Comparación molecular de poblaciones de Chile (capsicum spp.) de tabasco y chiapas, méxico

Molecular comparison of chili populations (Capsicum spp.) from Tabasco and Chiapas, Mexico Based on the importance of chile in the Southeast of Mexico, the objectives of this research were to characterize molecularly, and estimate the polymorphism and genetic structure of 21 populations of Capsicum spp. of Tabasco and Chiapas States, Mexico. After 40 days of germination of the seeds collected, two young leaves of each population were cut per each of 10 plants. The 20 leaves were mixed and three samples of 0.5 g were taken to extract the DNA. Four microsatellite markers (SSR) to determine the genetic diversity. A total of 229 alleles were detected, and 70 were polymorphics. The marker Hpms1-106 detected 38.8 % polymorphism, and HpmsCaSIG-19 the lowest polymorphism (20.55 %). The AMOVA explained 13.0 % of the variability among populations, and individuals within populations explained the remaining 87.0 %. The statistics FST = 0.176, showed a large differentiation between populations. The FIS = -0.448 showed an excess of heterozygous in populations, and the FIT = -0.193 showed that individuals in each population have moderate non-random mating effect between them. Cluster analysis grouped all evaluated chili populations into six clusters. The cluster I grouped 13 populations, some of these such as Amashito Cerro Blanco and Colmillo de Lagarto El Porvenir showed to be the most genetically similar. In the cluster VI, Pico de Paloma Miahuatlán showed to be different from the rest of populations. Microsatellite markers were useful to analyze the genetic diversity of these chili populations
Dada la importancia que tiene el chile en el sureste de la república mexicana, los objetivos de la investigación fueron caracterizar molecularmente, estimar el polimorfismo y la estructura genética de 21 poblaciones de Capsicum spp. de los estados de Tabasco y Chiapas. Se sembraron semillas de las poblaciones y a los 40 días después de la germinación, se cortaron dos hojas jóvenes por planta de 10 individuos de cada población. Las 20 hojas de cada población se mezclaron y de ellas se tomaron tres muestras de 0,5 g de tejido vegetal para extraer el ADN. Se usaron cuatro marcadores microsatélites (SSR) para estimar la diversidad genética. Se detectaron 229 alelos, de ellos 70 fueron polimórficos. El marcador Hpms1-106 detectó 38,8 % de polimorfismo, y HpmsCaSIG-19 el menor polimorfismo (20,55 %). El AMOVA explicó 13,0 % de la variabilidad entre poblaciones, y los individuos dentro de las poblaciones el 87,0 % restante. El estadístico FST = 0,176 indicó que la diferenciación genética entre poblaciones es grande, el FIS = -0,448 que las poblaciones poseen exceso de heterocigotos, y el FIT = -0,193, que los individuos de cada población mostraron efecto moderado de apareamiento no aleatorio. El análisis cluster aglomeró a las poblaciones evaluadas en seis grupos. El cluster I agrupó 13 poblaciones, y dentro de éstas, Amashito Cerro Blanco y Colmillo de Lagarto El Porvenir mostraron ser las más parecidas genéticamente. En el cluster VI, Pico de Paloma Miahuatlán fue diferente al resto de las poblaciones. Los marcadores microsatélites fueron útiles para analizar la diversidad genética de las poblaciones de chile evaluadas.