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Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de Clostridium sp. IBUN22A

Authors :
José David Montoya Solano
Zulma Rocío Suárez Moreno
Dolly Montoya Castaño
Fabio Ancízar Aristizábal Gutiérrez
Source :
Revista Colombiana de Biotecnología, Vol 8, Iss 1 (2006)
Publication Year :
2006
Publisher :
Universidad Nacional de Colombia, 2006.

Abstract

Este trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de la cepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaæos superiores a 500 pb fueron secuenciados y analizados por medio de bÅ“squedas de los insertos completos o de sus marcos abiertos de lectura (ORFs) traducidos en GenBank 141.0 y Uniprot 6.6 con BLAST 2.2.8. Se identificaron seis genes con alta similaridad a genes de metabolismo bÆsico (housekeeping) en diferentes especies de Clostridium. En el clon pBsIBUN22A-1 se localizó una secuencia de 851 pb con una identidad del 99.74% respecto al gen codificante de la enzima glicerol deshidratasa (DhaBl) de Clostridium butyricum (AY968605) involucrada en la producción de 1,3 Propanodiol (1,3-PD). La identifica­ción de genes presentes en la cepa nativa Clostridium IBUN 22A abre la puerta a la investigación básica y a la ingeniería metabólica para hacer más rentable el proceso de producción de 1,3-PD junto al conocimiento de los genes presentes en la cepa nativa. Palabras clave: análisis de secuencias, librería genómica, Clostridium, glicerol deshidratasa, 1,3-propanodiol.

Details

Language :
Spanish; Castilian
ISSN :
01233475 and 19098758
Volume :
8
Issue :
1
Database :
Directory of Open Access Journals
Journal :
Revista Colombiana de Biotecnología
Publication Type :
Academic Journal
Accession number :
edsdoj.5102d8bcdf2d4ffab057b9d036df25a2
Document Type :
article