1. Sorghum mastrevirus-associated alphasatellites: new geminialphasatellites associated with an African streak mastrevirus infecting wild Poaceae plants on Reunion Island
- Author
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Sohini Claverie, Arvind Varsani, Pierre Lefeuvre, Jean-Michel Lett, Philippe Roumagnac, Denis Filloux, Murielle Hoareau, Darren P. Martin, Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Arizona State University [Tempe] (ASU), University of Cape Town, Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), European Union (EU) : GURDT I2016-1731-0006632, Agropolis Fondation (Labex Agro - Montpellier, E-SPACE project) : 1504-004, Conseil Regional de la Reunion, CIRAD, and Agropolis Fondation (E-SPACE)
- Subjects
Séquence nucléotidique ,Subfamily ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Genome, Viral ,Poaceae ,Zea mays ,Sorghum arundinaceum ,Genome ,03 medical and health sciences ,Mastrevirus ,Genus ,Virology ,Maize streak virus ,Alphasatellite ,Phylogeny ,Sorghum ,Géminivirus ,Plant Diseases ,H20 - Maladies des plantes ,030304 developmental biology ,Genetics ,0303 health sciences ,Génome ,biology ,030306 microbiology ,Sequence Analysis, DNA ,General Medicine ,biology.organism_classification ,Geminiviridae ,Reunion - Abstract
Nine complete nucleotide sequences of geminialphasatellites (subfamily Geminialphasatellitinae, family Alphasatellitidae) recovered from the wild Poaceae Sorghum arundinaceum collected in Reunion are described and analyzed. While the helper geminivirus was identified as an isolate of maize streak virus (genus Mastrevirus, family Geminiviridae), the geminialphasatellite genomes were most closely related to, and shared ~63% identity with, clecrusatellites. Even though the geminialphasatellite molecules lack an adenine rich-region, they have the typical size of geminialphasatellites, encode a replication-associated protein in the virion sense, and have probable stem-loop structures at their virion-strand origins of replication. According to the proposed geminialphasatellite species and genus demarcation thresholds (88% and 70% nucleotide identity, respectively), the genomes identified here represent a new species (within a new genus) for which we propose the name "Sorghum mastrevirus-associated alphasatellite" (genus "Sorgasalphasatellite").
- Published
- 2020