Investigation of in-vitro effects of L. acidophilus ATCC 4356 strain on icaA gene expression of biofilm positive Staphylococcus epidermidis

Amaç: S.epidermidis biyofilmoluşumu, bu bakterilerin antibakteriyel ilaçlara ve bağışıklık sistemisavunmasına karşı koruyan önemli bir bariyer görevi oluşturmaktadır. IcaA genibunun oluşumu için önemlidir. Lactobacillus türlerinin probiyotik etkileribilinmektedir. Bizde çalışmamızda, CRA yöntemi ile biyofilm pozitifliğisaptanan S. epidermidis kökenlerinin icaA gen ekspresyonuna, L. acidophilus ATCC 4356 kökenininin-vitro etkisinin incelenmesi amaçladık.Materyal ve metod: Haziran – Aralık 2017 döneminde klinik örneklerdenizole edilmiş olan ve CRA metodu ile biyofilm üretimi pozitif olarak saptananyirmi (20) S. epidermidis kökeniçalışmamıza dahil edildi. CRA’da siyah pozitif kolonilerden, 2 McFarland’lıksüspansiyonundan 250 mLalınarak, L. acidophilus içeren ve içermeyen 2 tüpe ilave edildi ve %5CO2’liortamda 37oC’da inkübasyona bırakıldı. Inkübasyonun 6. saatinde,tüplerden RNA izolasyonları gerçekleştirildi. cDNA sentezi sonrası, spesifikprimerler ile LightCycler480 sisteminde real-time PCR yöntemi ile çalışıldı.Gruplara ait sonuçlar delta delta Ct yöntemi ile oluşturularak, Mann-Whitney Utesti ile istatistiksel olarak incelendi.Bulgular: L.acidophilus ATCC 4356etkileşimi sonrasında S. epidermidiskökenlerinde icaA gen ekspresyonseviyesinde gözlenen upregulasyon, istatistiksel olarak anlamlı düzeyde bulundu(p
Background: The formation of S.epidermidis biofilm is an important barrier to protecting these bacteriaagainst antibacterial drugs and defense of the immune system. IcaA gene is important for the formationof this. The probiotic effects of Lactobacillusspecies are known. Aim of this study was to investigate the in-vitro effect of L. acidophilus ATCC 4356 genotype on theexpression of the icaA gene in S. epidermidis strains, which were found to bepositively biofilm with CRA method.Methods: Between June and December 2017, Twenty (20) S. epidermidis strains isolated fromclinical specimens and detected as positive for biofilm production by CRAmethod were included the study. 250 μL of 2 McFarland suspension ofblack-positive colonies from the CRA were added to 2 vials containing with and withoutL. acidophilus and incubation wascarried out at 37°C in 5% CO2. At the 6th hour of incubation, RNAwas isolated from these tubes. After cDNA synthesis, real-time PCR wasperformed on the LightCycler480 system with specific primers. The results ofgroups by delta delta Ct method were statistically analyzed by Mann-Whitney Utest.Results: The upregulation at the level of icaA gene expression in S.epidermidis strains after L.acidophilus ATCC 4356 interaction was found statistically significant (p