Investigation of molecular markers of human prostate cancer

In this study, TMPRSS2:ERG fusion transcripts were detectd in 58.86% of prostate cancer (PCa) tumour tissues, T1/E4 (46.62%) was the most predominant fusion type. Occurrence of the TMPRSS2:ERG rearrangement was accompanied by increased production of ERG, revealed increased production of the SPINK1 transcript in the subgroup of TMPRSS2:ERG fusion-negative cases. Our results demonstrated that the expression of TMPRSS2:ERG or TERT (catalytic subunit of telomerase) as a single biomarker was not highly informative for prediction of biochemical recurrence in PCa. However, the combination of both biomarkers showed significant association with the outcome of the disease. We successfully identified the TMPRSS2:ERG and TERT transcripts in catheterized urine of PCa patients. The detection rate of TMPRSS2:ERG reached 16.39% and was slightly lower than other investigators found. In this study we analyzed multifocal PCa samples. We identified different gene expression and TMPRSS2:ERG fusion transcripts isoforms were in multifocal PCa samples. This study identified reduced expression of tumour suppressor genes (GSTP1, RARB, RASSF1 and ZAC) in PCa non-cancerous prostate tissues and TMPRSS2:ERG fusion-positive cases, but we did not get significant association. Based on microarray data we selected five miRNAs (hsa-miR-33b, hsa-miR-370, hsa-miR-149, hsa-miR-886-3p and hsa-miR-206) that were down-regulated in TMPRSS2:ERG fusion-positive samples. QPCR data from PCa samples and cell lines... [to full text]
TMPRSS2:ERG sulietinių transkriptų aptikimo priešinės liaukos (PL) mėginiuose dažnis – 58,86 %, dažniausia izoforma – T1/E4 (46,62 %). PL mėginiuose aptikome padidėjusią ERG geno raišką, kuri siejama su TMPRSS2:ERG sulietinio transkripto buvimu PL mėginyje. TMPRSS2:ERG sulietiniam transkriptui neigiamuose PL mėginiuose aptinkome padidėjusią SPINK1 geno raišką. Mūsų atlikti tyrimai parodė, kad vieno TMPRSS2:ERG arba TERT biožymens aptikimas PL mėginiuose nėra informatyvus, tačiau abiejų biožymenų derinys rodo patikimas sąsajas su ligos progresavimu. Neinvazinio tyrimo metu aptikome TMPRSS2:ERG ir TERT transkriptus šlapimo nuosėdose. TMPRSS2:ERG sulietinio transkripto aptikimo dažnis siekė 16,39 % ir buvo šiek tiek mažesnis, nei nurodomas kitų tyrėjų. PL vėžys yra daugiažidininės kilmės, ištyrus tokius mėginius nustatėme, kad genų raiška ir TMPRSS2:ERG sulietinio transkripto izoformos yra skirtingos daugiažidininio PL vėžio mėginiuose. Mes nustatėme sumažėjusią naviką slopinančių genų (GSTP1, RARB, RASSF1 ir ZAC) raišką nenavikiniuose ir TMPRSS2:ERG sulietinį transkriptą turinčiuose mėginiuose, nors patikimų sąsajų ir negavome. Mikrogardelių tyrimui atsirinkome penkias mikroRNR (hsa-miR-149, hsa-miR-33b, hsa-miR-886-3p, hsa-miR-370 ir hsa-miR-206), kurių raiška yra sumažėjusi TMPRSS2:ERG sulietinį transkriptą turinčiuose mėginiuose. Atlikus tinkamumo patikrinimą kPGR metodu, o gautus rezultatus patvirtinus su VCaP ir LNCaP ląstelių linijų tyrimais, rasta stipri hsa-miR-149... [toliau žr. visą tekstą]