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Start Over Author "Julia Morere" Topic [sdv]life sciences [q-bio]
4 results on '"Julia Morere"'

1. Apport de la génomique dans la médecine de demain, applications cliniques et enjeux

Author

Lionel Perrier, Guillaume Grenet, Bruno Laviolle, Florence Gaillard-Bigot, Pascal Bilbault, Olivier Perche, Hélène Espérou, Jean-François Guérin, Julia Morere, Julien Thevenon, Caroline Guillot, Élodie Bégué, François Gueyffier, Damien Sanlaville, Pierre-Henry Longeray, Nathalie Varoqueaux, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC CHU Lyon (inserm), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Faculté de Médecine Laennec, Université de Lyon, Lyon, France., Ligue Nationale Contre le Cancer - Paris, Ligue Nationale Contre le Cancer (LNCC), The Lymphoma Academic Research Organisation [Lyon] (LYSARC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Hypoxie : Physiopathologie Respiratoire et Cardiovasculaire (HP2 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Hospices Civils de Lyon, Departement de Neurologie (HCL), Pfizer Oncology, Fédération française des diabétiques, Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Groupe d'Analyse et de Théorie Economique Lyon - Saint-Etienne (GATE Lyon Saint-Étienne), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Centre hospitalier universitaire de Grenoble (CHU de Grenoble), CHU Grenoble, Roche SAS, Neuilly-sur-Seine, France, Laboratoire Roche SAS, AstraZeneca, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ligue Nationnale Contre le Cancer, Hypoxie et physiopathologies cardiovasculaire et respiratoire, Groupe d'analyse et de théorie économique (GATE Lyon Saint-Étienne), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Dao, Taï

Subjects
Thérapeutique, [QFIN]Quantitative Finance [q-fin], [SDV]Life Sciences [q-bio], Questions éthiques, Médecine personnalisée, 030226 pharmacology & pharmacy, [QFIN] Quantitative Finance [q-fin], Séquençage du génome entier, [SDV] Life Sciences [q-bio], 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Pronostic, Pharmacology (medical), Diagnostic
Abstract

International audience; Le séquençage du génome est aujourd’hui accessible à la population mais il n’existe que peu de preuves de son utilité comme outil diagnostique, thérapeutique et pronostique. En France, le plan France médecine génomique 2025 a été lancé en 2015 avec pour objectif d’intégrer les analyses génomiques dans la pratique clinique pour des indications validées et de développer une filière nationale de la médecine génomique incluant des partenariats industriels. Une réflexion sur les applications scientifiques et les enjeux opérationnels et sociétaux est nécessaire afin de formuler des recommandations pour permettre de mieux associer la génomique et la médecine de demain. Dans la perspective d’une médecine factuelle personnalisée, il convient de promouvoir des études avec un niveau d’exigence méthodologique approprié et d’approfondir la définition du niveau de preuve. Les nombreux enjeux opérationnels nécessitent de mettre en place des organisations et des moyens afin de fluidifier le circuit de rendu des résultats ainsi que des adaptations réglementaires sur les statuts des professions impliquées, la gestion des données générées et le consentement des patients. En parallèle des actions de formation en génétique à destination des professionnels de santé et des actions de sensibilisation sur les tests génétiques vis-à-vis du grand public doivent être envisagées. Les enjeux éthiques doivent également être pris en compte, notamment sur la participation du patient aux décisions le concernant en fonction de ses attentes et en intégrant la notion d’incertitude dans l’information délivrée. Les effets sociologiques sur le vécu et les attentes des patients et de la population générale vis-à-vis de la médecine génomique doivent également être évalués pour améliorer l’information, la prévention et l’accompagnement des personnes. Enfin, des études médicoéconomiques doivent être conduites pour éclairer les décideurs sur le caractère coût-efficace du séquençage complet du génome pour la santé des populations.

Published
2019
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2. The contribution of genomics in the medicine of tomorrow, clinical applications and issues

Author

Florence Gaillard-Bigot, Patrice Denèfle, Nathalie Varoqueaux, Damien Sanlaville, Jean-François Guérin, Lionel Perrier, Olivier Perche, Julia Morere, Caroline Guillot, Pascal Bilbault, François Gueyffier, Pierre-Henry Longeray, Guillaume Grenet, Élodie Bégué, Bruno Laviolle, Julien Thevenon, Hélène Espérou, Service de Pharmacologie [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Généthon, Evaluation et modélisation des effets thérapeutiques, Département biostatistiques et modélisation pour la santé et l'environnement [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ligue Nationale Contre le Cancer - Paris, Ligue Nationale Contre le Cancer (LNCC), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Agence de la biomédecine [Saint-Denis la Plaine], Hypoxie : Physiopathologie Respiratoire et Cardiovasculaire (HP2 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération française des diabétiques, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Léon Bérard [Lyon], Groupe d'Analyse et de Théorie Economique Lyon - Saint-Etienne (GATE Lyon Saint-Étienne), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Cytogénétique (HFME), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Roche SAS, Neuilly-sur-Seine, France, Laboratoire Roche SAS, The advent of a new paradigm induced by the massive deployment of high-throughput sequencing raises economic and organisational issues. The evaluation of the production cost of genome sequences shows a notable change in the production costs of a gene panel targeted by next-generation sequencing (NGS) according to indications, enrichment techniques, retained sequencing, or the number of patients per run. In France, for example, the cost per patient (from the receipt of samples to the return of results to prescribers) varies from one to three depending on the laboratories [17]. What about the cost of genome sequencing? One can assume that production costs will largely depend on the organisational model chosen and its ability to integrate multiple technical constraints (prescription portals, automated extraction systems, production platform, IT infrastructure, data analysis, rendering of results, interoperability with patient records, etc.).The medico-economic assessment of the genome-wide sequencing strategy is essential to inform policy makers on the cost-effectiveness (or not) of one or more innovative health strategies compared to the reference strategy (s). These assessments are planned in the pilot projects of the France genomics 2025 plan. This approach has well-known benefits such as the absence (most often) of selection bias. In contrast, the time horizon of the economic evaluation is usually limited to the follow-up period of the trial and differential cost-result ratio (DCRR) is not always expressed in cost per year of life gained in good health. These can also emanate from modelling. The review of the literature published by Schwarze et al. on genome sequencing reports a very limited number (N = 8) of publications including a complete medico-economic assessment (i.e. that integrates economic considerations and clinical efficacy) [18]. Furthermore, the heterogeneity of the efficacy criteria does not favour comparisons between studies. Only one of them expresses the DCRR in cost per year of life gained in good health [19]., Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Roche, Université de Lyon, Ligue Nationnale Contre le Cancer, Hypoxie et physiopathologies cardiovasculaire et respiratoire, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe d'analyse et de théorie économique (GATE Lyon Saint-Étienne), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Dao, Taï, and École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)

Subjects
Big Data, Process (engineering), [SDV]Life Sciences [q-bio], Commodity, Population, education, Genomics, Population health, Therapeutics, Social issues, 030226 pharmacology & pharmacy, [SHS]Humanities and Social Sciences, Translational Research, Biomedical, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Diagnosis, Humans, Genomic medicine, Pharmacology (medical), Precision Medicine, education.field_of_study, Evidence-Based Medicine, business.industry, Ethical issues, Prognosis, Personalized medicine, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Whole genome sequencing, Engineering ethics, France, [SHS] Humanities and Social Sciences, business
Abstract

International audience; Fifteen years after the completion of first human genome sequencing, the technique is almost a commodity but there is still little evidence of its usefulness as a diagnostic, prognostic or therapeutic tool. In France, the France genomics plan 2025 was launched in 2015 with the goal of integrating genomic tests into clinical practice and developing a National genomics network including industrial partnerships. Reflection on scientific applications and operational or societal issues is needed to make recommendations to help better associate Genomics and the medicine of tomorrow. In the perspective of personalized Evidence-based Medicine, studies with an appropriate methodological level to improve the definition of evidence should be promoted. The many operational challenges require the implementation of organisations and means to streamline the process of results reporting, and regulatory adaptations concerning the status of professions involved, the management of data generated, and the consent of patients. In parallel, genetic training for healthcare professionals and raising awareness on genetic tests for the public should be considered. The ethical stake should also be taken into account, especially on the participation of the patient in decisions concerning them and integrating the notion of uncertainty into the information given. The sociological effects on the experience and expectations of patients and the general population towards genomic medicine should also be evaluated to improve information, prevention and support for people. Finally, medico-economic studies must be conducted to inform policy-makers on the cost-effectiveness of complete genome sequencing for population health.

Published
2019
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3. TRF2 and Apollo Cooperate with Topoisomerase 2α to Protect Human Telomeres from Replicative Damage

Author

Annamaria Biroccio, Eric Gilson, Anaïs Poulet, Christelle Lenain, Anna Bizard, Delphine Benarroch, Arturo Londoño-Vallejo, Erica Salvati, Laure Sabatier, Els Verhoeyen, Julia Morere, Jing Ye, Sébastien Britton, Bernard Salles, Yunlin Wu, Angela Maria Rizzo, Marc Nadal, Patrick Calsou, Adelaïde Saint-Léger, Marie Josèphe Giraud-Panis, Frédérique Magdinier, Simon Amiard, Serge Bauwens, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biologie et pathologie des génomes, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Experimental Chemotherapy Laboratory, Regina Elena Cancer Institute, Laboratoire Joliot Curie, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virologie humaine, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-IFR128-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique et microbiologie [Orsay] (IGM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Radiobiologie et d'Oncologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Department of Medical Genetics, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Laboratory of Biology and Pathology of Genomes, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-IFR128-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), and École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], MESH: Antigens, Neoplasm, MESH: DNA Replication, chemistry.chemical_compound, MESH: Protein Structure, Tertiary, 0302 clinical medicine, Telomeric Repeat Binding Protein 2, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cellular Senescence, Genetics, Telomere-binding protein, 0303 health sciences, Nuclear Proteins, MESH: Telomeric Repeat Binding Protein 2, Telomere, DNA-Binding Proteins, MESH: DNA Repair Enzymes, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, MESH: Cell Aging, 030220 oncology & carcinogenesis, DNA supercoil, Cell aging, DNA Replication, DNA damage, DNA repair, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, Antigens, Neoplasm, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, 030304 developmental biology, MESH: DNA Topoisomerases, Type II, Eukaryotic, MESH: DNA Damage, MESH: Humans, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology(all), DNA replication, DNA, Protein Structure, Tertiary, DNA Repair Enzymes, DNA Topoisomerases, Type II, Exodeoxyribonucleases, chemistry, MESH: Telomere, MESH: Nuclear Proteins, MESH: DNA-Binding Proteins, DNA Damage
Abstract

International audience; Human telomeres are protected from DNA damage by a nucleoprotein complex that includes the repeat-binding factor TRF2. Here, we report that TRF2 regulates the 5' exonuclease activity of its binding partner, Apollo, a member of the metallo-beta-lactamase family that is required for telomere integrity during S phase. TRF2 and Apollo also suppress damage to engineered interstitial telomere repeat tracts that were inserted far away from chromosome ends. Genetic data indicate that DNA topoisomerase 2alpha acts in the same pathway of telomere protection as TRF2 and Apollo. Moreover, TRF2, which binds preferentially to positively supercoiled DNA substrates, together with Apollo, negatively regulates the amount of TOP1, TOP2alpha, and TOP2beta at telomeres. Our data are consistent with a model in which TRF2 and Apollo relieve topological stress during telomere replication. Our work also suggests that cellular senescence may be caused by topological problems that occur during the replication of the inner portion of telomeres.

Published
2010
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4. Identification of a perinuclear positioning element in human subtelomeres that requires A-type lamins and CTCF

Author

Frédérique Magdinier, Serge Bauwens, Eric Gilson, Alexandre Ottaviani, Sophie Gazzo, Sylvie Rival-Gervier, Julia Morere, Evelyne Callet-Bauchu, Amina Boussouar, Delphine Rondier, Caroline Schluth-Bolard, Andrea M. Foerster, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Biologie du développement et reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire d'Hématologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), and Magdinier, Frederique

Subjects
CCCTC-Binding Factor, [SDV]Life Sciences [q-bio], Uterine Cervical Neoplasms, Plasma protein binding, Genome, 0302 clinical medicine, Genetics, 0303 health sciences, telomere, General Neuroscience, Subtelomere, Lamin Type A, Female, Insulator Elements, Cell Nucleolus, Protein Binding, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, Down-Regulation, HUMAIN, [SDV.GEN.GH] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Biology, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Article, 03 medical and health sciences, Cell Line, Tumor, Animals, Humans, BIOLOGIE DU DEVELOPPEMENT, [INFO]Computer Science [cs], Molecular Biology, Locus control region, 030304 developmental biology, FSHD, D4Z4, General Immunology and Microbiology, Base Sequence, Carcinoma, genome stability & dynamics, Biological Transport, Epithelial Cells, Locus Control Region, CTCF, Telomere, Repressor Proteins, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Human genome, nuclear periphery, 030217 neurology & neurosurgery, Lamin
Abstract

International audience; The localization of genes within the nuclear space is of paramount importance for proper genome functions. However, very little is known on the cis-acting elements determining subnuclear positioning of chromosome segments. We show here that the D4Z4 human subtelomeric repeat localizes a telomere at the nuclear periphery. This perinuclear activity lies within an 80 bp sequence included within a region known to interact with CTCF and A-type Lamins. We further show that a reduced level of either CTCF or A-type Lamins suppresses the perinuclear activities of D4Z4 and that an array of multimerized D4Z4 sequence, which has lost its ability to bind CTCF and A-type Lamins, is not localized at the periphery. Overall, these findings reveal the existence of an 80 bp D4Z4 sequence that is sufficient to position an adjacent telomere to the nuclear periphery in a CTCF and A-type lamins-dependent manner. Strikingly, this sequence includes a 30 bp GA-rich motif, which binds CTCF and is present at several locations in the human genome.

Published
2009
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