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The objective of this study was to develop a rapid, sensitive detection assay for the quarantine pathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni, causal agent of stone fruit bacterial spot, an economically important disease of Prunus spp. Unique targets were identified from X. arboricola pv. pruni genomes using a comparative genomics pipeline of other Xanthomonas species, subspecies and pathovars, and used to identify specific diagnostic markers. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was then applied to these markers to provide rapid, sensitive and specific detection. The method developed showed unrivalled specificity with the 79 tested strains and, in contrast to previously established techniques, distinguished between phylogenetically close subspecies such as X. arboricola pv. corylina. The sensitivity of this test is comparable to that of a previously reported TaqMan™ assay at 103 CFU mL−1, while the unrivalled speed of LAMP technology enables a positive result to be obtained in

1. Die normale Entwicklung der Meduse vonPodocoryne carnea M.Sars wird aufgrund morphologischer und anatomischer Kriterien in insgesamt 10 Differenzierungsstadien unterteilt. 2. Medusenknospen, die fruhzeitig vom Blastostyl isoliert werden, sind lebensfahig und vollbringen verschiedene Entwicklungsleistungen, deren Art und Haufigkeit vom Entwicklungsalter der Knospe im Moment der Isolation abhangig sind. 3. Junge Medusenknospen der Stadien 1–4 sind nach Isolation einem Dedifferenzierungsprozes unterworfen, der zu einem sog. „Kugelstadium“ fuhrt. Aus diesem morphogenetisch indifferenten Stadium konnen Stolonen und aus diesen wiederum Nahrpolypen entstehen. Dieser von jungen Medusenknospen ausgehende Strukturwandel kann als Metaplasie bezeichnet werden. 4. Altere, in den Stadien 5–8 isolierte Medusenknospen entwickeln sich in der Regel zu Medusen oder medusenahnlichen Gebilden weiter. Der kritische Zeitpunkt, in welchem die Entwicklungsrichtung der Meduse irreversibel festgelegt wird und von dem aus die Differenzierung der Meduse autonom erfolgen kann, liegt zwischen den Entwicklungsstadien 4 und 5. 5. Zellreaggregate, die durch Dissoziation voll ausdifferenzierter Medusen gewonnen wurden, bildeten in wenigen Fallen Stolonen und stolonenahnliche Gebilde. Dies bedeutet, das wenigstens ein Teil der die Meduse aufbauenden Zellen die Fahigkeit zur funktionellen und strukturellen Metaplasie nicht irreversibel verloren hat. 6. Samtliche im Verlaufe dieser Untersuchungen beobachteten Strukturwandlungen fuhrten uber den als niedrigste Realisationsstufe zu bezeichnenden Zustand des Stolo, aus dem unter gunstigen Voraussetzungen die nachsthoheren Stufen (Frespolypen, Blastostyle) hervorgehen konnen.