Back to Search Start Over

NeuroLOG: sharing neuroimaging data using an ontology-based federated approach

Authors :
Bernard Gibaud
Gilles Kassel
Michel Dojat
Bénédicte Batrancourt
Franck MICHEL
Alban Gaignard
Johan Montagnat
Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5)
Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)
Modélisation, Information et Systèmes - UR UPJV 4290 (MIS)
Université de Picardie Jules Verne (UPJV)
Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5)
Grenoble Institut des Neurosciences (GIN)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (CRICM)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS
Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems (Laboratoire I3S - SPARKS)
Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S)
Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)
Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)
Montagnat, Johan
Source :
American Medical Informatics Association, American Medical Informatics Association, Oct 2011, Washington DC, United States. pp.472-80, Scopus-Elsevier, ResearcherID, Europe PubMed Central, HAL
Publication Year :
2011
Publisher :
HAL CCSD, 2011.

Abstract

International audience; This paper describes the design of the NeuroLOG middleware data management layer, which provides a platform to share heterogeneous and distributed neuroimaging data using a federated approach. The semantics of shared information is captured through a multi-layer application ontology and a derived Federated Schema used to align the heterogeneous database schemata from different legacy repositories. The system also provides a facility to translate the relational data into a semantic representation that can be queried using a semantic search engine thus enabling the exploitation of knowledge embedded in the ontology. This work shows the relevance of the distributed approach for neurosciences data management. Although more complex than a centralized approach, it is also more realistic when considering the federation of large data sets, and open strong perspectives to implement multi-centric neurosciences studies.

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
American Medical Informatics Association, American Medical Informatics Association, Oct 2011, Washington DC, United States. pp.472-80, Scopus-Elsevier, ResearcherID, Europe PubMed Central, HAL
Accession number :
edsair.pmid.dedup....c9403943d6a31b83d5c767b2d5784fdf