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Despite the constant development of new therapies, surgery retains a major role in Crohn's disease (CD) and the occurrence of postoperative recurrence (POR) is struggling to be slowed down. Prevention of POR is therefore an essential issue in the management of CD patients. Indeed, almost all of the operated patients present with an endoscopic, then clinical POR and up to 20% of the patients will be operated on for a second intestinal resection. Dysbiosis plays a major role in CD recurrence, and over the past twenty years, many studies have highlighted the role of adherent and invasive Escherichia coli (AIEC) in the occurrence of POR and the severity of the lesions. The treatment of patients with prolonged antibiotic therapy cannot be considered due to significant side effects, this is why anti-bacterial targeted therapy strategies represent a new area of research. Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae) CNCM I-3856 is a probiotic yeast whose safety and efficacy in the symptoms of irritable bowel disease has already been demonstrated in clinical studies. The first part of our study aimed to investigate the preventive role of S. cerevisiae on AIEC-induced POR after ileocecal resection (ICR) in HLA-B27 transgenic (Tg) mouse model mimicking CD. We have demonstrated a significant prevention of AIEC-induced POR in Tg rats orally challenged with S. cerevisiae CNCM I-3856, in association with a significant decrease in the severity of macroscopic and histological lesions. We found that the level of adherent and luminal flora colonization by AIECs was correlated with the POR and that the administration of S. cerevisiae CNCM I-3856 was associated with a decrease in the persistence of luminal and adherent AIECs, due to a competitive anti-adhesion mechanism. In addition, stimulation of the production of anti-inflammatory cytokine IL-10 was also observed in the Tg rats receiving the treatment with S. cerevisiae CNCM I-3856, as well as an inhibition of the local AIEC-induced production of IL-17 and IL-23.The second part of this work consisted in studying the impact of oral administration of Tofacitinib, a Janus Kinase inhibitor, in the prevention of POR after ICR in the Tg HLA-B27 rat model. A decrease in macroscopic, histological and endoscopic lesions was demonstrated during treatment with Tofacitinib in comparison with control Tg rats receiving PBS.S. cerevisiae CNCM I-3856 and Tofacitinib seem to represent new perspectives for the management of POR in CD patients.; Malgré le développement constant de nouvelles thérapeutiques, la chirurgie garde un rôle majeur dans la maladie de Crohn (MC) et la survenue d'une récidive post-opératoire (RPO) peine à être freinée. La prévention de la RPO est donc un enjeu essentiel dans la prise en charge des patients atteints de MC. En effet, la quasi-totalité des patients opérés présentent une RPO endoscopique, puis clinique et on estime que jusqu'à 20% des patients seront opérés d'une seconde résection intestinale. La dysbiose joue un rôle majeur dans cette récidive, et, depuis une vingtaine d'années, nombre d'études ont mis en lumière le rôle des Escherichia coli adhérents et invasifs (AIEC) dans la survenue de la RPO et la sévérité des lésions. Le traitement des patients par une antibiothérapie prolongée ne peut être envisagé en raison d'effets secondaires notables ; dans ce contexte les stratégies de thérapies ciblées anti-bactériennes représentent une nouvelle piste thérapeutique. Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae) CNCM I-3856 est une levure probiotique dont l'innocuité, et l'efficacité dans les symptômes des troubles fonctionnels intestinaux, ont déjà été démontrées chez l'homme. La première partie de notre étude visait à étudier le rôle préventif de S. cerevisiae sur la RPO AIEC-induite après résection iléo-caecale (RIC) dans un modèle murin transgénique (Tg) HLA-B27 mimant la MC. Nous avons mis en évidence une prévention significative de la RPO AIEC-induite lors du traitement oral des rats Tg par S. cerevisiae CNCM I-3856, en association avec une diminution significative de la sévérité des lésions macroscopiques et histologiques. Nous avons constaté que le niveau de colonisation de la flore adhérente et luminale par les AIEC était corrélé à la RPO, et que l'administration de S. cerevisiae CNCM I-3856 était associée à une diminution de la persistance des AIEC luminaux et adhérents, grâce à un mécanisme compétitif anti-adhésif. Par ailleurs, on observait également une stimulation de la production de la cytokine anti-inflammatoire IL-10 chez les rats Tg recevant le traitement par S. cerevisiae CNCM I-3856, ainsi qu'une inhibition de la production locale d'IL-17 et d'IL-23 induite par les AIEC.La seconde partie du travail a consisté à étudier l'impact de l'administration orale de Tofacitinib, une molécule inhibitrice de Janus kinase, dans la prévention de la RPO après RIC dans le modèle du rat Tg HLA-B27. Il a été mis en évidence une diminution des lésions macroscopiques, histologiques et endoscopiques lors du traitement par Tofacitinib en comparaison avec les rats Tg contrôles recevant du PBS.S. cerevisiae CNCM I-3856 et le Tofacitinib semblent pouvoir représenter de nouvelles perspectives de prise en charge de la RPO chez les patients atteints de MC.

L’ataxie spinocérébelleuse de type 3, aussi connue en tant que la maladie de Machado-Joseph (MMJ), est une maladie qui se développe lorsqu’il y a une expansion des trinucléotides CAG dans la région codante du gène ATXN3. Ce dernier code pour la protéine ATXN3, une enzyme désubiquitinante avec des fonctions essentielles dans le maintien et la stabilisation de l’homéostasie protéique, la résistance au stress, la régulation de la transcription, la réparation de l’ADN, l’organisation du cytosquelette et la régulation de la myogenèse. Les principaux symptômes associés à cette maladie sont l’ataxie (le symptôme clé), une détérioration motrice progressive, la dystonie, la spasticité et la rigidité. Du fait de l’absence de thérapie spécifique et efficace pour traiter les individus atteints de la MMJ, l’approfondissement des connaissances liées à cette maladie est nécessaire. Le but de cette thèse est de comprendre davantage les mécanismes et voies de signalisations impliqués dans la pathologie de la MMJ. Pour atteindre cet objectif, à partir de notre modèle transgénique C. elegans MMJ, deux différents criblages ont été effectués : un criblage non biaisé de 3942 composés, et un criblage de modificateurs génétiques à base d’ARN interférent (ARNi) de 387 clones de facteurs de transcription. Le premier criblage nous a permis d’identifier cinq molécules prometteuses : l’alfacalcidol, le chenodiol, le cyclophosphamide, le fenbufen et le sulfaphenazole. Elles ont permis la restauration du défaut de la motilité, la protection contre la neurodégénérescence, et une augmentation de la durée de vie réduite chez les vers mutants. Trois parmi ces molécules, le chenodiol, le fenbufen et le sulfaphenazole ont démontré une nécessité de la présence de HLH-30/TFEB, un régulateur clé de l’autophagie et de la biogenèse lysosomale, pour leurs propriétés neuroprotectrices. Concernant le deuxième criblage, il nous a permis d’identifier un nouveau gène candidat impliqué dans la MMJ, fkh-2/FOXG1. L’inactivation de ce gène a entraîné une aggravation du défaut de la motilité, de la neurodégénérescence, et de la longévité réduite. À l’inverse, sa surexpression a restauré tous ces phénotypes, suggérant ainsi un rôle neuroprotecteur pour FKH-2/FOXG1 dans la MMJ. Le modèle C. elegans de MMJ et les criblages sont des outils puissants permettant un approfondissement des connaissances quant à la pathologie de la MMJ. Pour cette thèse, par l’identification des molécules neuroprotectrices et les facteurs de transcription HLH-30/TFEB et FKH-2/FOXG1, ayant des activités neuroprotectrices dans notre modèle lorsqu’ils sont surexprimés, il a été possible à mieux comprendre la pathologie de la MMJ, ainsi que les mécanismes et les voies de signalisation qui y sont impliqués. Ces découvertes sont prometteuses à investiguer dans des organismes modèles plus avancés, des applications précliniques et également, pour le développement de nouvelles interventions thérapeutiques pour la MMJ., Spinocerebellar ataxia type 3, also known as Machado-Joseph disease (MJD), is a polyglutamine expansion disease arising from a trinucleotide CAG repeat expansion in the coding region of ATXN3. This gene encodes ATXN3 protein, a deubiquitinating enzyme, which is involved in protein homeostasis maintenance and stabilization, stress resistance, transcription regulation, DNA repair, cytoskeleton organisation and myogenesis regulation. The main symptoms associated with this disease are ataxia (the key symptom), progressive motor deterioration, dystonia, spasticity and stiffness. Due to our incomplete understanding of mechanisms and molecular pathways related to this disease, there are no therapies that successfully treat core MJD patients. Therefore, the identification of new candidate targets related to this disease is needed. The aim of this thesis is to gain insights into the pathways and mechanisms leading to MJD. In order to achieve this goal, we performed two different screens, a blind drug screen of 3942 compounds to identify protective small molecules, and a large-scale RNA interference (RNAi) screen of 387 transcription factor genes leading to identification of modifiers involved in our transgenic C. elegans MJD model. The first screen allowed us to identify five lead compounds restoring motility, protecting against neurodegeneration, and increasing the lifespan in mutant worms. These compounds were alfacalcidol, chenodiol, cyclophosphamide, fenbufen and sulfaphenazole. We then found that three of these compounds, chenodiol, fenbufen and sulfaphenazole required HLH-30/TFEB, a key transcriptional regulator of the autophagy and the lysosomal biogenesis, to complete their neuroprotective activities. The second screen brought us to identify a news hit gene candidate involved in MJD, fkh-2/FOXG1. We showed that inactivation of this gene enhanced the motility defect, neurodegeneration and reduced longevity in our MJD model. However, in opposite, its overexpression rescued all these phenotypes, suggesting a neuroprotective role for FKH-2/FOXG1 in MJD when overexpressed. C. elegans models for MJD and the screenings are promising tools to understand the mechanisms and pathways causing neurodegeneration, leading to MJD. In this study, we identified positively acting compounds that may be promising candidates for investigation in mammalian models of MJD and preclinical applications in the treatment of this disease. Also, we gained insights into the pathways of MJD and found that HLH-30/TFEB and FKH-2/FOXG1 are both implicated in MJD and have neuroprotective activities when they are overexpressed. These promising findings may aid the development of novel therapeutic interventions for MJD.

Introduction - Spondyloarthritis (SpA) is a frequent chronic inflammatory disease. Both in human and in HLA-B27/human β2-microglobulin transgenic rat model (B27-rat), SpA development is associated with the activation of interleukin (IL)-23/IL-17 axis, including a biased differentiation of naive CD4+ T cells into T helper-17 (Th17), favored by dendritic cells (DC). We aimed to decipher the transcriptomic and epigenomic mechanisms leading to altered naive CD4+ T cells differentiation in B27-rat.Results - We first demonstrated that both DC and naive CD4+ T cells from B27-rats contributed additively to a Th17 proinflammatory profile of CD4+ T cells, even before rat-SpA. This was supported by a Th1/Th17 imbalance at the transcriptomic level, that was reflected at the epigenomic level. STAT1 and STAT3 appeared as upstream transcription factors regulating this biased programing of naive CD4+ T cells. At the protein level, STAT1 deficiency appeared as an early and persistent characteristic of B27-rat naive CD4+ T cells, even before disease onset, whereas STAT3 protein increased upon rat-SpA development. In vitro, IL-17A expression by B27-rats naive CD4+ T cells was reversed by a selective STAT1 transcriptional activator, IFNγ, or IL-27, which effects were related to STAT1/STAT3-related genes rebalancing. Moreover, Stat1 mRNA expression was decreased in naive CD4+ T cells from SpA patients as compared to healthy controls and rheumatoid arthritis patients. The propensity of CD4+ T cells from SpA patients to produce increased level of IL-17A was dampened by IL-27 in vitro. In vivo, in B27-rat, IL-27 reduced arthritis and colitis severity, in relation with a decrease in Th17 effector T cells.Conclusion - Naive CD4+ T cells from B27-rats harbor an intrinsic bias favoring to Th17 differentiation, imprinted at the epigenomic level, preceding disease onset, and related to a precocious STAT1 defect. Induction of STAT1 signaling reversed Th17 differentiation bias in vitro and in vivo. Next perspectives are to decipher the mechanisms linking HLA-B27 to STAT1 defect and to develop IL-27 as a new therapeutic target in SpA., Introduction - La spondyloarthrite (SpA) est une maladie inflammatoire chronique fréquente. Chez l'homme et dans le modèle du rat transgénique pour le HLA-B27 et la β2-microglobuline humaine (rat-B27, SpA-rat), le développement de la SpA est associé à l'activation de l'axe interleukine (IL)-23/IL-17, impliquant notamment un biais de différenciation des lymphocyte T CD4+ naïfs en T helper 17 (Th17), favorisé par les cellules dendritiques (DC). Nous avons cherché à comprendre les mécanismes moléculaires conduisant à ce biais de différenciation des lymphocytes T CD4+ naïfs chez le rat-B27.Résultats - Nous avons d'abord démontré que les DC et les lymphocytes T CD4+ naïfs de rats-B27 contribuaient de façon additive la survenue d'un profil pro-inflammatoire Th17 des lymphocytes T CD4+, même avant le début de la SpA-rat. Ceci était lié à un déséquilibre de la balance Th1/Th17 au plan transcriptomique, par ailleurs imprimé au plan épigénomique. STAT1 et STAT3 sont apparus comme des facteurs de transcription clés possiblement responsables de la programmation biaisée des lymphocytes T CD4+ naïfs. Au niveau protéique, un déficit en STAT1 était une caractéristique précoce et persistante des lymphocytes T CD4+ naïfs du rat-B27, précédant l'apparition de la maladie, alors que STAT3 n'augmentait qu'après l'apparition de la SpA-rat. In vitro, l'expression de l'IL-17A par les lymphocytes T CD4+ naïfs des rats-B27 était inhibée par un activateur transcriptionnel sélectif de STAT1, l'IFNγ, et également par l'IL-27 dont les effets étaient liés au rééquilibrage de la balance d'expression entre des gènes dépendants de STAT1 ou de STAT3, en faveur du premier. De plus, l'expression de l'ARNm de Stat1 était diminuée dans les lymphocytes T CD4+ naïfs des patients atteints de SpA, comparativement à des témoins sains ou atteints de polyarthrite rhumatoïde. La propension des lymphocytes T CD4+ des patients atteints de SpA à produire un niveau accru d'IL-17A était réduite par l'IL-27 in vitro. In vivo, chez le rat-B27, l'IL-27 réduisait la sévérité de l'arthrite et de la colite, en lien avec la diminution de cellules T effectrices au profil Th17.Conclusion - Les lymphocytes T CD4+ naïfs de rats-B27 présentent un biais intrinsèque favorisant leur différenciation en Th17, imprimé au niveau épigénomique, précédant l'apparition de la maladie et lié à un défaut précoce de la voie STAT1. L'induction de la signalisation STAT1 inhibe le biais de différenciation Th17 in vitro et in vivo. En perspective, nous tâcherons de préciser les mécanismes liant l'expression du HLA-B27 au défaut de STAT1 et de développer l'IL-27 comme une nouvelle cible thérapeutique pour la SpA.

L’un des plus grands défis actuellement pour la santé publique au Brésil et dans le monde sont les maladies à transmission vectorielle, et les mesures de lutte actuelles sont inefficaces. Les moustiques sont parmi les vecteurs de diverses maladies, parce qu’ils sont hématophagous, les femelles ont besoin de sang dans la période d’ovulation pour la reproduction et une fois contaminés, le moustique peut contenir des bactéries, protozoaires et virus qui sont alloués dans leurs glandes salivaires, infectant ainsi l’individu directement dans la circulation sanguine. Aedes aegypti est responsable de ces maladies : dengue, zika, chikungunya et fièvre jaune. Les formes de lutte contre les moustiques vecteurs jusqu’à présent sont inefficaces, et avec cela plusieurs technologies ont été développées comme alternatives dans la lutte et la lutte contre le moustique Aedes aegypti. Avec les approbations récentes pour la libération d’insectes génétiquement modifiés, il est nécessaire d’avoir des études plus détaillées pour évaluer leur potentiel écologique et leurs effets évolutifs. Ces effets peuvent se produire en deux phases : une phase transitoire lorsque la population focale change de densité, et une phase d’état stable lorsqu’elle atteint une densité nouvelle et constante. Avec les innovations dans la lutte antivectorielle par le biais d’insectes génétiquement modifiés nous donner une nouvelle perspective par rapport à la manipulation génétique. Cette étude vise à évaluer les effets potentiels d’un changement rapide de la densité du moustique Aedes aegypti lié à la lutte biologique par le moustique génétiquement modifié. Nous nous demandons donc si la biotechnologie peut être une solution aux problèmes de santé publique dans le cas du moustique Aedes aegypti ou un problème? Puisque la transformation ou les modifications de ces êtres vivants dans les laboratoires sont de nouvelles techniques qu’il est impossible jusqu’à présent de savoir quelles seront les conséquences à long terme.

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Malaria is a tropical disease caused by a parasite of the Plasmodium genus. High levels of circulating human group IIA secreted phospholipase A2 (hGIIA) have been reported in malaria patients. The enzyme is well known for its bactericidal and pro-inflammatory actions. However, so far its role in malaria is unknown. In order to address the in vivo role of hGIIA in malaria, we performed a hematological, histopathological and immunohistochemical characterization of C57BL/6 hGIIA transgenic mice (Tg+ mice) infected with P. chabaudi chabaudi (864VD strain), a murine Plasmodium species and strain which causes non-lethal chronic malaria. Infected Tg+ mice present a 27% reduction of parasitaemia at the peak of infection (D14 post-inoculation, p.i.) compared to infected non-transgenic littermates (Tg- mice). Intraperitoneal injection of recombinant hGIIA at D12, D13 and D14 p.i. (0.125 mg/kg twice a day) into P. chabaudi 864VD-infected WT C57BL/6 mice leads to a 19% reduction of the parasitaemia at D14 p.i., demonstrating the direct and acute role of hGIIA in lowering parasite population and presumably ruling out a potential effect linked to chronic overexpression of hGIIA in Tg+ mice. Hematological data show a durable anemia in Tg+ mice compared to Tg- mice during the infection and an important increase of leucocytes, especially of polynuclear neutrophils. The parasitized Tg+ mouse also presents a higher activation of lymphocytes and a specific activation of monocyte cells at the pic of crisis. In the infected Tg- mouse, histological data show a better histopathological recovery in the liver and B cells hyperplasia in the spleen, whereas the infected Tg+ mouse presents late hepatic injuries and splenic extra-medullar hematopoiesis. RT-qPCR analyses suggest that hGIIA mRNA increases at the pic of infection in the liver of infected Tg+ mice, but decreases in spleen and blood. Intraperitoneal injection of recombinant hGIIA at the patent phase is without effect on parasitaemia, which suggests that later infection events are needed for the enzyme antiparasitic activity. Involvement of oxidized-lipoproteins as potential hGIIA substrates, based on in vitro studies, is discussed. In conclusion, our studies allowed us to elaborate a larger picture of the infection of Plasmodium in the mice expressing hGIIA and open new perspectives in the analysis of the role of the enzyme in malaria pathophysiology.; Le paludisme est une maladie tropicale causée par un parasite du genre Plasmodium. Chez l’Homme, un niveau élevé de phospholipase A2 sécrétée de groupe IIA humaine (hGIIA) est mesuré dans le plasma des patients impaludés. Cette enzyme est connue pour son rôle antibactérien et pro-inflammatoire. Cependant, son rôle dans le paludisme n’a jamais été exploré. Pour comprendre le rôle in vivo de la hGIIA dans cette pathologie, nous avons entrepris la caractérisation hématologique, histopathologique et immunohistochimique de l’infection de souris C57BL/6, transgéniques (Tg+) pour l’enzyme humaine, par l’espèce murine Plasmodium chabaudi chabaudi 864VD. Ce modèle reproduit un paludisme non létal. Nos résultats ont permis d’établir que les souris Tg+ ont un meilleur contrôle de l’infection au moment du pic de crise parasitaire (J14 post-inoculation), avec une diminution de 27% de la parasitémie, comparé aux souris « littermates » non transgéniques (Tg-). L’injection de hGIIA recombinante aux jours 12, 13 et 14 p.i. (0,125 mg/kg deux fois par jour) à des souris C57BL/6 wild-type (WT) infectées par P. c. chabaudi 864VD provoque une diminution d’environ 19% de la parasitémie à J14 p.i., démontrant un rôle direct de la hGIIA dans la diminution de la population parasitaire. Les données hématologiques montrent que l’infection chez la souris Tg+ provoque une anémie plus durable que chez la souris Tg- et une élévation nettement plus importante du nombre de leucocytes, en particulier des polynucléaires neutrophiles. Chez la souris Tg+ parasitée, on observe aussi l’activation d’un nombre important de lymphocytes et une activation spécifique des monocytes avant le pic de crise. Chez la souris Tg- infectée, les données histologiques mettent en avant une meilleure récupération des lésions histopathologiques du foie et une hyperplasie des lymphocytes B dans la rate, tandis que les souris Tg+ infectées présentent des lésions hépatiques tardives et une hématopoïèse extramédullaire splénique. Les résultats des analyses par RT-qPCR suggèrent que l’ARNm de la hGIIA augmente au pic parasitaire dans le foie des souris Tg+ infectées, mais diminue dans la rate et les cellules sanguines. L’injection de hGIIA recombinante au début de la phase patente est sans effet sur la parasitémie, ce qui laisse supposer que des événements plus tardifs dans l’infection sont nécessaires à l’activité antiparasitaire de l’enzyme. L’étude du rôle des lipoprotéines oxydées comme substrat potentiel de l’activité antiparasitaire de l’enzyme, basée sur des résultats in vitro, est abordée. En conclusion, nos études ont permis de dresser un tableau large de l’infection à Plasmodium chez la souris exprimant la hGIIA, et ouvrent de nouvelles perspectives dans l’analyse du rôle de l’enzyme dans la physiopathologie du paludisme.

Formation of crossovers (COs) during meiosis depends on the coordinated activities of multiple pro-CO factors, including the MutSγ complex and COSA-1, that become concentrated at the sites of CO-designated recombination intermediates in an interdependent manner (Yokoo et al. 2012; Woglar and Villeneuve 2018). The MutSγ complex is a heterodimer comprising the conserved proteins MSH-5 and MSH-4 (aka HIM-14, encoded by the him-14 gene) (Zalevsky et al. 1999; Kelly et al. 2000). COSA-1 is a member of the cyclin superfamily and is hypothesized to function as part of a cyclin-dependent protein kinase (CDK) complex (Yokoo et al. 2012). The MutSγ complex was suggested to be a potential target for this hypothesized COSA-1 dependent CDK activity, as MSH-5 has multiple potential CDK phosphorylation sites and can be phosphorylated in vitro by a mammalian CDK. These and other data led to a model in which COSA-1-dependent phosphorylation boosts the activity of MutSγ as part of a positive feedback loop that concentrates pro-CO factors at CO sites (Yokoo et al. 2012).

Cette contribution interroge les modes de présence d’un saumon transgénique (l’AquAdvantage Salmon®) dans la tentative de la construction de son marché aux Etats-Unis. Est-il un objet ? Est-il un objet ordinaire ? Elle montre que celui-ci surgit de façon multiple tout au long des réseaux de relation au sein desquels il est amené à s’insérer. Tour à tout nouvel objet technique, poisson, aliment, produit, et « objet frontière », ces modes de présence instaurent aussi de nouvelles réalités sociales qui semblent plus problématiques que le saumon transgénique lui-même. This contribution questions the modes of the presence of a transgenic salmon (AquAdvantage Salmon ®) in an attempt to build its market in the United States. Is it an object? Is it an ordinary object? It shows this salmon arises in multiple ways throughout the networks of relationships in which it is led. Alternaltely new technical object, fish, food, product, and “boundary object”, these modes of presence also introduce new social realities that seem more problematic than the transgenic salmon itself. Esto pone en duda la contribución de los modos de la presencia de un salmón transgénico (el Salmón AquAdvantage®) en un intento de construir su mercado en los Estados Unidos. Es un objeto? ¿Es un objeto común y corriente? Se muestra que surge de varias maneras a través de las redes de relaciones en la que se llevaron. Alternaltely nuevo objeto técnico, pescado, alimentos, productos y “objeto frontera”, estos modos de presencia también introducen nuevas realidades sociales que parecen más problemáticos que el salmón transgénico en sí.

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Le modèle murin transgénique TCR1640 possède un récepteur de cellule T spécifique pour le peptide 92-106 de la glycoprotéine oligodendrocyte myéline et développe spontanément une encéphalomyélite autoimmune expérimentale (EAE). Celle-ci est plus prévalente chez les femelles, développant un décours de la maladie de type poussée-rémission (RR), alors que la majorité des mâles présente une EAE primaire progressive (PP). Ce modèle reflète parfaitement les différences liées au sexe, l’hétérogénéité de la présentation, la pathologie ainsi que l’implication de diverses populations de cellules immunitaires observées dans la sclérose en plaques. Ce projet vise l’étude des changements pathologiques au cours des diverses phases de la maladie, ainsi que des mécanismes responsables des différences inhérentes au sexe. La caractérisation pathologique in situ par immunohistochimie révèle que la barrière hémo-encéphalique (BHE) est altérée lors des phases actives de l’EAE spontanée, de façon concomitante à une activation de l’endothélium ainsi qu’une infiltration du système nerveux central par les cellules immunitaires. Or, la perméabilité de la BHE semble rétablie lors de la phase de rémission. Le transfert adoptif de cellules issues de TCR1640 dans des animaux nontransgéniques, a permis de démontrer que le cours de la maladie dépend du sexe du donneur. En effet, les souris receveuses de cellules de mâles développent une EAEPP, alors que celles recevant des cellules de femelles développent une EAE-RR, et ce indépendamment du sexe de l’animal receveur. Des analyses transcriptomiques révèlent des différences d’expression génique entre les cellules immunitaires issues de mâles et de femelles TCR1640, suggérant que le cours de la maladie RR versus PP est déterminé par des gènes sexe-dépendants du compartiment immun., The TCR1640 transgenic mice carry a T cell receptor specific for myelin oligodendrocyte glycoprotein peptide 92-106 and develop spontaneous experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE). The disease is more prevalent in female mice and most of them develop an EAE with a relapsing-remitting (RR) disease course whereas the majority of the males present a primary progressive (PP)-EAE. This model perfectly reflects disease-related sex differences, heterogeneous disease courses, pathology and immune cell involvement seen in multiple sclerosis. The aim of this project is to study how the pathological burden evolves in spontaneous EAE developed by TCR1640 mice, and to unravel mechanisms behind sex-related difference. The blood-brain barrier (BBB) permeability and integrity of central nervous tissues from TCR1640 mice was investigated at different phases in the disease, using immunohistochemistry. BBB alterations were found in active phases of the disease, accompanied by CD4+ and FOXP3+ T cell infiltration and endothelium activation. The integrity of the BBB seems to be re-established following remission phase. To investigate disease-related sex differences observed in these mice, an adoptive transfer experiment was performed. Immune cells from TCR1640 were injected in WT mice in different combinations of males or females donor and recipient. We found that recipients injected with male cells developed PP-EAE, whereas recipients injected with females cells developed RR-EAE, regardless of the sex of the recipient animal. Moreover, transcriptomic analysis revealed that gene expression differs in immune cells for males versus females TCR1640 suggesting that RR versus PP disease course is dictated by sex-dependent genes encoded by the immune compartment.

Cet article examine la pertinence du modele agro-exportateur dans lequel l’Argentine s’est engagee sous l’angle de sa soutenabilite. Il suggere un conflit profond entre, d’une part, le succes indeniable de la « sojatization » de l’agriculture argentine, mesure en termes de production et de profits records, et, d’autre part, la soutenabilite sociale, economique et environnementale de ce nouveau modele de production en reseau.

Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is a neuromuscular disease that affects many tissues. Brain involvement is demonstrated by debilitating neurological symptoms, as well as brain structural changes, such as predominant white matter lesions. DM1 neurological manifestations have a profound impact on the daily life of patients and their families. DM1 is caused by the abnormal expansion of a CTG repeat in the 3¿UTR of the DMPK gene. Expanded transcripts are toxic: they accumulate in RNA aggregates (foci), affecting RNA-binding proteins and deregulating primarily the alternative splicing of downstream targets and other aspects of RNA metabolism. Today, we still do not know which cell types and molecular pathways are primarily affected in the brain and how they contribute to DM1 neurological symptoms. To investigate this problem our laboratory has developed a transgenic mouse model of DM1. The DMSXL mice express expanded human DMPK transcripts in multiple tissues, notably in the brain, and display relevant behavioural, electrophysiological and neurochemical phenotypes. As a result, these mice provide a powerful tool to study DM1 brain dysfunction. A previous global proteomics study of DMSXL brain tissue revealed changes in oligodendrocyte-specific proteins, among others. Together with the prevalent white matter lesions reported in patients, the abnormalities in mouse myelin proteins suggest the implication of oligodendrocytes (OL) in DM1 neuropathology. Thus, my project aimed to investigate OL and myelin dysfunction in the aetiology of DM1 brain disease. I first looked for signs of RNA toxicity in OLs and characterised myelin phenotypes in DMSXL mice. I confirmed RNA foci accumulation in vivo, associated with mild spliceopathy of candidate genes in OL isolated from adult mice. To confirm the impact on myelin biology, I studied the expression of key myelin protein components and found delayed expression in young DMSXL animals, as well as in other complementary mouse models of DM1. Although myelin protein deregulation was not accompanied by abnormalities in myelin ultrastructure, it was associated with a decrease in the number of myelinated axons, suggestive of early hypomyelination in these animals. To investigate whether hypomyelination was due to abnormalities in OL maturation, I quantified subpopulations of the oligodendroglial cell lineage and found a decrease in fully differentiated cells. Following the confirmation of myelin phenotypes in DMSXL mice, I investigated the underlying cellular physiology. To this end, I used DMSXL mice as a renewable source of homogenous cultures of OL. I optimised cell culture conditions and semi-automated analysis of live-cell videomicroscopy to monitor OL proliferation and differentiation in culture. Although displaying normal proliferation in culture, DMSXL OL precursor cells (OPC) display signs of impaired migration and defective differentiation. To gain insight into the molecular mechanisms behind OL defective differentiation, I used RNA sequencing to find expression and splicing events deregulated in primary DMSXL OLs. Gene ontology analysis of transcriptome abnormalities pointed to abnormal expression of structural and regulatory components of the cytoskeleton, as well as critical signalling pathways involved in cell motility and differentiation. Interestingly, the analysis revealed that the spliceopathy detected in DMSXL OLs recreates the splicing profiles of undifferentiated OPC, providing molecular support for the maturation delay of these cells. Importantly, the cell maturation defects are recreated to some extent in human OLs differentiated from DM1 iPS cells models. All together my work has provided novel insight into the cell-specific mechanisms operating in DM1, demonstrating the implication of OL and myelin defects in a DM1 mouse model, and contributing towards an integrative understanding of brain pathology., La dystrophie myotonique de type 1 (DM1) est une maladie neuromusculaire multisystémique. L'atteinte cérébrale se manifeste par des symptômes neurologiques handicapants et des modifications structurales du cerveau, telles que des lésions prédominantes de la substance blanche. Les manifestations neurologiques de la DM1 impactent sévèrement le quotidien des patients et de leurs familles. La DM1 est due à l'amplification anormale de répétitions CTG dans la partie 3'UTR du gène DMPK. Les transcrits DMPK mutants ont un effet toxique en trans: ils s'accumulent sous forme d'agrégats d'ARN (foci) qui dérégulent des protéines de liaison à l'ARN, l'épissage alternatif ainsi que d'autres aspects du métabolisme des ARN. Aujourd'hui, les types cellulaires et voies moléculaires principalement perturbés dans le cerveau ainsi que leur contribution aux symptômes neurologiques restent méconnus. Pour étudier ces mécanismes, notre laboratoire a créé des modèles murins transgéniques DM1 dont les DMSXL. Ces souris expriment des transcrits DMPK mutants humains dans plusieurs tissus, y compris le cerveau, et présentent des phénotypes comportementaux, électrophysiologiques et neurochimiques pertinents. Ces souris représentent un outil unique pour l'étude du dysfonctionnement cérébral dans la DM1. Une approche protéomique réalisée sur le cerveau des DMSXL a notamment montré une dérégulation de protéines spécifiques des oligodendrocytes (OL). Cette dérégulation protéique dans les DMSXL, associée aux lésions de la substance blanche décrites chez les malades, suggère l'implication des OL dans la neuropathologie de la DM1. Mon projet de thèse avait comme objectif d'étudier l'implication des OL et de la myéline dans l'étiologie de l'atteinte cérébrale de la DM1. J'ai d'abord caractérisé la toxicité des ARN CUG dans les OL et les phénotypes de la myéline dans les DMSXL. J'ai confirmé l'accumulation de foci d'ARN in vivo, associée à des défauts d'épissage dans les OL isolés de souris adultes. Pour confirmer les atteintes de la myéline, j'ai étudié l'expression de ses composants clés, et j'ai constaté une expression retardée de certaines protéines dans les souriceaux DMSXL, ainsi que dans d'autres modèles murins de la DM1. La dérégulation de ces protéines n'est pas associée à des anomalies ultrastructurales de la myéline dans les souris DMSXL, en revanche moins d'axones y sont myélinisés, suggérant une hypomyélinisation précoce chez ces animaux. Pour rechercher si l'hypomyélinisation était due à des anomalies de maturation des OL, j'ai quantifié les sous-populations de la lignée oligodendrogliale : l'hypomyélinisation des souris DMSXL est associée à une diminution de la densité d'OL pleinement maturés. J'ai par la suite étudié les défauts cellulaires derrière les phénotypes de la myéline. Pour cela, j'ai mis au point les conditions de culture d'OL primaires issus des souris DMSXL, ainsi que les protocoles d'analyse de leur prolifération et différentiation par vidéo-microscopie semi-automatisée. Malgré une prolifération normale en culture, les précurseurs des OL (OPC) présentent des défauts de migration et de différenciation. Afin de caractériser les anomalies d'expression et d'épissage dans les OL primaires des DMSXL j'ai fait un séquençage des ARN. L'analyse bioinformatique a mis en évidence une dérégulation du cytosquelette, ainsi que des voies de signalisation impliquées dans la motilité et la différenciation cellulaire. De plus, l'analyse a montré que les défauts d'épissage détectés dans les OL DMSXL ressemblent aux profils d'épissage d'OPC indifférenciés, appuyant l'hypothèse d'un retard de maturation de la lignée oligodendrogliale. Certains défauts de maturation cellulaire ont été validés dans des OL humains différenciés à partir de cellules iPS dérivés de patients DM1. Mes travaux ont démontré des défauts des OL et de la myéline dans un modèle de la DM1, contribuant ainsi à une compréhension intégrative des atteintes cérébrales dans la DM1.

Parkinson's disease (PD) belongs to the a-synucleinopathies family. These pathologies have in common that they are linked to a-synuclein (a-syn), a neuronal protein whose precise roles are poorly defined. Some pesticides, such as paraquat, have been epidemiologically linked to the early onset of PD in farmers; some substances have become essential in the studies of synucleinopathies. Paraquat induces parkinsonian pathologies including a-syn aggregations or specific dopaminergic neurons loss. In our studies, we first set up a model of oral exposure to paraquat by drinking water. Subsequently, we studied the effects of this oral administration to paraquat on the enteric nervous system of the intestine of C57Bl/6 and TgM83 transgenic mice. This transgenic line has the peculiarity of simultaneously and spontaneously developing a synucleinopathy in the intestine and in the brain, displaying deposits of phosphorylated a-syn. The oral ingestion of paraquat induces acceleration in the appearance of enteric synucleinopathy. In a second biochemical study, we show that oral exposure to paraquat induces an overall increase in total a-syn levels in the central and enteric nervous systems of mice.Our results show the deleterious effects of paraquat oral administration on the intestine in relation to a-syn, by the acceleration of synucleinopathy but also by the induction of a widespread cerebral and enteric response, shown by an increase in cellular levels of a-syn, La maladie de Parkinson (MP) appartient à la famille des a-synucléinopathies. Ces pathologies ont en commun d'être liées à l'a-synucléine (a-syn), protéine neuronale dont les rôles précis sont encore mal définis. Dans un contexte où des pesticides, comme le paraquat, ont été liés épidémiologiquement au déclenchement précoce de la MP chez des agriculteurs, certaines substances sont devenues des substances de référence dans les études portant sur les synucléinopathies. Le paraquat induit une pathologie parkinsonienne comprenant des agrégations de l'a-syn ou des pertes spécifiques de neurones dopaminergiques. Dans nos études nous avons premièrement mis en place un modèle d'exposition par voie orale au paraquat en utilisant l'administration. Par la suite nous avons étudié les effets de cette administration orale au paraquat sur le système nerveux entérique présent dans l'intestin de souris C57Bl/6 et transgénique TgM83. Cette lignée transgénique possède la particularité de développer spontanément une synucléinopathie, simultanément dans l'intestin et le cerveau, présentant des dépôts d'a-syn phosphorylée. L'ingestion du paraquat induit une accélération de l'apparition de la synucléinopathie entérique. Dans une seconde étude biochimique, nous montrons que l'exposition orale au paraquat induit une augmentation globale des niveaux d'a-syn totale dans le système nerveux central et entérique des souris.Nous montrons ici les effets délétères de l'exposition orale au paraquat sur l'intestin en lien avec l'a-syn, par l'accélération d'une synucléinopathie mais aussi par l'induction d'une réponse générale, cérébrale et entérique, traduite par une hausse des niveaux d'a-syn

In Brazil, soybean production has increased with an annual growth of 7.2% since 1996. The adoption of transgenic soybean, rendered tolerant to glyphosate herbicide, has contributed to this remarkable increase. After the presentation of soybean production in Brazil, this article introduces the results of a survey conducted to capture the use of transgenic soybean, during the 200708 campaign in Paraná, one of the main producing States. The survey indicates that producers may show no, partial or total adoption of glyphosate-tolerant varieties of transgenic soybean. The allocation of transgenic soybean to most weedy plots is one reason of the coexistence of transgenic and non-transgenic soybean within the same farm holding. The continuation of the observed coexistence depends particularly on the evolution of royalties on transgenic soybean, and on the measures to ensure the non-transgenic purity of conventional soybean seeds., Au Brésil, la production de soja a progressé avec une croissance annuelle de 7,2 % depuis 1996. La culture des variétés de soja transgéniques tolérantes à l'herbicide glyphosate a concouru à cette importante progression. Après avoir présenté le contexte de production du soja au Brésil, l'article présente les résultats d'une enquête sur l'utilisation du soja transgénique, se rapportant à la campagne 2007/2008 dans le Paraná, l'un des principaux États brésiliens producteurs de soja. Cette enquête indique que, selon les exploitations agricoles, l'adoption du soja transgénique peut être nulle, partielle ou totale. L'utilisation du soja transgénique en fonction de l'état d'infestation des parcelles par les mauvaises herbes est une raison de la production simultanée des deux types de soja dans une même exploitation. La poursuite de cette coexistence dépend notamment de l'évolution des royalties appliquées au soja transgénique et des dispositions prises pour assurer la pureté des semences de soja conventionnel.

La cryptococcose chez les patients atteints du VIH-1 est principalement causée par Cryptococcus neoformans var. grubii tandis que Cryptococcus gattii infecte surtout les personnes immunocompétentes. Afin d’élucider les mécanismes causant la susceptibilité différentielle à l’égard de ces deux espèces de Cryptococcus dans le contexte de l’infection au VIH-1, nous avons utilisé un modèle novateur de la cryptococcose chez la souris transgénique CD4C/HIVMutA, qui exprime les gènes nef, env et rev du VIH-1. L’expression du transgène VIH-1 a augmenté le recrutement pulmonaire des macrophages alvéolaires mais a diminué celui des lymphocytes T CD4+ et CD8+ en réponse à l’infection par le C. neoformans ou le C. gattii. La production pulmonaire des chimiokines MCP-1 (CCL2) et RANTES (CCL5) était également réduite chez les souris transgéniques infectées par l’une ou l’autre de ces espèces de Cryptococcus. La production pulmonaire de MIP-1α, MIP-1β, TNF-α, TGF-β, IL-2, IL-4 et IL-13 était augmentée chez la souris infectée au C. neoformans comparativement à C. gattii. In vitro, les macrophages alvéolaires prélevés chez la souris Tg et stimulés par des agonistes ont produit davantage de MIP-1β, alors que les chimiokines MCP-1 et RANTES n’ont pas été détectées., The most common cause of cryptococcosis in HIV-1-infected patients is Cryptococcus neoformans var. grubii, while Cryptococcus gattii usually infects immunocompetent people. We used a novel inhalation model of cryptococcosis in CD4C/HIVMutA transgenic mice expressing nef, env, and rev of HIV-1 to examine the mechanisms that cause differential susceptibility to these species of Cryptococcus in the context of HIV-1 infection. HIV-1 transgene expression increased alveolar macrophage but decreased pulmonary CD4+ and CD8+ T lymphocyte recruitment. Pulmonary production of the CC chemokines MCP-1 (CCL2) and RANTES (CCL5) was reduced in transgenic mice infected with C. neoformans or C. gattii, and concentrations were lower after infection with C. gattii compared to C. neoformans. Production of MIP-1α, MIP-1β, TNF-α, TGF-β, IL-2, IL-4 and IL-13 was increased in mice infected with C. neoformans compared to C. gattii. Production of MIP-1β by alveolar macrophages harvested from Tg mice was enhanced after agonist exposure in vitro, but production of the chemokines MCP-1 and RANTES was undetectable.

Resume Etat de l’art Les strategies d’ingenierie tissulaire comportent des therapies cellulaires par transfert direct ou mobilisation des cellules. Les structures ligamentaires sont hautement specialisees et un element essentiel de l’appareil musculo-squelettique. Les lesions ligamentaires sont responsables d’importantes pertes fonctionnelles. Hypothese Le but de cette etude est d’analyser l’integration d’un greffon tendineux, son repeuplement cellulaire et sa « ligamentisation » en utilisant un modele de reparation ligamentaire chez le lapin transgenique gene fluorescent protein (GFP). Materiel et methode La technique de transplantation tendineuse a ete mise au point pour s’approcher le plus possible des conditions de realisation d’une reparation du ligament croise anterieur. Les allogreffes tendineuses ont ete implantees dans 8 lapins New Zealand White et evalues a 5 jours, 3 semaines et 6 semaines par un arthroscanner, l’analyse morphologique de l’allogreffe transplantee, une analyse histologique, l’immunohistochimie du collagene de type I dans le transplant, et le typage cellulaire GFP. Les modifications collageniques ont ete evaluees a 3 semaines et 6 semaines. Resultats La colonisation des allogreffes par les cellules de l’hote (cellules de type chondrocyte a l’interface entre le tendon et l’os) et la corticalisation des tunnels osseux ont ete notees a 3 semaines. Une necrose centrale de l’allogreffe transplantee dans sa portion intra-articulaire a ete notee a 6 semaines avec une migration cellulaire depuis les zones peripheriques de l’allogreffe a proximite de la synoviale. Discussion Notre etude apporte de nouvelles connaissances sur la comprehension de l’integration a l’os d’une allogreffe tendineuse ainsi que sur les phenomenes de colonisation cellulaire d’une allogreffe et son processus de « ligamentisation ». Nous pensons que les deux strategies de transfert direct cellulaire et de colonisation secondaire sont benefiques a la qualite du resultat final au niveau du transplant. Des etudes ulterieures pourraient permettre d’elucider les etapes de cette colonisation cellulaire en provenance de cellules pre-differentiees ou pro-genitrices. Niveau d’evidence Niveau V (etude animale).

The Cotton Beltwide Conferences 2010 have provided a new vision of the consequences of about 15 years of widespread and non-coordinated use of transgenic cotton in the United States. The observation of the shift of pest complexes in one hand, and in the other hand the adaptation solutions being explored today show that the positive effects firstly claimed look like vanished illusions in the areas of pest control effectiveness, cost reduction, and antagonism between chemical and biotech means. The technical and economic sustainability of transgenic varieties lies on systemic and coordinated approach of their use., Les conférences du Beltwide 2010 ont apporté une vision nouvelle sur les conséquences de 15 années d'utilisation massive des variétés de coton transgénique aux Etats-Unis. L'observation des changements dans les complexes d'ennemis de la culture du cotonnier et les solutions recherchées pour y faire face montrent que les effets positifs clamés de l'utilisation de ces variétés ressemblent aujourd'hui à des illusions évanouies en termes d'efficacité du contrôle des ennemis de culture, de réduction du coût et d'antagonisme entre voie chimique et voie biotechnologique de ce contrôle. La durabilité technique et économique des variétés transgéniques dépend de l'approche systémique et coordonnée de leur utilisation.

Spondyloarthritis (SpA) is a chronic inflammatory rheumatic disorder characterized by joint manifestations affecting the spine, peripheral joints and entheses, as well as extra-articular manifestations such as psoriasis, uveitis, or intestinal inflammation. This complex disorder has a strong genetic component dominated by the HLA-B27 antigen of the major histocompatibility complex class I (MHC-I), which is present in more than 80% of SpA patients. Discovered 45 years ago, the association between HLA-B27 and SpA development remains unexplained. Several hypotheses have been proposed to explain this association at the molecular level, but all face experimental inconsistencies that seem to invalidate them. Therefore, it appeared to us essential to elaborate new and yet unexplored approaches in order to better understand the molecular role of HLA-B27 in SpA development. Drosophila melanogaster is a powerful genetic model that has led to considerable advances in understanding numerous functions of metazoan cells, as well as in describing the cellular and molecular processes of many human pathologies. To elucidate the molecular pathogenic mechanisms associated with HLA-B27, we have established several transgenic Drosophila lines for SpA-associated and non-associated of HLA-B alleles, as well as for the MHC-I invariant chain, the human 2-microglobulin (hβ2m). Expression of the HLA-B27 alleles, in the presence of hβ2m, in the Drosophila wing and eye led to two specific phenotypes. The crossveinless wing phenotype is due to a disturbance in the Bone Morphogenetic Protein (BMP) signaling pathway. Interestingly, this misregulation is associated with a co-localization of HLA-B27 and the BMP type I receptor named Sax. Our preliminary results obtained in SpA patient cells suggest that HLA-B27 also colocalizes with ALK2 receptor, which is ortholog to Sax. Altogether, our results suggest that the pathogenic role of HLA-B27 in SpA may depend on a BMP signaling misregulation at the crosstalk between ossification and inflammation.; Les spondyloarthrites (SpA) sont des maladies inflammatoires chroniques articulaires qui se caractérisent par des atteintes de la colonne vertébrale et des articulations périphériques, en particulier des enthèses, souvent associées à des manifestations extra-articulaires telles que le psoriasis, l’uvéite, ou l’inflammation intestinale. Ces maladies complexes possèdent une forte composante génétique dominée par l'antigène HLA-B27 du complexe majeur d'histocompatibilité de classe I (CMH-I), présent chez plus de 80% des patients atteints de SpA. Découverte il y a 45 ans, l'association entre HLA-B27 et le développement des SpA reste inexpliquée. Plusieurs hypothèses ont été proposées pour expliquer cette association au niveau moléculaire. Cependant, la plupart se heurtent à des incohérences expérimentales qui semblent les invalider. Pour élucider les mécanismes moléculaires pathogènes liés au HLA-B27, nous avons utilisé une nouvelle approche. Drosophila melanogaster est un puissant modèle génétique qui a permis des avancées considérables dans la compréhension de nombreuses fonctions des cellules de métazoaires, ainsi que dans la description des processus cellulaires et moléculaires de nombreuses pathologies humaines. Nous avons établi plusieurs lignées de drosophiles transgéniques pour des formes d’HLA-B associées aux SpA ou pour une forme non associée à la maladie, ainsi que pour la chaîne invariante du CMH-I, la β2m humaine (hβ2m). L'expression des formes associées à la maladie, exclusivement en présence de la hβ2m, dans l'aile et dans l'œil de la drosophile conduit à l'apparition de deux phénotypes spécifiques. Mes résultats ont permis de mettre en évidence que le phénotype de perte des veines transversales de l’aile était associé à une perturbation de la signalisation par la voie des Bone Morphogenetic Protein (BMP). Cette perturbation est associée à une co-localisation de HLA-B27 avec le récepteur BMP de type I, Sax. Nos résultats préliminaires obtenus dans les cellules de patients atteints de SpA suggèrent l’existence d’une co-localisation analogue d’HLA-B27 avec le récepteur ALK2, orthologue de Sax. L'ensemble de nos résultats plaide en faveur d’un rôle pathogène de HLA-B27 passant par une dérégulation de la voie BMP à l’intersection des voies de l’ossification et de l’inflammation et pourrait donc s’appliquer à la physiopathologie des SpA.

In Brazil, the evolution of the authorization of the use of transgenic soybean, rendered tolerant to RoundUp herbicide of Monsanto (RRS), is a topic which has attracted attention of the international community. To our knowledge, this paper proposes the most comprehensive study of the mentioned topic by covering a period of more than ten years and by addressing the conditions of access to RRS. Our study, which lies in the analysis of the governance in setting the rules for RRS use, is the first governance study applied to the area of GMO in agriculture. The study of governance is implemented through the systemic approach of Türk (2008). The dynamics of the social system involved in the use of RRS demonstrates various shapes of public and private governance within a context dominated by the trust in technical progress and in the role of large firms to promote agribusiness., Au Brésil, l'évolution de l'autorisation de l'utilisation du soja transgénique rendu tolérant à l'herbicide RoundUp® de Monsanto, dit soja SRR, est un sujet qui a attiré l'attention de la communauté internationale. Cet article en propose l'étude la plus complète à notre connaissance, en couvrant une période de plus de dix ans et en s'intéressant aux modalités pratiques d'accès au SRR. Notre analyse, qui a porté sur l'évolution de la gouvernance des règles d'utilisation du SRR, est la première analyse de gouvernance relative au domaine des OGM en agriculture. Cette étude a été réalisée en appliquant l'approche systémique proposée par Türke (2008). La dynamique du système social concerné par l'utilisation du SRR illustre différentes configurations de gouvernance publique et privée, dans un contexte dominé par la confiance dans le progrès technique et par le rôle des grandes entreprises dans le développement de l'agro-business.

MUC5B, one of the 5 gel-forming mucins in mammals, is part of the mucus gels and responsible of the visco-elastic properties of these gels. The density of goblet cells, which secrete this macromolecule, reflects the homeostasis of secretory epitheliums.The main goal of this thesis was the creation and characterization of a transgenic mouse to easily follow in vivo the production of Muc5b. The second goal was to show that, as previously reported by the laboratory in wild-type mice, a (n-3) long chain polyunsaturated fatty acid enriched diet modulates the production of Muc5b in the cystic fibrosis mouse model CftrΔF508.A Muc5b-GFP transgenic mouse was created by replacing the Stop codon of Muc5b with a GFP (Green Fluorescent Protein) coding sequence. Muc5b expression pattern was studied ex vivo in tissues and in anaesthetized mouse. Muc5b is produced in middle ear, eye, nasal cavity, trachea, gallbladder, cervix, and in embryonic lung at E12.5. As a proof-of-concept, we show that Muc5b-GFP is a biomarker of goblet cell density in a dry eye model. In anaesthetized mice, we measured a decreased goblet cell density after dry eye induction, which was restored by interleukin 13 topical application. Muc5b-GFP mouse is a preclinical model to follow the mucin production and goblet cell density. In the cystic fibrosis mouse model CftrΔF508, we show that a long term (n-3) long chain polyunsaturated fatty acid supplementation has no effect after an acute pulmonary inflammation on the Muc5b expression level, but induces an improvement of lung histology and a modulation of the inflammatory response.; MUC5B, une des 5 mucines gélifiantes chez les mammifères, constitue la matrice de gels de mucus et est responsable des propriétés visco-élastiques de ces gels. Cette macromolécule est sécrétée par des cellules caliciformes dont la densité reflète l'homéostasie des épithéliums sécrétoires.L'objectif principal de ce travail de thèse était la création et la caractérisation d'une souris transgénique afin de suivre facilement la production in vivo de Muc5b. Le second objectif était de montrer, chez des souris mucoviscidosiques CftrΔF508, qu'une nutrition enrichie en acides gras polyinsaturés à longues chaînes (n-3) module la production de la mucine Muc5b, confirmant des résultats précédemment publiés sur la régulation transcriptionnelle du gène Muc5b chez des souris de type sauvage par ce régime alimentaire.Une souris transgénique Muc5b-GFP a été créée par insertion d'une séquence codant la GFP (pour « Green Fluorescent Protein ») à la place du codon Stop de Muc5b. Le profil d'expression de Muc5b a été déterminé ex vivo sur tissus et chez la souris anesthésiée. Muc5b est produit dans l'oreille moyenne, l’œil, la cavité nasale, la trachée, la vésicule biliaire, le cervix, ainsi que dans le poumon embryonnaire à E12,5. Nous apportons la preuve de concept que Muc5b-GFP est un biomarqueur de la densité des cellules à mucus dans un modèle de syndrome de l’œil sec où nous mesurons, chez la souris anesthésiée, une diminution de la densité en cellules caliciformes qui est restaurée par application topique d'interleukine 13. La souris Muc5b-GFP est donc un modèle pré-clinique pour suivre la production de la mucine et la densité de cellules caliciformes. Dans le modèle murin CftrΔF508, nous montrons qu'une supplémentation à long terme en acides gras polyinsaturés à longues chaînes (n-3) n'influence pas le taux d'expression de Muc5b suite à une inflammation pulmonaire aiguë, mais améliore l'histologie pulmonaire et module la réponse inflammatoire.

La Food and Drug Administration americaine est sur le point de remettre son avis sur la commercialisation de l’AquAdvantage Salmon, un saumon transgenique destine a la consommation humaine. La creation, en cours, de ce marche pose la question des operations necessaires pour definir une nouvelle entite bio-legale et pour assurer sa viabilite sur les marches. Nous eprouvons ici le cadre conceptuel concu par Javier Lezaun pour analyser la fabrique d’un nouvel objet de gouvernance, en etendant toutefois son usage a la fabrique d’un marche. Cet article explore ainsi les actes de delimitation et de demarcation de l’entite « saumon transgenique » necessaires a son inscription dans l’architecture juridique americaine, mais aussi les operations de demarcation issues d’une tension grandissante entre les promoteurs de ce projet et la societe civile, toutes necessaires a sa potentielle commercialisation sur les marches americains.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.