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This thesis analysed the factors that can impact the success of restocking or stock-enhancement programs for the European abalone (Haliotis tuberculata). Indeed, over the last two decades several populations of this species have collapsed. The possibility to support these populations is considered in order to reconstitute their past level. In this perspective, the first two chapters were dedicated to analyse the effects of domestication on the behaviour of juveniles from nursery that would be implanted, and to evaluate the impact of several stressors (preparation, transport and feed restriction) prior to implantation on behaviours essential for the survival of abalone juveniles in the wild. The results suggest that domestication process does not impact the behaviours studied. However, the stress procedure caused behavioural changes that would be detrimental to survival after implantation in the wild. A third chapter focused on the characterisation of the biotic and abiotic factors constituting the abalone habitat, essential to their survival and development. It appeared that the size and arrangement of the boulders play a key role in the habitat quality. The fourth chapter compared the genetic diversity of wild populations from Brittany and Normandy, as farmed cohorts from three generations. It was shown that the natural populations located on either side of the Ouessant front are genetically differentiated, as this current probably represents a natural barrier to larval flows. In addition, the rearing process has so far maintained a high genetic diversity. These results are encouraging because they showed that there would be no effect of seeding on the genetic diversity of wild populations. The results from this thesis will be used to provide essential answers on the precautions to be taken prior restocking or stock-enhancement programs.; Cette thèse a consisté à définir et à analyser les facteurs déterminants la réussite d’opérations de repeuplement ou de soutien de stocks de certaines populations de l’ormeau européen (Haliotis tuberculata), qui se sont effondrées au cours des deux dernières décennies. Dans cette optique, les deux premiers chapitres ont été consacrés d’une part à analyser les effets de la domestication sur le comportement de juvéniles provenant de nurserie, et d’autre part à évaluer l’impact de plusieurs facteurs de stress en amont de l’implantation (préparation, transport et sous-nutrition) sur des comportements essentiels à la survie des ormeaux en milieu naturel. Les résultats suggèrent que la domestication n’impacte pas le comportement. En revanche, les stress ont engendré des modifications comportementales potentiellement préjudiciables à la survie dans le milieu naturel. Un troisième chapitre a permis de caractériser l’habitat de l’ormeau en plongée sous-marine, afin de mettre en évidence les facteurs environnementaux essentiels à sa survie et son développement. Il est apparu que la taille et l’agencement des blocs rocheux jouent un rôle prépondérant dans la capacité d’un environnement à accueillir des ormeaux. Le quatrième chapitre a étudié la diversité génétique de populations sauvages de Bretagne et de Normandie, ainsi que plusieurs cohortes de trois générations d’élevage. Il a été montré que les populations naturelles situées de part et d’autre du front de Ouessant sont génétiquement différenciées, ce courant représentant probablement une barrière naturelle aux flux larvaires. De plus, le processus d’élevage a permis jusqu’à maintenant de maintenir une diversité génétique élevée. Ces résultats sont encourageants car ils suggèrent l’absence d’effets délétères de futures implantations sur la diversité génétique des populations naturelles. Les résultats issus de cette thèse apportent des connaissances indispensables pour identifier les précautions à prendre en amont de la mise en place de projets de repeuplement ou de soutien de stocks de l’ormeau européen.

Selon les termes de la saisine, « cette zone qui s’étend à 20km autour des foyers d’influenza aviaire (IA) déclarés dans ces départements a été mise en place suite à votre avis rendu sur la saisine n° 2020-AST-0179 : Demande d’avis scientifique et technique de l’Anses relative aux mesures de maitrise de l’épizootie d’influenza aviaire dans la région du Sud-Ouest(département 40 et départements mitoyens) », Question n°2. Dans cet avis l’Anses a indiqué “Compte tenu des délais de levée des zones réglementées autour des foyers d’IAHP, le Gecurecommande de lever les restrictions de mises en place d’oiseaux et d’entrées/sorties de la zone tampon à une date au moins égale à celle de la levée de l’APDI du dernier foyer de l’ensemble des zones réglementées qu’encercle la zone tampon (cf. annexe 2 : levée des zones règlementées)".Toutefois nous souhaitons examiner l’opportunité d’une éventuelle levée progressive : il apparaît en effet que certaines zones ne connaissent plus de foyers depuis plusieurs semaines et leur situation épidémiologique pourrait être différenciée d'autres zones qui ont connu des foyers plus récemment. Par ailleurs, alors que dans certaines zones des foyers sont apparus entre 10 et 20km autour des foyers, cela n’est pas le cas, par exemple dans les Pyrénées Atlantiques et le Gers. Du fait des nombreux abattages à titre préventif qui ont été effectués autour des foyers, la densité d'animaux a fortement chuté dans certains territoires, il resterait 35000 canards dans les Landes et 200 000 dans la zone tous départements compris. Cet examen s’intéresse également aux conditions dans lesquelles, après la levée de la zone tampon, des remises en place sont possibles.Aussi les questions que je souhaite vous poser sont les suivantes : - Quelles sont les conditions requises pour envisager la levée de certaines zones stabilisées de la grande zone tampon du sud-ouest ? - Sous quelles modalités peut-il être envisagé cette levée partielle ? - Quelles seraient les conditions pour envisager un repeuplement des élevages dans ces zones ? »

International audience; Parentage assignment with genomic markers provides an opportunity to monitor salmon restocking programs. Most of the time, it is used to study the fate of hatchery-born fish in those programs, as well as the genetic impacts of restocking. In such analyses, only fish that are assigned to their parents are considered. In the Garonne-Dordogne river basin in France, native salmon have disappeared, and supportive breeding is being used to try to reinstate a self-sustained population. It is therefore of primary importance to assess the numbers of wild-born returning salmon, which could appear as wrongly assigned or not assigned, depending on the power of the marker set and on the size of the mating plan. We used the genotypes at nine microsatellites of the 5800 hatchery broodstock which were used from 2008 to 2014, and of 884 upstream migrating fish collected from 2008 to 2016, to assess our ability to identify wild-born salmon. We simulated genotypes of hatchery fish and wild-born fish and assessed how they were identified by the parentage assignment software Accurassign. We showed that 98.7% of the fish assigned within the recorded mating plan could be considered hatchery fish, while 93.3% of the fish in other assignment categories (assigned out of the mating plan, assigned to several parent pairs, not assigned) could be considered wild-born. Using a Bayesian approach, we showed that 31.3% of the 457 upstream migrating fish sampled from 2014 to 2016 were wild-born. This approach is thus efficient to identify wild-born fish in a restoration program. It remains dependent on the quality of the recording of the mating plan, which we showed was rather good (

International audience; Salmonid juvenile stocking programs are often poorly monitored due to the lack of identification between stocked and wild fish. In this study, a hierarchical Bayesian model is developed to take advantage of spatiotemporal variations of stocking and wild recruitment for estimating these two components despite the absence of identification data. It is first tested by means of simulated data and then applied to the 37 year abundance data set of the Atlantic salmon (Salmo salar) population of the Allier catchment (France). Despite the absence of identification data, juvenile densities could be estimated and split into wild and stocked components. We found that the stocked juveniles contributed significantly to the total juvenile production, while the wild reproduction continued to provide an important contribution. This approach is encouraging and promising from a management advice perspective. It is flexible enough to accommodate for case study specificities and shows that long-term monitoring abundances can be useful to assess the impact of stocking programs even in the absence of direct means of identifying stocked versus wild fish.

Erratum: Page 262 of this article erroneously refers to Louis Riffardeau Baron de Riviére (1817-1890) as the inventor of eel restocking. This conflates the names of two people living in the same place and period: Baron Louis de Riviére (1789-1871) and Duke Louis Riffardeau de Riviére (1817-1890). While the Baron was the inventor of eel restocking, the Duke was not involved. The article thus incorrectly speculates about the initial transports from St. Gilles in the Camargue (where the Baron was mayor) to lakes around Vernais in Cher (owned by the Duke). Apart from that speculation on page 262 (only), the content of the article is not further affected by this error. Young eel, recruiting from the ocean towards Europe, are most abundant along the Atlantic coast of France. Since 1840, attempts have been made to redistribute them from the areas of highest abundance to other countries and farther inland. This 'restocking' has been troubled by technical constraints (e.g. mode of transport and maximum distance eel can be shipped alive), wars (e.g. the Franco-Prussian War and World Wars One and Two) and, in recent decades, by shortage of supply due to the general decline of the eel stock all across Europe. Though objectives and procedures have changed considerably over the years, the recurring aim has been to increase production and, in that way, to 'faire mieux que la nature'. We document the historical development of these efforts from their inception, and contrast the achievements to the objectives. Except for the 1952-1990 period in Eastern Europe, restocking has probably added only slightly to the natural production. As successful as restocking might have been locally, it has not markedly changed the overall trends and distribution patterns or halted the general decline of the stock and fishery. Poor post-evaluation, frequent technical innovation and a constant renewal of the countries and people involved have kept the promise of a better future alive for 175 years.

La présente étude sur les populations de truites du fond du Golfe de Gascogne révèle une diversité génétique fortement structurée par l’architecture du réseau hydrographique. Cette structuration est entretenue par les truites de mer qui adoptent massivement un comportement de homing. Un flux de TRMs étrangères s’ajoute parfois aux flux de TRMs natives. En provenance des petits fleuves cantabriques ou basques espagnols, ce flux est important dans les Nives et la Nivelle et anecdotique au niveau des Gaves. Les gènes d’origine domestique sont peu présents chez les populations de truites sauvages et contribuent à part égale aux populations sédentaires et marines. Certaines truites du bassin de l’Adour, plus spécifiquement dans sa partie amont, sont génétiquement proches de celles de la Garonne, accréditant l’hypothèse d’un flux de truites entre la Garonne et l’Adour par le biais du canal de la Neste

La présente expertise, réalisée dans le cadre du GIS GRISAM, a mobilisé 10 experts dans le but de produire un état des lieux sur l'efficacité des "repeuplements" mis en ½uvre dans le cadre du Plan national anguille ; ainsi que des recommandations sur les protocoles de déversement et de suivi, dans la perspective d'un triple objectif. Informer les gestionnaires de l'anguille impliqués dans ces opérations - Servir de base au rapportage de la Commission européenne en 2015 - Permettre l'optimisation de la mise en ½uvre de la seconde phase de transferts, si celle-ci devait continuer à figurer dans le PGA français.

The European eel is a species now considered as critically endangered. It is the subject of a European restoration plan since 2007, whereas it has long been considered in France as a pest. The restoration plan include a restocking program, which started in 2011 in France and is monitored for the first time in this study. This program consists in catching glass eels in estuarine waters, to reintroduce them on sites considered as favorable. The aim is to increase the breeding population migrating to the spawning sites. Over the period 2011-2013 have been released nearly 6.7 tonnes of glass eels, which represent nearly 20 million individuals on 28 release sites in North and Western France. Considering that this study occurs 6 months to 3 years after the stocking, it is not possible yet to conclude on the final silver eel production. Thus, other approaches have been chosen to bring the first clues necessary to answer to the question of the efficiency of this program. First, the factors influencing the short-term mortality were identified and their effects quantified in a GLM binomial model explaining almost 52% of the deviance. Then, it was shown that stocked individuals are still present in the environment, at least over the period of the study. These individuals shows recapture rates consistent with what was expected and grows, although a bit lower than what is reported in the literature. One of the major findings of this study tackles the subject of the marking used for the scientific monitoring. The latter generates an additional mortality (29%) and a lower growth (-9.9%) and should be limited as much as possible.; L'anguille européenne est une espèce aujourd'hui considérée comme en danger critique d'extinction. Elle fait l'objet depuis 2007 d'un plan européen de restauration, alors qu'elle a longtemps été considérée en France comme une espèce nuisible. Ce plan de restauration inclut un programme de repeuplement, débuté en 2011 en France, dont la présente étude réalise pour la première fois le bilan. Ce programme consiste en la capture de civelles au niveau estuarien, puis à leur réintroduction sur des sites jugés favorables. L’objectif étant d’augmenter la population de reproducteurs lors de la migration vers les sites de pontes. Sur la période 2011-2013 ont ainsi été déversées près de 6,7 tonnes de civelles, soit près de 20 millions d’individus sur 28 sites du Nord et de l’Ouest de la France. Cette étude intervenant de 6 mois à 3 ans après les alevinages, il est encore impossible de conclure sur la production finale d’anguilles argentées. D’autres approches ont donc été choisies pour apporter de premiers éléments de réponses quant au succès de ce programme. Dans un premier temps, les facteurs influençant la mortalité à court terme ont été identifiés et leurs effets quantifiés, dans un modèle GLM binomial expliquant près de 52% de la déviance. Puis, il a été montré que les individus alevinés sont bien présents dans le milieu, au moins sur la période de l’étude. Ces individus présentent des taux de recaptures conformes à ce qui était attendu et grandissent, bien que sur des échelles moindres que ce qui est indiqué dans la littérature. Un des résultats important de cette étude est relatif au marquage employé pour le suivi scientifique. Ce dernier engendre une mortalité supplémentaire (+29%), ainsi qu’une moindre croissance (-9,9%) et doit donc être limité autant que possible.

International audience; Captive-bred mallards Anas platyrhynchos have been released for hunting purposes at a very large scale in Europe since the mid-1970s. In spite of a potential genetic impact, the actual contribution of restocked mallards to the genome of the target population has received little attention. The genetic structure of modern wild mallards in the Camargue, Southern France, was assessed from two samples: one originating from shot birds in hunting bags and one from presumed wild ducks captured alive in a hunting-free reserve. Reference samples originated from five mallard farms, as well as from museum samples collected before the mid-1970s (i.e. before massive mallard releases started). Our results revealed that the genetic signature of wild wintering mallards has not changed significantly because museum and presumed wild samples from the Camargue hunting-free nature reserve were genetically similar, and clearly differentiated from the farm mallards. This suggests that mallard releases in the Camargue or elsewhere in France, although massive, have not actually translated into complete admixture of wild and captive genomes, most likely due to low survival of released birds once in the wild. Nevertheless, although genetic introgression of the wild population by captive-bred was contained, we found significant rates of hybridization between wild and captive-bred mallards in modern samples. This result suggests that long-term releases of captive-bred mallards, if carried on at such large scale, could compromise irreversibly the genetic structure and composition of European mallards. This work contributes to fill in the gap on the monitoring of the genetic consequences of large-scale game releases for exploitation.

The present work aims at a better understanding of the adaptation to farming conditions through a behavioural approach based on the comparison between wild vs. domesticated populations of three species: a marine species, sea bass (Dicentrarchus labrax), two freshwater species, arctic charr (Salvelinus alpinus) and brown trout (Salmo trutta). The thesis is divided into two parts which objectives were : 1) to test the impact of biotic and abiotic factors selected based on their importance in aquaculture on sea bass and artic charr behavioural plasticity (behavioural modifications in response to environmental changes). 2) to characterize the domestication effect on behaviour through the comparison between wild vs. domesticated sea bass and brown trout at different ages and under different experimental conditions (challenges, maze).In the first part, experiments performed on arctic charr showed that an artificial shelter induced a lower mobility, better growth performances and a higher level of survival during the endogenous feeding period, that egg size and social environment play an important role on feeding behaviour and mobility during the weeks following the first exogenous feeding period. These results illustrated behavioural flexibility in response to abiotic and biotic factors. The findings could be used to improve culture performances and welfare of arctic charr. The experiments performed on sea bass showed that a plant-based diet do neither modify the learning abilities under self-feeding conditions nor the cognition under a test situation in a maze, but has an impact on swimming activity (the mean velocity decreased and the total distance travelled decreased) and on the short-term release of cortisol (plasmatic concentration lower than the control group). Another experiment showed that, under self-feeding conditions, size grading and the resulting social environment have no major influence on feed-demand, feeding rhythm, food wastage, social structure, growth performances and physiological status. At last, a three-week fasting period does not modify the social structure and high-triggering fish are exactly the same individuals before and after the fasting period. Individual’s triggering activity levels could therefore be considered as personality traits but further research is needed to verify this hypothesis.In the second part of the thesis, the experiment performed on brown trout showed an impact of domestication on swimming activity before and after a light-elicited stress, using a biological material controlled by genotyping. Angular velocity was higher in wild fish while mean velocity and total distance travelled were higher in domesticated fish. All the experiments carried out on sea bass compared wild-caught fish (from the larval stage) to domesticated fish (industrial standard). The first one showed the interplay of age and ontogeny on swimming activity and escape response rate. These variables decreased in fish from both origins. The impact of domestication was shown through differences between wild-caught and domesticated larvae (angular velocity and vigilance level higher in wild fish). They showed that domestication has no influence on gregarism, and cognition in sea bass but there was a high individual variability. The ability to discriminate familiarity was shown only in domesticated fish. The behavioural approach developed in this thesis was demonstrated to be relevant to reveal plasticity in response to a few abiotic and biotic factors among the numerous ones that remain to be investigated. Plasticity plays an important role in the adaptation of fish to culture conditions. Domestication impact on behaviour was also demonstrated as well as the interplay of age and ontogeny. This thesis followed the path and brings new insights for research programs targeting fish selection based upon personality traits in order to improve adaptation for aquaculture or restocking purposes.; Ce travail vise une meilleure compréhension de l’adaptation aux conditions d’élevage par une approche comportementale basée sur la comparaison de diverses populations de téléostéens pour trois espèces, l’une marine, le bar (Dicentrarchus labrax), les deux autres d’eau douce, l’omble chevalier (Salvelinus alpinus) et la truite commune (Salmo trutta). La thèse s’articule en deux parties qui ont permis : 1) de tester des facteurs biotiques et abiotiques sélectionnés en fonction de leur importance en élevage du bar et de l’omble chevalier. 2) de caractériser les effets de la domestication sur le comportement par le biais d’une comparaison entre des bars ou des truites sauvages et domestiqués à des âges différents et dans des contextes variables (challenges, labyrinthe). Dans la première partie, les travaux réalisés sur l’omble chevalier ont montré que la présence d’un refuge artificiel durant la phase de nutrition endogène induisait une forte diminution de la mobilité accompagnée de meilleures performances de croissance et d’une survie plus importante, que la taille de l’œuf et l’environnement social jouaient un rôle important sur le comportement alimentaire et la mobilité des juvéniles dans les semaines qui suivent la première nutrition exogène. Les travaux réalisés sur le bar ont montré qu’un aliment végétal ne modifiait pas les capacités d’apprentissage en condition d’auto-alimentation ni leurs capacités cognitives en situation de test en labyrinthe, mais qu’il semble réduire l’activité de nage et la libération à court terme du cortisol. Une autre expérience a montré que la pratique du tri et l’environnement social qui en résulte, en conditions d’auto-alimentation, a peu d’influence sur la demande, le rythme, le gaspillage alimentaires, la structure sociale, les performances de croissance et le statut physiologique. Une période de trois semaines de jeûne, enfin, ne modifie pas la structure sociale et les manipulateurs principaux sont les mêmes avant et après cette période, ce qui pourrait être lié à l’existence de traits de personnalité basés sur le pourcentage d’activation de la tige tactile du dispositif d’auto-alimentation. Dans la seconde partie de la thèse, l’expérience sur la truite a mis en évidence un effet de la domestication sur l’activité de nage avant et après application d’un stress lumineux, en utilisant un matériel biologique contrôlé par génotypage (vitesse angulaire plus élevée chez les individus sauvages, vitesse moyenne et distance parcourue plus importantes chez les individus domestiqués). Les expériences réalisées sur le bar ont comparé des populations sauvages capturées à l’état larvaire dans le milieu naturel à des populations standard industrielles. La première a montré l’influence combinée de l’âge et de mécanismes d’ordre ontogénique sur l’activité de nage et le taux de réponse de fuite (diminution chez les deux catégories de larve). L’impact de la domestication se traduit par des différences entre individus sauvages et domestiquées (vitesse angulaire et vigilance plus élevés chez les individus sauvages). En situation de labyrinthe, la domestication ne semble pas avoir d’influence sur le grégarisme et la cognition chez le bar, mais il existe une forte variabilité individuelle. La discrimination de la familiarité, enfin, n’a pu être mise en évidence que chez les individus domestiqués.L’approche comportementale a permis de révéler une plasticité en réponse à quelques facteurs abiotiques et abiotiques, qui constitue un véritable levier adaptatif pour les téléostéens en élevage. L’effet de la domestication sur le comportement a également été démontré ainsi que l’influence de l’âge et des mécanismes ontogéniques dont la nature reste à déterminer. Cette thèse s’inscrit dans la lignée des travaux qui vise à sélectionner les téléostéens sur leurs traits de personnalité dans l’optique d’une adaptation optimale en élevage ou dans la perspective de programmes de repeuplement.

A round table discussion involving 25 researchers from 11 European countries was organized during the congress “European Crayfish: food, flagships and ecosystem services” (held in Poitiers, France, 26–29th October 2010) to consider current activities dealing with management of indigenous crayfish species (ICS) with special regards to their culture, restocking and conservation strategy. In the following opinion paper, we attempt to summarize best practice of current conservation strategy as well as advantages and disadvantages of applied tools and approaches for listed species or species complexes. The development of conceptual models for the protection of ICS in Europe seems to be necessary; however, currently recommended approaches of conservation strategy of ICS differ according to countries and species. The different approaches to conservation of Astacus astacus and species in the genus Austropotamobius, such as genetic diversity, captive breeding, origin and characteristics of stocking material and establishment, as well as long-term objectives of sanctuary or “ark” sites, were highlighted during the round table discussion.

The present work aims at a better understanding of the adaptation to farming conditions through a behavioural approach based on the comparison between wild vs. domesticated populations of three species: a marine species, sea bass (Dicentrarchus labrax), two freshwater species, arctic charr (Salvelinus alpinus) and brown trout (Salmo trutta). The thesis is divided into two parts which objectives were : 1) to test the impact of biotic and abiotic factors selected based on their importance in aquaculture on sea bass and artic charr behavioural plasticity (behavioural modifications in response to environmental changes). 2) to characterize the domestication effect on behaviour through the comparison between wild vs. domesticated sea bass and brown trout at different ages and under different experimental conditions (challenges, maze).In the first part, experiments performed on arctic charr showed that an artificial shelter induced a lower mobility, better growth performances and a higher level of survival during the endogenous feeding period, that egg size and social environment play an important role on feeding behaviour and mobility during the weeks following the first exogenous feeding period. These results illustrated behavioural flexibility in response to abiotic and biotic factors. The findings could be used to improve culture performances and welfare of arctic charr. The experiments performed on sea bass showed that a plant-based diet do neither modify the learning abilities under self-feeding conditions nor the cognition under a test situation in a maze, but has an impact on swimming activity (the mean velocity decreased and the total distance travelled decreased) and on the short-term release of cortisol (plasmatic concentration lower than the control group). Another experiment showed that, under self-feeding conditions, size grading and the resulting social environment have no major influence on feed-demand, feeding rhythm, food wastage, social structure, growth performances and physiological status. At last, a three-week fasting period does not modify the social structure and high-triggering fish are exactly the same individuals before and after the fasting period. Individual’s triggering activity levels could therefore be considered as personality traits but further research is needed to verify this hypothesis.In the second part of the thesis, the experiment performed on brown trout showed an impact of domestication on swimming activity before and after a light-elicited stress, using a biological material controlled by genotyping. Angular velocity was higher in wild fish while mean velocity and total distance travelled were higher in domesticated fish. All the experiments carried out on sea bass compared wild-caught fish (from the larval stage) to domesticated fish (industrial standard). The first one showed the interplay of age and ontogeny on swimming activity and escape response rate. These variables decreased in fish from both origins. The impact of domestication was shown through differences between wild-caught and domesticated larvae (angular velocity and vigilance level higher in wild fish). They showed that domestication has no influence on gregarism, and cognition in sea bass but there was a high individual variability. The ability to discriminate familiarity was shown only in domesticated fish. The behavioural approach developed in this thesis was demonstrated to be relevant to reveal plasticity in response to a few abiotic and biotic factors among the numerous ones that remain to be investigated. Plasticity plays an important role in the adaptation of fish to culture conditions. Domestication impact on behaviour was also demonstrated as well as the interplay of age and ontogeny. This thesis followed the path and brings new insights for research programs targeting fish selection based upon personality traits in order to improve adaptation for aquaculture or restocking purposes., Ce travail vise une meilleure compréhension de l’adaptation aux conditions d’élevage par une approche comportementale basée sur la comparaison de diverses populations de téléostéens pour trois espèces, l’une marine, le bar (Dicentrarchus labrax), les deux autres d’eau douce, l’omble chevalier (Salvelinus alpinus) et la truite commune (Salmo trutta). La thèse s’articule en deux parties qui ont permis : 1) de tester des facteurs biotiques et abiotiques sélectionnés en fonction de leur importance en élevage du bar et de l’omble chevalier. 2) de caractériser les effets de la domestication sur le comportement par le biais d’une comparaison entre des bars ou des truites sauvages et domestiqués à des âges différents et dans des contextes variables (challenges, labyrinthe). Dans la première partie, les travaux réalisés sur l’omble chevalier ont montré que la présence d’un refuge artificiel durant la phase de nutrition endogène induisait une forte diminution de la mobilité accompagnée de meilleures performances de croissance et d’une survie plus importante, que la taille de l’œuf et l’environnement social jouaient un rôle important sur le comportement alimentaire et la mobilité des juvéniles dans les semaines qui suivent la première nutrition exogène. Les travaux réalisés sur le bar ont montré qu’un aliment végétal ne modifiait pas les capacités d’apprentissage en condition d’auto-alimentation ni leurs capacités cognitives en situation de test en labyrinthe, mais qu’il semble réduire l’activité de nage et la libération à court terme du cortisol. Une autre expérience a montré que la pratique du tri et l’environnement social qui en résulte, en conditions d’auto-alimentation, a peu d’influence sur la demande, le rythme, le gaspillage alimentaires, la structure sociale, les performances de croissance et le statut physiologique. Une période de trois semaines de jeûne, enfin, ne modifie pas la structure sociale et les manipulateurs principaux sont les mêmes avant et après cette période, ce qui pourrait être lié à l’existence de traits de personnalité basés sur le pourcentage d’activation de la tige tactile du dispositif d’auto-alimentation. Dans la seconde partie de la thèse, l’expérience sur la truite a mis en évidence un effet de la domestication sur l’activité de nage avant et après application d’un stress lumineux, en utilisant un matériel biologique contrôlé par génotypage (vitesse angulaire plus élevée chez les individus sauvages, vitesse moyenne et distance parcourue plus importantes chez les individus domestiqués). Les expériences réalisées sur le bar ont comparé des populations sauvages capturées à l’état larvaire dans le milieu naturel à des populations standard industrielles. La première a montré l’influence combinée de l’âge et de mécanismes d’ordre ontogénique sur l’activité de nage et le taux de réponse de fuite (diminution chez les deux catégories de larve). L’impact de la domestication se traduit par des différences entre individus sauvages et domestiquées (vitesse angulaire et vigilance plus élevés chez les individus sauvages). En situation de labyrinthe, la domestication ne semble pas avoir d’influence sur le grégarisme et la cognition chez le bar, mais il existe une forte variabilité individuelle. La discrimination de la familiarité, enfin, n’a pu être mise en évidence que chez les individus domestiqués.L’approche comportementale a permis de révéler une plasticité en réponse à quelques facteurs abiotiques et abiotiques, qui constitue un véritable levier adaptatif pour les téléostéens en élevage. L’effet de la domestication sur le comportement a également été démontré ainsi que l’influence de l’âge et des mécanismes ontogéniques dont la nature reste à déterminer. Cette thèse s’inscrit dans la lignée des travaux qui vise à sélectionner les téléostéens sur leurs traits de personnalité dans l’optique d’une adaptation optimale en élevage ou dans la perspective de programmes de repeuplement.

International audience; Rabbit restocking is widely used in Spain for conservation and/or hunting purposes; however, the success of rabbit restocking is generally low. Thus, many studies have assessed ways to reduce this problem, one of which is the use of a “soft-release” procedure whereby rabbits are acclimated to their release site for a variable time period prior to release. This study assessed the short-term effects of two soft-release confinement periods on the survival of rabbits during an experimental restocking program carried out in southwest Spain. The post-release survival rate of rabbits confined at the release site for six nights was significantly higher than that of rabbits confined for three nights. The longer acclimation period after rabbit translocation minimized mortality while rabbits adapted to their new environment.

International audience; The genetic variability of 11 French pike Esox lucius populations from rivers or extensive aquaculture ponds was analysed using seven microsatellite markers. The fish stocking of eastern European pike in French rivers is widespread, so five supplementary populations from this region were also analysed. Genetic variability within the French population was small, and similar to that previously found in Europe for this species. French populations from stocked rivers and extensive farms formed a genetically homogeneous group, and did not diverge from most eastern European samples, which may reflect either ancestral polymorphism or a complete introgression of French populations by introduced stocks. Bayesian analysis of the admixture between populations enabled identification of the French populations that were likely to be affected by introduced stocks (of local or foreign origin). Three genetically distinct evolutionary branches were identified: continental Europe, Danube basin, and south-western France. The last is a new finding in the species which needs to be further explored by comparisons with wild populations at other sites.

Les pratiques de repeuplement en truite à des stades précoces (alevins nourris et truitelles 3-5 cm) ont été évaluées par la technique de fluoromarquage des otolithes sur le bassin amont du Fier pour trois cohortes (1995, 1996, 1997). La contribution du repeuplement et du recrutement naturel a été suivie à la fois dans la population en place et dans les captures par pêche à la ligne. Au stade 0+ en place à l’automne, la contribution des poissons alevinés est relativement importante pour les trois cohortes considérées. Cependant, l’analyse du rapport entre le nombre d’alevins introduits au printemps et le nombre de truitelles recapturées à l’automne fait apparaître un taux d’implantation très faible des 0+ marqués quelle que soit la densité alevinée. La contribution des marqués chute brutalement au stade 1+ en place (cohorte 95 et 96) et devient très faible. Cette tendance se poursuit au stade 2+ en place pour la cohorte 95 avec des taux de marqués qui diminuent encore. Dans les captures par pêche à la ligne le taux de 2+ marqués est supérieur à celui observé dans la population en place à l’automne mais la contribution du recrutement naturel reste toujours dominante. Ensuite, la contribution de repeuplement suit la même dynamique que dans la population en place puisqu’il diminue avec l’âge. Elle devient négligeable au stade 3+ et nulle à partir de 4+.

Techniques de production du saumon de repeuplement a la station de Newport (Irlande)

Quelques aspects techniques de la production du saumon de repeuplement au Japon

L'aquiculture dans le monde : généralités, problèmes et perspectives