Impacts of pelagic habitat modifications on the behavior and physiological condition of tropical tuna

Tropical tunas, as many pelagic fish species are known to associate with floating objects (FOBs). If this associative behavior has been known for almost 2 millennia, the reasons underlying it are still largely unknown. Fishers exploit this associative behavior to facilitate the search and catch of fish. In particular, in the 1980s, industrial fishers began to build and deploy their own man-made floating objects, drifting fish aggregating devices (DFADs). Since then, the deployment of DFADs has increased massively, which has several ecological impacts, on the environment and directly on marine species. This thesis focuses on DFADs ecological impacts on tropical tuna. DFADs impact tropical tuna directly by increasing purse seine fleets’ efficiency, yield and by expanding their fishing grounds. They also change species catch composition and increase the catch of small yellowfin (Thunnus albacares) and bigeye (Thunnus obesus) tunas. Besides these direct impacts (related with fishing mortality), DFADs could impact tropical tunas indirectly by their sole presence in the ocean. This thesis aims at (1) reviewing the indirect impacts of DFADs in tropical tuna, (2) quantifying the modifications induced by DFADs and other anthropic activities on tropical tuna surface habitat, and (3) characterizing the direct and indirect impacts of these modifications, considering tropical tuna behavior and condition. Based on a literature review, Chapter 2 outlines that DFADs do modify tropical tuna habitat, but quantitative characterizations are missing. There is a lack of clear converging scientific evidences on the indirect impacts of DFADs on the behavior and biology of tropical tuna. In the Western Indian Ocean, DFADs strongly increased FOB density, representing around 85 % of the encountered FOBs by observers onboard purse seine vessels (Chapter 3). Other human activities, like deforestation or climate change, did not induce any clear variation of natural floating objects density, sugg
Les thons tropicaux, comme d’autres poissons pélagiques, s’associent aux objets flottants. Si ce comportement associatif est connu depuis près de deux millénaires, les raisons sous-jacentes sont encore méconnues. Les pêcheurs exploitent ce comportement associatif pour faciliter la recherche et la capture de poissons. Dans les années 1980, les pêcheurs industriels ont commencé à construire et à déployer leurs propres objets flottants artificiels, les dispositifs de concentration de poissons dérivants (DCPd). Depuis, le déploiement de DCPd a augmenté drastiquement, ce qui a plusieurs impacts écologiques sur les thons tropicaux. Les DCPd ont de nombreux impacts directs (liés à la mortalité par pêche) : ils augmentent l’efficacité des senneurs, modifient la composition spécifique des captures et augmentent les captures de petits albacores (Thunnus albacares) et thons obèses (Thunnus obesus). Outre ces impacts directs, les DCPd pourraient avoir des impacts indirects sur les thons tropicaux de par leur seule présence. Cette thèse vise à (1) faire le point sur les impacts indirects des DCPd, (2) quantifier les modifications induites par les DCPd et d’autres activités anthropiques sur l’habitat, et (3) caractériser les impacts directs et indirects de ces modifications en considérant le comportement et la condition physiologique des thons tropicaux. Une revue de littérature a permis de montrer que les DCPd modifient l’habitat des thons tropicaux, mais que les quantifications manquent. Il n’existe pas de résultats scientifiques convergeants concernant les impacts indirects des DCPd sur le comportement et la biologie des thons tropicaux (Chapitre 2). Dans l’ouest de l’océan Indien, les DCPd représentent 85 % des objets flottants, augmentant ainsi fortement leur densité (Chapitre 3). Les autres activités humaines (e.g. déforestation, changement climatique) n’ont pas induit de variations claires de la densité d’objets flottants naturels, suggèrant que les DCPd sont le principal