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Enzymatic browning, called post mortem melanosis in crustaceans, is an enzymatic phenomenon catalyzed by proteins with phenoloxidase activities (tyronase, catecholase, laccase and hemocyanin). The use of sulfite preservatives (E220 to E228 and E539) remains at present the most widespread solution to avoid the development of this unattractive color towards consumers. But, a part of the population develops hypersensitivity reactions by consuming sulfited foods. With the objective to find an alternative to these conversators, two research axes have been planned : the biochemical characterization of the proteins responsible for post mortem melanosis in the P. monodon shrimp, then the search for inhibitory molecules. Fractionation on Phenyl Sepahrose™ CL-4B resin (HIC) followed by SDS-PAGE electrophoresis separation showed the presence of three proteins of 46, 82 and 89 kDa with mainly laccase activity. Identification by RP-HPLC-Q / TOF revealed the presence of hemocyanin only. A pH of 7.0 and a temperature between 37 and 50 °C showed the most important activities, using the enzymatic assay called "MBTH test". On the other hand, a high throughput screening of 45 potentially inhibitory molecules could be performed under standardized analysis conditions thanks to the robotic tools of the Realcat platform; Le bruissement enzymatiques, appelé mélanose post mortem chez les crustacés est un phénomène enzymatique catalysé par des protéines à activités phénoloxydases (tyronase, catécholase, laccase et hémocyanine). L'utilisation de conservateurs de type sulfites (E220 à E228 et E539) reste à l'heure actuelle la solution la plus répandue pour éviter le développement de cette coloration peu attrayante pour le consommateur. Mais une partie de la population développe des réactions d'hypersensibilité en consommant des aliments sulfités. Dans l'onbjectif de rechercher une alternative à ces conservateurs, deux axes de recherche ont été développés durant ces travaux de thèse : la caractérisation biochimique des protéines responsables de la mélanose post mortem chez la crevette P. monodon, puis la recherche de molécules inhibitrices. Un fractionnement sur résine Phenyl Sepahrose™ CL-4B (HIC) suivie d'une séparation par électrophorèse SDS-PAGE ont montré la présence de trois protéines de 46, 82 et 89 kDa à activité principalement laccase. Une identification par RP-HPLC-Q/TOF a mis en évidence la présence d'hémocyanine uniquement. Un pH de 7,0 et une température comprise entre 37 et 50 °C ont mis en évidence les activités les plus importantes, en utilisant le dosage enzymatique dit "test au MBTH". Par ailleurs, un criblage à haut débit de 45 molécules potentiellement inhibitrices a été réalisé dans des conditions d'analyses standardisées grâce à l'outil de robotique de la plateforme Realcat. Une inhibition a été mise en évidence pour 23 composés, certains étant suffisamment efficaces pour être utilisés seuls. D'autres pourraient être introduits dans un cocktail de molécules inhibitrices aux fonctionnalités complémentaires. Les résultats des tests de trempage réalisés sur des crevettes entières ont montré qu'il était indispensable de compléter les études in vitro avec des essais à l'échelle de la matrice alimentaire dans son intégralité.

De part son profil équilibré en acides aminés essentiels (AAE), la farine de poisson (FP) est la source protéique principale utilisée dans l’alimentation des crevettes d’élevage. Cependant, compte tenu des enjeux du développement durable de la production aquacole, son utilisation doit être réduite, et remplacée par d’autres sources protéiques comme les protéines végétales (PV), qui sont souvent carencées en lysine et méthionine mais riches en cystine. Les conséquences d’un tel changement alimentaire sont peu connues chez la crevette tigrée Penaeus monodon. Pour les évaluer, nous avons utilisé des aliments semi-purifiés reflétant les carences/excès en AA des PV pour estimer les besoins en protéine, lysine et méthionine pour l’entretien et la croissance. Tout en confirmant les données antérieures sur les besoins pour la croissance des stades postlarves, nous avons pu préciser la contribution de l’apport en ces deux acides aminés pour l’entretien. Au niveau métabolique, la variation de l’apport protéique (10, 30, 50% protéine brute) et la carence en méthionine (-30% par rapport au besoin) entraînent une modification de l’activité des enzymes du catabolisme des AA, mais pas celle des voies de reméthylation et transsulfuration. En revanche, et pour la première fois chez la crevette, nos résultats démontrent une épargne de la méthionine par la cystine (et la choline), soulignant l’importance de l’apport en AA soufrés totaux (methionine + cystine). Nos résultats illustrent aussi l’importance qu’il convient d’accorder à la disponibilité des AAE dans les études de remplacement de la FP par un mélange de PV pour améliorer l’utilisation azotée chez la crevette P. monodon

La composition chimique de l'huile essentielle de Cinnamosma fragrans a été déterminée. 68 échantillons d'huiles essentielles de C. fragrans provenant de deux régions de Nord Ouest de Madagascar dont 38 de Tsaramandroso et 30 de Mariarano ont été analysés par CPG/SM. La composition de l'huile essentielle que nous avons analysée varie de 88,3 à 99,4%. 57 composants ont été identifiés. Les constituants majeurs sont le linalol pour Tsaramandroso (72,5 ±23,3%) et le 1,8 cinéole pour Mariarano (47,3 ±10,2%). Deux échantillons contenant la teneur la plus élevée: B8 (95,8% linalol) provient de Tsaramandroso et B143 (71,6% 1,8-cinéole) provient de Mariarano, ont été sélectionnés pour déterminer leurs activités antimicrobiennes contre 12 souches de référence et 10 souches isolées de la ferme. Les effets des deux huiles (B8 et B143) sur la survie et les concentrations bactériennes des larves et l'eau d'élevage de Penaeus monodon ont été déterminés. Bacillus subtilis, Bacillus pumulus et Staphylococcus aureus sont les souches les plus sensibles aux deux huiles. La concentration minimale inhibitrice (CMI) de B143 est faible (0,73 à 2,93 mg/ml) contre toutes les bactéries gram négatives testées par rapport au 1,8-cinéole pure (1,47 à 11,75 mg/ml), B8 montre une CMI élevée par rapport au linalol pur contre Salmonella typhimurium, Micrococcus sp, Vibrio alginolyticus et Vibrio vulnifucus qui sont respectivement 11,75 ; 5,88 ; 2,93 et 5,88 mg/ml, alors qu'il présente la même valeur de CMI au linalol pure pour les autres gram négatives. Les deux huiles ont des CMI élevée (5,88 mg/ml) contre Fusarium oxysporum. Des essais avec deux huiles (B8 et B143) ont été effectués à l'écloserie de l'OSO farming Madagascar et nous ont permis d'évaluer la concentration bactérienne des larves et de l'eau d'élevage de P. monodon sur Agar marine et TCBS. L'huile essentielle est ajoutée dans l'eau d'élevage. La survie obtenue avec des essais à quatre répétitions sur B8, B143, antibiotique érythromycine(E) et le témoin montre que l'huile B8 a un effet similaire à l'érythromycine (E) (P>0.05) et plus active que B143 (P

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Presque soixante quinze ans sont écoulés depuis le début de l’élevage moderne des crevettes Pénéides. Jusqu’à maintenant, l’homme ne maîtrise pas encore totalement la conduite de l’élevage. Ce dernier est dû au fait que, il est difficile de reproduire fidèlement le milieu naturel, car il existe des paramètres qu’on ne pourra pas créer ni maîtriser. Mais, pour faire face aux problèmes survenus durant l’élevage, les aquaculteurs tentent toujours de trouver une solution adéquate à chaque problème qu’il rencontre. Dernierèment, ils ont créé un produit issu du milieu naturel pour assurer le nettoyage et le traitement du bassin d’élevage. C’est le produit EPICIN. Ce dernier a été testé dans la ferme de l’AQUAMEN E.F Tsangajoly et les résultats obtenus sont plutôt prometteur. La croissance des crevettes est à peu près la même dans les bassins traités et non traités avec le produit. 22.98g (I3), 15.78 g (I8), 16.77g (I9) [bassins traités] et 13.71 g (S18), 14.19g (S25), 15.01g (S30B), 16.08g (S34) [bassins témoins]. Malgré ces résultats, d’autres études complémentaires devront être faites en parallèle avec l’expérience. Ceci nous permet par la suite, de tirer une conclusion irrévocable sur la faisabilité de ce produit. Almost sixty fifteen years are past since the beginning of the modern breeding of the Peneids shrimps. Until now, the man does not yet completely control the control of the breeding. This last is due to the fact that, it is difficult to reproduce the natural environment accurately, because there are parameters which one will not be able to create nor to control. But, to face the problems which have occurred during the breeding, the aquaculturists always try to find a solution adequate with each problem which it encounters. Lately, they created a product resulting from the natural environment to ensure the cleaning and the treatment of the basin of breeding. It is product EPICIN. This last was tested in the farm of AQUAMEN E.F Tsangajoly and the results obtained are rather promising. The growth of shrimps is about the same one in the basins treated and untreated with the product. 22.98g (I3), 15.78 G (I8), 16.77g (I9) [ treated basins ] and 13.71 G (S18), 14.19g (S25), 15.01g (S30B), 16.08g (S34) [ pilot basins ]. In spite of these results, other complementary studies will have to be made in parallel with the experiment. This allows us thereafter, to draw an irrevocable conclusion on the feasibility of this product. IH.SM , universite Toliara Mémoire de fin d’études pour l’obtention du diplôme de MaST/ML Unpublished produit EPICIN croissance et survie Indice de conversion

Depuis l’assec du canal d’alimentation en 2004 après le passage du cyclone Gafilo, on a constaté une augmentation massive de la densité d’Upogebia spinimanus au sein de la ferme de l’AQUALMA-Besalampy. En cas d’apparition d’une nouvelle maladie des crustacés, ce phénomène constituerait un grand risque en favorisant sa transmission chez les crevettes élevées, voire les consommateurs. Une nouvelle méthode d’approche installée par le laboratoire centrale de l’AQUALMA s’intéresse sur la prévention des risques de maladie liée à la biosécurité, en même temps des crevettes, des consommateurs et de l’environnement. Par conséquent, durant ce 5 mois de stage, des pratiques sur terrain et en laboratoire au moyen de différentes expériences à noter le suivi échantillonnage bimensuel, l’expérience liner, le dragage du fond du canal d’alimentation, le suivi éclosion d’Upogebia et le bioessai concernant la transmissibilité inter espèce par prédation d’Upogebia à juvéniles de crevette sont effectuées pour fournir des données indispensables dans l’étude de cette espèce parasite. A partir des résultats évoqués par ces différents essais, on définit d’abord les priorités d’action pour mener la lutte, ensuite il serait plus facile d’évaluer l’efficacité des traitements expérimentés. Enfin, dans le cadre de la surveillance accrue de la biosécurité dans la ferme de l’AQUALMABesalampy, quelques suggestions sont soulevées pour maîtriser la prolifération massive des parasites dans le canal. UNIMA AQUALMA, IH.SM OPTION : PECHE AQUACULTURE Published Penaeus monodon, Upogebia, biosécurité, bioessai, pathologie

La ferme de l’AQUALAMA Besalampy est confrontée à un problème de mue des juvéniles de crevettes Penaeus monodon durant leurs transfert du bassin de pré-grossissement vers les bassins de grossissement. Le pourcentage des crevettes molles dépasse le seuil 10% durant la pêche. On est obligé alors d’arrêter le transfert et de le rapporter à un autre jour. L’arrêt fréquent du programme de transfert perturbe le planning déjà établi par la société. Afin d’essayer de trouver les raisons qui déclenchent spontanément la mue des juvéniles, on a effectué le suivi des paramètres physico-chimique de l’eau (pH, température, salinité, oxygène dissous, profondeur de l’eau, les marées, la gestion d’eau,…) durant l’élevage et durant le transfert. On a constaté alors que le changement brusque d’un des paramètres physico-chimique de l’eau provoque des stress aux juvéniles et déclenchent l’exuviation ou la mue. Les cycles lunaires et les marées sont des phénomènes naturels qui influencent la mue des crevettes. Durant les marées de vives eaux (Nouvelle lune et pleine lune) les crevettes sont en stades dures et les périodes de mues des crevettes sont durant les marées de mortes eaux (Premier quartier et dernier quartier). Pour éviter l’échec du programme de transfert, il faut minimiser les stress que peuvent subir les juvéniles et éviter d’effectuer la pêche durant les périodes de mue des crevettes IH.SM - UNIMA , Université de Toliara OPTION Contrôle de qualité et Aquaculture Published AQUALMA Besalampy Juvéniles Paramètres physico-chimiques. Pré-grossissement Transfert Mue

Traditional fishing using beach seines was studied over a period of one year at the mouth of the Onilahy river. The catches/efforts were recorded on a daily basis, biological sampling and the measurement of hydrological parameters being carried out twice a month. The moderate variations of salinity and temperature (14 < salinity < 35; 25 degrees C < temperature < 30 degrees C) which were observed in the estuary can be explained by the semiarid climate of the area. Four species of penaeid shrimps are to be found on the Onilahy: Metapenaeus monoceros, Panaeus indicus, Penaeus monodon and Penaeus japonicus, which were mainly caught at the subadult/adult stage with a Carapace length between 10 and 50 mm. The presence of these important sizes at the mouth of the river, associated with the fact that no mature female shrimps were observed in the catches, means that part of the population tends to extend its stay in the estuary. Growth parameters were estimated for M. monoceros and P. indicus, and the growth in the estuary appears to be faster than that observed at sea, especially for P. indicus. In contrast with what is observed in wet tropical areas, the decline in salinity is limited in semiarid climates and is thus not a major factor in the emigration of the shrimps towards the open sea. On the other hand, there is a rather precise link between emigration towards the open sea and falling temperature: important sizes disappear from the river mouth during the transition between autumn and winter. In the estuary of the Onilahy, a temporal partitioning of resources for the four species of penaeid, leading to a reduction of interspecific competition, can be underscored. The traditional fishing yield in the estuary was estimated at 220 metric tons of shrimps per annum, with a catch per unit effort of 15 to 22 kg/seine/trip., La pêche traditionnelle à la senne de plage a été suivie durant un an, dans l'embouchure de l'Onilahy. Les captures/efforts ont été relevés journellement alors que l'échantillonnage biologique et la mesure des paramètres hydrologiques ont été effectués bimensuellement. Le climat semi-aride de la région se traduit sur l'année au niveau de l'estuaire par des écarts de salinité et de température modérés (14 < salinité < 35 ; 25 °C < température < 30 °C). Quatre espèces de pénéides sont observées sur l'Onilahy, Metapenaeus monoceros, Penaeus indicus, Penaeus monodon et Penaeus japonicus, essentiellement capturées au stade subadulte/adulte avec des longueurs céphalothoraciques comprises entre 10 et 50 mm. La présence de ces tailles importantes dans l'embouchure associée au fait qu'aucune crevette femelle mature n'a été observée dans les captures signifie qu'une partie de la population tend à prolonger son séjour dans l'estuaire. Les paramètres de croissance ont pu être estimés pour M. menaceras et P. indicus, et il apparaît, notamment pour P. indicus, que la croissance en estuaire est supérieure à celle observée en mer. Contrairement aux zones tropicales humides, la dessalure est limitée en climat semi-aride et joue un rôle négligeable comme facteur d'émigration des pénéides vers le large. Il existe par contre une liaison assez nette entre l'émigration vers le large et la baisse de température, la disparition des grandes tailles sur l'embouchure se faisant au cours de la transition automne/hiver. Au niveau de l'estuaire de l'Onilahy, on peut mettre en évidence un partage des ressources dans le temps pour les quatre espèces de pénéides qui conduit à une réduction de la compétition interspécifique. La production de la pêche traditionnelle sur l'estuaire a été estimée à 220 tonnes de crevettes par an, avec une capture par unité d'effort de 15 à 22 kg/senne/sortie.

Thirteen populations belonging to seven species of Penaeid prawns (Crustacea, Decapoda) were analyzed at 29 protein loci. The authors show that both inter and intrapopulational genetic diversity are very low. These results are discussed in view of their use as guidance for aquaculture programs., Treize populations appartenant à sept espèces de Crevettes Pénéides (Crustacea, Decapoda), ont été analysées à 29 locus protéiques par électrophorèse enzymatique. Les résultats montrent une très faible variabilité génétique tant interpopulationnelle qu'intrapopulationnelle.

The main factors conditioning the larval development of P. serratus have been studied in the Marine Station at Roscoff. Several types of natural diets have been tested. The nauplii of Artemia salina remain the most practical food. However, it was necessary to verify that a diet of Artemia permits development to a normal mysis. In these experiments, only Artemia originating in California, gave satisfactory results (84.5% viable post-larval shrimps). The most favorable density of larvae during cultivation was between 50 and 100/1. The larvae of P. serratus resisted very wide and sudden variations in salinity. However, when the salinity was