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DESCRIPTION OF PARACOCCUS ONUBENSIS SP. NOV. Paracoccus onubensis (o.nu′ ben.sis, N.L. masc. adj. onubensis, pertaining to Onuba, the Roman name of Huelva, the province where the organism was first isolated). Cells are facultatively anaerobic, non-motile, Gram-stainnegativeandnon-endospore-forming.Theyare 0.5–0.7µm×1.2– 1.8µm in diameter, grow in pairs or singly (Fig. S4). Colonies on marine agar are 0.5–1.3mm in diameter, circular, convex, smooth and have entire margins. Good growth at 10–37°C, optimal at 20–30°C and weak growth at 8 and 42°C. Tolerates up to 12% NaCl, with optimum growth within 3–5% (v/w) NaCl. Growth occurs at pH 5.0–9.0, with an optimum at pH 5.0–6.0. Catalase- and oxidase-positive. It grows heterotrophically with various carbon sources and chemoautotrophically with thiosulfate under aerobic conditions. D-Glucose,L-galactose, D -mannose,D-mannitol, N -acetylglucosamine, maltose, potassium gluconate, adipate, malate, citrate and phenylacetate can be utilized as carbon sources. Utilizes sodium nitrate, ammonium sulphate, sodium glutamate, casamino acids and peptone as sole nitrogen sources. Produces acid from D,L-arabinose, aesculin, D -fructose, D-fucose, D-galactose, D-glucose, D-mannose, D-ribose andD,L-xylose; weakly from D-adonitol,L-arabitol, L-fucose, glycerol, D-lyxose, maltose, melibiose, sucrose and trehalose. Negative for amygdalin, D-arabitol, arbutin, dulcitol, gentibiose, glycogen, inositol, inulin, lactose, melezitose, methyl α-D-glucopyranoside, methyl α-D-mannopyranoside, methyl β- D-xylopyranoside, N -acetylglucosamine, potassium gluconate, potassium 2-ketogluconate, potassium 5-ketogluconate, raffinose, L-ramnose, salicin, D-sorbitol, L-sorbose, starch, D -tagatose, turanose and xylitol. Reduces nitrate to nitrite. Hydrolyses aesculin and Tween 20, and does not hydrolyse DNA, casein or Tweens 40 and 80. Produces alkaline phosphatase, esterase (C4), esterase lipase (C8), leucine arylamidase, valine arylamidase, cystine arylamidase, acid phosphatase, naphthol- AS-BI-phosphohydrolase and α-glucosidase. Assimilates glucose, arabinose, mannose, mannitol, N -acetyl-glucosamine, maltose, potassium gluconate, adipic acid, malate, trisodium citrate and phenylacetic acid, but does not assimilate capric acid. The most abundant fatty acid is C 18:1 ω7 c. Ubiquinone-10 is the major respiratory quinone. The polar lipids are diphosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, phosphatidylglycerol and an unidentified aminolipid, an unidentified glycolipid and unidentified polar lipid. The G+C content of the type strain is 60.3 mol%. The type strain, 1011MAR3 C25 T (=CECT 9092 T =LMG 29414 T), was isolated from white biofilms on the walls of the cave Gruta de las Maravillas, Aracena (Huelva, Spain)., Published as part of Gutierrez-Patricio, Sara, Gonzalez-Pimentel, Jose L., Miller, Ana Zelia, Hermosin, Bernardo, Saiz-Jimenez, Cesareo & Jurado, Valme, 2021, Paracoccus onubensis sp. nov., a novel alphaproteobacterium isolated from the wall of a show cave, pp. 1-10 in International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (004942) (004942) 71 (8) on page 8, DOI: 10.1099/ijsem.0.004942, http://zenodo.org/record/6224160

Programa de Doctorado en Biotecnología, Ingeniería y Tecnología Química, Línea de Investigación: Biotecnología Microbiana, Clave Programa: DBI, Código Línea: 11, Los ambientes subterráneos son sistemas singulares caracterizados por condiciones específicas como la ausencia de luz natural, escasez de nutrientes y temperatura y humedad constantes, las cuales definen un complejo escenario para el desarrollo de la vida. Los tubos de lava forman parte de estos ambientes, diferenciándose de otras formaciones subterráneas por su origen volcánico. Una vez se ha formado el tubo de lava, los microorganismos colonizan sus paredes y techos interactuando con el sustrato, desempeñando un papel relevante en los ciclos globales de nutrientes, así como permitiendo la biomineralización y formación de espeleotemas y otras estructuras de origen biogénico. La diversidad microbiana de los tubos de lava es compleja. Comunidades quimiolitoautótrofas y heterótrofas están representadas por grupos taxonómicos a nivel de filo, comunes en la mayoría de los tubos de lava estudiados globalmente. Los grupos más abundantes son Proteobacteria y Actinobacteria, filos bien conocidos por su dinamismo metabólico y que han sido el centro de atención para la ciencia e industria. En los últimos años, ha tomado relevancia la exploración de fuentes alternativas para la obtención de nuevos antibióticos debido a la aparición de bacterias multirresistentes. Los mecanismos que componen el resistoma en las bacterias son muy antiguos y extendidos entre las comunidades microbianas. Por lo tanto, el estudio de estos elementos podría ayudar a diseñar estrategias para combatir la resistencia a antibióticos. A principios del siglo XX, el descubrimiento de la penicilina supuso el inicio de la edad de oro de los antibióticos, siendo el suelo la principal fuente de aislamiento de microorganismos utilizados para tal fin. Ya a finales del citado siglo, las mejoras tecnológicas permitieron la exploración de los océanos, aumentando las opciones de identificar nuevos compuestos bioactivos de origen microbiano. Las condiciones específicas de las cuevas y otros ambientes subterráneos, junto con los avances en materia de secuenciación del ADN, podrían definir a estos ecosistemas como una importante fuente de metabolitos secundarios. Los microorganismos de los tubos de lava de las Islas Canarias (España) no han sido explorados con anterioridad, ofreciendo una oportunidad única para estudiar la microbiología subterránea y su potencial uso biotecnológico. Así, se implementaron métodos dependiente e independiente de cultivos para describir la diversidad microbiana en los tubos de lava y el descubrimiento de nuevas especies de bacterias. Las metodologías independientes de cultivo se centraron en los estudios de los marcadores 16S e ITS usando técnicas de clonación y secuenciación masiva de nueva generación (NGS). La clonación se utilizó inicialmente para comparar las comunidades totales y metabólicamente activas mediante el aislamiento del ADN y ARN de las muestras ambientales. Se identificaron los filos Proteobacteria y Actinobacteria como los grupos más relevantes en todas las muestras estudiadas, destacando el filo Actinobacteria en los estudios del ARN. Las distancias geográficas entre las muestras no parecieron ser una característica determinante para la diferenciación de la diversidad, ya que dos muestras más distantes presentaron comunidades microbianas más semejantes que en otras más próximas. La aplicación de técnicas de NGS en una segunda fase de la tesis supuso el estudio de un mayor número de muestras a analizar. El filo más abundante en casi todas las muestras fue Proteobacteria, a excepción de las muestras de moonmilk donde Actinobacteria constituyó el filo más representativo. Las técnicas dependientes de cultivo se utilizaron para contribuir al estudio de la diversidad microbiana, así como para describir nuevas especies de bacterias. Se aislaron un total de 118 bacterias, clasificadas en los filos Firmicutes (42), Actinobacteria (40), Proteobacteria (34) y Bacteroidetes (2). Un total de 15 cepas de hongos fueron igualmente identificadas. El género de bacterias más abundante fue Streptomyces, proponiéndose a Streptomyces tigalatensis y Streptomyces benahoarensis como nuevas especies. Se llevaron a cabo el desarrollo de ensayos in silico e in vitro de las nuevas especies bacterianas para comprobar sus habilidades metabólicas. Los análisis genómicos predijeron un sistema metabólico secundario dinámico, sugiriendo la capacidad para producir una gran cantidad de diferentes compuestos activos. Sin embargo, únicamente se pudo determinar la capacidad antibiótica y antifúngica en Streptomyces tigalatensis. En definitiva, el trabajo realizado en esta tesis propone a los tubos de lava como potencial reservorio de bacterias productoras de interesantes compuestos bioactivos, así como describe a estos ecosistemas como agentes relevantes en los ciclos globales de nutrientes., Universidad Pablo de Olavide de Sevilla. Centro de Estudios de Posgrado, Postprint

CNPq/Universal (475358/2011-2), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP; 2012/19590-0) and Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT; PTDC/SAU-ONC/115513/2009) grants to R.M.R. The project was cofinanced by Programa Operacional Regional do Norte (ON.2-O Novo Norte), Quadro de Referência Estratégico Nacional (QREN) and Fundo Europeu de Desenvol- vimento Regional (FEDER). M.V.-P. is the recipient of an FCT Post-Doctorate Research Fellowship (SFRH/BPD/104290/2014), Hotspot activating mutations of the telomerase reverse transcriptase (hTERT) promoter region were recently described in several tumor types. These mutations lead to enhanced expression of telomerase, being responsible for telomere maintenance and allowing continuous cell division. Additionally, there are alternative telomere maintenance mechanisms, associated with histone H3 mutations, responsible for disrupting the histone code and affecting the regulation of transcription. Here, we investigated the clinical relevance of these mechanistically related molecules in nnedulloblastoma. Sixty-nine medulloblastomas, formalin fixed and paraffin embedded, from a cohort of patients aged 1.5-70 years, were used to investigate the hotspot mutations of the hTERT promoter region, i.e. H3F3A and HIST1H3B, using Sanger sequencing. We successfully sequenced hTERT in all 69 medulloblastoma samples and identified a total of 19 mutated cases (27.5%). c.-124:G>A and c.-146:G>A mutations were detected, respectively, in 16 and 3 samples. Similar to previous reports, hTERT mutations were more frequent in older patients (p < 0.0001), being found only in 5 patients, This study was partially supported by CNPq/Universal (475358/2011-2), Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado de Sao Paulo (FAPESP; 2012/19590-0) and Fundacao para a Ciencia e Tecnologia (FCT; PTDC/SAU-ONC/115513/2009) grants to R.M.R. The project was cofinanced by Programa Operacional Regional do Norte (ON.2-O Novo Norte), Quadro de Referencia Estrategico Nacional (QREN) and Fundo Europeu de Desenvolvimento Regional (FEDER). M.V.-P. is the recipient of an FCT Post-Doctorate Research Fellowship (SFRH/BPD/104290/2014)., info:eu-repo/semantics/publishedVersion

O Projeto “mostra o que fazes bem” surgiu por proposta do IGEC, como forma de superação de uma das fragilidades identificadas no Agrupamento em dezembro de 2013 - inexistência de mecanismos sistemáticos de supervisão pedagógica de acompanhamento e de monitorização das atividades letivas, bem como a ausência de trabalho colaborativo interpares. Todo o processo foi desenvolvido com a preocupação basilar de claramente se diferenciar do conceito de avaliação do desempenho docente, tendo uma tónica acentuada na vertente formativa e de autorregulação da atividade educativa. Daqui, nasceu uma proposta de formação continua acreditada para professores do agrupamento, sob o formato de oficina de formação, a desenvolver durante o ano letivo 2014/2015. O projeto foi supervisionado por Cristina Palmeirão, da Universidade Católica Portuguesa do Porto, na qualidade de consultora do Projeto TEIP do Agrupamento de Escolas António Nobre.

A produção de leite e seus derivados na Região do Inhamuns tem elevada importância economica e social para as propriedades do segmento da Agricultura Familiar. O sabor diferenciado do queijo da região, abre possibilidades de tornar-se um produto de alto valor agregado por uma certificação de origem, contudo requer um esforço concentrado da pesquisa, treinamento e capacitação de produtores para corrigir as distorções que se verificam nos sistemas de produção e de processamento, em virtude de práticas inadequadas tanto no manejo dos rebanhos, quanto nas fases de processamento e acondicionamento do produto. Devido a importância da produção do queijo-de-colho para esse território, este estudo busca conhecer a dinâmica desse segmento que vem a constituir um recurso importante para o sustento das famílias, além de ser um fator cultural. A Agricultura Familiar nessa região, caracterisa-se pelo emprego de práticas tradicionais, na produção e processamento dos seus produtos. Dessa forma, esse trabalho possibilitou conhecer a dinâmica de desenvolvimento dessas comunidades, como também, abriu possibilidades para um acompanhamento futuro sobre a evolução dessa dinâmica.----------------------------------------------The production of milk and its derivatives in the Region of Inhamuns has high economic and social importance to the properties of the segment of Family Agriculture. The flavor of the cheese differently in the region, opens possibilities to become a product of high value added by a certificate of origin, but requires a focused effort of the research, training and capacity building of producers to correct the distortions that occur in production systems and processing, due to both inadequate practices in the management of herds, as at the processing and packaging of the product. Due to the importance of the production of cheese-of-cropping for this territory, this study seeks to know the dynamics of this segment that has to be an important resource for the sustenance of families, in addition to being a cultural factor. The Family Agriculture in that region, caracterisa by the use of traditional practices, in the production and processing of their products. Thus, this study allowed to know the dynamics of development of these communities, but also has opened possibilities for a future monitoring on the evolution of this dynamic.

The thermal spring of Fetida Cave, a still active sulfuric acid cave opening at sea level and located in Santa Cesarea Terme, southeastern Salento (Apulia region, Southern Italy) hosts abundant floating white filaments. The white filaments were mainly composed of sulfur crystals surrounded by microbial mass of the phyla Epsilonbacteraeota, Proteobacteria, Bacteroidetes, and Patescibacteria. The most abundant genus in the white filaments collected from the waters in the innermost part of the cave dominated by sulfidic exhalations was Arcobacter. This abundance can be related to the higher concentration of sulfide dissolved in water, and low oxygen and pH values. Conversely, lower Arcobacter abundances were obtained in the filaments collected in the entrance and middle part of the cave, where sulfidic water mixes with seawater, as the cave is subjected to tides and the mixing of fresh (continental) with marine water. The geochemical analysis of water and atmospheric gases confirmed these environmental constraints. In fact, the highest concentrations of H2S in the air and water were recorded closest to the spring upwelling in the innermost part of the cave, and the lowest ones near the cave entrance. The metabolic versatility of Arcobacter might provide a competitive advantage in the colonization of water bodies characterized by high sulfide, low oxygen, and dynamic fluid movement., This work was supported by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness through project CGL2016-75590-P with ERDF funds and PID2019-110603RB-I00/AEI/10.13039/501100011033. We acknowledge support of the publication fee by the CSIC Open Access Publication Support Initiative through its Unit of Information Resources for Research (URICI).