Las redes de pangenomas como herramienta clave para mejorar la resolución en el análisis de brotes de salmonella typhi

Los sistemas de salud pública de vigilancia genómica de brotes producidos por bacterias infecciosas tradicionalmente se han enfocado en medir la relación entre genomas utilizando solo loci cromosómicos, es decir, utilizan una aproximación de evolución vertical u homología por descendencia. Sin embargo, el genoma accesorio de las bacterias es muy relevante para explicar los fenómenos evolutivos recientes. Por tanto, la medición de la homología en el genoma accesorio (homología por mezcla) podría ofrecer información epidemiológica molecular relevante. En este estudio aplicamos el Indice Jaccard (JI) y su visualización en una red para analizar la relación del pangenoma de Salmonella enterica serotipo Typhi (Typhi). El análisis de red JI representa gráficamente tanto la homología por descendencia como la homología por mezcla y complementa los métodos filogenéticos existentes al ofrecer una dimensión molecular adicional para serotipos clonales como Typhi. Estos hallazgos tienen implicaciones importantes para la salud pública, ya que permiten una mejor resolución de las diferencias genómicas que resultan aplicables a la detección e investigación de brotes y el rastreo de cepas emergentes resistentes a los antibióticos. Este enfoque multidimensional nos proporciona una visión más amplia y compleja para entender la evolución de los patógenos.