Este estudio evaluó la sostenibilidad de un conjunto de intervenciones para la prevención del dengue y la diarrea, en 33 escuelas rurales en los municipios de Anapoima y La Mesa, Colombia, dos años post-proyecto. Se midió la sostenibilidad en dos categorías: mantenimiento de los beneficios e intervenciones, e institucionalización y desarrollo de capacidades de la comunidad. Se comparó la sostenibilidad de las intervenciones que fueron distribuidas en cuatro brazos: intervenciones para prevenir la diarrea, para prevenir el dengue, combinadas para prevenir la diarrea y el dengue, y control. El puntaje final de cada brazo se clasificó en uno de cinco niveles de sostenibilidad: regresivo, no sostenible, moderadamente sostenible, sostenible y altamente sostenible. Se compararon los brazos mediante las pruebas ANOVA y Kruskal-Wallis, con un nivel de significancia de 0,05. A los dos años post-proyecto, se observa que el nivel total de sostenibilidad para la prevención de diarrea fue moderadamente sostenible en los cuatro brazos y para dengue no sostenible en tres de los cuatro brazos, sin encontrar diferencias estadísticamente significativas entre estos. También se observa que los niveles de sostenibilidad varían, en cuanto a los beneficios, intervenciones, desarrollo de capacidades e institucionalización. El mantenimiento de los beneficios y de las intervenciones en ambas enfermedades fue más sostenible que la institucionalización y desarrollo de capacidades. Es importante el análisis de estas variables para identificar los diferentes factores que influyen en la sostenibilidad de los proyectos, relacionados con el diseño y ejecución de estos, con el marco organizacional, y con el contexto social. This study evaluated the sustainability of a set of interventions to prevent dengue and diarrhea in 33 rural schools in the municipalities (counties) of Anapoima and La Mesa, Colombia, two years post-project. The study measured sustainability in two categories: maintenance of the benefits and the interventions, and institutionalization and community capacity-building. The sustainability of the interventions was compared across four arms: interventions to prevent diarrhea, to prevent dengue, combined interventions to prevent diarrhea and dengue, and control. The final score for each arm was classified in five levels of sustainability: regressive, not sustainable, moderately sustainable, sustainable, and highly sustainable. The arms were compared with ANOVA and Kruskal-Wallis test, with significance set at 0.05. At two years post-project, the overall sustainability for the prevention of diarrhea was moderate in the four arms, while dengue prevention was not sustainable in three of the four arms, without statistically significant differences. Sustainability levels also varied in terms of benefits, interventions, capacity-building, and institutionalization. Maintenance of benefits and interventions in both diseases was more sustainable than institutionalization and capacity-building. The analysis of these variables is important for identifying the different factors that influence projects’ sustainability, related to their design and execution, organizational framework, and social context. Este estudo avaliou a sustentabilidade de um conjunto de intervenções para a prevenção de dengue e diarreia, em 33 escolas rurais nos municípios de Anapoima e La Mesa, Colômbia, dois anos pós-projeto. A sustentabilidade foi medida em duas categorias: manutenção dos benefícios e intervenções, e institucionalização e desenvolvimento de capacidades da comunidade. Foi comparada a sustentabilidade das intervenções que foram distribuídas em quatro áreas: intervenções para prevenir a diarreia, e também o dengue, combinadas para prevenir a diarreia e o dengue, e o controle. A pontuação final de cada área foi classificada em um entre cinco níveis de sustentabilidade: regressivo, não sustentável, moderadamente sustentável, sustentável e altamente sustentável. As diferentes áreas foram comparadas através das provas ANOVA e Kruskal-Wallis, com um nível de significância de 0,05. Em dois anos pós-projeto, foi observado que o nível total de sustentabilidade para a prevenção de diarreia foi moderadamente sustentável nas quatro áreas e para dengue não sustentável em três das quatro áreas, sem encontrar diferenças estatisticamente significativas entre elas. Também foi observado que os níveis de sustentabilidade variam, em quanto aos benefícios, intervenções, desenvolvimento de capacidades e institucionalização. A manutenção dos benefícios e das intervenções em ambas as doenças foi mais sustentável do que a institucionalização e desenvolvimento de capacidades. É importante o análise destas variáveis para identificar os diferentes fatores que influem na sustentabilidade dos projetos, em relação com o desenho e execução destes, com o marco organizativo, e com o contexto social.