The chicken model organism for epigenomic research

Introduction Among the animals to be domesticated, chickens are the most numerous domestic animal and the preferred source of animal protein (Wang et al. 2020). The chicken as a model [...]
The chicken model organism has advanced the areas of developmental biology, virology, immunology, oncology, epigenetic regulation of gene expression, conservation biology, and genomics of domestication. Further, the chicken model organism has aided in our understanding of human disease. Through the recent advances in high-throughput sequencing and bioinformatic tools, researchers have successfully identified sequences in the chicken genome that have human orthologs, improving mammalian genome annotation. In this review, we highlight the importance of chicken as an animal model in basic and pre-clinical research. We will present the importance of chicken in poultry epigenetics and in genomic studies that trace back to their ancestor, the last link between human and chicken in the tree of life. There are still many genes of unknown function in the chicken genome yet to be characterized. By taking advantage of recent sequencing technologies, it is possible to gain further insight into the chicken epigenome. Key words: chicken, poultry, epigenetics, sequencing, histone modification, DNA methylation. Le poulet a gagne en importance en tant qu'organisme modele pour des etudes en biologie du developpement, en virologie, en immunologie, en oncologie, en regulation epigenetique de l'expression genique, en biologie de la conservation et en genomique de la domestication. De plus, le poulet en tant qu'organisme modele a contribue a la comprehension de la maladie chez l'humain. Grace aux recentes avancees en matiere de sequencage a haut debit et d'outils bioinformatiques, les chercheurs ont reussi a identifier des sequences au sein du genome du poulet qui ont des orthologues chez l'humain, ce qui a permis d'ameliorer l'annotation des genomes chez les mammiferes. Dans cette synthese, les auteurs soulignent l'importance du poulet en tant que modele animal en recherche fondamentale et preclinique. Les auteurs exposent l'importance du poulet pour l'epigenetique aviaire et pour des etudes genomiques qui remontent a leur ancetre, le dernier lien entre les humains et le poulet dans l'arbre de la vie. I1 reste de nombreux genes de fonction inconnue au sein du genome du poulet qui doivent encore etre caracterises. En profitant des recentes technologies de sequencage, il est possible d'acquerir une meilleure comprehension de l'epigenome du poulet. [Traduit par la Redaction] Mots-cles: poulet, volaille, epigenetique, sequencage, modification des histones, methylation de l'ADN.