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Análisis de concordancia de diferentes metodologías para la identificación de aislamientos orales de especies de Candida

Authors :
Pontificia Universidad Javeriana. Facultad de Medicina. Departamento de Medicina Interna. Grupo de Investigación en Enfermedades Infecciosas HUSI - PUJ
Zuluaga, Alejandra
Arango Bustamante, Karen
Caceres, Diego H.
Sánchez-Quitian, Zilpa A.
Velásquez, Verónica
Gómez, Beatriz L.
Parra Giraldo, Claudia Marcela
Maldonado, Natalia
Cano, Luz E.
Bedout, Catalina de
Rivera, Raúl E.
Pontificia Universidad Javeriana. Facultad de Medicina. Departamento de Medicina Interna. Grupo de Investigación en Enfermedades Infecciosas HUSI - PUJ
Zuluaga, Alejandra
Arango Bustamante, Karen
Caceres, Diego H.
Sánchez-Quitian, Zilpa A.
Velásquez, Verónica
Gómez, Beatriz L.
Parra Giraldo, Claudia Marcela
Maldonado, Natalia
Cano, Luz E.
Bedout, Catalina de
Rivera, Raúl E.
Source :
Colombia Médica; Vol. 49 Núm. 3 (2018)

Abstract

Introducción: La clasificación a nivel de especies de las levaduras del género Candida de origen clínico es fundamental para el diagnóstico y la instauración de un adecuado tratamiento para el paciente. Se realizó un estudio de concordancia de cinco metodologías usadas para la identificación de aislamientos orales de Candida spp en Colombia. Métodos: Sesenta y siete aislamientos de Candida spp fueron identificados a nivel de especie utilizando; API® 20 C AUX‚ Vitek® 2 Compact, MALDI TOF (Vitek® MS y Microflex®) y una prueba molecular, PCR Panfungal y secuenciación. Un análisis del costo comercial y tiempo de procesamiento de las muestras por cada método fue realizado mediante el análisis gráfico de ambas variables. Resultados: La PCR Panfungal y secuenciación diferenció 12 especies de Candida ‚ los métodos Vitek® MS y Microflex® identificaron 9 especies y los métodos API® 20 C AUX y Vitek® 2 Compact identificaron 8 especies. El análisis de Kappa ponderado (wK) demostró una concordancia alta entre los métodos PCR Panfungal y secuenciación‚ Vitek® MS‚ Microflex® y API® 20 C AUX‚ concordancias agrupadas en las categorías buena y muy buena (wK 0.62-0.93); los Kp que involucraron el método Vitek® 2 Compact presentaron concordancias moderadas o buenas frente a los otros métodos (wK 0.56-0.73). Las metodologías basadas en MALDI TOF MS requirieron 4 minutos para generar un resultado y el método Microflex® fue el método que en nuestro medio presentó el menor precio de venta del servicio. Conclusión: Los métodos evaluados presentaron una alta concordancia en sus resultados‚ siendo más alta para los métodos moleculares y las metodologías basadas en MALDI TOF MS; estas últimas son metodologías más rápidas, económicas y precisas, las cuales se presentan como alternativas prometedoras para la identificación rutinaria de especies de levaduras del género Candida.

Details

Database :
OAIster
Journal :
Colombia Médica; Vol. 49 Núm. 3 (2018)
Publication Type :
Electronic Resource
Accession number :
edsoai.on1299205171
Document Type :
Electronic Resource