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Caracterización molecular de algunas especies y variedades de ñame presentes en la Costa Atlántica colombiana

Authors :
Silvia L. Bustamante R.
Mónica Guzmán B.
Gustavo Buitrago H.
Source :
Revista Colombiana de Biotecnología, Vol 3, Iss 2 (2001)
Publication Year :
2001
Publisher :
Universidad Nacional de Colombia, 2001.

Abstract

En Colombia el ñame (Dioscorea data y Dioscorea rotundata) es un cultivo de importancia para los pequeños productores de la Costa Atlántica. El Programa Colombiano de Biotecnología Agrícola (PBA) de Ñame tiene el objetivo de incrementar la sostenibilidad de grupos de campesinos de la región, adelantando investigaciones participativas en diferentes aspectos relacionados con el cultivo. En el presente trabajo, el objetivo principal fue caracterizar molecularmente las ocho variedades de ñame utilizadas en el PBA, a través de marcadores moleculares tipo AFLP para determinar si existe concordancia entre la taxonomía morfológica establecida para la clasificación de las especies y variedades con la discriminación y agrupación de los individuos por sus perfiles de bandas moleculares aportados por los AFLP Para la obtención de los patrones de AFLP se utilizaron los kits de Gibco-BRL, New York Analysis System I y Analysis System II, siguiendo los manuales de instrucción. Para el análisis estadístico se realizaron matrices de presencia ausencia, se determinaron las similitudes a partir del índice de similaridad de Dice con el paquete estadístico Gel Stats. Posteriormente, las matrices se transformaron en matrices de distancia, y a partir de éstas se construyeron los dendogramas utilizando como estrategia de agrupamientos UPGMA (Unweighted Pare Group Method Averange). Finalmente se realizó una comparación entre matrices utilizando el análisis de permutaciones de Mantel. Los resultados muestran que de las siete variedades de Dioscorea alata analizadas solamente tres de ellas presentan polimorfismos que permiten diferenciarlas. Las otras cuatro se agruparon como una sola variedad.

Details

Language :
Spanish; Castilian
ISSN :
01233475 and 19098758
Volume :
3
Issue :
2
Database :
Directory of Open Access Journals
Journal :
Revista Colombiana de Biotecnología
Publication Type :
Academic Journal
Accession number :
edsdoj.12bc6d636b40e0b69f9650d3e895fb
Document Type :
article