Estudio de la microbiota en pacientes de fibrosis quística: identificación de disbiosis intestinales y caracterización de la microbiota de esputos

[Introducción] La fibrosis quística (FQ) es una enfermedad autosómica recesiva atribuible a una mutación en el gen regulador de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quística (CFTR). Como resultado, existe una alteración en el transporte transepitelial de iones, lo que resulta en una deficiencia en la producción de la capa de mucus que recubre los epitelios respiratorio y gastrointestinal. Esta disfunción es un factor crítico que condiciona la calidad y esperanza de vida en los pacientes con FQ, generando además unas condiciones muy particulares en la mucosa intestinal y respiratoria, que pueden condicionar la composición de la microbiota asociada a dichos ambientes. [Objetivos] Identificar marcadores microbianos a nivel de la microbiota intestinal, asociados a la FQ así como caracterizar la microbiota asociada a muestras de esputo en los mismos pacientes. Materiales y Métodos: Se ha estudiado la composición de la microbiota en muestras fecales y de esputo de 21 pacientes con FQ, mediante secuenciación masiva de productos de amplificación del gen del ARN ribosomal 16S mediante la plataforma Ion Torrent. Las posibles disbiosis intestinales asociadas a la FQ han sido analizadas mediante comparación con los perfiles metagenómicos obtenidos en 22 individuos sanos equiparables en distribución de sexo y edad. [Resultados] El perfil microbiano obtenido en muestras de heces de pacientes de FQ presentó una diversidad alfa significativamente menor al observado en el grupo control de individuos sanos, observándose además una reducción significativa de la ratio Firmicutes/Bacteroidetes. A nivel de Familia, los grupos cuya abundancia mostro cambios significativos en el grupo de FQ respecto al grupo control han sido las familias de Lachnospiraceae y Verrucomicrobia. Asimismo, se han determinado los perfiles microbianos en las muestras de esputo de los pacientes de FQ. Cambios en el perfil microbiano asociado a los pacientes con FQ han podido asociarse con el número de cic