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78 results on '"Dijon, Institut Agro"'

1. Membrane protective role of autophagic machinery during infection of epithelial cells by Candida albicans

Author: Pierre Lapaquette, Amandine Ducreux, Louise Basmaciyan, Tracy Paradis, Fabienne Bon, Amandine Bataille, Pascale Winckler, Bernhard Hube, Christophe d’Enfert, Audrey Esclatine, Elisabeth Dubus, Marie-Agnès Bringer, Etienne Morel, Frédéric Dalle, Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Plateforme d'Imagerie Cellulaire [Dijon] (CellImaP), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Procédés Microbiologiques et Biotechnologiques (PMB), Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Dispositif Inter-régional d'Imagerie Cellulaire [Dijon] (DImaCell), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ingénierie et biologie cellulaire et tissulaire (IBCT (ex IFR133)), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology (Hans Knoell Institute), Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany], Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), This work was supported by the Regional Council of Bourgogne – Franche Comté, the 'Fonds Européen de DEveloppement Régional (FEDER), the Institut Carnot Qualiment, the University of Burgundy and the Hôpital du Bocage, Dijon, France. This work was supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (KANJI, ANR‐08‐MIEN‐ 033‐01) and a BIOASTER‐Sanofi‐Alliance pour les Sciences de la Vie et de la Santé (AVIESAN) joint program (Candida ‐ BAP110) to Frederic Dalle and Christophe d’Enfert., ANR-08-MIEN-0033,KANJI,Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans(2008), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Université de Franche-Comté (UFC), Dijon, Institut Agro, and Maladies Infectieuses et environnement - Colonisation et invasion de la muqueuse digestive par le champignon pathogène de l'homme Candida albicans - - KANJI2008 - ANR-08-MIEN-0033 - MIE - VALID
Subjects: Microbiology (medical), autophagy, Gastroenterology, RC799-869, [SDV.BC.IC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], Diseases of the digestive system. Gastroenterology, lysosomal exocytosis, [SDV.MP.MYC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Microbiology, epithelial cells, plasma membrane damage, Infectious Diseases, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, candida albicans, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology
Abstract: International audience; Candida albicans (C. albicans) is an opportunistic pathogen causing infections ranging from superficial to life-threatening disseminated infections. In a susceptible host, C. albicans is able to translocate through the gut barrier, promoting its dissemination into deeper organs. C. albicans hyphae can invade human epithelial cells by two well-documented mechanisms: epithelial-driven endocytosis and C. albicans-driven active penetration. One mechanism by which host cells protect themselves against intracellular C. albicans is termed autophagy. The protective role of autophagy during C. albicans infection has been investigated in myeloid cells; however, far less is known regarding the role of this process during the infection of epithelial cells. In the present study, we investigated the role of autophagy-related proteins during the infection of epithelial cells, including intestinal epithelial cells and gut explants, by C. albicans. Using cell imaging, we show that key molecular players of the autophagy machinery (LC3-II, PI3P, ATG16L1, and WIPI2) were recruited at Candida invasion sites. We deepened these observations by electron microscopy analyses that reveal the presence of autophagosomes in the vicinity of invading hyphae. Importantly, these events occur during active penetration of C. albicans into host cells and are associated with plasma membrane damage. In this context, we show that the autophagy-related key proteins ATG5 and ATG16L1 contribute to plasma membrane repair mediated by lysosomal exocytosis and participate in protecting epithelial cells against C. albicans-induced cell death. Our findings provide a novel mechanism by which epithelial cells, forming the first line of defense against C. albicans in the gut, can react to limit C. albicans invasion.
Published: 2022
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2. Potential of microorganisms to decrease the 'beany' off-flavor

Author: Fischer, Estelle, Cayot, Nathalie, Cachon, Rémy, Dijon, Institut Agro, and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: Alcohol dehydrogenase, Volatile compounds, Microorganisms, Aldehyde dehydrogenase, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, "beany" off-flavor
Published: 2022

3. Increased Weight Gain and Insulin Resistance in HF-Fed PLTP Deficient Mice Is Related to Altered Inflammatory Response and Plasma Transport of Gut-Derived LPS

Author: Lorène J. Lebrun, Gaëtan Pallot, Maxime Nguyen, Annabelle Tavernier, Alois Dusuel, Thomas Pilot, Valérie Deckert, Isabelle Dugail, Naig Le Guern, Jean-Paul Pais De Barros, Anissa Benkhaled, Hélène Choubley, Laurent Lagrost, David Masson, Thomas Gautier, Jacques Grober, Dijon, Institut Agro, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Service d'anesthésie - réanimation chirurgicale [CHU de Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Nutrition et obésités: approches systémiques (UMR-S 1269) (Nutriomics), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Plateforme Lipidomique [Dijon] (LAP), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), and CHU Dijon
Subjects: Lipopolysaccharides, Phospholipid transfer protein PLTP, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Lipoproteins, Diet, High-Fat, Weight Gain, Catalysis, Inorganic Chemistry, Mice, lipid metabolism, Animals, Obesity, Physical and Theoretical Chemistry, Phospholipid Transfer Proteins, Molecular Biology, Spectroscopy, Inflammation, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Organic Chemistry, General Medicine, Endotoxemia, Computer Science Applications, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, PLTP (phospholipid transfer protein), LPS (lipopolysaccharides), obesity, inflammation, dietary fat, Insulin Resistance, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Lipopolysaccharides LPS, Dietary fat
Abstract: International audience; Bacterial lipopolysaccharides (LPS, endotoxins) are found in high amounts in the gut lumen. LPS can cross the gut barrier and pass into the blood (endotoxemia), leading to low-grade inflammation, a common scheme in metabolic diseases. Phospholipid transfer protein (PLTP) can transfer circulating LPS to plasma lipoproteins, thereby promoting its detoxification. However, the impact of PLTP on the metabolic fate and biological effects of gut-derived LPS is unknown. This study aimed to investigate the influence of PLTP on low-grade inflammation, obesity and insulin resistance in relationship with LPS intestinal translocation and metabolic endotoxemia. Wild-type (WT) mice were compared with Pltp-deficient mice (Pltp-KO) after a 4-month high-fat (HF) diet or oral administration of labeled LPS. On a HF diet, Pltp-KO mice showed increased weight gain, adiposity, insulin resistance, lipid abnormalities and inflammation, together with a higher exposure to endotoxemia compared to WT mice. After oral administration of LPS, PLTP deficiency led to increased intestinal translocation and decreased association of LPS to lipoproteins, together with an altered catabolism of triglyceride-rich lipoproteins (TRL). Our results show that PLTP, by modulating the intestinal translocation of LPS and plasma processing of TRL-bound LPS, has a major impact on low-grade inflammation and the onset of diet-induced metabolic disorders.
Published: 2022
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4. Evolution de la couverture nuageuse basse de saison sèche sur la façade atlantique de l’Afrique centrale de l’échelle diurne à interannuelle

Author: Vincent Moron, Raffael Aellig, Lewis Backita, Alexandre Berger, Sylvain Bigot, Pierre Camberlin, Thierry Castel, Olivier Champagne, Andreas Fink, Peter Knippertz, Jean Damien Maloba Makanga, Armand Mariscal, Béatrice Morel, Amine Ouhechou, Julien Pergaud, Nathalie Philippon, Gaston Samba, Geneviève Sèze, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Afrique Centrale, [SDV.EE.BIO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Bioclimatology, Modèles CMIP6, Nuages bas, Cycle diurne
Abstract: Malgré son importance bioclimatique, peu d'études se sont intéressées à la couverture nuageuse basse stratiforme de saison sèche (juin-septembre) de la façade Atlantique de l'Afrique Centrale. Grâce à des données in-situ documentant la période 1971-2019, nous montrons que cette couverture nuageuse est sous-estimée par les observations satellites SAFNWC et les modèles CMIP6. Nous identifions trois types de journées : claires, nuageuses la nuit et totalement nuageuses, ces dernières étant plus fréquentes sur la côte et l'intérieur, au vent des Monts de Cristal et de Chaillu. A l'échelle interannuelle, les anomalies de température dans l'Atlantique tropical Sud, le Pacifique équatorial et le bassin du Congo, en modulant les cellules méridienne et zonale de circulation jouent sur la stabilité des basses couches, le cisaillement vertical et in-fine la fréquence des journées les plus nuageuses.
Published: 2022

5. Polyphenols in kombucha: Metabolomic analysis of biotransformations during fermentation

Author: Tran, Thierry, Romanet, Rémy, Roullier-Gall, Chloé, Verdier, François, Martin, Antoine, Schmitt-Kopplin, Philippe, Alexandre, Hervé, Grandvalet, Cosette, Tourdot-Maréchal, Raphaëlle, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Kombucha, Fermentation, Polyphenols, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology
Abstract: Kombucha is a non-alcoholic beverage made of sugared tea that is transformed by a symbiotic consortium of yeasts and bacteria. This beverage is increasingly produced at industrial scale, but its quality standards remain to be defined. Metabolomics analysis was carried out using FT-ICR-MS (Fourier Transform-Ion Cyclotron Resonance-Mass Spectrometry) to understand the chemical transformations induced by the production phases and the type of tea on the non-volatile compounds of kombucha.
Published: 2022

6. Could CTA be a reliable alternative method to identify non-genotoxic substances in Food Contact Material extract ?

Author: Lacour, Théo, Hayrapetyan, Ruzanna, Séverin, Isabelle, Mouche, Isabelle, Finot, Francis, Chagnon, Marie-Christine, Dijon, Institut Agro, GenEvolutioN, École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL), Derttech Packtox, Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Institut Agro Dijon, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; In this work the objective is to minaturize the classical Cell Transformation Assay. In a second step, the aim is to etablish a more specific and sensitive labeling of transformed foci. Finally we would like to identify transcriptomics markers impacted by a Non-intentionally added substances (NIAS).
Published: 2022
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7. Polyphenols in kombucha: impact of infusion time on extraction and investigation of their behavior during 'fermentation'

Author: Tran, Thierry, Grandvalet, Cosette, Verdier, François, Martin, Antoine, Alexandre, Hervé, Tourdot-Maréchal, Raphaëlle, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Kombucha, Fermentation, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Polyphenols, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering
Abstract: Kombucha is a non-alcoholic beverage made of sugared tea that is transformed by a symbiotic consortium of yeasts and bacteria. Polyphenols are expected to be responsible of several health benefits attributed to kombucha consumption, among other metabolites. Evidence point at an enhancement of tea polyphenol bioactivity during kombucha elaboration. This study investigated the impact of tea infusion time and of kombucha "fermentation", on the tea polyphenols and the color. Most of the present experiments have been carried out during a 3 rd year Bachelor training by Shane Fennell from Carlow Institute of Technology (Ireland).
Published: 2022

8. Le fer dans les aliments, la lutte contre le déficit de fer

Author: Cayot, Philippe, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Carence en fer, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Fer dans l'organisme, Sang, Santé humaine, Espérance de vie, Aliment, Corps humain
Published: 2022

9. Effect of Microbial strains on Hexanal

Author: Fischer, Estelle, Cayot, Nathalie, Cachon, Rémy, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology
Abstract: The positive effects of plant-based protein consumption have been reported, nonetheless, several disadvantages suchgrassy or beany off-flavors are encountered (1) and are limiting the consumers acceptance towards these proteins.In this project, we investigated the potential of selected microorganisms to metabolize compounds responsible forthe leguminous off-flavor. Hexanal, well-known as a main contributor to the beany descriptor (2), was chosen for thisstudy.A selection of 16 strains representative of different fermentative types has been used to treat a liquid model matrixcontaining hexanal at 2 mg/L. The strains were applied on the medium at the end of their growing phase. Theinoculum was between 10α and 10α UFC/mL depending on the microorganism. The amounts of hexanal and hexanolat the end of the fermentation were determined using HS-SPME-GC-MS.Hexanal was reduced by all the strains but at different levels, and different amounts of hexanol were produced.Results were discussed regarding the different metabolic pathways of the strains with particular attention to thealcohol dehydrogenase, responsible for the conversion of hexanal into hexanol (3,4,5,6,7). Strains presentingconstitutive alcohol dehydrogenase in their catabolism, like obligatory heterofermentative lactic acid bacteria oracetic acid bacteria, were particularly efficient for the reduction of hexanal.1 Rackis, J. J. et al. (1979). JAOCS, 56, 262-271.2 Warner, K. et al. (1978). JAOCS, 55, 252-256.3 Caplice, E. and Fitzgerald, G. F. (1999). Int. J. Food Microbiol., 50(1-2), 131-149.4 Garrigues, C. et al. (1997). J. Bacteriol., 179 :6, 5282-5287.5 Faria-Oliveira, F. et al. (2013). Food Industry, Intech, 23, 519-547.6 Cruz Ramos, H. et al. (2000). J. Bacteriol., 182(11), 3072-3080.7 Lynch, K. M. et al. (2019). Compr. Rev. Food Sci. Food Saf., 18(3), 587-625.
Published: 2022
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10. Optimiser la régulation biologique des adventices par l’utilisation de couverts végétaux à l’échelle du système de culture

Author: Cordeau, Stéphane, Moreau, Delphine, Rouge, Alicia, Guillemin, Jean-Philippe, Adeux, Guillaume, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, régulation biologique, agroécologie, couverts végétaux, densité de semis, diversité
Abstract: Les couverts végétaux peuvent fournir de nombreux services écosystémiques dont la régulationbiologique des adventices, mais ce n’est pas le service écosystémique qui est principalementmentionné par les agriculteurs. En revanche, il y a une connaissance experte très vaste des couvertsvégétaux, car les agriculteurs expérimentés ont déjà optimisé leur mélange, pour maximiser laproduction de biomasse, la couverture végétale, dans des conditions pédo-climatiques pourtantchangeantes. Mais les combinaisons d’espèces, de densité, de pratiques de gestion sontnombreuses et la connaissance scientifique manque pour identifier des leviers de gestion descouverts végétaux qui assureraient une régulation biologique satisfaisante des adventices, et ce àl’échelle des systèmes de culture. Le fil conducteur de cet article sera de considérer que pouroptimiser la régulation biologique des adventices par les couverts végétaux, ces derniers doiventêtre considérés comme des cultures en tant que telles, tant par le choix des espèces, variétés queleur nombre dans le mélange, leur densité de semis, mais aussi les dates et outils de semis etdestruction. Cet article passe en revue les connaissances acquises sur l’effet de ces leviers degestion des couverts végétaux sur la flore adventice.
Published: 2022

11. Interactions between proteins, phytic acid and calcium in Fava Bean concentrate

Author: Amat, Tiffany, Assifaoui, Ali, Schmitt, Christophe, Saurel, Rémi, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology
Abstract: Interactions between proteins, phytic acid and calcium in Fava Bean concentrate
Published: 2022

12. Directed evolution of oenococcus oeni to improve acid-tolerance reveals fixed beneficial mutations in the citrate locus

Author: Eicher, Camille, Julliat, Frédérique, Coulon, Joana, Favier, Marion, Alexandre, Hervé, Guyot, Stéphane, Reguant, Critina, Grandvalet, Cosette, Dijon, Institut Agro, and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering
Published: 2022

13. Évolution des approches, méthodes et outils de l'agronomie

Author: Boiffin, Jean, Caneill, Jacques, Messéan, Antoine, Trebuil, Guy, Dijon, Institut Agro, and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, [SDV.SA.STA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of agriculture
Abstract: Depuis 1945, le domaine de l’agronomie s’est étendu, ses objets d’étude se sont diversifiés et son bagage conceptuel s’est enrichi : le chapitre précédent a mis en évidence l’accroissement considérable de ce dont traite l’agronomie. Dans le même temps, ses démarche sont elles aussi fortement évolué, du triple point de vue des approches, c’est-à-dire des façons d’aborder et poser les problèmes, des méthodes, qui concernent les cheminements, processus et règles de raisonnement mis en œuvre, et enfin des outils permettant cette mise en œuvre – appareils de mesure, équipements, logiciels, procédures d’observation ou de calcul...
Published: 2022

14. Increased Phospholipid Transfer Protein Activity Is Associated With Markers of Enhanced Lipopolysaccharide Clearance in Human During Cardiopulmonary Bypass

Author: Maxime Nguyen, Thomas Gautier, Guillaume Reocreux, Gaëtan Pallot, Guillaume Maquart, Pierre-Alain Bahr, Annabelle Tavernier, Jacques Grober, David Masson, Belaid Bouhemad, Pierre-Grégoire Guinot, Service d'anesthésie - réanimation chirurgicale [CHU de Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Université de Montpellier (UM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Dijon, Institut Agro
Subjects: medicine.medical_specialty, Lipopolysaccharide, Inflammation, Cardiovascular Medicine, 030204 cardiovascular system & hematology, [SDV.BBM.BM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Lipopolysaccharide transport, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, High-density lipoprotein, Phospholipid transfer protein, Internal medicine, Diseases of the circulatory (Cardiovascular) system, Medicine, Lipoprotein, Original Research, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Triglyceride, business.industry, Cholesterol, Cardiopulmonary bypass, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Endotoxemia, 3. Good health, Endocrinology, chemistry, RC666-701, Phospholipid transfer protein (PLTP), lipids (amino acids, peptides, and proteins), medicine.symptom, Cardiology and Cardiovascular Medicine, business
Abstract: Introduction: Lipopolysaccharide (LPS) is a component of gram-negative bacteria, known for its ability to trigger inflammation. The main pathway of LPS clearance is the reverse lipopolysaccharide transport (RLT), with phospholipid transfer protein (PLTP) and lipoproteins playing central roles in this process in experimental animal models. To date, the relevance of this pathway has never been studied in humans. Cardiac surgery with cardiopulmonary bypass is known to favor LPS digestive translocation. Our objective was to determine whether pre-operative PLTP activity and triglyceride or cholesterol-rich lipoprotein concentrations were associated to LPS concentrations in patients undergoing cardiac surgery with cardiopulmonary bypass.Methods: A post-hoc analysis was conducted on plasma samples obtained from patients recruited in a randomized controlled trial.Total cholesterol, high density lipoprotein cholesterol (HDLc), low density lipoprotein cholesterol (LDLc), triglyceride and PLTP activity were measured before surgery. LPS concentration was measured by mass spectrometry before surgery, at the end of cardiopulmonary bypass and 24 h after admission to the intensive care unit.Results: High PLTP activity was associated with lower LPS concentration but not with inflammation nor post-operative complications. HDLc, LDLc and total cholesterol were not associated with LPS concentration but were lower in patients developing post-operative adverse events. HDLc was negatively associated with inflammation biomarkers (CRP, PCT). Triglyceride concentrations were positively correlated with LPS concentration, PCT and were higher in patients with post-operative complications.Conclusion: Our study supports the role of PLTP in LPS elimination and the relevance of RLT in human. PLTP activity, and not cholesterol rich lipoproteins pool size seemed to be the limiting factor for RLT. PLTP activity was not directly related to post-operative inflammation and adverse events, suggesting that LPS clearance is not the main driver of inflammation in our patients. However, HDLc was associated with lower inflammation and was associated with favorable outcomes, suggesting that HDL beneficial anti-inflammatory effects could be, at least in part independent of LPS clearance.
Published: 2021
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15. Muricholic Acids Promote Resistance to Hypercholesterolemia in Cholesterol-Fed Mice

Author: Erwan Garo, Charles Thomas, Kristina Schoonjans, Dany Gaillard, Maamar Souidi, Jacques Grober, Philippe Besnard, Jean-Paul Pais de Barros, David Masson, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), University of Colorado Anschutz [Aurora], Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Université de Montpellier (UM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Radiobiologie des expositions accidentelles (IRSN/PSE-SANTE/SERAMED/LRAcc), Service de recherche en radiobiologie et en médecine régénérative (IRSN/PSE-SANTE/SERAMED), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Laboratoire de Physiologie de la Nutrition, Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Dijon, Institut Agro, Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire, Fontenay-aux-Roses, Plateforme Lipidomique [Dijon] (LAP), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Equipe NuTox (LNC - U1231) (NUTOX), and Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Muricholic acid, Drug Evaluation, Preclinical, Receptors, Cytoplasmic and Nuclear, Cholesterol, Dietary, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Biology (General), Spectroscopy, 2. Zero hunger, Kidney, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Bile acid, Chemistry, General Medicine, 3. Good health, Computer Science Applications, Blot, medicine.anatomical_structure, Cholesterol, FXR, 030220 oncology & carcinogenesis, lipids (amino acids, peptides, and proteins), LXR, medicine.medical_specialty, Oxysterol, QH301-705.5, medicine.drug_class, Hypercholesterolemia, Article, Catalysis, Bile Acids and Salts, Inorganic Chemistry, 03 medical and health sciences, In vivo, Internal medicine, medicine, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Physical and Theoretical Chemistry, Liver X receptor, QD1-999, Molecular Biology, Organic Chemistry, Cholic Acids, Bile acids, Mice, Inbred C57BL, 030104 developmental biology, Endocrinology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Background and aims: Hypercholesterolemia is a major risk factor for atherosclerosis and cardiovascular diseases. Although resistant to hypercholesterolemia, the mouse is a prominent model in cardiovascular research. To assess the contribution of bile acids to this protective phenotype, we explored the impact of a 2-week-long dietary cholesterol overload on cholesterol and bile acid metabolism in mice. Methods: Bile acid, oxysterol, and cholesterol metabolism and transport were assessed by quantitative real-time PCR, western blotting, GC-MS/MS, or enzymatic assays in the liver, the gut, the kidney, as well as in the feces, the blood, and the urine. Results: Plasma triglycerides and cholesterol levels were unchanged in mice fed a cholesterol-rich diet that contained 100-fold more cholesterol than the standard diet. In the liver, oxysterol-mediated LXR activation stimulated the synthesis of bile acids and in particular increased the levels of hydrophilic muricholic acids, which in turn reduced FXR signaling, as assessed in vivo with Fxr reporter mice. Consequently, biliary and basolateral excretions of bile acids and cholesterol were increased, whereas portal uptake was reduced. Furthermore, we observed a reduction in intestinal and renal bile acid absorption. Conclusions: These coordinated events are mediated by increased muricholic acid levels which inhibit FXR signaling in favor of LXR and SREBP2 signaling to promote efficient fecal and urinary elimination of cholesterol and neo-synthesized bile acids. Therefore, our data suggest that enhancement of the hydrophilic bile acid pool following a cholesterol overload may contribute to the resistance to hypercholesterolemia in mice. This work paves the way for new therapeutic opportunities using hydrophilic bile acid supplementation to mitigate hypercholesterolemia.
Published: 2021
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16. Intra-Abdominal Lipopolysaccharide Clearance and Inactivation in Peritonitis: Key Roles for Lipoproteins and the Phospholipid Transfer Protein

Author: Maxime Nguyen, Gaëtan Pallot, Antoine Jalil, Annabelle Tavernier, Aloïs Dusuel, Naig Le Guern, Laurent Lagrost, Jean-Paul Pais de Barros, Hélène Choubley, Victoria Bergas, Pierre-Grégoire Guinot, David Masson, Belaid Bouhemad, Thomas Gautier, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Université de Montpellier (UM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plateforme Lipidomique [Dijon] (LAP), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Laboratoire de biochimie médicale (CHU de Dijon), Dijon, Institut Agro, Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Laboratoire de biochimie médicale (CHU Dijon)
Subjects: Lipopolysaccharides, 0301 basic medicine, Time Factors, Lipopolysaccharide, sepsis, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Phospholipid transfer protein, Ascitic Fluid, Immunology and Allergy, Phospholipid Transfer Proteins, Original Research, Mice, Knockout, endotoxemia, Chemistry, phospholipid transfer protein, medicine.anatomical_structure, [SDV.IMM.IA]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Adaptive immunology, [SDV.IMM.IA] Life Sciences [q-bio]/Immunology/Adaptive immunology, lipids (amino acids, peptides, and proteins), Peritoneum, Lipoproteins, HDL, Protein Binding, lipopolysaccharides 4, medicine.medical_specialty, Immunology, Peritonitis, 03 medical and health sciences, Peritoneal cavity, Internal medicine, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, medicine, Animals, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Peritoneal fluid, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Fast protein liquid chromatography, RC581-607, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, lipoproteins, Mice, Inbred C57BL, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, Endocrinology, inflammation, Immunologic diseases. Allergy, 030217 neurology & neurosurgery, Lipoprotein
Abstract: IntroductionDuring peritonitis, lipopolysaccharides (LPS) cross the peritoneum and pass through the liver before reaching the central compartment. The aim of the present study was to investigate the role of lipoproteins and phospholipid transfer protein (PLTP) in the early stages of LPS detoxification.Material and MethodsPeritonitis was induced by intra-peritoneal injection of LPS in mice. We analyzed peritoneal fluid, portal and central blood. Lipoprotein fractions were obtained by ultracentrifugation and fast protein liquid chromatography. LPS concentration and activity were measured by liquid chromatography coupled with mass spectrometry and limulus amoebocyte lysate. Wild-type mice were compared to mice knocked out for PLTP.ResultsIn mice expressing PLTP, LPS was able to bind to HDL in the peritoneal compartment, and this was maintained in plasma from portal and central blood. A hepatic first-pass effect of HDL-bound LPS was observed in wild-type mice. LPS binding to HDL resulted in an early arrival of inactive LPS in the central blood of wild-type mice.ConclusionPLTP promotes LPS peritoneal clearance and neutralization in a model of peritonitis. This mechanism involves the early binding of LPS to lipoproteins inside the peritoneal cavity, which promotes LPS translocation through the peritoneum and its uptake by the liver.
Published: 2021
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17. Deletion of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 in myeloid cells worsens hepatic steatosis after a high-fat diet

Author: Bourgeois, Thibaut, Jalil, Antoine, Thomas, Charles, Magnani, Charlène, Le Guern, Naig, Gautier, Thomas, Pais de Barros, Jean-Paul, Bergas, Victoria, Choubley, Hélène, Mazzeo, Loïc, Menegaut, Louise, Josiane Lebrun, Lorène, Van Dongen, Kévin, Xolin, Marion, Jourdan, Tony, Buch, Chloé, Labbé, Jérome, Saas, Philippe, Lagrost, Laurent, Masson, David, Grober, Jacques, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Université de Montpellier (UM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plateforme Lipidomique [Dijon] (LAP), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098) (RIGHT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté]), Laboratoire de biochimie médicale (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de biochimie médicale (CHU Dijon), and Dijon, Institut Agro
Subjects: obesity, AA, arachidonic acid, QD415-436, Biochemistry, LPCAT3, lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, PC, phosphatidylcholine, insulin resistance, lipid metabolism, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, arachidonic acid, steatosis, LPLAT, lyso-PL-acyltransferase, phospholipid, lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 (LPCAT3), 1-Acylglycerophosphocholine O-Acyltransferase, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, PS, phosphatidylserine, macrophages, pPE, plasmalogen, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, inflammation, LPS, lipopolysaccharide, PL, phosphatidylinositol, lipids (amino acids, peptides, and proteins), LXR, liver X receptor, atherosclerosis, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Research Article
Abstract: International audience; Recent studies have highlighted an important role for lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 (LPCAT3) in controlling the PUFA composition of cell membranes in the liver and intestine. In these organs, LPCAT3 critically supports cell-membrane-associated processes such as lipid absorption or lipoprotein secretion. However, the role of LPCAT3 in macrophages remains controversial. Here, we investigated LPCAT3's role in macrophages both in vitro and in vivo in mice with atherosclerosis and obesity. To accomplish this, we used the LysMCre strategy to develop a mouse model with conditional Lpcat3 deficiency in myeloid cells (Lpcat3KOMac). We observed that partial Lpcat3 deficiency (approximately 75% reduction) in macrophages alters the PUFA composition of all phospholipid (PL) subclasses, including phosphatidylinositols and phosphatidylserines. A reduced incorporation of C20 PUFAs (mainly arachidonic acid [AA]) into PLs was associated with a redistribution of these FAs toward other cellular lipids such as cholesteryl esters. Lpcat3 deficiency had no obvious impact on macrophage inflammatory response or endoplasmic reticulum (ER) stress; however, Lpcat3KOMac macrophages exhibited a reduction in cholesterol efflux in vitro. In vivo, myeloid Lpcat3 deficiency did not affect atherosclerosis development in LDL receptor deficient mouse (Ldlr-/-) mice. Lpcat3KOMac mice on a high-fat diet displayed a mild increase in hepatic steatosis associated with alterations in several liver metabolic pathways and in liver eicosanoid composition. We conclude that alterations in AA metabolism along with myeloid Lpcat3 deficiency may secondarily affect AA homeostasis in the whole liver, leading to metabolic disorders and triglyceride accumulation.
Published: 2021
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18. Cardiolipin content controls mitochondrial coupling and energetic efficiency in muscle

Author: Serge Luquet, Vladimir Veksler, Céline Henry, Alexandre Prola, Marie Maurer, Alexandra Malgoyre, Hadrien Chauvin, Stéphane Guyot, Jordan Blondelle, Audrey Solgadi, Frédéric Relaix, Frederic Joubert, Fanny Pilot-Storck, Cindy Gallerne, Jean Demarquoy, Geneviève Derumeaux, F. Dumont, Laurent Guillaud, Laurent Tiret, Julien Ternacle, Mélanie Gressette, Arnaud Mourier, Aymeline Vandestienne, Guillaume Courtin, Marie-France Giraud, Nathalie Koulmann, Nahed Khadhraoui, Jérôme Piquereau, Raphaël G. P. Denis, Julien Castel, Thibaut Molinié, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Signalisation et physiopathologie cardiovasculaire (CARPAT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Unité de Biologie Fonctionnelle et Adaptative (BFA (UMR_8251 / U1133)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Procédés Microbiologiques et Biotechnologiques (PMB), Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut de biochimie et génétique cellulaires (IBGC), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ingénierie et Plateformes au Service de l'Innovation Thérapeutique (IPSIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire de Biologie de l'Exercice pour la Performance et la Santé (LBEPS), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), École du Val de Grâce (EVDG), Service de Santé des Armées, Université Paris-Saclay, Faculté de Pharmacie, 92290 Châtenay-Malabry, France, Plateforme d'Analyse Protéomique de Paris Sud Ouest (PAPPSO), AFM-Téléthon Translamuscle I (#19507) & Translamuscle II (#22946), ANR-12-JSV1-0005,LipidoMyo,Rôle des acides gras à très longue chaîne dans la physiopathologie musculaire(2012), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Dijon, Institut Agro, and Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA)
Subjects: muscle, [SDV]Life Sciences [q-bio], Respiratory chain, Diseases and Disorders, Oxidative phosphorylation, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, 030204 cardiovascular system & hematology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, medicine, Cardiolipin, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Inner mitochondrial membrane, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Research Articles, Fatty acid synthesis, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Multidisciplinary, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, ATP synthase, biology, fungi, food and beverages, SciAdv r-articles, Skeletal muscle, Fatty acid, Cell Biology, mitochondrial, Cell biology, medicine.anatomical_structure, chemistry, biology.protein, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Research Article
Abstract: Decreasing mitochondrial energy-production efficiency in skeletal muscle can confer protection against diet-induced obesity., Unbalanced energy partitioning participates in the rise of obesity, a major public health concern in many countries. Increasing basal energy expenditure has been proposed as a strategy to fight obesity yet raises efficiency and safety concerns. Here, we show that mice deficient for a muscle-specific enzyme of very-long-chain fatty acid synthesis display increased basal energy expenditure and protection against high-fat diet–induced obesity. Mechanistically, muscle-specific modulation of the very-long-chain fatty acid pathway was associated with a reduced content of the inner mitochondrial membrane phospholipid cardiolipin and a blunted coupling efficiency between the respiratory chain and adenosine 5′-triphosphate (ATP) synthase, which was restored by cardiolipin enrichment. Our study reveals that selective increase of lipid oxidative capacities in skeletal muscle, through the cardiolipin-dependent lowering of mitochondrial ATP production, provides an effective option against obesity at the whole-body level.
Published: 2021
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19. Enseigner le travail des agriculteurs à des futurs ingénieurs agronomes

Author: Balard, Eve, Balay, Claire, Cournut, Sylvie, Hostiou, Nathalie, Mugnier, Sylvie, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Enseignement agricole et agronomique, Exploitation agricole, [SDV.SA.STA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of agriculture, [SHS] Humanities and Social Sciences
Published: 2021

20. Intestinal release of biofilm-like microcolonies encased in calcium-pectinate beads increases probiotic properties of Lacticaseibacillus paracasei

Author: Charles Thomas, Laurent Beney, Ali Assifaoui, David Da Silva Barreira, Arnaud Heumann, Jean Guzzo, Aurélie Rieu, Pierre Lapaquette, Romain Briandet, Julie Laurent, Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Université de Montpellier (UM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Dijon, Institut Agro, Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Bourgogne Franche-Comté (UBFC), and INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Male, Lactobacillus paracasei, Osmotic shock, Drug Compounding, [SDV]Life Sciences [q-bio], Capsules, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, Article, lcsh:Microbial ecology, law.invention, Mice, 03 medical and health sciences, Probiotic, Extracellular polymeric substance, Osmotic Pressure, law, In vivo, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Animals, Osmotic pressure, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Cellular microbiology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, Extracellular Polymeric Substance Matrix, 030306 microbiology, Chemistry, Probiotics, Dextran Sulfate, Biofilm, food and beverages, Lacticaseibacillus paracasei, Colitis, biology.organism_classification, Disease Models, Animal, Freeze Drying, Treatment Outcome, Biofilms, Pectins, lcsh:QR100-130, Bacteria, Biotechnology
Abstract: In this study, we show that calcium pectinate beads (CPB) allow the formation of 20 µm spherical microcolonies of the probiotic bacteria Lacticaseibacillus paracasei (formerly designated as Lactobacillus paracasei) ATCC334 with a high cell density, reaching more than 10 log (CFU/g). The bacteria within these microcolonies are well structured and adhere to a three-dimensional network made of calcium-pectinate through the synthesis of extracellular polymeric substances (EPS) and thus display a biofilm-like phenotype, an attractive property for their use as probiotics. During bacterial development in the CPB, a coalescence phenomenon arises between neighboring microcolonies accompanied by their peripheral spatialization within the bead. Moreover, the cells of L. paracasei ATCC334 encased in these pectinate beads exhibit increased resistance to acidic stress (pH 1.5), osmotic stress (4.5 M NaCl), the freeze-drying process and combined stresses, simulating the harsh conditions encountered in the gastrointestinal (GI) tract. In vivo, the oral administration of CPB-formulated L. paracasei ATCC334 in mice demonstrated that biofilm-like microcolonies are successfully released from the CPB matrix in the colonic environment. In addition, these CPB-formulated probiotic bacteria display the ability to reduce the severity of a DSS-induced colitis mouse model, with a decrease in colonic mucosal injuries, less inflammation, and reduced weight loss compared to DSS control mice. To conclude, this work paves the way for a new form of probiotic administration in the form of biofilm-like microcolonies with enhanced functionalities.
Published: 2020
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21. Innovative Magnetic Nanoparticles for PET/MRI Bimodal Imaging

Author: Thomas, Guillaume, Boudon, Julien, Maurizi, Lionel, Moreau, Mathieu, Walker, Paul, Séverin, Isabelle, Oudot, Alexandra, Goze, Christine, Poty, Sophie, Vrigneaud, Jean-Marc, Demoisson, Frédéric, Denat, Franck, Brunotte, François, Millot, Nadine, Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne [Dijon] (LICB), Université de Bourgogne (UB)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Equipe NuTox (LNC - U1231) (NUTOX), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'imagerie préclinique [Centre Georges-François Leclerc] (CGFL), Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER, Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne (ICB), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Dijon, Institut Agro
Subjects: lcsh:Chemistry, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, lcsh:QD1-999, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, technology, industry, and agriculture, Nanoparticles, Imaging agents, Tomography, Article, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Nanostructures
Abstract: International audience; Superparamagnetic iron oxide nanoparticles were developed as positron emission tomography (PET) and magnetic resonance imaging (MRI) bimodal imaging agents. These nanoparticles (NPs), with a specific nanoflower morphology, were first synthesized and simultaneously functionalized with 3,4-dihydroxy-l-phenylalanine (LDOPA) under continuous hydrothermal conditions. The resulting NPs exhibited a low hydrodynamic size of 90 ± 2 nm. The functional groups of LDOPA (-NH2 and -COOH) were successfully used for the grafting of molecules of interest in a second step. The nanostructures were modified by poly(ethylene glycol) (PEG) and a new macrocyclic chelator MANOTA for further ⁶⁴Cu radiolabeling for PET imaging. The functionalized NPs showed promising bimodal (PET and MRI) imaging capability with high r2 and r2∗ (T2 and T2∗ relaxivities) values and good stability. They were mainly uptaken from liver and kidneys. No cytotoxicity effect was observed. These NPs appear as a good candidate for bimodal tracers in PET/MRI.
Published: 2019
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22. Long-term high intake of 9-PAHPA or 9-OAHPA increases basal metabolism and insulin sensitivity but disrupts liver homeostasis in healthy mice

Author: Claire Vigor, Laurence Pessemesse, Jacques Grober, Gilles Fouret, François Casas, Sylvie Gaillet, Charles Coudray, Thierry Durand, Christine Feillet-Coudray, Jean-François Landrier, Florence Bernex, Veronika Paluchova, Laurence Balas, Béatrice Bonafos, Ondrej Kuda, Melha Benlebna, Dynamique Musculaire et Métabolisme (DMEM), Université de Montpellier (UM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Czech Academy of Sciences [Prague] (CAS), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Algerian Ministry of Higher Education and Scientific Research, French Lipid Nutrition Group, National Institute for Agronomic Research, Grant Agency of the Czech Republic, Human Nutrition Department (Alim-H department), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Blood Glucose, Liver Cirrhosis, Male, 0301 basic medicine, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Clinical Biochemistry, Liver steatosis, White adipose tissue, Biochemistry, Mice, 0302 clinical medicine, Fibrosis, Homeostasis, Insulin, chemistry.chemical_classification, Nutrition and Dietetics, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Fatty Acids, Insulin sensitivity, 3. Good health, Liver, 030220 oncology & carcinogenesis, medicine.symptom, medicine.medical_specialty, Adipose Tissue, White, Liver fibrosis, Inflammation, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Animals, FAHFA, Molecular Biology, business.industry, Body Weight, Fatty acid, Metabolism, Glucose Tolerance Test, Lipid Metabolism, medicine.disease, Fatty Liver, Mice, Inbred C57BL, 030104 developmental biology, Endocrinology, chemistry, Basal metabolic rate, Basal Metabolism, Insulin Resistance, Steatosis, Energy Metabolism, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Branched fatty acid esters of hydroxy fatty acids (FAHFAs) are a new family of endogenous lipids recently discovered. Several studies reported that some FAHFAs have antidiabetic and anti-inflammatory effects. The objective of this study was to explore the impact of two FAHFAs, 9-PAHPA or 9-OAHPA, on the metabolism of mice. C57Bl/6J male mice, 6 weeks old, were divided into 3 groups of 10 mice each. One group received a control diet and the two others groups received the control diet supplemented with 9-PAHPA or 9-OAHPA for 12 weeks. Mouse weight and body composition were monitored throughout the study. Some days before euthanasia, energy expenditure, glucose tolerance and insulin sensitivity were also determined. After sacrifice, blood and organs were collected for relevant molecular, biochemical and histological analyses. Although high intake of 9-PAHPA or 9-OAHPA increased basal metabolism, it had no direct effect on body weight. Interestingly, the 9-PAHPA or 9-OAHPA intake increased insulin sensitivity but without modifying glucose tolerance. Nevertheless, 9-PAHPA intake induced a loss of glucose-stimulated insulin secretion. Surprisingly, both studied FAHFAs induced hepatic steatosis and fibrosis in some mice, which were more marked with 9-PAHPA. Finally, a slight remodeling of white adipose tissue was also observed with 9-PAHPA intake. In conclusion, the long-term high intake of 9-PAHPA or 9-OAHPA increased basal metabolism and insulin sensitivity in healthy mice. However, this effect, highly likely beneficial in a diabetic state, was accompanied by manifest liver damage in certain mice that should deserve special attention in both healthy and pathological studies.
Published: 2020
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23. Lemon Juice, Sesame Paste, and Autoclaving Influence Iron Bioavailability of Hummus: Assessment by an In Vitro Digestion/Caco-2 Cell Model

Author: Nicolas Sok, Maya Tueni, Philippe Cayot, Marie-Christine Chagnon, Jacqueline Maalouly, Nour Doumani, Isabelle Severin, Laurence Dahbi, Elias Bou-Maroun, Physico-Chimie de l'Aliment et du Vin (PCAV), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Equipe NuTox (LNC - U1231) (NUTOX), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Faculty of Sciences II [Fanar, Lebanon], Dijon, Institut Agro, Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Faculty of science II [Fanar], Lebanese University [Beirut] (LU), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon
Subjects: Food processing and formulation, Health (social science), 030309 nutrition & dietetics, Iron uptake by Caco-2 cells, Plant Science, lcsh:Chemical technology, Health Professions (miscellaneous), Microbiology, Article, law.invention, 03 medical and health sciences, 0404 agricultural biotechnology, Iron dialysis, Plant-based food, In vivo, law, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, lcsh:TP1-1185, Food science, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, biology, Chemistry, Mediterranean and middle-eastern cuisine, Cell model, In vitro digestion, 04 agricultural and veterinary sciences, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Hummus, 040401 food science, 3. Good health, Bioavailability, Ferritin, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Caco-2, biology.protein, Lemon juice, Atomic absorption spectroscopy, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Non-heme iron, Food Science
Abstract: Hummus, an iron-containing plant-based dish mainly made from chickpea pur&eacute, e, tahini, lemon juice and garlic, could be a valuable source of iron when bioavailable. Since the processing and formulation of food influence iron bioavailability, the present study investigated for the first time, their effects on hummus. Firstly, iron bioaccessibility was assessed on eight samples (prepared according to the screening Hadamard matrix) by in vitro digestion preceding iron dialysis. Then, iron bioavailability of four selected samples was estimated by the in vitro digestion/Caco-2 cell model. Total and dialyzable iron were determined by the atomic absorption spectrometry and ferritin formation was determined using an ELISA kit. Only autoclaving, among other processes, had a significant effect on iron bioaccessibility (+9.5, p &lt, 0.05). Lemon juice had the highest positive effect (+15.9, p &lt, 0.05). Consequently, the effect of its acidic components were investigated based on a full factorial 23 experimental design, no significant difference was detected. Garlic&rsquo, s effect was not significant, but tahini&rsquo, s effect was negative (&minus, 8.9, p &lt, 0.05). Despite the latter, hummus had a higher iron bioavailability than only cooked chickpeas (30.4 and 7.23 ng ferritin/mg protein, respectively). In conclusion, hummus may be a promising source of iron, further in vivo studies are needed for confirmation.
Published: 2020
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24. L’ignorance et la dépendance, facteurs d’apprentissage dans les interactions de tutelle au travail

Author: Patrick Mayen, Dijon, Institut Agro, Unité Propre - Développement Professionnel et Formation (Eduter) (DPF), AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut Éduter
Subjects: Continuing professional development, Political science, Formation professionnelle continue, [SHS] Humanities and Social Sciences, Tutorat, Humanities, Apprentissage, [SHS]Humanities and Social Sciences, Education
Abstract: National audience; L’objet de cet article est de montrer l’importance de l’ignorance et de la dépendance dans l’apprentissage. L’une et l’autre peuvent être des facteurs positifs. C’est aussi le rôle des tuteurs de prendre en charge l’ignorance et la dépendance, et parfois de les susciter pour en faire des moyens d’apprendre. Trois cas empiriques sont mobilisés pour défendre cette thèse.
Published: 2017
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25. Intelligence professionnelle du formateur-accompagnateur de transitions professionnelles : activités d’adaptation et de coopération dans quatre dispositifs d’accompagnement

Author: Auricoste, Caroline, Cerf, Marianne, Orly, Paul, Département Sciences pour l'Action et le Développement (DEPT SAD), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés (LISIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-ESIEE Paris-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Formation et apprentissages professionnels (FoAP), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne), Association RPDP, Université de Sherbrooke, Dijon, Institut Agro, Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne), and Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SHS.EDU]Humanities and Social Sciences/Education, [SHS.EDU] Humanities and Social Sciences/Education, coopération, activité du formateur, adaptation, expérience, affects, [SHS] Humanities and Social Sciences, Activité du formateur, Mots-Clés Activité du formateur, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract: International audience; A partir de notre expérience de quatre dispositifs visant la reconfiguration de l’activité dans le cadre de transitions professionnelles, nous chercherons à éclairer l’activité du formateur/accompagnateur dans ses dimensions adaptative, coopérative et attentive à la part sensible et émotionnelle des situations. Nous porterons un regard dans ces expériences sur l’articulation entre diagnostic, animation et évaluation, en nous inspirant du concept de diagnostic en situation dynamique (Hoc et Amalberti, 1994) et sur l’intelligence professionnelle collective pour mener, adapter et articuler ces différentes étapes à plusieurs.
Published: 2019

26. Sociologie des changements de pratiques en agriculture : L’apport de l’étude des réseaux de dialogues entre pairs

Author: Compagnone, Claude, Centre d'Economie et de Sociologie Rurales Appliquées à l'Agriculture et aux Espaces Ruraux (CESAER), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dijon, Institut Agro, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Sociologie, Environnement socio-économique, Pratique agricole
Abstract: Cet ouvrage a bénéficié du soutien financier de l’UMR Cesaer (AgroSup Dijon-INRA).Référence eBook [ePub] : 02637EPB; International audience; Cet ouvrage rend compte de la façon dont les dynamiques de changements de pratiques des agriculteurs sont liées à la structure des réseaux de dialogues professionnels dans lesquels ils sont insérés. Développant une analyse des réseaux sociaux, il montre comment, du fait de certaines caractéristiques de ces réseaux, les agriculteurs se trouvent socialement plus ou moins bien armés pour mettre en œuvre de nouvelles pratiques plus respectueuses de l’environnement.Dans son argumentation, l’ouvrage s’appuie sur la présentation de quatre études de cas.Ces études ont été choisies car : 1) elles permettent d’appréhender les réseaux de dialogues des agriculteurs à des échelles spatiales différentes (la commune, le bassin versant, un canton ou un espace non prédéfini) ; 2) elles s’intéressent à des types de production variés (vigne, culture de banane, céréaliculture ou élevage) ; 3) elles se centrent sur l’étude de réseaux complets ou personnels. En prenant appui sur ces études de cas, la littérature sur la question de la diffusion des innovations et des changements de pratiques en agriculture est discutée ; les dispositifs d’enquête mis en œuvre et les analyses des réseaux effectuées sont présentés ; les grands enseignements, théoriques, méthodologiques et pratiques, tirés de ces travaux sont exposés.Cet ouvrage est en open access : https://www.quae-open.com/produit/120/9782759230754/sociologie-des-changements-de-pratiques-en-agriculture
Published: 2019

27. How to design a cost-effective policy of wetland selection for water quality preservation in agricultural landscape?

Author: Martin, Elsa and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.SA.AEP] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics
Abstract: Wetlands are the interface between land and water – simultaneously providing benefits and imposing costs on local communities. On the one hand, water percolates through wetlands, providing a cleaning process beneficial to society. This cleaning process is particularly important in agricultural landscape where pollution from pesticides or nutrients are widespread. Yet, on the other hand, wetlands are costly for agricultural production since they are unproductive land.
Published: 2019

28. Lebanese pita extracts with presence of trace elements: hazard assessment

Author: Séverin, Isabelle, Bou-Maroun, Elias, Akiki, Rita, Zoghbi, Ghiwa, Lebbos, Nada, Ouaini, Rosette, Chebib, Hanna, Afram, Michel, Curmi, Pierre, DAOU, CLAUDE, Chagnon, Marie-Christine, Equipe NuTox (LNC - U1231) (NUTOX), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Physico-Chimie de l'Aliment et du Vin (PCAV), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Biochemistry Department, Faculty of Science - Section II, Lebanese UniversityJdeidet, Lebanon, Agricultural Research Institute, Heavy Metals department, Biogéosciences [UMR 6282] [Dijon] (BGS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, French Society of Genetic Toxicology (SFTG), Dijon, Institut Agro, Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Biogéosciences [UMR 6282] (BGS), and Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: inorganic chemicals, 2. Zero hunger, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [SPI]Engineering Sciences [physics], [SPI] Engineering Sciences [physics], [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; Among Trace Elements (TE) that can be present in food, some are known to be toxic and must be monitored. Regarding food safety, it is relevant to study the case of the pita, since it represents a large part of the daily diet of the Lebanese population. In a previous study, the Lebanese Agricultural Research Institute (LARI) analyzed the presence of several TE (arsenic, cadmium, cobalt, chromium, mercury, nickel and lead) in white Lebanese pita. Although the toxicity of each TE is known individually, it is important to test the toxicity of the mixture of TE, present in the bread, in order to check the presence of "cocktail" effects between TE, especially synergism.
Published: 2019
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29. L'enseignement de la durabilité sociale en élevage dans les formations agricoles de niveau bac+2 ou +3

Author: Ghibaudo, Sarah, Herbert, Caroline, Raymond, Marie, Mugnier, Sylvie, AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), RMT Travail en élevage, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and Dijon, Institut Agro
Subjects: Durabilité sociale, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Enseignement supérieur agricole, Formation agricole, Elevage
Abstract: Etude menée de novembre 2017 à mars 2018 dans le cadre du projet Phace C; L'évolution de la société vis-à-vis de l'élevage, l'agrandissement des structures et la diminution de la main-d'oeuvre, l'évolution des attentes des éleveurs vis-à-vis de leur travail (plus de temps libre, de weekends) et la diversification des formes d'agricultures (traditionnelle, agro-écologique, de firme, de précision…) rendent la prise en compte du pilier social du déve-loppement durable, incontournable. L'enseignement supérieur agricole, en formant les futurs acteurs de l'élevage, est une des cibles privilégiée d'une réflexion menée dans le cadre du RMT Travail en élevage, sur l'amélioration de la prise en compte de la durabilité sociale. Cette étude exploratoire réalise un premier état des lieux de la prise en compte de la durablité sociale en élevage dans l'enseignement supérieur agricole de niveau BTS ou licence. Des données recueillies auprès de 19 enseignants et 100 étudiants Ces données portaient sur la définition de la durabilité sociale, les thèmes enseignés en lien avec cette notion, les modalités d'enseignement et les améliorations pour une meilleure prise en compte de cette thématique en formation initiale. Les informations collectées auprès des enseignants ont été retranscrites le plus exhaustivement possible afin de conserver leur richesse et de ne pas déformer les propos. Les réponses des étudiants au questionnaire en ligne ont été triées, homogénéisées et ordonnées dans un tableur avec, pour variables, les questions posées. Une analyse quantitative de ces données (mise en gra-phique et tests statistiques) a ensuite été effectuée. Des entretiens semi-directifs ont été conduits auprès d'enseignants de BTS et licence professionnelle. Les questionnaires étudiants ont été élaborés de manière à être diffusés sur internet afin de maximiser le taux de réponse et proposent donc des questions plutôt fermées.
Published: 2018

30. Erosion des sols viticoles et adaptation aux changements : vulnérabilité, diagnostic et stratégie d'adaptation. De l’adaptation des pratiques à la réorganisation des vignobles

Author: Follain, Stéphane, Fayolle, Etienne, Noll, Dorothéa, Quiquerez, Amélie, Dijon, Institut Agro, Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), IHEV Institut des hautes études de la vigne et du vin, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Bordeaux Sciences Agro [Gradignan], Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Changins Haute Ecole de Viticulture et Oenologie, Archéologie, Terre, Histoire, Sociétés [Dijon] (ARTeHiS), Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: Viticulture, Erosion, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Adaptation, [SDV.SA.SDS] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Changements globaux, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Pertes en terre
Abstract: International audience
Published: 2018

31. Increasing herd sizes on Franche-Comte daily farms place grazing systems under strain

Author: Gaillard, Claire, Mougenot, C., Granger, Sylvie, Petit, Sandrine, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Imagerie moléculaire et fonctionnelle: de la physiologie à la thérapie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-IFR8-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Economie et de Sociologie Rurales Appliquées à l'Agriculture et aux Espaces Ruraux (CESAER), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-IFR8-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Centre d'Economie et de Sociologie Rurales Appliquées à l'Agriculture et aux Espaces Ruraux ( CESAER ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Dijon, Institut Agro, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: International audience; In the Franche Comte region, where Comte cheese is produced, dairy herd sizes are increasing; this trend matches what is seen on a broader scale. However, in this region, common intensive farming and livestock feeding practices are framed by cheese certification requirements. In this study, we administered a survey to 24 dairy farmers whose herd sizes exceeded 80 cows. Despite having large herds, farmers were able to maintain grazing-based systems by 0 rethinking field patterns and animal parcel assignments; ii) differentially managing grasslands (e.g., tightly controlling grazing, overseeding permanent grasslands, and developing temporary grasslands); and iii) exploiting complementary forms of forage (e.g., grass or maize green feed, hay). These shifts, which respect regional regulations, could weaken local production systems.
Published: 2017

32. Activité de conception du formateur et formation professionnelle

Author: Guérin, Jérôme, Olry, Paul, Chaliès, Sébastien, Centre de Recherche sur l'Education, les apprentissages et la didactique (CREAD EA 3875), Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Brestois des Sciences de l'Homme et de la Société (IBSHS), Université de Brest (UBO), Unité Propre - Développement Professionnel et Formation (Eduter) (DPF), Institut Éduter-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Education, Formation, Travail, Savoirs (EFTS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA), AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Formateur, [SHS.EDU]Humanities and Social Sciences/Education, [SHS.EDU] Humanities and Social Sciences/Education, 05 social sciences, 050301 education, 0501 psychology and cognitive sciences, Conception de formation professionnelle, 0503 education, 050104 developmental & child psychology
Abstract: International audience; Parmi la diversité des activités menées par les formateurs, celle relative à la conception des situations et/ou dispositifs de formation, est peu étudiée et, de fait, reste à ce jour encore assez méconnue. La préoccupation première de ce dossier thématique est de permettre au lecteur d'avoir accès à des contributions qui, à partir d'ancrages théoriques et de méthodologies différents mais aussi de terrains d'étude singuliers (agriculture, enseigne-ment, etc.), étudient l'activité de conception. Les contributions retenues au sein de ce dossier permettent de couvrir trois types d'enjeux en matière de conception des situations et/ou dispositifs de formation. Certaines étudient comment et dans quelle mesure l'activité de conception du formateur parvient à prendre en considération les contraintes et les aménagements nécessaires au passage de la transmission/acquisition des savoirs au développement de compétences singulières chez les formés. D'autres contributions interrogent plutôt la place du métier, objet de formation plus ou moins objectivité et formalisé, au cœur de l'activité de conception. À ce titre, elles posent des problématiques connexes telles que par exemple celle relative au statut des formateurs et à la nature de leur expertise. Enfin, certaines contributions étudient plus spécifiquement comment concevoir des situations et/ou dispositifs de formation dont l'objectif serait de participer à la construction de compétences plus générales (par exemple les « soft skills » relatives au travail en équipe, à la pensée critique, etc.) de plus en plus attendues dans de nombreux domaines professionnels.
Published: 2017

33. Diversifier les types d'animaux dans les élevages : quelle diversité ? quel(s) intérêt(s) ? comment la piloter pour en tirer partie sur le long terme ?

Author: Cournut, Sylvie, Magne, M.-A, Mugnier, Sylvie, OLLION, Emilie, Sabatier, R., Dijon, Institut Agro, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ISARA-LYON (ISARA-LYON), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche d'Écodéveloppement (ECODEVELOPPEMENT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Territoires (Territoires), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ISARA-Lyon, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.SA.ZOO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Zootechny, Agroécologie, [SDV.SA.ZOO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Zootechny, Système d'élevage, gestion de troupeaux, Zootechnie
Abstract: Inra SAD, groupe zootechnie
Published: 2017

34. In vitro hazard assessment of nanoparticles developed for biomedical applications

Author: Luce, Annette, Saibi, Y, Séverin, Isabelle, Boudon, Julien, Millot, Nadine, Chagnon, Marie-Christine, Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne (LICB), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Derttech Packtox, Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne (ICB), Dijon, Institut Agro, and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain
Abstract: Nanotechnology is a growing sector in industry for twenty years and nanomaterials are currently used in numerous industrials applications. Their interest is based on their dimensions and their shape that give them very particular technological and biological properties. However, the development of these nanoparticles, their industrial preparation and integration into various products already involve an initial increased of human exposure (via inhalation, percutaneous and oral route). Another exposure pathway exists and is represented by drug injections. The risks associated with these new technologies and new products are still unclear. After a characterization step (zeta potential, TEM, TGA, DLS, XPS, IR measurements …), different toxicological endpoints were analyzed in vitro. However, bioassay protocols need to be adapted to nanoparticles. Cytotoxicity was assessed with the RNA synthesis inhibition assay, which is an early very sensitive sublethal bioassay. Oxidative stress was detected using DCF-DA assay for a sensitive and rapid quantitation of oxygen-reactive species. For genotoxicity, the comet assay performed in presence of Formamido-Pyrimidine-Glycosylase (FPG) detects low levels of DNA damage relative to DNA oxidative damage. Finally a short-term cell transformation assay (CTA) was performed, using the Bhas 42 cell line to distinguish between tumor initiators and promotors properties. Nanoparticles (SPIONs and titanate nanotubes (TiONts)) didn't induce any cytotoxic, genotoxic and oxidative response after a 24h treatment with concentrations up to 100 µg/mL in the human HepG2 cell line. However, TiONts induced a positive dose dependent response in the CTA assay at the initiation step (1-10 µg/mL).
Published: 2016

35. Reliable bioassays to detect potential hazard of paperboard food contact material extracts

Author: Souton, Emilie, Dahbi, Laurence, Nury, Thomas, Aljawish, Abdulhadi, Séverin, Isabelle, Chagnon, Marie-Christine, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, Physiologie de la Nutrition et Toxicologie (NUTox) (U866, Lipides et nutrition, équipe 7) (NUTox), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Laboratoire Bio-PeroxIL. Biochimie du Peroxysome, Inflammation et Métabolisme Lipidique (Bio-PeroxIL), Université de Bourgogne (UB), and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain
Abstract: Food contact materials (FCM) represent a major economic issue and a large field of innovation. Food packaging production must be in compliance with the European Regulation 1935/2004: the third article specifies that FCM must not transfer their constituents to food in quantities which could endanger human health under normal or foreseeable conditions of use. Indeed, these materials are not inert and, in addition to started substances, Non-Intentionally Added Substances (NIAS) are able to be released into the food. NIAS can be contaminants from recycled materials, impurities, synthetic residues, new substances formed along the packaging production chain… Then, NIAS could represent a larget part of migrating substances which are not risk assessed, some being unpredictabled (Grob et al., 2006 ; Skejevrak et al., 2005). The European Regulation 10/2011 on plastic materials, multilayers and articles intended to come into contact with food regulates NIAS. It requires that the notion of the risk engendered by a substance concerns the substance itself, the impurities of this substance and any reaction or degradation products that are foreseeable in the context of the intended use. However there are currently no available guidelines to assess the risk of NIAS. They may also be present in other FCM than plastics, such as paper and boards... Because of the complex nature of FCM extract, it is pertinent to evaluate the potential toxicity of FCM as a whole taking into account any « cocktail effect ». The objectives of this study are to provide to packaging and food companies scientific relevant tools combining physicochemical and toxicological strategies based on bioassays applied to FCM extracts, especially paper and boards. Four toxicological endpoints were checked as relevant for low dose exposure: cytotoxicity, genotoxicity , oxidative stress and endocrine disruption activities.
Published: 2016

36. Transformations des conditions de travail en élevage et santé des éleveurs

Author: Madelrieux, Sophie, Dasse, Florian, Macquart, Colette, Depoudent, Caroline, Pupin-Ruch, Marion, Destrez, Alexandra, Gaillard, Claire, Marec, Céline, de Torcy, Bertrand, Pailleux, Jean-Yves, Rousset, Nathalie, Sicard, Gabrielle, Tourne, Mathias, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Caisse Centrale de la Mutualité Sociale Agricole (CCMSA), Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne (CRAB), Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Mutations des activités, des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF)-ENITA Clermont-AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Technique de l'Aviculture (ITAVI), Inter AFOCG, RMT Travail en Elevage, Réseau Mixte Technologique 'Travail en élevage', Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), ITAVI, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Santé des travailleurs agricoles, Relation Homme-Animal, Eleveurs de bétail, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.NEU.SC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Cognitive Sciences, [SDV.SA.ZOO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Zootechny, Elevage bovin, Elevage, [SDV] Life Sciences [q-bio], Condition de travail, [SDV.SA.ZOO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Zootechny, [SDV.NEU.SC] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Cognitive Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience; La question de la santé au travail devient l'un des quatre axes structurant du programme actuel (2014-2018) du RMT Travail avec la Mutualité Sociale Agricole (MSA) devenue partenaire du réseau. Ungroupe mixte se constitue, avec des ingénieurs conseil directement impliqués sur les questions desanté au travail et de prévention13 des risques professionnels en agriculture, et des zootechniciens,non spécialistes de ces questions, qui dans leurs entretiens auprès d’éleveurs entendent desexpressions de fatigues, de difficultés, mais aussi des satisfactions de retrouver du sens à leur métier,après des changements individuels ou collectifs.
Published: 2015

37. HACD1, a regulator of membrane composition and fluidity, promotes myoblast fusion and skeletal muscle growth

Author: S. Blot, Fanny Pilot-Storck, Yusuke Ohno, Anaëlle Rahier, Nicolas Blanchard-Gutton, Inès Barthélémy, Geneviève Aubin-Houzelstein, Alexandre Prola, Sébastien Storck, Richard J. Piercy, Jean Demarquoy, Vincent Gache, Laurent Tiret, Marie Maurer, Gemma Walmsley, Frédéric Relaix, Arnaud Ferry, Laurent Guillaud, Akio Kihara, Stéphane Guyot, Stéphanie Gadin, Jordan Blondelle, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hokkaido University [Sapporo, Japan], Procédés Microbiologiques et Biotechnologiques (PMB), Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Thérapie des maladies du muscle strié, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bourgogne (UB), Comparative Neuromuscular Diseases Laboratory, Royal Veterinary College, Dijon, Institut Agro, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Subjects: Male, [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Cellular differentiation, Generalized muscle weakness, Biology, Muscle Development, centronuclear myopathy, Cell Line, Myoblasts, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Myoblast fusion, Mice, 0302 clinical medicine, Dogs, VLCFA, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Genetics, medicine, Myocyte, Animals, Humans, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, MUFA, Centronuclear myopathy, Muscle, Skeletal, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Mice, Knockout, 0303 health sciences, PTPLA, Cell Membrane, Skeletal muscle, Cell Differentiation, Cell Biology, General Medicine, Articles, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, medicine.disease, Congenital myopathy, Lysophosphatidylcholine, medicine.anatomical_structure, LPC, chemistry, Biochemistry, Female, Protein Tyrosine Phosphatases, lpc, mufa, ptpla, vlcfa, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; The reduced diameter of skeletal myofibres is a hallmark of several congenital myopathies, yet the underlying cellular and molecular mechanisms remain elusive. In this study, we investigate the role of HACD1/PTPLA, which is involved in the elongation of the very long chain fatty acids, in muscle fibre formation. In humans and dogs, HACD1 deficiency leads to a congenital myopathy with fibre size disproportion associated with a generalized muscle weakness. Through analysis of HACD1-deficient Labradors, Hacd1-knockout mice, and Hacd1-deficient myoblasts, we provide evidence that HACD1 promotes myoblast fusion during muscle development and regeneration. We further demonstrate that in normal differentiating myoblasts, expression of the catalytically active HACD1 isoform, which is encoded by a muscle-enriched splice variant, yields decreased lysophosphatidylcholine content, a potent inhibitor of myoblast fusion, and increased concentrations of ≥C18 and monounsaturated fatty acids of phospholipids. These lipid modifications correlate with a reduction in plasma membrane rigidity. In conclusion, we propose that fusion impairment constitutes a novel, non-exclusive pathological mechanism operating in congenital myopathies and reveal that HACD1 is a key regulator of a lipid-dependent muscle fibre growth mechanism.
Published: 2015
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38. Use of reliable bioassays to detect potential hazard of food contact materials extracts to ensure quality, safety and innovation of paperboards

Author: Marie-Christine Chagnon, Isabelle Severin, E. Souton, Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: 0303 health sciences, Food contact materials, 9. Industry and infrastructure, General Medicine, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, Toxicology, Hazard, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, Packaging, Food, Environmental health, Quality safety, Environmental science, 030217 neurology & neurosurgery, 030304 developmental biology
Abstract: International audience; Food contact materials (FCM) represent a major economic issue and also an important field of innovation for packaging industries. Food packaging production must currently meet manufacturing good practices, safety for human health and thus be in compliance with the article 3 of the European Regulation 1935/2004: “Material and articles in contact with food do not transfer substances in amounts which could endanger human health…”.
Published: 2015

39. Les espèces adventices, indispensables à la production agricole dans les systèmes à bas intrants

Author: Gaba, Sabrina, Perrot, Thomas, Caneill, Jacques, Bretagnolle, Vincent, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 (CEBC), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), GCHP2E, GIS - Grande Culture à Hautes Performances Economiques et Environnementales, France., Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR), GIS - Grande Culture à Hautes Performances Economiques et Environnementales (GCHP2E). FRA., Centre d'études biologiques de Chizé (CEBC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, agroécologie, adventices, herbicides, service écosystémiques, biodiversité, production agricole, pollinisation, socio-écosystème agricole, Herbicides, Pollinisation, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, Agroécologie, Adventices, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, Production agricole, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Service écosystémiques, Biodiversité
Abstract: National audience; Le défi principal de l’agriculture aujourd’hui est la conception de systèmes de culture (SdC) permettant de limiter le recours aux intrants chimiques, tout en régulant les bio-agresseurs des cultures et en maintenant le potentiel de production et le revenu des exploitants agricoles. La flore adventice est un exemple emblématique de ce défi et un obstacle majeur aux objectifs du plan Ecophyto ; les herbicides représentent une part importante des produits phytosanitaires utilisés. L’agroécologie repose sur le postulat que la biodiversité, de par ses fonctions et les services écosystémiques (ex. biocontrôle, pollinisation) qu’elle sous-tend, pourrait compenser l’usage d’intrants chimiques (fertilisants, pesticides). Or, à ce jour, peu d’études ont validé ce postulat. Les services rendus par la biodiversité pour la production agricole reste à quantifier. C’est précisément l’objectif du projet ANR Agrobiose (2014-2018). Dans ce projet, qui s’inscrit dans la problématique du plan ECOPHYTO, nous testons l’hypothèse que la diminution d’usage d’herbicides permettra une augmentation de la diversité adventice, mais également de pollinisateurs et d’agents de contrôle biologique. Cette augmentation de biodiversité permettra en retour un maintien voire une augmentation de la production agricole avec les services de régulation (biocontrôle, pollinisation) qu’elle fournit. Les espèces adventices sont à la base de réseaux trophiques dans les milieux agricoles. Elles jouent un rôle crucial de support de la biodiversité dans les agroécosystèmes. Les graines des espèces adventices sont des ressources pour les insectes carabidés (Marshall et al. 2003) mais également pour des espèces d’oiseaux migratrices comme l’alouette des champs (Eraud et al. 2015). Les espèces adventices fournissent également du pollen et du nectar pour les insectes pollinisateurs sauvages, y compris les abeilles domestiques (Rollin et al. 2013, Requier et al. 2015). Or la diversité adventice a diminué de manière drastique depuis les années 1950’s (Sutcliffe & Kay 2000, Hyvönen et al. 2007). Cette perte de biodiversité est notamment remarquable chez les espèces adventices rares (Richner et al. 2015), c’est-à-dire les espèces déjà peu fréquentes et abondantes dans les parcelles. Cette perte de diversité adventice a pour origine l’utilisation massive d’herbicides dans l’objectif de maximiser les rendements des cultures annuelles. Les espèces adventices des grandes cultures conduiraient en effet à des pertes de rendement allant jusqu’à 23% dans le monde (mais actuellement de 8% ; Oerke 2006) du fait de la compétition pour les ressources (eau, azote, lumière) avec les plantes de culture. Même si cet impact est largement admis, de nombreuses études remettent en question l’amplitude de cet impact, 37 Actes des rencontres sur la gestion durable des adventices en grandes cultures 15 décembre 2015 notamment dans le blé, culture dominante dans les rotations (Steckel et al. 1990, Salonen 1992, Hamill and Zhang 1995, Zhang et al. 2000). Dans cette présentation, nous exposerons les premiers résultats issus du projet ANR Agrobiose en trois temps. Dans un premier temps, nous présenterons les résultats d’une expérimentation menée en 2013 et 2014 avec et chez des agriculteurs de la Zone Atelier de « Plaine & Val de Sèvre » (http://www.za.plainevalsevre.cnrs.fr/) dont l’objectif était de quantifier la compétition entre culture et plantes adventices dans une large gamme de systèmes de cultures. Dans cette expérimentation, nous avons manipulé l’apport de fertilisation azotée et les traitements herbicides afin de quantifier l’effet de ces deux pratiques sur la diversité adventice, et l’effet de diversité sur la production agricole de céréales d’hiver. Les résultats mettent en évidence (i) une absence de relation entre usage d’herbicides (IFT, Indice de Fréquence de Traitement) et la production agricole et, (ii) une production de biomasse adventice équivalente entre les parcelles à faible et à fort IFT. Dans un deuxième temps, nous présenterons des résultats sur l’effet de la pollinisation entomophile sur la production agricole de cultures oléagineuses (colza et tournesol). Environ 35% des principales cultures dans le monde dépendent des services de pollinisation (Klein et al. 2007). Depuis 2013, nous avons entrepris de quantifier l’effet de la pollinisation entomophile sur la production de colza et de tournesol en situations réelles. L’analyse des résultats des années 2013 et 2014, montre qu’en absence totale de pollinisateurs, la production agricole chute de 50 à 75% (T. Perrot, Thèse). Enfin, dans un troisième temps, nous présenterons un cadre conceptuel, synthétisant ces éléments et des résultats obtenus par ailleurs (Bretagnolle & Gaba 2015), qui met en évidence le rôle clé des espèces adventices dans la fourniture à la fois (1) de services d’approvisionnement en assurant la production de cultures oléagineuses et de miel, (2) de services de régulation en assurant la survie des abeilles mellifères en l'absence de cultures de graines oléagineuse et (3) de services culturels en améliorant la survie d’espèces végétales, d’insectes pollinisateurs patrimoniaux, et la valeur socio-culturelle des paysages. L’ensemble de ces éléments questionne l’usage systématique des traitements herbicides et démontre que la présence des espèces adventices dans les agroécosystèmes est en réalité indispensable pour assurer la production agricole à l’échelle du système de production.
Published: 2015

40. Using the concept of functional economy to explore the spatial and environmental challenges associated with sustainable mobility

Author: Drut, Marion, Economie Quantitative, Intégration, Politiques Publiques et Econométrie (EQUIPPE), Université de Lille, Droit et Santé-PRES Université Lille Nord de France-Université de Lille, Sciences Humaines et Sociales-Université de Lille, Sciences et Technologies, Université de Lille 1, Alain Ayong Le Kama, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Sustainable mobility, Economie de la fonctionnalité, Mobilité durable, Fonctional economy, JEL: R - Urban, Rural, Regional, Real Estate, and Transportation Economics/R.R4 - Transportation Economics, [SHS.ECO] Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance
Abstract: Traffic congestion, parking problems, and air pollution constitute contemporary challenges affecting especially urban areas. These concerns are intertwined and mutually reinforcing ; there is thus a need to address them jointly. Using the concept of functional economy (FE), this thesis attempts to go beyond the traditional compartmentalized approach. More specifically, this study investigates the role of a function-based transportation system, and namely of sharing the uses, in addressing jointly the spatial and environmental issues associated with sustainable mobility. After a short presentation of the concept of FE and its application to transportation (essay 1), we examine the role of sharing the uses in addressing spatial and environmental issues (essay 2). Then, we highlight the mechanisms underlying the rivalry of use affecting parking (essay 3), as well as the impact of local air pollution on labor productivity (essay 4). This thesis allows putting into perspective transportation infrastructure projects or policies through a two-angle analysis of the issues associated with mobility. First, transportation policies are explored from a spatial perspective, with space considered as a scarce resource in open access and whose consumption from transportation modes is subject to a shadow cost and to rivalry. Then, the link between enhanced accessibility and increased local air pollution from transportation is drawn, and the analysis reveals that accounting for environmental impacts leads to more accurate assessments of the expected agglomeration gains., La congestion automobile, les difficultés de stationnement, et la pollution atmosphérique constituent des enjeux contemporains affectant particulièrement les zones urbaines. Ces enjeux se renforcent mutuellement et appellent des mesures conjointes. Cette thèse propose de dépasser les approches cloisonnées en utilisant le concept d’économie de la fonctionnalité (EF). Plus précisément, cette étude explore le rôle d’un système de transport basé sur la fonction, et notamment sur le partage des usages, dans la résolution des problématiques spatiales et environnementales liées à la mobilité durable. Après avoir présenté le concept d’EF et son application au domaine de la mobilité (article 1), nous explorons le rôle du partage des usages dans la résolution des problématiques spatiales et environnementales (article 2). Nous mettons ensuite en lumière les mécanismes sous-tendant les rivalités d’usage liées au stationnement (article 3), ainsi que l’impact de la pollution atmosphérique locale sur la productivité du travail (article 4). Cette thèse permet de mettre en perspective les projets d’infrastructures ou les politiques de transport par une analyse des problématiques liées à la mobilité sous deux angles distincts. Tout d’abord, les politiques de transport sont explorées en lien avec l’espace pris comme une ressource rare en libre accès et dont la consommation par les modes de transport a un coût implicite et est sujette à rivalité. Ensuite, le lien entre meilleure accessibilité et hausse de la pollution atmosphérique locale est fait et l’analyse montre que la prise en compte des impacts environnementaux conduit à une estimation plus fine des gains d’agglomération attendus.
Published: 2014

41. Influence de la teneur en matière organique sur les propriétés de rétention d’eau et de retrait des technosols construits

Author: Deeb, Maha, Lerch, Thomas, Blouin, Manuel, Pando, Anne, Podwojewski, Pascal, Grimaldi, Michel, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), iEES Paris, Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Dijon, Institut Agro, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], Technosol construit, [SDV]Life Sciences [q-bio], Matière organique
Abstract: Pas de résumé, Influence de la teneur en matière organique Influence de la teneur en matière organique sur les propriétés de rétention d'eau et de retrait des technosols construits
Published: 2014

42. Mucin and α-amylase, the main salivary proteins, impact on aroma release

Author: Pagès-Hélary, Sandy, Guichard, Elisabeth, Canon, Francis, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dijon, Institut Agro, ProdInra, Migration, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: saliva, interaction, Protéine salivaire, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, stomatognathic diseases, fluids and secretions, aroma, stomatognathic system, [SDV.MHEP.OS] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Sensory Organs, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Aromes, [SDV.MHEP.OS]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Sensory Organs, protein, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience;  These data will be analyzed in regard to the following saliva parameters:  Amylase activity  Lipolytic activity  Anhydrase carbonic quantification  Lipocalines quantification  Total proteins quantity  Saliva viscosity  Saliva Flow Materials and Method  Tested molecules:  Static headspace analyses: 40min of equilibration at 30°C  Medium tested
Published: 2014

43. Impacts of Integrated Weed management in cropping systems on N2O emissions from soils

Author: Vermue, Anthony, Hénault, Catherine, Coffin, Arnaud, Munier-Jolain, Nicolas, Nicolardot, Bernard, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de recherche Science du Sol (USS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Global Research Alliance on Agricultural GreenHouse Gases., Unité de Recherche de Science du Sol d'Orléans (UR SOLS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), The Cropland Group Global Research Alliance on Agricultural GreenHouse Gases., Unité de Science du Sol (Orléans) (URSols), Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, and Dijon, Institut Agro
Subjects: [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, n2o, émission de gaz, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, mesure de gaz, Sciences de la Terre, Protoxyde d'azote, Pratique culturale, Modélisation, Earth Sciences, Milieux et Changements globaux, [SDV.SA.SDS] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Gaz à effet de serre, sol agricole, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2014

44. Metabolism of n-Butyl Benzyl Phthalate in the Female Wistar Rat. Identification of New Metabolites

Author: Jean-Claude Lhuguenot, I Valentin, K. Picard, C. Nativelle, Marie-Christine Chagnon, Unité mixte de recherche de toxicologie alimentaire, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Dijon, Institut Agro, and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
Subjects: Metabolite, Phthalic Acids, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, Urine, 010501 environmental sciences, Toxicology, 01 natural sciences, Gas Chromatography-Mass Spectrometry, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Pharmacokinetics, Plasticizers, Female rat, Metabolites, Animals, Toxicokinetics, n-butyl benzyl phthalate, Rats, Wistar, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, Benzoic acid, 0303 health sciences, Chromatography, Molecular Structure, Hippurates, Phthalate, Hippuric acid, General Medicine, Rats, 3. Good health, Phthalic acid, Teratogens, Metabolism, Diazomethane, [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, chemistry, Female, Oxidation-Reduction, Food Science
Abstract: International audience; n-Butyl benzyl phthalate (BBP), a plasticizer used in polyvinylchloride (PVC) and other polymers, has been orally administered to female Wistar rats with four doses (150, 475, 780 and 1500 mg/kg body weight/day) for 3 consecutive days. Metabolites recovered in urines were analysed by gas chromatography±mass spectrometry (GC±MS) after 24, 48 and 72 hours. Six metabolites were identi®ed. Mono-n-butyl phthalate (MBuP) and mono-n-benzyl phthalate (MBeP) represented respectively 29± 34% and 7±12 % of the total recovered metabolites. Hippuric acid, the main metabolite of benzoic acid, represented the second major metabolite (51±56%). Phthalic acid, benzoic acid and an o-oxidized metabolite of MBuP were also recovered in urine but in small quantities. BBP was never identi®ed in urines. Total urinary metabolites recovery represented 56% of the dose administered in the ®rst 24 hours. However, total recovery decreased when the dose increases (43% at 780 mg/kg body weight/ day, only 30% at 1500 mg/kg body weight/day). Whatever the time was, BBP metabolites recovered in urines were all present and in the same proportions for the two lowest doses. Discrepancy in metabolites quantities expressed as percentages of the dose observed in urine of rat treated with the highest BBP dose disappeared with time as MBuP, MBeP and hippuric acid recovery has signi®cantly increased at day 3. Metabolic pro®le of BBP in female rats has been established. The aim of the present study is to identify further the active(s) agent(s) involved in the BBP malformations and teratogenic eects. # 1999 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
Published: 1999
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45. The optimization of extrusion condition of Phatthalung Sungyod rice extrudate: a preliminary study

Author: Keawpeng, Ittiporn, Charunuch, Chulaluck, Roudaut, Gaëlle, Meenune, Mutita, Dijon, Institut Agro, Faculty of Agricultural Technology, Institute of Food Research and Product Development, Kasetsart University, Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), and Faculty of Agro-Industry
Subjects: Optimization, Extrusion cooking, Physicochemical properties, Brown rice, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Methodology, Response surface, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering
Abstract: International audience; Phatthalung Sungyod rice flour was supplied to extrude in a co-rotating twin screw extruder. The effects of extrusion conditions such as, barrel temperature (135-165oC), screw speed (300-400 rpm) and feed moisture contents (12.5-17.5%) on physicochemical properties of rice extrudate and the optimized condition were studied by the use of response surface methodology (RSM). The second-order polynomials were used to model the product response as a function of process variables and the multiple regression equations were obtained to describe effect of each variable on product responses. Barrel temperature, screw speed and feed moisture content had significant effects on density, expansion ratio, water absorption index (WAI), water solubility index (WSI) and hardness of rice extrudate. They were most affected by the changes in the level of feed moisture content and barrel temperature. At low feed moisture content and high temperature, rice extrudate appeared to be expanded with low density and more crispness. WAI and WSI of extrudate increased with increase barrel temperature and decrease feed moisture content. The hardness of rice extrudate varied between 23.31 and 54.24 N. At the highest feed moisture content, the lowest barrel temperature and screw speed, the highest value of product’s hardness was obtained. The optimized extrusion condition for produced rice extrudate was at low feed moisture (12.5%), low screw speed (300 rpm) and high barrel temperature (165oC). With this condition, the well expansion, low product density and more crispness of extruded snack were obtained.
Published: 2014

46. CelG from Clostridium cellulolyticum: a multidomain endoglucanase acting efficiently on crystalline cellulose

Author: Chantal Tardif, Christian Gaudin, Sandrine Pagès, Anne Belaich, Laurent Gal, Jean-Pierre Belaich, Institut de biologie structurale et microbiologie (IBSM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Dijon, Institut Agro
Subjects: Cellulase, Biology, Protein Engineering, Clostridium cellulolyticum, Microbiology, Substrate Specificity, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Clostridium, Bacterial Proteins, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Escherichia coli, medicine, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Binding site, Cellulose, Molecular Biology, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Binding Sites, 030306 microbiology, Protein engineering, Cellulose binding, biology.organism_classification, Recombinant Proteins, Carboxymethyl cellulose, Biochemistry, chemistry, biology.protein, Research Article, medicine.drug
Abstract: International audience; The gene coding for CelG, a family 9 cellulase from Clostridium cellulolyticum, was cloned and overexpressed in Escherichia coli. Four different forms of the protein were genetically engineered, purified, and studied: CelGL (the entire form of CelG), CelGcat1 (the catalytic domain of CelG alone), CelGcat2 (CelGcat1 plus 91 amino acids at the beginning of the cellulose binding domain [CBD]), and GST-CBD(CelG) (the CBD of CelG fused to glutathione S-transferase). The biochemical properties of CelG were compared with those of CelA, an endoglucanase from C. cellulolyticum which was previously studied. CelG, like CelA, was found to have an endo cutting mode of activity on carboxymethyl cellulose (CMC) but exhibited greater activity on crystalline substrates (bacterial microcrystalline cellulose and Avicel) than CelA. As observed with CelA, the presence of the nonhydrolytic miniscaffolding protein (miniCipC1) enhanced the activity of CelG on phosphoric acid swollen cellulose (PASC), but to a lesser extent. The absence of the CBD led to the complete inactivation of the enzyme. The abilities of CelG and GST-CBD(CelG) to bind various substrates were also studied. Although the entire enzyme is able to bind to crystalline cellulose at a limited number of sites, the chimeric protein GST-CBD(CelG) does not bind to either of the tested substrates (Avicel and PASC). The lack of independence between the two domains and the weak binding to cellulose suggest that this CBD-like domain may play a special role and be either directly or indirectly involved in the catalytic reaction.
Published: 1997
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47. Émotions et cognition animale, ou comment l'éthologie cognitive permet d'accéder au monde affectif des animaux de ferme

Author: Boissy, Alain, Destrez, Alexandra, Coulon, Marjorie, Veissier, Isabelle, Deiss, Véronique, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Dijon, Institut Agro
Subjects: Ethics, animal de ferme, cognition animale, émotion, agneau, bien-être animal, [SDV.ETH] Life Sciences [q-bio]/Ethics, pratique d'élevage, [SDV.ETH]Life Sciences [q-bio]/Ethics, adaptation comportementale, Ethique, [ SDV.ETH ] Life Sciences [q-bio]/Ethics, éthologie appliquée, relation homme animal
Abstract: L'évaluation du bien-être des animaux d'élevage nécessite une bonne compréhension des expériences affectives des animaux, y compris de leurs émotions. Néanmoins, les émotions ne peuvent être inférées chez les animaux qu’à partir des réactions comportementales et physiologiques étant donné l’absence de langage verbal. De plus ce sont des réactions transitoires alors que le bien-être est un état affectif plus durable. Notre objectif est de rapporter la démarche expérimentale que nous avons mise en oeuvre sur les ovins pour démontrer qu’il est possible d’accéder aux expériences affectives des animaux. Cette démarche s’inspire de travaux en psychologie humaine sur la relation intime entre émotions et cognition. Dans une première section, nous montrons comment des processus cognitifs simples que l'animal utilise pour évaluer son environnement, sont à l’origine de ses émotions. Dans une deuxième section, nous montrons comment les émotions peuvent influencer ces processus cognitifs, lesquels en retour modulent les émotions. Cette boucle de rétroaction permet de comprendre le passage des émotions à un état affectif persistant assimilable à l’état de bien-être ou de mal-être. Dans une troisième section, nous nous intéressons aux processus d’évaluation susceptibles de déclencher des émotions positives. Nous y discutons de l’intérêt de cette démarche pour contribuer au développement de pratiques d’élevage innovantes basées sur la sensibilité des animaux et leurs compétences cognitives, répondant ainsi à un souci éthique d’amélioration du bien-être des animaux tout en tenant compte de l’efficacité économique des productions.
Published: 2013

48. Chimie des couleurs et investigations préliminaires en police scientifique

Author: Dujourdy, Laurence, Santin, Bénédicte, Soto, Thierry, Institut National de Police Scientifique (INPS), and Dijon, Institut Agro
Subjects: [CHIM.ANAL] Chemical Sciences/Analytical chemistry, Réaction de Griess, presumptive tests, Réactif de Bratton-Marshall, explosives, Explosif, Test de Scott et de Marquis, Stupéfiants, Tests orientation colorimétriques, reaction mechanisms, Complexe de Meisenheimer, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Forensic science, Criminalistique, controlled substance, [PHYS.PHYS.PHYS-DATA-AN] Physics [physics]/Physics [physics]/Data Analysis, Statistics and Probability [physics.data-an], [PHYS.PHYS.PHYS-DATA-AN]Physics [physics]/Physics [physics]/Data Analysis, Statistics and Probability [physics.data-an]
Abstract: National audience; La mise en oeuvre de réactions colorimétriques pour l'identification de molécules, ou de familles de molécules, est une stratégie analytique simple, peu onéreuse et robuste, qui reste très utile pour de nombreux applicatifs de la vie courante. Ces tests, dits d'orientation, offrent également diverses applications dans la chaîne de l'enquête scientifique. Par delà leurs limites de spécificité, une bonne utilisation de ces tests, qui continuent à être étudiés et améliorés, permet d'avoir une première orientation, pouvant être capitale dans une enquête de police. Cet article présente quelques exemples d'analyses appliquées aux stupéfiants et aux explosifs.
Published: 2013

49. Cellular and molecular aspects of fat metabolism in the small intestine

Author: Hélène Carlier, A. Bernard, Isabelle Niot, Philippe Besnard, Laboratoire de Physiologie de la Nutrition, Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), and Dijon, Institut Agro
Subjects: Medicine (miscellaneous), Fatty Acid-Binding Proteins, Myelin P2 Protein, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Intestine, Small, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, medicine, Animals, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Nutrition and Dietetics, Chemistry, Tumor Suppressor Proteins, Fatty Acids, Lipid metabolism, Dietary Fats, Small intestine, Neoplasm Proteins, medicine.anatomical_structure, Gene Expression Regulation, Biochemistry, Carrier Proteins, Fatty Acid-Binding Protein 7, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; No abstract
Published: 1996
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50. Functional ecology for evaluating and predicting the aptitude of permanent grassland to provide services

Author: Duru, M., Jouany, C., Theau, J. -P., Granger, Sylvie, Cruz, P., Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Dijon, Institut Agro, AGrosystèmes et développement terrItoRial ( AGIR ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], flexibility of management, grass, pasture management practices, [SDV]Life Sciences [q-bio], forage production, seasonal variations, Biodiversity, grassland typology, nutritive value, nitrogen, fertilisation, [SHS]Humanities and Social Sciences, [SDV] Life Sciences [q-bio], functional composition, environmental factor, vegetation, [SDE]Environmental Sciences, forage system, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, utilization value of grasslands, services provided by grassland, permanent pasture, estimation method
Abstract: National audience; Applying the principles of functional ecology helps better predict the services which can be provided by permanent grassland. Farming practices and environmental characteristics influence the functional composition of grassland. Functional plant types have a generic effect on forage services which can be assessed. 13 types of grassland composed of distinct functional types were defined based on 1,283 sample grassland fields located on 8 sites. This approach was validated by checking 8 Ellenberg indicator values (used to evaluate environmental characteristics and farming practices) against climatic data and descriptive data for farming practices. The interest of a functional approach is discussed as a means of understanding the structure of plant communities, estimating the effect of changes in climatic conditions and farming practices, and predicting input services and services not included in farm income.; La difficulté de prédire les services rendus par les prairies permanentes par une approche phytosociologique ou bien par des descripteurs des pratiques et du milieu peut être levée par l'application des concepts et principes de l'écologie fonctionnelle. Dans une première partie, nous montrons comment ils peuvent être mobilisés pour définir des types de plantes qualifiés de fonctionnels car répondant de manière générique aux caractéristiques de l'environnement et aux pratiques, et ayant des effets génériques sur les services fourragers. Dans une deuxième partie, nous examinons la pertinence de l'approche pour 1 283 prairies réparties sur 8 sites (Alpes, Auxois, Aveyron, Aubrac, Jura, Normandie, Pays Basque et Pyrénées centrales). Nous définissons 13 types de prairies correspondant à des assemblages distincts de types fonctionnels ; l'environnement et les pratiques étant caractérisés d'une part par 8 indices d'Ellenberg et d'autre part par des données climatiques et des descripteurs des pratiques. Dans une troisième partie, nous discutons de l'intérêt de l'approche fonctionnelle pour comprendre la structuration des communautés, estimer les effets de changements concernant le climat et les pratiques, puis prédire des services intrants et hors revenu agricole.
Published: 2013

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