1. J Hosp Infect
- Author
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Rodolphe Thiébaut, Alexandre Boyer, Julien Asselineau, Véronique Dubois, Anne Gaëlle Venier, Pierre Cassier, S. Parer, Serge Alfandari, C. Slekovec, Xavier Bertrand, Emmanuelle Cambau, Alain Lepape, Maïder Coppry, Bernard Clair, Bruno Mégarbane, Camille Leroyer, Anne Marie Rogues, Hélène Boulestreau, C. Lawrence, Dominique Trivier, Marion Saly, Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Tourcoing, Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Centre Hospitalier de Lens, CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Statistics In System biology and Translational Medicine (SISTM), Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)- Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB), Hôpital Lariboisière, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Lariboisière-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Hôpital Jean Minjoz, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), AP-HP Hôpital Raymond Poincaré [Garches], Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Lariboisière-Université de Paris (UP), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], CHU Raymond Poincaré, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), CCSD, Accord Elsevier, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Bordeaux - Sud-Ouest, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)
- Subjects
Microbiology (medical) ,medicine.medical_specialty ,Genotype ,health care facilities, manpower, and services ,030501 epidemiology ,medicine.disease_cause ,Risk Assessment ,Disease Outbreaks ,law.invention ,Cohort Studies ,03 medical and health sciences ,Tap water ,law ,Internal medicine ,Intensive care ,medicine ,Pulsed-field gel electrophoresis ,Humans ,Mass Screening ,Pseudomonas Infections ,Intensive care unit ,Prospective Studies ,Typing ,[SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology ,Cross Infection ,0303 health sciences ,030306 microbiology ,Pseudomonas aeruginosa ,business.industry ,General Medicine ,Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field ,3. Good health ,SISTM ,Intensive Care Units ,Infectious Diseases ,[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology ,Cohort ,[SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie ,France ,Water Microbiology ,0305 other medical science ,business ,Water taps ,Cohort study - Abstract
Summary Background Pseudomonas aeruginosa remains one of the most common nosocomial pathogens in intensive care units (ICUs). Although exogenous acquisition has been widely documented in outbreaks, its importance is unclear in non-epidemic situations. Aim To elucidate the role of exogenous origin of P. aeruginosa in ICU patients. Methods A chronological analysis of the acquisition of P. aeruginosa was performed using samples collected in 2009 in the DYNAPYO cohort study, during which patients and tap water were screened weekly. Molecular relatedness of P. aeruginosa isolates was investigated by pulsed-field gel electrophoresis. Exogenous acquisition was defined as identification of a P. aeruginosa pulsotype previously isolated from another patient or tap water in the ICU. Findings The DYNAPYO cohort included 1808 patients (10,402 samples) and 233 water taps (4946 samples). Typing of 1515 isolates from 373 patients and 375 isolates from 81 tap water samples identified 296 pulsotypes. Analysis showed exogenous acquisition in 170 (45.6%) of 373 patients. The pulsotype identified had previously been isolated from another patient and from a tap water sample for 86 and 29 patients, respectively. The results differed according to the ICU. Conclusion Exogenous acquisition of P. aeruginosa could be prevented in half of patients. The overall findings of this survey support the need for studies on routes of transmission and risk assessment approach to better define how to control exogenous acquisition in ICUs.
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- 2020
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