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44 results on '"IFREMER - Nantes"'

1. Phthalates and organophosphate esters in surface water, sediments and zooplankton of the NW Mediterranean Sea: Exploring links with microplastic abundance and accumulation in the marine food web

Author: Benjamin Oursel, Richard Sempéré, Natascha Schmidt, Javier Castro-Jiménez, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Agence de l’eau Rhône Mediterranee Corse Blue-POLUTproject and from European FEDER Fund under project 1166-39417, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), and Université de Nantes (UN)
Subjects: phthalate, zooplankton, Microplastics, plasticizers, Food Chain, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Health, Toxicology and Mutagenesis, Bioconcentration, 010501 environmental sciences, Toxicology, Flame retardants, 01 natural sciences, Zooplankton, Mediterranean sea, plastic, Plasticizers, Mediterranean Sea, Animals, 14. Life underwater, 0105 earth and related environmental sciences, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Water, Sediment, Esters, General Medicine, organophosphate esters, Bioaccumulation, Pollution, Organophosphates, sediment, 13. Climate action, Environmental chemistry, Environmental science, Seawater, Plastics, Surface water, Bay, Water Pollutants, Chemical, Environmental Monitoring
Abstract: In this study, surface seawater, sediment and zooplankton samples were collected from three different sampling stations in Marseille Bay (NW Mediterranean Sea) and were analyzed for both microplastics and organic plastic additives including seven phthalates (PAEs) and nine organophosphate esters (OPEs). PAE concentrations ranged from 100 to 527 ng L−1 (mean 191 ± 123 ng L−1) in seawater, 12–610 ng g−1 dw (mean 194 ± 193 ng g−1 dw) in sediment and 0.9–47 μg g−1 dw (mean 7.2 ± 10 μg g−1 dw) in zooplankton, whereas OPE concentrations varied between 9 and 1013 ng L−1 (mean 243 ± 327 ng L−1) in seawater, 13–49 ng g−1 dw (mean 25 ± 11 ng g−1 dw) in sediment and 0.4–4.6 μg g−1 dw (mean 1.6 ± 1.0 μg g−1 dw) in zooplankton. Microplastic counts in seawater ranged from 0 to 0.3 items m−3 (mean 0.05 ± 0.05 items m−3). We observed high fluctuations in contaminant concentrations in zooplankton between different sampling events. However, the smallest zooplankton size class generally exhibited the highest PAE and OPE concentrations. Field-derived bioconcentration factors (BCFs) showed that certain compounds are prone to bioaccumulate in zooplankton, including some of the most widely used chlorinated OPEs, but with different intensity depending on the zooplankton size-class. The concentration of plastic additives in surface waters and the abundance of microplastic particles were not correlated, implying that they are not necessarily good indicators for each other in this compartment. This is the first comprehensive study on the occurrence and temporal variability of PAEs and OPEs in the coastal Mediterranean based on the parallel collection of water, sediment and differently sized zooplankton samples.
Published: 2021
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2. Rapp. Comm. int. Mer Médit., 42, p 97, 2019

Author: CARLOTTI, Francois, Tronczynski, Jacek, TEDETTI, Marc, Marc, Pagano, Garnier, Cédric, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)
Subjects: [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2020

3. Biological, socio-economic, and administrative opportunities and challenges to moving aquaculture offshore for small French oyster-farming companies

Author: Barillé, Laurent, LE BRIS, Anthony, Goulletquer, Philippe, Thomas, Yoann, Glize, Philippe, Kane, Frank, Falconer, Lynne, Guillotreau, Patrice, Trouillet, Brice, Palmer, Stéphanie, Gernez, Pierre, Mer, molécules et santé EA 2160 (MMS), Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique (LETG - Nantes), Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Syndicat Mixte pour le Développement de l'Aquaculture et de la Pêche en Pays de la Loire (SMIDAP), Marine Institute [Ireland], University of Stirling, Laboratoire d'économie et de management de Nantes Atlantique (LEMNA), Institut d'Économie et de Management de Nantes - Institut d'Administration des Entreprises - Nantes (IEMN-IAE Nantes), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-FR 3473 Institut universitaire Mer et Littoral (IUML), Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Project: 678396,H2020,H2020-SFS-2015-2,TAPAS(2016), Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement (IGARUN), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap), FR 3473 Institut universitaire Mer et Littoral (IUML), Université de Bretagne Sud (UBS)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Institut d'Économie et de Management de Nantes - Institut d'Administration des Entreprises - Nantes (IEMN-IAE Nantes), and Université de Bretagne Sud (UBS)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)
Subjects: Site selection, acl, Dynamic energy budget (DEB) model, Off-shore aquaculture, Remote sensing, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, Pacific oyster, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, JEL: Q - Agricultural and Natural Resource Economics • Environmental and Ecological Economics/Q.Q2 - Renewable Resources and Conservation/Q.Q2.Q22 - Fishery • Aquaculture, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography
Abstract: International audience; Oyster production has historically taken place in intertidal zones, and shellfish farms already occupy large extents of the French intertidal space. The expansion of French shellfish aquaculture within intertidal areas is therefore spatially limited, and moving production to the subtidal offshore environment is considered to be a possible solution to this problem. Finding new sites along the French Atlantic coast was studied here from the perspective of small oyster companies run by young farmers, who are interested in offshore bivalve aquaculture expansion compatible with their investment capacity. In assessing the feasibility of such offshore production, we considered three main issues: (1) bivalve growth potential and (2) technical feasibility and conflicting uses, both within a spatial framework, as well as (3) the steps and barriers of the administrative licensing process. Oyster spat in an experimental offshore cage showed significantly faster growth, in terms of both weight and length, compared to those in an intertidal cage, mainly due to lower turbidity and full-time feeding capacity (i.e., constant immersion in the water). A combination of Earth Observation data and bivalve ecophysiological modelling was then used to obtain spatial distribution maps of growth potential, which confirmed that offshore sites have better potential for oyster growth than the traditionally oyster-farmed intertidal sites overall, but that this is highly spatially variable. Small-scale producers indicated two technical factors constraining where farms could be located: bathymetry must be between 5 and 20 m and the distance from a harbor no more than five nautical miles. These were included along with maps of various environmental and socioeconomic constraints in a Spatial Multi-Criteria Evaluation (SMCE). Touristic traffic and bottom trawling by fisherman were found to be the two other most restrictive variables. The GIS-based SMCE developed in this study showed that there is almost 400 km 2 of highly-to very highly-suitable area within which to develop offshore aquaculture using simple, low-cost bottom-cage techniques, and can be used to assist the shellfish industry in the Marine Spatial Planning decision-making process, still in progress in this coastal area. However, the complexity of the administrative processes necessary to obtain an offshore license is perceived as a stronger barrier by farmers owning small companies than site selection, technical feasibility, and required investments, and will be crucial to address in order to realistically proceed to offshore cultivation. The process demonstrated here, and the results are relevant to other coastal and offshore locations throughout the world and can be adapted for other species.
Published: 2020
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4. Supplementary materials : Salt Shock Responses of Microcystis Revealed through Physiological, Transcript, and Metabolomic Analyses

Author: Georges des Aulnois, Maxime, Réveillon, Damien, Robert, Elise, Caruana, Amandine, Briand, Enora, Guljamow, Arthur, Dittmann, Elke, Amzil, Zouher, Bormans, Myriam, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), University of Potsdam, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: microcystin, Microcystis aeruginosa, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, transcript, salt stress, metabolomic
Abstract: International audience; The transfer of from freshwater to estuaries has been described worldwide and salinity is reported as the main factor controlling the expansion of to coastal environments. Analyzing the expression levels of targeted genes and employing both targeted and non-targeted metabolomic approaches, this study investigated the effect of a sudden salt increase on the physiological and metabolic responses of two toxic strains separately isolated from fresh and brackish waters, respectively, PCC 7820 and 7806. Supported by differences in gene expressions and metabolic profiles, salt tolerance was found to be strain specific. An increase in salinity decreased the growth of with a lesser impact on the brackish strain. The production of intracellular microcystin variants in response to salt stress correlated well to the growth rate for both strains. Furthermore, the release of microcystins into the surrounding medium only occurred at the highest salinity treatment when cell lysis occurred. This study suggests that the physiological responses of involve the accumulation of common metabolites but that the intraspecific salt tolerance is based on the accumulation of specific metabolites. While one of these was determined to be sucrose, many others remain to be identified. Taken together, these results provide evidence that is relatively salt tolerant in the mesohaline zone and microcystin (MC) release only occurs when the capacity of the cells to deal with salt increase is exceeded.
Published: 2020
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5. Modeling and analysis of an Absorption Column Connected to a Microalgae Culture

Author: Francis Mairet, Andrés I. Ávila, Carlos Martínez, David Jeison, Leslie Meier, Université Côte d'Azur (UCA), Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Universidad de la frontera [Chile], Escuela de Ingeniería Bioquímica [Valparaíso], Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (PUCV), This work was supported by the project FONDECYT 1120488, by INRIA Chile-CIRIC, by the INRIA associated team Greencore, and by the INRIA Project Lab Algae in silico., COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), and Gouzé, Jean-Luc
Subjects: Steady state (electronics), Absorption column, 7. Clean energy, 01 natural sciences, global asymptotic behavior, biogas upgrading, Shooting method, Biogas, [INFO.INFO-AU]Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, Microalgae, Applied mathematics, Uniqueness, Boundary value problem, 0101 mathematics, Mathematics, microalgae, Applied Mathematics, shooting method, State (functional analysis), Global asymptotic behavior, 010101 applied mathematics, boundary value problem, Biogas upgrading, [INFO.INFO-AU] Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, absorption column
Abstract: International audience; We build and analyze a mathematical model of a system for biogas upgrading: an absorption column connected to a microalgae culture. The construction of the model is based on a chemical engineering approach and classical models of microalgae cultures. In our analysis, we prove the existence and uniqueness of solutions of a boundary value problem describing the absorption column. Some properties of this solution are also proved. Then, we use these results to study the long-term behavior of the mathematical model describing the coupled system. We state sufficient conditions for the existence of a globally attracting steady state characterized by the presence of microalgae. Finally, we find numerically the steady states of the system to test the efficiency of the system for purifying biogas.
Published: 2020
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6. Combining multiple data sets to unravel the spatio-temporal dynamics of a data-limited fish stock

Author: Cecilia Pinto, Youen Vermard, Etienne Rivot, Morgane Travers-Trolet, Jed I. Macdonald, Département Sciences et Technologies Halieutiques / Laboratoire Technologie Halieutique (Ifremer) (STH - LTH), Unité de recherche Sciences et Technologies Halieutiques (STH), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Faculty of Life and Environmental Sciences, University of Iceland [Reykjavik], Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Líf- og umhverfisvísindadeild (HÍ), Faculty of Life and Environmental Sciences (UI), Verkfræði- og náttúruvísindasvið (HÍ), School of Engineering and Natural Sciences (UI), Háskóli Íslands, and University of Iceland
Subjects: Vistkerfi, 0106 biological sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], distributions, population, Aquatic Science, Biology, computer.software_genre, Fish stock, 01 natural sciences, spatial autocorrelation, Sjávarlíffræði, 010104 statistics & probability, 14. Life underwater, mullet, 0101 mathematics, north-sea, uncertainty, species distribution models, climate, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Data limited, 010604 marine biology & hydrobiology, conservation, approximate bayesian-inference, Multiple data, mullus-surmuletus, [SDV.SA.STP]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of fishery, Data mining, Fiskar, computer, [PHYS.PHYS.PHYS-DATA-AN]Physics [physics]/Physics [physics]/Data Analysis, Statistics and Probability [physics.data-an]
Abstract: Publisher's version (útgefin grein), The biological status of many commercially exploited fishes remains unknown, mostly due to a lack of data necessary for their assessment. Investigating the spatiotemporal dynamics of such species can lead to new insights into population processes and foster a path towards improved spatial management decisions. Here, we focused on striped red mullet (Mullus surmuletus), a widespread yet data-limited species of high commercial importance. Aiming to quantify range dynamics in this data-poor scenario, we combined fishery-dependent and -independent data sets through a series of Bayesian mixed-effects models designed to capture monthly and seasonal occurrence patterns near the species’ northern range limit across 20 years. Combining multiple data sets allowed us to cover the entire distribution of the northern population of M. surmuletus, exploring dynamics at different spatiotemporal scales and identifying key environmental drivers (i.e., sea surface temperature, salinity) that shape occurrence patterns. Our results demonstrate that even when process and (or) observation uncertainty is high, or when data are sparse, if we combine multiple data sets within a hierarchical modelling framework, accurate and useful spatial predictions can still be made., CP’s postdoc was funded by Ifremer and France Filière Peche. The authors thank Bruno Ernande for suggestions and comments that improved the work during the analysis. The authors also thank two anonymous reviewers for their comments, which helped to improve the manuscript.
Published: 2019
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7. Usability of the bivalves Dreissena polymorpha and Anodonta anatina for a biosurvey of the neurotoxin BMAA in freshwater ecosystems

Author: Grilot, Théo, Jean, Sarah, Faassen, Elisabeth, Amzil, Zouher, Mineaud, Emilien, Brient, Luc, Savar, Véronique, Robert, Elise, Lepoutre, Alexandra, Hervieux, J., Faassen, E.J., Zweers, A.J., Lürling, Miquel, Geffard, Alain, Lance, Emilie, IFREMER - Nantes, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), and Aquatic Ecology (AqE)
Subjects: Aquatic Ecology and Water Quality Management, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Health, Toxicology and Mutagenesis, Dreissena polymorpha, BU Contaminanten & Toxines, Fresh Water, 010501 environmental sciences, Toxicology, 01 natural sciences, Dreissena, Freshwater ecosystem, β-Methylamino-L-alanine, BU Contaminants & Toxins, Phytoplankton, Neurotoxin, Animals, 14. Life underwater, Anodonta, Ecosystem, 0105 earth and related environmental sciences, Pollutant, WIMEK, biology, Cyanobacteria Toxins, Aquatic ecosystem, Amino Acids, Diamino, General Medicine, Plan_S-Compliant_NO, Contamination, Aquatische Ecologie en Waterkwaliteitsbeheer, biology.organism_classification, Pollution, Bioaccumulation, 6. Clean water, Biosurvey, 13. Climate action, Environmental chemistry, international, Anodonta anatina, [SDE]Environmental Sciences, Water Pollutants, Chemical, Environmental Monitoring
Abstract: The environmental neurotoxin β-methylamino-L-alanine (BMAA) may represent a risk for human health in case of chronic exposure or after short-term exposure during embryo development. BMAA accumulates in freshwater and marine organisms consumed by humans. It is produced by marine and freshwater phytoplankton species, but the range of producers remains unknown. Therefore, analysing the phytoplankton composition is not sufficient to inform about the risk of freshwater contamination by BMAA. Filter-feeders mussels have accumulation capacities and therefore appear to be relevant to monitor various pollutants in aquatic ecosystems. We investigated the suitability of the freshwater mussels Dreissena polymorpha and Anodonta anatina for monitoring BMAA in water. Both species were exposed to 1, 10, and 50 μg of dissolved BMAA/L daily for 21 days, followed by 42 days of depuration in clean water. On days 0, 1, 7, 14, and 21 of exposure and 1, 7, 14, 21 and 42 of depuration, whole D. polymorpha and digestive glands of A. anatina were sampled, and the total BMAA concentration was measured. D. polymorpha accumulated BMAA earlier (from day 1 at all concentrations) and at higher tissue concentrations than A. anatina, which accumulated BMAA from day 14 when exposed to 10 μg BMAA/L and from day 7 when exposed to 50 μg BMAA/L. As BMAA accumulation by D. polymorpha was time and concentration-dependent, with a significant elimination during the depuration period, this species may be able to reflect the levels and dynamics of water contamination by dissolved BMAA. The species A. anatina could be used for monitoring water concentrations above 10 μg BMAA/L. D. polymorpha and A. anatina could be used to biomonitor BMAA in fresh water.
Published: 2019
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8. Usability of the bivalves Dreissena polymorpha and Anodonta anatina for a biosurvey of the neurotoxin BMAA in freshwater ecosystems

Author: Grilot, Théo, Jean, Sarah, Faassen, Elisabeth, Bormans, Myriam, Amzil, Zouher, Mineaud, Emilien, Brient, Luc, Savar, Véronique, Robert, Elise, Lepoutre, Alexandra, Hervieux, J., Faassen, E.J., Zweers, A.J., Lürling, Miquel, Geffard, Alain, Lance, Emilie, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), IFREMER - Nantes, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), and Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)
Subjects: [SDE]Environmental Sciences
Abstract: International audience; The environmental neurotoxin β-methylamino-l-alanine (BMAA) may represent a risk for human health. BMAA accumulates in freshwater and marine organisms consumed by humans. However, few data are available about the kinetics of BMAA accumulation and detoxification in exposed organisms, as well as the organ distribution and the fractions in which BMAA is present in tissues (free, soluble bound or precipitated bound cellular fractions). Here, we exposed the bivalve mussel Dreissena polymorpha to 7.5 µg of dissolved BMAA/mussel/3 days for 21 days, followed by 21 days of depuration in clear water. At 1, 3, 8, 14 and 21 days of exposure and depuration, the hemolymph and organs (digestive gland, the gills, the mantle, the gonad and muscles/foot) were sampled. Total BMAA as well as free BMAA, soluble bound and precipitated bound BMAA were quantified by tandem mass spectrometry. Free and soluble bound BMAA spread throughout all tissues from the first day of exposure to the last day of depuration, without a specific target organ. However, precipitated bound BMAA was detected only in muscles and foot from the last day of exposure to day 8 of depuration, at a lower concentration compared to free and soluble bound BMAA. In soft tissues (digestive gland, gonad, gills, mantle and muscles/foot), BMAA mostly accumulated as a free molecule and in the soluble bound fraction, with variations occurring between the two fractions among tissues and over time. The results suggest that the assessment of bivalve contamination by BMAA may require the quantification of total BMAA in whole individuals when possible.
Published: 2019
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9. Optimal control of bacterial growth for metabolite production: The role of timing and costs of control

Author: H. de Jong, Jean-Luc Gouzé, Eugenio Cinquemani, Francis Mairet, Ivan Yegorov, Modeling, simulation, measurement, and control of bacterial regulatory networks (IBIS), Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut Jean Roget, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), North Dakota State University (NDSU), Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Inria IPL project CoSy, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique)
Subjects: 0209 industrial biotechnology, Computer science, [SDV]Life Sciences [q-bio], 020208 electrical & electronic engineering, Control (management), 02 engineering and technology, Business process reengineering, Bacterial growth, Optimal control, Bioproduction, Synthetic biology, 020901 industrial engineering & automation, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, Production (economics), Resource allocation, [INFO]Computer Science [cs], Biochemical engineering, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Abstract: International audience; The growth of microorganisms is controlled by strategies for the dynamical allocation of available resources over different cellular functions. Synthetic biology approaches are considered nowadays to artificially modify these strategies and turn microbial populations into biotechnological factories for the production of metabolites of interest. In our recent work [1], [2] we have studied dynamics of microbial resource allocation and growth in terms of coarse-grained self-replicator models described by ordinary differential equations, and proposed artificial control strategies for the optimization of metabolite production based on the reengineering of resource allocation. In this paper, we elaborate on our earlier results and further investigate synthetic resource allocation control strategies. Using numerical simulation, we study the effect on growth and bioproduction of the (biological or technological) costs associated with discontinuous control strategies, and of the time allotted to optimal substrate utilization. Results provide novel insight into the most favorable synthetic control strategies.
Published: 2019
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10. Modelling paralytic shellfish toxins (PST) accumulation in Crassostrea gigas by using Dynamic Energy Budgets (DEB)

Author: Yoann Thomas, Eric Rannou, Jonathan Flye-Sainte-Marie, Philippe Soudant, Emilien Pousse, Marianne Alunno-Bruscia, Hélène Hégaret, Caroline Fabioux, Ludovic Hermabessiere, Zouher Amzil, Gonçalo M. Marques, Justine Castrec, Malwenn Lassudrie, Laure Pecquerie, Fred Jean, Marc Long, Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique (LMBA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Instituto Superior Técnico, Technical University of Lisbon, School of Chemistry [Wollongong], University of Wollongong [Australia], Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), ANR-10-LABX-0019,LabexMER,LabexMER Marine Excellence Research: a changing ocean(2010), ANR-13-CESA-0019,ACCUTOX,De la caractérisation des déterminants de l'accumulation des toxines paralysantes (PST) chez l'huître (Crassostrea gigas) au risque sanitaire pour l'homme dans son contexte sociétal(2013), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Marine, Environment and Technology Center (MARATEC), School of Chemistry, University of Wollongong, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-11-LABX-0020,LEBESGUE,Centre de Mathématiques Henri Lebesgue : fondements, interactions, applications et Formation(2011)
Subjects: 0106 biological sciences, Oyster, Alexandrium minutum, Dynamic energy budget, Paralytic shellfish toxins (PST), Zoology, Aquatic Science, Oceanography, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Modelling, chemistry.chemical_compound, biology.animal, medicine, Pacific oyster, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Shellfish, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, Saxitoxin, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, biology, 010604 marine biology & hydrobiology, ACL, fungi, Dinoflagellate, food and beverages, Dynamic Energy Budget (DEB), biology.organism_classification, medicine.disease, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, Shellfish poisoning, [SDV.BA.ZI]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Invertebrate Zoology, chemistry, [SDE]Environmental Sciences, Crassostrea, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, Clearance rate
Abstract: International audience; As other filter-feeders, Crassostrea gigas can concentrate paralytic shellfish toxins (PST) by consuming dino-flagellate phytoplankton species like Alexandrium minutum. Intake of PST in oyster tissues mainly results from feeding processes, i.e. clearance rate, pre-ingestive sorting and ingestion that are directly influenced by environmental conditions (trophic sources, temperature). This study aimed to develop a mechanistic model coupling the kinetics of PST accumulation and bioenergetics in C. gigas based on Dynamic Energy Budget (DEB) theory. For the first time, the Synthesizing Units (SU) concept was applied to formalize the feeding preference of oysters between non-toxic and toxic microalgae. Toxin intake and accumulation were both dependent on the physiological status of oysters. The accumulation was modelled through the dynamics of two toxin compartments: (1) a compartment of ingested but non-assimilated toxins, with labile toxins within the digestive gland eliminated via faeces production; (2) a compartment of assimilated toxins with a rapid detoxification rate (within a few days). Firstly, the DEB-PST model was calibrated using data from two laboratory experiments where oysters have been exposed to A. minutum. Secondly, it was validated using data from another laboratory experiment and from three field surveys carried out in the Bay of Brest (France) from 2012 to 2014. To account for the variability in PST content of A. minutum cells, the saxitoxin (STX) amount per energy units in a toxic algae (ppsT) was adjusted for each dataset. Additionally, the effects of PST on the oyster bioenergetics were calibrated during the first laboratory experiment. However, these effects were shown to depend on the strain of A. minutum. Results of this study could be of great importance for monitoring agencies and decision makers to identify risky conditions (e.g. production areas, seawater temperature), to properly assess detoxification step (e.g. duration, modalities) before any commercialization or to improve predictions regarding closing of shellfish areas.
Published: 2019
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11. Microcarriers Based on Glycosaminoglycan-Like Marine Exopolysaccharide for TGF-beta1 Long-Term Protection

Author: Zykwinska, Agata, Marquis, Mélanie, Godin, Mathilde, Marchand, Laëtitia, Sinquin, Corinne, Garnier, Catherine, Jonchère, Camille, Chédeville, Claire, Le Visage, Catherine, Guicheux, Jérôme, Colliec-Jouault, Sylvia, Cuenot, Stéphane, Laboratoire Ecosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies [IFREMER, Nantes], Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Regenerative Medicine and Skeleton research lab (RMeS), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Nantes - UFR Odontologie, Université de Nantes (UN), Ostéo-articulaire - Tête et cou - Odontologie - Neurochirurgie - Neurotraumatologie [CHU Nantes] (Pôle hospitalo-universitaire PHU4 - OTONN), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut des Matériaux Jean Rouxel (IMN), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), UFR d’Odontologie [CHU Hôtel Dieu, Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies (EM3B), Biotechnologies et Ressources Marines (BRM), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Regenerative Medicine and Skeleton (RMeS), École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Jehan, Frederic
Subjects: Cartilage, Articular, Drug Compounding, microfluidics, Biological Availability, Article, Cell Line, Transforming Growth Factor beta1, Hydrothermal Vents, Polysaccharides, Humans, Regeneration, lcsh:QH301-705.5, Drug Implants, microparticles, Drug Carriers, [SDV.MHEP.RSOA] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Rhumatology and musculoskeletal system, Tissue Scaffolds, [SDV.MHEP.GEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Geriatry and gerontology, [SDV.MHEP.GEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Geriatry and gerontology, growth factor, Drug Liberation, lcsh:Biology (General), [SDV.MHEP.RSOA]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Rhumatology and musculoskeletal system, bioactivity, Delayed-Action Preparations, exopolysaccharide, Alteromonas
Abstract: Articular cartilage is an avascular, non-innervated connective tissue with limited ability to regenerate. Articular degenerative processes arising from trauma, inflammation or due to aging are thus irreversible and may induce the loss of the joint function. To repair cartilaginous defects, tissue engineering approaches are under intense development. Association of cells and signalling proteins, such as growth factors, with biocompatible hydrogel matrix may lead to the regeneration of the healthy tissue. One current strategy to enhance both growth factor bioactivity and bioavailability is based on the delivery of these signalling proteins in microcarriers. In this context, the aim of the present study was to develop microcarriers by encapsulating Transforming Growth Factor-&beta, 1 (TGF-&beta, 1) into microparticles based on marine exopolysaccharide (EPS), namely GY785 EPS, for further applications in cartilage engineering. Using a capillary microfluidic approach, two microcarriers were prepared. The growth factor was either encapsulated directly within the microparticles based on slightly sulphated derivative or complexed firstly with the highly sulphated derivative before being incorporated within the microparticles. TGF-&beta, 1 release, studied under in vitro model conditions, revealed that the majority of the growth factor was retained inside the microparticles. Bioactivity of released TGF-&beta, 1 was particularly enhanced in the presence of highly sulphated derivative. It comes out from this study that GY785 EPS based microcarriers may constitute TGF-&beta, 1 reservoirs spatially retaining the growth factor for a variety of tissue engineering applications and in particular cartilage regeneration, where the growth factor needs to remain in the target location long enough to induce robust regenerative responses.
Published: 2019
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12. Oceanic mercury concentrations on both sides of the Strait of Gibraltar decreased between 1989 and 2012

Author: Bastien Thomas, Francesca Sprovieri, Philippe Courau, Daniel Cossa, Marie Boye, Nicolas Marusczak, Joël Knoery, Institut des Sciences de la Terre (ISTerre), Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire de Science et Technologie de la Biomasse Marine, Nantes (IFREMER), Laboratoire de Science et Technologie de la Biomasse Marine, Biogéochimie et Ecotoxicologie (IFREMER BE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Atmospheric Pollution Research (IIA), Consiglio Nazionale delle Ricerche [Roma] (CNR), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-PRES Université de Grenoble-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Département Biogéochimie et Ecotoxicologie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-IPG PARIS-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Laboratoire Biogéochimie des Contaminants Métalliques (LBCM), Biogéochimie et Ecotoxicologie (BE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), National Research Council of Italy | Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), and European Project: 265113,EC:FP7:ENV,FP7-ENV-2010,GMOS(2010)
Subjects: Mediterranean climate, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Natural cycle, chemistry.chemical_element, North east, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), Mediterranean Sea, Ecosystem, 14. Life underwater, Atlantic Ocean, 0105 earth and related environmental sciences, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Global and Planetary Change, Gibraltar, Ecology, Aquatic ecosystem, Pelagic zone, Mercury, Mercury (element), Oceanography, chemistry, 13. Climate action, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Bioaccumulation, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science
Abstract: Mercury (Hg) is a toxic metal that threatens the health of aquatic ecosystems and fish consumers. Its natural cycle has been deeply perturbed by Anthropogenic Hg emissions have deeply perturbed its natural cycle, especially since the start of the Industrial Revolution circa 1850 CE. Anthropogenic Hg emissions from North America and Europe have decreased by a factor of two in the last decades following the implementation of strict regulations. The response of North Atlantic Ocean and Mediterranean waters to this decrease remains poorly documented by field observations. A comparison of results obtained between 1989 and 2012 shows a significant decrease of Hg concentrations in waters on both sides of the Strait of Gibraltar. West of Gibraltar, the Hg decrease ranges from ∼35 % in the upper North East Atlantic Deep Water to ∼50 % in the North East Atlantic Central Water. East of Gibraltar, the observed decrease is ∼30 % in the Western Mediterranean Deep Water. No decrease is observed in the deep Atlantic Ocean layer that formed before the industrial era. These results strongly substantiate the effectiveness of global anti-pollution policies on Hg contamination in oceanic waters. A consequent decline of Hg bioaccumulation in Northeastern Atlantic and Western Mediterranean pelagic ecosystems still requires verification.
Published: 2019
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13. Hide and seek in the Bay of Biscay—a functional investigation of marine megafauna and small pelagic fish interactions

Author: Jérôme Spitz, C. Lambert, Vincent Ridoux, Ghislain Dorémus, Mathieu Doray, Matthieu Authier, Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 (CEBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire PELAGIS UMS 3462 (PELAGIS), LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMR 7266 (LIENSs), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IFREMER - Nantes, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMRi 7266 (LIENSs), and Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Ecology, predator-prey interactions, 010604 marine biology & hydrobiology, Hide and seek, predator–prey interactions, Pelagic zone, Aquatic Science, Oceanography, Bay of Biscay, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Fishery, cetaceans, prey profitability, marine top predators, Geography, Megafauna, predator avoidance, [SDE]Environmental Sciences, 14. Life underwater, functional traits, Bay, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, seabirds
Abstract: Prey and predator distributions influence one another. Understanding the scale and the orientation of predator–prey spatial correlations is crucial in foraging ecology. Growing evidence suggests that predator–prey interactions are more constrained by functional characteristics of both the predator and the prey. Unfortunately, in marine pelagic systems, the scale and orientation of spatial correlations between predators and prey have been only little explored from a functional point of view. We tested the existence of fine-scale association between predators and fish functional groups. Visual predator sightings and acoustic fish records were collected synchronously during oceanographic surveys from 2004 to 2014. Prey biomass was integrated by nautical miles and split into four size classes (30 cm) and two depth layers (surface, deep). We computed the relative biomass by prey size and depth category from 0 to 12 nm around predator sightings to determine the predators’ proximity to local prey biomass. Two cetaceans (common, bottlenose dolphins) and three seabirds (northern gannets, auks, northern fulmars) were studied. No association was found in fulmars, indicating they probably do not feed on considered fishes in the area. Gannets and auks were positively correlated with local prey biomass for sizes
Published: 2019
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14. Unique Biosynthetic Pathway in Bloom-Forming Cyanobacterial Genus Microcystis Jointly Assembles Cytotoxic Aeruginoguanidines and Microguanidines

Author: Christian Hertweck, Claire Pancrace, Muriel Gugger, Enora Briand, Arthur Guljamow, Keishi Ishida, Nathalie Sassoon, Annika R. Weiz, Thibault Scalvenzi, Douglas Gatte Pichi, Elke Dittmann, Collection des Cyanobactéries, Institut Pasteur [Paris], Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Leibniz-Institute for Natural Product Research and Infection Biology - Hans-Knöll-Institute, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology (Hans Knoell Institute), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), University of Potsdam, Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany], DFG-fundedCollaborative Research Centre ChemBioSys (SFB 1127, Institut Pasteur [Paris] (IP), University of Potsdam = Universität Potsdam, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES (UMR_7618 / UMR_D_242 / UMR_A_1392 / UM_113) ), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), and Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany]
Subjects: 0301 basic medicine, Cyanobacteria, Microcystis, Metabolite, [SDV]Life Sciences [q-bio], 01 natural sciences, Biochemistry, Genome, Guanidines, METABOLITES, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Nonribosomal peptide, ddc:570, RESOURCE, Gene cluster, Axenic, Institut für Biochemie und Biologie, chemistry.chemical_classification, biology, 010405 organic chemistry, Biological activity, PEPTIDES, General Medicine, Eutrophication, biology.organism_classification, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, 6. Clean water, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Biosynthetic Pathways, 030104 developmental biology, chemistry, 13. Climate action, ESCHERICHIA-COLI, DISCOVERY, Molecular Medicine, GENOMICS
Abstract: International audience; The cyanobacterial genus Microcystis is known to produce an elaborate array of structurally unique and biologically active natural products, including hazardous cyanotoxins. Cytotoxic aeruginoguanidines represent a yet unexplored family of peptides featuring a trisubstituted benzene unit and farnesylated arginine derivatives. In this study, we aimed at assigning these compounds to a biosynthetic gene cluster by utilizing biosynthetic attributes deduced from public genomes of Microcystis and the sporadic distribution of the metabolite in axenic strains of the Pasteur Culture Collection of Cyanobacteria. By integrating genome mining with untargeted metabolomics using liquid chromatography with mass spectrometry, we linked aeruginoguanidine (AGD) to a nonribosomal peptide synthetase gene cluster and coassigned a significantly smaller product to this pathway, microguanidine (MGD), previously only reported from two Microcystis blooms. Further, a new intermediate class of compounds named microguanidine amides was uncovered, thereby further enlarging this compound family. The comparison of structurally divergent AGDs and MGDs reveals an outstanding versatility of this biosynthetic pathway and provides insights into the assembly of the two compound subfamilies. Strikingly, aeruginoguanidines and microguanidines were found to be as widespread as the hepatotoxic microcystins, but the occurrence of both toxin families appeared to be mutually exclusive. M icrocystis is a dominant bloom-forming cyanobacterium occurring in temperate freshwater ecosystems. 1 The genus is infamous for the production of the well-known hepatotoxin microcystin. 2 Both blooms and toxins cause ecosystem disturbance and public health threats and constitute a growing concern in the frame of freshwater eutrophication and global warming. Microcystis has also been described as a producer of a multitude of bioactive natural products, some of interest for biotechnological and pharmaceutical application. 3−5 Cytotoxic aeruginoguanidines (AGDs) represent one of the most remarkable families of compounds described for Microcystis. 6 The three AGD congeners reported for strain Microcystis aeruginosa NIES-98 feature highly unprecedented characteristics such as a 1-(4-hydroxy-3-hydroxymethyl)-phenyl-1-hydroxy-2-propylamine-4′,3′,1-triO -sulfate (Hphpa trisulfate) moiety, along with geranylation and prenylation of arginines (Figure 1A). While bloom-forming Microcystis belong to the most intensively studied cyanobacteria, AGDs were reported only twice from a bloom in Czech Republic and an isolate in Brazil, 7,8 never from any other cyanobacteria. Their intricate features confine AGDs into a unique compound family. 3 Our recent genomic analysis of ten Microcystis strains revealed that the different genotypes share a highly similar core genome, while their biosynthetic gene clusters (BGCs) involved in natural product (NP) formation show a sporadic distribution. Moreover, we uncovered three cryptic BGCs not
Published: 2019
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15. Investigation of interactions between the marine GY785 exopolysaccharide and transforming growth factor-β1 by atomic force microscopy

Author: Mélanie Marquis, Corinne Sinquin, Stéphane Cuenot, Agata Zykwinska, Laëtitia Marchand, Sylvia Colliec-Jouault, Institut des Matériaux Jean Rouxel (IMN), Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Ecosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), ANR, French National Research Agency [ANR-17-CE08-0001], Pays de la Loire region, and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique)
Subjects: 0301 basic medicine, Polymers and Plastics, 02 engineering and technology, Plasma protein binding, Nanoassemblies, Glycosaminoglycan, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Sulfation, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Materials Chemistry, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, AFM imaging, Sulfate, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Glycosaminoglycans, Sulfated polysaccharides, Atomic force microscopy, Organic Chemistry, Force spectroscopy, 021001 nanoscience & nanotechnology, 030104 developmental biology, chemistry, Single-molecule force spectroscopy, Biophysics, [PHYS.COND.CM-MS]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Materials Science [cond-mat.mtrl-sci], 0210 nano-technology, Macromolecule, Transforming growth factor
Abstract: International audience; Sulfated polysaccharides, such as glycosaminoglycans (GAG) regulate various biological activities through their interactions with growth factors. Investigating these interactions becomes the key to understand the structurefunction relationship of GAG. Highly sulfated derivatives prepared from the marine GY785 exopolysaccharide (EPS) produced by the deep-sea hydrothermal vent bacterium Alteromonas infernus have previously shown to stimulate the chondrogenic differentiation of mesenchymal stem cells in the presence of Transforming Growth Factor-beta 1 (TGF-beta 1). Here, the interactions between the GAG-mimetic GY785 EPS derivatives and TGF-beta 1 were investigated by Atomic Force Microscopy (AFM). The affinity between slightly sulfated or highly sulfated derivatives and TGF-beta 1 was explored by AFM imaging and single-molecule force spectroscopy experiments. The number of measured interactions and the interaction strength were both higher for highly sulfated derivative compared to the slightly sulfated one. These results clearly emphasize the involvement of sulfate groups in the protein binding and open new ways to tune cellular processes by designing macromolecules with adjustable sulfate charge density.
Published: 2018
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16. Concentration and purification of Porphyridium cruentum exopolysaccharides by membrane filtration at various cross-flow velocities

Author: Marthe Gilbert, Corinne Sinquin, Benjamin Le Gouic, Anthony Massé, Nicolas Brodu, Sophie Le Gall, Romain Le Balc’h, Rafik Balti, Bioprocédés Appliqués aux Microalgues (GEPEA-BAM), Laboratoire de génie des procédés - environnement - agroalimentaire (GEPEA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Ifremer, French Regional Council of the 'Pays de la Loire', and Nantes University
Subjects: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Exopolysaccharides, Concentration, Bioengineering, Polysaccharide, Diafiltration, 01 natural sciences, Applied Microbiology and Biotechnology, Biochemistry, 03 medical and health sciences, [SPI]Engineering Sciences [physics], 010608 biotechnology, Monosaccharide, Dry matter, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, chemistry.chemical_classification, Chromatography, biology, Permeation, biology.organism_classification, 6. Clean water, 030104 developmental biology, Ceramic membrane, Membrane, chemistry, Porphyridium cruentum, Membrane filtration, Microalga
Abstract: International audience; Exopolysaccharides (EPS) from cell-free Porphyridiwn cruentum media were concentrated then purified (diafiltration) on a 0.14 ism ceramic membrane. The influence of cross-flow velocities on filtration performances was investigated. Mean permeate fluxes equal to 49.8, 68.9 and 81.9 L h(-1). m(-2) were obtained during the concentration at 4 bars for respectively cross-flow velocities inside the membrane lumen equal to 2.5, 3.3 and 4.2 m s(-1); 49.7 Lm(-1). M-2 for the diafiltration at 3.3 m s(-1). Permeate fluxes were correctly predicted from polysaccharide concentrations (10% deviation). Volume reduction factors higher than 7.8 were reached. Rejection rates of polysaccharides and proteins varied according to the cross-flow velocities. Thus, the EPS recovery rate or time of filtration could be modulated following the cross-flow velocity. Polysaccharides were concentrated 6.3 to 10.4 times in such a way that the final sugars concentration reached 1.74-2.26 g L-1. Rheological behavior of filtered solutions changed following the concentration progress. More than 80% (w/w) of polysaccharides were recovered while 49% and 99% of proteins and salts were removed respectively. The filtrations allowed reaching a final monosaccharide content of dry matter equal to 48.9% against 0.6% (w/w) initially.
Published: 2018
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17. Procédure de qualification des donnnées Quadrige² - Données chimie RNOPHY (Imposex)

Author: Enez, Florian, Gauthier, Emilie, Pellouin-Grouhel, Anne, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Ifremer Nantes, Rue de l'Île d'Yeu, 44980 Nantes, and Enez, Florian
Subjects: [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: La qualification a pour objectif d’attribuer un niveau de qualité aux données : Bon, Douteux ou Faux. Le processus de qualification consiste à rechercher des anomalies plus ou moins complexes dans les données stockées dans la base de données Quadrige², les anomalies étant définies par les responsables de programme Quadrige ou responsables thématiques. Ces recherches d’anomalies sont faites en lien avec la cellule quadrige². La qualification des données peut se faire : • de façon ponctuelle : identification d’un problème de processus analytique pour quelques données • en routine : un processus de qualification dite « automatique » permet de qualifier les enregistrements individuellement (cohérence des informations de chaque résultat individuellement). Puis une qualification dite « experte » permet de vérifier la cohérence d’un résultat par rapport aux autres résultats (séries temporelles, analyse graphique ou statistique). Le présent document décrit les processus de qualification en routine des données du réseau ROCCH – volet IMPOSEX (programme RNOPHY de Quadrige).
Published: 2018

18. The GEOTRACES Intermediate Data Product 2017

Author: Thomas J. Browning, Hans-Jürgen Brumsack, Katharina Pahnke, Saeed Roshan, Stephanie Owens, Rosie Chance, Peter Croot, Steven van Heuven, Alison E. Hartman, Mercedes López-Lora, Pu Zhang, Heather A. Bouman, Géraldine Sarthou, François Lacan, Robyn E. Tuerena, José Marcus Godoy, Ester Garcia-Solsona, Steven L. Goldstein, Hans A. Slagter, Celia Venchiarutti, A. Russell Flegal, Emily Townsend, Ralph Till, Christopher T. Hayes, Melanie Gault-Ringold, Ros Watson, Peter N. Sedwick, Chandranath Basak, Bronwyn Wake, Loes J. A. Gerringa, Noriko Nakayama, Lars-Eric Heimbürger, Paul J. Morris, François Fripiat, Paul B. Henderson, Chris J. Daniels, Catherine Jeandel, Helen M. Snaith, Patrizia Ziveri, Toshitaka Gamo, Yanbin Lu, Oliver J. Lechtenfeld, Yingzhe Wu, Andreas Wisotzki, Hajime Obata, Cynthia Dumousseaud, Ashley T. Townsend, Sebastian Mieruch, Donna Cockwell, Laurent Bopp, Elena Masferrer Dodas, Bernhard Schnetger, J. K. Klar, Sunil K. Singh, Joaquin E. Chaves, Kuo-Fang Huang, Louise A. Zimmer, Laura F. Robinson, Michiel M Rutgers van der Loeff, Corey Archer, Feifei Deng, Karen Grissom, Robert Rember, Nicholas J. Hawco, Jingfeng Wu, Robert M. Sherrell, Rachel U. Shelley, Jan-Lukas Menzel Barraqueta, E. Malcolm S. Woodward, Fanny Chever, Yuichiro Kumamoto, Hélène Planquette, Dorothea Bauch, Frank Dehairs, Daniel C. Ohnemus, Akira Nishiuchi, Paul D. Quay, Sanjin Mehic, Zichen Xue, Maxi Castrillejo, Brian Peters, Michael J. Ellwood, Stephen R. Rintoul, Tobias Roeske, Jing Zhang, Gretchen J. Swarr, Peng Ho, Ken O. Buesseler, Gwenaelle Moncoiffe, Martin Frank, Maureen E. Auro, Abby Bull, David Kadko, Montserrat Roca-Martí, Maeve C. Lohan, Roulin Khondoker, Patricia Cámara Mor, Melissa Gilbert, Sebastian M. Vivancos, Erin E. Black, Santiago R. Gonzalez, Gideon M. Henderson, David J. Janssen, Sylvain Rigaud, Amandine Radic, Maxence Paul, Cyril Abadie, Ana Aguliar-Islas, Seth G. John, Marie Boye, Evgenia Ryabenko, Abigail E. Noble, Luke Bridgestock, Brian Duggan, Hisayuki Yoshikawa, Jun Nishioka, Kathrin Wuttig, Pieter van Beek, Jana Friedrich, Thomas M. Church, Maija Heller, Stephen J.G. Galer, Pier van der Merwe, Claire P. Till, Xin Yuan Zheng, Henning Fröllje, John Niedermiller, Howie D. Scher, Johnny Stutsman, Patricia Zunino, Christel S. Hassler, Ye Zhao, Tim M. Conway, William M. Landing, Yang Xiang, Katrin Bluhm, Maria T. Maldonado, Elena Chamizo, Sabrina Speich, Claudine H. Stirling, Guillaume Brissebrat, Matthew A. Charette, Jeremy E. Jacquot, Yu-Te Hsieh, Pinghe Cai, Ivia Closset, Yoshiki Sohrin, Ejin George, Jong-Mi Lee, Leopoldo D. Pena, Edward Mawji, Damien Cardinal, Catherine Pradoux, Martin Q. Fleisher, Virginie Sanial, Derek Vance, Craig A. Carlson, Pere Masqué, Katlin L. Bowman, Evaline M. van Weerlee, Oliver Baars, Ruifang C. Xie, María Villa-Alfageme, Hein J W de Baar, M. Alexandra Weigand, Tina van de Flierdt, J. Bown, Timothy C. Kenna, Kenneth W. Bruland, Jeroen E. Sonke, Hai Cheng, Mark J. Warner, Sven Ober, Rob Middag, Jessica N. Fitzsimmons, Emilie Le Roy, Yishai Weinstein, Nicholas R. Bates, Joerg Rickli, Daniel M. Sigman, Hendrik M. van Aken, Angela Milne, Cheryl M. Zurbrick, Gregory A. Cutter, Igor Semiletov, Marie Labatut, Torben Stichel, Pascale Lherminier, Gabriel Dulaquais, Jay T. Cullen, Christopher I. Measures, Mark Rosenberg, Tomoharu Minami, Mariko Hatta, Alexander L. Thomas, Gonzalo Carrasco, Karel Bakker, Clifton S. Buck, Maarten B Klunder, Willard S. Moore, Reiner Schlitzer, Tomas A. Remenyi, Susan H. Little, Eberhard Fahrbach, Charles R. McClain, Edward A. Boyle, Ursula Schauer, Linjie Zheng, Alex R. Baker, Emma Slater, Kay Thorne, Patrick Laan, Christina Schallenberg, Reiner Steinfeldt, Benjamin S. Twining, Yolanda Echegoyen-Sanz, Neil J. Wyatt, Alison M. Agather, Viena Puigcorbé, Peter Scott, Gillian Stewart, Matthew P. Humphreys, Frédéric A. C. Le Moigne, Phoebe J. Lam, Núria Casacuberta, Josh Helgoe, Edward C.V. Butler, Mark Rehkämper, Elizabeth M. Jones, Karen L. Casciotti, James W. Moffett, Tristan J. Horner, Sue Velazquez, Yuzuru Nakaguchi, Micha J.A. Rijkenberg, Antje H L Voelker, Joseph A. Resing, Lesley Salt, Eric P. Achterberg, Sven Kretschmer, Jan van Ooijen, Dominik J. Weiss, Moritz Zieringer, Carl H. Lamborg, Rick Kayser, Pierre Branellec, John M. Rolison, Sara Rauschenberg, Walter Geibert, Raja S. Ganeshram, Myriam Lambelet, Janice L. Jones, Chad R. Hammerschmidt, William J. Jenkins, Jordi Garcia-Orellana, Alessandro Tagliabue, Philip W. Boyd, Alan M. Shiller, Marcus Christl, Mark Baskaran, Mak A. Saito, Huong Thi Dieu, Morten B. Andersen, Kenji Isshiki, Taejin Kim, Christian Schlosser, Melanie K. Behrens, Albert S. Colman, Frédéric Planchon, Bettina Sohst, Andrew R. Bowie, Mark A. Brzezinski, R. Lawrence Edwards, Kristen N. Buck, Jeanette O'Sullivan, William M. Smethie, Wafa Abouchami, Valentí Rodellas, Ed C Hathorne, Robert F. Anderson, James H. Swift, Frank J. Pavia, Daniel Cossa, Lauren Kipp, Peter L. Morton, Fabien Quéroué, Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI), Centre for Automotive Safety Research, University of Adelaide, University of California, National Oceanography Centre (NOC), Scottish Association for Marine Science (SAMS), Department of Oceanography [Cape Town], University of Cape Town, Antarctic Climate and Ecosystems Cooperative Research Centre (ACE-CRC), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Max Planck Institute for Chemistry (MPIC), Max-Planck-Gesellschaft, University of Toyama, Department of Marine Chemistry and Geochemistry (WHOI), Woods Hole Oceanographic Institution (WHOI), Royal Netherlands Institute for Sea Research (NIOZ), Leibniz-Institut für Meereswissenschaften (IFM-GEOMAR), Department of Geology, Wayne State University [Detroit], The Bartlett, University College of London [London] (UCL), Institute for Environmental Research, Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule Aachen (RWTH), Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) (LMD), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-École des Ponts ParisTech (ENPC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département des Géosciences - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Department of Earth Sciences [Oxford], University of Oxford [Oxford], Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Cycles biogéochimiques marins : processus et perturbations (CYBIOM), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Research on Learning, Services communs OMP - UMS 831 (UMS 831), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Marine Science Institute [Santa Barbara] (MSI), University of California [Santa Barbara] (UCSB), University of California-University of California, National Oceanography Centre [Southampton] (NOC), University of Southampton, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), University of Victoria [Canada] (UVIC), Massachusetts Institute of Technology (MIT), Universidad de Dakota del Sur, Analytical, Environmental and Geo- Chemistry, Vrije Universiteit [Brussels] (VUB), Wright State University, School of Geography, Earth and Environmental Sciences [Plymouth] (SoGEES), Plymouth University, Lamont-Doherty Earth Observatory (LDEO), Columbia University [New York], Alfred Wegener Institute [Potsdam], Institute of Global Environmental Change [China] (IGEC), Xi'an Jiaotong University (Xjtu), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Mathematics and Science, National Taiwan Normal University (NTNU), School of Information Technology [Kharagpur], Indian Institute of Technology Kharagpur (IIT Kharagpur), GEOMAR - Helmholtz Centre for Ocean Research [Kiel] (GEOMAR), University of California [Davis] (UC Davis), Institut de Ciencia i Tecnologia Ambientals (ICTA), Universitat Autònoma de Barcelona [Barcelona] (UAB), Institute of Low Temperature Science, Hokkaido University, The University of Tokyo, Institute for Marine and Antarctic Studies [Horbat] (IMAS), University of Tasmania (UTAS), Joint Institute for the Study of the Atmosphere and Ocean (JISAO), University of Washington [Seattle], Institute of Geochemistry and Petrology, Détection, évaluation, gestion des risques CHROniques et éMErgents (CHROME) / Université de Nîmes (CHROME), Université de Nîmes (UNIMES), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), School of Earth and Ocean Sciences, University of Victoria, Knowledge Media Institute (KMI), The Open University [Milton Keynes] (OU), Bermuda Biological Station for Research (BBSR), Bermuda Biological Station for Research, Department of Geosciences [Princeton], Princeton University, Kyoto University [Kyoto], Géochimie des Isotopes Stables (GIS), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), School of Earth and Environmental Sciences [Queens New York], Queens College [New York], City University of New York [New York] (CUNY)-City University of New York [New York] (CUNY), SOEST, University of Hawai‘i [Mānoa] (UHM), Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Bigelow Laboratory for Ocean Sciences, Department of Earth Science and Technology [Imperial College London], Imperial College London, Plymouth Marine Laboratory, Rosenstiel School of Marine and Atmospheric Science (RSMAS), University of Miami [Coral Gables], Tsinghua National Laboratory for Information Science and Technology (TNList), RITE, Research Institute of Innovative Technology for the Earth, Agricultural Information Institute (AII), Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Department of Mathematics [Shanghai], Shanghai Jiao Tong University [Shanghai], University of California [Irvine] (UCI), Institute of Environmental Science and Technology [Barcelona] (ICTA), University of California (UC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule Aachen University (RWTH), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), University of Oxford, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Southern California (USC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Laboratoire d'Océanographie Physique et Spatiale (LOPS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Services communs OMP (UMS 831), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France, University of California [Santa Barbara] (UC Santa Barbara), University of California (UC)-University of California (UC), Institut des Sciences de la Terre (ISTerre), Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Vrije Universiteit Brussel (VUB), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Florida International University [Miami] (FIU), Department of Earth Science and Engineering [Imperial College London], Helmholtz Centre for Ocean Research [Kiel] (GEOMAR), Universitat Autònoma de Barcelona (UAB), British Oceanographic Data Centre (BODC), Institute of Low Temperature Science [Sapporo], Hokkaido University [Sapporo, Japan], The University of Tokyo (UTokyo), Institute of Geochemistry and Petrology [ETH Zürich], Department of Earth Sciences [Swiss Federal Institute of Technology - ETH Zürich] (D-ERDW), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich)- Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), College of Earth, Ocean, and Environment [Newark] (CEOE), University of Delaware [Newark], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Knowledge Media Institute (KMi), Kyoto University, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Academia Sinica, University of California [Irvine] (UC Irvine), Danish Technological Institute (DTI), Scientific Committee on Oceanic Research (SCOR) from the U.S. National Science Foundation [OCE-0608600, OCE-0938349, OCE-1243377, OCE-1546580], UK Natural Environment Research Council (NERC), Ministry of Earth Science of India, Centre National de Recherche Scientifique, l'Universite Paul Sabatier de Toulouse, Observatoire Midi-Pyrenees Toulouse, Universitat Autonoma de Barcelona, Kiel Excellence Cluster The Future Ocean, Swedish Museum of Natural History, University of Tokyo, University of British Columbia, Royal Netherlands Institute for Sea Research, GEOMAR-Helmholtz Centre for Ocean Research Kiel, Alfred Wegener Institute, Scientific Committee on Oceanic Research, National Science Foundation (US), Natural Environment Research Council (UK), Ministry of Earth Sciences (India), Centre National de la Recherche Scientifique (France), Université Toulouse III Paul Sabatier, Observatoire Midi-Pyrénées (France), Universidad Autónoma de Barcelona, Helmholtz Centre for Ocean Research Kiel, Alfred Wegener Institute Helmholtz Centre for Polar and Marine Research (Germany), Schlitzer, Reiner [0000-0002-3740-6499], Masferrer Dodas, Elena [0000-0003-0879-1954], Chamizo, Elena [0000-0001-8266-6129], Christl, M. [0000-0002-3131-6652], Masqué, Pere [0000-0002-1789-320X], Villa-Alfageme, María [0000-0001-7157-8588], Universitat de Barcelona, Natural Environment Research Council (NERC), Leverhulme Trust, Massachusetts Institute of Technology. Department of Earth, Atmospheric, and Planetary Sciences, Carrasco Rebaza, Gonzalo, Echegoyen Sanz, Yolanda, Kayser, Richard A, Isotope Research, Ocean Ecosystems, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Hassler, Christel, Schlitzer, Reiner, Masferrer Dodas, Elena, Chamizo, Elena, Christl, M., Masqué, Pere, and Villa-Alfageme, María
Subjects: Geochemistry & Geophysics, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Isòtops, sub-01, Geotraces, MODELS, Digital data, Context (language use), 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, IDP2017, Isotopes, Geochemistry and Petrology, Oceans, Electronic atlas, ddc:550, 0402 Geochemistry, 14. Life underwater, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, NetCDF, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Trace elements, Science & Technology, Information retrieval, ACL, Geology, computer.file_format, Ocean Data View, Metadata, Data processing, GEOTRACES, 0403 Geology, Data extraction, 13. Climate action, Data quality, Physical Sciences, [SDE]Environmental Sciences, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, 0406 Physical Geography and Environmental Geoscience, computer, Processament de dades, Trace elements Isotopes
Abstract: The GEOTRACES Intermediate Data Product 2017 (IDP2017) is the second publicly available data product of the international GEOTRACES programme, and contains data measured and quality controlled before the end of 2016. The IDP2017 includes data from the Atlantic, Pacific, Arctic, Southern and Indian oceans, with about twice the data volume of the previous IDP2014. For the first time, the IDP2017 contains data for a large suite of biogeochemical parameters as well as aerosol and rain data characterising atmospheric trace element and isotope (TEI) sources. The TEI data in the IDP2017 are quality controlled by careful assessment of intercalibration results and multi-laboratory data comparisons at crossover stations. The IDP2017 consists of two parts: (1) a compilation of digital data for more than 450 TEIs as well as standard hydrographic parameters, and (2) the eGEOTRACES Electronic Atlas providing an on-line atlas that includes more than 590 section plots and 130 animated 3D scenes. The digital data are provided in several formats, including ASCII, Excel spreadsheet, netCDF, and Ocean Data View collection. Users can download the full data packages or make their own custom selections with a new on-line data extraction service. In addition to the actual data values, the IDP2017 also contains data quality flags and 1-σ data error values where available. Quality flags and error values are useful for data filtering and for statistical analysis. Metadata about data originators, analytical methods and original publications related to the data are linked in an easily accessible way. The eGEOTRACES Electronic Atlas is the visual representation of the IDP2017 as section plots and rotating 3D scenes. The basin-wide 3D scenes combine data from many cruises and provide quick overviews of large-scale tracer distributions. These 3D scenes provide geographical and bathymetric context that is crucial for the interpretation and assessment of tracer plumes near ocean margins or along ridges. The IDP2017 is the result of a truly international effort involving 326 researchers from 25 countries. This publication provides the critical reference for unpublished data, as well as for studies that make use of a large cross-section of data from the IDP2017. This article is part of a special issue entitled: Conway GEOTRACES - edited by Tim M. Conway, Tristan Horner, Yves Plancherel, and Aridane G. González., National Science Foundation (U.S.) (Grant OCE-0608600), National Science Foundation (U.S.) (Grant OCE0938349), National Science Foundation (U.S.) (Grant OCE-1243377), National Science Foundation (U.S.) (Grant OCE-1546580)
Published: 2018
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19. A multiscale study of mercury transformations and dynamics at the chemocline of the Petit-Saut tropical reservoir (French Guiana)

Author: Didier Jézéquel, Daniel Cossa, Edouard Metzger, Bogdan Muresan, Laboratoire de Planétologie et Géodynamique - Angers (LPG-ANGERS), Laboratoire de Planétologie et Géodynamique [UMR 6112] (LPG), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre d'Enseignement et de Recherche Eau Ville Environnement (CEREVE), AgroParisTech-École des Ponts ParisTech (ENPC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire de Planétologie et Géodynamique - Bio-Indicateurs Actuels et Fossiles (LPG-BIAF), Laboratoire de Planétologie et Géodynamique UMR6112 (LPG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-IPG PARIS-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)
Subjects: Biogeochemical cycle, Environmental Engineering, 010504 meteorology & atmospheric sciences, chemistry.chemical_element, 010501 environmental sciences, Chemocline, 01 natural sciences, Pollution, Redox, Mercury (element), Nutrient, Water column, chemistry, Environmental chemistry, Epilimnion, Dissolved organic carbon, [SDE]Environmental Sciences, Environmental Chemistry, Waste Management and Disposal, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: This study investigated, on both metric and centimetric scales, mercury (Hg) transformations and dynamics within a water column chemocline of a tropical reservoir. Data collected included conventional measurement of Hg in water samples, diffusive gradients in thin-films (DGT) assessments, and thermodynamic speciation modeling in order to portray the biogeochemical processes that control elemental Hg (EM) and dissolved monomethylated Hg (MeHgD) production. The primary contribution of this study is demonstration that the DGT technique can be successfully implemented to examine labile Hg compound mobilization, and estimation of how local substratum facilitates Hg reduction and methylation reactions. DGT profiles with a resolution of 1 cm revealed a fine sequence of prominent Hg reduction/oxidation reactions at the chemocline level. This is interpreted as a manifestation of both: i) kinetic effects capable of arising inside the diffusive layer of DGT devices, and ii) extremely localized production or consumption of reducible and methylable Hg. Another key result obtained at the metric scale is that EM and MeHgD production at a water column chemocline are intricately linked, as both are fueled by nutrients episodically released during the decomposition of falling epilimnetic organic particles or inhibited by dissolved organic matter and inorganic compounds continuously transported from the deeper monimolimnion. Finally, it is worth noting that the chemocline acts as an accumulation and recycling domain for falling MeHg-loaded organic particles, whereas the high primary productivity layer in the epilimnion represents the principal reactor with respect to Hg methylation and reduction.
Published: 2018
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20. Full-scale validation of an algal productivity model including nitrogen limitation

Author: Olivier Bernard, Quentin Béchet, Noémie Coulombier, Thomas Lasserre, Christophe Vasseur, Loic Le Dean, Université Côte d'Azur (UCA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), La Compagnie du Vent, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Gouzé, Jean-Luc, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), and Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Full scale, Photobioreactor, Biomass, chemistry.chemical_element, 01 natural sciences, 7. Clean energy, 03 medical and health sciences, 010608 biotechnology, [INFO.INFO-AU]Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, Raceway, Productivity model, Quota model, 2. Zero hunger, Environmental engineering, Modeling, Nitrogen, Carotenoids, Raceway ponds, Outdoor cultivation, 030104 developmental biology, chemistry, Productivity (ecology), 13. Climate action, Biofuel, Biofuels, Environmental science, Dunaliella salina, [INFO.INFO-AU] Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, Agronomy and Crop Science
Abstract: International audience; Accurate predictions of algal productivity under nutrient-limiting conditions are needed to assess the economics of full-scale algal cultivation for the developing markets of food, feed, and at longer term, green chemistry and biofuel. In particular, predicting pigments production from micro-algae is a critical milestone in the assessments of high-value chemicals production from micro-algae. This study validates a mathematical model predicting algal biomass productivity in outdoor raceway ponds under nitrogen-limiting conditions. The model was first validated from experimental data collected during Dunaliella salina cultivation in indoor photobioreactors and accounts for the impact of light, temperature, and nitrogen concentration on algal productivity (overall accuracy on algal concentration of ±2.7 mg L−1, N = 48). The model was then validated against data collected in outdoor raceway ponds over a period of 2 years, representing a total of 111 days of cultivation. Biomass and extracellular nitrogen concentrations predictions were accurate within ±0.055 g L−1 (N = 69) and ±0.0024 g L−1 (N = 26), respectively. Model inaccuracies were mostly due to measurement errors and uncertainties on model inputs. Measured carotenoids concentrations were found proportional to the biomass concentrations in the outdoor raceway ponds. By coupling this linear correlation to the productivity model, predicted carotenoids concentrations were in good agreement with experimental data (accuracy within ±0.0046 g L−1, N = 55). The mathematical model developed in this study has therefore the potential to refine previous assessments of algal cultivation for biofuels and pigments production.
Published: 2018
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21. Membrane separation applied to micro-algae: applications to the water treatment and the bio-refinery

Author: Masse, Anthony, Amzil, Zouher, Balti, Rafik, Brodu, Nicolas, Jean Baptiste, Castaing, Fleurence, Joel, Frappart, M., Guilbaud, Julie, Haure, Joël, Jaouen, Pascal, Jubeau, Sébastien, Le Balc’h, Romain, Le Gall, Sophie, Marchal, Luc, Séverine, Plantier, Guillaume, Roelens, Sabiri, Nour-Eddine, Sechet, Véronique, Sinquin, Corinne, Wolff, Francois-Charles, Bioprocédés Appliqués aux Microalgues (GEPEA-BAM), Laboratoire de génie des procédés - environnement - agroalimentaire (GEPEA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Phycotoxines, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Mer, molécules et santé EA 2160 (MMS), Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Station Ifremer de la Tremblade, Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Algosource Technologies, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Traitement Eau Air Métrologie (GEPEA-TEAM), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL), Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique)
Subjects: [SPI]Engineering Sciences [physics], [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

22. Impacts of green tides on estuarine fish assemblages

Author: A. Paumier, E. Le Luherne, T. Tatlian, S. Ballu, Elodie Réveillac, O. Le Pape, Mario Lepage, Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Centre d'Etude et de Valorisation des Algues (CEVA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), French Fisheries Organization, Loire-Bretagne Water Agency, France Filiere Peche, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CEVA PLEUBIAN FRA, Partenaires IRSTEA, and Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)
Subjects: 0106 biological sciences, Nursery, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Estuarine ecology, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, Demersal zone, Nutrient, Macroalgae, Fish community, 14. Life underwater, Green tides, 0105 earth and related environmental sciences, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, geography, geography.geographical_feature_category, 010604 marine biology & hydrobiology, Pelagic zone, Estuary, Fishery, Water Framework Directive, Habitat, Benthic zone, [SDE]Environmental Sciences, Guild, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; All around the world, an increasing proportion of estuarine systems are facing massive proliferations of green macroalgae, called green tides, in response to nutrient enrichment. The consequences of this perturbation for ichthyofauna that use estuarine systems as essential fish habitats remain understudied. To estimate these consequences, we combined outputs of both macroalgae proliferation and fish community surveys conducted for the European Water Framework Directive in thirteen estuaries in northwestern France, a region where green tides are of great concern. The approach revealed the influence of green tides on estuarine fish communities. The response of each community to the green tides differed according to their functional guild composition. Benthic and marine juvenile guilds were negatively impacted, while demersal and pelagic fish guilds appeared to be more resilient. Green tides, which significantly affect the suitability of fish habitat, change the composition of the fish community and may hinder the future recruitment of marine fish species that rely on estuaries during the juvenile stage.
Published: 2018
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23. Introduction to the French GEOTRACES North Atlantic Transect (GA01): GEOVIDE cruise

Author: Géraldine Sarthou, Pascale Lherminier, Eric P. Achterberg, Fernando Alonso-Pérez, Eva Bucciarelli, Julia Boutorh, Vincent Bouvier, Edward A. Boyle, Pierre Branellec, Lidia I. Carracedo, Nuria Casacuberta, Maxi Castrillejo, Marie Cheize, Leonardo Contreira Pereira, Daniel Cossa, Nathalie Daniault, Emmanuel De Saint-Léger, Frank Dehairs, Feifei Deng, Floriane Desprez de Gésincourt, Jérémy Devesa, Lorna Foliot, Debany Fonseca-Batista, Morgane Gallinari, Maribel I. García-Ibáñez, Arthur Gourain, Emilie Grossteffan, Michel Hamon, Lars Eric Heimbürger, Gideon M. Henderson, Catherine Jeandel, Catherine Kermabon, François Lacan, Philippe Le Bot, Manon Le Goff, Emilie Le Roy, Alison Lefèbvre, Stéphane Leizour, Nolwenn Lemaitre, Pere Masqué, Olivier Ménage, Jan-Lukas Menzel Barraqueta, Herlé Mercier, Fabien Perault, Fiz F. Pérez, Hélène F. Planquette, Frédéric Planchon, Arnout Roukaerts, Virginie Sanial, Raphaëlle Sauzède, Rachel U. Shelley, Gillian Stewart, Jill N. Sutton, Yi Tang, Nadine Tisnérat-Laborde, Manon Tonnard, Paul Tréguer, Pieter van Beek, Cheryl M. Zurbrick, Patricia Zunino, Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de physique des océans (LPO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Cartografic de Catalunya (ICC), Institut Cartografic de Catalunya, Laboratoire des Sciences de l'Information et des Systèmes (LSIS), Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Arts et Métiers Paristech ENSAM Aix-en-Provence-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Research on Learning, National Oceanography Centre [Southampton] (NOC), University of Southampton, Physiologie et Ecophysiologie des Mollusques Marins (PE2M), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Analytical and Environmental Chemistry and Earth System Sciences, Vrije Universiteit [Brussels] (VUB), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Spanish National Research Council (CSIC), UMS 3113, Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO), Neuropsychopharmacologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Spatiale (LOPS), Institut de Ciencia i Tecnologia Ambientals (ICTA), Universitat Autònoma de Barcelona [Barcelona] (UAB), GEOMAR LEGOS, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), School of Earth and Environmental Sciences [Queens New York], Queens College [New York], City University of New York [New York] (CUNY)-City University of New York [New York] (CUNY), Shenzhen Key Laboratory of Sensor Technology, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, 13. Climate action, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, 14. Life underwater, 01 natural sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: The GEOVIDE cruise, a collaborative project within the framework of the international GEOTRACES programme, was conducted along the French-led section in the North Atlantic Ocean (Section GA01), between 15 May and 30 June 2014. In this Special Issue, results from GEOVIDE, including physical oceanography and trace element and isotope cyclings, are presented among seventeen articles. Here, the scientific context, project objectives and scientific strategy of GEOVIDE are provided, along with an overview of the main results from the articles published in the special issue.
Published: 2018
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24. Membrane processes for the microalage biorefinery : example of polysaccharides upgrading

Author: Anthony Masse, Luc Marchal, Jeremy Pruvost, Nicolas Brodu, Lisa Zaouk, Romain Le Balc’h, Rafik Balti, Pascal Jaouen, Corinne Sinquin, Sophie Le Gall, Bioprocédés Appliqués aux Microalgues (GEPEA-BAM), Laboratoire de génie des procédés - environnement - agroalimentaire (GEPEA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)
Subjects: [SPI]Engineering Sciences [physics], [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2016

25. Assembly of HE800 exopolysaccharide produced by a deep-sea hydrothermal bacterium into microgels for protein delivery applications

Author: Corinne Sinquin, Sylvia Colliec-Jouault, Mélanie Marquis, Stéphane Cuenot, Agata Zykwinska, Institut des Matériaux Jean Rouxel (IMN), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), EU Interreg IVA 2 Seas 'Bio-Care Marine', Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), and Université de Nantes (UN)
Subjects: 0301 basic medicine, business.product_category, Polymers and Plastics, Microfluidics, Nanotechnology, 02 engineering and technology, Polysaccharide, Hydrothermal circulation, Divalent, 03 medical and health sciences, Marine exopolysaccharide, Microfiber, Materials Chemistry, Animals, Microparticle, Bovine serum albumin, Microencapsulation, Protein release, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Glycosaminoglycans, Vibrio, chemistry.chemical_classification, Drug Carriers, biology, Chemistry, Organic Chemistry, Polysaccharides, Bacterial, Microcarrier, Polychaeta, Serum Albumin, Bovine, Microfluidic Analytical Techniques, 021001 nanoscience & nanotechnology, 030104 developmental biology, Microfluidic, Microfibers, biology.protein, [PHYS.COND.CM-MS]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Materials Science [cond-mat.mtrl-sci], Cattle, Microgel particles, 0210 nano-technology, business, Gels
Abstract: International audience; Assembly of biopolymers into microgels is an elegant strategy for bioencapsulation with various potential biomedical applications. Such biocompatible and biodegradable microassemblies are developed not only to protect the encapsulated molecule but also to ensure its sustained local delivery. The present study describes the fabrication of microassemblies from a marine HE800 exopolysaccharide (EPS), which displays a glycosaminoglycan (GAG)-like structure and biological properties. HE800 EPS was assembled, through physical cross-linking with divalent ions, into microgel particles and microfibers using microfluidics. The microparticle morphology was highly affected by the polysaccharide concentration and its molecular weight. A model protein, namely Bovine Serum Albumin (BSA) was subsequently encapsulated within HE800 microparticles in one-step process using microfluidics. The protein release was tuned by the microparticle morphology with a lower protein amount released from the most homogeneous structures. Our findings demonstrate the high potential of HE800 EPS based microassemblies as innovative protein microcarriers for further biomedical applications.
Published: 2016
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26. Abrupt shifts in the Gironde fish community: an indicator of ecological changes in an estuarine ecosystem

Author: Jérémy Lobry, Arthur Rigaud, Maud Pierre, Aurélie Chaalali, Hilaire Drouineau, Benoît Sautour, Xavier Chevillot, Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), UMR 5805 Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, CHANGEMENT CLIMATIQUE GLOBAL, Time series, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Generalised linear mixed models, ECOSYSTEME, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Biodiversity, Climate change, Context (language use), Shift, Aquatic Science, 01 natural sciences, ecological indicators, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Regime shift, Ecosystem, 14. Life underwater, Inter-shift periods, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Fish diversity, 0105 earth and related environmental sciences, biodiversity, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, BIODIVERSITE, Global warming, Estuary, Community structure, global climate change, Pelagic zone, 15. Life on land, estuaries, Geography, 13. Climate action, ESTUAIRE, Ecosystem state, INDICATEUR ECOLOGIQUE, [SDV.EE.BIO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Bioclimatology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ecosystems, GLMM
Abstract: International audience; For decades, global climate change has directly and indirectly affected the structure and function of ecosystems. Abrupt changes in biodiversity have been observed in response to linear or sudden modifications to the environment. These abrupt shifts can cause long-term reorganizations within ecosystems, with communities exhibiting new functional responses to environmental factors. Over the last 3 decades, the Gironde estuary in southwest France has experienced 2 abrupt shifts in both the physical and chemical environments and the pelagic community. Rather than describing these shifts and their origins, we focused on the 3 inter-shift periods, describing the structure of the fish community and its relationship with the environment during these periods. We described fish biodiversity using a limited set of descriptors, taking into account both species composition and relative species abundances. Inter-shift ecosystem states were defined based on the relationship between this description and the hydro-physico-chemical variables and climatic indices defining the main features of the environment. This relationship was described using generalized linear mixed models on the entire time series and for each inter-shift period. Our results indicate that (1) the fish community structure has been significantly modified, (2) environmental drivers influencing fish diversity have changed during these 3 periods, and (3) the fish-environment relationships have been modified over time. From this, we conclude a regime shift has occurred in the Gironde estuary. We also highlight that anthropogenic influences have increased, which re-emphasizes the importance of local management in maintaining fish diversity and associated goods and services within the context of climate change.
Published: 2016
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27. Abrupt shifts in the Gironde fish community: an indicator of ecological changes in an estuarine ecosystem

Author: Chevillot, X., Pierre, M., Rigaud, A., Drouineau, H., Chaalali, A., Sautour, B., Lobry, J., Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), UMR 5805 Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), and Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: CHANGEMENT CLIMATIQUE GLOBAL, ECOSYSTEME, BIODIVERSITE, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, global climate change, estuaries, ecological indicators, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, ESTUAIRE, INDICATEUR ECOLOGIQUE, [SDV.EE.BIO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Bioclimatology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ecosystems, biodiversity
Abstract: International audience; For decades, global climate change has directly and indirectly affected the structure and function of ecosystems. Abrupt changes in biodiversity have been observed in response to linear or sudden modifications to the environment. These abrupt shifts can cause long-term reorganizations within ecosystems, with communities exhibiting new functional responses to environmental factors. Over the last 3 decades, the Gironde estuary in southwest France has experienced 2 abrupt shifts in both the physical and chemical environments and the pelagic community. Rather than describing these shifts and their origins, we focused on the 3 inter-shift periods, describing the structure of the fish community and its relationship with the environment during these periods. We described fish biodiversity using a limited set of descriptors, taking into account both species composition and relative species abundances. Inter-shift ecosystem states were defined based on the relationship between this description and the hydro-physico-chemical variables and climatic indices defining the main features of the environment. This relationship was described using generalized linear mixed models on the entire time series and for each inter-shift period. Our results indicate that (1) the fish community structure has been significantly modified, (2) environmental drivers influencing fish diversity have changed during these 3 periods, and (3) the fish-environment relationships have been modified over time. From this, we conclude a regime shift has occurred in the Gironde estuary. We also highlight that anthropogenic influences have increased, which re-emphasizes the importance of local management in maintaining fish diversity and associated goods and services within the context of climate change.
Published: 2016
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28. 210 Po and 210 Pb trophic transfer within the phytoplankton–zooplankton–anchovy/sardine food web: a case study from the Gulf of Lion (NW Mediterranean Sea)

Author: Jacek Tronczynski, Olivier Radakovitch, Mireille Harmelin-Vivien, Emilie Strady, Jean François Chiffoleau, Alain Veron, Centre Asiatique de Recherche sur l'Eau CARE-HCMUT, Vietnam, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biogéochimie des contaminants organiques (LBCO), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire d'étude des transferts en hydrologie et environnement (LTHE), Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Laboratoire Biogéochimie des Contaminants Organiques (LBCO), Biogéochimie et Ecotoxicologie (BE), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)
Subjects: Polonium, Water Pollutants, Radioactive, Food Chain, Health, Toxicology and Mutagenesis, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Pb-210, Biology, Zooplankton, Engraulis, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, Anchovy, Phytoplankton, Mediterranean Sea, Environmental Chemistry, Animals, 14. Life underwater, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, Waste Management and Disposal, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, Trophic level, Po-210, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Ecology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Fishes, Pelagic zone, Pelagic fishes, General Medicine, Lead Radioisotopes, Plankton, biology.organism_classification, Pollution, Food web, Oceanography, [SDU]Sciences of the Universe [physics], [SDE]Environmental Sciences, France, Seasons, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: The transfer of (210)Po and (210)Pb in the food web of small pelagic fishes (from phytoplankton and zooplankton to anchovy Engraulis encrasicolus and sardine Sardina pilchardus) is investigated in the Gulf of Lion (GoL). We present original data of (210)Po and (210)Pb activity concentrations, C and N stable isotope ratios, measured (i) from different size classes of phytoplankton and zooplankton during spring and winter in different environments of the GoL, and (ii) in two fish species. Significant spatial patterns based on (210)Po, (210)Pb activity concentrations and (210)Po/(210)Pb ratios in the different plankton size classes are evidenced by hierarchical clustering, both in spring and winter. This variability, also observed for C and N stable isotopes ratios, is connected to local specific pelagic habitats and hydrodynamics. The sampling strategy suggests that (210)Po bioaccumulation in the GoL remains at a constant level from the first (dominated by phytoplankton) to the second trophic level (zooplankton), while (210)Pb bioaccumulation shows an increase in winter. Based on stable N isotope ratios and (210)Po activity concentrations measured in anchovies and sardines, we evidence (210)Po bio-magnification along the trophic food web of these two planktivorous pelagic fishes.
Published: 2015
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29. Point de vue sur l'échantillonnage passifs pour la surveillance des contaminants dans les milieux aquatiques : réalisations et perspectives

Author: Miege, C., Mazzella, N., Allan, I., Dulio, V., Smedes, F., Tixier, C., Vermeirssen, E., Brant, J., O'Toole, S., Budzinski, H., Ghestem, Jean Philippe, Staub, P.F., Lardy Fontan, S., Gonzalez, J.L., Coquery, M., Vrana, B., Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Norwegian Institute for Water Research (NIVA), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS), Masaryk University [Brno] (MUNI), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Swiss Federal Insitute of Aquatic Science and Technology [Dübendorf] (EAWAG), Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science [Lowestoft] (CEFAS), Environmental Protection Agency, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture, IRSTEA, Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, IFREMER - Laboratoire Provence Azur Corse, Réseaux épuration et qualité des eaux (UR REBX), Masaryk University, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Swiss Federal Institute for Environmental Science and Technology [Dübendorf] (EAWAG), and Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: EMERGING SUBSTANCE, AQUATIC ENVIRONMENT, SUBSTANCE EMERGENTE, ECHANTILLONNEUR PASSIF, SUBSTANCE PRIORITAIRE, EUROPEAN WATER FRAMEWORK DIRECTIVE, SURVEILLANCE, [SDE]Environmental Sciences, PRIORITY SUBSTANCE, DIRECTIVE CADRE EUROPEENNE SUR L'EAU, MONITORING, MILIEU AQUATIQUE
Abstract: International audience; This paper, based on the outcome of discussions at a NORMAN Network-supported workshop in Lyon (France) in November 2014 aims to provide a common position of passive sampling community experts regarding concrete actions required to foster the use of passive sampling techniques in support of contaminant risk assessment and management and for routine monitoring of contaminants in aquatic systems. The brief roadmap presented here focusses on the identification of robust passive sampling methodology, technology that requires further development or that has yet to be developed, our current knowledge of the evaluation of uncertainties when calculating a freely dissolved concentration, the relationship between data from PS and that obtained through biomonitoring. A tiered approach to identifying areas of potential environmental quality standard (EQS) exceedances is also shown. Finally, we propose a list of recommended actions to improve the acceptance of passive sampling by policy-makers. These include the drafting of guidelines, quality assurance and control procedures, developing demonstration projects where biomonitoring and passive sampling are undertaken alongside, organising proficiency testing schemes and interlaboratory comparison and, finally, establishing passive sampler-based assessment criteria in relation to existing EQS.
Published: 2015
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30. Biofunctional microassemblies on an exopolysaccharide produced by a deep sea hydrothermal bacterium for tissue engineering applications

Author: Zykwinska, Agata, Marquis, Mélanie, Davy, Joëlle, Sinquin, C., Ratiskol, J., Cuenot, S., Renard, Denis, Colliec-Jouault, S., Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER). Nantes, FRA., and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV.IB.BIO] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Biomaterials, Biopolymer, Microfluidic, [SPI.NANO] Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, [SDV.IB.BIO]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Biomaterials, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2014

31. The fate of river organic carbon in coastal areas: A study in the Rhône River delta using multiple isotopic (δ 13 C, Δ 14 C) and organic tracers

Author: Ming-Yi Sun, Claire Treignier, Nadine Tisnérat-Laborde, K. Loftis, Tommaso Tesi, S. Azoury, Bruno Lansard, Roselyne Buscail, Jacek Tronczynski, Philippe Kerhervé, L. Pastor, Christophe Rabouille, Cecile Cathalot, Flora Toussaint, Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Océan et Interfaces (OCEANIS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géochrononologie Traceurs Archéométrie (GEOTRAC), Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Georgia [USA], Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire de géochimie des Eaux (LGE), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris), Department of Applied Environmental Science [Stockholm] (ITM), Stockholm University, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris, Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), and Université de Nantes (UN)
Subjects: 0106 biological sciences, Delta, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Fraction (chemistry), 01 natural sciences, Physics::Geophysics, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Geochemistry and Petrology, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, Organic matter, 14. Life underwater, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Physics::Atmospheric and Oceanic Physics, 0105 earth and related environmental sciences, Carbon flux, chemistry.chemical_classification, Total organic carbon, geography, River delta, geography.geographical_feature_category, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, 010604 marine biology & hydrobiology, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, Oceanography, chemistry, 13. Climate action, [SDU.STU.CL]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Climatology, [SDU.STU.ST]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Stratigraphy, [SHS.ENVIR]Humanities and Social Sciences/Environmental studies, Geology
Abstract: A significant fraction of the global carbon flux to the ocean occurs in River-dominated Ocean Margins (RiOMar) although large uncertainties remain in the cycle of organic matter (OM) in these systems. In particular, the OM sources and residence time have not been well clarified. Surface (0-1 cm) and sub-surface (3-4 cm) sediments and water column particles (bottom and intermediate depth) from the Rhone River delta system were collected in June 2005 and in April 2007 for a multi-proxy study. Lignin phenols, black carbon (BC), proto-kerogen/BC mixture, polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), carbon stable isotope (delta C-13(OC)), and radiocarbon measurements (delta C-14(OC)) were carried out to characterize the source of sedimentary organic material and to address degradation and transport processes. The bulk OM in the prodelta sediment appears to have a predominantly modern terrigenous origin with a significant contribution of modern vascular C-3 plant detritus (Delta C-14(OC) = 27.9 parts per thousand, delta C-13(OC) = -27.4 parts per thousand). In contrast, the adjacent continental shelf, below the river plume, seems to be dominated by aged OM (Delta C-14(OC) = -400 parts per thousand, delta C-13(OC) = -24.2 parts per thousand), and shows no evidence of dilution and/or replacement by freshly produced marine carbon. Our data suggest an important contribution of black carbon (50% of OC) in the continental shelf sediments. Selective degradation processes occur along the main dispersal sediment system, promoting the loss of a modern terrestrial OM but also proto-kerogen-like OM. In addition, we hypothesize that during the transport across the shelf, a long term resuspension/deposition loop induces efficient long term degradation processes able to rework such refractory-like material until the OC is protected by the mineral matrix of particles.
Published: 2013
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32. L’argent (Ag, Nanoag) comme contaminant émergent dans l’estuaire de la Gironde : Evaluations scientifiques et gouvernance des risques

Author: Salles, Denis, Roumezi, A., Lanceleur, L., Schäfer, J., Chiffoleau, J.-F., Auger, D., Blanc, G., Petit, J., Coynel, A., Aménités et dynamiques des espaces ruraux (UR ADBX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)
Subjects: GEOCHIMIE, SILVER, [SDE]Environmental Sciences, WATER POLLUTION, ESTUAIRE, ARGENT, ESTUARY, SOCIOLOGY, POLLUTION DE L'EAU, GIRONDE ESTUAIRE, SOCIOLOGIE, GEOCHEMISTRY
Abstract: Cet article présente les résultats d'une recherche pluridisciplinaire (géochimie, sociologie) portant sur l'accroissement observé des concentrations d'argent sous la forme particulaire et nanoparticulaire (Ag et nanoAg) dans les milieux aquatiques de l'estuaire de la Gironde. Il propose conjointement d'analyser les risques d'une contamination des milieux aquatiques par l'argent et d'observer le processus de construction sociale et politique de ce risque par les gestionnaires de l'eau, les autorités sanitaires, les agences et comités d'expertise et d'évaluation des risques, des associations environnementales et des industriels utilisateurs d'argent. La mise à jour de quatre types de construction du risque permet de comprendre les différentes logiques d'argumentation mobilisées. Cette coopération scientifique pluridisciplinaire ouvre des perspectives sur les problématiques santé-environnement en diffusant des savoirs pour l'action et en favorisant la réflexivité des acteurs locaux confrontés au problème émergent de la concentration de l'argent dans les milieux aquatiques. / This article presents the results of multidisciplinary research (geochemistry, sociology) into the increasing concentrations of silver (Ag and nanoAg) in the environment and their potential impact on aquatic environments. We investigate simultaneously the risk of contamination of these environments by silver and the process of the social and political construction of this risk by water managers, health authorities, agencies and committees responsible for expert evaluations, environmental associations, and potential users of silver or nano-silver. Four updated models of risk construction allow us to understand the logic of arguments mobilized at this stage of the emerging risk. This interdisciplinary cooperation opens up possibilities for dealing with some environmental health issues; it highlights the benefits of an approach aiming to disseminate knowledge to enable action and to promote awareness and analysis by the local stakeholders and officials who face this emerging problem.
Published: 2013
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33. Integrative samplers for the monitoring of PCBs in the dissolved phase of aquatic media: the ECLIPSE project

Author: Miège, Cécile, Jacquet, Romain, Smedes, Foppe, Tixier, Celine, Troczynski, J., Berho, Catherine, Togola, Anne, Valor, I., Llorca, J., Barillon, B., Coquery, M., Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Institut de Tecniques Energetiques, Universitat Politècnica de Catalunya [Barcelona] (UPC), SUEZ ENVIRONNEMENT (FRANCE), FUI, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), and Université de Nantes (UN)
Subjects: PCB, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, echantillonneur passif, Calibration, [SDE]Environmental Sciences
Abstract: Various integrative samplers, at different stages of development, are now available to estimate time-weighted average (TWA) concentrations of freely dissolved hydrophobic contaminants in aquatic environments. The ECLIPSE project (2009-2011, coord. C Miège, Irstea) involves 5 laboratories and aims to calibrate and compare 5 different integrative samplers for the monitoring of indicator and dioxin-like PCB in water: semi-permeable membrane device (SPMD, studied by Irstea), low-density polyethylene strip (LDPE, Ifremer), silicone rubber (SRPS, Deltares), Chemcatcher® (BRGM) and ontinuous-flow integrative sampler (CFIS, LABAQUA). The first step of the project was the simultaneous calibration of these samplers under laboratory conditions. During summer 2009, samplers were exposed under constant agitation and temperature in a stainless steel tank filled with 200 L of PCB contaminated water. A constant PCB concentration of about 1 ng/L was achieved by immersing a large amount of silicone rubber sheets [Rusina 2010] spiked with indicator and dioxin-like PCB. Prior to deployment, samplers were spiked with Performance Reference Compounds (PRC) and exposure durations ranged from 1 day to 3 months. After exposure, processing and analysis, samplers were compared in terms of sampling rate, linear uptake phase duration, repeatability and accuracy of calculated TWA concentration. The second step of the ECLIPSE project was the deployment and comparison of these samplers in real aquatic environments. In summer and autumn 2010, and in spring 2011, three field campaigns were carried out along the Rhône River and near the lake Le Bourget (France), known to be contaminated by PCB. Using appropriate cages, canisters and holders, studied samplers were exposed simultaneously at an approximate depth of 1 m during 1, 2, 3 and 4 weeks with duplicates and/or triplicates. These field campaigns allowed to compare in-situ ease of use and robustness of the five integrative samplers in addition to repeatability of sampling and TWA concentration estimate.
Published: 2012

34. Occurrence of priority and emerging organic compounds in fishes from the Rhone River (France)

Author: A. Peretti, Pierre Labadie, B. Le Bizec, Katrin Vorkamp, Cecile Miege, Jacek Tronczynski, Marc Babut, Hélène Budzinski, Marina Coquery, Henri Persat, Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Structure et fonctionnement des systèmes hydriques continentaux (SISYPHE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Aarhus University [Aarhus], Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Fluviaux (EHF), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)
Subjects: PRIORITY COMPOUNDS, SUBSTANCE PRIORITAIRE, 0211 other engineering and technologies, 02 engineering and technology, POLLUTION DE L'EAU, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Biochemistry, Analytical Chemistry, chemistry.chemical_compound, Priority compounds, SUBSTANCE EMERGENTE, Emerging compounds, 14. Life underwater, 0105 earth and related environmental sciences, RIVER WATERS, 021110 strategic, defence & security studies, Barbel, EMERGING COMPOUNDS, biology, Squalius, Common bream, Blicca bjoerkna, Fishes, Hexachlorobenzene, biology.organism_classification, Barbus barbus, Contamination level, 6. Clean water, Hexachlorobutadiene, CONTAMINATION, CONTAMINATION LEVEL, chemistry, 13. Climate action, River waters, Environmental chemistry, [SDE]Environmental Sciences, Freshwater fish, FISHES, POISSON, IMPACT SUR L'ENVIRONNEMENT
Abstract: [Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]BELCA; The main objective of this study was to collect new data on the occurrence and levels of priority and emerging organic compounds in freshwater fishes sampled in the Rhone River. The 34 studied contaminants included alkylphenols (AP), bisphenol A (BPA), polybromodiphenylethers (PBDE), perfluorinated compounds (PFC), hexabromocyclododecanes (HBCD), hexachloro-benzene (HCB) and hexachloro-butadiene (HCBD). About 50 fish samples (individual specimens or pooled fishes) were collected from 3 sites located upstream and downstream of the Lyon metropolitan area in the Rhone River (France). Four species were caught at each site, namely: the barbel (Barbus barbus), the common bream (Abramis brama), the white bream (Blicca bjoerkna) and the chub (Squalius cephalus). Some contaminants were quantified in all the 32 fish samples analysed: 4-nonylphenol, Α-HBCD, the 6 PBDE congeners (28, 47, 99, 100, 153, 154), perfluorooctanesulfonate (PFOS) and perfluorodecanoic acid. And 23 of the 32 samples had concentration of PFOS above the Environmental Quality Standards (up to 6 times higher the EQS); and all the 32 samples had concentrations of PBDE above the EQS (up to 4000 times higher, with the sum of 6 PBDE varying from 4.5 to 182 ng/g dw). Clearly, the interest to consider PFOS and HBCD as new priority substances is confirmed. In contrast, the pertinence of a priority status for HCBD, which was never quantified in our study, might have to be reconsidered in the future.
Published: 2012
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35. Marine ecosystems’ responses to climatic and anthropogenic forcings in the Mediterranean

Author: Romaric Verney, William L. Miller, Lars-Eric Heimbürger, Pierre-Laurent Merle, Louis Marie Prieur, Sauveur Belviso, Scott W. Fowler, Frédéric Gazeau, Francois Carlotti, D. Ruiz Pino, Richard Sempéré, Bastien Mérigot, Jean-Christophe Poggiale, Lars Stemmann, Camila Fernandez, David Doxaran, Stéphane Gasparini, Patrice Francour, Marc Tedetti, Sabine Charmasson, Laure Mousseau, Marcel Babin, Jean-Claude Dutay, R. Lemé, Frédéric Diaz, Stéphan Jacquet, F. Van Wambeke, J. L. Gonzalez, Jean-François Ghiglione, Vincent Vantrepotte, P. Le Hir, Hervé Thébault, Christophe Lejeusne, Marc Mallet, X. Durrieu de Madron, Françoise Elbaz-Poulichet, Pulido-Villena, Benedicte Thouvenin, Malik Chami, Pascal Conan, Philippe Koubbi, Claude Estournel, Laurent Mortier, Christian Tamburini, Bruno Charrière, Dominique Lefèvre, Catherine Goyet, Jean-François Rontani, C. Mellon, B. Bonsang, Thierry Moutin, René Galzin, Nathaniel Bensoussan, Vincent Taillandier, Olivier Radakovitch, Jacek Tronczynski, Katell Guizien, Behzad Mostajir, F. Eyrolles, Daniel Cossa, Christophe Rabouille, Frédéric Mélin, Andrew P. Rees, Wade H. Jeffrey, Jordi Dachs, Chrystelle Bancon-Montigny, M. Eléaume, Sandrine Vaz, Laurence Méjanelle, Thierry Perez, Tsuneo Tanaka, Melika Baklouti, J. Para, Christophe Brunet, Ioanna Bouloubassi, Marie-Dominique Loÿe-Pilot, Mireille Pujo-Pay, Caroline Ulses, Anne Petrenko, Sophie Bonnet, Fabrizio D'Ortenzio, Fabien Joux, Franck Touratier, Lionel Guidi, Pierre Testor, Cécile Guieu, Patrick Raimbault, Jean-Francois Cadiou, Marie-Alexandrine Sicre, Christophe Migon, Jean-Claude Gaertner, Isabelle Taupier-Letage, Karine Leblanc, Céline Ridame, Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Océanographie côtière, Laboratoire d'aérologie (LAERO), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), IPSO FACTO [Marseille], Laboratoire de Robotique de Versailles (LRV), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Etudes Radioécologiques des milieux Continental et marin (IRSN/PRP-ENV/SESURE/LERCM), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Institute of Environmental Assessment and Water Research (IDAEA), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Modélisation du climat (CLIM), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'étude radioécologique du milieu continental et marin (IRSN/DEI/SESURE/LERCM), Service d'étude et de surveillance de la radioactivité dans l'environnement (IRSN/DEI/SESURE), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Laboratoire catalyse et spectrochimie (LCS), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Marine Environment Laboratories [Monaco] (IAEA-MEL), International Atomic Energy Agency [Vienna] (IAEA), Ecosystèmes Côtiers Marins et Réponses aux Stress (ECOMERS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Insulaire du Vivant et de l'Environnement (LIVE), Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Modélisation et d'Analyses en géo-environnement et santé - Espace Développement (IMAGES-Espace DEV), UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA), Sorbonne Université (SU), Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - 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Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Biogéochimie et Ecotoxicologie (BE), Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 (LOG), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Laboratoire Ressources halieutiques Boulogne sur mer (LRHBL), Halieutique Manche Mer du Nord (HMMN), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), The MerMex Group, Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - 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Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique (LOPB), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Sorbonne Université (SU)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Spain] (CSIC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'étude radioécologique du milieu continental et marin (LERCM), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Direction de l'Environnement et de l'Intervention, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Biologie et écologie tropicale et méditerranéenne (BETM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes (UMR ASTRE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Center for Environmental Diagnostics and Bioremediation, University of west Florida, IFREMER (IFREMER), College of Marine Studies (CMS), University of Delaware [Newark], Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Systématique, adaptation, évolution (SAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Couplage physique-biogéochimie-carbone (PHYBIOCAR), Ecologie des systèmes marins côtiers (Ecosym), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie et de biogéochimie (LOB), CE, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pôle de recherche pour l'organisation et la diffusion de l'information géographique (PRODIG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris-Sorbonne (UP4)-École pratique des hautes études (EPHE)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Panthéon-Sorbonne (UP1), Austral Boréal, Laboratoire de mesure du carbone 14 (LMC14 - UMS 2572), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER), Aubert & Duval, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), UMR 212 EME 'écosystèmes marins exploités' (EME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Océan et Interfaces (OCEANIS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Tunis El Manar (UTM), Chimie Atmosphérique Expérimentale (CAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Biologie et écologie tropicale et méditerranéenne [2007-2010] (BETM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), Center for Environmental Diagnostics and Bioremediation [Pensacola] (UWF | CEDB), University of West Florida [Pensacola] (UWF), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Marine Sciences [Athens], University of Georgia [USA], Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris-Sorbonne (UP4)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Austral Boréal (AB), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), Image, Modélisation, Analyse, GEométrie, Synthèse (IMAGES), Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Télécom Paris-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Télécom Paris, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stazione Zoologica Anton Dohrn (SZN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA), CBETM, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Modélisation et d'Analyse en Géo-Environnement et Santé (IMAGES), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), Département Biogéochimie et Ecotoxicologie, Centre d'Enseignement et de Recherche sur l'Environnement et la Societé / Environmental Research and Teaching Institute (CERES-ERTI), JRC Institute for Environment and Sustainability (IES), European Commission - Joint Research Centre [Ispra] (JRC), Laboratoire Ressources Halieutiques (LRH), Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), Department of Marine Sciences [Athènes], Plymouth Marine Laboratory (PML), Plymouth Marine Laboratory, Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines (LBCM), Université de Bretagne Sud (UBS), Biogéochimie des contaminants organiques (LBCO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Montpellier 1 (UM1), Paléoclimats, proxies, processus ( PALEOPROXUS ), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques ( LOCEAN ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Couplage physique-biogéochimie-carbone ( PHYBIOCAR ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ipso Facto ScopARL, Association Arkaeos, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), CNRS UMR 7057 - Laboratoire Matières et Systèmes Complexes (MSC) (MSC), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)
Subjects: 0106 biological sciences, Mediterranean climate, Biogeochemical cycle, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Biodiversity, Climate change, [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], Aquatic Science, 01 natural sciences, [ SDU.STU.GP ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], Mediterranean sea, [ PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH ] Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], Marine ecosystem, Ecosystem, 14. Life underwater, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 010604 marine biology & hydrobiology, Geology, Global change, 15. Life on land, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Oceanography, 13. Climate action, Climatology, Environmental science
Abstract: Corrigendum : https://doi.org/10.1016/j.pocean.2011.08.003; International audience; The semi-enclosed nature of the Mediterranean Sea, together with its smaller inertia due to the relative short residence time of its water masses, make it highly reactive to external forcings, in particular variations of water, energy and matter fluxes at the interfaces. This region, which has been identified as a “hotspot” for climate change, is therefore expected to experience environmental impacts that are considerably greater than those in many other places around the world. These natural pressures interact with the increasing demographic and economic developments occurring heterogeneously in the coastal zone, making the Mediterranean even more sensitive. This review paper aims to provide a review of the state of current functioning and responses of Mediterranean marine biogeochemical cycles and ecosystems with respect to key natural and anthropogenic drivers and to consider the ecosystems’ responses to likely changes in physical, chemical and socio-economical forcings induced by global change and by growing anthropogenic pressure at the regional scale. The current knowledge on and expected changes due to single forcing (hydrodynamics, solar radiation, temperature and acidification, chemical contaminants) and combined forcing (nutrient sources and stoichiometry, extreme events) affecting the biogeochemical fluxes and ecosystem functioning are explored. Expected changes in biodiversity resulting from the combined action of the different forcings are proposed. Finally, modeling capabilities and necessity for modeling are presented. A synthesis of our current knowledge of expected changes is proposed, highlighting relevant questions for the future of the Mediterranean ecosystems that are current research priorities for the scientific community. Finally, we discuss how these priorities can be approached by national and international multi-disciplinary research, which should be implemented on several levels, including observational studies and modeling at different temporal and spatial scales.
Published: 2011
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36. Methylmercury in tailings ponds of Amazonian gold mines (French Guiana): Field observations and an experimental flocculation method for in situ remediation

Author: Stéphane Guédron, Daniel Cossa, Michel Grimaldi, Laurent Charlet, Géochimie, Institut des Sciences de la Terre (ISTerre), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Supported mainly by the CNRS as a part of the Mercury in French Guiana research program and by the Boulanger Mine Company (CMB)., Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-PRES Université de Grenoble-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-PRES Université de Grenoble-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), and Université de Nantes (UN)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, 010501 environmental sciences, engineering.material, 01 natural sciences, Water column, Decantation, Geochemistry and Petrology, parasitic diseases, Environmental Chemistry, Organic matter, Turbidity, [SDU.STU.AG]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Applied geology, 0105 earth and related environmental sciences, Lime, chemistry.chemical_classification, Hydrology, fungi, 15. Life on land, Pollution, Tailings, Anoxic waters, 6. Clean water, Soil structure, chemistry, engineering, Geology
Abstract: Sites of monomethylmercury (MMHg) production in Amazonian regions have been identified in hydraulic reservoirs, lake sediments and wetlands, but tailings ponds have not yet received sufficient attention for this purpose. This work evidenced high MMHg production within the water column and the interstitial water of two tailings ponds of French Guiana Au mines located; (i) in a small scale exploitation (Combat) where Hg was used for Au amalgamation, and (ii) in an industrial on-going Au mine (Yaoni) processing without Hg. The (MMHg)(D) maximum (2.5 ng L-1) occurred in the oxic water column above the sediment-water interface (SWI) of the most recent tailings pond (Combat), where the substrate was fresh, the redox transition was sharp and the pool of total Hg was large. In the Yaoni pond, the (MMHg)(D) maximum concentration (1.4 ng L-1) was located at the SWI where suboxic conditions prevailed. Using the (MMHg)(D) concentration as a proxy for Hg methylation rates, the present results show that Hg methylation may occur in various redox conditions in tailings ponds, and are favored in areas where the organic matter regeneration is more active. A 3-month long laboratory experiment was performed in oxic and anoxic boxes filled with high turbidity waters from the Combat Au mine to simulate tailings ponds. Slaked lime was added in an experimental set (2 mg L-1)and appeared to be very efficient for the reduction of suspended particulate matter (SPM) to environmentally acceptable concentrations. However, at the end of the experiment, large (MMHg)(D) concentrations were monitored under treated anoxic conditions with the (MMHg)(D) maximum located at the SWI above the Fe-reducing zones. No (MMHg)(D) was detected in oxic experiments. The use of slaked lime for SPM decantation appears to be an efficient and non-onerous process for Au miners to avoid Hg methylation in tailings ponds when it is combined with rapid drainage of the mine waters. A subsequent human intervention is however necessary for the recovery of soil structure through the cover of dried ponds with organic rich materials and reforestation to avoid the stagnation of rain waters and the occurrence of anoxia. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Published: 2011
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37. Le risque écotoxicologique dans le bassin de la Seine : comprendre et diagnostiquer l'impact de la contamination sur les organismes

Author: Catherine Gourlay-France, Françoise Vincent-Hubert, Marie-Hélène Tusseau-Vuillemin, Wilfried Sanchez, Alain Geffaro, Yves Levi, Lucie Oziol, Pierre Labadie, Jean-Marie Mouchel, Mireille Raguet, Sylvain Théry, Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et des forêts, Centre National du Machinisme Agricole, du Génie Rural, des Eaux et des Forêts, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS), Laboratoire d'Eco-Toxicologie / Vignes et Vins de Champagne-Stress et Environnement - EA 2069, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Ecologie Systématique et Evolution (ESE), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structure et fonctionnement des systèmes hydriques continentaux (SISYPHE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence de l'Eau Seine-Normandie, Fédération Île-de-France de Recherche sur l'Environnement (FIRE), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-AgroParisTech, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris)
Subjects: PCB, DIOXINE, PRODUIT PHYTOSANITAIRE, [SDE]Environmental Sciences, ORGANOCHLORE, POLLUTION DE L'EAU, ECOTOXICOLOGIE, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology
Abstract: Le PIREN-Seine s’intéresse à la présence dans le bassin versant de la Seine de contaminants d’origines agricole, industrielle et domestique depuis une vingtaine d’années. Ces polluants, qui se retrouvent parfois à des concentrations très faibles dans l’eau, peuvent avoir des impacts sur l’homme et l’environnement qui restent peu connus. La présence de ces substances toxiques suscite un intérêt majeur auprès des gestionnaires de la ressource comme des consommateurs. Les perturbations endocriniennes, les effets cancérigènes, la présence de résidus de médicaments sont autant de sujets d’inquiétude largement médiatisés et débattus. Pour garantir la protection de la santé humaine et du milieu aquatique, la réglementation a défini des normes de qualité environnementale, les NQE. En application de la directive cadre sur l’eau, des seuils de concentrations moyennes et maximales ont été édictées par la directive fille 2008/105/EC du 16 décembre 2008 pour les 33 substances prioritaires initialement listées. Des NQE provisoires sont aussi disponibles pour plus de 100 autres substances. Les NQE reposent sur l’évaluation approfondie des effets toxiques en laboratoire de ces molécules. L’écotoxicologie traite des effets toxiques des substances chimiques sur les organismes vivants et l’environnement. Ce thème de recherche est étudié aujourd’hui par les équipes d’écotoxicologie, d’écologie et de chimie du PIREN-Seine, notamment via des études sur trois sites pilotes : le bassin de l’Orge, le bassin de la Vesle et l’axe Seine. Comment mesurer l’impact de ces substances ? Les analyses chimiques étant insuffisantes pour évaluer le risque des substances toxiques dans le milieu, les scientifiques étudient d’autres méthodes. Les bio-essais réalisés en laboratoire en font partie. Regroupant un ensemble très vaste d’essais réalisés sur des échantillons de l’environnement, ils permettent de caractériser le «potentiel toxique», comme la présence des perturbateurs endocriniens et la génotoxicité des masses d’eau. In situ, la bioaccumulation, mesurée sur des organismes « sentinelles » contribue à l’évaluation de l’exposition aux micropolluants. Enfin, les biomarqueurs constituent une solution prometteuse pour diagnostiquer l’impact sur l’environnement des contaminants chimiques.
Published: 2011

38. Shellfish and residual chemical contaminants: hazards, monitoring, and health risk assessment along French coasts

Author: Thierry Guérin, Pierre-Marie Badot, Jean-Paul Vernoux, Marielle Guéguen, Didier Claisse, Jean-Claude Amiard, Nathalie Arnich, Laboratoire Phycotoxines, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ), SMAB, Université de Nantes ( UN ), Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons-Alfort, ANSES, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes ( IFREMER Nantes ), Laboratoire d'études et de recherches sur la qualité des aliments et sur les procédés agroalimentaires, AFSSA, Microbiologie d'Intérêt Laitier et Alimentaire ( MILA ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Nantes (UN), Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons-Alfort (LSAl), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments (AFSSA), Microorganismes d'Intérêt Laitier et Alimentaire (MILA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)
Subjects: 0106 biological sciences, Oyster, Cerastoderma edule, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], BLUE MUSSELS, Ruditapes, 010501 environmental sciences, URINARY ARSENIC SPECIATION, 01 natural sciences, HEAVY-METALS, biology.animal, UNITED-KINGDOM ESTUARIES, Pecten maximus, ORGANIC CONTAMINANTS, 14. Life underwater, [ SDV.OT ] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Shellfish, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, CRASSOSTREA-GIGAS, MUSSEL MYTILUS-GALLOPROVINCIALIS, biology, business.industry, 010604 marine biology & hydrobiology, Mussel, biology.organism_classification, Fishery, Agriculture, ORGANOTIN COMPOUNDS, DEFENSE-MECHANISM, Crassostrea, business, SEAFOOD CONSUMERS
Abstract: Shellfish farming is a common industry along European coasts. According to the 2005–2006 data from the French National Shellfish Farming Committee (CNC – Comite National de la Conchyliculture 2010; see Table 1 for a list of acronyms and abbreviations used in this chapter), Spain is the largest shellfish producer in Europe (∼270,000 t) and France ranks second, producing 200,000 t of shellfish annually. France is the leading European oyster producer, with an annual output of 130,000 t of Crassostrea gigas, and ranks fourth in the world after China, Japan, and Korea. The top three European mussel (Mytilus edulis and Mytilus galloprovincialis) producers are Spain (260,000 t), Denmark (80,000 t), and France (65,000 t). For other shellfish, the French annual output level is 15,000 t for king scallops (Pecten maximus) and a few thousand tons for Ruditapes clams (Ruditapes decussatus and Ruditapes philippinarum) and cockles (Cerastoderma edule). The economic impact of shellfish farming is considerable; despite fairly long production lead times and difficult operating conditions, shellfish farming generates annual sales of more than 650 million Euros in France, owing to its high added value.
Published: 2011
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39. Aromas potentiality of tuna cooking juice concentrated by nanofiltration

Author: Pascal Jaouen, Mireille Cardinal, Anthony Massé, Patrick Bourseau, Josiane Cornet, Carole Prost, Raja Ben Amar, Khaled Walha, Univ Sfax, Fac Sci Sfax, Lab Sci Mat & Environm, Sfax 3018, Tunisia., Université de Sfax - University of Sfax, Laboratoire de génie des procédés - environnement - agroalimentaire (GEPEA), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL), Laboratoire d'Ingénierie des Matériaux de Bretagne (LIMATB), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Ifremer Nantes, STBM, Nantes, France, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Food Quality Aroma, École nationale d'ingénieurs des techniques des industries agricoles et alimentaires (ENITIAA), Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Microfiltration, Membrane separation, 02 engineering and technology, Aromas concentration, Membrane technology, 0404 agricultural biotechnology, 020401 chemical engineering, Organic matter, 14. Life underwater, Food science, 0204 chemical engineering, Effluent, Aroma, chemistry.chemical_classification, biology, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, Permeation, Sensory analysis, biology.organism_classification, 040401 food science, Nanofiltration, chemistry, 13. Climate action, Tuna cooking juice, Tuna, Food Science
Abstract: International audience; Tuna cooking juices contain high organic load preventing the rejection in the environment without treatment. But the effluents present an interesting fishy odour and it is worth recovering aroma compounds. In this work, two industrial tuna cooking juices were concentrated by nanofiltration. Nanofiltration performance was discussed in terms of permeation fluxes, organic matter retention and impact on the aromatic properties of juices. NF sharply decreases the global intensity of juices and modifies their aromatic equilibrium. However, the main characteristics and the marine nature of juices were kept. A pre-treatment by microfiltration (MF) induces a marked increase in permeation fluxes during NF concentration while it slightly affects the aromatic properties of juice. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Published: 2011
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40. Amazonian former gold mined soils as a source of methylmercury: Evidence from a small scale watershed in French Guiana

Author: Stéphane Guédron, Delphine Tisserand, Daniel Cossa, Catherine Grimaldi, Michel Grimaldi, Laurent Charlet, Géochimie, Institut des Sciences de la Terre (ISTerre), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-PRES Université de Grenoble-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-PRES Université de Grenoble-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), This research was supported mainly by the CNRS, FNS, FEDER, MATE/DIREN, and ANR as a part of the Mercury in French Guiana research program and by the Boulanger Mine Company (CMB)., Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Biogeochemical cycle, Environmental Engineering, Watershed, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Rain, chemistry.chemical_element, Hydromorphic soils, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Mining, Sink (geography), Stream water, Rivers, Soil Pollutants, Gold placers, Tropical watershed, [SDU.STU.GM]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geomorphology, Oxisols, Waste Management and Disposal, 0105 earth and related environmental sciences, Water Science and Technology, Civil and Structural Engineering, Hydrology, geography, geography.geographical_feature_category, Ecological Modeling, Methylmercury, Mercury, Methylmercury Compounds, 15. Life on land, Particulates, Throughfall, Pollution, 6. Clean water, French Guiana, Mercury (element), Wilderness, chemistry, 13. Climate action, Oxisol, Soil water, Environmental science, Gold, Seasons, Water Pollutants, Chemical, Environmental Monitoring
Abstract: Agrohydrologie; International audience; Total mercury (HgT) and monomethylmercury (MMHg) were investigated in a tropical head watershed (1 km2) of French Guiana. The watershed includes a pristine area on the hill slopes and a former gold mined flat in the bottomland. Concentrations of dissolved and particulate HgT and MMHg were measured in rain, throughfall, soil water and at three points along the stream. Samples were taken in-between and during 14 storm events at the beginning and middle of the 2005 and 2006 rainy seasons. Dissolved and particulate HgT concentrations in the stream slightly increased downstream, while dissolved and particulate MMHg concentrations were low at the pristine sub-watershed outlet (median = 0.006 ng L−1 and 1.84 ng g−1, respectively) and sharply increased at the gold mined flat outlet (median = 0.056 ng L−1 and 6.80 ng g−1, respectively). Oxisols, which are dominant in the pristine area act as a sink of HgT and MMHg from rain and throughfall inputs. Hydromorphic soils in the flat are strongly contaminated with Hg (including Hg0 droplets) and their structure has been disturbed by former gold-mining processes, leading to multiple stagnant water areas where biogeochemical conditions are favorable for methylation. In the former gold mined flat high dissolved MMHg concentrations (up to 0.8 ng L−1) were measured in puddles or suboxic soil pore waters, whereas high dissolved HgT concentrations were found in lower Eh conditions. Iron-reducing bacteria were suggested as the main methylators since highest concentrations for dissolved MMHg were associated with high dissolved ferrous iron concentrations. The connection between saturated areas and stagnant waters with the hydrographic network during rain events leads to the export of dissolved MMHg and HgT in stream waters, especially at the beginning of the rainy season. As both legal and illegal gold-mining continues to expand in French Guiana, an increase in dissolved and particulate MMHg emissions in the hydrographic network is expected. This will enhance MMHg bio-amplification and present a threat to local populations, whose diet relies mainly on fish.
Published: 2011
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41. Assessing interactions between snow chemistry and microbial populations in the snowpack: a metagenomic approach

Author: Larose, Catherine, Dommergue, Aurélien, de Angelis, Martine, Cossa, Daniel, Averty, Bernard, Marusczak, Nicolas, Soumis, Nicolas, Schneider, Dominique, Ferrari, Christophe, Ampère, École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de glaciologie et géophysique de l'environnement (LGGE), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Pacte, Laboratoire de sciences sociales, Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Sciences Po Grenoble - Institut d'études politiques de Grenoble (IEPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ampère (AMPERE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Pacte, Laboratoire de sciences sociales (PACTE), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Sciences Po Grenoble - Institut d'études politiques de Grenoble (IEPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), and Ampère, Publications
Subjects: [SDE] Environmental Sciences, [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

42. Présence et effets des pesticides dans le système fluvio-estuarien de la baie de la Vilaine (Bretagne) : 1. Suivi de la contamination environnementale

Author: Caquet, T., Mazzella, N., Delmas, F., Budzinski, H., Dubernet, J.F., Madigou, C., Allenou, J.P., Gabellec, R., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Réseaux épuration et qualité des eaux (UR REBX), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Université de Bordeaux (UB), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), INRA RENNES FRA, CEMAGREF BORDEAUX UR REBX FRA, CEMAGREF BORDEAUX REBX, UNIVERSITE DE BORDEAUX I FRA, and IFREMER NANTES FRA
Subjects: CONTAMINATION, PESTICIDES, PESTICIDE, ESTUARIES, [SDE]Environmental Sciences, ESTUAIRE, QUALITE DE L'EAU, WATER QUALITY, VILAINE COURS D'EAU
Abstract: International audience; A two-year multidisciplinary programme has been implemented in the northern part of the Bay of Vilaine area (Brittany, Western France) on the presence and effects of chemicals on estuarine continuums (the Vilaine river and two tidal streams). Pesticide contamination was assessed through the analysis by HPLC-MS of water samples collected by an automatic flow-triggered sampler in the Vilaine and point samples for the other sites. Measurements of PAHs, PBDEs, OCPs, alkylphenols and pharmaceuticals were made on water (dissolved phase and particulate matter), sediment and bivalve samples. Phenylurea and chloroacetanilide herbicides and Irgarol 1051 were the most frequently detected contaminants, with individual concentrations ranging from 0.1 to 1.5 µg/L. Values of the corresponding risk quotients frequently exceeded the threshold value of 1. After rain events, elevated herbicide concentrations were also detected in estuarine sites. PAHs, PBDEs, OCPs, alkylphenols, PCBs and pharmaceuticals were only detected at levels corresponding to baseline levels except for summer period in harbour place where high levels of PAHs were recorded for sediments.
Published: 2008

43. Synergic effect of gold mining and damming on mercury contamination in fish

Author: Gilles Durrieu, Marina Coquery, Régine Maury-Brachet, Alain Boudou, Daniel Cossa, UMR 5805 Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique (LMBA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Bordeaux (UB), Qualité des eaux et prévention des pollutions (UR QELY), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Irstea Publications, Migration, Durrieu, Gilles, Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), and Université de Nantes (UN)
Subjects: [SDE] Environmental Sciences, Gold mining, 010504 meteorology & atmospheric sciences, CEMAGREF, chemistry.chemical_element, Food Contamination, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Mining, Fish diet, Rivers, [STAT.AP] Statistics [stat]/Applications [stat.AP], GUYANE FRANCAISE, Environmental Chemistry, Hydroelectric reservoir, Animals, MIC, Mercury contamination, QELY, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, [STAT.AP]Statistics [stat]/Applications [stat.AP], business.industry, Environmental engineering, Fishes, General Chemistry, Mercury, Particulates, Contamination, 6. Clean water, Mercury (element), chemistry, 13. Climate action, Environmental chemistry, Soil water, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, France, Gold, business, Water Pollutants, Chemical, Environmental Monitoring, CHI
Abstract: International audience; Since the late 1980s, several studies have shown that human populations in the Amazon basin are exposed to high mercury levels in their fish diet. Gold mining, which releases the metal during the amalgamation process and erodes soils naturally rich in mercury, is regarded as the main contamination source. Here, we present the results of a comparative study of mercury distribution in the water and fish of two adjacent rivers in French Guiana, with and without gold mining activities. As a consequence of a marked difference in suspended particulate matter between the two systems, total mercury concentrations in unfiltered water samples were higher in the mined river (25.4-34.9 ng L-1) as compared to the reference one (2.1- 5.4 ng L-1). Surprisingly, no significant differences were observed in mercury concentrations between 13 common fish species at upstream sites. In sharp contrast, mercury concentration of fish caught downstream a hydroelectric reservoir, where the two rivers flow, was up to 8-fold higher than that upstream. Mercury speciation measurements allowed one to relate these differences in fish to the water distribution of monomethylmercury, the mercury chemical species that biomagnifies along aquatic foodwebs. Indeed, mean dissolved monomethylmercury concentrations were low and similar in both rivers (0.03-0.06 ng L-1), while they were 10 times higher (up to 0.56 ng L-1) in the water outflowing the hydroelectric dam. Dissolved monomethylmercury determinations along a water column profile suggest that methylation of inorganic mercury occurs in the deep anoxic part in reservoir. We conclude that mercury mobilization related to gold mining is not solely sufficient to account for high concentrations in fish and that environmental conditions that favor mercury methylation, such as anoxia, are needed.
Published: 2005

44. Comparison Between NaCl Tolerance Response and Acclimation to Cold Temperature in Shewanella putrefaciens

Author: Yanick Auffray, Françoise Leroi, Céline Leboeuf, Laurence Leblanc, Axel Hartke, Institut universitaire de formation des maîtres - Nord-Pas-de-Calais (IUFM Nord-Pas-de-Calais), Université d'Artois (UA), Interactions cellulaires et moléculaires (ICM), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire de Microbiologie de l’Environnement (LME), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IFR140-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Nantes (IFREMER Nantes), Université de Nantes (UN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique)
Subjects: Acclimatization, [SDV]Life Sciences [q-bio], Molecular Sequence Data, Shewanella putrefaciens, Reductase, Sodium Chloride, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, 03 medical and health sciences, Bacterial Proteins, Vibrionaceae, Osmotic Pressure, Electrophoresis, Gel, Two-Dimensional, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Amino Acid Sequence, Incubation, 030304 developmental biology, Northern Blot Analysis, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Strain (chemistry), biology, Osmotic concentration, 030306 microbiology, General Medicine, Peroxiredoxins, biology.organism_classification, Hydroperoxide, Cold Temperature, Enzyme, chemistry, Biochemistry, Peroxidases, 13. Climate action, Polypeptide, Northern Blot, Sequence Alignment
Abstract: International audience; Two strains of the spoiling bacterium S. putrefaciens showed an adaptation capacity to hyperosmotic shock when they were pretreated with a sublethal concentration of NaCl. The maximal tolerance factor for the CIP 69.29 strain was obtained when cells were incubated for 1 h in the presence of 1.5% NaCl, whereas for the J13.1 strain, an incubation of 15 min in the presence of 1% NaCl seemed to be the optimal conditions to harden the cells against a subsequent lethal salt treatment. During NaCl adaptation and growth at low temperatures (2°C), 37 and 32 polypeptides were induced respectively. Interestingly, 11 proteins were common between the two different stress responses. These proteins and the corresponding genes seem to play a key role in the observed cross-protection towards the NaCl challenge induced by growth of the cultures at 2°C. One of the overlapping proteins has been identified to correspond to the alkyl hydroperoxide reductase (AhpC) of S. putrefaciens. Northern blot analysis showed that induction of this enzyme was accompanied by accumulation of the corresponding transcript under both conditions.
Published: 2003
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