show any preference for leaves with or without microorganisms when building cases. Two experiments were realized at municipality of Presidente Figueiredo (Amazonas – Brazil), containing leaves treated with Hydrogen peroxide (H2O2), a compost that has an antimicrobial action, and another one with untreated leaves. In the first were observed the case-building by larvae of Phylloicus spp. And in the second was tested the preference by treated or untreated leaves. The larvae were monitored during 24 hours and to statistical analysis was used the t-test. Were not observed significant differences in the number of discs used by the larvae in the first experiment (p=0.24; t=-0.73) and no preference by type of leaf in the second experiment (p=0.41; t=0.23). Therefore, we do not recommend the use of hydrogen peroxide in studies that aim to eliminate microorganisms from decomposing leaves. Uso de Folhas Tratadas com Peróxido de Hidrogênio na Construção de Abrigos por Phylloicus spp. (Trichoptera: Calamoceratidae) Resumo. O objetivo deste estudo foi avaliar se larvas de Phylloicus spp. possuem preferência por folhas com ou sem micro-organismos para a construção de abrigos. Dois experimentos foram realizados no município de Presidente Figueiredo (Amazonas – Brasil), contendo folhas tratadas com peróxido de hidrogênio (H2O2), composto que possui ação antimicrobiana, e folhas não tratadas. No primeiro observaram-se a construção de abrigos pelas larvas de Phylloicus spp. e no segundo testou-se a preferência por folhas tratadas ou não tratadas. As larvas foram monitoradas durante 24 horas e para a análise estatística foi utilizado o teste-t. Não foram observadas diferenças significativas no número de discos usados pelas larvas no primeiro experimento (p=0,24; t=-0,73) e nem na preferência pelo tipo de folha no segundo experimento (p=0,41; t=0,23). Portanto, não recomendamos o uso do peróxido de hidrogênio em estudos realizados em laboratório que visem à eliminação de micro-organismos de folhas em decomposição.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico The mechanization makes agricultural work less strenuous, more homogeneous farming and increases crop productivity. The system of mechanized tillage directly influence the physical and biological soil properties, in addition to providing appropriate environment for establishment of cultures. Some studies have reported the microbial activity in the soil of the same quality. Microbial activity can be measured by the microbial biomass carbon, soil basal respiration, metabolic quotient and microbial quotient, among others. Tillage can affect the microbial activity because the levels of soil organic carbon can be changed as well as the density, temperature and soil moisture. Several studies using microbiological analyzes for determination of disturbances in agricultural and forestry crops, but the quantification of the interference of tillage, in an isolated form in soil microbial activity is rarely studied. Knowing how much and how tillage impacts on soil microbiota, one can analyze the effects of this process, and seek to mitigate noxious factors, seeking managements best suited to each type of soil and crop systems to be implemented. Thus objective with this study was to evaluate how different systems of mechanized tillage can affect their microbiological activity, evaluating the total organic carbon, microbial biomass carbon, basal soil respiration, metabolic quotient and the quotient soil microbial. The experiment was conducted in an experimental area belongs to the Federal University of Viçosa, was used as treatments for the following types of tillage: No tillage (PD) and conventional tillage (PC) and minimum tillage (CM). The treatments were arranged in a randomized block. The experiment was disposed in a split plot sub subdivided, where the parcels types of tillage systems, subplots depths and in the sub split plots sampling periods in randomized block design with 4 replications causualizados. Data were analyzed by analysis of variance and means were compared using the Tukey test, adopting the 5% level of probability. All analyzes were performed with the aid of SAEG. Microbiological analyzes were conducted at the Laboratory of Organic Matter in Soil, Federal University of Viçosa department. The collections were made in triplicate in two depths, the bands from 0 to 0,10 m from 0,10 to 0,20 m depth. We determined the total organic carbon (COT), microbial biomass carbon (CBM), basal soil respiration (RBS), metabolic quotient (qCO2) and microbial quotient (qMic). The no tillage showed higher levels of microbial biomass carbon and soil basal respiration, in the range 0 0,10 m depth. The values of metabolic quotient were higher in minimum tillage system. The no till was the system that had higher microbial activity in the soil. A mecanização torna o trabalho agrícola menos árduo, a lavoura mais homogênea e aumenta a produtividade das culturas. O sistema de preparo mecanizado do solo influencia diretamente as propriedades físicas e biológicas do solo, além de propiciar ambiente adequado para estabelecimento das culturas. Alguns estudos relacionam à atividade microbiológica do solo a qualidade do mesmo. A atividade microbiológica pode ser mensurada através do carbono da biomassa microbiano, respiração basal do solo, quociente metabólico e quociente microbiano. O preparo do solo pode interferir na atividade microbiológica, pois os teores de carbono orgânico do solo podem ser alterados assim como a densidade do solo, a temperatura e a umidade do solo. Vários estudos utilizam as análises microbiológicas para determinações de perturbações em culturas agrícolas e florestais, mas a quantificação da interferência do preparo do solo, de forma isolada na atividade microbiana do solo é pouco estudada. Conhecendo-se quanto e como o preparo do solo impacta a microbiota do solo, pode-se analisar os efeitos deste processo, e procurar mitigar fatores nocivos, buscando sistemas de manejos mais adequados a cada tipo de solo e da cultura a ser implementada. Dessa forma objetivou-se com o presente trabalho avaliar como os diferentes sistemas de preparo mecanizado do solo podem afetar a sua atividade microbiológica, avaliando o carbono orgânico total, o carbono da biomassa microbiana, a respiração basal do solo, o quociente metabólico e o quociente microbiano do solo. O experimento foi realizado numa área experimental pertencente à Universidade Federal de Viçosa. Utilizaram-se como tratamentos os seguintes tipos de preparo do solo: plantio direto (PD), Plantio convencional (PC) e cultivo mínimo (CM). O experimento foi disposto em um esquema de parcelas sub subdivididas, tendo nas parcelas os tipos de preparos do solo, nas subparcelas as profundidades e nas sub subparcelas as épocas de amostragem, no delineamento de blocos causualizados com 4 repetições. Os dados foram analisados empregando-se a analise de variância e as médias comparadas utilizando-se o teste Tukey adotando o nível de 5% de probabilidade. Todas as análises foram realizadas com o auxilio do SAEG. As análises microbiológicas foram realizadas no Laboratório de Matéria Orgânica, do departamento de solos da Universidade Federal de Viçosa. As coletas foram realizadas em triplicata, em duas profundidades, nas faixas de 0,0 a 0,10 m e de 0,10 a 0,20 m de profundidade. Foram determinadas o Carbono orgânico total (COT), Carbono da biomassa microbiana (CBM), Respiração basal do solo (RBS), quociente metabólico (qCO2) e quociente microbiano (qMic). O plantio direto apresentou maiores índices de carbono da biomassa microbiana e respiração basal do solo, na faixa de 0,0 - 0,10 m de profundidade. Os valores do quociente metabólico foram maiores no sistema de cultivo mínimo. O plantio direto foi o sistema que apresentou maior atividade microbiológica do solo.

This study aimed to evaluate the effect of combination of chemical treatments and solarization on cleaning and chemical and physical composition of sewage sludge a waste from sewage treatment system from an upflow anaerobic sludge blanket reactor and UASB (Upflow Anaerobic Sludge Blanket Reactor) of Treatment Plant - ETE Uberabinha located in Uberlândia-MG. It is known that the presence of pathogenic organisms and heavy metals are major limiting the use of this sludge in agriculture. For this, we used the split plots in time, in an experimental design of randomized blocks 5x3 + 1, with four replicates, in four (4) evaluation periods (0, 7, 14 and 21), and the zero time (0) corresponded to additional treatment, totaling 64 plots. The treatments consisted of pure sludge, sludge more peracetic acid (260 mg L-1), homogenized with hydrated lime sludge (CaOH2) in the proportion of 30% of the dry mass of sludge, sludge with sodium hypochlorite (2500 mg L-1) and more quaternary ammonium sludge (2400 mg L-1). Treatment with hydrated lime reduced levels of total and thermotolerant at 7 days after mixing with the sludge, meeting the requirements specified in environmental legislation for agricultural use coliforms. A solar radiation alone did not reduce the concentration of fecal coliforms to acceptable limits by environmental standard. Evaluated treatments did not cause temperature differences in the mass of sewage sludge limed sludge showed the highest levels of calcium (302 g kg-1), magnesium (4.2 g kg-1) and total solids, lower levels of Zn, Cu, Cd, Cr, Ni, volatile solids and moisture after mixing with sewage sludge. Concentrations of heavy metals (Zn, Cu, Cd, Cr, Ni and Pb) were below the limits specified in Resolution CONAMA n. 375/2006. The limed sludge showed the highest pH (12.65) lower levels of aluminum (20.10 g kg-1), phosphorus (1.6 g kg-1), organic matter (368, 6 g kg-1), carbon (213.80 g kg-1), nitrogen (20.88 g kg-1) and sodium (0.61 g kg-1). In treatment with sodium hypochlorite, sodium highest values (4.10 g kg-1) were recorded. The evaluation periods did not influence the concentration of nutrients and heavy metals. Considering Resolution CONAMA n. 375/2006, limed sludge in the ratio of 30% by weight of silt meets the parameters of fecal coliform, being more efficient. You can use the limed sludge in agriculture provided it meets the other requirements explicit in CONAMA Resolution n. 375/2006. O presente trabalho objetivou avaliar o efeito da combinação entre tratamentos químicos e solarização na higienização e composição química e física do lodo de esgoto resíduo oriundo do sistema de tratamento de efluentes proveniente de um reator anaeróbio de fluxo ascendente e manta de lodo UASB (Upflow Anaerobic Sludge Blanket Reactor) da Estação de Tratamento ETE Uberabinha, localizada em Uberlândia-MG. Sabe-se que a presença de agentes patogênicos e metais pesados são os principais limitantes da utilização desse lodo na agricultura. Para tanto, utilizou-se o esquema de parcelas subdivididas no tempo, em delineamento experimental de blocos ao acaso 5x3 + 1, com quatro repetições, em 4 (quatro) épocas de avaliação (0,7,14 e 21 dias), sendo que a época zero (0) correspondia ao tratamento adicional, totalizando 64 subparcelas. Os tratamentos foram constituídos por lodo puro, lodo mais ácido peracético (260 mg L-1), lodo homogeneizado com cal hidratada (CaOH2) na proporção de 30% da massa seca do lodo, lodo com hipoclorito de sódio (2500 mg L-1) e lodo mais quaternário de amônio (2400 mg L-1). O tratamento com cal hidratada reduziu os níveis de coliformes totais e termotolerantes aos 7 dias, após a mistura com o lodo, atendendo aos requisitos determinados na legislação ambiental para uso agrícola. A radiação solar, por si só, não reduziu a concentração de coliformes termotolerantes aos limites aceitáveis pela norma ambiental. Os tratamentos avaliados não ocasionaram diferenças de temperatura na massa do lodo de esgoto. O lodo caleado apresentou os maiores teores de cálcio (302 g kg-1), magnésio (4,2 g kg-1) e sólidos totais, menores teores de Zn, Cu, Cd, Cr, Ni, sólidos voláteis e umidade após a mistura com o lodo de esgoto. Os teores de metais pesados (Zn, Cu, Cd, Cr, Ni e Pb) encontravam-se abaixo dos limites especificados na resolução CONAMA n. 375/2006. O lodo caleado apresentou os maiores valores de pH (12,65), menores teores de alumínio (20,10 g kg-1), fósforo (1,6 g kg-1), matéria orgânica (368, 6 g kg-1), carbono (213,80 g kg-1), nitrogênio (20,88 g kg-1) e sódio (0,61 g kg-1). No tratamento com hipoclorito de sódio, foram registrados os maiores valores de sódio (4,10 g kg-1). As épocas de avaliação não influenciaram na concentração de nutrientes e metais pesados. Considerando a resolução CONAMA n. 375/2006, o lodo caleado na proporção de 30% da massa do lodo atende aos parâmetros de coliformes termotolerantes, sendo mais eficiente. Pode-se utilizar o lodo caleado na agricultura desde que atenda aos demais requisitos explícitos na resolução CONAMA n. 375/2006. Mestre em Agronomia

Orientadores: Gláucia Maria Pastore, Luiz Carlos Basso Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos Resumo: Os frutooligossacarídeos (FOS) são ingredientes de grande importância na indústria de alimentos e têm despertado muita atenção nos últimos anos por possuírem aplicações variadas e apresentarem propriedades prebióticas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a produção biotecnologica de FOS a partir de micro-organismos osmofílicos em um proceso de biotransformação utilizando células íntegras microbianas. As linhagens de Bacillus sp. e Aureobasidium sp, previamente isoladas de favo-de-mel e identificadas, foram primeiramente avaliadas quantos aos principais parâmetros de produção utilizando a metodologia de Superfície de Resposta, precisamente pelo Placket-Burman (PB), nos quais foram analisados 12 parâmetros para cada um dos microrganismos, dentre eles, a concentração da sacarose, inóculo, extrato de levedura, K2HPO4, (NH4)2SO4, MgSO4.7H2O, ZnSO4, MnSO4.7H2O, pH, temperatura e agitação. O Bacillus sp. apresentou 5 fatores significativos, sendo o pH, temperatura e agitação com efeitos negativos e o extrato de levedura e sulfato de amônia com efeitos positivos. Já o Aureobasidium sp. apresentou efeito positivo apenas para os parâmetros concentração de sacarose e sulfato de magnésio, sugerindo que o melaço de cana-de-açúcar, o qual era utilizado apenas para este microrganismo na etapa de cultivo do inóculo, poderia estar carreando nutrientes essenciais ao processo. A partir desta etapa, o trabalho teve continuidade apenas com a linhagem Aureobasidium sp. utilizando planejamentos experimentais sequenciais, a fim de se obter a faixa ótima de produção de FOS totais para esse processo. O estudo realizado para avaliar o efeito do melaço como meio de cultivo para o crescimento e obtenção do inóculo microbiano para o processo, demonstrou que a suplementação com nutrientes, avaliados na etapa do PB, era desnecessária, e o meio para síntese de FOS foi definido em apenas sacarose sem suplementação de nutrientes, com o inóculo na forma de suspensão celular cultivado previamente em meio a base de melaço. A produção neste momento atingia valores de 287,6 e 251,5 g/L de FOS totais e rendimentos de 72% e 63% em 24 e 48 horas respectivamente, com uma produtividade de 12 g/L.h às 24 horas de incubação. Em seguida foi realizado o planejamento fatorial fracionado para 4 variáveis definidas em tempo de cultivo e concentração do melaço, na etapa do cultivo do inóculo, e concentração de sacarose e de inóculo para a síntese de FOS, cujos apresentaram-se positivos com exceção ao tempo de cultivo que não demonstrou efeito nas condições avaliadas. Os valores de produção atingidos na etapa do fatorial foram de 333 g/L e 354 g/L de FOS totais e rendimentos de 60,5% e 64% em 24 e 48 horas respectivamente, e produtividade de 13,8 g/L.h às 24 horas de incubação. Após esses resultados, fixou-se a concentração do melaço em 10% de açúcares redutores totais, permanecendo apenas a concentração de sacarose e inóculo como variáveis para prosseguir o planejamento. A otimização desses dois fatores por Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR), possibilitou definir 4 modelos significativos ao processo, atingindo faixas ótimas de produção para cada FOS como o GF2, GF3 e GF4, e revelou a condição ótima para o processo em 600 a 650 g/L de sacarose e de 20 a 23% de inóculo, resultando em uma produção de 351 e 374 g/L de FOS e rendimentos de 53,5% e 57% em 24 e 48 horas respectivamente, atingindo uma produtividade de 14,7 g/L.h às 24 horas de incubação. Após definida a condição ótima do processo, o xarope de cana-de-açúcar, que é o caldo concentrado, foi utilizado como substrato alternativo à substituição da sacarose pura na produção de FOS. Os valores de rendimentos obtidos foram de 54%, entretanto as concentração de FOS totais foram de 110 g/L uma vez que a concentração inicial de sacarose no xarope era de apenas 203 g/L. A maioria dos experimentos revelou que o micro-organismo manteve-se viável e em crescimento durante o período de incubação, de acordo com os valores de biomassa e atividade enzimática avaliados nos experimentos. Sendo assim, foi proposto avaliar o processo em um biorreator de bancada de 7L, cujo foi conduzido inicialmente em sistema de batelada e após as 48 horas o processo passou a ser contínuo com taxa de diluição de 0,04.h-1 por mais 72 horas, totalizando 120 horas de cultivo. A concentração média de FOS totais produzidos foi de 228 g/L e uma produtividade média foi de 9 g/L.h Abstract: Fructooligosaccharides (FOS) are considered food ingredients with very significance for food industry that has receiving attention in the last few years, because of their functional properties for the health as prebiotics and industrial application. The objective of the present work was evaluate the biotechnological production of FOS by osmophilics microorganisms in a biotransformation process using free whole cells. Firstly the effects of production parameters using Bacillus sp. and Auerobasidium sp. strains. was employed by the Response Surface Methodology (RSM) exactly Plackett-Burman Design with 12 variables: concentration of sucrose, inoculum, yeast extract, K2HPO4, (NH4)2SO4, MgSO4.7H2O, ZnSO4, MnSO4.7H2O, pH, temperature and agitation. The Bacillus sp. showed 5 significant parameters, as pH, temperature and agitation with negative effect and yeast extract and ammonium sulfate with positive effect. The Aureobasidium sp. presents positive effect only for sucrose and magnesium sulfate concentration, which suggested the inoculum culture was caring nutrients from sugar cane molasses, that was the base of the inoculum cultivation for Aureobasidium sp. The work has continued only with Aureobasidum sp. applying sequential planning experiments to optimize the process. The experiment for evaluate the molasses effect as inoculum cultivation medium on process showed that nutrients supplementation, used in the PB design, wasn¿t necessary, consequently, the FOS synthesis medium was defined as sucrose, without nutrients supplements and the inoculum as cellular suspension previously cultivated in molasses medium. Total FOS data, at this point, reached 287.6 and 251.5 g/L with 72% and 63% of yield data at 24 and 48 hours respectively, with 12 g/L.h of productivity at 24 hours. Subsequently, the factorial planning was realized with 4 parameters as cultivation time and molasses concentration, in the inoculum cultivation step, and sucrose and inoculum concentration for the FOS synthesis. Almost all these factors showed positive effect, exception of inoculum cultivation time. The total FOS data, at this point, was 333 and 354 g/L with 60.5% and 64% of yield data at 24 and 48 hours respectively, with 13.8 g/L.h of productivity at 24 hours. Regarding these data, the molasses concentration was fixed at 10% of total reduce sugars, remaining only sucrose and inoculum concentration as variables to continue the planning. The two factors optimization was proceed by Central Composite Rotational Design (CCRD) that allowed defined 4 significant process model, aimed optimum production scales for which one FOS, as GF2, GF3 and GF4, that reveals the optimum process condition in 600 to 650 g/L of sucrose and 20 to 23% of inoculum, resulting in 351 and 354 g/L of total FOS data and 53.5% e 57% of yield data at 24 and 48 hours respectively, with 14.7 g/L.h of productivity at 24 hours. After defined the optimum process condition, the sugar cane syrup was evaluated as alternative substrate to pure sucrose for FOS production. The yield data reached was 54%, however the total FOS concentration was 110 g/L due to the small initial sucrose concentration on syrup that was 203 g/L. All the experiments showed significant microorganism growth and increase enzyme activity during the process. For this reason, the process was conducted in a 7L bioreactor, using initially batch system and after 48 hours the system was changed to continuous process with 0.04. h-1 for more 72 hours, with 120 total hours process. Data values showed the 9 g/L.h of productivity and 228 g/L of total FOS concentration Doutorado Ciência de Alimentos Doutora em Ciência de Alimentos

Orientador: Anita Jocelyne Marsaioli Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química Resumo: Neste trabalho avaliou-se a ação de micro-organismos em amostras de petróleo naturalmente biodegradadas e em ensaios de biodegradação realizados em laboratório, através da otimização de um protocolo que utiliza metodologias rápidas de análise da fração polar por ESI-MS. Assim sendo foi possível aferir a composição molecular dos constituintes das classes de compostos oxigenados (O, O2, O3 e O4) e nitrogenados (N, NO, NO2, NO3) presentes no petróleo e correlacioná-las ao fenômeno de biodegradação, e ambiente deposicional em óleos da Bacia de Campo e da Bacia Potiguar, respectivamente. As informações geradas nesse estudo contribuíram para o entendimento da origem dos biomarcadores ácidos através da degradação dos respectivos hidrocarbonetos. Complementando o escopo principal do trabalho foram caracterizados dos micro-organismos do petróleo por técnicas de espectrometria de massas, mostrando a importância do desenvolvimento desta técnica com construções de bibliotecas de referência e elaboração de softwares mais elaborados. Finalizando foi realizada a síntese de um biomarcador trideuterado com ampla utilização em estudos de petróleo Abstract: In this work we were able to evaluate the action of microorganisms in naturally biodegraded samples and in biodegraded laboratory assays, by optimizing a protocol that uses fast methods of analysis of the polar fraction by ESI-MS. Which was possible to determine the molecular composition of the compounds for oxygen (O, O2, O3 and O4) and nitrogen classes (N, NO, NO2, NO3) present in petroleum. Allowing to correlate those classes with the biodegradation phenomenon, and the depositional environment for the different studied petroleum samples. Even more information is generated about the origin of biomarkers acids through degradation of the respective hydrocarbons. In addition to the main scope of work, we characterize the petroleum microorganisms by mass spectrometry techniques, showing the importance of developing this MO identification technique by the construction of reference libraries and development of more sophisticated software. Also we synthesized a trideuterated biomarker widely used in studies with petroleum Doutorado Química Orgânica Doutor em Ciências

The use of pacifiers can cause risks to children health, resulting in opportunistic infections and accidents. Our paper intends to evaluate the structural and microbiological conditions of children pacifiers at public and private nursery schools, in the city of Imperatriz, Maranhão, Brazil. Thirty children pacifiers from public (n = 15) and private (n = 15) nursery schools, were evaluated considering their adequacy to Brazilian standards such as presence of dirt, and presence of infectivity by mutans streptococci group, Candida sp. and Enterococcus sp. The care provided for the use of pacifiers was asked to the parents and caregivers through a questionnaire.The analyzed pacifiers met the Brazilian standards (100 %). Pacifiers were infected by the three groups of microorganisms studied (› 15 %), with higher prevalence (p ‹ 0.05) to Candida sp (93.3 %). There was no statistically significant difference between the type of nursery school and the presence of dirt or infectivity of pacifiers (p › 0.05). The morphological conditions and contamination of pacifiers did not vary between the types of nursery schools, verifying that the necessary hygiene and care to the management of these pacifiers were inadequate despite the suitability to Brazilian standards. Sschool and dentists have an important hole in modifying this condition Aberto

For evaluation of microbiological conditions of raw milk and studies of some factors that influence their quality 24 properties were examined dairy located in the western region of Paraná. There were three collections for aerobic mesophilic microorganism analysis and coliform and thermotolerant. There was also one collect for verification of microorganisms health quality indicators (coliform and thermotolerant) of the water of these properties. For the analysis of mesophilic microorganisms 83.33% meet the requirement for default count of Normative Instruction No. 62. For total coliform, 46.87% of the samples have been checked have values above the recommended. For coliforms thermotolerants, there was 31.25% of contamination in samples. Regarding water samples, all were in agreement with the resolution of Conama (2005) but the presence of coliform thermotoleran is undesirable. It is concluded that further changes are required during the production of milk, with improvements in the quality and hygiene of milk.. Para avaliação das condições microbiológicas do leite cru de 24 propriedades leiteiras localizadas na região oeste do Paraná realizaram-se três coletas para análise de microorganismos aeróbios mesófilos, coliformes totais e coliformes termotolerantes. Foram coletadas amostras da água de dessedentação dos animais para verificação de microorganismos indicadores de qualidade sanitária (coliformes totais e termotolerantes). Para as análises de micro-organismos mesófilos 83,33% das amostras atendem o requisito para contagem padrão da Instrução Normativa nº 62. Para coliformes totais, verificou-se que 46,87% das amostras apresentam valores acima do recomendado. Para coliformes termotolerantes, verificou-se 31,25% de contaminação nas amostras. Quanto às amostras de água, todas estavam de acordo com a resolução do Conama (2005), porém a presença de coliformes termotolerantes é indesejável. Conclui-se que são necessárias alterações durante a produção do leite, com melhorias na qualidade e na higiene. .

Milk is an ideal medium for bacterial growth and forms of contamination are numerous. It may already be contaminated during milking. Its quality depends not only on the existing microbiota in raw milk, but is directly linked to hygienic procedures and temperature control on farm, in processing industries and sale locations. Twelve brands of milk produced by agribusinesses type C in the Federal District and surrounding areas were analyzed. The samples were collected at the retail level, and microbiological tests for total coliform, fecal coliform, Salmonella and viable aerobic mesophilic heterotrophic were performed. Comparing with the requirements contained in the DRC 12/2002 ANVISA/MS, of the 178 samples analyzed 37 were in poor sanitary conditions as they presented fecal coliform levels above the permitted. Salmonella sp. was not identi? ed in any sample. The high counts observed in some samples for total coliforms and aerobic mesophiles, which were evaluated according to IN 51, demonstrated that there were problems related to hygiene of the raw material and processing. Thus, there is need for greater and more eficient control of milk processing by using quality tools such as good manufacturing practices and standard operating procedures. . O leite é um meio ideal para crescimento bacteriano e as formas de contaminação são numerosas. Ele pode já estar contaminado no momento da ordenha. Sua qualidade não depende somente da microbiota existente no leite cru, mas está ligada diretamente aos procedimentos de higiene e controles de temperaturas realizados nas fazendas, nas indústrias beneficiadoras e nos locais de venda. Foram analisadas 12 marcas de leites tipo C produzidas por agroindústrias do Distrito Federal e Entorno. As amostras foram coletadas no varejo, realizando-se análises microbiológicas de coliformes totais, coliformes termotolerantes, Salmonella sp e aeróbios mesófilos heterotróficos viáveis. Segundo as exigências contidas na RDC 12/2002, ANVISA/MS, das 178 amostras analisadas 37 estavam em condições sanitárias insatisfatórias por apresentarem coliformes termotolerantes acima do permitido. Em nenhuma amostra foi identificada Salmonella sp. As elevadas contagens observadas em algumas amostras de coliformes totais e de aeróbios mesófilos foram avaliadas segundo a IN nº 51 e demonstraram que houve problemas relacionados à higiene da matéria-prima e do processamento. Desta forma, destaca-se que existe necessidade de um controle maior e mais eficiente utilizando ferramentas de qualidade como boas práticas de fabricação e procedimentos operacionais padronizados.

This study evaluated the efficiency of ozonated water compared with chlorhexidine to disinfect teats of cattle and their influence on milk quality. 48 cows were separated in 2 groups of sanitation: (I) using ozonated water at 2 mg.L-1 for 30s and (II) using 2%(v/v) chlorhexidine for 30s (standard methodology of disinfection). Before and after sanitation, swabs of teat were collected for carry out microbiological analysis. Additionally, after teats sanitation, the milking was performed and the obtained milk were evaluated by microbiological and physico-chemical parameters. The number of decimal reductions (NDR) reached after ozone sanitation was 2.52, 2.09 and 1.50 for aerobic mesophilic, Staphylococcus sp. and Enterobacteriaceae, respectively. The use of chlorhexidine promoted NRD of 2.38 (aerobic mesophilic), 2.04 (Staphylococcus sp.) and 1.16 (Enterobacteriaceae). Therefore, no significant differences were found between NRD caused by chlorhexidine and ozonated water. Moreover, no significant differences were observed in the psychrotrophic and aerobic mesophilic counts of the milk obtained after teats sanitation with ozonated water and chlorhexidine. Furthermore, it was observed that only samples obtained from cows treated with chlorhexidine showed the presence of Enterobacteriaceae. There were no changes in the physico-chemical parameters of milk obtained after both treatments. Thus, the ozonated water is a potential substitute of chlorhexidine for cows teats sanitation, resulting in similar microbiological reductions without risks of bacterial resistance development and waste generation. Este trabalho avaliou a eficiência da água ozonizada em comparação com a clorexidina na desinfecção de tetos dos bovinos e sua influência na qualidade do leite. Um total de 48 bovinos foi dividido em dois tratamentos de sanitização: (I) água ozonizada na concentração de 2 mg.L-1 por 30s e (II) clorexidina a 2%(v/v) por 30s. Antes e após a desinfecção, amostras de esfregaços dos tetos foram coletadas para realização de análises microbiológicas. Além disso, após o processo de higienização também foram coletadas amostras de leite para realização de análises microbiológicas e físico-químicas. A desinfecção dos tetos com água ozonizada resultou em número de reduções decimais (NRD) nos tetos de 2,52, 2,09 e 1,50 para aeróbios mesófilos, Staphylococcus sp. e enterobactérias, respectivamente. O uso da clorexidina resultou em NRD de 2,38, 2,04 e 1,16 para os mesmos micro-organismos pesquisados. A avaliação comparativa desses resultados indicou não haver diferença significativa entre os tratamentos. No leite, as contagens de psicrotróficos e aeróbios mesófi los não apresentaram diferença entre os tratamentos. Para Staphylococcus sp. foi verificado a presença em duas amostras após higienização com água ozonizada e em quatro após a higienização com clorexidina. Para enterobactérias só foi verificado a presença em cinco amostras obtidas de vacas tratadas com clorexidina. Adicionalmente, não foram constatadas diferenças nos parâmetros físico-químicos do leite obtido após a desinfecção com clorexidina e água ozonizada. Assim, a água ozonizada é um substituto potencial da clorexidina na sanitização dos tetos de bovinos, obtendo reduções microbiológicas similares, sem risco do desenvolvimento de resistência bacteriana e sem gerar resíduos.

Agradecimentos: This work was supported by the Brazilian agencies FAPESP (11/09047-4), CNPq (302575/2009-0), and CAPES Abstract: Revascularization outcome depends on microbial elimination because apical repair will not happen in the presence of infected tissues. This study evaluated the microbial composition of traumatized immature teeth and assessed their reduction during different stages of the revascularization procedures performed with 2 intracanal medicaments. Fifteen patients (7–17 years old) with immature teeth were submitted to the revascularization procedures; they were divided into 2 groups according to the intracanal medicament used: TAP group (n = 7), medicated with a triple antibiotic paste, and CHP group (n = 8), dressed with calcium hydroxide + 2% chlorhexidine gel. Samples were taken before any treatment (S1), after irrigation with 6% NaOCl (S2), after irrigation with 2% chlorhexidine (S3), after intracanal dressing (S4), and after 17% EDTA irrigation (S5). Cultivable bacteria recovered from the 5 stages were counted and identified by means of polymerase chain reaction assay (16S rRNA). Both groups had colony-forming unit counts significantly reduced after S2 (P < .05); however, no significant difference was found between the irrigants (S2 and S3, P = .99). No difference in bacteria counts was found between the intracanal medicaments used (P = .95). The most prevalent bacteria detected were Actinomyces naeslundii (66.67%), followed by Porphyromonas endodontalis, Parvimonas micra, and Fusobacterium nucleatum, which were detected in 33.34% of the root canals. An average of 2.13 species per canal was found, and no statistical correlation was observed between bacterial species and clinical/radiographic features. The microbial profile of infected immature teeth is similar to that of primarily infected permanent teeth. The greatest bacterial reduction was promoted by the irrigation solutions. The revascularization protocols that used the tested intracanal medicaments were efficient in reducing viable bacteria in necrotic immature teeth FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESP CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQ COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPES Fechado

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The cow urine applied to lettuce (Lactuca sativa L.) has promoted the growth and production of leaves. However, questions have been raised regarding the microbiological contamination. The study aimed to evaluate the effect of solutions of cow urine on plant growth characteristics and microbiological quality of lettuce. Four experiments were conducted in IFMG - Campus São João Evangelista MG. Experiments 1 and 2 were carried out from November 2011 to February 2012 and the experiments 3 and 4 in the period August to November 2012. The experiments were conducted in greenhouse under organic cropping system. Experiments 1 and 2 consisted of five treatments, corresponding to concentrations of cow urine solutions of 0.0, 0.5, 1.0, 2.0 and 4.0%, conducted in a completely randomized design with five replications. In experiment 1, the application of the solutions was foliar and in experiment 2 was in the soil, both with lettuce 'Regina 2000'. Experiments 3 and 4 were made up of five treatments, solutions corresponding to concentrations of 0.0, 2.0, 4.0, 6.0 and 10%, conducted in a completely randomized design with four replications. In both, the application of foliar solution was only in experiment 3 the lettuce was the 'Regina 500' and in experiment 4 Lettuce was 'Babá de Verão'. The solutions were prepared with the same water used for irrigation, and the control received only water. In all the experiments were applied 60 mL of solution/plant. This volume was divided into five applications, starting seven days following transplantation of seedlings, applying respectively 5, 5, 10, 20 and 20 mL/plant. The plot consisted of four longitudinal rows of 1.75 m long, with plants spaced 0.25 x 0.25 m. The six central plants from the two central rows were considered useful. Were evaluated the production of lettuce and microbiological analysis of irrigation water, the cow urine stored, the solutions applied cow urine, lettuce washed and not washed in pure water. Qualitative data were subjected to analysis of variance. The data on the concentration of the solutions were subjected to regression analysis, using the t test, the 1% and 5% probability. Solutions cow urine applied foliar or soil, the concentration of up to 5.21%, promoted plant growth and yield of lettuce. Solutions cow urine applied to soil, up to a concentration of 4%, and foliar up to 10%, did not improve the microbial load in lettuce. The cow urine in sealed plastic bombona kept in the dark showed growth of micro- organisms total coliforms, fecal coliforms and aerobic mesophilic until around the 5th week, dropping dramatically and reaching zero, or close to it, in the 7th week. The irrigation water had a high microbial load and was largely responsible for the microbial load on the lettuce, and the simple washing of lettuce leaves with pure water, although reducing the microbial load, was not effective for reducing this burden to acceptable levels for diners. A urina de vaca aplicada em alface (Lactuca sativa L.) tem promovido o seu crescimento e a produção de folhas. Todavia, questionamentos têm sido feitos em relação à contaminação microbiológica. O trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da aplicação de soluções de urina de vaca sobre características de crescimento de planta e qualidade microbiológica da alface. Foram realizados quatro experimentos no IFMG Campus São João Evangelista - MG. Os experimentos 1 e 2 foram desenvolvidos no período de novembro de 2011 a fevereiro de 2012 e os experimentos 3 e 4 no período de agosto a novembro de 2012. Os experimentos foram conduzidos em ambiente protegido e em sistema de cultivo orgânico. Os experimentos 1 e 2 foram constituídos de cinco tratamentos, correspondentes às concentrações de soluções de urina de vaca de 0,0; 0,5; 1,0; 2,0 e 4,0%, conduzidos no delineamento inteiramente casualizado, com cinco repetições. No experimento 1, a aplicação das soluções foi via foliar e no experimento 2 foi via solo, ambos com a alface 'Regina 2000'. Os experimentos 3 e 4 foram constituídos de cinco tratamentos, correspondentes às concentrações de soluções de 0,0; 2,0; 4,0; 6,0 e 10%, conduzidos no delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições. Em ambos, a aplicação das soluções foi via foliar. No experimento 3 a alface foi a 'Regina 500' e no experimento 4 a alface foi 'Babá de Verão'. As soluções foram preparadas com a mesma água utilizada para irrigação, sendo que a testemunha recebeu somente água. Em todos os experimentos foram aplicados 60 mL de solução/planta. Esse volume foi dividido em cinco aplicações semanais, iniciando sete dias após transplante das mudas, aplicando-se, respectivamente, 5, 5, 10, 20 e 20 mL de solução/planta. A parcela foi constituída por quatro fileiras longitudinais de 1,75 m de comprimento, com plantas espaçadas de 0,25 x 0,25 m. Foram consideradas úteis, as seis plantas centrais das duas fileiras centrais. Foram avaliadas características de produção da alface e realizadas análises microbiológicas da água de irrigação, da urina de vaca armazenada, das soluções de urina de vaca aplicadas, da alface lavada e não lavada em água pura. Os dados qualitativos foram submetidos à análise de variância. Os dados referentes às concentrações das soluções foram submetidos à análise de regressão, utilizando-se o teste t, a 1% e a 5% de probabilidade. Soluções de urina de vaca aplicadas via foliar ou solo, na concentração de até 5,21%, promoveram o crescimento das plantas e a produção da alface. Soluções de urina de vaca aplicadas via solo, até a concentração de 4%, e via foliar até 10%, não promoveram aumento da carga microbiana em alface. A urina de vaca hermeticamente fechada em bombona plástica mantida no escuro apresentou crescimento dos micro-organismos coliformes totais, coliformes termotolerantes e aeróbios mesófilos até por volta da 5ª semana, caindo drasticamente e alcançando nível zero, ou próximo desse, na 7ª semana. A água de irrigação com elevada carga microbiana foi a maior responsável pela carga microbiana em alface, sendo que a simples lavação das folhas de alface com água pura, apesar de reduzir a carga microbiana, não foi eficaz em reduzir essa carga até níveis aceitáveis aos comensais.

Este estudo teve como objetivo avaliar a frequência de mastite clínica e subclínica e descrever os micro-organismos envolvidos no processo inflamatório da glândula mamária nos rebanhos de búfalos leiteiros no Nordeste do Brasil. Foram analisadas 1.896 amostras de leite provenientes de 474 búfalos em quatro propriedades localizadas nos Estados de Alagoas, Bahia, Ceará e Pernambuco. Após o exame físico da glândula mamária, as amostras de leite de cada teto foram submetidas aos testes da caneca do fundo preto e CMT (California Mastitis Test). As amostras que apresentaram scores ++ e +++ no CMT e as positivas para a caneca do fundo preto foram submetidas ao exame microbiológico. Do total de amostras estudadas, 90/1.896 (4,74%) apresentaram mastite clínica. Com relação ao CMT, observou-se que 802/1.896 (42,2%) das amostras demonstraram mastite subclínica. Staphylococcus spp. foram os micro-organismos mais frequentes, seguidos de Corynebacterium spp. e bactérias gram-negativas. Os resultados obtidos neste trabalho demonstram uma elevada prevalência de mastite subclínica em rebanhos bubalinos no Nordeste do Brasil, especialmente causadas por Staphylococcus coagulase negativa (SCN). Recomenda-se que o processo de ordenha seja aprimorado, incluindo melhorias na higiene e treinamento de ordenhadores, a fim de reduzir a frequência da doença nos rebanhos.

A infecção do trato urinário (ITU) é uma das infecções mais comuns durante o período gestacional. O fácil acesso das bactérias presentes na microbiota instestinal facilita a sua migração ao ânus e consequentemente ao trato urinário. Objetivou-se correlacionar as complicações das infecções do trato urinário com o período gestacional. A metodologia consistiu de uma pesquisa bibliográfica descritiva de caráter qualitativo, incluindo estudos desde 2000 a 2013. As ITUs podem causar sérias complicações tanto para mãe quanto para o feto, dentre estas complicações destacam-se; parto prematuro, recém-nascido de baixo peso, ruptura de membranas amnióticas, ou até mesmo a morte materno-fetal. Por isso, é de suma importância um monitoramento contínuo para que a infecção não evolua e traga consequências danosas tanto para a mãe quanto para o feto.

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2020-04-27T14:18:24Z No. of bitstreams: 1 2013 - Alexandre De Donato.pdf: 784023 bytes, checksum: 217f92b3244ed832603f2cbf030a1290 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-27T14:18:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013 - Alexandre De Donato.pdf: 784023 bytes, checksum: 217f92b3244ed832603f2cbf030a1290 (MD5) Previous issue date: 2013-08-12 Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior, CAPES, Brasil. In Brazil most of the agricultural soils have low availability of phosphorus , a nutrient limiting for several crops in Brazilian soils . The ability of filamentous fungi in solubilizing the phosphorus from various sources, has been considered as a desirable characteristic for various uses. Brazil has a huge biodiversity , and one way of extracting economic value of it, is bioprospecting, which presents a systematic search for organisms , genes , enzymes , compounds , processes and parts from living beings in general, which may eventually lead to the development of a product. The goal was the isolation of filamentous fungi solubilizing phosphorus of soil and litter, and quantification of fungal mycoflora. The study was conducted in one Semi-deciduous forest biome Cerrado of Sete Lagoas, MG city, in which soil samples were collected from eight distinct forest fragments , two collection periods , and 2 depths , layer 0 - 5cm, 5 -10cm and litter, for the isolation of mycobiota , and subsequent evaluation of the ability to solubilize phosphate . The soils were classified according to the Brazilian System of Soil Classification . The mycoflora was quantified using the methodology of colony-forming unit and identified based on morphological study. Soil fertility and nutrient content were evaluated for exchangeable nutrients, for the 0-10 cm layer of soil. The identification of isolates capable of solubilizing phosphorus was made by plating in the same culture medium Pikovskaya . The litter showed higher CFU in samples collected during the rainy season (C1) compared to the dry season (C2) , and for both periods of collect, the litter had a higher number of UFC the other two depths . In the collection C1 , held in late January 2012, 907 fungi were isolated , of these, 103 (11.35%) were filamentous had capacity to solubilize phosphorus In the collection C2 , held in early September 2012 , 947 fungi were isolated , 152 (16,76%) were filamentous had the capacity to solubilize phosphorus. The C2 showed higher percentage of phytase - producing species belonging to the genus Penicillium, while C1 showed higher percentage of fungi belonging to the genus Aspergillus section Nigri with production capacity of phytase . The total number of fungal isolates producing phytase was higher in C2. It was concluded that the soil in the area in the study have high mycobiota diversity and high number of phosphorus solubilizing fungi, and are potentially exploitable with respect to obtaining these . No Brasil grande parte dos solos agricult?veis tem baixa disponibilidade de f?sforo, um nutriente limitante para diversas culturas nos solos brasileiros. A habilidade dos fungos filamentosos em solubilizar o f?sforo de v?rias fontes, tem sido considerada como uma desej?vel caracter?stica para usos diversos. O Brasil possui uma enorme biodiversidade, e uma das maneiras de se extrair valor econ?mico da mesma ? a bioprospec??o, onde apresenta uma busca sistem?tica por organismos, genes, enzimas, compostos, processos e partes provenientes de seres vivos em geral, que possam, eventualmente, levar ao desenvolvimento de um produto. O objetivo foi o isolamento de fungos filamentosos solubilizadores de f?sforo do solo e serrapilheira e a quantifica??o da micobiota f?ngica. O trabalho foi realizado em uma floresta estacional semidec?dua no bioma Cerrado, Munic?pio de Sete Lagoas, MG, no qual as amostras de solo foram coletadas de 8 fragmentos florestais distintos, 2 ?pocas de coleta, e 2 profundidades, camada de 0-5 cm, e 5-10 cm, e serrapilheira, para o isolamento da micobiota, e posterior avalia??o quanto ? capacidade de solubiliza??o de f?sforo. Os solos foram classificados segundo o Sistema Brasileiro de Classifica??o dos Solos. A micobiota foi quantificada por meio da metodologia de unidade formadora de col?nia e identificada com base no estudo morfol?gico. A fertilidade do solo e o teor de nutrientes troc?veis foram avaliados para camada de 0-10 cm do solo. A identifica??o dos isolados capazes de solubilizar f?sforo foi feita por meio do plaqueamento dos mesmos em meio de cultura Pikovskaya. A serrapilheira apresentou maior n?mero de UFC nas amostras coletadas na ?poca chuvosa (C1) em rela??o ? ?poca seca (C2), e em ambas as ?pocas a serrapilheira apresentou um n?mero superior de UFC que as outras duas profundidades. Na coleta C1, realizada no final de janeiro de 2012, foram isolados 907 fungos, destes, 103 (11,35%) eram filamentosos que apresentavam capacidade de solubilizar f?sforo. Na coleta C2, realizada no in?cio de setembro de 2012, foram isolados 947 fungos, 152 (16,76%) eram filamentosos que apresentavam a capacidade de solubilizar f?sforo. A C2 mostrou maior porcentagem de esp?cies produtoras de fitase pertencentes ao g?nero Penicillium, enquanto C1 mostrou maior porcentagem de fungos pertencentes ? se??o Nigri do g?nero Aspergillus com capacidade de produ??o de fitase. O n?mero total de isolados f?ngicos produtores de fitase foi maior em C2. Concluiu-se que os solos situados na regi?o do estudo possuem uma elevada diversidade de micobiota e elevado n?mero de fungos solubilizadores de f?sforo, e s?o potencialmente explor?veis no tocante ? obten??o destes.

Submitted by Luciene Weber (lucieneweber@gmail.com) on 2014-07-25T17:22:52Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jane Rosado.pdf: 2140291 bytes, checksum: fb2956ebddf8c48850800f4695e6dbb7 (MD5) Made available in DSpace on 2014-07-25T17:22:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jane Rosado.pdf: 2140291 bytes, checksum: fb2956ebddf8c48850800f4695e6dbb7 (MD5) As enzimas são ferramentas importantes no estabelecimento de processos tecnologicamente limpos. As hidrolases constituem um dos mais importantes grupos de enzimas com aplicações em diferentes setores industriais. Os micro-organismos, principal fonte de enzimas industriais, apresentam limitações quanto à produtividade. Dessa forma, a identificação de novas fontes para obtenção em larga escala de enzimas torna-se relevante. Objetivou-se, nesse trabalho, investigar a possibilidade de obtenção de enzimas amilolíticas a partir de resíduos agrícolas das lavouras cacaueira e dendenzeira. A restrição de substrato no meio de cultivo foi utilizada para a triagem inicial de microrganismos produtores de amilase, lipase e celulase. Entre as cepas isoladas, quatro delas apresentaram atividade amilolítica relevante com Índice Enzimático (IE) superior a 2.0. A extração, sequenciamento e análise filogenética do gene ribossomal bacteriano 16S permitiu a identificação das seguintes cepas com atividade amilolítica: Paenibacillus tundrae, Xanthomonas cordiaei, Bacillus subtilis, Acinetobacter baumannii. P. tundrae (cepa dende1c) e X. cordiaei (cepa cacau1a) foram as mais promissoras apresentando IE 9,0 e 14,0 respectivamente. Essas cepas foram cultivadas em meio líquido e tiveram a atividade amilolitica monitorada em solução. Esses dados demonstram que os micro-organismos selecionados são promissores para obtenção de enzimas com potencial para aplicação na indústria.

Tendo em vista fazer uma verificação de algumas das características de microorganismos com potencial probiótico, esse trabalho tem por objetivo identificar, avaliar e comparar o potencial probiótico de Enterococcus faecium isolados de queijo artesanal da cidade de Londrina. Primeiramente foram identificadas por técnica molecular as cepas já isoladas de Enterococcus. O restante dos testes foram feitos somente com os isolados de Enterococcus faecium. Fez-se então, um antibiograma frente à eritromicina 15 µg, tetraciclina 30 µg e vancomicina 30 µg, verificando-se a resistência ou sensibilidade de cada isolado frente a estes antibióticos. Em seguida foram realizados testes de simulação in vitro do trato gastro-intestinal e comparados com a cepa comercial de Lactobacillus acidophilus. Para simular as condições na boca foi realizado o teste de resistência à lisozima, verificando assim a sua viabilidade. Já para simular as condições no estômago realizou-se o teste de tolerância em meio ácido, em cultivo. Foram avaliadas as condições de sobrevivência simulando o intestino delgado, determinando-se a viabilidade destes micro-organismos frente à pancreatina em pH 8,0. No estudo de auto-agregação, cada isolado de E. faecium e a cepa comercial de L. acidophilus, foram colocados separadamente e verificados em densidade óptica de 540 nm. Os resultados demonstraram que dos 98 isolados de Enterococcus, 54,0 % eram E. faecium, 39,8% eram E. faecalis e 6,2% eram Enterococcus spp. Em relação à susceptibilidade à antimicrobianos foram pouco resistentes aos antibióticos testados, sendo que 24,5% apresentaram resistência à eritromicina e 1,9% apresentaram resistência à tetraciclina e vancomicina. Já no teste de resistência à lisozima após 120 min obteve-se 15 isolados que não apresentaram diferença significativa ao nível de 5% quando comparados ao L. acidophilus e 7 isolados que foram mais resistentes que o mesmo. No resultado frente ao estresse ácido após 3 h, 3 isolados não apresentaram diferença significativa ao nível de 5 % quando comparados com L. acidophilus e 2 isolados apresentaram maior resistência que o Lactobacillus. Em relação ao teste sobrevivência ao intestino delgado, em comparação a cepa comercial de L. acidophilus, apresentaram-se com taxas de sobrevivência sem diferença significativa, 21 isolados de E. faecium, e ainda pode-se destacar 7 isolados, onde encontrou-se uma taxa de sobrevivência maior que o controle. Dos 53 isolados analisados 60 % apresentaram capacidade de auto-agregação. The purpose of this work was to identify, assess and compare some Enterococcus faecium potential probiotic micro-organisms isolated from artisanal cheese in Londrina. First, identified by molecular techniques already isolated strains of Enterococcus. The rest of the tests were made only with isolates of Enterococcus faecium. There was then a antibiogram forward to erythromycin 15 mg, 30 mg tetracycline and vancomycin 30 mg, checking the resistance or sensitivity of each isolate against these antibiotics. It was then performed simulation tests in vitro gastro-intestinal tract and compared with the commercial Lactobacillus acidophilus strain. To simulate the conditions in the mouth was performed to test for resistance to lysozyme, thus verifying its viability. Have to simulate conditions in the stomach was performed tolerance test in acid medium in cultivation. We evaluated the survival conditions simulating the small intestine, determining the viability of these micro-organisms against the pancreatin at pH 8.0. In the study of auto-aggregation, either isolated from E. faecium and a strain of commercial L.acidophilus were separately placed and the optical density verified of 540 nm. The results showed that the 98 Enterococcus, isolated from cheese, was 54.0% E. faecium, 39.8% E. faecalis and 6.2% Enterococcus spp. Regarding antimicrobial susceptibility were slightly resistant to the antibiotics tested, and 24.5% were resistant to erythromycin and 1.9% to tetracycline and vancomycin. Already in lysozyme resistance test after 120 min showed 15 isolates that had no significant difference at 5% when compared to L. acidophilus and 7 isolates were more resistant than the same. In result against acid stress after 3 h, 3 isolates showed no significant difference at 5% when compared with L. acidophilus and 2 isolates had greater resistance than Lactobacillus. Regarding testing survival to the small intestine, compared to commercial strain of L. acidophilus, presented with survival rates without significant difference, 21 isolates of E. faecium, and still can highlight the isolates 7 isolates, which found a higher survival rate than the control. 32 of the 53 isolates tested showed the ability to auto-aggregation, or 60%.

Micro-organismos estão presentes em toda a cadeia de processamento da carne, desde a matéria-prima até o produto final e compete aos programas de qualidade industrial verificar se existe contaminação na matéria-prima e nos produtos finais para, dessa forma, garantir um produto seguro ao consumidor. Para tanto, faz-se necessário utilizar metodologias alternativas à convencional na rotina diagnóstica dos laboratórios para obtenção de resultados confiáveis e em menor tempo possível. Com objetivo de verificar e comparar a correlação e o tempo de processamento, da metodologia convencional com as metodologias alternativas do sistema PetrifilmTM (3M) e sistema TEMPO® (bioMeriéux), foi realizada contagem de micro-organismos mesófilos, de enterobactérias e de Escherichia coli. As amostras foram coletadas da superfície de carcaças suínas em um abatedouro com Inspeção Federal no Estado de Santa Catarina, Brasil. A contagem de micro-organismos mesófilos, de enterobactérias e Escherichia coli foi feita por meio de ensaios realizados com os métodos alternativos TEMPO®, Petrifilm™ e o método convencional de contagem de micro-organismos em placas. Após análise estatística, o coeficiente de correlação de Pearson (r) demonstrou fortes correlações, acima de 0.70 entre as metodologias utilizadas para a contagem de enterobactérias e micro-organismos mesófilos, porém demonstrou moderada correlação, entre 0.30 a 0.70, para o diagnóstico de Escherichia coli. O uso dos métodos alternativos testados em substituição à metodologia convencional pode ser utilizado para diagnóstico de Escherichia coli, enterobactérias e micro-organismos mesófilos, por haver concordância entre os resultados encontrados, acrescido da rapidez dessas metodologias com benefício direto para a indústria de carne suína. Micro-organisms are present throughout the meat processing chain, from raw materials until finished product. Industrial quality programs check for contamination in raw materials and final products to ensure the safety of consumer products; for this reason, the use of alternative methods instead of the conventional methods used in routine diagnostic laboratories is necessary to obtain reliable results in the shortest time possible. Samples of pig carcasses were collected in a slaughterhouse with Federal Inspection in the State of Santa Catarina, Brazil. Mesophilic micro-organisms, Enterobacteriaceae and Escherichia coli were evaluated and tests performed by alternative methods, TEMPO®, Petrifilm™, and the conventional method of counting micro-organisms in Petri dishes. After statistical analysis, the Pearson correlation coefficient (r) showed a strong correlation up to 0.70 between the methodologies used for the enumeration of Enterobacteriaceae and mesophilic micro-organisms, show a moderate correlation between 0.30 to 0.70, for the diagnosis of Escherichia coli. The use of alternative methods to replace the conventional method can be recommended for diagnosis of Escherichiacoli, Enterobacteriaceae and mesophilic micro-organisms, because there was consistency between the results and the speed was increased by the alternative methodologies benefiting the pork industry.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:37:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_tony_picoli.pdf: 555622 bytes, checksum: 3db1b36bb01598b01f400cb7267e3223 (MD5) Previous issue date: 2013-02-20 Given the importance of the milk chain in Rio Grande do Sul, aimed to the characterization of production systems in the southern region of the state and relate the quality of milk from cooling tanks. Questionnaires were performed with farmers and milk samples were collected for chemical and microbiological analysis. The dairy business is carried out in 26,06 ha with 8,4 cows in lactating on average. Most farms produce between 50 and 100L/day. 39,3% of the farmers manual milking their animals, only 14,2% perform pre milking disinfection, 53,9% use a cloth to dry the teats of all animals. There was a negative correlation between SCC and production (r = -0,23) and between SCC and lactose (r = -0,39) and positive between lactose content and yield (r = 0,31). Concerning microbiological analyzes, the mean scores were: Staphylococcus sp. (5,32 x106 CFU/mL), S. aureus (1,33 x105 CFU/mL), Enterobacteriaceae (1,82 x107 CFU/mL). There was presence of Escherichia coli (27,8% of farms), Streptococcus agalactiae (6,2%), S. dysgalactiae (37,2%), S. uberis (16,8%), Candida sp. (15,7%), Aspergillus sp. (5,8%) and Trichosporum sp. (3,6%). Risk analyzes showed great chances of S. agalactiae, S. dysgalactiae and S. bovis when using inadequate handling practices and poor facilities. There was a significant difference (p = 0,003) in SCC, which is enhanced when milking performed manually, which also contributes to the increased count S. aureus (p = 0,0428). Performing pre milking disinfection demonstrably reduces the counting Staphylococcus sp. (p = 0,0415). The milk produced in the region is quite contaminated and one of the causes is the inadequate milking handling. Devido à importância da cadeia do leite no Rio Grande do Sul, objetivou-se a caracterização dos sistemas de produção na região sul do Estado, relacionando-os com a qualidade do leite proveniente de tanques resfriadores. Foram realizados questionários epidemiológicos com os produtores e, amostras de leite foram coletadas para análise química e microbiológica. Observou-se que a atividade leiteira é realizada em 26,06 ha e com 8,4 vacas em lactação em média com produtividade média de 6,8 L/dia. A maioria das propriedades produz entre 50 e 100L/dia. Dentre os produtores, 39,3% ordenham seus animais manualmente; apenas 14,2% realizam pré-dipping; 53,9% utilizam um único pano para secagem dos tetos de todos os animais. Houve correlação negativa entre a contagem de células somáticas (CCS) e produção (r= -0,23) e entre CCS e lactose (r= -0,39) e positiva entre teor de lactose e produção (r= 0,31). Quanto às análises microbiológicas do leite dos tanques, as médias das contagens foram: Staphylococcus sp. (5,32x106 unidades formadoras de colônias (UFC)/mL), S. aureus (1,33x105 UFC/mL), enterobactérias (1,82x107 UFC/mL). Houve presença de Escherichia coli (27,8% das propriedades), Streptococcus agalactiae (6,2%), S. dysgalactiae (37,2%), S. uberis (16,8%), Candida sp. (15,7%), Aspergillus sp. (5,8%), Trichosporum sp. (3,6%) e Cryptococcus sp. (1,5%). As análises de risco mostraram grandes chances de ocorrência de S. agalactiae, S. dysgalactiae e S. bovis, quando se utilizam práticas de manejo e instalações precárias. Houve diferença (p=0,003) na CCS, a qual aumentou onde se realiza ordenha manual, que também contribuiu para o aumento na contagem de S. aureus (p=0,0428). A realização de pré-dipping, comprovadamente diminui as contagens de Staphylococcus sp. (p=0,0415). O leite produzido na região encontra-se bastante contaminado e uma das causas é o manejo inadequado de ordenha.

O colorau e o cominho podem se tornar agentes causadores de doenças, devido a suas cargas microbianas. Alguns procedimentos de higienização vêm sendo há tempos destinados à destruição ou diminuição no número de micro-organismo presente nos alimentos. Muitos trazem desvantagens na qualidade dos alimentos, mas outros não interferem, como, a esterilização por radiação gama. O objetivo deste trabalho foi aplicar a técnica da radiação para analisar se as doses de 2, 8 e 12 kGy eram suficientes para a inibir o crescimento de colônias bacterianas e fúngicas nas amostras de colorau e cominho. Estas doses estão de acordo com a faixa limites para condimentos, entre 8 e 30 kGy, determinada pelo Instituto de Pesquisa Energéticas e Nucleares (IPEN). A de dose 12 kGy foi a mais eficaz, enquanto que a de 2 kGy não inibiu o crescimento de colônias, com exceção da análise para coliformes termotolerantes.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior During the chicken slaughter line, some steps are considered critical, due to the possibility of cross-contamination among carcasses, which directly influence in the shelf-life of the carcasses. New technologies that reduce the microbial counts, leading to an increase of the quality and shelf-life are very welcome. The ultraviolet-C (UV-C) radiation appears as an alternative, because is a non-thermal method, of low cost and of easy implementation, which has already proved to be lethal to many microorganisms in food surfaces. Thus, this work aimed to evaluate the use of doses of UV-C radiation of 5,4 and 9,46 kJ/m2, applied at two temperatures near the slaughter steps (5 and 25 °C), on the physicochemical parameters (color, pH, conjugated dienes content, peroxide value, thiobarbituric acid reactive substances and fatty acid profile) and microbiological (total aerobic mesophilic bacteria, psychrotrophic, yeasts and molds) of chicken drumsticks. The analyses were performed immediately after the doses were applied (zero day) and every 3 days, during 12 days of storage at 5 °C, but the fatty acid profile was analyzed after the doses were applied, and on sixth and twelfth days. The number of colonies of total aerobic mesophilic bacteria had significant reductions (p < 0,05) on the third, sixth and ninth days of storage, at both temperatures of application and after the doses were applied (zero day) for the application at 25 °C. Regarding the total aerobic mesophilic bacteria, application of UV-C radiation at 5 °C, provided shelf-life of carcasses of 9 days of storage, whereas at 25 °C, the shelf-life was 6 days. The number of colonies of psychrotrophic bacteria had significant decreases (p < 0,05) in all days of storage when applied the dose of 9,46 kJ/m2 at 5 °C, and only on the third and on the twelfth days when applied at 25 °C. At the sixth day, the number of colonies of psychrotrophic bacteria was characteristic of deterioration, regardless the treatment applied. The molds and yeasts were not affected by UV-C radiation. Generally, in a same temperature of application, the UV-C radiation doses didn t cause significant changes (p > 0,05) compared to the samples from the control group (without irradiation) in any of the physicochemical parameters, independent of the day of storage. The application of UV-C radiation at 25 °C compared to 5 °C, promoted higher formation of conjugated dienes and lower amount of omega-6 and omega-3 polyunsaturated fatty acids. Thus, the UV-C radiation could be applied in industry after the step of cooling carcass (at 5 °C) due to the non-acceleration of initiation of lipid oxidation, the non-diminishing of essential fatty acids and being effective on the reduction of aerobic mesophilic and psychrotrophic bacteria. Durante a linha de abate de frangos, algumas etapas são consideradas críticas, devido à possibilidade de contaminação cruzada entre as carcaças, o que influencia diretamente na vida útil das mesmas. Novas tecnologias que venham a reduzir as contagens microbianas, levando ao aumento da qualidade e vida útil das carcaças são muito bem-vindas. A radiação ultravioleta-C (UV-C) aparece como uma alternativa, pois é um método não térmico, de baixo custo e de fácil aplicação, que já se mostrou letal para vários micro-organismos em superfícies de alimentos. Desta forma, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o uso de doses de radiação UV-C de 5,4 e 9,46 kJ/m2, aplicadas em duas temperaturas próximas as de etapas do abate (5 e 25 °C), sobre os parâmetros físico-químicos (cor, pH, teor de dienos conjugados, índice de peróxidos, substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico e perfil de ácidos graxos) e microbiológicos (bactérias mesófilas aeróbias totais, psicrotróficas e bolores e leveduras) em sobrecoxas de frangos. As análises foram realizadas logo depois de aplicadas as doses (zero dia) e de 3 em 3 dias, durante 12 dias de armazenamento a 5 °C, sendo que o perfil de ácidos graxos foi analisado logo depois de aplicadas as doses e no 6º e 12º dias. O número de colônias das bactérias mesófilas aeróbias totais teve reduções significativas (p < 0,05) no 3º, 6º e 9º dias de armazenamento, em ambas as temperaturas de aplicação e logo depois de aplicadas as doses (zero dia) para a aplicação a 25 °C. Em relação às bactérias mesófilas aeróbias totais, a aplicação da radiação UV-C a 5 °C proporcionou tempo de vida útil das carcaças de 9 dias de armazenamento, enquanto que na aplicação a 25 °C, o tempo de vida útil foi de 6 dias. O número de colônias de bactérias psicrotróficas teve reduções significativas (p < 0,05) em todos os dias de armazenamento quando aplicada a dose de 9,46 kJ/m2 a 5 °C, e somente no 3° e 12° dias, quando aplicada a 25 °C. A partir do 6° dia de armazenamento, o número de colônias de bactérias psicrotróficas foi característico de deterioração, independente do tratamento aplicado. Os bolores e leveduras não foram afetados pela radiação UV-C. De maneira geral, em uma mesma temperatura de aplicação, as doses de radiação UV-C não causaram modificações significativas (p > 0,05) em relação às amostras pertencentes ao grupo controle (sem irradiação) em nenhum dos parâmetros físico-químicos, independente do dia de armazenamento. A aplicação da radiação UV-C a 25 °C em relação a 5 °C, promoveu maior formação de dienos conjugados e um menor teor de ácidos graxos poli-insaturados ômega-6 e ômega-3. Dessa forma, a radiação UV-C poderia ser aplicada na indústria após a etapa de resfriamento das carcaças (a 5 °C), devido a não acelerar o início da oxidação lipídica, não diminuir os teores dos ácidos graxos essenciais, e sim apresentar eficiência na redução de bactérias mesófilas aeróbias e psicrotróficas.

Resumo A contaminação de hortaliças por micro-organismos patogênicos está diretamente relacionada com a qualidade das águas de irrigação utilizadas na agricultura e com o solo onde se encontram. Com o objetivo de se verificar as condições empregadas na produção de alface (Lactuca sativa L.) em três pequenas propriedades do interior do Rio Grande do Sul (Brasil), foram avaliadas a condição físico-química das águas de irrigação, e a condição microbiológica das águas, solo e folhas de alface. As análises bacteriológicas das águas de irrigação, hortaliças e do solo foram realizadas usando a técnica dos tubos múltiplos ou por contagem em placa, e levou em conta os coliformes totais, coliformes termotolerantes, e presença ou ausência de Escherichia coli, Salmonella sp. e Listeria sp.. As análises físico-químicas realizadas nas águas de irrigação foram pH, turbidez, oxigênio dissolvido, demanda bioquímica de oxigênio, carbono orgânico total e nitrogênio total. As análises bacteriológicas nas águas de irrigação indicaram a ausência de Salmonella sp. e Listeria sp.. Entretanto, foi detectada a presença de E. coli e valores acima do permitido pela legislação para coliformes termotolerantes. Desta forma, estas águas se encontram fora dos padrões estabelecidos pela Resolução CONAMA n° 357. A pesquisa também mostrou a presença de E. coli, Salmonella sp. e Listeria sp. nas hortaliças irrigadas, sugerindo que a fonte de contaminação por Salmonella sp. e Listeria sp. deve ser a partir do solo, e não a partir da água de irrigação. Os dados físico-químicos mostraram que apenas uma das propriedades analisadas apresentou todos os parâmetros adequados, segundo a legislação vigente para águas doces de classe 1. Portanto, apenas uma das propriedades apresentou condições físico-químicas para ser utilizada na irrigação de alface, embora nenhuma tenha apresentado condições higiênico-sanitárias para tal uso. Abstract The contamination of greenery by pathogenic microorganisms is directly related to the quality of irrigation water used in agriculture and to the soil where the greenery is located. In order to verify the conditions surrounding lettuce (Lactuca sativa L.) production at three small properties of Rio Grande do Sul State, Brazil, we evaluated the physico-chemical conditions of irrigation water as well as the microbiological condition of water, soil and lettuce leaves. Bacteriological analyses of the irrigation water, greenery and soil were performed using the multiple tubes or plate-counting techniques, and the total coliforms, thermo-tolerant coliforms, and presence or absence of Escherichia coli, Salmonella sp. and Listeria sp. was evaluated. The irrigation water was analyzed to determine pH, turbidity, dissolved oxygen, biochemical oxygen demand, total organic carbon and total nitrogen. Bacteriological analysis on the irrigation water indicated the absence of Salmonella sp. and Listeria sp.. However, we detected the presence of E. coli and higher thermo-tolerant coliform levels than that established by current legislation. Thus, these water samples do not conform to the standards established by the CONAMA n° 357 Resolution. Our analyses also showed the presence of E. coli, Salmonella sp. e Listeria sp. on the irrigated greenery, suggesting that the source of the Salmonella sp. and Listeria sp. contamination must be the soil, rather than the irrigation water. Physico-chemical analyses showed that only one of the analyzed properties conforms to the standards established by current legislation for Class 1 fresh water. Therefore, only one of the properties presented the physico-chemical conditions appropriate for lettuce irrigation, although no property presented hygienic sanitary conditions for such use.

Since Brazil is a major producer of coffee in the world, the waste that it generates should be of great environmental concern. The coffee processing wastewater (CPW) can bring serious environmental impacts if disposed untreated, due to the large amount of macro/micronutrients and phenolic compounds that they have. Folic acid, a vitamin complex essential in metabolic pathways, can stimulate the development of microorganisms in the environment and thereby provide more rapid removal of the organic load of wastewater. The purpose of this work was to evaluate the influence of varying concentrations of folic acid in stimulating the degradation of organic material contained in the CPW and also investigate the effect of solubility of folic acid in distilled water, distilled boiling water, and a solution of sodium bicarbonate. The addition of folic acid in concentrations from 4.0 to 32.0 mg L-1 increased the rate of decay of chemical oxygen demand (COD). The dose of 8 mg L-1 folic acid diluted in distilled water provided the optimum results in terms of removing organic material from the CPW. Sendo o Brasil um dos maiores produtores de café do mundo, os resíduos que essa atividade gera devem ser de grande preocupação ambiental. A água residuária do descascamento dos frutos do cafeeiro (ARC) pode trazer graves impactos ambientais se descartada sem tratamento prévio, em razão da grande quantidade de macro/micronutrientes e compostos fenólicos que possui. O ácido fólico, como complexo vitamínico essencial na rota metabólica, pode estimular o desenvolvimento de micro-organismos no meio e, com isso, proporcionar mais rápida remoção da carga orgânica de águas residuárias. Com a realização deste trabalho, objetivou-se avaliar a influência de concentrações variadas de ácido fólico no estímulo à degradação do material orgânico contido na ARC e, ainda, verificar o efeito da solubilização do ácido fólico em água destilada, água destilada fervente e em solução de bicarbonato de sódio. A adição de ácido fólico, nas concentrações de 4,0 a 32,0 mg L-1, proporcionou aumento na taxa de decaimento da demanda química de oxigênio (DQO). A dose de 8 mg L-1 de ácido fólico diluído apenas em água destilada, foi a que proporcionou a obtenção dos melhores resultados, em termos de remoção do material orgânico da ARC.

El objetivo de este estudio fue ensayar una serie de concentraciones de un producto granulado preparado con Bacillus sphaericus, sobre larvas de Culex quinquefasciatus y Anopheles albimanus en condiciones de laboratorio. Se utilizaron once concentraciones (20, 40, 60, 80, 100, 120, 140, 160, 180, 200 y 500 ppm) sobre larvas de An. albimanus, y ocho concentraciones diez veces menores (2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 y 16 ppm) sobre larvas de Cx. quinquefasciatus. Se utilizaron 60 larvas y un control con 20 larvas por concentración. El tiempo de exposición fue de 48 h, a una temperatura de 28 ± 2 °C. Para estimar las concentraciones letales 50 y 95 se utilizó la prueba Probit. Se encontró una CL95 de B. sphaericus entre 6,45 y 7,28 ppm para larvas de Cx. quinquefasciatus; mientras que en larvas de An. albimanus se observó una CL95 entre 450,56 y 466,76 ppm. The purpose of this study was to assay a series of concentrations of a granulated product prepared with Bacillus sphaericus on Culexquinquefasciatus and Anopheles albimanus larvae in laboratory conditions. Eleven concentrations (20, 40, 60, 80, 100, 120, 140, 160, 180, 200, 500 ppm) were used on An. Albimanus larvae and eight concentrations ten times smaller (2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16 ppm) were used on Cx. quinquefasciatus larvae. Sixty (60) larvae and a control with 20 larvae were used per concentration. The time of exposure was of 48 hours at a laboratory temperature of 28 ± 2 °C. LC50 and LC95 were determined through the Probit tests. A LC95 of B. sphaericus was found between 6,45 and 7,28 ppm for Cx. quinquefasciatus larvae; whereas LC95 was observed between 450.56 and 466.76 ppm in An. albimanus larvae. O objetivo deste estudo foi testar uma série de concentrações de um produto granulado preparado com Bacillus sphaericus, sobre larvas de Culex quinquefasciatus e Anopheles albimanus em condições de laboratório. Utilizaram-se onze concentrações (20, 40, 60, 80, 100, 120, 140, 160, 180, 200 e 500 ppm) sobre larvas de An. albimanus, e oito concentrações dez vezes menores (2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 e 16 ppm) sobre larvas de Cx. quinquefasciatus. Utilizaram-se 60 larvas e um controle com 20 larvas por concentração. O tempo de exposição foi de 48h, a uma temperatura de 28 ± 2 °C. Para estimar as concentrações letais 50 e 95 utilizou-se o teste Probit. Encontrou-se uma CL95 de B. sphaericus entre 6,45 e 7,28 ppm para larvas de Cx. quinquefasciatus; enquanto que em larvas de An. Albimanus observou-se uma CL95 entre 450,56 e 466,76 ppm.

Campos elétricos pulsados de alta intensidade (CEPAI) constituem um método não-térmico de conservação para alimentos em substituição à pasteurização tradicional. Em comparação ao processamento térmico, os CEPAI, além de serem eficientes na eliminação de micro-organismos e na inativação de enzimas, também minimizam as perdas de sabor, cor, textura, nutrientes e componentes termolábeis dos alimentos. O objetivo desse trabalho foi levantar dados bibliográficos atuais sobre o tema CEPAI, abordando: definição do processo, instalação experimental, efeito da ruptura dielétrica do alimento, efeito sobre micro-organismo, enzimas e constituintes dos alimentos. Os dados encontrados na literatura apontam o tratamento por CEPAI como alternativa promissora para a conservação de alimentos, podendo ser utilizado como tecnologia única ou como complemento aos processamentos térmicos. Pulsed electric fields of high intensity (HIPEF) is a non-thermal food conservation to replace traditional thermal pasteurization. Compared to thermal processing, the HIPEF as well as being effective in removing microorganisms and inactivate enzymes also minimize the loss of flavor, color, texture, nutrients and labile components of food. The aim of this work was to gather bibliographic data current HIPEF on the subject, covering: experimental setup, effects of dielectric breakdown of food, effect on microorganisms, enzymes and constituents of food. The data found in the literature indicate treatment of HIPEF as a promising alternative for food conservation and it could be used as a single technology or in addition to thermal processing.

Métodos analíticos microbiológicos na indústria de alimentos são essenciais para a liberação de lotes de alimentos seguros. Porém, os métodos oficiais aplicados apresentam desvantagens quando comparados com métodos sofisticados, além disso, existe a demanda por novos métodos rápidos e de confiabilidade. Neste sentido, métodos fundamentados em Polymerase Chain Reaction destacam-se como substitutos ou complementares aos métodos convencionais. Assim, o presente artigo possui como objetivo verificar a visão dos gestores de laboratórios microbiológicos quanto à utilização do diagnóstico molecular como auxiliar no controle microbiológico de alimentos. Para verificar a visão dos gestores foi realizada a observação indireta com a aplicação de um questionário semi-estruturado em quatro empresas processadoras de alimentos e duas empresas que terceirizam diagnóstico microbiológico em alimentos, localizadas na região dos Campos Gerais, Paraná. O questionário foi aplicado após a avaliação e pré-teste, os quais permitiram a verificação da estabilidade e confiabilidade. Os resultados apontaram, de modo geral, que a visão dos gestores é positiva, estes destacam os benefícios do emprego de técnicas moleculares, embora apenas uma empresa faça uso do diagnóstico molecular. Foi possível observar que para as empresas se voltarem para a inovação em métodos analíticos é necessário que a legislação brasileira vigente se amplie, pois está focada em métodos que podem oferecer dificuldades de execução, enquanto, existe a possibilidade de aplicação de técnicas confiáveis que não somente as moleculares.

Foi feita a contagem bacteriana de 179 amostras de leite cru refrigerado provenientes de diferentes bacias leiteiras de Minas Gerais, pelos métodos de citometria de fluxo e contagem padrão em placas. Os resultados obtidos pelos diferentes métodos foram analisados através da correlação de Pearson. Houve correlação significativa entre os valores de contagem de psicrotróficos e mesófilos determinados pelo método de referência com os valores de contagem bacteriana total determinados por citometria de fluxo (r = 0,6695 e 0,7008, respectivamente), sendo possível estabelecer equações de regressão linear para a contagem bacteriana obtida por citometria de fluxo em função da contagem de mesófilos (log CBI = 0,701log mesófilos +1,9091) e psicrotróficos (log CBI = 0,4703log psicrotróficos + 3,2784). Não foi possível estabelecer curvas de calibrações para termófilos e termodúricos, pois os coeficientes de correlação obtidos entre a contagem desses micro-organismos e a contagem bacteriana total,determinada por citometria de fluxo, foram baixos (r = 0,2996 e 0,2746, respectivamente). Adicionalmente, foram determinados os coeficientes de correlação entre a contagem de psicrotróficos e os teores de gordura, proteína, lactose e sólidos totais do leite, através da correlação de Spearman. Houve uma fraca correlação negativa (p < 0,01) para os teores de gordura e sólidos totais (r = -0,2198 e -0,1635, respectivamente). Também foi encontrada uma fraca correlação negativa (p < 0,01) entre a contagem de células somáticas (análises realizadas no equipamento Somacount, Bentley) e os teores de sólidos totais (r = -0,1346), e alta correlação entre a contagem de células somáticas e os teores de lactose (r = -0,7180) empregando-se a correlação de Spearman. Não houve correlação entre a contagem bacteriana total e a contagem de células somáticas do leite. Os teores de gordura, proteína, lactose e sólidos totais do leite apresentaram correlações fracas e negativa (p